2QWPA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the adp*pi form #2
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
386
structure length
386
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
molecule tags Chaperone
source organism Bos taurus
total genus 123
structure length 386
sequence length 386
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwpA04
5BRDA 3JXUA 2P9PB 1T44A 4K25A 4FPAA 1G99A 2HMPA 3H3NO 3L0QA 1TUYA 3VESA 3DXMB 4CD3A 3SK3A 2E1ZA 4ISGA 2E2PA 2VYPA 4CZHA 4H03B 3D2EA 3WXLA 5AQXA 1E4GT 4WQ4C 3R8EA 3QB0A 3A5MC 3CJ7A 2ZGYA 5BPNA 4CZJA 3BEXA 4A61A 3UB5A 3EZWA 2ZGZA 3GDQA 3EKUA 1NGFA 2ZF5O 2F9WA 2GTDA 3FLCO 1P8ZA 2QXLA 3MMVA 4JNEA 4BQLA 4NO7A 3VEXA 3J8AA 3FFKB 1GLDG 3O1BA 2GWKA 3FZHA 5FPEA 4YDUA 4MLEA 3CHWA 1HX1A 5KPTA 1HJOA 3LDOA 5FPDA 4XEIA 3D2EB 1HKBA 4BRFA 3HSCA 2HF3A 2ASOA 3UE5A 4EHTA 2HOEA 4FO0A 3LM9A 4JAXA 1DGKN 4WQ5C 2P9UA 1NGDA 2E88A 3ID8A 1NM1A 2FF3B 3WUHA 3ENOA 5AZIA 2QWNA 1LCUA 5BN9A 3FE1A 4NB4A 5I9EB 1KAZA 3VGKA 3RSEA 1SZ2A 3M6GA 3QFPA 4CZGA 4B1ZA 2ITMA 5E84A 5JLFA 5KPZA 4FSVA 5AR0A 2YHYA 2A5XA 5EOYA 3C7NA 4BR4A 5AFUA 1XUPO 3VGLA 3VETA 5ADXA 3CETA 4B9QA 4RWTA 1H1VA 3LDPA 4FWOA 4A62A 4HWIA 5EXWA 4BVOA 4JHDB 1QQMA 1BU6O 1NGGA 4B1WB 3FR0A 5BPLA 4QS7A 4JD2A 5ELZA 2CH6A 4FWQA 1TUUA 4CZKA 4Z94A 2P9UB 4M7XA 3D7EO 2IVOA 5AZIB 3I33A 3OHRA 3VPZA 4BROA 3WEEA 3A5OC 3BF3A 3UKRA 4PKGA 4CBWA 5BN8A 5AQUA 3RSEB 3CQXA 1MWKA 3O08A 2AA4A 3VENA 5AQLA 3GL1A 1T6DA 1JCGA 1X3NA 1ZXOA 4H0XB 4MO5A 4BRCA 3HBTA 2E2OA 3C7NB 4BRGA 3FZFA 2E1YA 4PL8A 3AARA 1NGEA 2Q31A 2ASMA 1Z6RA 2D4WA 2IIRA 5AQJA 1HLUA 2GELA 2FF6A 4BVPA 1XC3A 3O4WA 1GLJO 4JD2B 1ESVA 1Z05A 3MN7A 4I6MA 3D2FA 1D4XA 2CGJA 4BRAA 3VF2A 3VF6A 3H1QA 5AQFA 3A5LC 3A5NC 3WEEB 3UKRB 2CGKA 5BREA 1GLEG 2YCHA 5AFUH 3QFUA 2QWOA 