1NGGA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
KGPAVGISLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
source organism Bos taurus
publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
total genus 125
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1nggA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nggA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1nggA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1nggA04
3H3OB 2P9IA 2W40A 4DHYA 3CJCA 1HLUA 2AP1A 1TUYA 4J8FA 3QFUA 1G99A 2GTDA 3S41A 3D2FA 3I33A 3FZLA 3SMSA 2P9IB 3TPQA 2ITMA 3D2EA 2FXUA 3AAPA 3MMVA 5TKYA 3MK6A 4IJAA 1YAGA 4MLHA 3A8YA 3VETA 1MWMA 4BRNA 3JS6A 3D2FB 4BRAA 1Z6RA 3EKSA 1T6DA 3D2EB 4LC9B 3QDKA 1QQOA 4K25A 1SQKA 4QS8A 5I9EB 1E4FT 2P9UA 2Q0UA 2ZWHA 2ZGZA 4ISGA 1RFQA 2IIRA 4WQ5A 4M7XA 1BA0A 1BG3A 3ENOA 2IVPA 2P9PA 4CZKA 2NLXA 2BUPA 3RSEA 1KAZA 2GWKA 3SJHA 3MDQA 1MA9B 3FZKA 3UKRA 2P9UB 2A5XA 4BREA 4H5RA 4DCHA 4XEIA 3BP8A 3U8XA 2P9PB 3C0BA 1ZC6A 2J4RA 1JCEA 2HF3A 4FWPA 4EHTA 3RSEB 3VERA 4BRFA 4AM6A 1TYQA 1WUAA 3P4IA 4QS7A 3GOIA 1XQSC 5AQKA 3UKRB 2VWBA 3A0IX 3VPZA 1LCUA 5AQJA 5AZIA 4BRDA 3CHWA 5B8HA 3A5OC 4FOIA 1SAZA 4FWNA 4MLEA 4YDUA 1XUPO 3MN9A 1TYQB 2F9TA 4K42A 2NZTA 4B1YB 1NGJA 2PAVA 4B1WB 5AQYA 3U9ZA 2H3GX 1NGFA 2YJEA 4FPAA 5AFUH 4BRGA 4CD3A 3QBWA 3CERA 3O4WA 5AZIB 4RWTA 2Q0RA 4CZHA 1Z05A 3SLCA 3B8AX 1BOTO 3VOVA 1DEJA 3VGKA 3VGMA 2E88A 3CJ9A 4BRQA 5AQRA 4IO8A 4B1ZA 3HZ6A 1NGHA 5AQUA 3CIPA 3CJ7A 1QZ5A 1GLLO 4BC3A 4QS9A 3UKUA 5AR0A 4B1VA 1Y64A 4ISEA 4DQ8A 3CETA 2CGJA 4FWLA 5AQFA 3R9PA 3EO3A 4GNIA 5AQPA 5BN8A 4JN4A 3UKUB 5AQQA 3G25A 1KAXA 4FOEA 4BVPA 1GLAG 2YJFA 4BRMA 3F9MA 3CQYA 3BUZB 1HUXA 3HTVA 4FWQA 3VF4A 3LL3A 1Q18A 3LDOA 1BUPA 5F2RA 3M1FA 3O1WA 2D1KA 3U4LA 1LOTB 2D0PA 3BF1A 5BRDA 4CJ7A 1ATNA 3KVGA 3MN6A 