2BUPA

T13g mutant of the atpase fragment of bovine hsc70
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGGTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The hydroxyl of threonine 13 of the bovine 70-kDa heat shock cognate protein is essential for transducing the ATP-induced conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
molecule tags Chaperone
source organism Bos taurus
total genus 122
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-09-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2bupA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2bupA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2bupA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2bupA04
4FWPA 4B1VA 1MWMA 1JCEA 4BR9A 1BA1A 1TUYA 2GUPA 1QZ6A 3DWLA 4CZGA 4DB3A 4IWVA 4M7XA 3VF6A 5AQXA 3S41A 4B1UB 5ADXA 4FWNA 4XEIA 4FWSA 1MDUB 1HX1A 3EO3A 3HBTA 2YJFA 1NGGA 2GTDA 3WUHA 4BRPA 5AZJA 5AR0A 3FZHA 4CJ7A 4A62A 3FGUA 4FL9A 3DXMA 2ITMA 2P9KB 2GELA 4B1YB 1QZ5A 3EZWA 2UYTA 2A42A 3QBXA 4BGBA 3W0LA 3MCPA 5AZIB 3I33A 4QS8A 4IO8A 4FWRA 2VCPA 4CBWA 5B8HA 5AQPA 4BR2A 5EX5A 4BC3A 4H5TA 2E1ZA 4CZHA 3O6WA 2I7NA 4K42A 3WQUA 2WUSA 2P9LA 2YHWA 3EKUA 5AQHA 4BG8A 4CI6A 3UKUA 3IFRA 1NMDA 2E2OA 2CGLA 2GEMA 4H0TB 4BR7A 4CBUA 2ASPA 4MO5A 5BPLA 5JICA 3QFUA 4BRHA 2FF3B 1JCGA 3RSEA 4BVOA 4BGAA 3H1VX 1NLVA 3SK3A 4JD2A 1SAZA 3ZX2A 3R9PA 3H6EA 4CZMA 3GG4A 1IJJA 2D0OA 2CH5A 4BRQA 3ENOA 1DEJA 3HSCA 5ELZA 4BG9A 3CQYA 4YDUC 3CJAA 3O1BA 1RFQA 5BREA 3KVGA 5AQYA 1BWFO 1G99A 5FPEA 2HMPA 4H0VB 1DKGD 1ZXOA 3SJHA 4JNEA 1Q18A 4B1WB 5AQUA 1YXQA 5BRHA 3GE1A 3BUZB 4AM7A 5KPZA 3EL2A 3GOIA 3WXJA 5JMVA 3CJBA 4DHYA 3VEYA 3ATVA 3D2EB 3UKUB 4WQ5A 4A2AA 2HF4A 2KHOA 3QDKA 3R6MA 2YHXA 3QFPA 1NGDA 1BUPA 5AQRA 2AA4A 2YCHA 2Q97A 3WEEB 3FR0A 4EIAA 3CI5A 2HF3A 4DCHA 2P9UA 3LDLA 5EY4A 2I7PA 3LDPA 4BRKA 4K43A 1V4TA 