1NGC | Genus

Total Genus 126

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	126
sequence length	378
structure length	378
Chain Sequence	GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFSVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
source organism	Bos taurus
total genus	126
structure length	378
sequence length	378
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1ngcA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngcA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngcA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1ngcA04

4M63C 1KAYA 1QQMA 3O1WA 3LM9A 3H6EA 3MN7A 1BUPA 2IVOA 2V7YA 5AQUA 4GNIA 4BRFA 4DHYA 5EVZA 5AQMA 1U6ZA 2Q0RA 3ZEUA 3I33A 4CBUA 5FPNA 5AQVA 1NGBA 3ID8A 3QMLA 4FWOA 5E26A 1NGAA 1QQNA 3H46O 4FWKA 4FWNA 3ULEA 1KAXA 4CZKA 1G99A 3AARA 4BRHA 3F9MA 3D2EB 2E2PA 3M1FA 2OANA 4NB4A 4BRIA 3VENA 4I6MA 3WEEB 1ZC6A 2E1YA 4AM6A 2PBDA 5AZIB 1QQOA 4BC4A 1E4GT 4B9QA 2FSNA 3CQXA 5ELZA 1ATSA 1RDWX 5AQZA 3P4IA 4HWIA 3O80A 5AQLA 5AQKA 3CJ1A 4CZLA 4ISFA 1DKGD 4CZEA 4QS9A 4E1JA 2HF4A 3D7EO 1ATNA 2I7PA 4BQLA 2I7NA 3GBTA 1J6ZA 1GLLO 2FXUA 1Z05A 3A0IX 4LC9B 3D2FB 3ZETA 3TU5A 4BRMA 2W40A 5AQSA 1YAGA 3VERA 3DXMA 5BR9A 1GLJO 3AY9A 3LM2A 4FL9A 4IJNA 5B8HA 5AQGA 4H0OA 3QFPA 4BRPA 2H3GX 3L6QA 4BRLA 4CZMA 2D0OA 4FWPA 2YI1A 5AFUH 3QBXA 1MDUB 2QWLA 3O08A 1YUWA 4JAXA 4O5FA 3QFUA 5KPTA 1K8KA 4H5NA 3MN5A 3G25A 4RCHA 3U4LA 4BGAA 4BG9A 4K42A 3VEWA 2YJEA 2E88A 3LL3A 4CZFA 1SZ2A 2NZTA 4A2BA 5EXWA 3H3OB 4JHDB 2WUSA 2QWMA 3CJAA 2P9LB 3FZKA 3FR0A 3CI5A 2GEMA 4H0VB 4FSVA 2AP1A 1Q18A 1S22A 1H1VA 4IZ9A 2F9TA 3GE1A 1HKBA 3WXLA 3DXKA 3IDHA 1U2VA 4WQ5A 4BVPA 3A5MC 3H45C 4IWVA 3KZBA 3VETA 2ASMA 4WQ5C 2P9IA 4J8FA 1SAZA 3VF6A 2P9SA 4BROA 4H0YB 3QDKA 5KQDA 3SMPA 3WT0A 1QZ6A 4PL8A 4FWQA 3R9PA 2CGLA 4BRGA 1BG3A 4QS7A 5AR0A 2Q1NA 3VEVA 2IVNA 1GLEG 2HOEA 3O5BA 1C0FA 3LDPA 4A61A 4FWMA 1DEJA 3ZX0A 4HTLA 1HKCA 3QB0A 1BO5O 1GLAG 3O4WA 3GG4A 2P9PA 5AQJA 3SMSA 1OKJA 3GDQA 2ZWHA 5AQPA 5AZJB 5LJWA 5KQ8A 5EX5A 2BUPA 3M6GA 3GOIA 1IJJA 2NRHA 3CQYA 1BOTO 1WOQA 3A5LC 2D1KA 