1NGFA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFNLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
source organism Bos taurus
total genus 121
structure length 382
sequence length 382
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngfA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngfA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngfA04
1GLAG 3O4WA 3UKRB 3QFUA 3SJHA 3IDHA 5AQHA 3WXKA 2E1ZA 4MO5A 3M1FA 2CGJA 3A5NC 5AFUH 3VEVA 3FE1A 2P9IB 1HLUA 4IO8A 4PL8A 3DXKB 3QICA 4A61A 4MLHA 2BUPA 1NGHA 4O8KA 4I6MB 3GE1A 4FWOA 1KAZA 4B1UB 1MWKA 3IFRA 1IJJA 4Z94A 3IUCA 4BR9A 3VEOA 5AQWA 2YI1A 1HJOA 1ZC6A 4YDUC 2P9NA 4CI6A 5FPDA 3HTVA 5F2RA 1NGFA 4BQZA 3EKSA 4BRIA 4CBXA 4PL7A 5F1XA 5AZIB 2E2NA 3IMXA 1T6DA 3U9ZA 3H3OB 1D4XA 1GLDG 3GBTA 1NWKA 3ZX2A 1DGKN 3D7EO 3S41A 4FWPA 2NZTA 1NGCA 5AQMA 3MK6A 2FXUA 3WEEB 5FPMA 1XUPO 5EOYA 4B1XB 4CJ7A 4BVPA 3VETA 2P9SA 3FZFA 5AQTA 3WXIA 3ENOA 3DWLA 1GLLO 1BWFO 1E4GT 3UKUA 4NB4A 2GELA 3U8XA 3LDOA 3HM8A 4LC9B 3L6QA 2ZGZA 1BA0A 2YCHA 3KZBA 3RSEB 2UYTA 2D1KA 4GY2B 3TU5A 2Q31A 4H03B 3SMSA 1YUWA 2QWNA 3VGMA 5BREA 4BRLA 5JMVA 4WQ4C 3CERA 3H46O 1HKBA 3CIPA 3FZKA 3F9MA 1NGJA 2ASMA 1H1VA 3CQXA 3FFKB 4GNIA 3ULEB 1CZAN 2ZWHA 3EZWA 3A5MC 2D0PA 5AQKA 2E20A 2A5XA 4FWQA 1SZ2A 3UKRA 4BR4A 5BPLA 3DJCA 4K43A 4BRMA 5EX5A 3MCPA 4BRKA 4H0PA 4EHTA 1C0GA 3KHYA 4B1ZA 5AZJB 2VYPA 4BC2A 5EVZA 4L3QA 2VCPA 4H5WA 4B1YB 1BU6O 1WUAA 4H0YB 1GLBG 3WXLA 4JD2A 3VEZA 1BOTO 3BEXA 3VF6A 2V7ZA 2KHOA 2P9LB 3ZETB 5ADXA 2BTFA 2V7YA 5BN9A 4PKHA 1LOTB 1DKGD 1ATSA 4AM6A 3AY9A 2V51B 3MN9A 1RFQA 4H5VA 3C7NB 4ISFA 1LCUA 2ZF5O 5BRDA 1P8ZA 3A5LC 3CI5A 4H5TA 4PKGA 5AZIA 2GWJA 1T6CA 1TYQB 4BR7A 5LY3A 2E2PA 5LJWA 1K8KA 3MN7A 3WXJA 2I7NA 1WOQA 2QWMA 4RWTA 4HTLA 3MMVA 3ZX0A 1HKCA 2FF3B 3SK3A 3B8AX 2FSKA 