1S3XA

The crystal structure of the human hsp70 atpase domain
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCIGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Human Hsp70 molecular chaperone binds two calcium ions within the ATPase domain
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-01-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1s3xA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1s3xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1s3xA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1s3xA04
5BPNA 1S22A 2P9KA 2GWJA 4FO0A 3SLCA 5ADXA 4K25A 2I7PA 3B8AX 1NGDA 2P9SB 5JMVA 4FWSA 2FF3B 3U8XA 2D0PA 4FWNA 4JNEA 3H6EA 3EN9A 4JN4A 1DEJA 4EHTA 5AQRA 2HOEA 4MO5A 3GBTA 3GE1A 4BRLA 1T6DA 5AQTA 5TKYA 1KAXA 1K8KA 3C7NB 3RSEB 4H5TA 1MWKA 3DXKB 1DKGD 5BRFA 1BO5O 3ZX2A 4XH4A 3MN7A 3EKSA 4FWQA 3WXJA 3LL3A 3QICA 1LOTB 3FR0A 1XQSC 3GOIA 2ASOA 2FF6A 3MDQA 1QQNA 4BG9A 1GLCG 1NBWA 1X9JA 3CETA 5BPLA 3A5MC 1YUWA 4WQ5A 5AZIA 4HTLA 4BQZA 4CI6A 4FPAA 1SZ2A 2CGLA 3MCPA 2YJEA 3A5LC 3D2EB 2FLOA 2A6AA 3GDQA 3ZEUB 3VF4A 3VEWA 3HI0A 1RDWX 3IMXA 1NGHA 3L0QA 1T6CA 3LDLA 3KZBA 5AQXA 3H3OB 2CH6A 3VGKA 4MLEA 1DGKN 1G99A 3L4IA 3WQUA 4PL8A 1GLFO 4PKHA 4YDUC 4AM6A 2FSNA 3UKUA 4IWVA 5AQYA 4H0PA 4B1YB 3CJ9A 2H3GX 5F1XA 5AFUH 3ENHA 4A2AA 3ULEA 2P9KB 5AZJA 3WEEA 2ZWHA 2QWPA 3QBXA 1HLUA 3BUZB 5AQVA 4Z94A 1YXQA 2CGJA 2V51B 3MMVA 4DHYA 5AQWA 5AQUA 3AAPA 3VENA 3FZHA 3W0LA 4BROA 1GLJO 2I7NA 1ATSA 3ATUA 2E2OA 5AQQA 1XUPO 2P9PA 3EL2A 3LM2A 1SAZA 1BUPA 2QWLA 1MDUB 2E2PA 3FZLA 3QB0A 4RTFD 1K8KB 4XEIA 4BRAA 4IZ9A 3VEVA 1YVNA 3AY9A 2QWNA 5AQNA 2Q0UA 4LC9B 5CE3A 4H0TB 2HMPA 4IXCA 2Q31A 4J8FA 3DWLA 2NLXA 1BA1A 1QZ5A 1U2VA 3BF1A 3H1VX 3I8BA 2V7YA 1RFQA 4JD2A 4WQ5C 4CZGA 3LDPA 3O1BA 3O8MA 3VEOA 3ZX0A 4ISFA 5LY3A 1GLAG 3VPZA 3GL1A 4BRMA 2NRHA 