2QWPA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the adp*pi form #2
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
386
structure length
386
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
molecule tags Chaperone
source organism Bos taurus
total genus 123
structure length 386
sequence length 386
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwpA04
2W40A 3AY9A 2QWOA 1NLVA 4B1YB 4A62A 1QZ6A 3C0BA 3UKRA 4EAHD 3IFRA 2Q97A 3BF1A 3U8XA 5BN8A 2A42A 3WUHA 4FL9A 5EY4A 3F9MA 5JLFA 2A40A 2P9PA 1HKBA 2YHYA 1CZAN 2P9KA 2V51B 2YJEA 1X3NA 3U9DA 4FWKA 5LJWA 1NGEA 3O6WA 4RTFD 3EO3A 4PL8A 2GWKA 3ZETA 4FPBA 2P9NB 5E84A 3GL1A 3VGMA 2FSKA 4WQ4A 1EQYA 3LL3A 3VERA 3VGKA 4EIAA 4BC3A 4IO8A 3BP8A 3ATVA 1NGDA 4BR2A 4CZHA 3O8MA 4B1VA 2CGKA 3HZ6A 4MO4A 4K41A 3FFKB 5FPNA 4CJ7A 3SMSA 3AAQA 3RSEA 5F1XA 3CJCA 4BR5A 2QWLA 2ZGYA 5TKYA 3TPQA 3LM2A 1IG8A 1OKJA 1X3MA 4AM7A 1MWMA 1BU6O 5I9EB 3EKUA 4PKIA 1KAYA 2FSJA 4L3QA 5BRHA 3EZWA 2E8AA 4BC4A 3DXMA 3DAWA 4RWTA 1DEJA 4JD2A 1RFQA 5AZJB 3UKUA 1ZBSA 3VOVA 4BC5A 2P9IB 1XQSC 3GE1A 4LC9B 4B9QA 2FF6A 5B8HA 4H5TA 3I8BA 5AQTA 4CZMA 4H5RA 2FF3B 4B1ZA 4FWLA 1QZ5A 4CI6A 3VENA 5KPZA 1QQOA 2H3GX 4K42A 1T6DA 2HF4A 2CH5A 3EN9A 3ZEUB 4IXCA 1MWKA 2J4RA 1BO5O 2P9LB 2QWPA 2P9SB 3C7NA 2Q0RA 4EHTA 4FWQA 1YAGA 2A41A 2D0OA 5BR9A 3QMLA 3O5BA 1S22A 5AQPA 1QHAA 3D7EO 2CH6A 3ENHA 2GEMA 1BOTO 3QICA 4CZFA 5FPDA 4BR9A 2AA4A 4XH5A 3MCPA 5BN9A 1T44A 3HI0A 5BPNA 3SK3A 4XEIA 3CHWA 3H45C 4JHDB 1DGKN 1X9JA 4JAXA 4BVPA 4ISEA 1HPMA 2IIRA 3A0IX 4FWPA 1GLFO 2ASMA 4BRIA 2QM1A 4H03B 2GWJA 2NLXA 1YUWA 5EOYA 4O5FA 5AQLA 3SLCA 3CJ1A 3S41A 4EHUA 5JLHA 4BRCA 3GG4A 1YXQA 1R59O 3VF6A 3R8EA 2QWNA 4BRHA 3HBTA 3H1QA 4CZLA 2NZTA 2D1KA 2VCPA 4FPAA 2GUPA 4BROA 4BVOA 5EX5A 3D2FB 2V7ZA 1NGFA 1E4FT 4A2BA 3UKRB 1NGCA 2QWQA 