3LDLA 3BF3A 4CZJA 4CZKA 1QQOA 4JHDA 4BRFA 4WQ4A 5AQIA 1MDUB 3LM9A 1R59O 5BR9A 3LL3A 2PAVA 3VEWA 2VWBA 4BRGA 5BPMA 3ATUA 1EQYA 4KBOA 4NO7A 5JICA 5BPNA 4H0XB 2QXLA 3GL1A 2AP1A 3D2EB 3AARA 5JLHA 4H5RA 1Z05A 2CH6A 4QS7A 3CHWA 4A2AA 4BRHA 2NRHA 2V52B 3M6GA 3TPQA 3WQUA 4BRDA 3AAQA 1S22A 4FWSA 3FZLA 3ULEA 3W0LA 5AR0A 1NGIA 4F9OA 5AQFA 2P9UA 4C23A 4BR0A 1NLVA 3FZMA 2P9KB 3VERA 2GEMA 1U2VB 4CZMA 5AZJA 1QZ6A 3CJBA 1TUUA 4BRNA 3DXMB 4M7YA 1X3NA 5AQNA 5ELZA 5AQYA 3U9DA 1NGAA 1GLFO 3H6EA 3O1WA 4BR5A 4ISEA 3AAPA 4H0VB 5BRFA 4Y0WA 2Q1NA 3D2FB 2A41A 3MN5A 4CZIA 2CGLA 2QW9A 3ZEUB 3EL2A 1QQMA 4FPAA 1RDWX 4E1JA 3R9PA 4EAHD 3QDKA 3M3ZA 1KAXA 1HUXA 2NLXA 1SAZA 5AQPA 5F0XA 1YXQA 2EWSA 3WQTA 3HI0A 2D4WA 2D0OA 4WQ5C 3VGKA 4FWMA 3FR0A 2E1YA 4BC3A 5AQZA 3A0IX 2P9IA 3VGLA 2A42A 4BG8A 4BQLA 4A2BA 4EHUA 3WUHA 5I9EB 2A3ZA 3DXKA 2QWRA 5AFUA 1V4TA 3LDPA 4IJAA 2ZGYA 4FO0A 1QQNA 1BA1A 2E2OA 3CJ7A 3VOVA 4MLEA 2AA4A 1NBWA 4I6MA 4O5FA 1BO5O 2W41A 3LDQA 1QZ5A 3JS6A 4RTFD 3VEYA 3ID8A 4CBWA 4EIAA 1X9JA 4XH1A 2YHXA 4DB3A 2Q2RA 4K42A 4K41A 2CGKA 2W40A 1YAGA 4M63C 1KAYA 2HF3A 1IG8A 2YHWA 3U4LA 4XH4A 3GOIA 4BVOA 4JN4A 4DHYA 4CBUA 3O80A 3ZX3A 5AQLA 2YHYA 5EXWA 3VESA 3ATVA 1G99A 4FWNA 3W3DA 4JNEA 3CJ9A 2QWLA 4ISGA 4B1VA 2Q97A 1C0FA 2P9PB 4QS9A 4B1WB 3QFPA 2A6AA 1YVNA 5CE3A 4BRQA 3WEEA 3L4IA 3GDQA 1Z6RA 2ASPA 2Q0RA 2FF6A 4BR2A 3VPZA 4FWKA 4JAXA 3J8AA 3QB0A 5E84A 2P9KA 5FPNA 2GTDA 4FWLA 4BREA 3H45C 1U2VA 2ITMA 3FLCO 4AM7A 5JLFA 3I8BA 4DQ8A 3QBWA 3QBXA 3RSEA 3VEXA 3O1BA 2IIRA 3DXMA 5BRHA 4BGBA 3HZ6A 3CJ1A 3UB5A 3SMPA 4JD2B 5KQ8A 5AQJA 2FLOA 1TUYA 5ADXH 2Q0UA 4WQ5A 4FPBA 2HMPA 1SQKA 1NGBA 3CJCA 4A62A 3D2FA 2F9WA 1GLJO 3ZEUA 2E8AA 1Q18A 4BGAA 2E88A 1J6ZA 5TKYA 4IZ9A 5EY4A 2FSNA 2H3GX 2CH5A 3EN9A 3VF2A 5AQVA 4XEIA 1OKJA 1ATNA 4H0OA 1Y64A 4H0TB 1ZBSA 3LDNA 