2QWQA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the amppnp hydrolyzed form
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
molecule tags Chaperone
source organism Bos taurus
total genus 115
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwqA04
2Q2RA 2DPNA 1K8KA 4H03B 3AAPA 2D4WA 2YJFA 3WQTA 2FSKA 2P9IB 2ZF5O 3CJ9A 1IJJA 4JHDA 5BREA 4ISEA 2E2OA 3MDQA 4I6MA 5AQXA 4IJAA 4QS7A 1RDWX 3VEYA 2A3ZA 4FWNA 4EHUA 4BRMA 3H6EA 1DEJA 4XH4A 3A5OC 3HTVA 4FWRA 3WUHA 4BGBA 2Q97A 4DHYA 1E4FT 3MN6A 4FWMA 1NGFA 4H0PA 5AQGA 4GNIA 3M6GA 2VWBA 3ATUA 4JD2B 3EO3A 2HF3A 4CZHA 2YHWA 1Z05A 4BR5A 3F9MA 2P9NA 4CBXA 3KVGA 2Q0UA 4CD3A 3SLCA 4DQ8A 3FE1A 1YAGA 1GLAG 2VCPA 2W40A 3R6MA 1D4XA 5AQFA 3CJBA 3FGUA 3D2EB 3MN5A 2V51B 5AZJB 1J6ZA 4CJ7A 1BU6O 1BG3A 4AM7A 2P9LB 2KHOA 2CGLA 3DJCA 3L0QA 3ZEUB 2P9IA 3U8XA 4BR0A 4FPBA 3IDHA 3A5MC 3CQYA 1S22A 1XQSC 4FWKA 3HZ6A 1RFQA 4XH1A 2FSJA 5AFUA 1NBWA 4H5WA 5AQKA 1KAYA 3VGKA 5I9EB 5AQHA 2E1YA 2QWOA 3O80A 4ISGA 5BRHA 3C0BA 3ID8A 3SK3A 4CD1A 4BRGA 3VGLA 3RSEB 5CE3A 3HI0A 3D7EO 1GLCG 3IFRA 5AQVA 3WXLA 1YUWA 2QWQA 4M7YA 2FF6A 5ELZA 2E88A 5AQIA 5EY4A 4H5RA 5KPRA 5AQNA 5BN9A 3D2EA 2YCHA 2ASPA 2PBDA 5AZJA 3UB5A 3KZBA 4XEIA 3BP8A 4Z94A 2AA4A 2I7NA 5LJWA 3ZX3A 2A6AA 3A5NC 2P9UA 1Y64A 4BRFA 4H0TB 2E20A 4CZGA 4H0XB 4YDUA 3UE5A 3FFKB 1ATRA 3U9ZA 3LM9A 4IWVA 3DXKB 4BR7A 3QBWA 1EQYA 2V52B 2QW9A 4DB3A 5AQMA 4K41A 4PL8A 1P8ZA 5E84A 5EOYA 5JICA 1IG8A 4FWLA 4FWQA 4BC3A 3H3OB 1X3MA 2OANA 3EZWA 3H3NO 1MDUB 3H45C 4BRHA 4EAHD 2QWPA 5LJVA 3L4IA 1WUAA 4LC9B 3FR0A 4BC5A 4DCHA 2E2QA 5EX5A 5AZIB 4B1YB 3LDLA 1GLJO 3GBTA 3GDQA 3HBTA 4H0VB 1QQOA 1BDGA 1XUPO 4BRDA 1DGKN 3O1WA 4JN4A 4H0OA 5BRDA 3JS6A 4BQZA 3FZLA 1X9JA 4WYBA 1BO5O 3SMSA 1NM1A 3UKRB 4CZKA 3ZETA 3QDKA 5KQDA 1NGIA 2AP1A 4MO4A 