2E8AA

Crystal structure of the human hsp70 atpase domain in complex with amp-pnp
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Direct inter-subdomain interactions switch between the closed and open forms of the Hsp70 nucleotide-binding domain in the nucleotide-free state.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70kDa protein 1A
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 127
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2e8aA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e8aA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2e8aA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2e8aA04
4O5FA 3CJBA 3H1VX 2V51B 3VGKA 4KBOA 4BR5A 5KQDA 4K41A 3L6QA 3MMVA 5JLFA 1BDGA 4BC4A 4MO4A 4BG9A 3EZWA 4DB3A 4HWIA 1BOTO 2ZGZA 1E4FT 4RTFD 3IMXA 3M1FA 3D2FA 1NGAA 3AAPA 4WQ4C 3S41A 4CZMA 2Q31A 1GLAG 3ID8A 2ZF5O 4FWQA 3QBWA 3FZKA 2IVNA 2QWNA 5JICA 4A62A 1ATSA 3CQXA 1YVNA 2V7YA 3WXJA 2D0OA 2E2OA 2E20A 3DJCA 1X3MA 3VERA 4H5VA 3H46O 3VEVA 3BP8A 3ATVA 1RGIA 3U8XA 2P9IB 3QMLA 4NB4A 2QM1A 1QQMA 3A8YA 3QB0A 4BRQA 1NGHA 3DWLA 2GWJA 4JN4A 4QS7A 3WQTA 4BRKA 4BQZA 4B1WB 4EAHD 1T44A 5FPDA 1XC3A 4WQ5C 4BRPA 4FWLA 1QQNA 4EHTA 4JD2B 3FE1A 5AQMA 3U9DA 3CJCA 2OANA 3QFPA 2E8AA 3ENHA 4CD1A 2ASPA 4RCHA 1KXPA 5AQQA 5LJVA 4FWKA 4MLHA 2AP1A 3C7NB 2P9PB 2QWOA 3VGLA 5BREA 2P9NA 3A5NC 3IDHA 4FPBA 4XH5A 1GLEG 3SMSA 3LDLA 1P8ZA 2P9UB 3CIPA 3MN9A 3QICA 4M63C 3WQUA 3LL3A 3CI5A 3C0BA 2E1ZA 5BPLA 3QBXA 3VF4A 3EL2A 3AAQA 2QXLA 3U4LA 5ADXH 3A5LC 4FPAA 4FOIA 1GLDG 1RDWX 3ZEUA 4BC5A 1H1VA 2P9SB 3WXLA 3MCPA 4EHUA 4RWTA 5I9EB 4BVPA 2CH5A 2I7PA 4CZGA 4YDUA 2Q0RA 1YUWA 2P9KA 3HM8A 1IG8A 2NRHA 4FWNA 5AQPA 1NGEA 1BA0A 3ZX2A 1XUPO 4B9QA 4FSVA 5AQNA 2F9WA 3BF3A 2GEMA 3TU5A 4K42A 4CZHA 1GLFO 3A0IX 1ESVA 3EN9A 1NGGA 4B1YB 3D2EA 3O6WA 4MLEA 1HJOA 1HKBA 5EX5A 1HKCA 