2QWPA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the adp*pi form #2
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
386
structure length
386
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
molecule tags Chaperone
source organism Bos taurus
total genus 123
structure length 386
sequence length 386
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwpA04
4CZKA 4PKHA 2YCHA 4BR9A 3VEYA 5EOYA 2ITMA 2P9PA 3CJ9A 5FPNA 3M3ZA 3CJ1A 4B1UB 2E1ZA 4H5WA 1YXQA 4CZJA 2QWRA 1GLEG 4F9OA 4PKIA 5FPEA 3DXMA 2P9SA 3VENA 4WQ5C 5EXWA 1YAGA 4O5FA 2V7ZA 1X9JA 3R8EA 2P9KB 2Q2RA 4Y0WA 3A5OC 4M7YA 3UKUA 3AY9A 4BG9A 3RSEB 5F0XA 1KXPA 3HBTA 2CH5A 3FR0A 2QWQA 2QWOA 1U2VA 4AM7A 3O5BA 3A5NC 4BR7A 4H0YB 3MDQA 2QWLA 5AQKA 3CQXA 3HI0A 3KVGA 4K42A 5JLFA 3D2FB 5AQRA 4CJ7A 5KQDA 3EKSA 5AQUA 2F9TA 5AQLA 2P9UA 4FWKA 3SMSA 3ZEUA 3WQUA 3VF6A 4CBXA 3LDPA 3G25A 2CGJA 3LL3A 4ISGA 3BF3A 3JXUA 2VWBA 2E8AA 4FWQA 1NGBA 2E2QA 5JLHA 3D7EO 3SMPA 3LDLA 3IMXA 1V4TA 3HM8A 3VGMA 3FZFA 3LDNA 4JN4A 4FL9A 5AQJA 2V51B 1MWMA 4BG8A 4DCHA 2FSJA 1H1VA 1U6ZA 2BUPA 5FPDA 5AQOA 4JAXA 4BRKA 2ASOA 3C7NA 4EFHA 2CH6A 3GG4A 3ZX2A 1BA0A 1HKBA 3VETA 1TYQB 4BR5A 1KAXA 4WYBA 4BQZA 3SLCA 1DEJA 2D0OA 1HKGA 1NGEA 2NZTA 5AZIA 3HTVA 4BRLA 2E1YA 4HWIA 1ZXOA 3CERA 3FLCO 5AQYA 5AQTA 3DAWA 4I6MA 4JD2A 4MLEA 2QWMA 5FPMA 3WUHA 2QWPA 5AQWA 1Z05A 3O4WA 4RWTA 1X3NA 2A5XA 5ADXH 1QZ5A 3QBWA 5AQZA 2VYPA 3ZX0A 3ENOA 3AAPA 2ZF5O 4BRMA 5E84A 3ZX3A 2Q31A 2W40A 4YDUC 2NLXA 3FZMA 4H0PA 4QS9A 5BN9A 2W41A 3FZHA 4H0XB 1ATNA 4H5VA 4BR2A 3CJ7A 1T6DA 3DXKA 3H46O 1QHAA 1NGAA 1QQNA 4CZIA 5JMVA 4FWSA 3BUZB 1D4XA 1HPMA 2F9WA 4BC2A 3AARA 4BQLA 5F1XA 3A5MC 3W3DA 4ISFA 3IFRA 4E1JA 5AQSA 2I7NA 2A6AA 3FGUA 3FFKB 4FOEA 3MN9A 3L6QA 2OANA 3H6EA 1NGFA 4B1XB 5BREA 3ATVA 3FZKA 2GUPA 3EKUA 