1ZC6A 4QS8A 5AFUA 2P9NA 4IJAA 5KPTA 3WXKA 4DCHA 4KBOA 3QFPA 2VWBA 3QBWA 3DJCA 4I6MA 5AQWA 1C0GA 1Z05A 4H0OA 2E1ZA 2P9PB 3VETA 3WQTA 3O08A 3MN9A 4XH1A 3LDNA 2QWMA 4H5NA 2P9KB 3BEXA 4CD3A 5KQDA 3LM9A 1NM1A 1LCUA 5AQNA 2E2QA 1NGGA 1U2VB 1Y64A 2EWSA 3A5OC 5BRDA 1NWKA 3DXKA 3ZETB 4H5VA 3L0QA 1TYQA 2HMPA 1V4TA 4B1WB 3ATUA 4Y0WA 4PKHA 4DQ8A 3VF2A 4H0TB 1HJOA 1P8ZA 3DWLA 4JN4A 5BRFA 5ADXA 4B1XB 3H3OB 2FLOA 4CZIA 1RGIA 2YI1A 1NGHA 2I7PA 3AARA 5BREA 4H0VB 3BF3A 3RSEB 1ATSA 5AQFA 5AFUH 1GLEG 4CZKA 1V4SA 3MN7A 5KPRA 3FZKA 3VGLA 3WT0A 3FE1A 1JCGA 1C0FA 1GLDG 3GOIA 2E2NA 3CJAA 3FZHA 3ULEA 3QDKA 2Q0UA 3UB5A 4O8KA 3H6EA 3R9PA 3A8YA 5AQHA 4CBWA 1BA1A 4IWVA 3DXMB 4FSVA 3FLCO 4ISFA 2DPNA 1SZ2A 2YJFA 4BR7A 4JD2B 4BRAA 4BR4A 5AQGA 5BPMA 3P4IA 4MLHA 5FPEA 2V52B 4PKGA 4BRLA 2QXLA 1T6CA 4BGAA 3O4WA 2PAVA 1HLUA 5ADXH 4H5WA 2ASOA 4K43A 3FZFA 4WQ5C 3EL2A 3M6GA 3WEEA 5JMVA 3D2EA 5AQUA 1BG3A 1K8KA 1HUXA 4FOIA 1KXPA 2PBDA 3ZX2A 1DKGD 5FPMA 3C7NB 4BRGA 3FGUA 3H1VX 4J8FA 1KAZA 3MDQA 3CIPA 3CERA 4PL7A 4BC2A 5AZIA 2OANA 2W41A 2E88A 3OHRA 2E2PA 3SMPA 2FXUA 3MN6A 2D0PA 4A2AA 3LDOA 2YCHA 4CBUA 4BG9A 3ZX3A 2P9UA 1JCFA 3HTVA 1Q18A 5LY3A 1NGJA 1BWFO 3CJ9A 1XUPO 3CQYA 3MMVA 4BG8A 4DHYA 5AQIA 1Z6RA 1WUAA 1G99A 1GLLO 4NB4A 3GDQA 3GBTA 3FR0A 1RDWX 1S3XA 2A3ZA 2A5XA 3QB0A 1NMDA 2IVNA 4YDUC 2QWRA 4RCHA 4IZ9A 3A5MC 4H0PA 3L6QA 4IJNA 1NBWA 3D2FA 2Q36A 3L4IA 3ENOA 4BRMA 4CZEA 1TUYA 1D4XA 1U6ZA 4XH4A 1BUPA 4CZJA 5F2RA 2Q31A 3IUCA 5AR0A 1H1VA 5CE3A 4K25A 3R6MA 5AQOA 2FSNA 2GELA 4ISGA 3SJHA 3U4LA 5JICA 1BA0A 4CZGA 2BUPA 3VEZA 1GLBG 3M3ZA 4BQLA 1GLCG 4BRNA 1U2VA 2A6AA 1NGBA 3BUZB 3QFUA 3JS6A 5AQRA 5AQXA 2BTFA 5F0XA 1NGAA 3O1WA 4F9OA 4CD1A 5BPLA 3MN5A 4I6MB 4E1JA 4HWIA 1KAXA 3FZLA 1HKCA 4AM6A 2I7NA 4CBXA 3A5NC 5AQQA 5KQ8A 3JXUA 4FOEA 1TUUA 1SQKA 2ASPA 4NO7A 