3ULEB 2ZGYA 3LDNA 3DXKA 1TUYA 1XC3A 3B8AX 4BC4A 3MN7A 2IIRA 1CZAN 1JCFA 3MCPA 1QZ6A 2QWRA 4BR9A 4F9OA 4CZJA 3TPQA 4IJNA 1QQNA 2YHYA 2FLOA 2IVOA 4CBWA 1S3XA 5AQZA 2P9PB 1MWMA 3QBXA 2IVNA 5AR0A 1C0FA 1C0GA 1DKGD 1GLEG 5AQRA 1LCUA 4PKGA 1LOTB 4CBUA 4XH5A 2GUPA 5ADXH 3LDPA 3DXMB 1HX1A 2QWNA 3VEOA 3H1QA 5KQ8A 3IUCA 4BRKA 1T44A 2BTFA 3UKUB 1X3NA 2NRHA 5KPZA 3VF6A 2HOEA 4HWIA 2V7YA 1GLBG 2Q1NA 2BUPA 2NLXA 3MN9A 1BWFO 3CJCA 5BN8A 4NO7A 4JD2A 1MWKA 1E4GT 4FWPA 4BVOA 5BPMA 2A42A 3HSCA 1NGCA 1GLLO 1ATSA 2ZGZA 3WQUA 3TU5A 3ENHA 5EXWA 3SJHA 1Q18A 4A2AA 4BVPA 3MK6A 3C7NB 1G99A 4M7XA 5BR9A 4BC2A 1RGIA 1U2VB 3FLCO 3H1VX 2P9SB 3O08A 4BG8A 3VEVA 4Y0WA 4EFHA 4WQ4A 4CZLA 1SZ2A 3OHRA 2P9LA 3A8YA 1TUUA 4IXCA 4CZEA 3ZEUA 3VERA 4QS8A 3LM2A 2A41A 2W41A 3U9DA 1SAZA 1H1VA 3M3ZA 2YHXA 3CIPA 5FPMA 1NGBA 3D2FB 4BR4A 1NGDA 3VENA 2GWKA 3EKUA 5JLFA 3UKUA 4EHTA 5JMVA 4RWTA 1NGAA 1TYQB 4WQ5A 3WEEB 3BUZB 3WXIA 4MLEA 3EN9A 3QB0A 4FOIA 3VPZA 2H3GX 1K8KB 5AQLA 5AQYA 3RSEA 4O5FA 3I8BA 2GTDA 1JCEA 3AY9A 3S41A 4B1WB 4RTFD 2Q31A 3VEWA 2D0OA 2I7PA 5AQTA 5FPDA 3R8EA 3EKSA 4BREA 3P4IA 2P9SA 2A40A 4MLHA 4B1XB 1NGEA 3VF4A 3LDQA 2PAVA 1GLFO 1ESVA 4O8KA 3VEZA 4BQLA 3ENOA 3VESA 3O1BA 1HKGA 5B8HA 5JLHA 1HPMA 4ISFA 3EL2A 1R59O 3LL3A 3W0LA 4BG9A 2QWLA 2NZTA 4K42A 4BRAA 2E8AA 2ASOA 3GL1A 3QMLA 4AM6A 1TYQA 3A0IX 3A5LC 1V4SA 4CZMA 3IMXA 4HTLA 5FPEA 3GOIA 3QFPA 2CGKA 3CQXA 1BOTO 1QQMA 4EIAA 3O4WA 1HKBA 1OKJA 3WXKA 4E1JA 4C23A 2ASMA 5F0XA 4FSVA 3VOVA 3WXJA 4FPAA 3QICA 2V7ZA 4GY2B 4H5NA 1ZC6A 2E2PA 3DAWA 3AARA 4MO5A 2CH6A 1KAXA 4IZ9A 1WOQA 5E26A 3G25A 4FL9A 2F9WA 3H46O 1KAZA 3BF1A 5AZIA 4K43A 3CETA 4PKIA 5LY3A 2FSNA 5ADXA 1NGGA 5AQJA 2UYTA 4FWOA 3ZX0A 1BA1A 4B9QA 3O5BA 3M1FA 1HKCA 1HUXA 2QWMA 3R9PA 5EVZA 1JCGA 4BRIA 3UKRA 5AQQA 1GLDG 4A2BA 