2E8AA

Crystal structure of the human hsp70 atpase domain in complex with amp-pnp
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Direct inter-subdomain interactions switch between the closed and open forms of the Hsp70 nucleotide-binding domain in the nucleotide-free state.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70kDa protein 1A
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 127
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2e8aA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e8aA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e8aA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2e8aA04
5FPDA 3C7NB 3ENHA 3HZ6A 4YDUA 3DXMA 4ISGA 4NB4A 2GWKA 2YJEA 5AQOA 3MDQA 3GG4A 3L0QA 3VOVA 4RWTA 2Q0RA 3LDQA 3FR0A 3FZHA 4ISEA 4RTFD 3SLCA 5TKYA 2Q0UA 2ASOA 5KQDA 3A5LC 4JN4A 1YUWA 5AQLA 2QWQA 3D7EO 3W0LA 3WXJA 4CZJA 3A8YA 5FPMA 4WYBA 3WEEA 4IJAA 3QDKA 4H03B 1H1VA 4BRQA 4NO7A 4IZ9A 3LDPA 4JHDB 1E4GT 3H3OB 1NGAA 3IMXA 3KZBA 1R59O 3VERA 2F9TA 3QICA 3MN9A 2VWBA 3A5NC 3VEVA 4FPAA 3MN7A 3ZETB 5AQFA 1DEJA 2P9IA 3O1BA 2HOEA 1NGDA 3TPQA 3TU5A 4AM7A 4A62A 5LJWA 1NGCA 3FFKB 3DXKA 2P9PA 2NLXA 2QWLA 1MA9B 5BRHA 3QFUA 3O08A 1HLUA 1TUYA 3EN9A 2NRHA 2KHOA 5JLHA 5AQJA 1BA1A 5AR0A 3QB0A 3UKRB 3SK3A 3U8XA 2GUPA 3DAWA 3O4WA 5AQGA 1P8ZA 3MMVA 3OHRA 2E1YA 3WQUA 3M3ZA 4H5RA 3A5MC 3H6EA 2Q1NA 3DXMB 3HTVA 5AFUH 4IO8A 4BQLA 1GLFO 3LL3A 3ULEB 4B1XB 1QZ5A 4I6MB 2IVOA 3AARA 4B1ZA 4EIAA 4XH5A 3VGLA 3R9PA 1S22A 4M63C 5EVZA 4BC2A 3A0IX 4YDUC 4XH4A 1XC3A 3ENOA 4FWSA 4CZIA 3BF1A 3CIPA 4BVOA 1TUUA 4K42A 2FXUA 1MWKA 3BEXA 3WQTA 3ZEUA 1TYQA 4MLEA 1T6CA 1HKCA 3H45C 4O8KA 4L3QA 5AQKA 1S3XA 2E88A 1BG3A 4BR5A 2HMPA 1NGJA 4H0TB 3VGKA 4CI6A 3CI5A 3IDHA 2V7ZA 2P9IB 4CZKA 4BVPA 1NMDA 5EOYA 1BOTO 3DXKB 2A41A 2A42A 4H0PA 5AZIA 4QS7A 2V7YA 3D2FA 2F9WA 4EFHA 3M6GA 