3IDHA 4BC2A 4M63C 3H1QA 1X3NA 1NWKA 1BA0A 3GG4A 5BPMA 3BF3A 4RWTA 1R59O 4GNIA 5FPEA 5LJVA 3O6WA 4A61A 2QW9A 4CZEA 4H5NA 5AFUA 1MA9B 2A40A 4FL9A 2P9UA 5BN9A 2HF4A 2D1KA 1TUYA 4I6MA 3A8YA 4O8KA 1HUXA 4JHDA 2W40A 3UKUB 3VEZA 2A5XA 3CJAA 2V7ZA 1NGAA 5AQKA 2ASPA 5AQSA 4BGBA 1BU6O 4PKIA 4B1WB 3ULEB 4PL7A 5AZJB 2GTDA 4E1JA 2J4RA 2YJFA 2A3ZA 4C23A 3VGLA 3CJ1A 3WXLA 1Y64A 4ISEA 5BRDA 2D4WA 1NM1A 2P9IA 5AQHA 1NGCA 1EQYA 3SMPA 4IO8A 4AM7A 5AR0A 4BR4A 5BREA 2QXLA 3QDKA 1S3XA 4H5VA 2P9PB 1HX1A 3CHWA 1QZ6A 3FFKB 2P9NA 3CQXA 4DB3A 2QWQA 5F2RA 1MWMA 2ZGYA 2GWKA 3UKRA 4K41A 3VF6A 5LJWA 5EVZA 4CBUA 1NGEA 2V52B 1QHAA 1U6ZA 1P8ZA 4BRQA 1IG8A 2P9LA 3ATVA 3TU5A 4XH1A 1ATRA 2E2NA 4FOEA 3DXMA 1QQMA 1C0GA 4B9QA 3R8EA 4BRDA 1TYQA 1U2VB 1GLBG 1KXPA 2E1ZA 1HPMA 5AQFA 2YHWA 3EZWA 5BR9A 4JD2B 3BEXA 3WXIA 3DJCA 5AQJA 3QBWA 2PAVA 3ZETA 5AQIA 2ITMA 5KQ8A 3ID8A 3LDOA 2F9TA 2IVOA 4CZKA 2IVPA 4GY2B 5EY4A 3UE5A 3JXUA 1HJOA 4DCHA 5BRHA 4B1UB 4FWRA 2P9UB 3D2FA 1NGBA 2VCPA 2E88A 1GLDG 3CI5A 1JCGA 5F0XA 3H46O 2FXUA 1BG3A 5AQZA 4JHDB 5E84A 4BRIA 1KAZA 4BRPA 4BRFA 1LCUA 4BR5A 4FWMA 5EXWA 3KVGA 2IVNA 1ESVA 3DXKA 3SMSA 3A0IX 1NGJA 1T44A 2ASMA 4H5WA 1H1VA 2GUPA 4B1ZA 2YHYA 4A2BA 4BR0A 5KQDA 1HKCA 4WQ4A 5AZIB 4H0YB 4CZLA 2YCHA 4DQ8A 4FOIA 1Z6RA 2P9NB 1NGGA 2AA4A 2A41A 1QQOA 3IUCA 2DPNA 3G25A 3UB5A 4IJNA 2YHXA 4EFHA 4NO7A 4Y0WA 4CZFA 4FWKA 2KHOA 3CERA 4PKGA 4RCHA 4BQLA 4BC4A 1NGFA 1YAGA 4FWOA 2Q1NA 4CZMA 3O1WA 3H45C 3FZFA 3DXMB 4QS8A 5JLFA 1E4FT 1TYQB 3ZX3A 4BVOA 3D7EO 4YDUA 2QWRA 5EX5A 4O5FA 3TPQA 3DAWA 3A5OC 3CJBA 3W3DA 3ZETB 1ZBSA 5ELZA 4QS9A 2BUPA 5FPMA 1CZAN 1HKBA 3KHYA 3LM9A 1BWFO 3LDQA 3WEEB 3ENOA 4HWIA 5KPTA 2Q97A 3CIPA 4L3QA 1IJJA 4QS7A 3WUHA 3D2FB 3IFRA 1TUUA 3M6GA 2YI1A 1Z05A 2PBDA 4BRNA 3U9ZA 4BR7A 1GLEG 3VOVA 1NGIA 4H5RA 3AARA 2ZGZA 1JCFA 3VETA 4M7YA 2HF3A 1HKGA 