2QW9A

Crystal structure of bovine hsc70 (1-394aa)in the apo state
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
molecule tags Chaperone
source organism Bos taurus
total genus 121
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qw9A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qw9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qw9A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qw9A04
2E1YA 4FWRA 4WYBA 4CZLA 5CE3A 3H46O 1GLEG 4H0TB 1RFQA 3O08A 3G25A 2QWRA 4EIAA 5JLFA 1ATRA 1NGCA 2YCHA 3IFRA 4FWLA 4H0VB 1R59O 2NZTA 5B8HA 4WQ5C 1TUYA 2DPNA 2IVPA 1E4GT 4Y0WA 4IJNA 3BF3A 1P8ZA 3WUHA 3GE1A 2YI1A 1ZXOA 2I7PA 2IVOA 3ZX3A 1U2VA 5I9EB 2P9PA 3AAPA 4PKIA 1HUXA 1GLJO 4A61A 3D2FA 1TYQA 1KAXA 1BA1A 3AY9A 4FWPA 1LCUA 4XEIA 3SLCA 4BG9A 1KAZA 4AM7A 1U2VB 2P9PB 3CJ9A 1X3NA 3D2FB 1TYQB 4RWTA 5BPMA 3A5NC 3M3ZA 3O5BA 4BRIA 3A8YA 3A5MC 2BUPA 4BRMA 1MWMA 3VF4A 2QWNA 2CGKA 4RCHA 4F9OA 1DGKN 1SZ2A 2D0PA 5AFUH 4BRKA 3UB5A 3EL2A 4DB3A 3VEYA 4BRHA 3VOVA 3DWLA 3SMSA 5F0XA 3VPZA 4FPBA 5FPEA 3H45C 3B8AX 3O8MA 3ATVA 4BR2A 4FO0A 3VEOA 2Q97A 3VETA 4BC4A 3FZKA 3RSEA 3BEXA 5BR9A 3HI0A 2ZF5O 4BR9A 3ID8A 3KZBA 3CJBA 2QW9A 2D0OA 3FZFA 4B1VA 4O8KA 3RSEB 2GELA 3CETA 1GLCG 4L3QA 2Q0RA 2A3ZA 3MCPA 1QQNA 3L0QA 5LY3A 1ZC6A 1HJOA 3L4IA 3LM9A 4BC3A 1NGBA 4B1YB 1MDUB 3LL3A 2P9UA 2HMPA 4BRCA 5AQVA 4M7YA 3A5OC 2OANA 5AQTA 3J8AA 3WQUA 1SAZA 2ZWHA 2P9UB 4NB4A 4BGBA 4GY2B 3IDHA 2E88A 3SMPA 3WXIA 1NGEA 3P4IA 2FXUA 4CZEA 3VEZA 2E8AA 1HLUA 4BQLA 4BQZA 1OKJA 2V7YA 3SK3A 4H5VA 5AQJA 5ELZA 4Z94A 2V7ZA 5F1XA 2Q0UA 1KAYA 4K41A 4MLHA 1NLVA 4B1ZA 5AQMA 3AAQA 3EKSA 1CZAN 3WXJA 2H3GX 3VGLA 3QBXA 5ADXA 1V4SA 1XQSC 2QWOA 5BPNA 1ATNA 3ENOA 4GNIA 1GLBG 2J4RA 4BR5A 3QDKA 4ISFA 4KBOA 1GLAG 3ENHA 3CI5A 2VYPA 3H1QA 2AA4A 3CJAA 4FOIA 5AQYA 4CZHA 4ISGA 