2QWRA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the amppnp intact form
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
molecule tags Chaperone
source organism Bos taurus
total genus 118
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwrA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwrA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwrA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwrA04
3S41A 2AP1A 2IIRA 2A40A 2QM1A 2FXUA 3A0IX 4XH5A 5ELZA 3BP8A 5AQKA 3M1FA 5AQHA 3O1WA 4B1WB 4I6MB 4PKGA 3O6WA 2P9UA 2ZWHA 2GEMA 4B1ZA 5AQQA 5AQOA 2D0PA 3VENA 3W3DA 1D4XA 4BRKA 4H5WA 4H5RA 3GL1A 3I8BA 3RSEB 3G25A 5AFUH 4BRGA 3D2EB 4FWSA 3GDQA 3UKUB 5AQJA 5JMVA 5B8HA 3FZLA 3ULEA 3WXKA 5LJWA 4CBWA 4NO7A 3DJCA 3H46O 1HUXA 4A2BA 1YUWA 1T6CA 4WQ4C 1YVNA 1X9JA 3IMXA 3D2EA 4FOIA 5AQGA 1XUPO 5BN9A 2Q1NA 3IDHA 3SLCA 2CGLA 1NLVA 2A5XA 3HSCA 3H3OB 4BGBA 2E2NA 4K25A 4FPBA 4WQ5A 3QFUA 4DQ8A 4FWNA 3B8AX 5AQTA 3CJ7A 3BF1A 3CQXA 4BC2A 4Y0WA 4IWVA 3ZEUB 4CD1A 3R8EA 4CZIA 3U9ZA 5F1XA 1WOQA 3A8YA 4CI6A 4PL7A 3ZETB 3BEXA 1ZC6A 3WUHA 1NGDA 1NGHA 4E1JA 3UE5A 3EKUA 3U8XA 3ZEUA 1RFQA 4BR4A 2E8AA 3VOVA 4BRQA 4BRIA 4CZKA 3UB5A 4H0TB 4B1YB 3H3NO 4BC4A 5EY4A 3EN9A 4AM7A 4BREA 4M7XA 4H5VA 3ZETA 4CD3A 1MDUB 3CQYA 4F9OA 3HTVA 2V52B 4H0XB 1BA1A 4AM6A 5AZIB 4BR0A 4XH4A 5KQ8A 4CZLA 1V4SA 3GE1A 1JCEA 1BWFO 4BG9A 2P9LA 1P8ZA 4FOEA 1TUYA 4MLHA 1HJOA 4BVPA 4FWQA 1ESVA 3O08A 5LY3A 4B1UB 2YHYA 3VERA 3D2FB 3LDPA 5BRFA 4CZJA 1C0FA 4B1VA 5EXWA 4BC3A 5ADXA 1Y64A 3QDKA 4FPAA 3WXIA 5AR0A 4IZ9A 3QFPA 3AAQA 2Q0RA 2PBDA 2FSJA 4BG8A 5EVZA 2AA4A 4BR2A 3QB0A 3CETA 2D1KA 1GLFO 3CI5A 5AQSA 3ATVA 3QBXA 3VF2A 1R59O 4DB3A 1DKGD 4EIAA 1BUPA 4PKHA 1J6ZA 3DXMA 3HM8A 1HKGA 3VGMA 2ASPA 5AQWA 2QWQA 3VEYA 5FPMA 3VESA 1C0GA 4EAHD 4PKIA 3I33A 1ATNA 3H45C 3CERA 1LCUA 1NGEA 2OANA 3VF6A 4QS8A 1SAZA 1X3MA 1NGJA 5AQMA 2F9WA 1XC3A 1SZ2A 3LL3A 4A62A 5EOYA 5BPMA 4ISFA 