4CZHA 3O08A 3VESA 4H0VB 2WUSA 3MN6A 4BRGA 5JLHA 2QWOA 3M3ZA 1OKJA 3U9DA 2A42A 4K42A 5AQPA 3JS6A 3FGUA 2VYPA 5KPZA 4BR9A 2GELA 4JAXA 5B8HA 3QMLA 4A62A 1V4SA 3EO3A 2VWBA 4K43A 3HSCA 2Q36A 4H03B 4XH5A 5I9EB 2W41A 4FWPA 4BREA 2QM1A 4CD1A 3FZKA 5JICA 1NLVA 3M1FA 2CGKA 5EOYA 3I33A 3HM8A 4WQ4C 4CJ7A 1WUAA 3O80A 1KAYA 4CZJA 1NMDA 2CH5A 3QFPA 3O4WA 3CJCA 4FPBA 5AQGA 4BG8A 4BVPA 4BC5A 1ZC6A 2AP1A 2BTFA 1E4GT 3MK6A 1BOTO 3MN9A 4H0XB 5AQLA 3WXKA 1SQKA 1BDGA 2IIRA 3WT0A 2P9SA 2D0OA 2EWSA 3SK3A 3H3NO 4I6MB 4CBXA 4FWLA 4BRHA 2ZF5O 3L6QA 3QFUA 3J8AA 1D4XA 1XC3A 4BGAA 3R6MA 4F9OA 4BRCA 2E8AA 3C7NA 1C0FA 3RSEA 5ADXH 4H0OA 2F9WA 4MO4A 2GEMA 2E20A 4B1XB 1Q18A 3CQYA 1RGIA 3FE1A 3VEXA 3C0BA 1JCEA 1WOQA 4MLHA 3HZ6A 4EIAA 2E2QA 4WYBA 1ATNA 1J6ZA 5E26A 2P9IB 3P4IA 3VF2A 4BR2A 4IJAA 3A5NC 3VGMA 5AQOA 3O5BA 1ZXOA 4BRKA 2OANA 4M7XA 3D2EA 3F9MA 4EHUA 5AQMA 2FSJA 2Q0RA 3UKRB 3MN5A 3ZEUA 4EAHD 2QWMA 2Q2RA 1V4TA 3BP8A 2UYTA 3EKUA 2P9LB 4NB4A 3U4LA 4B1VA 3FLCO 3HBTA 3LDNA 4ISGA 4CBWA 5BN8A 3VERA 3OHRA 1GLLO 5KPRA 4KBOA 3S41A 3SJHA 4CZIA 5FPNA 4CD3A 2E1YA 3HTVA 3R9PA 3CJ7A 4FSVA 5FPDA 1X3MA 3AAQA 3FZMA 3WQTA 2NZTA 4BC3A 3VEYA 2FSKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Y1JA 4B3MK 2QXFA 2P9KA 4CEZA 1TK8A 4OGCA 4NLBA 4CJ4A 4AHVA 1NGDA 1WSGA 2P9SB 3D0PA 3I55N 2LR3A 3NH1A 3U8XA 2IC3A 2KW4A 1EO1A 5HRNA 3OYLA 4Z4GA 4BY9C 1DEJA 5AQRA 1BMRA 3M8SA 1TKDA 1ASWA 4DMNA 4OPKA 3HJFA 1K8KA 1NK5A 1WBBA 3AA4A 5HBMA 1MWKA 2P5GA 1DKGD 3QESA 3J7YP 3HP6A 1HJRA 1LAVA 2OPPA 5GIOA 4J2DA 4DQIA 3FR0A 4B9SA 3KD5E 2YHBA 4FJ9A 4DF4A 3ZT3A 1FXXA 3OYEA 1QQNA 2OTJN 3HP9A 3ID6A 1NBWA 3PUFA 1X9JA 4E7JA 5BPLA 3A5MC 1YUWA 5AZIA 4U7BA 4BQZA 3THXB 4RW8A 1SZ2A 3D2EB 3QEXA 1K73O 4CF1A 4I2PA 4RW6A 3VF4A 3AO4A 3VEWA 3HI0A 3IMXA 4ELVA 4UJ0A 1TAQA 4YFUA 3NGZA 3CM5A 5CYQA 4M3RA 4YOYA 5AQXA 