4FPAA 2ASPA 2QWPA 3H1VX 2FLOA 3DAWA 4EHUA 4WQ4C 4BR7A 3ZEUA 4H0YB 3FZMA 3D7EO 3EKUA 5BREA 3C7NB 2F9WA 3CERA 4XH1A 4H03B 2YHXA 4JHDA 4PL8A 3ZEUB 1T6CA 3VF2A 3GDQA 5AZJA 4PKGA 3M6GA 3VEVA 1BO5O 1MA9B 1NBWA 3VENA 5AR0A 4XH5A 4BC2A 1GLLO 2P9SA 4WQ4A 4JHDB 1RDWX 2PBDA 5AZJB 3VEXA 5AZIA 1BUPA 5AQIA 3O80A 4H0PA 2P9SB 3MN9A 5FPNA 4CZFA 3DXKB 3AARA 5AQQA 2FSNA 5AZIB 4FWNA 4JNEA 4MO5A 5LJVA 2ZGZA 1TUUA 2E2NA 4FL9A 3FR0A 4YDUA 4JAXA 3I33A 3FFKB 3WQTA 3LDLA 2AP1A 1QZ6A 1RGIA 4B1UB 3GOIA 4FOEA 1NGIA 3H3NO 2Q31A 3GBTA 1Z6RA 5KQDA 1G99A 2WUSA 4QS7A 3EZWA 3IMXA 4C23A 1NWKA 4K42A 4BGAA 1NGAA 2QWMA 3VGMA 1U6ZA 3O4WA 4DCHA 4IWVA 4BRAA 3CJCA 5TKYA 4BR0A 1C0GA 5BPLA 2EWSA 4BC5A 2E2PA 1HX1A 3MK6A 2W40A 3GG4A 4DQ8A 4BRLA 1QQOA 1YXQA 4BRQA 1Z05A 5KPTA 2IVNA 3QICA 4CBWA 3ULEA 1K8KA 4BRGA 1D4XA 2GEMA 3UKUA 2E2OA 5JICA 1E4FT 4BRFA 1HKGA 3ULEB 1YUWA 3H3OB 1QZ5A 1K8KB 3FE1A 1JCGA 3UKUB 1ESVA 4LC9B 3MN6A 3ZX2A 3FZHA 3CJ1A 3H6EA 1NGFA 4A2BA 3VEWA 3W0LA 1X3MA 3FGUA 3W3DA 2GUPA 4CD3A 1DKGD 3LDOA 5AQXA 3BP8A 1WUAA 3QBWA 4K43A 5AQFA 4EHTA 1BG3A 3CQYA 2V52B 3UKRA 1H1VA 3MN7A 1LOTB 4PL7A 2FSJA 5EXWA 3HBTA 2VCPA 1NMDA 2CH6A 3UKRB 2GWKA 2NLXA 2YHWA 4J8FA 4E1JA 3TPQA 1JCEA 5AQRA 1GLDG 5EX5A 4IXCA 4A2AA 1NGJA 1QQMA 5AQKA 3A5LC 2HF3A 1NGDA 4CI6A 2QXLA 3A0IX 3U9ZA 4FWKA 4M63C 3MMVA 3HSCA 3C7NA 1X9JA 3U9DA 1NM1A 2VWBA 2D1KA 2ASMA 4FWQA 3QFUA 5AQWA 1ZBSA 5AQOA 3JS6A 3WEEA 4CBXA 4CZGA 3O1WA 1QHAA 4K25A 2ASOA 2D4WA 5F2RA 5AQHA 3FLCO 1J6ZA 4CZIA 2KHOA 2UYTA 4AM6A 3WEEB 3R6MA 3JXUA 4EFHA 4FSVA 2E2QA 3ZX0A 4QS8A 2P9KA 4BR4A 4FWOA 3DXKA 4YDUC 3BUZB 1XC3A 1Q18A 3U8XA 2P9LA 3VERA 5BN9A 1YVNA 3OHRA 4MLEA 4BVOA 3MN5A 1HPMA 2P9KB 3CIPA 4IZ9A 3CHWA 4CZKA 2Q1NA 2A41A 1Y64A 2P9LB 3LDPA 4WQ5A 4HWIA 2HF4A 1MWKA 2FF6A 2F9TA 3LM2A 5LJWA 1S3XA 5FPMA 3R8EA 4I6MA 5AQZA 2YJFA 3BF1A 