4RCHA 3HBTA 3G25A 3FZKA 3VF6A 2GTDA 3ZX3A 2YCHA 3M1FA 4FSVA 1LCUA 2P9NB 3FE1A 1Z6RA 3VEOA 3U9DA 2OANA 4O5FA 1E4FT 3JXUA 2HF4A 5BPNA 4BRDA 1ZBSA 2Q36A 4MLHA 2IIRA 4JAXA 1ZC6A 3RSEA 4BRIA 4FWLA 3FZLA 1NGBA 2VYPA 3HSCA 2GWJA 1QHAA 1V4TA 1NGEA 5AQXA 4CZGA 1U2VB 3H46O 5AQHA 2Q31A 3LDNA 2W41A 1NLVA 1K8KA 3LM9A 3ZX0A 4B9QA 4WQ5C 4PKHA 4HTLA 1HX1A 4BG8A 5F2RA 4ISFA 3ZEUB 1TYQB 3O8MA 3CERA 3CHWA 3CJ1A 4CBWA 3FLCO 2V52B 3GBTA 3O80A 2QWMA 2E8AA 1GLCG 3GDQA 3MCPA 4IWVA 5LY3A 5JMVA 1ATNA 1HJOA 1BO5O 1KAZA 4A2BA 1EQYA 2P9KB 1U6ZA 3CQYA 3I8BA 3KVGA 4BRAA 4BRKA 4BREA 4LC9B 2DPNA 5CE3A 1DKGD 1HUXA 4KBOA 5I9EB 1QQNA 5AQIA 3S41A 4BGAA 4Y0WA 2ITMA 5BREA 3H1VX 3D2FB 2QWOA 1YXQA 5AQZA 1KXPA 4DB3A 4PKGA 1QZ6A 3ZX2A 4EAHD 3ID8A 4H0VB 2CH6A 2CH5A 4BROA 2E2PA 5EX5A 4B1UB 2YJFA 3RSEB 4H0YB 2P9UA 2FLOA 4JD2A 2P9LA 2E20A 3VF2A 3VEXA 4CZHA 2QM1A 1ESVA 1SAZA 1SQKA 2GELA 4B1YB 4CZFA 2BUPA 2FF3B 4H5TA 1RFQA 3VPZA 1NWKA 1X3NA 1T6DA 4JNEA 5BRDA 3IUCA 1OKJA 3AY9A 1HPMA 5ADXH 1QQOA 4MO4A 3H3NO 3J8AA 3ATVA 1JCFA 1GLJO 1NGFA 5AFUA 1DGKN 4B1WB 3CJBA 3FZFA 4FWRA 1NGIA 1JCGA 3WEEB 1ATSA 5AQPA 2FF6A 3A5OC 3VETA 5BPMA 1HKGA 3GE1A 4BR4A 3C7NA 4EHUA 1V4SA 2P9SA 4A61A 1IG8A 4K41A 4BGBA 5LJVA 2UYTA 5AQUA 3MK6A 3W3DA 4QS9A 1MDUB 1KAYA 2D1KA 5B8HA 2P9PB 4IXCA 2ZWHA 4CBUA 2IVNA 4M7XA 5KPTA 3SMPA 1GLEG 4GNIA 3D2EA 1MWMA 1WOQA 1C0FA 4K25A 3VF4A 1GLDG 1YAGA 2D0PA 2A40A 4K43A 4JHDA 2QWNA 5BN8A 2QXLA 2EWSA 3JS6A 5AZJA 4CJ7A 2P9UB 4FWMA 3SMSA 4E1JA 3BP8A 4XH1A 2P9LB 2H3GX 2WUSA 4BQZA 3WXLA 5KQ8A 3VESA 2YI1A 3CJ7A 4IJNA 2ASPA 2QWPA 3CQXA 4M7YA 4BRLA 4A2AA 2Q97A 4QS8A 3WUHA 4BR2A 3AAQA 3O5BA 3MN5A 2GEMA 4J8FA 2D0OA 3VENA 2FSNA 3L4IA 5FPNA 3LDOA 3VEZA 4HWIA 1Z05A 4CBXA 4CZMA 1JCEA 2CGKA 3UKRA 3BUZB 4DQ8A 1J6ZA 1SZ2A 4WQ4A 2P9SB 4CD3A 1LOTB 3ULEA 4BR0A 1CZAN 4I6MA 3C0BA 4H0OA 2YHWA 4BRCA 3VEWA 2I7PA 2J4RA 