2BUPA

T13g mutant of the atpase fragment of bovine hsc70
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGGTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The hydroxyl of threonine 13 of the bovine 70-kDa heat shock cognate protein is essential for transducing the ATP-induced conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
molecule tags Chaperone
source organism Bos taurus
total genus 122
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-09-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2bupA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2bupA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2bupA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2bupA04
4YDUA 1YAGA 3HBTA 3O5BA 4JD2A 3O4WA 1GLCG 1SAZA 5BRHA 5CE3A 4CBUA 1YUWA 5AZJA 3F9MA 3JXUA 1RDWX 3FZFA 3R6MA 3M3ZA 1GLFO 3UB5A 4EAHD 4WQ5C 3CJAA 3HZ6A 1HKBA 2VYPA 4CZLA 2QWRA 1NGIA 1DKGD 4CZKA 2KHOA 2NRHA 4B1XB 2P9UB 4BRQA 3O80A 5EY4A 1ATRA 1U6ZA 3DXMB 3MN6A 5ADXH 2I7NA 1KAXA 1G99A 3FGUA 3CHWA 1GLAG 3WEEA 1NGAA 2P9LB 4FO0A 4H0TB 4BVOA 2E2NA 1BWFO 4IO8A 5FPDA 4NB4A 5BN9A 3EKUA 3VEYA 1QQMA 3BEXA 4BR0A 4FWQA 5BR9A 1LCUA 4FWNA 4FWLA 4CI6A 3DXKB 4CZGA 3QMLA 5F0XA 1NGGA 3O1BA 2FXUA 4E1JA 3ZX2A 4Z94A 1X9JA 3C7NB 3VESA 4PL7A 1CZAN 2IVPA 3EO3A 4CZEA 2V52B 4WQ5A 4BREA 5AQRA 5AR0A 1TYQB 4CD1A 4H0YB 5JLFA 3O1WA 1TUYA 2CGLA 3EZWA 3DXMA 3SMPA 3P4IA 3L6QA 3QB0A 2FLOA 5JICA 3FZKA 1NGEA 3A5OC 4BRGA 1X3NA 2OANA 2QWOA 1MWMA 3S41A 3DJCA 3UKRA 3FE1A 4FSVA 4IWVA 4B1WB 1BU6O 3FZLA 3LDOA 3LM9A 1RGIA 3WQTA 4A2BA 4MLEA 1E4GT 3KVGA 3R9PA 2Q97A 4I6MA 5E26A 1ESVA 3GOIA 3A8YA 3A5LC 4BQZA 2EWSA 2GEMA 4FWOA 2P9NA 2PAVA 4RTFD 1YVNA 2P9KA 2HMPA 5AZJB 5EXWA 1NLVA 3LDPA 1JCGA 2E20A 2Q2RA 4BC4A 2E2QA 3BF3A 2GTDA 3DAWA 3HI0A 4PKHA 1Z6RA 4EIAA 2VWBA 3AAQA 4K43A 4MO4A 4BR5A 3HTVA 2GWKA 2Q36A 3AY9A 2W40A 3QBXA 4IJNA 