3IMXA 3WXJA 3DXKB 4WYBA 3B8AX 4JNEA 2ITMA 3VF4A 5AQKA 3WXLA 1ZXOA 4A61A 1TYQB 2Q1NA 4BRFA 4FWOA 5AZJA 1ATRA 3G25A 2P9IA 4M63C 4C23A 1QQMA 1J6ZA 3VEXA 5EXWA 4WQ5A 4QS7A 4BRQA 2GTDA 4GY2B 4BRKA 1YVNA 3VESA 2CGLA 2YHXA 4WQ4C 4FWRA 3VEVA 3KZBA 4FWMA 3A5LC 1QQNA 1ESVA 4QS9A 2HF3A 2ZGZA 3MK6A 1JCEA 5AQJA 3EKSA 5AQVA 3UKUB 3FZMA 2KHOA 2IVPA 1WOQA 3ZEUA 2V7YA 1ATNA 3CQXA 4FWSA 4H0YB 4BRPA 4BQZA 2D4WA 2P9SA 2P9LA 3KHYA 4Z94A 3O80A 3J8AA 4M7XA 2E2OA 3VEYA 3WXIA 2E1YA 4HTLA 3ULEB 3CJBA 1E4GT 3HM8A 3UE5A 4H0XB 2UYTA 3I33A 1GLAG 4EFHA 3CJ7A 4BGBA 4FWNA 4BRDA 2IVOA 1HX1A 1MA9B 5EVZA 5AQSA 3U9ZA 2QW9A 1HKGA 2Q2RA 2AP1A 2WUSA 1XC3A 5LJVA 1NGIA 1IJJA 3W3DA 2E20A 4JHDA 2ZWHA 4M7YA 3TU5A 3VEWA 3O1BA 5AQZA 3ID8A 2ZF5O 4YDUA 3LDPA 3HSCA 4MLEA 4GNIA 3AAPA 3WEEB 3D2EB 1K8KB 4DB3A 2F9TA 1LOTB 4BREA 3KVGA 1MDUB 1SAZA 3LDLA 2NRHA 3VEOA 1BDGA 5AZIB 3IDHA 5AQYA 3M1FA 3ZX0A 5E26A 3CETA 3QBXA 2F9WA 5ELZA 3WQUA 4MO5A 5AQMA 1GLJO 2YHWA 2P9UB 4B1UB 2CGJA 3VPZA 3LDQA 3CI5A 4FO0A 2HOEA 4BR0A 3H3NO 3H46O 2VYPA 3W0LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HPHA 2QWOA 4R5PA 1QZ6A 3RMDA 3C0BA 5M1OA 3U3GA 4EAHD 2YNFA 3JSMA 3IFRA 1WBDA 4RW8A 1Q8IA 3WUHA 3I55N 1L3UA 4JI3K 2OTJN 2XY8A 1L3TA 1RTIA 3MX5A 3AVKA 3KD1E 1NE5A 4KKOA 1VSEA 1NPIA 1CZAN 3EZ5A 3P5JA 1U4BA 1KFDA 5LJWA 3M8QA 1NGEA 1JKZA 2O8FB 3EO3A 3ZETA 2GWKA 4WFBL 3V9WA 3FFIA 3PLAA 2G2KA 4EP5A 3MX2A 4YOWA 3OYMA 1WAFA 5C15A 3MEGA 3M8RA 3RTVA 4E72A 2CGKA 3HZ6A 4K41A 3FFKB 4ILGB 3AAQA 5A2QO 3DOKA 4DTUA 4AILC 1EP4A 5CY4A 1D9DA 1SL1A 1OH6A 2O8DB 2E3GA 3JAMO 4E7IA 4JKHA 1XMQK 3EKUA 4W5TA 2YNGA 4JRPA 5C12A 1RBRA 4F3OA 1VSJA 4IOAL 4CHNA 4FJ5A 3SYZA 2X6SA 3ZT0A 1PE4A 1ZU3A 1IH7A 4JD2A 2N69A 2DY4A 3AVGA 4H5TA 3THWA 1KVCA 3HJFA 5HRNA 4IBNA 1HR0K 3PX4A 3T7ZA 2FF3B 2KLAA 1T7AA 1NH5A 4M3UA 