3ATVA 1ZXOA 1HJOA 3CJ1A 3ULEA 4JAXA 5AQUA 3FZMA 3GG4A 2FF3B 3FZHA 5AFUH 3U4LA 1NGJA 2E2NA 2QXLA 1ZBSA 2GELA 1T6CA 2VYPA 4H0YB 4PL7A 2P9UB 3CERA 3DWLA 1Z6RA 5F2RA 4A62A 1QHAA 4NB4A 1BUPA 1NLVA 1KXPA 2FXUA 5AQWA 5AQPA 2YJEA 4KBOA 3L6QA 4BRPA 3LDOA 3CJ7A 4H5TA 2D1KA 2P9PA 4FWSA 3I33A 4WQ4C 5BRFA 4B1VA 4H5VA 4PKHA 2P9KB 4BRNA 5KPTA 3DXMA 1NGHA 1NMDA 2D0PA 2Q36A 3QFUA 4BRLA 4K25A 4JNEA 1YXQA 3VEXA 5BPNA 3VF2A 4J8FA 4QS9A 3BEXA 4B1ZA 1NWKA 1YVNA 4WQ5C 3FZFA 5AQOA 5AQSA 2WUSA 3KHYA 1U6ZA 4YDUC 1SQKA 4BGAA 3J8AA 4RCHA 4CI6A 4JHDB 1T6DA 3MMVA 2QM1A 3O6WA 4L3QA 4I6MB 4BROA 2A5XA 2HF4A 4BRCA 3AAQA 1HLUA 3CHWA 4FO0A 4BR2A 2IVPA 1BA0A 1QZ5A 5FPNA 3BF3A 2E1ZA 3WT0A 2YI1A 2ZWHA 3VGMA 3SMPA 3C7NA 2CGJA 1V4TA 3O8MA 1U2VA 4M63C 1MA9B 2CH5A 3ZETB 2ITMA 4IO8A 2J4RA 2EWSA 4CZFA 3FZKA 2F9TA 3CJAA 2P9NB 2P9KA 5TKYA 4BRQA 4B1UB 3HM8A 3CI5A 3VETA 3ZX2A 2GWJA 3JXUA 4FOEA 3D2FA 2GEMA 5BPLA 4A61A 4CZIA 2Q0RA 1ATNA 2HMPA 3W3DA 5F1XA 3WEEA 3GE1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1N36K 2FBYA 1YJ9N 2IGIA 1O13A 2D4WA 3WQTA 2P9IB 5BREA 1IJJA 2E2OA 3MDQA 2O8EA 3VQ9A 1RTIA 5FRNA 4B9UA 2HW3A 3SBGA 4DWIA 3T69A 4DTXA 1ZU3A 4EHUA 4DR1K 3F5TA 3QINA 1BCMA 1RT1A 4DSFA 3AVNA 3CCJN 3PY8A 2LJ7A 4KH4A 3KWGA 3ATUA 1SL1A 4FLZA 3EO3A 3CCVN 2HHVA 2B5JA 2QEXN 3F9MA 2F7TA 2Q0UA 1NRBA 1UGLA 2E0HA 3SLCA 2D5RA 1YJWN 1IG9A 2VCPA 3PX0A 4CGFA 3CJBA 2N2QA 2V51B 3DMJA 4IEIA 4KHWA 3QETA 3SNNA 1W9HA 3AO4A 4KTWA 4M3ZA 3D0PA 1Q82O 4KI6A 4AHCA 3ZLJA 3MX2A 1Y97A 4FPBA 3CC7N 3O9QA 5C15A 1QSLA 1XQSC 2ITGA 1RFQA 2RKIA 2A1RA 4N47A 3H08A 4ILHA 1NBWA 1DTQA 3CCLN 3VGKA 3ITHA 5AQHA 1BCGA 3N4PA 3SK3A 2P5OA 2D0AA 5C42A 3HI0A 3D7EO 1WSIA 3LANA 4B9MA 5I3UA 1ZBLA 3WXLA 3L2WA 5HRRA 4E7KA 4IOXA 5ELZA 5AQIA 5EY4A 1C6VA 3ZSXA 1I6FA 4H5RA 3KLIA 4DV3K 