4Y0WA 4CBXA 3H1VX 1YUWA 1RDWX 5AQVA 3O1WA 3ENHA 3DWLA 2GWJA 3U8XA 3VEVA 2E2QA 5AQOA 1TYQB 4FOIA 3CQYA 3QMLA 5BRHA 3O6WA 3LL3A 5F1XA 3R9PA 5JICA 3H45C 2DPNA 3HI0A 4C23A 3F9MA 3FZKA 4H5VA 3GBTA 3G25A 2FSJA 2P9LA 1GLLO 4BR7A 3S41A 3QBXA 2YHWA 4BRKA 3ULEA 4XH4A 1YAGA 2P9IA 1Y64A 4I6MB 1QZ6A 3D2FB 5EVZA 3FZMA 2GEMA 3VEYA 3W3DA 2F9TA 3MK6A 3UKUA 1R59O 4PL7A 5AQTA 3IUCA 1XQSC 3KHYA 4RTFD 1NGAA 3EO3A 5AQRA 4BG8A 4IZ9A 3TU5A 4BG9A 2VWBA 4BRMA 2A40A 4FWRA 2P9KA 2QWRA 4DCHA 4IO8A 1GLAG 2YHXA 1CZAN 4CZFA 3L4IA 5AQMA 4CD1A 4F9OA 2V51B 4QS8A 4ISFA 4B1VA 1DEJA 3WQUA 2P9LB 2FSKA 1RFQA 5E26A 3LDNA 4CZIA 1JCFA 2GUPA 1X3MA 3R6MA 3ULEB 3CERA 4QS9A 2P9IB 4H0YB 3DXKA 4M7YA 2NLXA 1BO5O 4H0PA 4BRQA 5AQPA 2CH5A 4BRLA 2PAVA 4FPBA 4FWNA 2QW9A 3UKUB 4L3QA 3LM2A 4BR5A 4H5TA 3AAPA 1YVNA 1ATSA 1ZC6A 2QWLA 1BG3A 4K41A 5AQNA 4EFHA 4EHUA 1HUXA 1HKCA 2P9KB 2Q97A 2YI1A 2QM1A 4HTLA 3IMXA 4WQ4A 4FWKA 2D1KA 4H5WA 3VEZA 1KXPA 5JMVA 1T6CA 3TPQA 1MA9B 1Q18A 1QZ5A 3DXKB 1K8KA 3EL2A 4BGAA 5JLHA 5KQ8A 1DKGD 5KPRA 4YDUC 4IJAA 3CJBA 5AQIA 4M63C 2V7ZA 5LJWA 3LDQA 2YJEA 2W40A 5LJVA 1KAXA 4B1UB 4CZMA 3FZLA 2H3GX 2KHOA 1OKJA 3MCPA 1HKGA 3BP8A 4BRIA 4WQ5A 2BUPA 2AP1A 1NGBA 3HTVA 3BUZB 5B8HA 4KBOA 5ADXH 4DB3A 1QQOA 4A2AA 1C0FA 1X9JA 3GG4A 4BRPA 3WXKA 4H5NA 2BTFA 1K8KB 4FL9A 3O8MA 3HM8A 1GLBG 3JS6A 2Q0UA 2QWQA 3EKSA 3CI5A 3GE1A 5AQHA 2P9NA 3MN9A 3L6QA 4CBUA 3WT0A 2UYTA 4BRDA 3HZ6A 2FLOA 3H6EA 4B1XB 3LDLA 2FSNA 3KVGA 4J8FA 3C0BA 2Q1NA 1NGCA 3WXJA 3VGMA 1MWMA 2YJFA 4K42A 4AM7A 3DJCA 4BRHA 2D0OA 3QICA 5AQWA 5LY3A 2P9SA 3VF4A 3EN9A 1NGHA 5AQGA 3CJ9A 3VOVA 3IFRA 3A8YA 5BRFA 3W0LA 1BOTO 2I7NA 3SJHA 3M3ZA 4IJNA 4O8KA 1RGIA 2NRHA 4BR9A 4MO4A 1J6ZA 3WXIA 4CJ7A 2A42A 4A2BA 1GLFO 1IJJA 1QQNA 2Q0RA 4PKIA 1ATRA 4DHYA 2Q2RA 4H5RA 3CJ1A 4FWPA 4CZLA 3O80A 4H0OA 