1NGDA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFNVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
source organism Bos taurus
total genus 120
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngdA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngdA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngdA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngdA04
1BA0A 3FZLA 1XQSC 3SMPA 1H1VA 3HM8A 3CQXA 1LCUA 2KHOA 3D2FA 1Z05A 2GWJA 3DXKA 1QQOA 4BRLA 2BTFA 2D0PA 2ASOA 1LOTB 3CJCA 2IVPA 4BROA 4FWSA 4FPAA 3WEEB 3WXKA 2EWSA 1ATSA 2Q0RA 3ZEUB 2AA4A 3WXLA 5AQLA 1HKCA 2ZWHA 4O5FA 2QWPA 2FSNA 1YVNA 2FXUA 4DQ8A 5AQKA 3QDKA 3CJ1A 1YXQA 2P9IB 5ELZA 4EHTA 3GE1A 1GLFO 3OHRA 5KQ8A 4XEIA 5EX5A 5AQSA 3O6WA 1NGIA 2H3GX 1C0FA 4H5VA 3IMXA 3J8AA 2P9KB 2HF4A 3G25A 4FWKA 3VEZA 3A5LC 3C0BA 5FPMA 3EL2A 4FPBA 5FPEA 5BRFA 3KVGA 2GWKA 1NGHA 3GL1A 2Q97A 4A61A 4CZFA 3IUCA 1BWFO 2A42A 3CI5A 4BVOA 5BPMA 2P9SA 2P9NB 3L4IA 2D4WA 5JICA 3VGKA 2QWRA 3ATVA 4M7XA 3DAWA 3VEXA 2ASMA 3CJBA 3FZFA 2FSJA 1QZ5A 1EQYA 1ZXOA 1C0GA 4AM7A 1NGBA 2Q36A 5BN8A 3ATUA 2P9LB 1ZC6A 4H0VB 4JD2B 4CZGA 3QB0A 1ATRA 3LDLA 2HOEA 3CETA 3ID8A 5TKYA 5AQXA 4XH4A 3R8EA 3B8AX 4Y0WA 3RSEA 3UB5A 1HLUA 4K42A 5ADXH 4BRIA 1X3NA 1X3MA 5KPZA 2W41A 1DGKN 3LDOA 2YCHA 2VYPA 1IG8A 3VGMA 5AZIB 5AQOA 1GLEG 3ENHA 3ZETB 2WUSA 3A8YA 2Q31A 5AQPA 3R9PA 2CGKA 2CH6A 1WUAA 4CZIA 1NM1A 1NGGA 4JHDA 4B1WB 5AQVA 3AAPA 4IO8A 3O4WA 3QFUA 3A5NC 2QW9A 3MK6A 2YHXA 1GLJO 3VF6A 1QZ6A 4H0TB 4J8FA 4BQZA 1TUUA 4EIAA 2VCPA 2OANA 3UE5A 3WUHA 4E1JA 3D2FB 3WXJA 4NO7A 2NLXA 2QXLA 5JLHA 4I6MA 3DXKB 3H3NO 3WXIA 1JCGA 2HMPA 5AQGA 3M3ZA 2IVOA 5BRDA 5KQDA 3QICA 4CD3A 3DXMA 4FWNA 4BREA 2W40A 1BDGA 3H1QA 5F1XA 1T6CA 2E1ZA 1NGDA 4CZKA 3FZHA 1T6DA 2QWOA 5B8HA 3UKRA 4RTFD 5KPTA 4BR5A 4YDUA 