3FZMA 5AQOA 4B1ZA 4JHDB 4H0VB 4A62A 3GE1A 4KBOA 4BRFA 2H3GX 4H5RA 5AQSA 3CERA 2ITMA 4CZHA 2ASOA 3LDLA 1C0FA 2E2PA 2FSKA 5AFUH 2AP1A 2CGJA 5EX5A 4EFHA 4BGBA 3BP8A 3H46O 2QXLA 1KAZA 1NBWA 3VEXA 3HSCA 2CGKA 2PBDA 4BRLA 2YI1A 3VEOA 1HKGA 1BUPA 3RSEA 5AQQA 2P9PA 3D2EB 1QZ5A 4XH1A 2Q31A 4PKIA 5KPTA 4F9OA 1LOTB 3MK6A 1NGHA 1C0GA 3VERA 4BRKA 2DPNA 4BROA 1HUXA 2CH6A 4JNEA 1BOTO 3WXKA 5TKYA 4FOEA 2UYTA 4IZ9A 5BRFA 5ADXA 1V4TA 3A0IX 1GLLO 1XC3A 4H0OA 3ATVA 4JHDA 3FR0A 3M6GA 1NGCA 1T44A 5AQFA 2HOEA 3JS6A 5AQGA 3IMXA 4ISFA 3SLCA 5BPLA 3VETA 4H5TA 4HTLA 1IG8A 1QZ6A 3QDKA 3UKRB 2ZGZA 3QBWA 1GLEG 5AQTA 1DGKN 4XH4A 2Q0UA 4DB3A 4GNIA 5KQDA 4JN4A 2NLXA 1V4SA 4FWSA 1OKJA 4LC9B 3D2EA 5BRDA 5AQWA 4CZJA 4BR9A 1ATNA 1T6DA 4I6MB 1X3MA 3VEZA 4BRPA 3VF6A 4H0XB 4ISGA 5AQXA 3U4LA 3O6WA 3EL2A 3QICA 1HX1A 2J4RA 5FPMA 2ASMA 2BTFA 2P9NB 2P9KB 5AQNA 3IDHA 3AARA 1NM1A 5JMVA 3CJ9A 1J6ZA 2QWMA 1HLUA 3HM8A 3KZBA 1TUUA 2VCPA 3H45C 5LY3A 2A5XA 4BRHA 4M7YA 2FF3B 4CJ7A 1Q18A 2FSJA 5ELZA 1GLJO 3FFKB 4H0PA 5EVZA 4FWKA 1HJOA 3ENOA 1YXQA 1Z05A 4BRIA 4ISEA 3CJBA 4EHUA 4QS8A 1ZBSA 1K8KA 3OHRA 4O8KA 3VGMA 2E1ZA 1H1VA 2A3ZA 2P9IB 2WUSA 4H5VA 5AQVA 5KPRA 4JAXA 4B9QA 1E4FT 4MLHA 3VGLA 3H3OB 2F9WA 3U8XA 3U9ZA 3LM2A 1ZXOA 3RSEB 3EKSA 3UE5A 3QFUA 3IUCA 2YJEA 4BGAA 1NGFA 4BQLA 2P9PB 3FZHA 1XQSC 1SQKA 3L0QA 5KPZA 3BUZB 3GG4A 4QS7A 4BC5A 4M63C 3A5MC 4BRMA 3H3NO 3D7EO 3ATUA 1WUAA 4WQ4C 3SJHA 3WXIA 1BG3A 1GLDG 4H03B 4K25A 5AQKA 3H1VX 3O8MA 5LJWA 4H5WA 1NMDA 4B1UB 5AFUA 2ZGYA 2W41A 4WYBA 2NZTA 1BA1A 5F2RA 3MDQA 5B8HA 3O08A 4GY2B 4FWMA 2ZF5O 2P9IA 4O5FA 4CBXA 1DEJA 3SMSA 2QWQA 2IIRA 4PKGA 2FF6A 4DQ8A 3LDNA 1S3XA 2GWJA 2YCHA 3IFRA 1EQYA 5FPEA 3ZEUA 5LJVA 1QQNA 2CH5A 4PL8A 5AQHA 3I8BA 1NGBA 4BR2A 1SZ2A 4RCHA 2HF3A 1MA9B 3WXJA 4IXCA 3AAPA 5AQLA 3BF1A 2YJFA 3VOVA 2AA4A 2E8AA 3MN9A 3GL1A 1WOQA 3WXLA 2A40A 3VEWA 5EOYA 3G25A 2YHWA 1HKCA 