1C0UA 1U04A 3VENA 1WBBA 3EE9A 4K42A 4JS4A 1N32K 1OMYA 1RBVA 2CH5A 1YJWN 4IXCA 4JKEA 3VQ8A 2QWPA 3VMFB 3V9SA 1S1UA 4DV0K 3CCVN 2QKBA 3QMLA 1S22A 3A2FA 4JI0K 1SUQA 3UIQA 3HOTA 2GEMA 4NCBA 4JKBA 4DV6K 1TKZA 4AHVA 1T44A 5BPNA 3SK3A 2FBXA 3BGRA 3IAYA 4BWJA 1L5UA 1Q9YA 4BVPA 4CIEA 1BCMA 2IIRA 4OKJA 3HVRA 2HHHK 3QEVA 1XWLA 3SLCA 3CFOA 1UGLA 2LT8A 5TKWA 2NRTA 4CERA 2N2RA 4BRCA 3J81O 4G9ZA 1YXQA 4CW7B 1ASVA 4AAZA 4IEIA 4FJNA 2IOCA 3H1QA 3HBTA 3J7YP 4JK8A 1X9WA 1VSKA 2VCPA 5EU7A 2GUPA 4JKGA 4CQKA 1HQUA 4AHCA 1IBMK 3ISNC 1NGFA 4HCCA 1NGCA 2QWQA 1WB9A 1TKXA 4CGFA 4I2QA 3QBWA 3KLIA 4I6MA 1BK8A 1Z05A 2E1ZA 3VQ7A 1M90O 4KHNA 5LMNK 5FRMA 3BDPA 3WQTA 4XH1A 4H5NA 4CD3A 5KQDA 2RHKA 4FLXA 1W2BM 1OVYA 5DMRA 5AQNA 3VQEA 1I3AA 3VQPA 1U2VB 2EWSA 3NF9A 4CJ3A 4LF7K 4CHOA 1EWRA 4YOXA 3L0QA 2D5RA 3ATUA 4Y0WA 1Q9XA 1HNZK 2NY8X 4H0TB 1HJOA 3DWLA 1NMNA 4JN4A 2QKKA 1I2UA 4KB1A 4FLVA 1XNRK 4B8CA 3AARA 3RSEB 2HHTA 5AQFA 1JL2A 5AFUH 2B5JA 4YHHK 4YOYA 3CM5A 2KKZA 4DTMA 3FZKA 3WT0A 3CC2N 1SKSA 2WFBA 2I61A 3NF8A 2KFNA 3CJAA 3ULEA 2Q0UA 1RBSA 4DFMA 3MWPA 2XO7A 3VTHA 3U3YA 3ID6A 4GV9A 4FJXA 1RT6A 3TAGA 1KLMA 4BRAA 3C65A 4BR4A 2X78A 4CIGA 5HRRA 2YC1C 4IFYA 1HYSA 4PKGA 2F4VK 3QNNA 1LAVA 4BGAA 3O4WA 4AHUA 4GKJK 1S1XA 4CEFA 1GOAA 3KK3A 4K43A 3FZFA 3TANA 3KLGA 3L2RA 3WEEA 5HRPA 4B08A 4LF6K 4DR6K 1YHQN 3ENBA 4FOIA 4R79A 1VSFA 1VQLN 3AO1A 4KREA 4DQQA 1RT4A 3SV3A 1KAZA 2WC9A 3CIPA 5AZIA 3G6EN 3DOLA 3CFPA 3TSPA 2F7TA 4I9LA 1JCFA 3NVMA 5LY3A 4KHYA 3O4QA 1NGJA 1BWFO 1B9DA 3KHWA 2HBLA 3PSMA 4B3TK 2VGMA 2DTUA 2A5XA 3QB0A 3AA5X 4YDUC 2YKMA 4IZ9A 3A5MC 4IJNA 2NNWA 3C6AA 3E9LA 4NXNK 4FLZA 4DS4A 1BGXT 1TUYA 5J2NA 5F2RA 5C0YA 5AR0A 2QI2A 3SAHA 4MDBA 5CZ2A 3VTIA 4B8AB 1YIJN 1HYVA 2FSNA 3PO4A 3SPYA 1ITGA 4B3MK 3M3ZA 5HRSA 4C1NI 4AEIA 2A6AA 1NGBA 1LQQA 3BUZB 3RR7A 