2QWOA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the adp*pi form #1
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
387
structure length
387
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
source organism Bos taurus
publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
total genus 120
structure length 387
sequence length 387
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwoA04
2ASPA 4BRDA 3CJAA 3FE1A 2FF3B 3D2EB 1Q18A 5FPMA 4IXCA 4H5WA 3RSEB 4BC3A 3IUCA 3CQXA 5ADXA 1GLFO 4XH1A 1V4SA 2AP1A 4CZMA 4BG8A 1XUPO 3D2FA 2CH5A 2A40A 3IMXA 4A2BA 1MDUB 5BREA 1Y64A 5BRHA 3JS6A 4MO4A 3VOVA 3SMSA 4JD2B 3H46O 1RFQA 4DB3A 4JHDA 5LY3A 1GLBG 3U4LA 4BRNA 1C0FA 4WQ4A 2P9UA 4B1WB 1NGIA 1TUYA 3WXIA 3U9DA 1JCGA 4FWOA 4I6MB 3WXJA 3CIPA 3HM8A 3IDHA 3ZX2A 3QFUA 1KAZA 1RGIA 5ADXH 1GLJO 4PKGA 1EQYA 4FPBA 2E8AA 1QZ5A 2A6AA 2YJEA 3MN6A 3D2EA 2GTDA 3L0QA 4BREA 2A41A 4BGBA 3AY9A 3LDQA 3RSEA 4NO7A 1HPMA 4BRGA 3CI5A 3VESA 5BPMA 5AZIB 4IJAA 3O08A 3CERA 4FOIA 2Q0UA 3P4IA 4BRCA 1ATSA 3UKUB 1ZC6A 2YCHA 2Q36A 4FWRA 2I7NA 4H0XB 1ESVA 5AQZA 4BC5A 4JD2A 1NGCA 2VYPA 2P9IB 1DKGD 4A61A 1S3XA 4F9OA 1WOQA 4WQ4C 5TKYA 5CE3A 3DXKA 1BOTO 3C0BA 2H3GX 3VEVA 1WUAA 4PKIA 2Q1NA 3HSCA 2PAVA 4I6MA 4Y0WA 2CGKA 3C7NB 3EKSA 2W41A 4K25A 1K8KB 4ISGA 3WQTA 5AQUA 3M3ZA 1DGKN 4BR9A 1IJJA 3ZX0A 5BN8A 2HOEA 3KVGA 3GG4A 5AFUA 2E88A 3UE5A 1GLEG 2P9SA 2P9NA 1D4XA 2BTFA 5AZIA 4M7YA 3VERA 4CI6A 1R59O 2ZGYA 4BVOA 5AQJA 3ID8A 3UKUA 2A5XA 3ZEUB 4H5TA 3WXLA 3EO3A 2Q31A 4BRIA 2I7PA 3QICA 4J8FA 1TYQB 2UYTA 2YI1A 3J8AA 3VEYA 4C23A 2D1KA 4FWPA 2P9IA 5AQRA 2F9TA 3FZMA 1DEJA 2E2QA 4BR7A 4CZEA 4PL8A 3A5NC 3H45C 1X3MA 5KQ8A 5AZJB 5AQQA 1YXQA 4O8KA 3ENOA 2V51B 3LDNA 3O80A 4BRFA 5AQKA 1NGGA 3ZX3A 5AFUH 1J6ZA 3C7NA 3MN9A 4Z94A 1Z6RA 1K8KA 3LDPA 3R9PA 3S41A 4B1UB 