2P9NB 2HF4A 4BQZA 1IG8A 1NGIA 1YXQA 2A6AA 4AM6A 1HPMA 3KZBA 4FWLA 1C0GA 5FPNA 1E4FT 1ZBSA 5EY4A 2IVNA 3H3OB 1S3XA 2J4RA 3ZETA 4PKHA 3I8BA 4JHDA 4BREA 1U6ZA 2P9SB 2V52B 3P4IA 3SLCA 3AAQA 3QBWA 2VCPA 4RCHA 3U4LA 3MN5A 2E2NA 4MLHA 3ATVA 3FGUA 4E1JA 4XH1A 4LC9B 4K43A 4JN4A 4CI6A 3H46O 5CE3A 4WYBA 1NGJA 1BWFO 2W41A 4H0TB 1MDUB 5EX5A 4BC2A 1GLCG 1BUPA 4GY2B 1U2VA 5AQSA 2QWPA 1V4TA 1NLVA 4H0VB 3AY9A 5F2RA 3CJCA 4EIAA 3A0IX 2A3ZA 4EAHD 1BA1A 3SMPA 3ZX2A 2WUSA 1BA0A 2IVPA 3O5BA 2ZWHA 3ZETB 5BPMA 3CIPA 1S22A 3ZEUA 5TKYA 1NMDA 4FOEA 1KAYA 4BR0A 3ZX0A 4FWSA 5FPMA 1WUAA 3CJAA 2A41A 4GNIA 2I7PA 5KQDA 2QWMA 4B1YB 5AZJA 4IWVA 2P9PA 4IXCA 2CGLA 1QHAA 2EWSA 2PBDA 4BGBA 1U2VB 1V4SA 5AQKA 1LOTB 3DXMA 3QDKA 3DAWA 3MDQA 2ASPA 2D0PA 4FWMA 4CZEA 1EQYA 3B8AX 3U9ZA 5AQZA 2Q36A 1TYQA 4BC4A 2E20A 1SQKA 4DQ8A 3WQTA 3ATUA 3SMSA 1NBWA 3M1FA 4BC5A 1BDGA 2E8AA 1SAZA 4O5FA 4XH5A 5AQQA 5F0XA 2NZTA 2V7YA 3MN6A 3IDHA 3GOIA 3BF1A 3ZEUB 2FXUA 4ISEA 5AQYA 3U9DA 3ZX3A 1NWKA 1JCEA 5BR9A 1ATNA 1WOQA 3VEWA 3VEOA 3VERA 4BR2A 4BC3A 2OANA 5AZJB 4BRNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JXUA 3EE9A 3C94A 1WSJA 4ILHA 1X9WA 4FPAA 1BQNA 2QA4N 3SK3A 2E1ZA 2E2PA 1T7BA 4H03B 3CMEN 3CCMN 3R8EA 1WAJA 2OA8A 1RT3A 1EO1A 2JGUA 4M3RA 1KFDA 3AO3A 1ASWA 1YIJN 3SI6A 3EZWA 1HQEA 3RMCA 4N76A 4CQKA 4BECA 1WSEA 3ZSWA 3FLCO 4E1NA 2QXLA 3HP6A 3J8AA 3E7UX 3DRPA 2VWKA 3HSTB 5M1OA 3I8DA 4YOVA 1TKXA 4GV9A 1BHLA 3RMAA 4M3YA 5M1FA 1JZBA 1P0AA 3KK1A 4MLEA 1EWQA 3CHWA 4CJUA 1HX1A 5KPTA 4BE0A 4DSEA 4KTQA 3VMFB 1TAUA 3DMJA 1HKBA 3HSCA 4EHTA 1X9MA 1KRPA 2LI7A 1NM1A 4CJ3A 3TAFA 4NB4A 5I9EB 3VQQA 3RSEA 5T7BA 4B1ZA 4F2RA 4FLYA 3MEGA 4A59A 5E84A 1G15A 3O9UA 1CZBA 4BE2A 2HNYA 2IOCA 4BR4A 5AFUA 1XUPO 4UJ0A 4B9QA 4DS4A 3LDPA 4FWOA 3THXB 3HK2A 4DR1K 4AILC 5EXWA 3R3LA 