3VESA 2D1KA 4IO8A 3DJCA 3AAQA 3U9ZA 4IJNA 5AFUH 4H0OA 4PL7A 3HZ6A 2P9LA 4K41A 1IJJA 4ISEA 3U9DA 4BREA 1HKCA 3EN9A 4RTFD 2FF3B 3VGKA 1OKJA 1BWFO 4BC5A 3VF4A 4BR0A 4EIAA 4GNIA 3FE1A 3QFPA 1GLCG 4MO5A 3WEEA 1NMDA 3MN7A 2P9NB 4B1WB 1YUWA 1CZAN 1XQSC 2P9IA 3ZETB 2ASMA 3IDHA 2KHOA 1ZBSA 2QM1A 5I9EB 5AZJB 2FSKA 3CIPA 1NGDA 3O8MA 2IVPA 4BRPA 4B1YB 3S41A 4A61A 1RFQA 2E2NA 2IVOA 3O1WA 3O6WA 2FXUA 5ELZA 3TPQA 4BRQA 5BRDA 4BC4A 1EQYA 1WOQA 4YDUA 5AQHA 1ESVA 1R59O 3BEXA 2Q36A 2V52B 3QFUA 2YJFA 3LDQA 1GLJO 3GL1A 5EY4A 3U4LA 3ULEA 1HX1A 3UKRA 3F9MA 2GTDA 3ENHA 4H5TA 2BTFA 3ID8A 5KPZA 2A3ZA 5BR9A 3CJCA 4BRNA 3MN6A 5AQNA 2P9PB 4WQ4C 4RCHA 2YHYA 3D2EA 1SAZA 2CGKA 4BRCA 4FO0A 4QS8A 4IWVA 4FSVA 1S3XA 3DXMB 1HLUA 2P9SB 3GE1A 5AQVA 1K8KA 4PKGA 5BPLA 1LOTB 1P8ZA 1Q18A 4FWRA 4NB4A 5BPNA 2WUSA 1JCGA 4JHDA 2GWJA 4XH4A 2ASPA 3A8YA 4B9QA 2YI1A 3UKUB 3VERA 4CD3A 3P4IA 4DQ8A 4CZLA 4B1VA 1NGJA 2QW9A 3CQYA 3EL2A 5BRFA 4CD1A 4H5RA 3R9PA 1JCFA 1U2VB 3U8XA 2A42A 1E4GT 4BRHA 2Q0UA 3CHWA 1KAZA 3ATUA 2IIRA 3VOVA 3B8AX 1BU6O 4H0VB 2AP1A 3A5LC 3GBTA 2P9UB 3ZEUB 5ADXA 5AQIA 5AQGA 5B8HA 5E26A 4BVOA 2D4WA 2P9KA 4BGAA 3RSEA 3H1QA 3QDKA 3TU5A 3QBXA 2H3GX 1X3MA 1BO5O 3H1VX 3D2EB 2HF3A 2D0PA 2A41A 1T44A 4FPBA 4CZEA 5LJWA 5BRHA 3WQTA 3C7NB 4WQ4A 1QZ6A 4H5NA 1K8KB 2FLOA 2Q1NA 4CZGA 3D2FA 2ZWHA 4KBOA 3WT0A 3H3NO 4XEIA 1YVNA 3FZLA 4JHDB 3VEXA 3EO3A 1RGIA 3BP8A 3QMLA 2J4RA 2PBDA 1Y64A 5KQ8A 1BOTO 5AZIB 2ZGYA 2HF4A 1HUXA 4Z94A 2UYTA 1XC3A 3J8AA 1MA9B 2E20A 4I6MB 4JD2B 5TKYA 3O1BA 1HJOA 2E2PA 1C0FA 3VF2A 3SK3A 5AFUA 2VCPA 3SJHA 1GLBG 3VPZA 4EHUA 5F2RA 4CBWA 1BG3A 4BRFA 1GLFO 4C23A 1KAYA 1E4FT 1V4SA 3OHRA 1QQMA 2HMPA 3H3OB 3QICA 4CZHA 1TYQA 1DKGD 4A2AA 4HTLA 3LM2A 3GDQA 4AM6A 4BRGA 4B1ZA 3VGLA 1G99A 1GLDG 5CE3A 4L3QA 1BDGA 3DXKB 4EHTA 2E88A 5KPRA 