4BR4A 3QFPA 3EKUA 3VENA 2Q0RA 3WEEB 4H0PA 1HUXA 2GUPA 5AR0A 3GE1A 5FPNA 2YJFA 4CBUA 4K42A 4FOEA 2QWLA 1JCEA 4BR0A 3QMLA 1KAXA 4IZ9A 1IG8A 2ASMA 2V7YA 1E4FT 4MLHA 3EN9A 1OKJA 1NGFA 1QZ6A 3BUZB 3O6WA 4PKHA 3A5LC 1HKGA 4HWIA 1U6ZA 3A0IX 3ZEUA 1GLDG 3LM2A 4H0VB 3H3OB 1ATNA 3VPZA 1LOTB 2E2PA 4BRHA 3QB0A 1NM1A 2OANA 3U8XA 2W40A 3QDKA 3CHWA 3SK3A 4B1VA 3FR0A 3CQYA 1V4TA 5KPRA 5AQSA 4L3QA 3VF2A 1RDWX 4CD3A 1ATRA 3HTVA 5JMVA 4B1ZA 1NWKA 5KQDA 1HJOA 2E2OA 1XQSC 1SAZA 4QS8A 3W3DA 2WUSA 4NB4A 5B8HA 5BR9A 3BP8A 4CBXA 3TPQA 3VGMA 1QQMA 4BRKA 4FWQA 3WEEA 3W0LA 4K43A 3WXKA 5EXWA 5JLFA 4QS7A 2QWMA 2DPNA 1BA0A 3EL2A 3VETA 3L4IA 4MO5A 4YDUA 1X3NA 4QS9A 1GLCG 4AM6A 5BN9A 3FGUA 3L6QA 3H1VX 3ULEB 3ENHA 3I33A 3HBTA 3CJBA 3DAWA 2F9WA 5KPTA 4BRLA 1BUPA 1MWMA 1BA1A 3FFKB 3HZ6A 4H0OA 1YAGA 3H3NO 5BRDA 4BC2A 2NRHA 2QXLA 2P9LB 5E26A 2QWRA 4H5RA 2IIRA 2D0PA 3JXUA 2ITMA 5AQIA 2P9PB 2P9KB 3UKRB 2GWJA 5E84A 2FSKA 4FWSA 5EOYA 2QWOA 4RWTA 2FF6A 1QHAA 3FZFA 1JCFA 3MDQA 2QWQA 2HMPA 4BRQA 2A42A 2D4WA 3FZLA 5AQYA 1G99A 3CJ9A 1GLAG 3GL1A 1LCUA 3O1BA 4XH5A 4YDUC 3A5MC 3VEOA 4H5VA 4A2AA 4BC4A 1T44A 5EX5A 3F9MA 3MN5A 3ATUA 1T6DA 5AQHA 5AQVA 3IFRA 3QBWA 4JN4A 3FLCO 2VCPA 1NGBA 2GWKA 3LL3A 2QM1A 3ULEA 5EY4A 2FXUA 4MLEA 2E2NA 2ZGZA 3WQUA 4CBWA 4CZLA 4BR2A 3UB5A 1KXPA 3BF3A 4PL7A 1TUUA 4H5NA 2J4RA 4DQ8A 5AQTA 4FWMA 3KZBA 5BPLA 2P9PA 2P9KA 3TU5A 3UKRA 1NGDA 4E1JA 4DCHA 2QWNA 1HX1A 5AQFA 1HKCA 4FPAA 1NBWA 3O5BA 3H1QA 3O4WA 3GBTA 4CZGA 4FWNA 4A62A 3LM9A 4BQZA 4KBOA 2AA4A 1NGHA 3DWLA 4H03B 3CETA 3VF4A 2FLOA 5I9EB 1SQKA 5JICA 2CH6A 4BVPA 2GEMA 3VEXA 5AQOA 3CJ1A 3A5OC 1TYQA 2NLXA 2IVPA 4ISFA 3MK6A 4CZFA 3DJCA 3LDOA 3O1WA 2PBDA 3DXMB 3VEWA 5AZJA 1QQOA 5AQLA 3SMPA 5AQGA 2NZTA 2CGJA 5AQPA 4B1XB 1XC3A 4GY2B 5AQWA 2HF3A 4BRMA 2YHWA 3M6GA 1BO5O 3QBXA 3MN7A 1S22A 2QW9A 