1K8KB 4MO4A 4IJNA 3G25A 5AQQA 2A40A 1ESVA 2HOEA 3MDQA 4IXCA 3A5OC 3CQYA 4IWVA 1JCEA 1GLEG 5KQDA 1XC3A 4WYBA 1E4FT 1V4SA 3LM2A 4FWRA 3SLCA 5KPTA 4M7XA 1U6ZA 2IVNA 1T44A 4JHDB 4FOIA 1HKGA 2IVOA 5AQGA 3O5BA 2P9LA 3WT0A 3A8YA 3H1VX 5AQXA 3ZETA 4BRCA 4DCHA 4CD3A 2WUSA 4BRAA 4FL9A 4CZHA 4H5NA 4FSVA 3KVGA 2PBDA 3C7NA 1DEJA 4QS8A 2P9NB 4FOEA 5AQSA 3O8MA 1S3XA 1JCFA 1X3MA 1MWMA 3BP8A 2GWKA 3O6WA 1BG3A 3EKUA 2FSJA 4EFHA 1TYQA 3FGUA 3H1QA 3O08A 2ASOA 1XQSC 2I7PA 1NGGA 4BC5A 4CZFA 3UE5A 1NGEA 2YJFA 2P9PA 1RGIA 2HF4A 1MA9B 4XH5A 3DAWA 3FZHA 4BC4A 3L0QA 3EO3A 2YJEA 3ENHA 4PKIA 4CZEA 5B8HA 3P4IA 3VF4A 3QMLA 2P9SB 2P9UB 2IVPA 4CZLA 1NM1A 3CJAA 4CZGA 3GG4A 4J8FA 4K25A 5KPRA 3HBTA 3UKUB 1QHAA 3CETA 2QWQA 4BROA 2F9TA 5LJVA 5AQOA 3MN6A 4YDUA 3R6MA 1HX1A 2QWPA 4HWIA 2OANA 2Q36A 3C0BA 2GUPA 3D2EA 5AQUA 1HPMA 2QM1A 3H3NO 3VENA 3I33A 4RCHA 3HSCA 1NMDA 1ZXOA 5KPZA 5BN8A 5AQRA 5E26A 4BRPA 1BDGA 3OHRA 3R8EA 1NGDA 3BUZB 1KXPA 2E2QA 2J4RA 3BF1A 1GLCG 4B9QA 5FPEA 1ATRA 1JCGA 1BUPA 4CD1A 4BG9A 3JXUA 2QWOA 2DPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HHIA 1D9FA 4FJJA 3O4WA 3UKRB 3VN5A 3AA2A 1T1TA 1WBBA 1NOZA 3VQEA 4DMNA 2CGJA 1ZVEA 3LP3A 1BI4B 2E3FA 2ETJA 3DXKB 2X74A 4FJ5A 2BUPA 1O13A 5KK4A 4O8KA 4KHWA 2LJ7A 4EP5A 3RMBA 4M3ZA 4CVNE 1KAZA 2ZQBA 4B1UB 3ENBA 1WSEA 4I2PA 3QINA 3OS2A 2YI1A 1WLJA 1HJOA 1U04A 4JI7K 4JS4A 3CF5L 3HTVA 1RT2A 2FC0A 1C56A 3EKSA 1N5YA 2E2NA 1RTDA 4DV2K 3C65A 2RF2A 3H3OB 1D4XA 3FFIA 2VWKA 4CFAA 4DQQA 2LKBA 1N33K 2DTUA 2NY9X 4BE1A 1I6FA 4KAZA 3WEEB 4JV5K 4CJ7A 2KZMA 2YC1C 4BVPA 3FZFA 5AQTA 1JLFA 3NHGA 3ENOA 1BWFO 2GELA 4E7LA 1KVBA 3TSQA 4LC9B 3L6QA 3QEPA 3RSEB 2C1IA 3E9LA 3LWMA 4M41A 4DV1K 4M3YA 1XNQK 3RR8A 3QNNA 1VNAA 5J2PA 1YUWA 5BREA 1VAZA 4KFBA 4BRLA 5JMVA 3THWA 4O5BA 3SNNA 1XC9A 4KTQA 3KLIA 4XJXA 