5AQPA 3R6MA 2YHWA 2HOEA 2AA4A 3BF1A 1GLLO 5LJVA 2YHXA 3IUCA 5AQQA 4MO4A 4CBUA 4BRDA 1BUPA 3O80A 2QWNA 2FSNA 5EVZA 2ZGZA 3WXIA 2YJEA 3VEWA 4FOIA 1NLVA 4IZ9A 3MK6A 4BR4A 4LC9B 3MMVA 1GLAG 4FWNA 4GY2B 1QQOA 5AQXA 1TUUA 1NGGA 3UB5A 3LDOA 2Q97A 2P9LB 4IJAA 3MCPA 1NGCA 4J8FA 4FWLA 5AR0A 4MLHA 1JCEA 3M1FA 2NRHA 1BA1A 2V7YA 1C0GA 2A40A 3I33A 2IVNA 4O8KA 4BRIA 4PL8A 2DPNA 3WXKA 4CI6A 3JS6A 3W0LA 2GELA 2GEMA 3WEEB 5AQMA 1RDWX 4A62A 3DWLA 2P9IB 1MDUB 4BRAA 3CJAA 2EWSA 3CJBA 2E2OA 2I7PA 4H03B 1NBWA 1ATSA 3M6GA 2QXLA 3H45C 3I8BA 3WXJA 4FWMA 5JICA 3QB0A 3O08A 3HSCA 4FWOA 4EAHD 4WQ5A 5EX5A 2GWKA 5BN8A 3KZBA 1ZC6A 1IG8A 4M63C 3VEZA 1MWKA 5AQFA 3VEOA 4JNEA 4M7XA 4FPAA 3L4IA 1J6ZA 3GOIA 3EZWA 4XH1A 4BGBA 3ULEB 1DGKN 3L0QA 4FWPA 1NM1A 2Q0RA 3A0IX 4H0TB 3UKRB 3VEVA 2P9NA 1SZ2A 1T6CA 3CI5A 4QS7A 3UE5A 1Z6RA 3WXLA 3ZETA 2CGLA 4DB3A 1SQKA 5AZJA 4NO7A 1NGHA 4CZMA 1NWKA 4BROA 1ATRA 4BVPA 4K25A 5KPTA 2PAVA 5BPMA 1WUAA 1NGIA 4CZFA 1LCUA 2FF6A 5LY3A 1S22A 3C0BA 3MN5A 4IXCA 3KHYA 4BC3A 4K43A 3LM9A 4XH5A 3CETA 1XUPO 4DHYA 1TUYA 4A2BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AF1A 4C8OA 4BR9A 3V1RA 2P9PA 3WXMB 4KPYA 3M3ZA 3CJ1A 4CJRA 2OCEA 2WFBA 5SWMA 4CFDA 2VG6A 4FJXA 3QIOA 1GLEG 3ALYA 4GVEA 3VENA 1OH6A 3HRGA 4KTWA 3AVIA 4I7FA 5CY4A 1RDDA 1TAUA 2OPQA 3R8EA 4BECA 2KLAA 4JLHA 1NE5A 2A1RA 1VNBA 3UKUA 1Q86O 3AY9A 3LAKA 2YIOA 3VQPA 5F0XA 1KXPA 1WSGA 4FK0A 3RMDA 1RT1A 1XHZA 2HHUA 1U2VA 3O5BA 2QWLA 3CQXA 3HI0A 1NJWA 3QERA 3AVLA 4LF8K 4NYFA 2F9TA 5AQLA 2P9UA 5DM7L 1L5UA 5M1FA 3VF6A 1DJTA 1UWBA 3HVRA 3LDPA 3NF8A 4FLTA 5I3UA 4ISGA 3Q7BA 4FJIA 1A5XA 3THWB 1NGBA 1T7BA 3V9WA 1EO1A 2RPIA 1WAJA 3VGMA 3ZT0A 3FZFA 1D9FA 2FBVA 4JN4A 4NLBA 1VQ9N 2O4IA 4DQRA 1RCHA 4JAXA 4CIEA 4BRKA 3C7NA 2D0BA 4B9TA 3GG4A 4BEBA 4HE7A 4N76A 4BR5A 3E7RL 