1EKEA 4C1NI 2ASPA 4X66K 5AZJA 3UB5A 4XEIA 5J2QA 4Z94A 4DKWA 2I7NA 4FJ5A 4ID5A 1WLJA 3JAMO 3KK7A 4F2RA 1CN2A 3HO1A 4IBNA 1Y64A 3LALA 4H0TB 1XMOK 3KP1A 4M45A 4ELVA 4CF8A 4CEEA 4CZGA 1N4NA 4H0XB 1YI2N 1T1TA 1ATRA 3DXKB 1J54A 5KRTA 3CPWM 2PYLA 1OVQA 1KV0A 1SV5A 4DB3A 3V9WA 4IOCL 5EOYA 4FCYA 1RDBA 2YNHA 1RDDA 4CEAA 3T1HK 1WSJA 2QK9A 3N4QA 3H3OB 1X9MA 4OGCA 4C1NK 1VSMA 2X6NA 1TL3A 3B6PA 4EAHD 3G4SN 5LJVA 3L4IA 3U3YA 1WUAA 2MZ0A 1N34K 2KJAA 3T19A 3S3MA 3WNFA 1OH5A 3GBTA 1KQSM 3GDQA 4DV0K 1BDGA 1XUPO 4ELUA 4JN4A 5BRDA 2G8HA 2P1JA 1DTTA 4WYBA 2HHHK 4B9NA 3SMSA 4CHQA 1NM1A 4LF5K 3QDKA 2AP1A 2PZSA 2F8SA 1T7AA 4FZYA 3LDNA 1EO1A 4Z4IA 4DUYK 3B8AX 2RPIA 1S6QA 4BE0A 3MN7A 4J2EA 4O0IA 2NRXA 3MCPA 3AA5X 2QWRA 4JKGA 3KOXA 4F9OA 3WNGA 4CZJA 4B9LA 3M8QA 4F8RA 3VQ6A 2IVOA 1S3XA 1ASWA 2P9PB 5AR0A 1C0FA 1C0GA 1DKGD 1LCUA 4PKGA 1LOTB 3BZKA 2HVIA 4O5BA 4XH5A 4FJNA 5CY0A 3TSQA 4CJ4A 2QWNA 2NRWA 4FM1A 3TAEA 4IOAL 1T44A 4DQPA 1JLGA 1RT5A 1WBBA 1I6GA 1Z25A 4DTNA 2ZJPL 1GLBG 2BUPA 4CJFA 3OVNA 3CM6A 3MN9A 1BWFO 2ETJA 2UUAK 3OYKA 1E4GT 4FWPA 4WFNL 2A42A 3WQUA 1ITGA 2ZGZA 3V9ZA 5SWMA 3TABA 4BVPA 1U04A 5SZTA 4KKOA 2ZE2A 4DSLA 4DR2K 2XY6A 2LY6A 1OH8A 4LF9K 5KI6A 4WQ4A 3TAPA 4YHHK 3AVGA 1C55A 3LM2A 4CFAA 4B8AB 2NY8X 4KTZA 2NRRA 4CEFA 4KI4A 3VENA 4KHNA 3QNOA 5JMVA 1SN1A 4WFAL 3WEEB 3TARA 3O9SA 1TV6A 1RBVA 3B6OA 4FOIA 3VPZA 4CERA 2RF2A 4YOVA 2O8EB 3OYAA 4CJ5A 4DF8A 4NLBA 4CJQA 1YT3A 2GTDA 3L2UA 3THXA 4JK7A 3AVKA 4N5SA 3MAQA 4KRFA 4DTRA 3SV3A 3VEWA 2G8KA 3C6TA 1NJIO 3OYGA 4H4MA 4MLHA 1TAQA 2HMIA 1NGEA 4BQLA 1GLFO 3ENOA 4IDKA 4OKJA 3KLGA 4CGHA 3E66A 5JLHA 4LFBK 3PSIA 1NK0A 3AVHA 4ISFA 2PFUA 3I56N 4O8UA 2KBKA 4BG9A 3NFAA 4CGGA 3OYCA 3OYEA 3C6UA 4K42A 4BRAA 3KJVA 2ASOA 4YY3K 4CHOA 1BIUA 2UXDK 3AVMA 3RVCA 2LN8A 4DTMA 4IDHA 