4A2AA 2QWPA 3LL3A 4CZMA 4WQ4A 4BRNA 3TU5A 1ZC6A 2GUPA 3ZX0A 3U9DA 1U2VB 4BR7A 1T6CA 2D4WA 3ID8A 3VF2A 3VGKA 1ATSA 2A42A 3I33A 3ULEB 1GLBG 4BC2A 3W0LA 3B8AX 4BRCA 1NGDA 3CJCA 3MN5A 3UKUA 2GELA 4QS9A 3A5NC 2E88A 4K41A 4FPAA 1K8KB 3MCPA 4BG9A 4RWTA 4XH5A 5AZIA 1KXPA 2QWNA 2E2OA 1JCEA 3ZETA 1BDGA 5BPMA 2IVNA 2E1YA 3TPQA 3CQXA 2ASPA 4BVPA 5I9EB 2BUPA 1BO5O 1S22A 1IJJA 3GBTA 4Y0WA 3CQYA 4BR4A 4BRDA 4CBWA 2V7YA 4M7XA 3EN9A 1U2VA 2FSNA 4DHYA 4FWPA 3ULEA 4BG8A 5AQZA 1XUPO 5F1XA 2P9UA 3W3DA 3M1FA 4B1YB 2YHXA 1JCFA 5AQUA 1P8ZA 3WQUA 3CIPA 4MO5A 5BN8A 4AM7A 4CZFA 3ENHA 2IVOA 2P9SB 4L3QA 4XEIA 2P9LA 4C23A 2I7PA 3MN7A 1NGJA 1MDUB 1RFQA 3ZEUB 4FWRA 3ZX3A 1D4XA 4YDUC 3KHYA 4FOIA 4HWIA 4BRAA 4DCHA 2QW9A 3DXKA 3WUHA 5JLHA 2V7ZA 2V51B 2Q1NA 3QFPA 3D2FB 1HPMA 3C7NA 3VEVA 2A6AA 4JD2B 1BA0A 4NO7A 2QWLA 4CZIA 4B1VA 4FPBA 3MMVA 1MWKA 1TYQA 4IJAA 2YHYA 4FL9A 5KQ8A 3VENA 1R59O 2D0PA 2F9TA 4A61A 2D1KA 4BC3A 5AQPA 3FLCO 5AQJA 5AQIA 3C0BA 2P9SA 4EHTA 4J8FA 2D0OA 2ZWHA 3LDQA 3H1QA 3DWLA 2Q0RA 3CJ1A 2HF4A 3CETA 3SK3A 1QQOA 3J8AA 3H6EA 4AM6A 4K42A 4H5NA 1Y64A 5FPNA 3VF4A 2A41A 3CI5A 3UKUB 5BPNA 1KAYA 3GDQA 5BREA 4CD3A 5AQYA 2QM1A 3L4IA 3WT0A 5AZIB 3VPZA 3WEEB 5AQMA 5E84A 3R8EA 1QHAA 1NWKA 3D2FA 3ZETB 3CJ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ICAA 3LP2A 4BE1A 1I2UA 1WAJA 4Y1DA 1UA1A 4E7IA 1VSKA 2E5LK 3I55N 5IWAK 2OPSA 3JXUA 4CF0A 1GLFO 5HL7L 1YF5L 4EAHD 1YHQN 1HKBA 3D6RA 2QWRA 3HOSA 1C0MA 3L3VA 2NRHA 1Q9XA 4NCBA 1L5UA 1T0ZA 3O80A 5EY4A 1QHTA 1ATRA 3KLGA 4B08A 1G99A 3FGUA 3WEEA 4BVOA 3SUQA 4FO0A 1YITN 2E2NA 4RW6A 2P5OA 4RG8A 4NB4A 5BN9A 2A7TA 4FJGA 4BDPA 2HHWA 4KH4A 4DSIA 1L4VA 1JKZA 4CFBA 1U47A 3QEIA 1QSYA 5M1NA 1K9MO 1NGGA 3ZX2A 1X9JA 3PO5A 1IKYA 2HNDA 2KW4A 3KOWA 3QESA 1T3VA 2AJQA 1NK9A 3EO3A 4BREA 1YIJN 5AQRA 5CR4A 2E0HA 2ZM6K 1TKZA 4KTQA 4DU4A 2VQEK 4E3SA 4AQYK 3P4IA 3QB0A 4OLAA 