1NGFA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFNLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
source organism Bos taurus
total genus 121
structure length 382
sequence length 382
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngfA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngfA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngfA04
3HI0A 4BR4A 2P9UA 1DKGD 5AQOA 5BRHA 4H0YB 4H03B 2QXLA 1Q18A 3QFPA 5E26A 1Y64A 1U2VA 3VPZA 5EY4A 2P9SA 3H3OB 3FLCO 5AZIB 3VEYA 1V4TA 3ENOA 1JCFA 5KPTA 3C7NB 4EHTA 2FSJA 2E8AA 1BOTO 5AQYA 3LL3A 2CH6A 3FZFA 2V7ZA 2EWSA 2QWOA 4M7XA 2GWJA 1SQKA 2VWBA 4ISGA 4WYBA 4FOIA 1S3XA 5AQVA 1MDUB 3VEWA 4K42A 3D2EB 1HKGA 4XH1A 1YUWA 4WQ5A 3CETA 3SJHA 3VENA 3O1BA 3EN9A 2A41A 3CI5A 2I7PA 4BGAA 5AFUA 1LOTB 3UKRA 4BVPA 4FWPA 2QWMA 3U9DA 4AM7A 4Z94A 4FO0A 1NGGA 3O8MA 3VEVA 2ZWHA 3VGLA 3VERA 4BRKA 1BWFO 3H46O 4PKHA 4BC2A 4CZFA 1HKCA 3EKSA 1XQSC 3BEXA 4B1YB 5AZIA 4EAHD 1T6CA 4C23A 3UE5A 1QHAA 3C7NA 3QFUA 1BDGA 4A2AA 2HF4A 3VGKA 2Q36A 4BR5A 1C0GA 4FWMA 1SAZA 3CJCA 3LM2A 2PAVA 4BG9A 1V4SA 4CZGA 3RSEB 3HSCA 4H5WA 2Q0RA 1HX1A 1KAZA 3ENHA 4QS7A 5AQZA 4PL8A 3VOVA 2Q31A 5AQUA 5EOYA 4FPBA 3UB5A 1BA0A 2ZF5O 2FF6A 3DWLA 4BROA 5FPDA 1NBWA 3UKUB 4RTFD 2UYTA 1E4FT 2FSKA 2E2PA 3CHWA 2E88A 3FFKB 3MN5A 2W41A 4CZLA 2GELA 3WT0A 4PKGA 4MLHA 4GY2B 3MK6A 4CZEA 3VESA 3VEZA 1RGIA 5BREA 5JLHA 4CBXA 2YHWA 4I6MB 4JHDA 3ATVA 4CBUA 2E2NA 3BF1A 3GE1A 3MN7A 3A5LC 3WEEA 1QQNA 2FSNA 2IVPA 3EZWA 5AQIA 4MO5A 4DCHA 3GOIA 1BO5O 2ASPA 3IFRA 4WQ4A 5KQ8A 3J8AA 1T6DA 5AQTA 4A61A 4BC5A 3ZEUB 3UKUA 4FOEA 2D1KA 2A5XA 4BR9A 3GL1A 5AQHA 3EKUA 4IWVA 3WQUA 1ATNA 4A62A 4NO7A 4B1WB 3MN9A 3I33A 4ISFA 3ZETB 4BQZA 5F2RA 3A5OC 2IVOA 4BR0A 4BRNA 1Z05A 4FSVA 4CZKA 4H0OA 3QDKA 3ULEA 3QBXA 1K8KB 2YCHA 5AQXA 