3ULEB 5AQZA 4JHDB 1V4SA 3CQYA 2QWQA 4BRHA 5EXWA 4JAXA 1LCUA 4HTLA 1ATNA 5AQFA 1U2VB 2YCHA 1Z05A 1NMDA 3KHYA 4AM6A 2CGJA 3H3NO 3RSEA 1G99A 5AQLA 1K8KA 4PKGA 2GELA 3F9MA 3IFRA 5AZJA 3BF1A 5EOYA 2Q97A 4J8FA 2ITMA 3WUHA 2BTFA 3BUZB 2CGLA 2HF4A 3O1WA 5AQYA 5LY3A 2ASMA 2FSNA 3UKRB 3FZLA 1TUUA 3H6EA 1DEJA 5BR9A 1S3XA 3KZBA 5BN8A 4BREA 4B1ZA 5BRHA 5F1XA 2IVPA 4PKIA 1E4GT 4CBWA 3GL1A 1MDUB 3QFUA 2ZWHA 3O1BA 3EKSA 3ZETA 4ISEA 2GTDA 4BRIA 5FPMA 5BPNA 2E88A 3BEXA 2VWBA 4BROA 4B1VA 4BR0A 3VENA 5BPMA 5CE3A 4EIAA 3IUCA 1GLJO 1OKJA 1QZ5A 3R8EA 4BQLA 4C23A 2PBDA 1TYQB 3UE5A 4Z94A 4F9OA 3DXMB 4H0TB 3SLCA 3SMPA 3D2FB 4WYBA 1JCGA 3GG4A 2P9IA 4CZKA 5TKYA 2UYTA 4CI6A 2A42A 5BRFA 4XH1A 3B8AX 5EVZA 2DPNA 4WQ4A 1ZBSA 2P9LA 3MN5A 2FXUA 3VEYA 4CZEA 3M6GA 1KAZA 5AFUA 3GOIA 4M7YA 3VEWA 5AQHA 3MN6A 1NBWA 4FWPA 3LM9A 1QQOA 2A41A 1SAZA 4ISFA 3H1QA 2FSJA 3UKUB 5AQKA 3I8BA 2H3GX 5AZIB 2A3ZA 4H5WA 3U9ZA 2NZTA 1WUAA 1Y64A 3C7NA 2P9PA 1HUXA 4CD3A 4AM7A 1X9JA 2WUSA 3J8AA 4BR7A 1EQYA 4I6MB 2EWSA 4MO5A 3ENOA 5LJWA 5E26A 1D4XA 2VYPA 4FOEA 5FPNA 4H5NA 4IO8A 4H5RA 3FLCO 3ATUA 3CJ7A 2A40A 4B1XB 5BN9A 5JMVA 3VEZA 4BRAA 2P9SA 1BWFO 4BG8A 4FWMA 3VPZA 4WQ5A 3VESA 1QZ6A 4CZLA 4PKHA 4FL9A 1NM1A 3HZ6A 2E2NA 2P9NB 3CJ1A 3LM2A 2ZGYA 1WOQA 4PL8A 1NWKA 3VETA 1NGCA 1HLUA 2ASOA 4L3QA 4BC2A 1ZC6A 4IZ9A 2FLOA 4FWSA 3CERA 3P4IA 4XEIA 1HPMA 1NGDA 2YJEA 4BRDA 1MA9B 2YI1A 1JCFA 3WEEA 3CJAA 4JHDA 1TUYA 2HOEA 4BRMA 5AQGA 3VGMA 2E2QA 1BG3A 1U2VA 2D0PA 2E2PA 3MN7A 4IXCA 2V52B 4ISGA 3HBTA 3O4WA 3O8MA 1NLVA 3I33A 2J4RA 2QW9A 3LDQA 3FZFA 5AQJA 3HTVA 2V7ZA 2D4WA 1R59O 3G25A 1BU6O 4O8KA 4H0YB 4K25A 5EY4A 2AA4A 1RFQA 3UKRA 4A61A 1C0FA 4BRCA 2FF3B 4BRFA 1LOTB 3GDQA 2D1KA 2I7NA 3OHRA 1X3NA 3DXKB 4FWRA 5ELZA 5FPEA 3LDOA 5E84A 5AQUA 1K8KB 1DGKN 3R9PA 4GY2B 4BRGA 3L4IA 4E1JA 3QDKA 1XQSC 4H0VB 2A6AA 3UB5A 4NO7A 1NGIA 5F0XA 