4CZMA 1IO2A 3IMXA 4PUOA 3QEXA 4JYAK 3QFPA 4E72A 4E89A 1QQMA 3L4QA 2XY5A 2ZD1A 3WXKA 4E1JA 1NK9A 5F0XA 2F8TA 4FSVA 2HHXA 3P31A 3VOVA 3HSTB 4FJ9A 1T0ZA 4FVUA 3HVTA 3TAQA 2MN5A 1A5WA 4RW4A 3M5RA 1KAXA 1XMQK 5M1NA 2P51A 5AJ3K 3ASMA 4PA1A 2QKKA 2WC9A 4DSJA 4KHSA 2OPQA 2F9WA 1X1PA 5AZIA 3L2RA 4K43A 1Q86O 1NGGA 1CLQA 5DM7L 3LZIA 1L3UA 4EP5A 4GVEA 4O44A 3R9PA 5EVZA 5HRNA 4Z4GA 3RRGA 4OJRA 4A2BA 4C8LA 1HJRA 1TKXA 5AFUH 1NGJA 2G8IA 3CF5L 4PL7A 1QHTA 2ZQBA 3DWLA 5C2FA 4ZTJA 3CYGA 2SN3A 3HP9A 3LZJA 4A62A 3K5LA 1QHAA 4FJ7A 2FXUA 2YJEA 4BRPA 1NOZA 3CJ7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1N36 K;  2FBY A;  1YJ9 N;  2IGI A;  1O13 A;  2D4W A;  3WQT A;  2P9I B;  5BRE A;  1IJJ A;  2E2O A;  3MDQ A;  2O8E A;  3VQ9 A;  1RTI A;  5FRN A;  4B9U A;  2HW3 A;  3SBG A;  4DWI A;  3T69 A;  4DTX A;  1ZU3 A;  4EHU A;  4DR1 K;  3F5T A;  3QIN A;  1BCM A;  1RT1 A;  4DSF A;  3AVN A;  3CCJ N;  3PY8 A;  2LJ7 A;  4KH4 A;  3KWG A;  3ATU A;  1SL1 A;  4FLZ A;  3EO3 A;  3CCV N;  2HHV A;  2B5J A;  2QEX N;  3F9M A;  2F7T A;  2Q0U A;  1NRB A;  1UGL A;  2E0H A;  3SLC A;  2D5R A;  1YJW N;  1IG9 A;  2VCP A;  3PX0 A;  4CGF A;  3CJB A;  2N2Q A;  2V51 B;  3DMJ A;  4IEI A;  4KHW A;  3QET A;  3SNN A;  1W9H A;  3AO4 A;  4KTW A;  4M3Z A;  3D0P A;  1Q82 O;  4KI6 A;  4AHC A;  3ZLJ A;  3MX2 A;  1Y97 A;  4FPB A;  3CC7 N;  3O9Q A;  5C15 A;  1QSL A;  1XQS C;  2ITG A;  1RFQ A;  2RKI A;  2A1R A;  4N47 A;  3H08 A;  4ILH A;  1NBW A;  1DTQ A;  3CCL N;  3VGK A;  3ITH A;  5AQH A;  1BCG A;  3N4P A;  3SK3 A;  2P5O A;  2D0A A;  5C42 A;  3HI0 A;  3D7E O;  1WSI A;  3LAN A;  4B9M A;  5I3U A;  1ZBL A;  3WXL A;  3L2W A;  5HRR A;  4E7K A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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