3LDNA 5AFUH 3D2FB 5F0XA 1IJJA 3AARA 4BRLA 4MO4A 5LJVA 1H1VA 4BRAA 3P4IA 4NB4A 3R6MA 1NGAA 3FZMA 4L3QA 2P9NB 3DXKB 5FPMA 2D0PA 3SK3A 3SMSA 4BG8A 2HMPA 4H0TB 2ITMA 5BPMA 1NGHA 1MWKA 4DB3A 3A0IX 4XEIA 3ZEUA 2YHYA 1ZBSA 1D4XA 4EHUA 5BN8A 1NWKA 2NZTA 4YDUA 2H3GX 5KQDA 3KZBA 3ZETA 1G99A 4B1UB 3VETA 3FZLA 3CQYA 5ELZA 3LM9A 1NGEA 4K41A 2IIRA 1E4GT 3TU5A 4EFHA 1K8KA 4BRFA 1HJOA 4IO8A 4CZHA 1WOQA 4BRHA 3D2FA 3GBTA 5AQSA 1LCUA 2CH5A 3ATUA 3SMPA 2YJEA 3W3DA 4J8FA 4BRCA 3IDHA 3FE1A 3DJCA 2P9NA 1QZ6A 3DXKA 4XH4A 5AQJA 4CZJA 2CGJA 2Q2RA 2Q1NA 4BQLA 3L4IA 2FF3B 5EXWA 5AQQA 2P9IB 1IG8A 3CQXA 5AQLA 3HZ6A 5KPRA 4H5RA 1NMDA 2Q97A 5LY3A 4F9OA 4M7YA 3D2EA 3L0QA 2BTFA 3FZHA 2E20A 2Q0UA 4QS9A 2ASMA 1S22A 2I7NA 2GWKA 3O6WA 1ZXOA 1X3MA 4FWOA 4LC9B 1QZ5A 1QQMA 3VF6A 3LDQA 4IJAA 3MCPA 1NM1A 4CJ7A 1CZAN 3CERA 2YI1A 1TUUA 2QWRA 2BUPA 3W0LA 3JXUA 4BC4A 4GNIA 5BN9A 1R59O 3CJ7A 4RWTA 3H6EA 4Y0WA 2QWLA 1P8ZA 1U6ZA 1SZ2A 4FWKA 3ID8A 2ZGZA 3O80A 3DXMB 5I9EB 3R8EA 4IXCA 1GLFO 4PKIA 4QS8A 2QWPA 3AAQA 1HPMA 2AA4A 3A5NC 2YHXA 3LDPA 5EVZA 4JAXA 2P9IA 1BUPA 4IZ9A 1JCGA 5AQPA 3HTVA 3TPQA 3QB0A 4H0XB 3RSEA 3ULEB 1XC3A 4BRQA 1KXPA 2D0OA 2A40A 2HOEA 3GDQA 2ASOA 1NGIA 4FL9A 5BR9A 4ISEA 3U8XA 4B1VA 1GLEG 2P9KB 1DEJA 2P9SB 4BRDA 4CBWA 3FGUA 5JLFA 1ATRA 2CGLA 4CD3A 2PBDA 3WXLA 3CJAA 4FWRA 3JS6A 4HTLA 2FLOA 2V51B 3VEOA 3ZX0A 4BC3A 3ZX2A 5AR0A 3U4LA 4I6MA 5JMVA 3KVGA 4JN4A 5AZJB 3S41A 1GLBG 3VF2A 4DQ8A 3WUHA 3R9PA 3BUZB 2NLXA 1HUXA 1KAYA 4E1JA 5BRDA 3LDOA 3IUCA 3LDLA 3WXIA 4BREA 2FXUA 3VF4A 4PL7A 1GLLO 2V7YA 1J6ZA 2P9KA 4H5TA 1DGKN 2CGKA 2W40A 3A8YA 1XUPO 2E2QA 2DPNA 3QMLA 5AQFA 3H1QA 3H1VX 5ADXA 4MLEA 2F9WA 3KHYA 2P9PB 1NGDA 5LJWA 1WUAA 1RDWX 1X3NA 3CJ1A 1ATSA 3FZKA 1MA9B 4CD1A 5E84A 3M6GA 1NGFA 4O8KA 4H5VA 3OHRA 1JCEA 1NLVA 3F9MA 3SLCA 3D7EO 