5CYQA 4BVOA 4JHDB 1HNWK 1P00A 4AHUA 2F96A 5IT9O 4Z94A 1W0HA 4JI7K 1GOBA 5AZIB 4Z4EA 3I33A 1RBTA 3SUNA 3OHRA 4BROA 5KK4A 5JVGL 5CR4A 1JXEA 3NH0A 4JKHA 4N41A 2AA4A 3C6TA 4F3OA 3KKSA 3GL1A 5GADP 3M8PA 4DV4K 3J7AP 4ZTJA 4JI1K 1ZXOA 3O3HA 2RN2A 2E2OA 3C7NB 4IDKA 4CHQA 2QEXN 1NGEA 1S1WA 2ASMA 1SL2A 2D4WA 2GELA 1RILA 1J5EK 2YKMA 3F9KA 2PYLA 1Z05A 3SV3A 4E7JA 3KLHA 1VRTA 4X66K 1D9DA 3A5NC 3UKRB 2BDPA 3T7ZA 2MZ0A 1GLEG 3IS9A 1HJRA 2QWOA 1RT6A 1VHXA 2HHHK 4DTOA 1D9FA 5AQVA 2O8CA 1TV6A 1HNIA 3ENHA 3K58A 2E2QA 1TYQB 1TVRA 3AVFA 3QEXA 1XHXA 4JI0K 3QMLA 2HB5A 3V9XA 5BRHA 1IV0A 1NKCA 5JICA 5JS1A 2M8BB 2ASCA 3O9QA 3FZKA 2Z1GA 4H5VA 3G25A 3HM9A 2FSJA 2P9LA 1GLLO 3QLHA 2YHWA 3K2PA 2YX6A 3HXMA 1I94K 2P9IA 3AVJA 1Y64A 5EVZA 5KGXA 4CGHA 3T69A 3W3DA 2W42A 3UKUA 1XQSC 4FLZA 2DY4A 1Y97A 4YOWA 1XRSB 3LPUA 3PY8A 3KLFA 3SZ2A 4KHSA 2UUAK 3L56A 3CCVN 4IO8A 4MFBA 4CZFA 1CZAN 1HNXK 1C6VA 1U4BA 3NVMA 5AQMA 4CD1A 1NE5A 2ZQBA 4ELUA 4B1VA 5E41A 3WQUA 3CF5L 5E26A 4CK2A 4FK0A 4O4GA 3SAFA 1ZBIA 4KV8A 1F21A 4QS9A 4H0YB 4JYAK 4K0KK 4OGEA 4FM0A 4DTNA 4BRQA 3DLKA 3K5NA 1JZAA 2QW9A 1SS6A 4L3QA 1YVUA 4H5TA 2HHWA 2HBJA 1YVNA 1TKDA 4BY9C 1I39A 1ATSA 1B9DA 1ZC6A 1BG3A 2A7TA 3PLAA 2HVHA 4C8NA 5AQNA 1QVGM 1HUXA 2P9KB 4CJSA 1N34K 2UXDK 3VQCA 2HMIA 2QM1A 2XRIA 4PWDA 4DV0K 3HYFA 5HROA 2D1KA 4H5WA 1D5AA 4RW7A 3VEZA 2G8VA 1D8YA 4B9VA 3E66A 1RDDA 2NRRA 3AVGA 3HL8A 1Q9XA 3D6RA 2G8FA 2FBYA 3K9JA 1Z25A 1FJGK 5KQ8A 3BK3C 1DKGD 1C1AA 2W6KA 5AQIA 4M63C 3B6OA 4NYFA 1S6PA 4DSJA 2KFNA 3RVCA 4LSNA 4EP5A 1BIUA 2OPSA 1KAXA 4F8RA 4B1UB 4N56A 1LQQA 2E0HA 1NK7A 1C55A 1NKEA 4YOUA 2KHOA 2LY5A 3WNEA 2E6LA 1NU0A 2IS3A 1FKPA 3QI7A 3BP8A 1WSFA 2O4GA 4CF2A 4BDPA 2ATBA 4WQ5A 4C8LA 2AP1A 3HTVA 3THVA 4M45A 5ADXH 4DB3A 1QQOA 1X9JA 1L4VA 3WXKA 2BTFA 3O8MA 1XC9A 3L2VA 1GLBG 