4H5NA 4BRHA 3R6MA 2QWRA 5AQYA 1IJJA 4F9OA 4H5WA 5AZIB 2A6AA 2I7NA 3D2EB 4C23A 1BWFO 4EHTA 4H5VA 1NGGA 3BF3A 2BTFA 3LDLA 5AQMA 4FWPA 2PAVA 5AZJB 2A5XA 3CJCA 3QBWA 3UE5A 4CZEA 3MN6A 3HM8A 4Z94A 2HF3A 2QW9A 1Q18A 1BUPA 5EY4A 2VCPA 4B1VA 4BRMA 2V51B 5BPLA 4MO5A 3EKSA 3EKUA 1BA0A 4FWNA 2E1ZA 3UKUA 2CGLA 5AQSA 5KPZA 2FSKA 3SJHA 5AQWA 3F9MA 1NGHA 5F1XA 3P4IA 2ZGYA 4BC4A 5AQRA 1QQMA 5FPEA 1K8KB 3AAPA 1ZXOA 4FOEA 4GY2B 5EXWA 4FWQA 4BRFA 3VEYA 4BR9A 3GL1A 1NBWA 4BRNA 3LM2A 1GLLO 1GLBG 5JLFA 3U4LA 2P9NA 3O1WA 2ZGZA 5BN9A 2W40A 4BRPA 1BDGA 3DJCA 1T44A 3UB5A 4DCHA 2YHXA 2E2OA 4FWOA 1D4XA 4PL8A 3H1QA 4DHYA 1X9JA 3EL2A 5BRFA 3CJ9A 2Q2RA 1C0GA 4WQ5A 5ADXA 2FSJA 4BRGA 1U2VA 1GLAG 3B8AX 4WQ4C 4BG9A 1RDWX 3DWLA 1NM1A 4BR7A 2NZTA 4BC3A 3QBXA 5E84A 4AM6A 4PL7A 4CD1A 3EZWA 3FGUA 4PKIA 3CJAA 1HKBA 3R8EA 2PBDA 2E2QA 4FL9A 1XQSC 2AA4A 3KHYA 5KPRA 3WXIA 1WUAA 3U9ZA 3IFRA 1X3MA 3CETA 3WT0A 3L6QA 5F0XA 2CGJA 4FWKA 3WXKA 4JD2B 3UKUB 4FOIA 2P9KA 1ATRA 4BC5A 3I33A 2YHYA 1KAXA 4H0XB 3ZETA 3QMLA 1YVNA 2A3ZA 1XUPO 3O6WA 2ASMA 3GOIA 3QFPA 1G99A 4CZLA 1Y64A 3ATUA 4FO0A 4XEIA 3FZMA 1BU6O 3VGMA 5BR9A 4FPBA 5AQVA 3EO3A 5E26A 5AQTA 2E2NA 5JICA 5ELZA 2D4WA 3HI0A 2ZF5O 2AP1A 1RGIA 5AQNA 2IVPA 5AQQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NGIA 3C7NB 3NDKA 3HZ6A 4JKGA 4F3OA 5AQOA 1LWFA 3L0QA 4CGGA 4CEEA 3TAMA 5HRSA 3LDQA 1AHOA 3FZHA 4RTFD 1IBKK 5TKYA 2Q0UA 4PY5A 1QS4A 5KQDA 1QHTA 2N2RA 4CJUA 4RW4A 2QWQA 3A8YA 3OYKA 4M3YA 4CF2A 1NKBA 4FVMA 1H1VA 4IZ9A 3LDPA 3L2RA 1E4GT 2JWLA 4E7JA 1DJTA 3K5OA 3KZBA 1NJWA 2VWBA 3A5NC 3VEVA 2RPIA 3ZYYX 4KH4A 1DEJA 3LALA 1PE4A 1VNAA 3TU5A 3T3FA 1U4BA 1NGCA 3MECA 4JI1K 2NLXA 5BRHA 2YNIA 2YC1C 2GBZA 3CCMN 1ICAA 2NRHA 3CPWM 2KHOA 5JLHA 4CVNE 4O4GA 3QEPA 5AQJA 3ZT2A 3NH0A 1JJ2M 3QB0A 3WNEA 1W2BM 3C65A 3U8XA 1VQLN 2NUBA 1P8ZA 2E1YA 4RW8A 3M3ZA 4DSIA 