2FSNA 3DXKB 3R6MA 1NGJA 1BG3A 2EWSA 3KHYA 2QWPA 3SLCA 5BPNA 2VWBA 4BGAA 3AAPA 4RTFD 5EVZA 2D0OA 4FSVA 4CJ7A 2KHOA 4FWKA 4XEIA 3VF6A 3WT0A 4JAXA 1ZBSA 1C0GA 2YHXA 1YUWA 3ZETB 2ZF5O 4EHUA 5KPZA 3FZHA 1HKBA 4IO8A 1NGAA 1CZAN 3U9ZA 1X9JA 5F0XA 2FSJA 3DXMA 3H6EA 3A8YA 2P9SB 2IVNA 4WQ5A 2P9NB 4FWLA 4B1YB 5FPEA 2YHYA 4M7XA 1E4GT 3VGKA 4BROA 4EAHD 3LDLA 1QQNA 4B9QA 2CGLA 4EFHA 4K41A 2E1ZA 1P8ZA 4H0YB 3D7EO 2E20A 1YVNA 4FO0A 4O5FA 4EIAA 3O8MA 5AQXA 4CD1A 1NGEA 1U2VB 3GOIA 4BG9A 4M63C 1SZ2A 3BEXA 2ZWHA 4BR5A 4DHYA 2V7ZA 1H1VA 1Z05A 4BRPA 5ELZA 3OHRA 4CZHA 2IVOA 4BQLA 2HF4A 4H0TB 5BRFA 3B8AX 2GELA 3MMVA 3CJ7A 1BU6O 3R8EA 4EHTA 1T6CA 3G25A 4CZKA 1HLUA 3ZETA 1MWKA 4CZIA 4AM7A 3WUHA 5AQMA 2Q97A 1GLLO 3ATVA 4WQ5C 1MA9B 3M1FA 2P9LA 4RCHA 1NMDA 5F1XA 3D2FB 4JNEA 4XH4A 4HTLA 3FZKA 4FL9A 4IJNA 1KAYA 2V52B 2E1YA 3HI0A 4ISEA 5F2RA 1BDGA 4CZJA 5JLHA 3I8BA 1U2VA 4JHDB 4BRAA 4WYBA 3AARA 1BWFO 3GDQA 5FPDA 1ZXOA 2P9UB 3CJCA 2A3ZA 2ASOA 5LJWA 3EZWA 5AQNA 3MCPA 1NLVA 2BUPA 4IWVA 3SJHA 3VEZA 3BF1A 4GNIA 3VGLA 2Q2RA 4LC9B 5LJVA 3AAQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JKEA 5CR4A 5FPMA 2HBJA 4H5WA 4LF9K 2A1SA 2JWLA 1VNAA 3IUCA 1MU2A 1S9GA 2VGMA 1C1BA 1UOCA 1DT9A 1RT5A 4XH1A 4DR6K 1C6VA 3O9QA 3AGRA 2AP1A 3HXMA 1YTUA 3CC4N 4DSFA 3D2FA 1W9HA 3LPUA 1ASUA 3IMXA 3ZSZA 4AHRA 5BREA 1Y64A 5BRHA 3JS6A 4MO4A 5AJ3K 4BE0A 4KV8A 3PY8A 1GLBG 2NRWA 4JK7A 4C1NI 4U67L 5D3GA 3OYFA 4BRNA 3QEPA 1JLQA 5JVHL 3C95A 1KC8O 3U9DA 1JCGA 4FWOA 3QERA 4DFMA 3TSPA 4FJ7A 4AEIA 4O5BA 4BE1A 4M3UA 4DFPA 2WTUA 1RGIA 4FLWA 5CZ1A 2NRRA 4PKGA 3AA4A 1K8AO 2A6AA 3C6UA 4CF0A 2O8CB 3EYZA 1FXXA 5SWMA 3THXA 1MR4A 3LDQA 4IFEA 4KKOA 5M1PA 4LF6K 2UXCK 1N34K 2HBKA 3O08A 2Q0UA 3P4IA 1S5JA 1ATSA 3UKUB 4KAZA 4DS5A 2XY6A 2YCHA 4Z4FA 3Q7CA 3AO4A 3AVHA 1ESVA 1C0TA 1IBKK 4CESA 1TK0A 