4FWLA 1HPMA 4FSVA 5AQUA 1NGFA 5KPRA 3QFPA 3WQTA 3JXUA 4XH1A 1NGAA 4XH5A 5EY4A 3HZ6A 2FSKA 4M7YA 4BRGA 4BR2A 5CE3A 3HBTA 4BRMA 1HJOA 4H5TA 4RCHA 4B1YB 4QS8A 1E4GT 5LJVA 2I7PA 1KXPA 4BRDA 3L6QA 1KAYA 2P9SB 3H46O 3VESA 2YI1A 2HF3A 3QBWA 1HKGA 3VF4A 3EO3A 1GLCG 5FPDA 3MN9A 1NWKA 2I7NA 3MN7A 3KZBA 4FWOA 3GDQA 3SMSA 1XUPO 2YJFA 5AQYA 1DEJA 2J4RA 4Z94A 2VWBA 3H45C 4GY2B 1V4TA 3W3DA 1NLVA 3VEVA 4BG8A 5AQFA 3VF2A 3MDQA 1S22A 4FO0A 1HUXA 2A5XA 1MWMA 5AQWA 1JCEA 4BRCA 3MCPA 3A5OC 5AQQA 5F2RA 4PKIA 3VOVA 3UKUB 4BC5A 4ISFA 4MLEA 2CGJA 5I9EB 4IWVA 2UYTA 5BN9A 4O8KA 1SAZA 3O80A 1MWKA 4K41A 4BC4A 5AQNA 4WQ4A 1OKJA 2QM1A 2E88A 2ITMA 4BRKA 1P8ZA 4A62A 4BRHA 3C7NB 4MLHA 2YHWA 4IJNA 2QWNA 4H5NA 1HKBA 3FLCO 4CZHA 3AARA 4WQ5A 3HTVA 2A3ZA 1Q18A 4BR9A 1GLLO 3ZEUA 3LL3A 3QBXA 4IXCA 3EKSA 4FOEA 2CH5A 3L0QA 2E2PA 4CZMA 2V51B 1S3XA 1JCFA 4K25A 2P9UA 3FGUA 2GEMA 2ZGZA 2P9IA 1T44A 4BGAA 5AZJA 3AAQA 5AQRA 3D2EA 1SQKA 3EKUA 4ISEA 2Q1NA 4B1UB 1BO5O 5AQMA 1KAXA 3JS6A 1Z6RA 2P9PA 1NMDA 4FL9A 3U8XA 2D0OA 4IJAA 1U6ZA 2PAVA 4BRFA 3LDQA 3UKRB 5AQTA 3M1FA 5EOYA 4BR4A 3O08A 3U9DA 2BUPA 2YHYA 2QWQA 1ZBSA 1RFQA 3VEYA 2V7YA 3ZX3A 3BEXA 4BGBA 2D1KA 4K43A 5AQHA 1V4SA 4BRQA 4BRPA 1BOTO 3A0IX 3FZKA 4A2BA 1RGIA 4H0PA 4F9OA 4JAXA 3HI0A 3BUZB 1GLDG 3SJHA 5BPLA 1NGCA 4H0YB 3O8MA 3R6MA 5BR9A 4HWIA 5BREA 4BQLA 3ZETA 4H0OA 5E84A 2GTDA 3ULEA 2ZGYA 1ESVA 5E26A 4RWTA 2AP1A 4BVPA 4PKGA 5FPNA 1QHAA 5EVZA 2PBDA 3O1BA 3KHYA 2A41A 3BF1A 2FF6A 1U2VA 3WT0A 3O5BA 2QWLA 4A2AA 3D7EO 2ZF5O 4EFHA 3CJAA 1KAZA 4WQ4C 1RDWX 3A5MC 4B1XB 3I33A 4H0XB 3VEWA 1TYQA 2GELA 4WQ5C 3LDPA 5AQZA 3CERA 2IIRA 3CJ7A 1Y64A 4CZJA 4H5RA 3FR0A 3ZX0A 4BG9A 2F9TA 4PL7A 1BG3A 4KBOA 1BA1A 5LY3A 2E1YA 1GLBG 2Q0UA 1GLAG 3RSEB 2YJEA 2E20A 1K8KA 3WQUA 3CHWA 4FOIA 3SLCA 2GUPA 2P9UB 3QMLA 3VETA 