3QBWA 4FWLA 4WQ5C 1NGBA 1MWMA 5AQKA 3MDQA 4YDUC 3VGMA 5AZJA 3BP8A 2E1YA 3AY9A 1HKBA 2E1ZA 2OANA 3AAPA 5AQWA 4JD2B 4EIAA 4BR2A 4H5NA 2VCPA 3H45C 2A42A 1RFQA 1YXQA 5BPNA 2KHOA 3CJBA 3IMXA 3O5BA 1C0FA 1T44A 3M1FA 4CI6A 3I8BA 4B1XB 1BU6O 2P9LB 2QM1A 2GEMA 3MMVA 5BRFA 4BVOA 2P9PA 5AQRA 3GG4A 5FPNA 4H0PA 4FWQA 4B9QA 2HF3A 1GLCG 1ZC6A 3O4WA 4JHDB 2QW9A 1GLJO 5AQNA 5AQMA 3CIPA 3WEEB 5AQGA 3QICA 4KBOA 3WQTA 4BR7A 3WXJA 1BG3A 3DAWA 4FWNA 4DHYA 1TYQB 2VYPA 3HBTA 4BRPA 4CZMA 4H0VB 3M3ZA 3EO3A 2IVNA 3G25A 4JD2A 4BGBA 1YVNA 4BRMA 4B1ZA 5BPLA 4CZIA 1HLUA 4JNEA 5TKYA 4AM6A 1TUYA 4K43A 5EX5A 1EQYA 2P9LA 3O1WA 4BRIA 1Z6RA 3CJ9A 3A5MC 2WUSA 2P9UB 1GLDG 1BA1A 2ZGYA 1YAGA 2GUPA 5JICA 5CE3A 4BRGA 3U9ZA 3EL2A 1U2VB 2GTDA 2D4WA 2F9TA 1X9JA 5B8HA 2QWQA 1GLAG 4XH5A 1NGJA 2J4RA 1QQOA 2E2OA 2V52B 1KAXA 5FPEA 4RCHA 5F1XA 4FWSA 3FR0A 2A6AA 1OKJA 3B8AX 3MN6A 3O08A 3ZX3A 1NGCA 4WQ4C 5ADXH 1TYQA 4A2BA 3DXMA 4HWIA 3C0BA 2A3ZA 5KPZA 4IJNA 2AP1A 4M63C 2YJFA 3VEXA 2QWNA 4O5FA 3WXKA 1ESVA 3BF3A 4K25A 3HM8A 3H3NO 2NRHA 4FPAA 3L6QA 3UKRB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HI0A 3Q7BA 4DTSA 2Y1IA 2NY8X 4OLAA 3VQDA 4H0YB 2N69A 1JL1A 4H03B 1IBLK 1LW0A 1GOBA 4KPYA 3KC6A 3VPZA 2O8FB 3OYDA 5EY4A 4RW4A 4FJXA 3VEYA 1JCFA 3LALA 4GVEA 4K8XA 1XWLA 4AH9A 4DTUA 4CHYA 4FZYA 2O4GA 3CFOA 4M45A 4FJHA 5AQYA 2Z1JA 3PLAA 3KWGA 4L8RB 2V7ZA 1LV5A 4M7XA 4LH4A 3V9UA 1VQ8N 3BK3C 3P5JA 3VEWA 1RT2A 1YUWA 3CETA 2A41A 4BGAA 2NY9X 3G6EN 2HHVA 4HUGA 4YOWA 1BRZA 4FO0A 3V9ZA 1NGGA 1BI4B 3VEVA 1OMYA 1BWFO 2G8KA 4CZFA 1HKCA 4DLGA 3O9TA 4RW9A 3BEXA 4EAHD 1SUQA 2O8DA 1T6CA 4C23A 3VQ7A 3THYA 1BDGA 4BR5A 2HBMA 1SAZA 3JSMA 3LM2A 3ZT2A 4CEAA 4B9VA 4W5NA 1TK0A 5CHIA 3RSEB 3HSCA 2VG7A 1JZAA 2Q0RA 3O9SA 1HX1A 1QVGM 1KAZA 1TVRA 2IOCA 4LD0A 1VQPN 5AQZA 2LKBA 