1RT6A 1AYJA 1NGCA 1RT4A 3QI7A 2P9IB 4A61A 4CEZA 4CEQA 4DLEA 3V6DA 2D5RA 1ILYA 1BOTO 4CJKA 3I0SA 1DTQA 1RBSA 3O9TA 1WSIA 4DSKA 3HSCA 4Y0WA 1ZU3A 4CHYA 3MAQA 4K25A 4ISGA 1RBUA 4B9SA 2O8CA 3SPYA 3PSMA 1POIA 4M3WA 5BN8A 3LAMA 3GG4A 3KKRA 4DV7K 3IKMA 1UGLA 3UE5A 1GLEG 3R3LA 3VQAA 2P9NA 4M7YA 1BQNA 4BVOA 4Q5VA 4K8ZA 1XWLA 4FK4A 3HRGA 3ID8A 1RTJA 4OPHA 3UKUA 3SJJA 3AVKA 4IDKA 3O4NA 3EO3A 2DFFA 4KH4A 3VTHA 2KBKA 3DOLA 4BRIA 3PO4A 1TYQB 2UYTA 3J8AA 3CQ8A 2P9IA 4KREA 4ILGB 4HCCA 4FW2A 3HVRA 3H45C 1NK7A 5KQ8A 1PX9A 1YXQA 4CJRA 3HPOA 1L5UA 4NXNK 3LDNA 4ZTJA 2O8FA 5A2QO 5AQKA 5FROA 4E72A 3MN9A 3MEDA 3OYJA 1Z6RA 2G8WA 5J2QA 1TI5A 4B1UB 2HHQA 3EKUA 2GUPA 1U47A 3GE1A 4X64K 5FPNA 2XO7A 4FOEA 3ZSQA 4IZ9A 1NRBA 1E4FT 2Z1HA 1NE5A 4FJMA 2DY4A 3O6WA 4BDPA 4PKHA 1R0AA 3A5LC 1Q82O 4JI3K 4HWIA 4H0VB 4CJQA 4Q0BA 3PV8A 4G1QA 3QB0A 4UAEF 2UUAK 4G9ZA 4CEDA 2VWJA 3SK3A 3SBTA 3IRXA 1QVFM 1S1VA 3K2PA 5KPRA 3SV3A 4KHYA 1ATRA 3HTVA 3QINA 1JLGA 4M3ZA 3M8QA 5KQDA 3NAEA 1K8BA 4FJLA 4Z4CA 1HJOA 4KH6A 1XQSC 4JKAA 3E66A 1SAZA 4H8KA 4QS8A 4W5OA 2XRIA 4AHVA 4Z4GA 2HNYA 4ELTA 3BP8A 3IS9A 3QETA 3CMAN 1QQMA 3EZ5A 2YNGA 3CF5L 3WXKA 1JZAA 5EXWA 2UUCK 2QWMA 2DPNA 3MCAB 1LQIA 3J7ZO 4F3TA 3WNEA 1X3NA 4GW6A 4QS9A 3TAFA 1HNZK 5I42A 4B3MK 4AM6A 3AVAA 4K8XA 1LQHA 2RE2A 3RRGA 4LF7K 2R7YA 3L6QA 3ULEB 4H0OA 5BRDA 2QXLA 2NRVA 3NE6A 1TAQA 2P9KB 3UKRB 3V9WA 5EOYA 1TK8A 2OTJN 2X78A 3DOKA 2O8BB 4IEEA 3BY5A 4CFDA 4NLCA 3FZFA 2A1RA 4DWIA 1DLOA 4DTJA 4CQKA 2HMPA 2A42A 2ZD1A 4Z4HA 3NVMA 4ID1A 3MXJA 1GLAG 4XH5A 1B7DA 3A5MC 4U7BA 2PY5A 3F9MA 1A5WA 1T1TA 3ZCMA 1JZBA 1YF5L 3IFRA 3AGKA 3I55N 3CG7A 4FM0A 3I56N 3ULEA 3AV9A 4MLEA 1NJYA 2W00A 4BWJA 3NH1A 1KXPA 4HUFA 5LL6Z 4PUOA 1NJIO 5C2FA 1SV5A 5T7BA 5AQTA 3A2FA 4FWMA 2G8HA 2OTLN 3B6PA 3VA3A 3V4IA 1WSEA 2P9KA 3UKRA 3VQQA 1JL1A 2O8EA 