3CFOA 2ASMA 3FFKB 4GNIA 3RR7A 1ZFUA 4F4KA 3A5MC 2D0PA 5AQKA 2KBJA 4A5BA 1MR4A 4FWQA 1SZ2A 4PY5A 2KYQA 4JKHA 4BRKA 5KI6A 1C0GA 4B1ZA 5AZJB 4F3OA 3MWPA 4DV3K 2VCPA 3CC4N 5CR4A 4H0YB 3AVHA 3DLGA 2KTQA 3ZSWA 4LF8K 3QEVA 1B9FA 1QE1A 2KHOA 1NJXA 5ADXA 3WNEA 3VQPA 4UQGA 4B9MA 3AVNA 2YEOA 4CK1A 3C95A 3G4SN 2NRRA 3KKRA 4BR7A 5LY3A 4HUEA 1QVFM 1TL3A 3F73A 3VA3A 3WXJA 1IG9A 3ZT4A 5J2MA 3V1QA 3NH2A 2QWMA 1Q81O 3MMVA 3ZX0A 1SN1A 1HKCA 2FF3B 2D0AA 3HSTB 5HOOA 4CJPA 5A2QO 1T7BA 5GIOA 1RBSA 4CZJA 3O9UA 5GIPA 1HR0K 3P5JA 4JHDA 3WNHA 1ICAA 3P83D 3G6EN 2GMOA 5BR9A 1S1VA 3JAMO 3HOSA 4B9LA 3C94A 2IAJA 1EQYA 3S3OA 4M3WA 1A5WA 1N4NA 3D2EB 2CH6A 5GAGP 3ZSVA 4E19A 3N4PA 2NRHA 1IV0A 3N4QA 3M6GA 4O44A 1WN7A 4FXDA 1PTXA 3TPQA 4FLUA 4FWSA 3OYGA 1T7EA 3QIPA 2ZJPL 3FZLA 4C1NK 1S72N 2HNZA 3V4IA 2O8EB 1DTQA 4DSIA 1NGIA 4C23A 3EZ5A 4OKJA 3IAYA 4LY7A 1NRAA 4JK7A 2YNFA 4LF4K 4WF9L 5KRSA 2ZM6K 3CJBA 1VQMN 3DXMB 3U6FA 3O9SA 3ZT0A 4IKFA 3ZYYX 5AQYA 3J7YP 3K5OA 3OA9A 3U9DA 3HJFA 1GLFO 4DU3A 3H6EA 4BE2A 4TSXA 4CF0A 3CCUN 5BRFA 3G0ZA 4Y0WA 3P31A 3THYB 1SKWA 5FRMA 1VQ8N 2CGLA 3ITHA 4RW8A 4K0KK 1VSKA 4E1JA 4FPAA 4WE1A 4JI0K 1RT1A 1C6VA 3ZT3A 3SYZA 3VQ6A 3QETA 1N6QA 4DR6K 4YOXA 2NLXA 1J54A 1RBTA 2D0OA 4WQ5C 2X6SA 2ZJRL 3FR0A 1VRUA 2KFZA 4BQLA 4EHUA 2A42A 4A2BA 4FJMA 1BI4A 2OCEA 3DXKA 4DF4A 3S9HA 3CJ7A 1BK8A 4MLEA 1N36K 2HNYA 4HTUA 1Q9YA 1QZ5A 3O4QA 5J2NA 3S3NA 5KGXA 4XIUA 1LAWA 3OJUA 2YHXA 4LF9K 2W40A 4DKWA 1BIUA 1IG8A 1RTHA 3D0PA 2OZMA 3U4LA 1VQPN 3QERA 4DHYA 4CW7B 4H4MA 3AVMA 3DRSA 3PX6A 2SN3A 1CHZA 4FWNA 1D5AA 3MXIA 3NDKA 5JVGL 1C0FA 4B1WB 4IBNA 4J2DA 2A6AA 5KTQA 1YVNA 4FM0A 1VSEA 4BRQA 3WEEA 1NG9A 4UY8O 3GDQA 1Z6RA 3CYGA 2Q0RA 1TKDA 3VPZA 1TK0A 4FWKA 3HM9A 4C8KA 4JAXA 3J8AA 4N76A 3QB0A 4DU1A 3ZSRA 2ATBA 4E1MA 4H8KA 1U49A 2M8BB 1KCFA 3FLCO 4AM7A 