5AQRA 5AQXA 2G8IA 2N66A 2VWKA 3O1WA 4CD1A 5BPLA 3OW2M 1FH3A 1RCHA 1SEGA 3L2UA 4FW1A 4HWIA 4E1JA 2PYLA 3PIPL 3L4QA 1N34K 2O8DA 4DQIA 4FOEA 1TUUA 1RDCA 1NOYA 2QA4N 3IMXA 4OKKA 1W0HA 3DXKB 3CC7N 3ZYYX 3B8AX 2ITMA 3VF4A 4N56A 1TL1A 3F73A 5DM6L 1ATRA 3ZLJA 3C95A 3HPGA 2VY6A 3O9SA 3KWIA 5EXWA 4WQ5A 4J2BA 4CK3A 2G8HA 4GY2B 2CGLA 2YHXA 3VEVA 3KZBA 3A5LC 1QQNA 4M42A 4QS9A 2ZGZA 3MK6A 1JCEA 2NY9X 4B3SK 5AQJA 3CD6N 1PX9A 3OBYA 3G0ZA 1VNBA 2KHOA 1WOQA 1RDBA 1ATNA 3CQXA 3NCIA 4W5OA 4HUGA 2EX3A 1JJ2M 3DYAA 2N2QA 4NLCA 4Z94A 3NGYA 3VEYA 3WXIA 3QIPA 2FBYA 3E7RL 3IRXA 4HTLA 4DV7K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HPH A;  2QWO A;  4R5P A;  1QZ6 A;  3RMD A;  3C0B A;  5M1O A;  3U3G A;  4EAH D;  2YNF A;  3JSM A;  3IFR A;  1WBD A;  4RW8 A;  1Q8I A;  3WUH A;  3I55 N;  1L3U A;  4JI3 K;  2OTJ N;  2XY8 A;  1L3T A;  1RTI A;  3MX5 A;  3AVK A;  3KD1 E;  1NE5 A;  4KKO A;  1VSE A;  1NPI A;  1CZA N;  3EZ5 A;  3P5J A;  1U4B A;  1KFD A;  5LJW A;  3M8Q A;  1NGE A;  1JKZ A;  2O8F B;  3EO3 A;  3ZET A;  2GWK A;  4WFB L;  3V9W A;  3FFI A;  3PLA A;  2G2K A;  4EP5 A;  3MX2 A;  4YOW A;  3OYM A;  1WAF A;  5C15 A;  3MEG A;  3M8R A;  3RTV A;  4E72 A;  2CGK A;  3HZ6 A;  4K41 A;  3FFK B;  4ILG B;  3AAQ A;  5A2Q O;  3DOK A;  4DTU A;  4AIL C;  1EP4 A;  5CY4 A;  1D9D A;  1SL1 A;  1OH6 A;  2O8D B;  2E3G A;  3JAM O;  4E7I A;  4JKH A;  1XMQ K;  3EKU A;  4W5T A;  2YNG A;  4JRP A;  5C12 A;  1RBR A;  4F3O A;  1VSJ A;  4IOA L;  4CHN A;  4FJ5 A;  3SYZ A;  2X6S A;  3ZT0 A;  1PE4 A;  1ZU3 A;  1IH7 A;  4JD2 A;  2N69 A;  2DY4 A;  3AVG A;  4H5T A;  3THW A;  1KVC A;  3HJF A;  5HRN A;  4IBN A;  1HR0 K;  3PX4 A;  3T7Z A;  2FF3 B;  2KLA A;  1T7A A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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