3KD1E 3V1QA 2HHHK 1G99A 3L4IA 1DTTA 1Q86O 3AVFA 4K8XA 4YORA 3KOZA 3KK2A 3UKUA 2VGNA 4O4GA 4LH4A 4A57A 4H0PA 2XY6A 3E66A 2G8VA 4CJEA 2JDQD 2YEOA 1C6VA 4A2AA 1HNZK 4CEQA 4FLTA 4W5NA 4CEEA 3QBXA 1RT2A 3SV4A 5AQVA 1JLCA 4FZXC 4DU3A 4F2SA 3MMVA 1YIJN 3AAPA 3OS1A 3VENA 4M45A 3W0LA 4BROA 4JI6K 3CQ8A 2E2OA 3EL2A 3LM2A 4FVUA 3LP1A 2QWLA 1MDUB 5HLFA 1OH7A 1X1PA 4HHTA 4CQKA 1KVAA 4JRQA 1U47A 3MWTA 3V81A 2QWNA 5AQNA 4E1MA 2B5JA 4IFYA 4J8FA 1FW6A 1W7AA 4N47A 4FW2A 4JK9A 2HVHA 4KI4A 1QZ5A 3OYHA 1U2VA 4IEEA 3AO5A 2YNFA 4DFJA 4JI4K 1OZZA 4OPHA 3MEGA 2V7YA 5KGXA 3V9WA 4KO0A 3RRHA 2GMOA 3CCSN 2O4GA 3LDPA 3AVMA 3O8MA 1ICAA 3VEOA 1Y97A 5LY3A 4CEFA 2E6LA 1ASUA 2Z1JA 4M63C 3CXCM 1BA0A 3GG4A 5BPMA 2QA4N 4F8RA 3BF3A 4RWTA 2D0BA 4A61A 3VQAA 1WMTA 4AF1A 1T3VA 2D0CA 4FLWA 1X9MA 4FL9A 5BN9A 4HTUA 3T19A 2MN5A 4O8KA 1HUXA 1NK8A 3OYDA 4OKJA 3VEZA 4CCHA 1I2UA 1LQIA 1S5JA 3SQ4A 1NJXA 1NGAA 2BE2A 1I94K 3HK2A 1BU6O 3J80O 4B1WB 2XRIA 1J53A 2GTDA 3LZIA 1BCOA 4ZTFA 2A3ZA 1HQEA 3TTFA 1BRZA 4H8KA 4AHRA 2P9IA 5AQHA 2EHGA 4AM7A 1QVFM 5C12A 4DR4K 5AR0A 4JYAK 4JI5K 4DV6K 4B9UA 3QIPA 4DTRA 3IAYA 3O9UA 4FJGA 2G2KA 4DSIA 4HUFA 4DTSA 1VQKN 3CQXA 4KPYA 4DB3A 2QWQA 1MWMA 1RDDA 1YJWN 3NAEA 5J2MA 4BWJA 4CBUA 1QHAA 1P8ZA 4FM1A 4YOTA 3QEIA 1XMQK 2P9LA 3SNNA 4BDPA 2E2NA 4FOEA 1QVGM 1EP4A 1N32K 2GL1A 4LD0A 3LPTA 2E5LK 3HVTA 1HPMA 3EZWA 3IKMA 5BR9A 4JD2B 3BEXA 3Q7BA 3DJCA 3ZYYX 1XHZA 2UUBK 3LANA 2HHSA 4BE0A 1LAWA 1JLGA 1U4BA 1XC9A 3ID8A 5J1EA 3LDOA 3CMEN 2X6NA 1HJOA 1X9WA 2IAJA 5BRHA 2BH1A 3D2FA 4KTZA 4X62K 2E88A 3KP1A 4DU1A 1A5WA 2IOCA 2DFEA 4RW4A 5FLXO 4BRFA 4IG3A 1HPZA 2FBTA 1YI2N 4JKHA 4BACA 4NCAA 4Y1CA 4FWMA 2HBKA 2IVNA 5M1PA 2LJ7A 3SMSA 4DSLA 4M3WA 1TKXA 5CYMA 1NGJA 1T44A 3EY1A 4CGDA 1SNBA 4H5WA 4LSNA 4NXMK 4OLBA 4B9NA 2BANA 3OYGA 3WXMB 1YF5L 1ILYA 1HKCA 1HNVA 1TK0A 1IKYA 4YHHK 