3JYTA 4JI8K 1XHXA 1RTIA 3QBWA 3QBXA 3RSEA 1GOCA 2IIRA 3HO1A 4BGBA 3D6RA 3BY5A 3SMPA 2B3CA 3CMAN 5KQ8A 1L3TA 1JJ2M 2F4VK 1BMRA 2FLOA 2WC9A 2HMPA 2XY5A 3KLGA 3QI7A 1J9AA 3K0SA 3HP9A 3DM2A 1LV5A 2W00A 1NH5A 4A62A 1U48A 3D2FA 3EE9A 3NE6A 4BY9C 1RCHA 3I0SA 3ZEUA 3PX0A 2O8CA 4KHQA 3HPHA 2FSNA 2JWKA 4DQRA 1OKJA 1TV6A 4H0OA 4N5SA 4H0TB 4MO4A 4DR7K 2RN2A 3IKMA 1RDAA 1BCOA 1ESVA 4IXCA 1RT7A 3A5OC 1RBVA 4IWVA 1T7AA 1XC3A 4KPYA 1E4FT 4CIGA 1ZYVA 4FJ7A 2KLAA 4FWRA 3SLCA 4DR4K 4CEDA 1T44A 2D0BA 4FOIA 2MBKA 2IVOA 2YHBA 3H1VX 5AQXA 4DCHA 4CECA 4JK8A 2YNGA 2F8TA 3NF6A 1Z26A 1BGXT 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2HHI A;  1D9F A;  4FJJ A;  3O4W A;  3UKR B;  3VN5 A;  3AA2 A;  1T1T A;  1WBB A;  1NOZ A;  3VQE A;  4DMN A;  2CGJ A;  1ZVE A;  3LP3 A;  1BI4 B;  2E3F A;  2ETJ A;  3DXK B;  2X74 A;  4FJ5 A;  2BUP A;  1O13 A;  5KK4 A;  4O8K A;  4KHW A;  2LJ7 A;  4EP5 A;  3RMB A;  4M3Z A;  4CVN E;  1KAZ A;  2ZQB A;  4B1U B;  3ENB A;  1WSE A;  4I2P A;  3QIN A;  3OS2 A;  2YI1 A;  1WLJ A;  1HJO A;  1U04 A;  4JI7 K;  4JS4 A;  3CF5 L;  3HTV A;  1RT2 A;  2FC0 A;  1C56 A;  3EKS A;  1N5Y A;  2E2N A;  1RTD A;  4DV2 K;  3C65 A;  2RF2 A;  3H3O B;  1D4X A;  3FFI A;  2VWK A;  4CFA A;  4DQQ A;  2LKB A;  1N33 K;  2DTU A;  2NY9 X;  4BE1 A;  1I6F A;  4KAZ A;  3WEE B;  4JV5 K;  4CJ7 A;  2KZM A;  2YC1 C;  4BVP A;  3FZF A;  5AQT A;  1JLF A;  3NHG A;  3ENO A;  1BWF O;  2GEL A;  4E7L A;  1KVB A;  3TSQ A;  4LC9 B;  3L6Q A;  3QEP A;  3RSE B;  2C1I A;  3E9L A;  3LWM A;  4M41 A;  4DV1 K;  4M3Y A;  1XNQ K;  3RR8 A;  3QNN A;  1VNA A;  5J2P A;  1YUW A;  5BRE A;  1VAZ A;  4KFB A;  4BRL A;  5JMV A;  3THW A;  4O5B A;  3SNN A;  1XC9 A;  4KTQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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