1IJJA 3I8BA 4BR7A 2F9WA 3FFKB 5LJWA 3U4LA 5AZJB 4DCHA 5BRHA 1CZAN 3D2EB 2QWMA 2NRHA 1SZ2A 4CBXA 1NGJA 1D4XA 4IZ9A 2P9PB 3TPQA 4DHYA 4JHDB 3WEEA 5BPNA 5F0XA 2FF3B 4B1VA 1J6ZA 4FWQA 4MO4A 3FE1A 3U9ZA 3LM2A 3CIPA 5AQIA 2A6AA 5AQJA 2FLOA 2IVNA 3ZX2A 3TU5A 1TUYA 1BU6O 3MN6A 3HSCA 4CZLA 3CJ9A 3GOIA 4BC3A 4JNEA 4H03B 5EXWA 3H6EA 2E8AA 5JMVA 4B1ZA 5ADXA 4PL8A 4AM6A 3VPZA 4I6MB 4JN4A 2P9KA 4QS9A 4CD1A 1BUPA 3LDNA 4YDUC 4GNIA 2E2NA 4LC9B 4QS7A 3DXMB 4CBUA 3DWLA 1E4FT 1XC3A 3O1WA 2ASPA 4HTLA 1MA9B 4DB3A 4ISGA 1WOQA 2P9NA 4CBWA 4MO5A 3BF3A 3UKUA 3DJCA 4L3QA 4EAHD 3CQYA 3ENOA 3IDHA 3ULEB 4FWPA 4BR0A 4C23A 1QQNA 3MN5A 4M63C 2V52B 4FWRA 4BC2A 4BRNA 2E2QA 2P9LA 3M6GA 1NGEA 3C7NA 1YAGA 1HX1A 1QQMA 4JD2A 3P4IA 1U2VB 3VGLA 3AY9A 1R59O 4CJ7A 2NZTA 4WYBA 2DPNA 3VERA 3GBTA 2A40A 4CI6A 4B9QA 2Q2RA 3IFRA 3VEOA 5AR0A 1TYQB 3F9MA 5JLFA 3MMVA 1X9JA 5AZIA 2E2OA 4H5WA 3GG4A 5AFUA 1ATNA 2CGLA 1G99A 3EN9A 4BRAA 3W0LA 3S41A 2V7ZA 3FZMA 1DKGD 3VENA 3H3OB 4PKHA 4CZEA 4FWMA 3LM9A 3EZWA 1YUWA 3SK3A 4EHUA 3H1VX 5AFUH 4NB4A 1MDUB 1K8KB 1NBWA 3BP8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K5MA 4KO0A 1BA0A 1RTIA 1IBLK 1S1UA 2X74A 1PTXA 3KD1E 1N8RO 1SS6A 2NY9X 3TAPA 1LCUA 1BQMA 3AA3A 2D0PA 1LOTB 4WFBL 2IVPA 1CZ9A 4B8AB 2WOMA 3WEEB 4RW9A 3M8QA 1P90A 4EP4A 1D9DA 3ZEUB 4K0KK 2XY5A 2Z1JA 5AQLA 2ZWHA 4DQ8A 2DFFA 1RDUA 1NJYA 3HK2A 3QDKA 4R5PA 1VSJA 1WSFA 5AQSA 2YC1C 1NGIA 1J54A 1RBRA 1C0FA 4H5VA 3IMXA 3J8AA 4PUOA 4KTZA 3CM5A 5J1EA 3O9UA 4WFAL 4C8KA 2HHUA 1Q86O 5BRFA 4MDBA 2GWKA 3TR8A 3AVGA 5CR4A 3S9HA 3IUCA 1VQPN 4Z4EA 1B92A 3KOYA 4EP5A 3SAHA 1NK5A 1U48A 3DAWA 1WSHA 1NK6A 2FSJA 3E1YA 4DR5K 3CC2N 3TTCA 1ZXOA 1R0AA 4BY9C 1S9GA 2LJ7A 1T7AA 2P9LB 4H0VB 4FJMA 1VSFA 2PYJA 2B4JA 5TKYA 4E7HA 3DLGA 4K8ZA 3B8AX 4FW1A 3OYMA 4K42A 1SEGA 2YNHA 