1K8KB 3L4IA 2FF3B 4IXCA 3TU5A 4I6MA 4B9QA 1HX1A 3OHRA 2YI1A 4FWLA 3UKRB 3FR0A 3WT0A 2E20A 4BRAA 4BQLA 4QS9A 1EQYA 2W41A 2P9SB 3RSEA 4M63C 3ID8A 3AAPA 3LM9A 2ITMA 4L3QA 3KHYA 3VEWA 2H3GX 4WQ5C 3UKUA 3UKRA 1QZ6A 4FWMA 2GUPA 2QWPA 1HPMA 2KHOA 3H1VX 1TUUA 2CH5A 2P9SA 3VGKA 3EKSA 4BR5A 3L0QA 2ZGZA 2VWBA 5JICA 4IJAA 5AQUA 1U2VB 4BRLA 2ZF5O 4H5NA 5BPNA 5EX5A 3FZMA 3LM2A 4H0VB 3LDNA 3W0LA 2QWRA 3AY9A 1GLLO 1H1VA 1GLJO 3D7EO 3ATUA 2V7ZA 1QQMA 4XEIA 5ADXH 2YCHA 2P9KB 4FO0A 3FZKA 4EHTA 4JD2B 4BC5A 3CJAA 1LOTB 2D0OA 3QBWA 3O8MA 2E2QA 1NGFA 2YHXA 3FFKB 3MDQA 1KXPA 3LDOA 4FWOA 2QXLA 2E1YA 2IVNA 4CJ7A 3C7NB 1ATRA 3WEEB 2NZTA 4IJNA 3KZBA 4MLEA 4O8KA 3CHWA 4BROA 1DEJA 3H6EA 1NMDA 4FL9A 1ZXOA 5BN8A 4JNEA 3LDQA 3M3ZA 3O4WA 4B1XB 4BQZA 3C7NA 2I7NA 1JCFA 3FE1A 2GELA 3ZX0A 5AQXA 3CJBA 4BRPA 4K43A 3JXUA 5AQRA 4RTFD 2NRHA 1NGBA 1NWKA 1T44A 3F9MA 3M6GA 3EL2A 3VF4A 3WQTA 4J8FA 2E2PA 2GWKA 4DHYA 5AZIA 2QW9A 3A5LC 4GNIA 4BRNA 3CJ9A 3CIPA 1G99A 1HKCA 1E4GT 3H1QA 2Q31A 3R6MA 3HI0A 2W40A 4EHUA 2CH6A 2Q97A 5BRDA 3IFRA 3VETA 1BA0A 3C0BA 4KBOA 2P9PB 4BRFA 4C23A 4BRCA 4CZGA 1Z6RA 3D2FA 1GLDG 4BRMA 3LDLA 5KQDA 5LJVA 2Q2RA 3WQUA 4EFHA 4H5TA 4YDUA 3VEVA 2A3ZA 3FGUA 5AQPA 5KPTA 3IUCA 1KAYA 3VEXA 5F2RA 2E88A 4BVOA 4RWTA 1MA9B 3A5MC 3EO3A 4RCHA 2HMPA 5KPZA 5F0XA 3MCPA 2YJEA 4BR7A 2P9NB 2QWNA 2I7PA 1XQSC 4Z94A 3WXLA 1BU6O 2YHWA 1MWMA 3FZFA 2E2OA 2P9UB 3SK3A 2A6AA 4BGAA 4H0OA 3FZHA 3ENHA 4WYBA 5JLHA 1U6ZA 2A41A 2P9NA 4QS7A 3J8AA 5TKYA 1SQKA 5AQYA 5I9EB 2FLOA 3ENOA 3MN7A 5AZJB 5E84A 3A5OC 3HBTA 5AQVA 3MN9A 5BPLA 4FWPA 4K41A 3SJHA 3O1BA 3VEZA 3VEOA 2PAVA 1Z05A 1K8KA 1RGIA 5AQZA 3ULEB 4JHDB 2D4WA 4CZFA 3QMLA 3R9PA 5CE3A 3CJCA 1BOTO 4CZEA 3MK6A 4ISEA 4MO4A 4CZHA 5AZJA 3P4IA 2DPNA 4A61A 3CJ1A 2BUPA 2NLXA 1HLUA 4CZMA 1OKJA 1GLBG 2YJFA 3JS6A 4JAXA 4FSVA 2CGKA 4JHDA 3BF3A 2HF3A 1IJJA 3GBTA 3O5BA 5AQFA 1KAZA 4H03B 2Q0UA 1MWKA 2HOEA 4A2AA 2IVOA 3AARA 4LC9B 3DAWA 3BUZB 