4BG9A 3GL1A 2OANA 4CZFA 5JICA 3CJAA 3KZBA 2QWMA 4RTFD 3I8BA 3TU5A 3CQXA 2I7PA 3WXKA 4MO5A 4CD1A 4BC4A 1BWFO 5EX5A 1J6ZA 3LDNA 3DAWA 5FPNA 2D4WA 1RGIA 5AFUA 5FPEA 4A2AA 3FFKB 2VYPA 2GUPA 4CI6A 5AQTA 2V52B 3VEZA 3ZX3A 3MN5A 3IMXA 2IVOA 3VF6A 3H1VX 4EAHD 3H45C 1QHAA 3MCPA 4EHUA 4M7YA 4EIAA 4PKGA 4XH1A 1KAYA 4BQLA 4JNEA 4H0VB 3FZFA 2Q1NA 1GLFO 2E2NA 1X9JA 1S22A 1T44A 1K8KA 3ZEUA 4F9OA 4BGBA 4A62A 3O8MA 5JLHA 3QBXA 1X3NA 4BRKA 2GWJA 3WT0A 3WXJA 4K41A 3ATUA 4PL7A 2DPNA 1NGGA 3ZEUB 2KHOA 1K8KB 4MO4A 2QW9A 4KBOA 1HKBA 1BU6O 2QWRA 4BR0A 5ADXH 4H5TA 1ZXOA 4B9QA 1DKGD 3HI0A 5F1XA 3A5LC 4AM7A 1NGIA 2YCHA 2QWNA 3IDHA 5AQLA 2FSNA 1XC3A 4FWOA 1NWKA 1C0FA 3ZETA 3ENHA 4CZEA 4CZIA 1QZ6A 4CZMA 3IFRA 1GLEG 1YUWA 1V4SA 5KPRA 2FF3B 3CJ1A 2QXLA 4BROA 2QWLA 3MN7A 3ZETB 1NBWA 1BA1A 1H1VA 3C7NA 4K43A 1TUUA 3U9DA 2P9SA 3WXLA 5LJWA 2WUSA 5JMVA 3QB0A 2A3ZA 1V4TA 1D4XA 1WOQA 1NGBA 3H3NO 1JCGA 2P9NA 1GLDG 5E26A 4CBWA 5KQDA 1KXPA 2CH6A 3EL2A 4H0PA 4M63C 3C7NB 1GLJO 1ZBSA 1NM1A 3UE5A 5AZJA 2QM1A 3BF3A 3WXIA 2P9SB 2EWSA 2YHWA 1YXQA 3VEYA 3LM2A 5AQVA 2VCPA 2BTFA 2QWPA 2P9NB 2Q2RA 2I7NA 1RDWX 3A5MC 1SZ2A 1NGCA 5AZJB 4CZLA 1BO5O 2P9KA 3ULEA 3FGUA 5BR9A 4PL8A 3W3DA 4BGAA 5AQSA 1GLCG 1ATSA 4PKHA 4H0TB 5EOYA 5EVZA 4A2BA 4ISFA 5AQMA 5AQZA 2E2QA 3W0LA 1NGAA 3OHRA 5ADXA 5AQGA 4WQ5C 5AQXA 2P9KB 3ULEB 3O5BA 1DGKN 3WQTA 4BG8A 4WQ4C 2ASOA 5F0XA 3H6EA 3DXMA 5ELZA 1HX1A 4CZGA 4B1XB 3O1BA 4H03B 3VEVA 2E8AA 5AQOA 3VEOA 4IWVA 2PBDA 3GE1A 5AQWA 4BRHA 3DXMB 1ESVA 3M3ZA 3L0QA 4BC5A 3CI5A 3FZHA 4BQZA 4FWKA 3GBTA 3HM8A 2GELA 1EQYA 2ZF5O 2A6AA 2CH5A 2E20A 5LJVA 2UYTA 2V7ZA 1IG8A 4GY2B 1E4GT 1U2VA 3ZX2A 5FPDA 3VENA 3DJCA 3FR0A 3KHYA 1NGEA 3R8EA 1JCFA 1T6CA 2A41A 5EXWA 3VF2A 2P9LA 3VEWA 5BPNA 1U2VB 4H0OA 3AAQA 5CE3A 3H1QA 4BRIA 2AA4A 5LY3A 5E84A 5KPZA 3O6WA 4FWMA 