1C0UA 3S3NA 4KH6A 1NGEA 3CG7A 3MX2A 3SPZA 2NRVA 1RTDA 4JV5K 3O9TA 3KK3A 1VSFA 3L8BA 2IAJA 3S3MA 5J2NA 3LM9A 4CIFA 2LSNA 2Y1JA 1NH5A 3JSMA 3KC6A 3G6EN 2HB5A 1XRSB 1OH8A 2YNFA 3R9PA 4C8KA 3N4PA 4DQPA 1ESVA 2NRZA 4BQZA 3A5LC 1RILA 4CGFA 4CECA 5AJ3K 4FWOA 4IOXA 2P9KA 5AZJB 4CFDA 3KD5E 1S72N 1VRUA 3ZT4A 4X62K 1BIZA 3DAWA 5CHIA 1Z6RA 4Z4IA 1Z25A 2A1SA 5GIPA 1MYNA 4DV2K 2GWKA 1ZBUA 4AHRA 5GIOA 5BR8K 1IKWA 5AQOA 4B1ZA 4JHDB 3CYMA 3K58A 1REVA 3CERA 4CZHA 5AQSA 3VQPA 1D9FA 2HVIA 2FSKA 5KTQA 1RT6A 1SS6A 1N34K 4WF9L 1W7AA 1AYJA 5C12A 3SQ2A 1TI5A 2YHAA 1HKGA 1BUPA 4CJUA 2P9PA 3D2EB 4CEEA 1XNQK 1TAQA 4F9OA 3MK6A 1M90O 1NGHA 4KB0A 2FBXA 1HUXA 3RMBA 1BOTO 4Q0BA 2UYTA 5CY0A 1VSDA 2DFFA 3A0IX 2RE2A 3CCVN 5I42A 3HT3A 1BIUA 4H0OA 3FR0A 4G9ZA 4CERA 1T44A 5AQGA 3CC4N 2KSKA 3EY1A 4ISFA 3ZSXA 2M8BB 3AVCA 1NK0A 1D9DA 4YY3K 3QBWA 5AQTA 3KLEA 4XH4A 1JLAA 2Q0UA 2VWJA 3KK7A 2LI7A 3R2VA 5M1KA 4BDYA 4FWSA 3J7YP 1BCOA 4BACA 4CZJA 4XIUA 3ZSRA 1ATNA 1T6DA 1X3MA 3VEZA 3VQ8A 1KFDA 1U49A 3DLBA 1NG9A 4ISGA 1RDDA 1C56A 3TTFA 1BGXT 4JK7A 1Y97A 1Q9YA 4DS4A 2IGIA 4B8AB 5JMVA 3CJ9A 1LWCA 3NHGA 1TUUA 3ENBA 1U04A 3H45C 1NRBA 4OO1J 4BRHA 4M7YA 3K9KA 5C42A 3SYZA 1GLJO 4DTJA 1XC9A 4H0PA 1JLCA 1POIA 4KHSA 1S5JA 4HTUA 3ZT1A 3LANA 1JXBA 3TANA 2HSTA 5GINA 4EHUA 3CPEA 1K8KA 4N47A 2E1ZA 3OS1A 2G8WA 2WUSA 4H5VA 4JAXA 2VY6A 4O44A 3H3OB 1QVFM 5FDLA 3B6OA 4DV4K 2OYQA 1T1TA 3IUCA 3AVAA 1NGFA 5GAHP 4CJRA 4CGGA 4LF7K 2HHIA 5KPZA 5J2MA 4W5QA 4BC5A 3AVNA 1T03A 4UAEF 4HHTA 4FM0A 4BRMA 3OBWA 3S3OA 4KTZA 3SJHA 1OVQA 5J2PA 2W00A 4B9VA 2G8VA 2P51A 1BG3A 1BHLA 4NXMK 2ZGYA 1Q86O 1S9EA 3MDQA 3I56N 3NF9A 4FWMA 2ZF5O 4LD0A 1CZ9A 3TSUA 2UXCK 2HBJA 1NK7A 3VQDA 3SMSA 1BQMA 3NF7A 3IRXA 2YCHA 4JI8K 4YOVA 4UY8O 5LJVA 4E1NA 3OYGA 1IBLK 4DSFA 4BR2A 5KGWA 3WXJA 2C1GA 4OJRA 3AAPA 3OYMA 3ALYA 1WLJA 1BCGA 4RW8A 4CGDA 3C94A 3NF8A 2KZMA 2HHXA 4FK4A 2E8AA 