2E8AA 1XUPO 2ZGZA 3FE1A 2D0PA 1HPMA 4CZGA 2QWQA 3MK6A 5BRHA 3FZFA 1NM1A 1NGCA 1T6CA 3C7NB 1LCUA 4A62A 1R59O 4K43A 2CH5A 1D4XA 3FGUA 3O6WA 1HUXA 4DQ8A 3ATVA 3U9DA 2F9WA 4EHUA 3EKSA 5AQNA 2GTDA 1X3MA 2DPNA 2GELA 4JD2A 4FWRA 3GL1A 1ESVA 3AAQA 4MLHA 1ZBSA 4BRCA 5EY4A 4H5WA 4H0TB 5AQIA 2Q2RA 2QWPA 3OHRA 4QS8A 4CJ7A 4JN4A 3W3DA 3HTVA 1V4SA 4WYBA 3I8BA 3L0QA 1RFQA 1CZAN 1NGIA 3U9ZA 3RSEA 3CJ9A 4CZHA 3BF1A 5AQRA 1XC3A 1ATRA 3M3ZA 3HSCA 1S3XA 1NGJA 5BN9A 3WXJA 3A5OC 3LDNA 4BRQA 2VWBA 2ASOA 3KHYA 1JCGA 2P9NA 2P9UA 2A5XA 1WUAA 3ZEUB 2E1ZA 3WXKA 4B1VA 1BA1A 2QW9A 4CBXA 2GUPA 1T6DA 2CH6A 4EFHA 2A41A 4XH1A 4K41A 4AM7A 5AQQA 3UKUA 1NGEA 3HBTA 5AQHA 1RGIA 2HMPA 4FOEA 2GWJA 4CBWA 4H0XB 1C0GA 3R6MA 2A3ZA 3VGKA 4BRKA 4EIAA 2QM1A 2E20A 1X3NA 4K25A 5FPDA 2P9KA 5I9EB 1TYQB 4B1UB 3HM8A 2Q0UA 5JLHA 2Q31A 3S41A 2GWKA 2HF3A 4C23A 3ZX2A 4ISEA 4BC5A 4PL7A 3O8MA 1GLCG 4MLEA 1NLVA 3FZLA 4M7XA 3ZETB 1X9JA 3CHWA 2J4RA 3DXMB 4BR9A 3UKRA 5E84A 3MN6A 2KHOA 5AQOA 4YDUA 5AQWA 2QWNA 3LDOA 3LDQA 4FWSA 1GLFO 4BR7A 4RWTA 2AA4A 4YDUC 3EL2A 4FOIA 4H5TA 3VEXA 3BEXA 4GY2B 4RTFD 3SJHA 1DGKN 3DJCA 4BC2A 3EN9A 3CETA 1NBWA 5JLFA 4MO4A 5AQYA 2BTFA 4BR5A 4Z94A 5BPNA 3IFRA 5F2RA 4BQZA 3D2EA 3C0BA 3HZ6A 3FFKB 3MMVA 3O1BA 3WEEA 1IG8A 1HX1A 1MWKA 2EWSA 3R8EA 3VEOA 5FPMA 4PKHA 5AZIA 1HJOA 4BRDA 1NWKA 2A40A 1NGGA 2YCHA 3HI0A 4PKGA 3VEYA 2D4WA 4O8KA 3MN9A 3DXKB 2FSKA 1U2VB 1KAZA 1ZXOA 1YXQA 1BU6O 4BREA 3A5NC 2P9IB 1QZ5A 3CJCA 2P9SB 3QBWA 4Y0WA 2VYPA 5FPEA 3D2FA 5ADXA 2YJFA 5BPMA 1NGHA 3FZMA 3IMXA 3UB5A 2YHXA 5F1XA 4ISGA 4EAHD 4XH4A 2QWOA 1BWFO 2FSJA 3L4IA 1JCEA 2ITMA 2E2QA 1P8ZA 5AQXA 1NGDA 4H03B 3A8YA 3BF3A 3FLCO 1HLUA 4IXCA 2A42A 2PAVA 2P9PB 4BG8A 3JXUA 3FZHA 4BRNA 2Q97A 1GLDG 1QHAA 1EQYA 1T44A 2W41A 3VPZA 4DB3A 3QICA 4JHDA 1BA0A 3MCPA 5BPLA 3ATUA 4FPAA 2P9LA 5LJVA 1YVNA 5JMVA 4XH5A 3DAWA 2NLXA 1V4TA 4B1XB 4CZJA 4XEIA 3VF2A 5BRDA 3WXIA 3ENOA 3CJ7A 1TYQA 2V51B 3SLCA 4WQ4A 1KXPA 3H3NO 4A2AA 4CD3A 2YHYA 4H5RA 2CGJA 4WQ4C 1HKGA 4BR4A 1NMDA 2FLOA 3VF4A 4H5VA 3ULEB 3VGMA 5CE3A 4I6MB 4JD2B 3J8AA 3U8XA 4KBOA 4B1ZA 1MA9B 3BP8A 