4PL8A 3CW4A 5GADP 3V1RA 3SAFA 1XNRK 3DWLA 4BROA 4CK1A 1RTHA 1LWCA 2SN3A 3UKUB 3VQ4A 3NMUA 3CM6A 4CJLA 1NPIA 4Q5VA 2E2PA 2E6MA 3CHWA 4CZLA 2FBXA 1NKBA 3WT0A 4HCBA 4NCAA 1XC9A 1WBDA 4MLHA 4JKHA 4U7BA 2G8HA 3DOLA 2O4IA 4CBXA 1KC8O 2PYLA 1WN7A 3SAGA 4X62K 4CBUA 3C6UA 2AJQA 2WBNA 3A5LC 3THVA 4DV7K 1FXXA 4CF0A 4JKGA 3EZWA 4JI1K 1WSFA 2F96A 1B3CA 3T1AA 1WBBA 2G8FA 3IFRA 3TARA 2BE2A 2OPSA 4WQ4A 3HO1A 4DR1K 3HXMA 1OZZA 3ZEUB 2KSKA 2LI7A 2QEXN 1TAUA 3QESA 3NHGA 3CQ8A 5CZ1A 4OLBA 4A62A 1U45A 4AHCA 4PA1A 3MN9A 2MN5A 3LP0A 2KYQA 3CYMA 1W7AA 3A5OC 1A5VA 1J9AA 1RDUA 3CPEA 1ASVA 1AHOA 4B9LA 3QDKA 1VQ6N 1WSEA 1LWEA 5KI6A 4IG3A 4CESA 5HRNA 5AFUH 3RRGA 3ZT4A 3AARA 4Z4GA 4IDHA 4AHRA 4Z4IA 3KLIA 3CPWM 3KK3A 1NGAA 3FZMA 2ZE2A 4L3QA 4DV0K 3M8QA 1T7PA 2P9NB 1CLQA 1HQUA 3NH1A 3SK3A 4DR4K 2N66A 4CFDA 3ITHA 3E1YA 3PSMA 1NGHA 4DB3A 4CF8A 1K9MO 4R5PA 4AF1A 4CHNA 1HNVA 2YNIA 5BN8A 5KQDA 4AAZA 3ZETA 1RT3A 3NVMA 4B1UB 3CCUN 2HVHA 5ELZA 3LM9A 3ALYA 4NYFA 3TU5A 2NRWA 1LW2A 1HJOA 1C1CA 1X9WA 1WOQA 4CJ5A 1VQMN 2O8FA 5AQSA 4UAFE 2CH5A 3VQ5A 3OYGA 4BE1A 3CYGA 1WLJA 4F2RA 2LY5A 3DXKA 4XH4A 1VSKA 2IS3A 1MU2A 1WAJA 3ISNC 4J2AA 3LP2A 1S1VA 4YOYA 4BQLA 1KFSA 3DLGA 5KPRA 4FLTA 3QINA 2C1GA 1N8RO 2B3CA 4F9OA 4JI4K 4Z4CA 3L0QA 5SZTA 3E7RL 2Q0UA 1M1KO 1S22A 2GWKA 3O6WA 2YNGA 1T7AA 4ELUA 4DR6K 1NM1A 4CJ7A 3CERA 1TUUA 3L2VA 2VQEK 1RNHA 2HNDA 1BI4A 2YNHA 1POIA 3AA3A 3MEEA 4A59A 4CJVA 3SQ1A 4JK7A 3CJ7A 2YILA 4JI6K 3T69A 1P8ZA 1SZ2A 3ID8A 2ZGZA 2YBRC 2P51A 1NMNA 5JVHL 4PKIA 4QS8A 3SF4D 3A5NC 5EVZA 1BUPA 2KBJA 3TPQA 3OTOK 3HTVA 4W5OA 4H0XB 4MDBA 3RSEA 1YJ9N 1IH7A 1NRAA 2KZZA 1XC3A 3PV8A 3IG1A 4NCGA 3GDQA 4ID1A 3RMBA 5BR9A 3OA9A 3SPZA 2IGIA 3TWHA 4ZTFA 2P9SB 5H1SQ 4BDPA 4LFCK 1J5OA 3SQ0A 1J54A 4BE7B 4I9LA 3NGYA 2D0BA 3OYHA 3ZSVA 4HTLA 2FLOA 4KHQA 