3QB0A 1BA0A 1RGIA 1MWKA 3AAPA 4A61A 2CGKA 3SMSA 5AQNA 2GWKA 4FPBA 1JCFA 5EOYA 2PBDA 4WQ4C 2Q31A 1KAYA 2P9IA 3R8EA 4PL7A 3QBWA 1GLLO 4H0PA 4NO7A 3L0QA 4JAXA 3M1FA 4MLEA 3A5MC 1CZAN 4BRGA 4FWOA 4BRNA 2H3GX 1HJOA 2QXLA 1LOTB 4O8KA 3LDNA 2FLOA 2Q0RA 1IG8A 3MK6A 4I6MA 3UB5A 5BPNA 1HKBA 3O8MA 3UKRB 3W3DA 2CGJA 4BROA 5AQVA 3VPZA 4F9OA 3GBTA 5JLFA 4PKHA 4CD3A 3LDOA 3HZ6A 4LC9B 2IVOA 4WYBA 3ZEUA 5BRFA 4ISFA 4NB4A 3WXKA 2E2QA 4IJNA 3U4LA 4B1ZA 4BC2A 3DAWA 1T44A 5KQ8A 4RCHA 2E20A 1YAGA 2IIRA 3WQTA 4BRMA 2FSNA 3A5NC 4H5NA 1HKCA 4BRCA 3WT0A 3FZFA 2FXUA 1X3MA 4RTFD 1C0FA 3F9MA 1V4SA 2PAVA 4HTLA 2ZWHA 1SZ2A 4QS9A 2P9NA 3M6GA 3D2FB 4FOIA 5AQSA 1T6DA 2YI1A 5I9EB 2FSJA 1NGHA 4KBOA 1NM1A 2BUPA 5EVZA 2A40A 4BRAA 2P9PB 5JLHA 5FPMA 4BRIA 2BTFA 3ZETA 3BP8A 1NGAA 3SMPA 4PKIA 4YDUA 5EXWA 3KZBA 3VGLA 2A5XA 3SLCA 3JXUA 5ADXH 5AZJB 3ULEA 2YHYA 3H1QA 1H1VA 3VF4A 3CHWA 2HOEA 3DXKA 3FLCO 5CE3A 2NLXA 4H5RA 3LL3A 3H45C 4A2BA 3DXMB 2A41A 2IVPA 3ZX3A 1U2VA 4H0YB 4H0OA 3ZX0A 3ENHA 4IZ9A 5LJVA 4K25A 3IUCA 2Q2RA 3LM2A 4BC4A 1YUWA 1HKGA 4QS7A 2E88A 4BQZA 1E4GT 5AQFA 2P9LB 4BREA 3FZMA 2Q1NA 3ZETB 4GY2B 5AQJA 3BF1A 1NGJA 2QWPA 3CJ1A 3B8AX 2P9SA 3QICA 3OHRA 3VESA 2GWJA 4BR0A 3RSEB 4XH1A 2Q0UA 4ISGA 2ZGYA 1HLUA 1NBWA 4WQ4A 3KHYA 4JD2B 4H0XB 3UE5A 1ATNA 3CERA 4FWMA 1QQNA 3VGKA 1QQOA 1NGEA 4EHUA 2ZGZA 5TKYA 5E26A 4CZFA 1U2VB 5AQTA 1XUPO 2W41A 2AP1A 5FPDA 2F9WA 1QHAA 1Z6RA 2YJEA 1Y64A 1NGIA 5AQOA 1K8KA 3VENA 2OANA 2D4WA 3BF3A 3WXIA 1TYQA 2QWOA 3H3NO 1U6ZA 5AQKA 1C0GA 3JS6A 4L3QA 2QWNA 3CJ9A 4BRLA 4BRDA 1R59O 4J8FA 4B9QA 2P9SB 4RWTA 2NZTA 3VERA 1P8ZA 4FWQA 4H5WA 3CETA 4FO0A 1J6ZA 3GDQA 2E2PA 3P4IA 2QWMA 2E1YA 5AQWA 2P9UB 4CZKA 5E84A 1BU6O 2QM1A 5AFUH 5LY3A 4ISEA 2A6AA 3HTVA 3IDHA 3L6QA 4EFHA 3GL1A 3MMVA 4CBXA 5BRDA 1NGBA 2D1KA 1BG3A 5AQIA 3O08A 2E2NA 2P9KA 2V7YA 3VF2A 1K8KB 3MN7A 1EQYA 4JHDA 1BO5O 4FPAA 