1HX1A 4Z4IA 3O5BA 3H1QA 2O8BA 1G15A 4IOAL 4YY3K 3P39A 2LN8A 3OBWA 3DLHA 3HK2A 3AVMA 3DWLA 3VQCA 4FLXA 3N4PA 4YHHK 1L3SA 1KVBA 5I9EB 3DRSA 2LT8A 2CH6A 3NMUA 2GEMA 1O1WA 3G0ZA 3A5OC 2YBRC 2NLXA 1J53A 2IVPA 4UADE 1Q8IA 2PFUA 1X9MA 3DM2A 4DTUA 1C55A 1TL1A 3MWPA 3CPEA 1QQOA 4KTWA 1KFSA 1WLJA 4KHPK 3O3FA 5AQGA 1VQLN 1YJWN 1XC3A 2XY5A 2HF3A 5JENA 3NDKA 3CCJN 2JDQD 3VQ7A 3JYTA 3OS2A 2KW4A 3DXKB 2EWSA 3OBYA 2I5JA 5HRRA 5BPNA 3L2VA 3AAPA 3MEEA 4RTFD 3C6HA 1W2BM 1NJXA 3PSFA 4AAZA 4E89A 2KYQA 3NF6A 4JAXA 1C0GA 3BZCA 3TAQA 4IBNA 1WN7A 4X66K 1OH7A 4NXMK 5KPZA 4J2AA 4F8RA 4RG8A 5C0YA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4JKE A;  5CR4 A;  5FPM A;  2HBJ A;  4H5W A;  4LF9 K;  2A1S A;  2JWL A;  1VNA A;  3IUC A;  1MU2 A;  1S9G A;  2VGM A;  1C1B A;  1UOC A;  1DT9 A;  1RT5 A;  4XH1 A;  4DR6 K;  1C6V A;  3O9Q A;  3AGR A;  2AP1 A;  3HXM A;  1YTU A;  3CC4 N;  4DSF A;  3D2F A;  1W9H A;  3LPU A;  1ASU A;  3IMX A;  3ZSZ A;  4AHR A;  5BRE A;  1Y64 A;  5BRH A;  3JS6 A;  4MO4 A;  5AJ3 K;  4BE0 A;  4KV8 A;  3PY8 A;  1GLB G;  2NRW A;  4JK7 A;  4C1N I;  4U67 L;  5D3G A;  3OYF A;  4BRN A;  3QEP A;  1JLQ A;  5JVH L;  3C95 A;  1KC8 O;  3U9D A;  1JCG A;  4FWO A;  3QER A;  4DFM A;  3TSP A;  4FJ7 A;  4AEI A;  4O5B A;  4BE1 A;  4M3U A;  4DFP A;  2WTU A;  1RGI A;  4FLW A;  5CZ1 A;  2NRR A;  4PKG A;  3AA4 A;  1K8A O;  2A6A A;  3C6U A;  4CF0 A;  2O8C B;  3EYZ A;  1FXX A;  5SWM A;  3THX A;  1MR4 A;  3LDQ A;  4IFE A;  4KKO A;  5M1P A;  4LF6 K;  2UXC K;  1N34 K;  2HBK A;  3O08 A;  2Q0U A;  3P4I A;  1S5J A;  1ATS A;  3UKU B;  4KAZ A;  4DS5 A;  2XY6 A;  2YCH A;  4Z4F A;  3Q7C A;  3AO4 A;  3AVH A;  1ESV A;  1C0T A;  1IBK K;  4CES A;  1TK0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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