2HHWA 3OW2M 4CIFA 4BQZA 3CCJN 1BCMA 2D0OA 4LSLA 1KV0A 3LPTA 3RMCA 4CF8A 2HHSA 2IDOA 4M3UA 3IG1A 1OH5A 4IFEA 4I6MA 5AQYA 4OKKA 4JD2A 3QEXA 3VQCA 3KP0A 4DV1K 3N4QA 3AO5A 1IKVA 1Z05A 3PSMA 2VG5A 4RWTA 1BIUA 3L2VA 2KBHA 3ZYYX 2KFNA 3ENOA 3L8BA 4C8KA 3LP0A 4JEPA 5E84A 2Q31A 3SQ1A 2NLXA 4I2QA 2RHKA 2DFEA 2UUAK 2XY6A 4FJ5A 2HNZA 1NK8A 4H5VA 4HCCA 3D45A 4CZIA 1QHAA 1NGAA 1BHLA 1OH7A 4Z4IA 4ELUA 4E1MA 4JKHA 5F1XA 4CEEA 4DR6K 2ZJPL 3ULDA 4BWMA 2ZM6K 4E1JA 4C8NA 4J2AA 2A6AA 1N32K 4UY8O 4FOEA 1HYZA 4R79A 1GOBA 5C25A 4ILJA 3OBWA 2UXCK 2OANA 1N8RO 3H6EA 1K9MO 3LWMA 3AAQA 3O3FA 4IJNA 3KHWA 2E5LK 4H0OA 4PL7A 3HZ6A 2Z1GA 1S1TA 3R2VA 4PHTX 2YNFA 1PE4A 4FM0A 1TKXA 2FF3B 4QAGA 4IOXA 4EIAA 4DR7K 1S1XA 3I0RA 4CGDA 4CEOA 4MO5A 1WSJA 3WEEA 1W0HA 4F3TA 2XHBA 1XQSC 2P9IA 2HBLA 1Q9XA 4KHYA 1HYVA 3O8MA 4BRPA 4B1YB 2KYQA 3HPGA 2HB5A 5LMNK 1KVCA 5GADP 5GINA 2RKIA 5BRDA 3KK2A 3SZ2A 1ZVGA 3SUOA 1WOQA 3KIOA 3HPHA 4LFAK 1C56A 4YOXA 1A5VA 2Q36A 4ILHA 3QFUA 1IKWA 2KKZA 1VHXA 4YY3K 4IEEA 1TL3A 4FJ7A 3KOXA 3U4LA 1HNXK 1XHXA 1HJRA 4YOTA 1TK0A 3TSUA 2BTFA 4I9LA 5KPZA 1FJGK 2IOCA 3V9ZA 3NF9A 5CYMA 4RCHA 1LQQA 3D2EA 5H1SQ 3SUQA 2CGKA 3DRPA 4AAZA 5AQVA 5CZ1A 4FWRA 1D9DA 2HHHK 3HP6A 3KJVA 3G4SN 1I6GA 3T1YK 2HMIA 3CFPA 5LL6Z 1Y97A 3A8YA 3CCQN 4FM1A 4CZLA 4B1VA 5BRFA 3R9PA 1SKSA 4UADE 1U47A 4LF9K 2XO7A 3MWPA 3PV8A 3RR7A 3ATUA 1Q9YA 4CE9A 1RILA 3A5LC 4DV5K 1C55A 2HSTA 2PFUA 4IFYA 3ZEUB 5ADXA 4E72A 5AQIA 1L3VA 5AQGA 2JWKA 3OYIA 5E26A 3TAEA 2O8BB 1NK5A 3P5JA 1C0MA 4C8MA 2KQ2A 4GW6A 4OKJA 1DLOA 3QDKA 3TU5A 2H3GX 2VQFK 3PSFA 3H1VX 3D2EB 2X6SA 4IKFA 2A41A 1LWCA 4WCEL 5BRHA 3WQTA 1ASWA 1NOYA 4H5NA 2FLOA 3NH2A 4E19A 4RG8A 4LF7K 4KBOA 3WT0A 2KBKA 4OO1J 1RGIA 4U7BA 2J4RA 4QCLA 1Y64A 2VG7A 5AZIB 2HF4A 1OZZA 2LY5A 3MCAB 1C1CA 5I42A 1FXXA 1J9AA 1ZYVA 