1EQYA 4A62A 4B9QA 3VGKA 4B1XB 3SJHA 1XUPO 3M1FA 1BOTO 4DHYA 2HOEA 4CZJA 3IUCA 5BRDA 2YHYA 3KVGA 4I6MB 3U4LA 5AQUA 4BREA 3HTVA 3VF6A 5ADXH 1HKCA 2CGJA 4O5FA 5KPZA 3ATUA 4JD2A 3LDQA 2QM1A 4EAHD 4RTFD 3L6QA 1BDGA 3C0BA 3O1BA 1C0FA 3TU5A 5AQSA 1HKBA 3KHYA 4JD2B 3S41A 4CBUA 5JLHA 4BG8A 3DJCA 2A6AA 4FWMA 2I7NA 3DXMA 3WXLA 2Q2RA 3QMLA 2NRHA 4H5RA 2V51B 5E26A 1T6DA 3QFPA 3MDQA 4IJAA 5FPDA 1ATSA 2GTDA 3EO3A 2ITMA 4XH4A 3DXMB 2CH5A 2CGLA 1BA0A 5EY4A 2P9IA 1V4TA 4PKHA 4H5TA 1WOQA 1IG8A 4M7XA 4CZMA 5BN8A 2PAVA 4BRNA 3EN9A 2A40A 2ZGYA 3FZLA 2P9IB 5E84A 5EOYA 5JMVA 4H0XB 1JCFA 1KXPA 3R9PA 4BRPA 1YAGA 3VESA 3HZ6A 3CJ7A 2GWJA 4B1WB 2Q36A 1NGGA 3HM8A 1DEJA 5KPRA 5KQ8A 5BRFA 3WXKA 4QS9A 4BROA 2A42A 3WT0A 4CD1A 2YJEA 3LDNA 5AQLA 3GL1A 2P9NA 2BTFA 3QB0A 4NO7A 4H5WA 1BWFO 4H5NA 3CQXA 1S22A 5AFUA 2E20A 2QWQA 4FWSA 4CJ7A 4HTLA 1SQKA 2QWLA 2P9NB 4BVPA 1IJJA 2W41A 3D2EA 4H0OA 1GLFO 1BU6O 3O6WA 3UE5A 2FF3B 5AQGA 3ZETA 1NGHA 5BRHA 1T44A 4MO4A 2IIRA 5EVZA 3F9MA 2A5XA 4IO8A 2E1ZA 2FSKA 4JN4A 4BRDA 5AQNA 3D2EB 5AQPA 3I8BA 3ZETB 4ISEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WYBA 4DFKA 1GLEG 2YX6A 2KKZA 3OBWA 4CHZA 4M3ZA 1RFQA 3OYEA 3F5TA 4CHYA 5JLFA 3HVTA 1NGCA 4PA1A 3PLAA 1KLMA 4FLXA 3IFRA 4JI2K 4O4GA 4CFBA 5LL6Z 1RDCA 4AQYK 2IVPA 5C0YA 1BHLA 1P8ZA 2KBHA 3NGYA 1VNBA 2F7TA 5KTQA 2I7PA 1ZVEA 3HVRA 4M3TA 3K0SA 4MDBA 5I9EB 4PKIA 1SL1A 2E3FA 1TYQA 1KAXA 4LFAK 2KQ2A 3AO5A 4XEIA 2IDOA 1GOBA 1SKRA 1CLQA 1Q7YO 2P9PB 1IH7A 4ID5A 2JWLA 1QSSA 3LP0A 3L2QA 3VF4A 2G8IA 1ASUA 1WWNA 4F9OA 3TAMA 1SZ2A 4CGHA 4AHCA 2D0PA 4KHSA 1YJWN 4NCBA 4BRKA 3UB5A 2NRRA 4DB3A 1SL2A 4O5BA 4R5PA 4KB0A 1S1XA 2B68A 5CR4A 3VOVA 1FH3A 3DWLA 4FO0A 2RF2A 2Q97A 1VQ7N 2HW3A 4FJ7A 3FZKA 3HRGA 5BR9A 3KWGA 4Z4CA 3K5OA 1SKSA 3HT3A 3KZBA 3HP6A 3T3FA 3NE6A 4O8KA 2GELA 1GLCG 