4BRIA 2F7TA 2X6NA 3THVA 1A5XA 2YCHA 2VYPA 3AO2A 1EWRA 3DOKA 2HHQA 3ZETB 2KBKA 5AQPA 3OJUA 4OKJA 4A5BA 2LSNA 4W5TA 1WUAA 4CZIA 1VQ6N 3SI6A 4CEZA 1LQIA 1D5AA 1JZAA 3AAPA 4CQKA 3K57A 4FZYA 2KJAA 3KP0A 4GVEA 1HNXK 3OVNA 4NLCA 1MR4A 3LP2A 3LZJA 3O9SA 4FW2A 4OX9K 5M1FA 4FK2A 1YJNN 4E7LA 2NLXA 5JLHA 4F2SA 3H3NO 4UY8O 1IBKK 1VSDA 4DG1A 2HMPA 2OTLN 1AYJA 3QIOA 4XJXA 2IVOA 4V19S 3AVMA 3O4NA 5KQDA 4BREA 4JEPA 1T6CA 1RTHA 2E1ZA 5HRNA 3UKRA 4O8UA 4FWLA 4UQGA 1RTJA 2Z1GA 3KKRA 1RBTA 3VQEA 3QFPA 3Q7BA 4FK4A 4FYDA 1LWCA 4DFPA 4XH5A 2YV0X 4I7FA 1GPTA 4BRGA 4E3SA 3HBTA 4BRMA 1L3SA 3KTQA 4IDKA 1EX4A 4DU4A 4DSKA 4FXDA 4FJHA 1KAYA 1U4BA 3CFRA 3R2VA 4DQSA 4DF4A 2HF3A 5KGWA 4AQYK 4M41A 1XC9A 5KI6A 2I7NA 1YHQN 2I61A 3KZBA 2KYQA 4FWOA 3SMSA 5AQYA 4CJFA 4CF1A 1ICAA 1XWLA 4CEOA 4CJQA 1NK7A 4X66K 4LF7K 3VF2A 1RBSA 2DFEA 3L3UA 1MWMA 4BEBA 1JCEA 4N5SA 1Z25A 2JWLA 4DUZK 3A5OC 3KLIA 3A2FA 1HYVA 1IO2A 2UYTA 1SAZA 3O80A 3VQDA 3BZCA 2O8BB 5HBMA 5C42A 4WQ4A 2O4IA 1OKJA 3MXJA 1W97L 4CJ4A 1Q9YA 4DTXA 3SAGA 1OH5A 3M8RA 4BRHA 2YHWA 4YORA 2DFHA 3KLFA 2QWNA 3S5TA 3OYNA 4WQ5A 3N4PA 3HTVA 2A3ZA 4JKAA 3ZSQA 4JK7A 3JAMO 4M3WA 3LL3A 3QBXA 2FC0A 3CW4A 2V51B 1S3XA 1NPIA 4BGAA 3AAQA 4GV9A 3EKUA 4BE1A 1A5VA 4CJKA 1BO5O 3R3LA 1T7EA 1WLJA 5AQMA 1DLOA 3JS6A 3QINA 4KRFA 1REVA 4PY5A 2OPRA 1T7BA 2XRIA 3SUPA 5AQTA 3M1FA 3ZSXA 2BUPA 1JLBA 1I2VA 4MDAA 4O4GA 4FJJA 4DSFA 4JS5A 3ZX3A 3BEXA 1L4VA 1BOTO 4A2BA 1RGIA 3M5RA 1QQCA 4C1NI 2E5LK 4KH4A 4F9OA 1BCOA 1XHXA 1ASVA 3HI0A 3MX2A 3T1HK 3NGZA 1J5EK 1C0TA 3O8MA 3DRSA 4OPHA 3V4IA 3T19A 1NKBA 2HHTA 1X1PA 4KTQA 3LALA 4JI0K 5E84A 2GTDA 3ULEA 2ZGYA 3C6AA 2KBJA 2LJMA 3NBPA 4HUFA 4ELVA 2AP1A 4BVPA 5FPNA 4PWDA 1HQEA 1JKZA 1VRUA 2PBDA 3MCAB 1F21A 3HPGA 3KLGA 1U2VA 3WT0A 3CCSN 4DUYK 3C6UA 3V9XA 4C8OA 3OYJA 3LANA 3BDPA 1RDWX 