2B68A 3EY1A 2E2PA 1ITGA 3HOSA 3UIQA 1SKWA 3VPZA 4EHUA 2PYJA 3FFIA 5F2RA 4CBWA 1BG3A 2LR3A 3O9TA 4UQGA 3J7AP 4UAFE 4A5AA 3OHRA 1VSFA 2HMPA 4CJ5A 2X78A 3MX2A 3QICA 4IFVA 5HP1A 4CF9A 1TYQA 3TTCA 3L2UA 3VQ8A 3QETA 1RT6A 4BRGA 3VQDA 2QKBA 1P00A 1BDGA 2X74A 2HHTA 5GAHP 2XRIA 3O9SA 1UGLA 3V9SA 2YHWA 1BISA 2UXBK 1TKDA 4LD0A 3QINA 4FJLA 1D5AA 5J2NA 1C0UA 2HBMA 2VQEK 5AQQA 2F8SA 4N47A 2VWKA 3EE9A 3K57A 3VEWA 1NLVA 4KHSA 4CJLA 1GOAA 4LC9B 3L2QA 2NY8X 4CGJA 4KHQA 5AQXA 3PX4A 3N4PA 1SS6A 1BQMA 2FBXA 3UB5A 4J8FA 4FWLA 4Q0BA 4MLHA 1KSPA 4OPHA 3J7YP 4J2EA 1GPTA 4LH4A 2O8DB 5HRSA 2NRZA 4NXNK 3JS6A 3NGYA 4C8LA 1SEGA 1T05A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4AF1 A;  4C8O A;  4BR9 A;  3V1R A;  2P9P A;  3WXM B;  4KPY A;  3M3Z A;  3CJ1 A;  4CJR A;  2OCE A;  2WFB A;  5SWM A;  4CFD A;  2VG6 A;  4FJX A;  3QIO A;  1GLE G;  3ALY A;  4GVE A;  3VEN A;  1OH6 A;  3HRG A;  4KTW A;  3AVI A;  4I7F A;  5CY4 A;  1RDD A;  1TAU A;  2OPQ A;  3R8E A;  4BEC A;  2KLA A;  4JLH A;  1NE5 A;  2A1R A;  1VNB A;  3UKU A;  1Q86 O;  3AY9 A;  3LAK A;  2YIO A;  3VQP A;  5F0X A;  1KXP A;  1WSG A;  4FK0 A;  3RMD A;  1RT1 A;  1XHZ A;  2HHU A;  1U2V A;  3O5B A;  2QWL A;  3CQX A;  3HI0 A;  1NJW A;  3QER A;  3AVL A;  4LF8 K;  4NYF A;  2F9T A;  5AQL A;  2P9U A;  5DM7 L;  1L5U A;  5M1F A;  3VF6 A;  1DJT A;  1UWB A;  3HVR A;  3LDP A;  3NF8 A;  4FLT A;  5I3U A;  4ISG A;  3Q7B A;  4FJI A;  1A5X A;  3THW B;  1NGB A;  1T7B A;  3V9W A;  1EO1 A;  2RPI A;  1WAJ A;  3VGM A;  3ZT0 A;  3FZF A;  1D9F A;  2FBV A;  4JN4 A;  4NLB A;  1VQ9 N;  2O4I A;  4DQR A;  1RCH A;  4JAX A;  4CIE A;  4BRK A;  3C7N A;  2D0B A;  4B9T A;  3GG4 A;  4BEB A;  4HE7 A;  4N76 A;  4BR5 A;  3E7R L;  2HHW A;  3OW2 M;  4CIF A; 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