4BRLA 4B1UB 1TYQA 3L0QA 3JXUA 3DXMA 1J6ZA 5JLHA 3VF6A 3VEXA 3CHWA 3W3DA 1CZAN 4BGAA 4DQ8A 3WXKA 4PL7A 2QWPA 3MK6A 3ZETB 4A2AA 3MDQA 1YAGA 3W0LA 2HMPA 1BUPA 3LDPA 2Q1NA 3FFKB 3FGUA 3O5BA 2HF3A 3EO3A 2KHOA 4IJNA 2FSKA 3R6MA 2BUPA 1YXQA 3H45C 5KPZA 1SQKA 4JD2A 4BC3A 2E1YA 3UKUA 1QHAA 4CBXA 4FWOA 5AFUH 5AQOA 1NGBA 5AZIA 3A5MC 5AQWA 3HI0A 4CJ7A 1ZXOA 5B8HA 1GLCG 3VEOA 1HX1A 1T6CA 2P9LB 4BR4A 1GLLO 4EFHA 1U6ZA 4I6MA 3DAWA 5AQSA 2P9UA 5F2RA 3GE1A 2A5XA 4IJAA 4FO0A 2Q36A 4YDUC 3LDNA 2YHWA 3M3ZA 5AQXA 1BO5O 3TPQA 5AQVA 2IVOA 5AQIA 4CZFA 4QS8A 3GBTA 4CZJA 1KAYA 1V4TA 4H0XB 4BVOA 3ZX0A 3EKUA 5ADXA 4M7XA 2GWKA 4BGBA 5AQRA 3O08A 5KPRA 4LC9B 3D7EO 5KQ8A 4DHYA 1HKGA 3KVGA 1S22A 2F9TA 4CBUA 5AR0A 2W41A 3A5OC 3SK3A 2CH6A 1MWMA 4Y0WA 2YJFA 5BRDA 3VF2A 1IJJA 2W40A 2PAVA 3ULEA 3ZEUB 3AARA 2YHXA 2QWMA 4BRNA 4IWVA 3H3OB 1Q18A 1KAXA 2P9KB 3WT0A 3O80A 3AY9A 4BR9A 1ATRA 1T6DA 2IIRA 3CJ9A 4H03B 4K43A 2YHYA 4DCHA 2Q2RA 3FZHA 3JS6A 1NGFA 3FR0A 3D2EB 2QWRA 4QS9A 3VOVA 3CETA 4CZIA 3HSCA 1Z6RA 2CGKA 2FF6A 3WEEB 2VCPA 4BR2A 3FZMA 1GLBG 1SZ2A 4H0OA 4GNIA 1NGJA 1DKGD 1MWKA 2GUPA 2QWLA 4H0PA 1JCEA 3SJHA 1BA1A 3ZX3A 1C0GA 3DXKA 4JNEA 5AQTA 3RSEB 2Q0UA 4XH4A 4A2BA 2NLXA 4H5TA 3WXIA 5AZJB 5KPTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HCCA 3K2PA 2ITGA 3MAQA 1RT3A 2Z1HA 3L6QA 1I6FA 1ZFUA 3TAGA 2ATQA 3AV9A 4DB3A 3G0ZA 4FJKA 5MLCQ 5JVHL 1NGAA 3S41A 2LJMA 5GAEP 3NCIA 4BY9C 2N66A 4HHFA 5HLFA 2ZF5O 3HJFA 3C6AA 4DR2K 2LY5A 1TKDA 2G8IA 2QWNA 1S1UA 4FJXA 3Q7CA 2O8BB 1ATSA 4FJ7A 1U47A 2D0BA 1JKHA 1TGOA 5KI6A 1X3MA 4H5VA 2HNDA 3BP8A 1NKBA 1NU0A 2NRWA 3EEQA 3HP6A 4YOWA 2YHAA 3DRRA 1XMOK 3QMLA 2O8EB 2YX6A 3L2UA 1RTHA 5FDLA 3KP1A 1BIUA 1MYNA 2F7TA 4C8NA 4DTPA 1JLEA 4CW7B 1VSJA 1OH5A 4JI0K 3DWLA 3WQTA 4B1WB 3ZT1A 4BEBA 3RR7A 5FPDA 3J7AP 1RBVA 4EHTA 1BQNA 5AQMA 4EP4A 1HR0K 4FXDA 2X6NA 