3CC4N 5LMUK 5LY3A 1D9FA 1LQQA 1NRBA 3LM9A 3WNGA 2ATQA 3DYAA 3DLEA 4YY3K 3G10A 3A5OC 5M1KA 3HK2A 2OANA 3KIOA 3DLKA 4EP4A 1SAZA 5CZ1A 5C10A 1DT9A 4NB4A 3KKRA 4C1NI 4C8OA 3K5NA 3AGRA 1X9SA 1CHZA 1RTIA 2RKIA 4BQZA 5SZTA 3ZSXA 3C6UA 1HRHA 4FJMA 5KRSA 2NY8X 2WOMA 4JKEA 4DTSA 4B9MA 1LWEA 1NK5A 3CMEN 2WTUA 1NJWA 3AA2A 4FJKA 2B6AA 5C2DA 1MYNA 1V4SA 1EETA 1XQSC 1JJ2M 1YITN 3VN5A 1YJNN 5AJ3K 2J4RA 1ICAA 3CCLN 4OVLA 4BR5A 3L3UA 3CM5A 1WSEA 1VSIA 5IWAK 1XMQK 5J2NA 2VYPA 1KVBA 1VSKA 1OVQA 3CJAA 1WSGA 4ISGA 1NKCA 4MDAA 3NGIA 3KD5E 4B3OA 3NFAA 3ZSWA 3TTDA 4KV8A 4WQ4C 3I0SA 1T8EA 4Q0BA 4X66K 1JXBA 5BREA 3CERA 1PX9A 2NRVA 2KSKA 3HYFA 2X78A 3ZSVA 4DR7K 1T6CA 4DR4K 3KLGA 3VQAA 1BO5O 4FJGA 5AR0A 4BC2A 4IEEA 1GLLO 4JHDB 2PBDA 4DF8A 1IKVA 1WBDA 5AZJB 1QS4A 1LQHA 2YKNA 1BUPA 3SBGA 3PIPL 3E01A 1EO1A 3MN9A 5FPNA 3DOKA 4CZFA 1Q9YA 1HNWK 1C1BA 3AARA 3DXKB 5AZIB 3SUQA 4DTJA 2QI2A 4MO5A 5LJVA 4HTUA 1XC9A 2E2NA 3TSQA 4CEFA 4YDUA 1L3UA 3LDLA 2O8CB 2ZM6K 3QINA 4CHOA 3VQ6A 3DLRA 4EZ9A 5HROA 1G99A 1BIUA 1ZBFA 4AHVA 1UAXA 3H08A 4GW6A 2ZJRL 3M8SA 4DCHA 1C0GA 5BPLA 3MK6A 3GG4A 5TKWA 1RTDA 4QAGA 5DM6L 4JKDA 1IO2A 1XNRK 4BRQA 2DFEA 5M1FA 3QICA 2ITGA 1HNXK 3KJVA 2O8EB 1K8KA 2F96A 3G0ZA 1RT7A 2E2OA 3RTVA 4KHQA 2KPYA 1E4FT 2D0AA 4ZHRA 3ULEB 1C1AA 3THYA 3QNOA 3UKUB 4DQQA 3I0RA 3ALYA 3CJ1A 1VQON 4A2BA 3HPGA 3K57A 3FGUA 3W3DA 5DMRA 2GUPA 1E3MA 4OLBA 1FW6A 3MN7A 2LI7A 3J81O 1IV0A 5I3UA 2VG6A 3TR8A 1BGXT 3LP1A 3K9KA 5EXWA 1M1KO 1VQNN 1VQ6N 1NMDA 2CH6A 1NKBA 3DLHA 2GWKA 5JS1A 1JZBA 2HVHA 3E9LA 2NLXA 3NCIA 2YHWA 3AVCA 3TPQA 1JCEA 1BI4A 4DR3K 1GLDG 4IXCA 1BCGA 4CE9A 2ZE2A 4LD0A 4KKOA 3SAGA 4FLUA 1XI1A 4JI8K 4FJ9A 3MX2A 1Z25A 3C7NA 1X9JA 1ILYA 2BRZA 1NRAA 3SQ0A 5HRSA 3QFUA 4BWMA 5AQWA 1RT6A 4KB1A 1KVAA 1FKPA 3WEEA 4JS5A 3RVCA 4KH5A 1QHAA 2D4WA 4HCCA 5AQHA 3TTFA 2UYTA 