3SMPA 2J4RA 1U2VA 2P9IB 4WQ4A 3FLCO 4BRDA 1Q18A 3U4LA 1HKBA 5BR9A 4CBXA 2CGJA 1QQNA 2WUSA 3ZX3A 1GLEG 2F9TA 2P9KA 4HWIA 5FPEA 1V4TA 1WUAA 2EWSA 5AQNA 4JD2A 3TPQA 2P9IA 1NGCA 3O80A 3WXJA 1NM1A 2GWJA 4CBUA 3WEEA 3MN5A 2Q36A 1QQOA 2UYTA 3MMVA 3L6QA 4JN4A 1GLCG 5AFUA 1DGKN 3HZ6A 4HTLA 2A42A 5KPRA 3GG4A 1S3XA 4GY2B 1ATSA 2P9LB 4K42A 4MO5A 5FPDA 2GTDA 1GLAG 2HF4A 3SMSA 1CZAN 2QWOA 1BO5O 1YXQA 1BG3A 1S22A 2ASMA 3DXKB 1YAGA 2QWLA 1ZBSA 3DWLA 3MN6A 1TYQB 4NB4A 4YDUC 1IG8A 3ZX2A 4H0PA 1E4FT 2VYPA 2V7YA 1X3NA 1NGGA 1NBWA 3KVGA 1T6DA 3GOIA 4H0YB 3DXKA 5JLFA 2QWMA 4FWKA 3U9DA 4O5FA 4DCHA 1TYQA 5BRHA 1RDWX 2E1ZA 2FSKA 2ZGYA 2P9PA 3VGLA 1JCGA 2FSNA 3EZWA 4BRHA 5BREA 4FWRA 1BDGA 1QHAA 1QZ5A 3DXMB 1NGAA 2IVPA 1NGIA 4M7YA 2V51B 2FF6A 4XH1A 3VPZA 4BR9A 5AQLA 2BTFA 5AQIA 2ASOA 3A5NC 5E26A 4IO8A 3QICA 1KAXA 4ISGA 4PL8A 5FPNA 2VCPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1D9DA 1ZU3A 4FLYA 1KLNA 3O4QA 2AP1A 4DV5K 1TKTA 3HSTB 2FBVA 4XH5A 4BE7B 5ELZA 3M1FA 1LAWA 4B1WB 1RT5A 5IT9O 2OZSA 4DV1K 2LSNA 3F2KA 1RDUA 1ZBUA 3OYKA 5KGXA 3VENA 3W3DA 2KGQA 4CK3A 3CC4N 1KRPA 1RBRA 3QNOA 1D4XA 4BRKA 3K2PA 2NRWA 1OH7A 3G25A 3LAMA 4LFAK 4E72A 3MXJA 3TR8A 1RBUA 1SN1A 2P51A 3GDQA 5JMVA 1HNXK 3ULEA 1PX9A 4NO7A 2HBMA 3DJCA 1OVYA 3OYIA 4FJIA 1LW0A 4AQYK 4FLXA 4WQ4C 4ZTFA 2Q1NA 3KLEA 1DQ7A 4HUFA 3T1AA 3VQ9A 4AHRA 3AA3A 3OW2M 1NJXA 3IAYA 3QIOA 3TANA 3HPGA 2VGMA 4FPBA 2C1GA 3DMJA 3B8AX 3CJ7A 3BF1A 1I94K 3CQXA 4O44A 4Y0WA 4UY8O 4IWVA 3ZEUB 1JZBA 3HOTA 3CMAN 3U9ZA 4BEBA 4B8CA 1NJIO 3NMUA 1SL1A 1OH8A 5CZ1A 3QEWA 1XMOK 4RW7A 3QESA 3O9RA 1GOAA 4CJEA 5CY0A 4CECA 1ZVEA 4BR4A 3P83D 3VOVA 4BRQA 4H0TB 4B1YB 4M42A 2XHBA 3ZETA 4F9OA 3HTVA 4BWMA 4GV6A 1JL2A 3MX5A 3HPOA 3MAQA 2HHSA 5E41A 3K57A 3BZKA 2KFZA 1J54A 1MYNA 3DYAA 4DLGA 5CR4A 4KAZA 1P8ZA 1HJOA 4DU1A 3TAFA 2UXDK 4DR7K 1IBKK 4O4GA 3KJVA 3TTDA 2D56A 3WNFA 2HHHK 3D2FB 5BRFA 1L4VA 4BC3A 5ADXA 4DWIA 1Y64A 4BE1A 