2P9IB 3FE1A 3CJCA 1WOQA 3FZLA 2D0PA 1ATRA 2EWSA 5AQLA 1XC3A 4E1JA 4O5FA 3C0BA 5FPNA 4FSVA 3TU5A 2CH6A 3MN6A 5BN8A 4I6MB 2ASMA 3C7NA 2QWLA 3I8BA 2FF6A 3DJCA 4BR5A 3CJ7A 3ZEUB 4AM6A 2E8AA 4MLHA 2QW9A 3CIPA 3FFKB 3G25A 3H46O 4CZLA 1GLJO 1Z05A 1BOTO 1GLEG 4C23A 1HUXA 4FWKA 4JHDB 3J8AA 4CZJA 1GLDG 3O4WA 3HI0A 4FWLA 5AQGA 5F0XA 3MN9A 5AQMA 2IVNA 1OKJA 1GLCG 1ZC6A 4BRFA 2P9NB 3IMXA 1ESVA 3LM9A 1DGKN 4EAHD 3VETA 2V51B 3D2EA 3L4IA 3C7NB 4H5VA 3EN9A 3TPQA 3U9ZA 4IXCA 5KQDA 4MO4A 2FSKA 4PKGA 4JN4A 1BDGA 4Z94A 3WEEA 1NWKA 2ZF5O 1KAZA 1ATSA 1KAXA 4IJAA 4CD1A 1S3XA 4M7YA 3A8YA 2DPNA 1T6CA 2Q36A 3CQXA 1LCUA 1RDWX 3ULEB 4BVPA 3BEXA 1D4XA 3DXKB 2F9TA 3EKSA 3VEOA 2W40A 2V52B 1GLAG 4PL8A 5BN9A 1QQMA 3VEWA 2ASOA 1E4FT 4BR4A 5F1XA 3FZKA 4GNIA 5AQZA 3U9DA 1ZBSA 5KPRA 2A3ZA 3MN5A 5BPMA 3AARA 1KXPA 4BQLA 3O5BA 3WXLA 5LJWA 3H3OB 1MA9B 3ID8A 1X3NA 4XH5A 1XQSC 2QWQA 3O1WA 3A5OC 1TUUA 3UKRA 5AFUA 3AAQA 3ATUA 3VEVA 5AQQA 3VOVA 3A5LC 5BR9A 4WQ5C 3AY9A 1NGCA 3A0IX 3MDQA 3U8XA 2NRHA 1X9JA 2J4RA 3HM8A 4H03B 2QWRA 1S22A 4BC5A 1GLFO 1GLBG 3M3ZA 3D7EO 5F2RA 3VEXA 2V7ZA 3QMLA 4CZIA 2VWBA 3LDQA 1HPMA 1SQKA 4HWIA 4B1XB 4XH4A 3O80A 4M63C 1NGFA 4CZEA 3D2FA 4Y0WA 4K41A 1YVNA 1TYQB 2VYPA 5AZIA 3VGMA 5KPTA 1WUAA 4DQ8A 4FOEA 4EHTA 3VEZA 2P9PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YHBA 4B1VA 1JCEA 4CJ4A 2HMIA 4RG8A 3CF5L 3AA3A 3ZSZA 4CJEA 3PX0A 1ZBHA 4M3WA 4CZGA 4M7XA 4Y1CA 4PQUA 2LR3A 5AQXA 1BRZA 2HBKA 1VQMN 4XEIA 4FWSA 1MDUB 4DTPA 4FM2A 2GTDA 3O9UA 4BRPA 4M45A 4DQIA 1KTQA 5AZJA 4FLUA 1LAVA 4CJ7A 3DRPA 4A62A 4FL9A 2LJMA 4B1YB 1QZ5A 1RDAA 3NVMA 4CBWA 4N5SA 5AZIB 3ITHA 4FVMA 2BE2A 1JLBA 3OTOK 3AVCA 4DV1K 4I2QA 1RT2A 1VSIA 2KLAA 1T05A 3RR8A 5GIOA 4R5PA 1NK4A 5AQHA 1Z26A 2PYLA 1CLQA 5K14A 1VNAA 1TK5A 3AGRA 4BG8A 3UKUA 3LDSA 2O8EA 1NMDA 3LALA 1HNZK 2SN3A 3O9RA 4CBUA 5MLCQ 4DV5K 4B08A 1LWFA 1NKCA 