1S1WA 2UUAK 1N32K 4W5RA 2WBNA 2N69A 4IEIA 1TKXA 1WOQA 2OZSA 2A40A 3VEWA 5EOYA 1RBTA 4B3TK 1HKCA 4IO9L 4IDKA 3E01A 3QEXA 3U9DA 1U2VB 5KI6A 1ATSA 3ULEB 3MEEA 2I61A 2ZJQL 1NGDA 4FLTA 1FKOA 4DSLA 3MN5A 2LR3A 3V4IA 4FPAA 3BK3C 2XY6A 3L56A 4NLBA 4XH5A 2UU9K 4CFCA 3SI6A 1RDUA 4IOAL 2IVNA 2A1RA 3TPQA 5HBMA 4E0DA 2KYQA 3SF4D 4FJ5A 1LAWA 2BUPA 3QETA 1S22A 5E41A 4BRDA 1N33K 4CBWA 3M8PA 2QKKA 4L8RB 2FSNA 1VSMA 2VG6A 4C1NK 4FWPA 5AQZA 4B1YB 4YOUA 2IDOA 3DRPA 1RT4A 2BH1A 4CJPA 2Z1GA 3I0RA 2OPQA 5BN8A 1T7EA 3WNEA 3ENHA 3UIQA 4X65K 2VG5A 4DF8A 3ZT0A 3ZX3A 4PA1A 3ZYYX 2G2KA 4LSNA 1D5AA 1WBBA 3QINA 4NLCA 4DCHA 4M41A 3O9UA 2QKBA 2Q1NA 3QFPA 3AO4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ICA A;  3LP2 A;  4BE1 A;  1I2U A;  1WAJ A;  4Y1D A;  1UA1 A;  4E7I A;  1VSK A;  2E5L K;  3I55 N;  5IWA K;  2OPS A;  3JXU A;  4CF0 A;  1GLF O;  5HL7 L;  1YF5 L;  4EAH D;  1YHQ N;  1HKB A;  3D6R A;  2QWR A;  3HOS A;  1C0M A;  3L3V A;  2NRH A;  1Q9X A;  4NCB A;  1L5U A;  1T0Z A;  3O80 A;  5EY4 A;  1QHT A;  1ATR A;  3KLG A;  4B08 A;  1G99 A;  3FGU A;  3WEE A;  4BVO A;  3SUQ A;  4FO0 A;  1YIT N;  2E2N A;  4RW6 A;  2P5O A;  4RG8 A;  4NB4 A;  5BN9 A;  2A7T A;  4FJG A;  4BDP A;  2HHW A;  4KH4 A;  4DSI A;  1L4V A;  1JKZ A;  4CFB A;  1U47 A;  3QEI A;  1QSY A;  5M1N A;  1K9M O;  1NGG A;  3ZX2 A;  1X9J A;  3PO5 A;  1IKY A;  2HND A;  2KW4 A;  3KOW A;  3QES A;  1T3V A;  2AJQ A;  1NK9 A;  3EO3 A;  4BRE A;  1YIJ N;  5AQR A;  5CR4 A;  2E0H A;  2ZM6 K;  1TKZ A;  4KTQ A;  4DU4 A;  2VQE K;  4E3S A;  4AQY K;  3P4I A;  3QB0 A;  4OLA A;  1C0U A;  3S3N A;  4KH6 A;  1NGE A;  3CG7 A;  3MX2 A;  3SPZ A;  2NRV A;  1RTD A;  4JV5 K;  3O9T A;  3KK3 A;  1VSF A;  3L8B A;  2IAJ A;  3S3M A;  5J2N A;  3LM9 A;  4CIF A;  2LSN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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