3THXA 4J2EA 4DQ8A 1SUQA 1Z6RA 3O4QA 2LT8A 2A41A 3IUCA 1SV5A 1J5EK 3F9KA 4IJNA 3UB5A 1VRTA 2YHXA 4CIEA 4EFHA 5C2DA 4CHQA 3E9LA 4FLYA 3RMDA 2Q1NA 1VQMN 2G8FA 5DK5A 1SS6A 3O1WA 3I56N 3DXMB 3CMAN 3JYTA 4YDUA 2QWRA 3SUPA 3MXIA 2N2RA 4O5FA 1JZBA 3OBYA 3OS0A 4DR7K 3ZETB 2G8IA 5FPMA 1WSHA 2MZ0A 1C56A 3SPZA 3LDQA 3OYKA 5T7BA 2Q97A 4WF9L 2JGUA 1IJJA 4QS7A 1ZBHA 1YTUA 1WN7A 2YI1A 4JRPA 3CYMA 4CERA 3DYAA 2I5JA 3DLHA 1VQLN 4BR7A 3VOVA 1NGIA 4H5RA 3BZKA 3E1YA 3VETA 2O8CB 3MN6A 3KLEA 2YV0X 1NRAA 2VWJA 3C6AA 1C55A 2W6KA 5M1FA 3PX6A 3N4QA 3FGUA 3CCVN 4ELTA 3V4IA 3L2RA 3G71N 2NRZA 3LWMA 5HRPA 4GMJB 1FKOA 1LW2A 1JXCA 3AVLA 3SAFA 3HSCA 3ZLJA 3HO1A 2HNDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2Y1J A;  4B3M K;  2QXF A;  2P9K A;  4CEZ A;  1TK8 A;  4OGC A;  4NLB A;  4CJ4 A;  4AHV A;  1NGD A;  1WSG A;  2P9S B;  3D0P A;  3I55 N;  2LR3 A;  3NH1 A;  3U8X A;  2IC3 A;  2KW4 A;  1EO1 A;  5HRN A;  3OYL A;  4Z4G A;  4BY9 C;  1DEJ A;  5AQR A;  1BMR A;  3M8S A;  1TKD A;  1ASW A;  4DMN A;  4OPK A;  3HJF A;  1K8K A;  1NK5 A;  1WBB A;  3AA4 A;  5HBM A;  1MWK A;  2P5G A;  1DKG D;  3QES A;  3J7Y P;  3HP6 A;  1HJR A;  1LAV A;  2OPP A;  5GIO A;  4J2D A;  4DQI A;  3FR0 A;  4B9S A;  3KD5 E;  2YHB A;  4FJ9 A;  4DF4 A;  3ZT3 A;  1FXX A;  3OYE A;  1QQN A;  2OTJ N;  3HP9 A;  3ID6 A;  1NBW A;  3PUF A;  1X9J A;  4E7J A;  5BPL A;  3A5M C;  1YUW A;  5AZI A;  4U7B A;  4BQZ A;  3THX B;  4RW8 A;  1SZ2 A;  3D2E B;  3QEX A;  1K73 O;  4CF1 A;  4I2P A;  4RW6 A;  3VF4 A;  3AO4 A;  3VEW A;  3HI0 A;  3IMX A;  4ELV A;  4UJ0 A;  1TAQ A;  4YFU A;  3NGZ A;  3CM5 A;  5CYQ A;  4M3R A;  4YOY A;  5AQX A;  3KD1 E;  3V1Q A;  2HHH K;  1G99 A;  3L4I A;  1DTT A;  1Q86 O;  3AVF A;  4K8X A;  4YOR A;  3KOZ A;  3KK2 A;  3UKU A;  2VGN A; 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