4MO5A 4RW8A 2QTDA 1W97L 4WFAL 4DFJA 4W5NA 1BQMA 2F8SA 3E9LA 1VAZA 3AVHA 1WWNA 3ZX2A 3R9PA 3SF4D 3GG4A 2D0CA 2ZQBA 4ELVA 2KTQA 1T8EA 4MDBA 4CECA 1HQUA 3CQYA 3VQDA 1HRHA 3O1BA 5FPEA 4K8ZA 3SJHA 1VSEA 3WNGA 3AA5X 3TTCA 1P00A 3PX4A 1I6GA 2LY5A 4OPAA 1R0AA 2G8HA 4CCHA 3VEYA 3SQ4A 2P51A 1N8RO 4FJ8A 1D5AA 2YHXA 4JEPA 4LF6K 5CR4A 3OVNA 3PUFA 3QFPA 4KKOA 1BUPA 3V4IA 2ITGA 4IDKA 4DWIA 5GADP 4DCHA 2N66A 2P9UA 3U3YA 4LF8K 1VQNN 3SZ2A 3LDPA 1OZZA 1U04A 3KHWA 3DI6A 5M1QA 3QB0A 2KZZA 4Z4FA 2XY8A 4A61A 2CGKA 5AQNA 3HM9A 3J7YP 2GWKA 4DQRA 5EOYA 3KD5E 1BI4A 1SL1A 3O3FA 1JLAA 1ILYA 3S3NA 1NJWA 4PL7A 1GLLO 1X9WA 3THXA 3L0QA 3VQPA 3KKRA 4W5TA 3M1FA 3LP1A 4MLEA 3A5MC 4CJUA 3CCRN 4BRGA 4C8LA 4FWOA 3AA2A 4CF9A 2E6MA 1JXCA 1K73O 3E7RL 4FLYA 3TTFA 3MEDA 4IOAL 1HNWK 1ITGA 4DS5A 2FLOA 2XHBA 1HR0K 5CYQA 4N56A 4DTMA 4CEBA 1J53A 3F73A 3VPZA 3KKSA 5JS2A 4XJXA 3KOWA 4R79A 4LH5A 4NB4A 2E2QA 4DTJA 4IJNA 3U4LA 3O4NA 1T44A 5KQ8A 1J5OA 2IIRA 3KOXA 4KO0A 1BL3A 1T0ZA 2W6KA 1X3MA 4RTFD 3OBYA 4W5OA 3HOSA 3NGIA 3G6EN 2P9NA 4ZHRA 4F8RA 1WAFA 2D0AA 2FSJA 1DTQA 1NGHA 4FVUA 4CIGA 3SV3A 2A40A 1NMNA 4F2SA 1RBRA 3R1XA 3TAEA 2IS3A 2HW3A 3OYKA 3MECA 3RMBA 3N4PA 4PKIA 1QQCA 2VY6A 4BEBA 3L3UA 4HUGA 5ADXH 4KREA 4O44A 1KSPA 3CHWA 3DXKA 4QCLA 5JVHL 3PV8A 3H45C 2A41A 2IVPA 4CGGA 3TI0A 3PSMA 1SEGA 2YC1C 3ZX0A 5LJVA 3OJSA 1NK0A 3V1RA 2QKKA 4K25A 1I2UA 2Q2RA 4IKFA 1HJRA 4IG3A 2FBTA 2ZJPL 2YILA 1HKGA 4QS7A 1QSLA 1E4GT 3I8DA 5AQFA 1VRUA 4OKJA 1ZBFA 5AQJA 1KVCA 1UGLA 1KC8O 3CJ1A 3SUPA 1Q8IA 2P9SA 1WAJA 1NK7A 3QICA 3HL8A 2AJQA 2FBYA 3KK2A 2WTUA 2OZMA 1Q9YA 2ZGYA 4WQ4A 1VQ5N 3O3GA 4JD2B 1I6FA 4IFYA 4B3OA 1NOYA 1U45A 1QQOA 1OMYA 2ZGZA 5TKYA 4CJTA 5AQTA 3RTVA 2DFFA 2XY6A 5HRRA 2HHXA 4M3YA 1RT6A 2JDQD 1NGIA 2YEOA 2D4WA 3ZT3A 1U6ZA 5AQKA 4PA1A 4M3ZA 4X64K 4J8FA 3P1GA 5KTQA 3PX6A 4FWQA 4MQ3A 1LAWA 3MCAB 2JWLA 3ALYA 4L8RB 2YKMA 