2E2OA 3VGLA 3B8AX 3EO3A 1E4FT 4FO0A 3CJBA 4CZIA 2FF6A 2UYTA 4BRAA 2VCPA 2A6AA 1SQKA 3RSEB 4CI6A 3JS6A 5AZJA 3IUCA 3WQTA 1TUYA 3EKUA 3ENHA 1MWMA 5BREA 5KPRA 4IJAA 2E2NA 5ADXH 1Z6RA 3DWLA 5F0XA 4JNEA 2P9NB 2P9UB 1NGFA 4F9OA 3WUHA 3SK3A 4MO5A 3WQUA 3CIPA 4BVOA 3H1VX 2CGKA 2ZGYA 4CD1A 1TUUA 3C7NA 5AQFA 5AQTA 3H1QA 1K8KB 3VEZA 5TKYA 2QXLA 4M7YA 3UKUB 3BUZB 3CERA 4BR2A 4B1YB 4BR0A 2ASPA 4DCHA 1Y64A 1JCFA 2V7ZA 3LDLA 3ZX3A 5JICA 5KPZA 1GLBG 2ZF5O 3VESA 4BGBA 2IIRA 3MDQA 2Q36A 3W0LA 3TPQA 5AFUA 2V52B 2QWRA 5BN8A 4L3QA 2IVPA 5EOYA 2FF3B 3AAPA 3VOVA 2P9KB 3KVGA 4PKIA 5BRFA 3EZWA 2YHWA 1LOTB 4B1WB 3UE5A 4IO8A 1BDGA 4EHTA 1XQSC 5LY3A 4BC3A 4NO7A 4H0PA 4FWLA 4FPBA 3UKRB
chains in the Genus database with same CATH superfamily

4M63C 3V9SA 4HCBA 4DMNA 1OVQA 3MN7A 2IVOA 2V7YA 2D56A 4GNIA 5EVZA 5HRSA 5AQMA 5GIOA 3SPYA 3I33A 3CPWM 2R7YA 2YNGA 4KTWA 1NGBA 4DF8A 3CFRA 4FK2A 4FWKA 4EP5A 4H4MA 2O8EA 3KTQA 3AARA 1LAWA 4NB4A 1S6QA 2ZJQL 4JI0K 2UUAK 3JAMO 2E1YA 4AM6A 2PBDA 2B68A 3DM2A 2HHSA 2WTUA 4JI3K 2FSNA 3A2FA 3CQXA 4Z4HA 1ATSA 3P4IA 4HWIA 1YJNN 3CJ1A 1VRTA 2HF4A 4AEIA 4IOCL 1U4BA 3SF4D 1ATNA 3GBTA 3AVJA 3TU5A 1ZBHA 1GLJO 4KHQA 4FL9A 3OS0A 4KFBA 1L3SA 4DQSA 3M8SA 1RCHA 2VQEK 2VGMA 4EZ9A 2N2RA 3OYNA 1ZVEA 2YI1A 3NMUA 3QBXA 4KI4A 1VSEA 2G8FA 4O44A 1S1XA 3O08A 4OKJA 1Q9YA 1GOBA 4ELVA 4FJIA 4H5NA 4RCHA 3CCEN 4BG9A 3TANA 2NNWA 4CJRA 4CZFA 2ZJRL 2NZTA 5EXWA 1RBUA 2XY8A 4RW6A 4FM1A 1CN2A 3RWUA 3IG1A 3CJAA 3CC7N 3FZKA 3CI5A 4H0VB 2AP1A 1Q18A 2GBZA 1S22A 4LF8K 1H1VA 4IZ9A 4OLBA 4I2QA 4YORA 4DTUA 3K0SA 1LQHA 3QEXA 3TAEA 2F9TA 1HKBA 1N6QA 3IDHA 4KI6A 4WQ5A 1RT4A 2IOCA 5KGWA 3VETA 3ZSVA 4NLBA 2NY8X 2P9IA 4NCBA 2VG5A 3AA5X 3QDKA 3HOTA 1X9MA 3SMPA 3WT0A 4Z4EA 3CD6N 3THYA 2OTLN 4PL8A 2YC1C 4FJHA 4FWQA 2QA4N 4Y1CA 1D5AA 3KLEA 2KQ2A 3G6EN 1EO1A 3O5BA 4FWMA 2YNFA 3L2QA 4HTLA 3QB0A 3O4WA 3GG4A 1HNVA 3HPHA 5AQJA 3NGZA 4CHZA 3DLLL 1KSPA 3P38A 4DWIA 4UJ0A 1NJWA 1IJJA 2NRHA 3MCAB 2E8AA 4N76A 4YOXA 1BGXT 3FE1A 3SZ2A 1IV0A 4CZGA 3RRHA 3G0ZA 1JZAA 3OYIA 1ASWA 1ZBUA 4FLYA 4HUGA 1NGCA 1T6CA 3C7NB 1W97L 4DFPA 