4FZYA 3OYBA 4I6MB 5AJ3K 2XY7A 2KFNA 1MU2A 3AARA 3SUNA 3AVKA 5GADP 3CFPA 3ZCMA 1S22A 3V81A 2WC9A 4YDUC 4M41A 1QVGM 1BL3A 1ZYVA 4IDKA 2P5OA 4FWSA 2LY6A 1J9AA 4CJFA 4CZIA 1TUUA 4K42A 3QESA 1Y97A 3DLRA 4NCBA 1VQ5N 3L8BA 1MWKA 2IAJA 3ZEUA 1TYQA 1NOYA 4FW1A 1N34K 4CEOA 1U04A 4O8KA 4L3QA 1WLJA 2E88A 4FLWA 1KLNA 4DFKA 3AVHA 1UAXA 4AB0A 2HMPA 2Y1JA 3IDHA 2QI2A 5GIOA 1LQHA 2G8HA 1XNRK 1EXQA 2KTQA 1VHXA 5CR4A 2A41A 2A42A 5AZIA 4CJWA 1LWEA 2V7YA 1Z26A 3BZCA 2B68A 3HPOA 3VA0A 1IBLK 3K57A 4JRPA 2HMIA 1Q8IA 2YCHA 3QLHA 4FSVA 5GAGP 4FJHA 1Z6RA 3VQ7A 4DR5K 2OANA 4DKWA 3S3MA 3EE8A 2MN5A 1E4FT 4I7FA 3P83D 5FRNA 4DR4K 1F21A 1RBUA 4DSKA 3P38A 4BRIA 1VQNN 2XO7A 2HB5A 2VYPA 3K9JA 1V4TA 2KJAA 3I56N 1KTQA 3QIPA 1WN7A 3O3GA 5AQHA 3V9ZA 3LDNA 3CFOA 3TAEA 1K8KA 3NCIA 3TI0A 4LF6K 3ZX0A 3IG1A 4PKHA 1XC9A 1HX1A 4Q0BA 5F2RA 3ID6A 1YIJN 1BRZA 3CJ1A 3ASMA 4CBWA 2V52B 4CFBA 4I9LA 2PZSA 2MZ0A 4B9MA 4OPJA 3MCPA 5LY3A 1OH5A 3E9LA 1OVYA 3CQYA 4BREA 3KVGA 4LC9B 5CZ2A 1I3AA 1DKGD 1JLCA 5I9EB 4OX9K 3S41A 1HJRA 4Y0WA 2ITMA 3H1VX 3D2FB 4YOTA 1A5XA 3HO1A 4BE0A 4V1DC 2HNDA 3CCEN 2UXDK 1O1WA 4CEAA 3MXIA 1N6QA 4DTNA 1RDAA 4H0VB 4UY8O 4QCLA 2Z1JA 3C95A 4BROA 2E2PA 1W7AA 2GUIA 1QE1A 1CLQA 4CZHA 3LZIA 4JKGB 3TSQA 1SQKA 4B1YB 1RT4A 3TAPA 2BUPA 4BECA 2B4JA 5DMRA 3QETA 4B3OA 3E9PA 4E7HA 4DR7K 2IDOA 4DG1A 4JNEA 1SNBA 1X9SA 3IUCA 1HPMA 3PLAA 1LW0A 3OS2A 5C15A 4MO4A 4HTUA 1BIUA 1WT7A 2Y1IA 1DGKN 4FJXA 3SAHA 3NHGA 3ZSOA 4R5PA 4LH4A 4BR4A 4V19S 4EHUA 4XIUA 3TAQA 4CCHA 3VQ4A 1IG8A 2UYTA 1GPTA 5EU7A 3W3DA 4HHTA 4JI4K 3OVNA 3WXMB 5T7BA 1SKRA 2UXBK 4E7KA 4B3SK 3ALYA 4PA1A 1VQON 5B8HA 3SAFA 4CBUA 4JYAK 4KKOA 2OZMA 4KI4A 1NK4A 1GLEG 4GNIA 1C0FA 1UWBA 4K25A 3SUOA 2A40A 5BN8A 2QXLA 3JS6A 3CM6A 5AZJA 4DTUA 2P9UB 3VQDA 4E1JA 3QIOA 3BP8A 2P9LB 2H3GX 3WXLA 3VQPA 4KO0A 5FLXO 2HHUA 2OTLN 2XRIA 2KYQA 2ASPA 4BRLA 3KTQA 