4RCHA 2NRXA 4CJKA 3HVTA 4DTXA 4CF1A 1S1TA 2YILA 1Z25A 4DSJA 1VQ8N 1VHXA 3VA0A 4KV8A 3QNNA 4KB1A 3CIPA 4M63C 1NRBA 1RDDA 3LL3A 3VF4A 3QBXA 2W00A 4DTSA 1T8EA 4AF1A 5ADXH 1HMVA 5GAHP 4XJXA 3MCPA 2P5GA 2HB5A 4RWTA 3OJUA 2Q0RA 3SQ2A 1YUWA 1WBDA 4FWNA 4JI7K 2F96A 3ZX2A 1N32K 4FZXC 1NGGA 1K9MO 1RBSA 4OKJA 5KGWA 4MLEA 1HKBA 5CHIA 1S6QA 2NRTA 3AA5X 1NNEA 3AVGA 4FW1A 4IFYA 5T7BA 3TAPA 3SI6A 1NJWA 4KHSA 3SZ2A 2DFEA 1IO2A 4CHQA 1ATNA 5AQFA 3ZSWA 4ZHRA 1Z05A 1X9WA 1BK8A 3KHYA 4AM6A 3RSEA 4DTOA 1K8KA 1AYJA 4Z4FA 2E3GA 3IFRA 5AZJA 4B9UA 4CHPA 4U7BA 2OPQA 4ID5A 3NFAA 3NHGA 4J8FA 2ITMA 4DSEA 2EX3A 5D3GA 3E9OA 3BUZB 1YI2N 4K8XA 5AQYA 3E7RL 3JAMO 5LY3A 2OPRA 4FZZA 2PZSA 1TUUA 5BR9A 1BISA 3OTOK 3CC2N 3SUNA 4PHTX 3BY5A 4FJ5A 4FJ9A 3IAYA 1A5XA 4PKIA 4CBWA 1SKSA 3CFRA 3O1BA 3EKSA 3ZETA 4DV2K 1Q8IA 4GVEA 3U3GA 2O8BA 1XWLA 5CE3A 3HM9A 3IUCA 2LR3A 4JK9A 4FK0A 1QZ5A 4BQLA 1K8BA 1TYQB 2M8BB 2GV9A 4YHHK 3T69A 2KPYA 3SLCA 2K35A 3D2FB 2UXBK 4DV7K 2NY8X 4WYBA 1JCGA 4YORA 5CZ2A 2O8EA 1HPZA 1C0UA 4M3UA 2A42A 2QI2A 2DFFA 3B8AX 1ZBSA 4ILJA 4CZEA 3AA3A 1NKCA 3M6GA 3V1OA 5AFUA 3OYDA 1U49A 3MN6A 1XNRK 2HNYA 4F2SA 1NBWA 4CEDA 3E01A 2HHVA 3LM9A 1VRUA 3ID6A 4LF7K 3TABA 3RMAA 3RRGA 3MEGA 5AQKA 5M1FA 4CGGA 3CQ8A 3LWLA 3AVHA 2NZTA 4YFUA 3LZJA 4NCAA 2GL1A 2YV0X 1VQKN 4C8KA 4CJRA 4JYAK 4AM7A 1SL0A 2WUSA 1EQYA 1RBRA 2YKNA 3SBTA 1NH5A 2YIOA 1RCHA 3ENOA 2OTJN 1OVQA 3CXCM 1NMNA 1LV5A 1C0TA 4FOEA 3J80O 3SV4A 3ATUA 1ILYA 1W97L 4HUFA 1WSJA 3VEZA 1BWFO 2WBNA 3IKMA 4CJVA 2FBVA 1QZ6A 4OVLA 2P9NB 3CJ1A 3LM2A 1WOQA 1WMTA 1NWKA 1Q9YA 1NGCA 3CFOA 1HLUA 5EU7A 1EWQA 2PYLA 3LP3A 2X74A 2G8VA 1GPTA 1KC8O 2YJEA 4BRDA 2YI1A 3MX5A 1TUYA 1TKXA 3VQDA 1N8RO 5AQGA 1BCOA 4CFBA 3K58A 2QK9A 4AEIA 2SN3A 3U3YA 2E2QA 1JKZA 2E2PA 2DFHA 4IXCA 5HRRA 4OKEA 4K8ZA 1S6PA 1FJGK 3I33A 2J4RA 3NMUA 1Q7YO 3LDQA 4KI6A 3HTVA 3G25A 4LFCK 