1RT7A 4AHVA 3V81A 3WNHA 4JYAK 4DV6K 2N2RA 2A1SA 5CR4A 3ZX0A 3U4LA 4GV9A 4Y1CA 1SL0A 4NCBA 3KVGA 1T0ZA 1GLBG 3ZT3A 3SNNA 2O8EB 2ITGA 4DTRA 1KVAA 1HUXA 1KAYA 2F7TA 3V9SA 3OYIA 4KREA 3LDLA 5DMRA 3WXIA 4JI0K 4YFUA 2FXUA 4PL7A 1DGKN 1I6FA 4HHTA 3H1VX 4GKJK 2G2KA 5AQFA 3TAFA 4ZTJA 4CFAA 1HYVA 3KHYA 4CF9A 3VTIA 2P5GA 1WUAA 1X3NA 3FZKA 5C24A 3J81O 3T19A 4CJ4A 3C94A 4YOTA 4M3ZA 4DTNA 3MXMA 1YVUA 1D5AA 5M1NA 3PY8A 5HL7L 1NLVA 1NK5A 4JI8K 4WQ5C 3QBWA 4PQUA 1AYJA 1VQ9N 4YDUC 3AVIA 3PUFA 1S1UA 5KRSA 5AZJA 1BCMA 1VSIA 3J7ZO 5AQWA 1X9MA 4QOZB 1IV0A 2MZ0A 1VQON 1EX4A 4CCHA 4CJRA 4FCYA 4B08A 3H45C 1YXQA 2KQ2A 2KHOA 3CJBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HI0 A;  3Q7B A;  4DTS A;  2Y1I A;  2NY8 X;  4OLA A;  3VQD A;  4H0Y B;  2N69 A;  1JL1 A;  4H03 B;  1IBL K;  1LW0 A;  1GOB A;  4KPY A;  3KC6 A;  3VPZ A;  2O8F B;  3OYD A;  5EY4 A;  4RW4 A;  4FJX A;  3VEY A;  1JCF A;  3LAL A;  4GVE A;  4K8X A;  1XWL A;  4AH9 A;  4DTU A;  4CHY A;  4FZY A;  2O4G A;  3CFO A;  4M45 A;  4FJH A;  5AQY A;  2Z1J A;  3PLA A;  3KWG A;  4L8R B;  2V7Z A;  1LV5 A;  4M7X A;  4LH4 A;  3V9U A;  1VQ8 N;  3BK3 C;  3P5J A;  3VEW A;  1RT2 A;  1YUW A;  3CET A;  2A41 A;  4BGA A;  2NY9 X;  3G6E N;  2HHV A;  4HUG A;  4YOW A;  1BRZ A;  4FO0 A;  3V9Z A;  1NGG A;  1BI4 B;  3VEV A;  1OMY A;  1BWF O;  2G8K A;  4CZF A;  1HKC A;  4DLG A;  3O9T A;  4RW9 A;  3BEX A;  4EAH D;  1SUQ A;  2O8D A;  1T6C A;  4C23 A;  3VQ7 A;  3THY A;  1BDG A;  4BR5 A;  2HBM A;  1SAZ A;  3JSM A;  3LM2 A;  3ZT2 A;  4CEA A;  4B9V A;  4W5N A;  1TK0 A;  5CHI A;  3RSE B;  3HSC A;  2VG7 A;  1JZA A;  2Q0R A;  3O9S A;  1HX1 A;  1QVG M;  1KAZ A;  1TVR A;  2IOC A;  4LD0 A;  1VQP N;  5AQZ A;  2LKB A;  4PL8 A;  3CW4 A;  5GAD P; 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