3ID6A 3NBPA 4BWJA 1WB9A 2UUBK 3SPYA 1B92A 3H6EA 4B1XB 3VA3A 4M3UA 2YNGA 3CG7A 4CGDA 1ZBLA 1QVFM 2FSNA 4FJXA 2YJFA 3G0ZA 4K42A 3MEDA 4KKOA 3QESA 4BRHA 4DQIA 5AQWA 3VQEA 3VF4A 3EN9A 2NRVA 3LAMA 1A5WA 4K8XA 1N5YA 3IFRA 1XNRK 2I7NA 3SJHA 3M3ZA 4O8KA 4DFPA 3OA9A 1HNVA 3O4NA 3OYBA 3WXIA 1QTMA 4ICLA 2A42A 4UADE 2LN8A 3T19A 1CXUA 4PKIA 1K8BA 1GOAA 3ZSRA 2XY8A 4J2DA 3O80A 4H0OA 5KGWA 1IG8A 5C25A 1RCHA 2NNWA 3TSQA 4FWLA 3OW2M 1QS4A 2IVNA 5HLFA 3LWMA 1UAXA 3ZETA 3I8BA 4C8KA 4JKGB 4E19A 4BREA 3C6UA 4DV2K 1VQ9N 2ATQA 3P4IA 1YTUA 1T7AA 4RCHA 1OZZA 3OS2A 2OCEA 4O0IA 4UAFE 1CHZA 4WYBA 1IKYA 4OLBA 2F7TA 4JKDA 1MDUB 3QEPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3JXU A;  3EE9 A;  3C94 A;  1WSJ A;  4ILH A;  1X9W A;  4FPA A;  1BQN A;  2QA4 N;  3SK3 A;  2E1Z A;  2E2P A;  1T7B A;  4H03 B;  3CME N;  3CCM N;  3R8E A;  1WAJ A;  2OA8 A;  1RT3 A;  1EO1 A;  2JGU A;  4M3R A;  1KFD A;  3AO3 A;  1ASW A;  1YIJ N;  3SI6 A;  3EZW A;  1HQE A;  3RMC A;  4N76 A;  4CQK A;  4BEC A;  1WSE A;  3ZSW A;  3FLC O;  4E1N A;  2QXL A;  3HP6 A;  3J8A A;  3E7U X;  3DRP A;  2VWK A;  3HST B;  5M1O A;  3I8D A;  4YOV A;  1TKX A;  4GV9 A;  1BHL A;  3RMA A;  4M3Y A;  5M1F A;  1JZB A;  1P0A A;  3KK1 A;  4MLE A;  1EWQ A;  3CHW A;  4CJU A;  1HX1 A;  5KPT A;  4BE0 A;  4DSE A;  4KTQ A;  3VMF B;  1TAU A;  3DMJ A;  1HKB A;  3HSC A;  4EHT A;  1X9M A;  1KRP A;  2LI7 A;  1NM1 A;  4CJ3 A;  3TAF A;  4NB4 A;  5I9E B;  3VQQ A;  3RSE A;  5T7B A;  4B1Z A;  4F2R A;  4FLY A;  3MEG A;  4A59 A;  5E84 A;  1G15 A;  3O9U A;  1CZB A;  4BE2 A;  2HNY A;  2IOC A;  4BR4 A;  5AFU A;  1XUP O;  4UJ0 A;  4B9Q A;  4DS4 A;  3LDP A;  4FWO A;  3THX B;  3HK2 A;  4DR1 K;  4AIL C;  5EXW A;  3R3L A;  5CYQ A;  4BVO A;  4JHD B; 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