3AVFA 4A62A 4H8KA 4JI8K 3SYZA 2CH5A 2C1GA 3FGUA 4DQ8A 3ATVA 2BGGA 4EHUA 1HPZA 4NCGA 4A57A 4UY8O 2D0BA 4FK0A 4BDYA 4H5WA 1Q7YO 1TL3A 3OHRA 1POIA 4JI1K 4CJ7A 3OYEA 1M90O 3E9LA 1T0ZA 3WXMB 4W5RA 3SCXA 3NGYA 4IDHA 3CQ8A 3MX2A 2E6LA 1K8BA 1VQKN 1ZYVA 2M8BB 1YF5L 3U9ZA 3RSEA 3BZKA 1C56A 4W5OA 1BHLA 1EX4A 3P5JA 3IAYA 2O8FA 4M41A 3BZCA 1T8EA 2ASOA 1VQ7N 4JKHA 3QIOA 1JCGA 4JI6K 2P9UA 2QTDA 4FLWA 4NXNK 3VTHA 4B9VA 2O8CB 3ZEUB 3E9OA 3NVKA 3WXKA 1BA1A 5C0YA 3D6RA 2GUPA 4GV9A 5M1PA 1YJ9N 2P51A 1VSIA 3C6TA 1UAXA 1VNBA 4DV1K 1FKPA 4CJPA 4ELTA 1RGIA 2OZMA 4FOEA 1KVAA 3J81O 3BY5A 5CY0A 4HCCA 4OLAA 1FK9A 1GPSA 2QM1A 4GW6A 4AHUA 3OY9A 1X3NA 1PX9A 4JEPA 1TYQB 3HM8A 2LR3A 2NRXA 2Q31A 5M1NA 4C23A 4DU3A 1DTQA 4CHYA 3O8MA 4MLEA 1NLVA 4M7XA 1X9SA 4CHQA 3J7ZO 2HMIA 2KHOA 4YDUA 2QWNA 1HQUA 3KHWA 1GLFO 4FOIA 1VQ4N 3BEXA 4BACA 3ULDA 4OX9K 2QKBA 3NHGA 4BC2A 5AQYA 2BTFA 4Z94A 5BPNA 3KKRA 4JKCA 3MWTA 1TKXA 3IFRA 3HZ6A 3QEIA 3ZT1A 3VMFB 3WEEA 1T3VA 4JKGB 4FZXC 2EWSA 4BEBA 3CYGA 3F9KA 4PKHA 1HJOA 4R79A 1J5EK 4HUEA 2YBRC 1EP4A 2YCHA 1VQNN 2KLAA 2YEOA 2D4WA 3LWLA 4E3SA 3MN9A 3THVA 1PE4A 3HP6A 4DLEA 3M5RA 4A5BA 1X9WA 1KFSA 2JDQD 3SPZA 1IKVA 3L56A 2GMOA 3AO3A 1WN7A 4G9ZA 3SUOA 1BQNA 5F1XA 4ISGA 4OGEA 1XI1A 1BWFO 4JI5K 1JCEA 2VY6A 2P1JA 3ZSOA 4DR6K 3PLAA 5AQXA 3QESA 4WCEL 1P90A 4ILGB 5CY4A 3AVGA 1JJ2M 2P9PB 1C1CA 1LWFA 2O8DB 4YFUA 1NG9A 1X1PA 2W41A 4JHDA 5HL7L 4FJMA 1L5UA 4E89A 1JL1A 1IBMK 1W7AA 4MFBA 3QO9A 3U3YA 1WSGA 2NLXA 4F4KA 4FJ9A 4CZJA 3LWMA 5BRDA 1TYQA 1I39A 1NRAA 4WQ4A 1KXPA 3LP3A 4YOVA 2YNHA 1QQCA 2CGJA 4DTNA 1KD1O 4QCLA 1P00A 4W5NA 2N69A 3VF4A 4BE0A 4FXDA 3ULEB 5CE3A 1RDDA 4JD2B 5TKWA 3BP8A 1NMNA 1WSJA 1S6PA 2E2OA 5KRSA 4DTSA 1JLGA 2E6MA 3CJBA 4K8ZA 2F96A 3HXMA 4CGJA 3ZSWA 1OZZA 4H4OA 1N33K 3OYFA 2A1RA 1ZBFA 3NH0A 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2WBNA 3ZETA 4DU1A 1ICAA 4KHPK 2W40A 1DTTA 4C8LA 3DXMA 2HVIA 1S5JA 4I9LA 3LM2A 4CJQA 3ZT3A 1HR0K 4DR4K 4BRLA 3JSMA 2YILA 1R0AA 5AFUH 4CJ3A 5KRTA 5C42A 4JAXA 3QFUA 4AHCA 5KPTA 4CEEA 3MN5A 3CMEN 1RTHA 4K42A 3VEWA 3AO1A 2KBKA 