4FO0A 1DLOA 3H08A 5FRMA 3BZCA 1UA0A 3P4IA 1U47A 4CZKA 4PHTX 4FK4A 4A57A 2W42A 5AFUH 4BWJA 1M90O 2O8FA 2A6AA 3IDHA 4CK2A 4EZ6A 4CBXA 4E7IA 2F4VK 2P9KA 2VG6A 4JI0K 3L8BA 1K8KB 2X6NA 5BR8K 1EQYA 4JHDA 1BO5O 1WSFA 2P9IB 3IKMA 5KI6A 2XRIA 4FLVA 3C95A 5EU7A 1ATRA 3QIPA 5M1FA 3V6DA 4FM1A 2KSKA 3SUOA 4O5FA 4ZTJA 3L3VA 3WXMB 1ZVGA 1TI5A 2QK9A 4DF4A 1TGOA 3MN6A 1S1XA 2QWLA 3ZT1A 2ZE2A 4NCAA 3HXMA 3SAHA 1FXXA 3AV9A 3NBPA 2PZSA 1L3UA 3NMUA 2E8AA 5TKWA 4MLHA 5J2NA 3G25A 1HNVA 1YVUA 1GLJO 1Z05A 5H1SQ 1BOTO 4HHFA 5C15A 3VTHA 2RKIA 3CC4N 1HUXA 3BDPA 4FWKA 3J8AA 4HUFA 3THYB 4IDHA 4FWLA 5AQGA 2NRZA 4FCYA 3UIQA 3C6HA 1RBTA 4W5QA 1ESVA 2ASCA 1IH7A 4EAHD 3L56A 3VETA 3VQ7A 4DG1A 3S3MA 4ZTFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2YHB A;  4B1V A;  1JCE A;  4CJ4 A;  2HMI A;  4RG8 A;  3CF5 L;  3AA3 A;  3ZSZ A;  4CJE A;  3PX0 A;  1ZBH A;  4M3W A;  4CZG A;  4M7X A;  4Y1C A;  4PQU A;  2LR3 A;  5AQX A;  1BRZ A;  2HBK A;  1VQM N;  4XEI A;  4FWS A;  1MDU B;  4DTP A;  4FM2 A;  2GTD A;  3O9U A;  4BRP A;  4M45 A;  4DQI A;  1KTQ A;  5AZJ A;  4FLU A;  1LAV A;  4CJ7 A;  3DRP A;  4A62 A;  4FL9 A;  2LJM A;  4B1Y B;  1QZ5 A;  1RDA A;  3NVM A;  4CBW A;  4N5S A;  5AZI B;  3ITH A;  4FVM A;  2BE2 A;  1JLB A;  3OTO K;  3AVC A;  4DV1 K;  4I2Q A;  1RT2 A;  1VSI A;  2KLA A;  1T05 A;  3RR8 A;  5GIO A;  4R5P A;  1NK4 A;  5AQH A;  1Z26 A;  2PYL A;  1CLQ A;  5K14 A;  1VNA A;  1TK5 A;  3AGR A;  4BG8 A;  3UKU A;  3LDS A;  2O8E A;  1NMD A;  3LAL A;  1HNZ K;  2SN3 A;  3O9R A;  4CBU A;  5MLC Q;  4DV5 K;  4B08 A;  1LWF A;  1NKC A;  4MO5 A;  4RW8 A;  2QTD A;  1W97 L;  4WFA L;  4DFJ A;  4W5N A;  1BQM A;  2F8S A;  3E9L A;  1VAZ A;  3AVH A;  1WWN A;  3ZX2 A;  3R9P A;  3SF4 D;  3GG4 A;  2D0C A;  2ZQB A;  4ELV A;  2KTQ A;  1T8E A;  4MDB A;  4CEC A;  1HQU A; 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