2G8UA 1L3UA 1C1AA 4K25A 5EY4A 1KVCA 4BRCA 1YJNN 4H4OA 5KK4A 4BRFA 4CGDA 4E7HA 4JI1K 4RW4A 1N33K 2KJAA 3DXKB 1L3VA 3VTHA 5E84A 2GUIA 5AQUA 3KLHA 4I2QA 4KKOA 1LWCA 3M8QA 3L4IA 4G1QA 3T1YK 1EKEA 4JS4A 1PTXA 4JKDA 1TYQA 3L0QA 4DU1A 3LP1A 3I0RA 3VF6A 3VEXA 3PO4A 2P1JA 3DYAA 5M1QA 1QSSA 4KI4A 4FYDA 4IO9L 4DQ8A 3V9WA 3C65A 1T3VA 4HUEA 3KK3A 2VGNA 2Q1NA 4J2EA 4IOXA 2JWLA 4CIGA 4GMJB 3VQ4A 3AVKA 4M3ZA 2FSKA 4FM2A 3OYKA 3R6MA 5KTQA 2BUPA 3DRSA 4MQ3A 4CEAA 3ZCMA 2B3CA 2E0HA 2E1YA 4FWOA 3AVMA 5AQOA 1T7BA 3A5MC 3E9PA 2Y1JA 3VEOA 2NRRA 4BR4A 2RPIA 4AB0A 4UY8O 4JKGB 2KYQA 2B5JA 1K6YA 3M8RA 3OYGA 4FLUA 4BECA 2P9UA 3ZSQA 2A5XA 3EE8A 2KTQA 4FO0A 3QESA 3LDNA 4CCHA 1GOCA 4JI5K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4HCC A;  3K2P A;  2ITG A;  3MAQ A;  1RT3 A;  2Z1H A;  3L6Q A;  1I6F A;  1ZFU A;  3TAG A;  2ATQ A;  3AV9 A;  4DB3 A;  3G0Z A;  4FJK A;  5MLC Q;  5JVH L;  1NGA A;  3S41 A;  2LJM A;  5GAE P;  3NCI A;  4BY9 C;  2N66 A;  4HHF A;  5HLF A;  2ZF5 O;  3HJF A;  3C6A A;  4DR2 K;  2LY5 A;  1TKD A;  2G8I A;  2QWN A;  1S1U A;  4FJX A;  3Q7C A;  2O8B B;  1ATS A;  4FJ7 A;  1U47 A;  2D0B A;  1JKH A;  1TGO A;  5KI6 A;  1X3M A;  4H5V A;  2HND A;  3BP8 A;  1NKB A;  1NU0 A;  2NRW A;  3EEQ A;  3HP6 A;  4YOW A;  2YHA A;  3DRR A;  1XMO K;  3QML A;  2O8E B;  2YX6 A;  3L2U A;  1RTH A;  5FDL A;  3KP1 A;  1BIU A;  1MYN A;  2F7T A;  4C8N A;  4DTP A;  1JLE A;  4CW7 B;  1VSJ A;  1OH5 A;  4JI0 K;  3DWL A;  3WQT A;  4B1W B;  3ZT1 A;  4BEB A;  3RR7 A;  5FPD A;  3J7A P;  1RBV A;  4EHT A;  1BQN A;  5AQM A;  4EP4 A;  1HR0 K;  4FXD A;  2X6N A;  4RCH A;  2NRX A;  4CJK A;  3HVT A;  4DTX A;  4CF1 A;  1S1T A;  2YIL A;  1Z25 A;  4DSJ A;  1VQ8 N;  1VHX A;  3VA0 A;  4KV8 A;  3QNN A;  4KB1 A;  3CIP A;  4M63 C;  1NRB A;  1RDD A;  3LL3 A; 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