3V1QA 3VQ9A 4B1XB 4H0XB 1NH5A 2GELA 5AQZA 4DTUA 3CERA 1ZYWA 1Q8IA 2P1JA 4CGHA 4BACA 1KLNA 4KBOA 3RR8A 3QETA 3K0SA 3QNNA 2F4VK 2E1YA 3AVKA 3OBYA 1RCHA 1FKOA 2YJEA 3OYGA 3CHWA 1O13A 4FOIA 3SLCA 2YIPA 3I8BA 3LPUA 4BR7A 3ZT2A 1SL2A 1WNSA 3IRXA 4CESA 4DFJA 4DR4K 3QEIA 3OYKA 3TAFA 1W7AA 5DMRA 3KLEA 4CFAA 2P9PB 4FZZA 5C10A 1VRTA 3WEEA 4CJVA 4B1VA 4MO4A 2KZZA 2HVHA 3LP3A 2A6AA 3P31A 3ZX2A 2KFZA 3KK3A 2KGQA 2RF2A 4B9UA 4BC3A 4JNEA 5EXWA 1NJWA 1VHXA 4B1ZA 2MBKA 3CF5L 4PL8A 2QXFA 3VPZA 1VQKN 2JLEA 4CD1A 1ZBHA 3SBGA 4CEAA 4ILJA 4FLUA 1YTAA 3BZKA 4GNIA 3CCVN 1J5OA 4KYPA 3DLRA 3C6TA 2KZMA 2XY6A 4LFCK 3UKUA 5C12A 1QSSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3K5M A;  4KO0 A;  1BA0 A;  1RTI A;  1IBL K;  1S1U A;  2X74 A;  1PTX A;  3KD1 E;  1N8R O;  1SS6 A;  2NY9 X;  3TAP A;  1LCU A;  1BQM A;  3AA3 A;  2D0P A;  1LOT B;  4WFB L;  2IVP A;  1CZ9 A;  4B8A B;  2WOM A;  3WEE B;  4RW9 A;  3M8Q A;  1P90 A;  4EP4 A;  1D9D A;  3ZEU B;  4K0K K;  2XY5 A;  2Z1J A;  5AQL A;  2ZWH A;  4DQ8 A;  2DFF A;  1RDU A;  1NJY A;  3HK2 A;  3QDK A;  4R5P A;  1VSJ A;  1WSF A;  5AQS A;  2YC1 C;  1NGI A;  1J54 A;  1RBR A;  1C0F A;  4H5V A;  3IMX A;  3J8A A;  4PUO A;  4KTZ A;  3CM5 A;  5J1E A;  3O9U A;  4WFA L;  4C8K A;  2HHU A;  1Q86 O;  5BRF A;  4MDB A;  2GWK A;  3TR8 A;  3AVG A;  5CR4 A;  3S9H A;  3IUC A;  1VQP N;  4Z4E A;  1B92 A;  3KOY A;  4EP5 A;  3SAH A;  1NK5 A;  1U48 A;  3DAW A;  1WSH A;  1NK6 A;  2FSJ A;  3E1Y A;  4DR5 K;  3CC2 N;  3TTC A;  1ZXO A;  1R0A A;  4BY9 C;  1S9G A;  2LJ7 A;  1T7A A;  2P9L B;  4H0V B;  4FJM A;  1VSF A;  2PYJ A;  2B4J A;  5TKY A;  4E7H A;  3DLG A;  4K8Z A;  3B8A X;  4FW1 A;  3OYM A;  4K42 A;  1SEG A;  2YNH A;  4BRI A;  2F7T A;  2X6N A;  3THV A; 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