3KP1A 1GOCA 4A2BA 3HO1A 3L8BA 4EP4A 1UA1A 4CHPA 1SKWA 5CYMA 5H1SQ 3DLRA 1BCGA 2KSKA 4O4GA 2HB5A 3RMAA 1K73O 4DV3K 3HM9A 4HTUA 1NKCA 3NF9A 3DXKA 4BVPA 4DQPA 3S9HA 1HMVA 3VQEA 2ASMA 4WQ5C 5CZ1A 4HE7A 2FBVA 3OA9A 2QK9A 3KP0A 4H0YB 4DFKA 3S3NA 5A2QO 1C6VA 3THXB 2DFHA 3NF8A 1BG3A 4QS7A 4KHYA 3VEVA 4CK3A 4OKKA 2HOEA 1C0FA 2XHBA 4IG0A 3LDPA 4A61A 2A1SA 1OH8A 3ZX0A 1RDUA 2ZQBA 1SL1A 4KH6A 2X74A 2XRIA 4AB0A 3GDQA 1BL3A 3T1HK 5AQPA 5AZJB 4C1NI 3RTVA 5EX5A 1TKZA 2BUPA 3DRPA 3TSQA 1E3MA 2NRZA 2MBKA 1BOTO 4E72A 1XUPO 2D0PA 1HPMA 3MK6A 4R5PA 3FZFA 2X78A 5GAEP 3SQ1A 5CYQA 1NM1A 4B8AB 4FJ8A 3E7RL 1NU0A 4BDZA 4CK1A 1EKEA 1LCUA 1JLFA 3C6HA 1W0HA 1RT6A 1VSKA 1JXBA 1D4XA 3OJUA 1XWLA 3O6WA 2IC3A 1T1TA 3AVKA 3ZT0A 3MEDA 1X3MA 2DPNA 3SAGA 2HSTA 3AAQA 2VQFK 4BRCA 3AGKA 1KCFA 1N5YA 1BI4B 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4M63 C;  3V9S A;  4HCB A;  4DMN A;  1OVQ A;  3MN7 A;  2IVO A;  2V7Y A;  2D56 A;  4GNI A;  5EVZ A;  5HRS A;  5AQM A;  5GIO A;  3SPY A;  3I33 A;  3CPW M;  2R7Y A;  2YNG A;  4KTW A;  1NGB A;  4DF8 A;  3CFR A;  4FK2 A;  4FWK A;  4EP5 A;  4H4M A;  2O8E A;  3KTQ A;  3AAR A;  1LAW A;  4NB4 A;  1S6Q A;  2ZJQ L;  4JI0 K;  2UUA K;  3JAM O;  2E1Y A;  4AM6 A;  2PBD A;  2B68 A;  3DM2 A;  2HHS A;  2WTU A;  4JI3 K;  2FSN A;  3A2F A;  3CQX A;  4Z4H A;  1ATS A;  3P4I A;  4HWI A;  1YJN N;  3CJ1 A;  1VRT A;  2HF4 A;  4AEI A;  4IOC L;  1U4B A;  3SF4 D;  1ATN A;  3GBT A;  3AVJ A;  3TU5 A;  1ZBH A;  1GLJ O;  4KHQ A;  4FL9 A;  3OS0 A;  4KFB A;  1L3S A;  4DQS A;  3M8S A;  1RCH A;  2VQE K;  2VGM A;  4EZ9 A;  2N2R A;  3OYN A;  1ZVE A;  2YI1 A;  3NMU A;  3QBX A;  4KI4 A;  1VSE A;  2G8F A;  4O44 A;  1S1X A;  3O08 A;  4OKJ A;  1Q9Y A;  1GOB A;  4ELV A;  4FJI A;  4H5N A;  4RCH A;  3CCE N;  4BG9 A;  3TAN A;  2NNW A;  4CJR A;  4CZF A;  2ZJR L;  2NZT A;  5EXW A;  1RBU A;  2XY8 A;  4RW6 A;  4FM1 A;  1CN2 A;  3RWU A;  3IG1 A; 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1NGCA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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