2Q97A 4BR2A 4BRLA 1C0GA 1NMDA 4HWIA 3QMLA 3L4IA 3DWLA 4L3QA 5BN9A 2QWOA 1HKCA 2A40A 2E2OA 2GEMA 2IVNA 2YHXA 4H0YB 1OKJA 2P9LB 4XH4A 5BPMA 4NB4A 1QQNA 3M6GA 2F9WA 4Y0WA 3ZX0A 2V51B 4FWRA 4RCHA 4WQ4A 5BRHA 3DXKA 4IXCA 4PKIA 4H5WA 1BDGA 2CGKA 3WQUA 3LDPA 3WUHA 2HOEA 2YHYA 4CZJA 3O80A 2YI1A 1HKGA 4FWSA 4JAXA 3JXUA 3SK3A 3VGLA 4BVOA 3SMPA 3DXKB 5KQ8A 2E2PA 4JD2A 4E1JA 1U6ZA 5EY4A 3O08A 3H46O 1X3MA 1S3XA 1CZAN 4FL9A 1P8ZA 2W41A 3AY9A 3A5NC 3GG4A 3CJBA 3FZMA 4JD2B 4EFHA 2FLOA 2E1ZA 4H5VA 3VEXA 5BREA 4DB3A 3QFPA 1IJJA 2NRHA 5FPMA 3IUCA 2ASMA 3L6QA 4BRPA 4FO0A 3EKUA 4IZ9A 3LM9A 1QQMA 4NO7A 4O8KA 3GDQA 3D7EO 4Z94A 3LDLA 2ZGYA 4BRCA 2FF6A 3ID8A 5AQHA 4FSVA 4O5FA 3J8AA 4B1UB 4HTLA 1R59O 2ASPA 2HMPA 2HF4A 4C23A 4FPBA 4A61A 4H5NA 2A42A 3ATVA 3WEEA 4XH5A 4CBUA 4BR4A 1GLBG 3FLCO 2FSKA 3VESA 4WYBA 3FE1A 4H0XB 3LDQA 1MWKA 2FSJA 2V7YA 4BR7A 3WEEB 1ATRA 4I6MA 3HSCA 4BC2A 5AQIA 5BPLA 2QWQA 1NLVA 3HBTA 4JHDA 5AQNA 3QICA 4BR5A 5BRFA 1YVNA 2D0OA 3AARA 4BR9A 1HPMA 5JLFA 1HJOA 3R6MA 3EN9A 2Q31A 1MDUB 4I6MB 5KPTA 3UB5A 3EZWA 4IJNA 3BEXA 4JHDB 2Q36A 4YDUC 2E1YA 4CBXA 2CGLA 1NGDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C0TA 2P9IA 3QERA 3L8BA 4DSKA 1L4VA 3ULDA 2AP1A 3BGRA 1X9SA 3QFUA 1ZBUA 4ELVA 3AGKA 5KI6A 3D2FA 4FYDA 3TPQA 2G8FA 4E3SA 2FBVA 4G1QA 2I61A 2QTDA 1ZYWA 3D2EA 5DM7L 3RMAA 2QKKA 1TV6A 1IBLK 3K9JA 2YILA 4DV0K 4CHPA 1X9MA 2NRRA 1JKZA 3P83D 4YOVA 5C10A 3OYEA 3QDKA 3V9SA 1SQKA 3F2KA 2IIRA 1SNBA 4WQ5A 1TK8A 1L3SA 2BUPA 5J1EA 2MZ0A 1SUQA 1P0AA 4OX9K 2HMIA 4KRFA 4G9ZA 1TAQA 2LN8A 2ZM6K 2A5XA 2E6MA 4BWMA 5C2DA 2DFHA 3VQ6A 4XEIA 3HPOA 1RTDA 1YTUA 2P9PB 1UAXA 3PIOL 4Z4IA 4C8KA 2HF3A 4FWPA 3RSEB 1NJIO 2O4IA 1WUAA 2ATQA 4A59A 1S9EA 3T1AA 1WSEA 3WNEA 4WFAL 3VQCA 4BWJA 3U3YA 4BRDA 3CHWA 3HJFA 1SL0A 5B8HA 1XUPO 2MN5A 3MN9A 1TYQB 5M1NA 