1KRPA 1QVFM 1TKXA 1T0ZA 4U67L 2W6LA 2P9KA 2UUCK 2HVIA 3OS1A 1XC3A 5KGXA 1Q18A 3VERA 4ICLA 3OYBA 1N33K 1NU0A 1JLCA 1U04A 1HPMA 3CHWA 4I2QA 4CZKA 1TAUA 2X6SA 4N56A 4A59A 1LQIA 5LJWA 4DU4A 3OVNA 2HNDA 1EQYA 4B9QA 4B1XB 2KW4A 3KK7A 3L2UA 5M1PA 4CFDA 3LANA 5C25A 3BZCA 3JAMO 1VHXA 2O8BA 1RT1A 1YVUA 1S9GA 4DV0K 3V1OA 2OZMA 3ATUA 3LDQA 4CJSA 4E7IA 2ASCA 3P38A 4HHTA 2GV9A 2HHWA 3QIOA 4FW1A 3S41A 5JLHA 1S1UA 2OCEA 4CJ3A 3VA0A 4W5TA 4CECA 2I7NA 2NY9X 4JKBA 2NUBA 1VSJA 4MQ3A 1T6DA 3AA4A 3PUFA 4MFBA 2HHSA 3MDQA 1OH6A 4YOWA 2ITMA 3OYNA 3V9UA 4AB0A 2KFNA 4JYAK 4PKHA 4DV5K 1WOQA 3TSPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4WYB A;  4DFK A;  1GLE G;  2YX6 A;  2KKZ A;  3OBW A;  4CHZ A;  4M3Z A;  1RFQ A;  3OYE A;  3F5T A;  4CHY A;  5JLF A;  3HVT A;  1NGC A;  4PA1 A;  3PLA A;  1KLM A;  4FLX A;  3IFR A;  4JI2 K;  4O4G A;  4CFB A;  5LL6 Z;  1RDC A;  4AQY K;  2IVP A;  5C0Y A;  1BHL A;  1P8Z A;  2KBH A;  3NGY A;  1VNB A;  2F7T A;  5KTQ A;  2I7P A;  1ZVE A;  3HVR A;  4M3T A;  3K0S A;  4MDB A;  5I9E B;  4PKI A;  1SL1 A;  2E3F A;  1TYQ A;  1KAX A;  4LFA K;  2KQ2 A;  3AO5 A;  4XEI A;  2IDO A;  1GOB A;  1SKR A;  1CLQ A;  1Q7Y O;  2P9P B;  1IH7 A;  4ID5 A;  2JWL A;  1QSS A;  3LP0 A;  3L2Q A;  3VF4 A;  2G8I A;  1ASU A;  1WWN A;  4F9O A;  3TAM A;  1SZ2 A;  4CGH A;  4AHC A;  2D0P A;  4KHS A;  1YJW N;  4NCB A;  4BRK A;  3UB5 A;  2NRR A;  4DB3 A;  1SL2 A;  4O5B A;  4R5P A;  4KB0 A;  1S1X A;  2B68 A;  5CR4 A;  3VOV A;  1FH3 A;  3DWL A;  4FO0 A;  2RF2 A;  2Q97 A;  1VQ7 N;  2HW3 A;  4FJ7 A;  3FZK A;  3HRG A;  5BR9 A;  3KWG A;  4Z4C A;  3K5O A;  1SKS A;  3HT3 A;  3KZB A;  3HP6 A;  3T3F A;  3NE6 A;  4O8K A;  2GEL A;  1GLC G;  3CC4 N; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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