1CN2A 3G10A 4AQYK 3OYNA 1RBVA 4B3MK 5KGXA 3TARA 1J54A 3PX4A 1HNXK 1IV0A 4RW7A 3MX2A 3L4IA 4AF1A 1P00A 1C56A 1IKYA 5FPNA 4DS5A 4ELVA 3C6AA 2KZMA 4CGJA 4IO9L 2I61A 3F2KA 4CBXA 4YORA 3O9RA 1ASVA 2A1SA 1JCEA 4N41A 4CJTA 4HUEA 3OA9A 3TWHA 1J5OA 3AV9A 4WQ4A 4CD3A 5C24A 3ULEA 3E7RL 3DM2A 3DLHA 1NKCA 3BK3C 2YHWA 3OYGA 2I7PA 2J4RA 4CESA 4H5NA 3LDSA 3R6MA 2QWRA 4B9LA 5AZIB 2OTJN 4DFMA 1TKZA 3SBGA 3L3VA 1XWLA 3BF3A 5AQMA 2PAVA 3M8SA 3OYCA 2BGGA 1ZYWA 1VQPN 4O55A 2QW9A 4B1VA 1S72N 4OPHA 4BE1A 1VSEA 1TVRA 2OPPA 1W97L 4DR3K 4DLEA 3P4IA 4WF9L 1K8KB 2D0AA 3AAPA 4CF1A 5EXWA 4LF7K 3VQ5A 4DQRA 1X9WA 4KTQA 2HHTA 3QNNA 5MLCQ 3VQCA 3SPYA 5BN9A 4HHFA 4BRPA 3DJCA 1AYJA 2KLAA 4FWOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3NGI A;  3C7N B;  3NDK A;  3HZ6 A;  4JKG A;  4F3O A;  5AQO A;  1LWF A;  3L0Q A;  4CGG A;  4CEE A;  3TAM A;  5HRS A;  3LDQ A;  1AHO A;  3FZH A;  4RTF D;  1IBK K;  5TKY A;  2Q0U A;  4PY5 A;  1QS4 A;  5KQD A;  1QHT A;  2N2R A;  4CJU A;  4RW4 A;  2QWQ A;  3A8Y A;  3OYK A;  4M3Y A;  4CF2 A;  1NKB A;  4FVM A;  1H1V A;  4IZ9 A;  3LDP A;  3L2R A;  1E4G T;  2JWL A;  4E7J A;  1DJT A;  3K5O A;  3KZB A;  1NJW A;  2VWB A;  3A5N C;  3VEV A;  2RPI A;  3ZYY X;  4KH4 A;  1DEJ A;  3LAL A;  1PE4 A;  1VNA A;  3TU5 A;  3T3F A;  1U4B A;  1NGC A;  3MEC A;  4JI1 K;  2NLX A;  5BRH A;  2YNI A;  2YC1 C;  2GBZ A;  3CCM N;  1ICA A;  2NRH A;  3CPW M;  2KHO A;  5JLH A;  4CVN E;  4O4G A;  3QEP A;  5AQJ A;  3ZT2 A;  3NH0 A;  1JJ2 M;  3QB0 A;  3WNE A;  1W2B M;  3C65 A;  3U8X A;  1VQL N;  2NUB A;  1P8Z A;  2E1Y A;  4RW8 A;  3M3Z A;  4DSI A;  4FZY A;  3OYB A;  4I6M B;  5AJ3 K;  2XY7 A;  2KFN A;  1MU2 A;  3AAR A;  3SUN A;  3AVK A;  5GAD P;  3CFP A;  3ZCM A;  1S22 A;  3V81 A;  2WC9 A;  4YDU C;  4M41 A;  1QVG M;  1BL3 A;  1ZYV A; 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