4B1YB 1CXUA 4CD3A 1NGFA 2YJEA 3LAMA 4ZHRA 5AZIB 3OS1A 1RCHA 4CZHA 1K8BA 3B8AX 1BOTO 3VOVA 1DEJA 3VGKA 5GADP 3RR8A 2E88A 4Y1CA 2G8HA 3KKSA 5C42A 2W6LA 1AHOA 4CK3A 4KB1A 4HUFA 4BRQA 3RMDA 1IKXA 4DSJA 4AHVA 1NRAA 2Z1GA 3NH0A 1NGHA 3CJ7A 1QZ5A 4TSXA 3AVLA 4BC3A 2QA4N 4M3TA 3UKUA 1OMYA 1Y64A 2CGJA 4B9SA 5AQFA 3R9PA 3OYAA 4GNIA 4B9VA 1U47A 3G25A 1KAXA 4FOEA 3PX6A 3F9MA 4FWQA 3LZJA 4DTRA 4ZTJA 1T7BA 3QINA 4I9QA 4X65K 1RTHA 4NCBA 2LJMA 5JVGL 2D0PA 3CCEN 4I7FA 4E7HA 4BG9A 4JLHA 4DTSA 3GL1A 5JICA 2NY9X 1RDAA 3WNGA 2XY7A 1BHLA 3CJAA 3MXIA 1SL2A 4CGGA 4DG1A 3L3VA 3I8BA 3TU5A 4CJTA 3CQXA 2I7PA 3DLBA 4CD1A 3QEXA 3ZLJA 1BWFO 5EX5A 1J6ZA 3QIPA 5T7BA 1JLQA 3KLEA 1KLNA 1ZVEA 1X1PA 3AV9A 3F5TA 4BACA 3CCQN 4FCYA 4CI6A 5M1FA 3OS2A 4KI6A 2V52B 3I0SA 3MN5A 2NRZA 2VGNA 3THWA 1HYSA 1BI4A 1QHAA 3CQ8A 4M7YA 4XH1A 1T05A 1JXEA 1KAYA 4JNEA 4H0VB 3VQDA 3V81A 2HBJA 1VSKA 3VMFB 2O8FB 2P5OA 1S22A 1RBSA 1T44A 3ZEUA 4F9OA 1N36K 2E5LK 1VSEA 3ITHA 1TKXA 4DV4K 1FH3A 2UUBK 4HUEA 3C6TA 4JKBA 4CGJA 1UA1A 2B3CA 1NRBA 3I55N 4K0KK 1CXQA 2QW9A 4AQYK 4KBOA 1HKBA 5ADXH 1ASWA 5M1QA 4PUOA 4CIGA 4ID1A 4OPAA 1XC3A 3AVBA 1PTXA 4J2AA 2BE2A 1LV5A 1QZ6A 3ALYA 1OVQA 5C2FA 2PY5A 1GLEG 4O8UA 4DTUA 1YUWA 2RHKA 3VA3A 3ZT0A 3CJ1A 2QXLA 1NBWA 1H1VA 3HP6A 3PUFA 4BEBA 3U9DA 3ZSWA 3WXLA 5LJWA 5JMVA 1DJTA 1V4TA 1WOQA 3T7ZA 3WXMB 2N2RA 3QEVA 1NGBA 1WBBA 4IKFA 3CCVN 3EL2A 4M63C 2IC3A 1BMRA 3CM6A 5AZJA 2QM1A 3CFOA 1TAUA 3VEYA 4AAZA 2QWPA 3RMCA 1RDWX 1NE5A 2JWLA 2UUCK 3W3DA 4BGAA 4AHUA 5EOYA 4A2BA 3L2WA 5AQMA 3W0LA 1C1BA 4JI0K 3CPWM 1VQLN 2JDQD 2O8BB 1GOAA 2KLAA 3O1BA 4H03B 2LY5A 4OLBA 4CQKA 2GX9A 3DLKA 4C1NI 4C8OA 4IO9L 5AQWA 1J53A 1RILA 4KTZA 3ZT3A 4O0IA 1ESVA 5CYMA 3KJVA 1IKVA 3JAMO 3HM8A 3SAGA 4AHTA 4CGHA 4MDAA 4PY5A 2UYTA 3QNOA 2HNYA 1IG8A 4JK8A 2VQEK 1WBDA 3ZT2A 3NE6A 2WONA 2HHQA 1NPIA 3AO2A 1C1AA 4CJUA 5EXWA 2LR3A 3SBGA 3S5TA 3CFRA 1L3TA 4JS5A 5HBMA 3H1QA 2HBMA 4BRIA 3O6WA 3LP0A 4FWMA 5MLCQ 4GV9A 1NNEA 4WFNL 4DU3A 4L3QA 3SI6A 1HKCA 4CEQA 2P9LB 3CFPA 1X9WA 1C0UA 2P5GA 1U4BA 3M6GA 2F9WA 2V51B 4FWRA 1RDCA 3HYFA 4WQ4A 3SQ4A 5BRHA 3DXKA 4FVMA 4PKIA 3KOWA 4IOCL 3QESA 1UA0A 1SKWA 2UXBK 3DRPA 4CJPA 3DOKA 4LF4K 4BVOA 4FWSA 3SK3A 4DSLA 4KV8A 4JD2A 3NBPA 4FW1A 1RBRA 3O08A 1VQ5N 3HOSA 1X3MA 1W7AA 4JI5K 4DUYK 4FL9A 1WSHA 3EE8A 3KKRA 3QO9A 3A5NC 3QLHA 1LQIA 1TI5A 3KK7A 3FZMA 2HHWA 2FLOA 2E1ZA 4JKHA 4N56A 4M3ZA 3MX5A 3V9WA 3QFPA 4F8RA 2HHSA 4BRPA 1NKCA 4M3YA 1EWQA 3T69A 3VTIA 3ZSVA 1OH6A 5HRRA 5FRMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1C0T A;  2P9I A;  3QER A;  3L8B A;  4DSK A;  1L4V A;  3ULD A;  2AP1 A;  3BGR A;  1X9S A;  3QFU A;  1ZBU A;  4ELV A;  3AGK A;  5KI6 A;  3D2F A;  4FYD A;  3TPQ A;  2G8F A;  4E3S A;  2FBV A;  4G1Q A;  2I61 A;  2QTD A;  1ZYW A;  3D2E A;  5DM7 L;  3RMA A;  2QKK A;  1TV6 A;  1IBL K;  3K9J A;  2YIL A;  4DV0 K;  4CHP A;  1X9M A;  2NRR A;  1JKZ A;  3P83 D;  4YOV A;  5C10 A;  3OYE A;  3QDK A;  3V9S A;  1SQK A;  3F2K A;  2IIR A;  1SNB A;  4WQ5 A;  1TK8 A;  1L3S A;  2BUP A;  5J1E A;  2MZ0 A;  1SUQ A;  1P0A A;  4OX9 K;  2HMI A;  4KRF A;  4G9Z A;  1TAQ A;  2LN8 A;  2ZM6 K;  2A5X A;  2E6M A;  4BWM A;  5C2D A;  2DFH A;  3VQ6 A;  4XEI A;  3HPO A;  1RTD A;  1YTU A;  2P9P B;  1UAX A;  3PIO L;  4Z4I A;  4C8K A;  2HF3 A;  4FWP A;  3RSE B;  1NJI O;  2O4I A;  1WUA A;  2ATQ A;  4A59 A;  1S9E A;  3T1A A;  1WSE A;  3WNE A;  4WFA L;  3VQC A;  4BWJ A;  3U3Y A;  4BRD A;  3CHW A;  3HJF A;  1SL0 A;  5B8H A;  1XUP O;  2MN5 A;  3MN9 A;  1TYQ B;  5M1N A;  4B1Y B;  1CXU A;  4CD3 A;  1NGF A;  2YJE A;  3LAM A;  4ZHR A;  5AZI B; 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