1ASVA 1Y97A 5AR0A 3WXIA 3LZJA 1VSMA 1BHLA 1I3AA 2YNHA 2FSJA 4UAEF 1A5WA 3QB0A 3CETA 5C0YA 3CI5A 1L5UA 1DKGD 1J6ZA 1NK0A 3VGMA 2HHIA 3SNNA 4FK0A 4OPKA 4ELTA 4O5BA 4DV6K 2HB5A 4YOTA 4C8OA 1S1WA 4CJWA 4G9ZA 1PE4A 2UXCK 3H45C 3I33A 2JWLA 2YNFA 3O3HA 1NMNA 1LCUA 1NGEA 4E0DA 3MXMA 3NBPA 5AQMA 3AO5A 3DLKA 3L2RA 4FJXA 1D8YA 2UUCK 3LL3A 2KKZA 3C95A 4ISFA 4IXCA 1K8KB 3TU5A 1WSFA 1ZVGA 5I3UA 5K14A 4BACA 4EZ9A 1C1CA 2KQ2A 3OS1A 3AAPA 2ITMA 3KKRA 2UU9K 3KHYA 4AH9A 1VAZA 1BI4B 4WQ5C 5J2NA 3UKRA 2D0CA 2YILA 4FWMA 2QWPA 3C6AA 1GPSA 2KHOA 1TUUA 4DSIA 2A1RA 2P9SA 3VGKA 4WFNL 3DLRA 4IJAA 1K6YA 1U2VB 1YI2N 1DJTA 4H5NA 3Q7CA 1REVA 4IDHA 4DR6K 3LDNA 3W0LA 2QWRA 4KI6A 4MDBA 3AY9A 3BK3C 1GLLO 1B3CA 4M3ZA 3ATUA 1S1TA 2FBYA 3AV9A 1QQMA 5ADXH 2OTJN 2OCEA 4B08A 1POIA 3TSPA 1IG9A 2G8VA 3CF5L 1NGFA 3FFKB 3MDQA 3NGIA 1KXPA 3NH1A 3LDOA 1T05A 1O13A 2IVNA 4ELUA 4JI8K 3HO1A 4GKJK 2NZTA 1NK8A 4CFBA 5KTQA 4MLEA 1B7DA 4CJUA 1K8AO 3H6EA 5FRNA 4FL9A 3EE8A 3LP2A 3HOSA 4JKGB 1QSYA 1B92A 3LDQA 1T7PA 3CCUN 3O4WA 1HNVA 2I7NA 1JCFA 3FE1A 2RKIA 1WBBA 2PYLA 5AQXA 4H4OA 5AQRA 3SYZA 4RTFD 1NGBA 1T44A 2RE2A 4W5NA 3ZT2A 1SNBA 1YITN 1TKXA 3EYZA 4DTUA 4GW6A 1Q8IA 2GWKA 3HVRA 3ID6A 2E3GA 3OYJA 3ZT1A 3THWA 4Z4HA 1JXBA 1EXQA 3CFOA 4CJVA 3IFRA 3P1GA 3ULDA 1BA0A 3VTHA 4BRFA 3SJJA 4CVNE 4BRCA 1Z6RA 1GLDG 1NK5A 3LDLA 4E7HA 2HBLA 1TAUA 1IV0A 1GOCA 5KQDA 3BZCA 5LJVA 2Q2RA 3WQUA 1Q81O 1ZYVA 2SN3A 3VEVA 4HVJA 4JRPA 5AQPA 4BWJA 2YX6A 3VQBA 3KLFA 5F2RA 2O8EA 2E88A 3EO3A 2R7YA 3MXIA 2IAJA 1D5AA 3V1RA 4R79A 2YHWA 4HHFA 4DS5A 4B9NA 1FKOA 3VA3A 3FZFA 2E2OA 2P9UB 4C8MA 2NUBA 4BGAA 3ENHA 5T7BA 5JLHA 1HYZA 3J8AA 1SQKA 4DF8A 2X6SA 1JLAA 4CJFA 3KD1E 4FWPA 3SJHA 2ZE2A 3AA2A 4LSLA 3O1BA 3OJUA 3KOWA 2PAVA 5JS2A 5BR8K 2HMIA 5AQZA 2G8WA 4JHDB 2D4WA 3QMLA 3WNEA 4F3TA 5CE3A 3CJCA 4DFPA 3G0ZA 3CW4A 3HRGA 1KTQA 1VNAA 3CJ1A 3C6UA 1HLUA 1Q82O 1W7AA 4KB1A 1C6VA 3JS6A 2F8TA 4JI4K 4W5OA 4QAGA 2KBJA 2GL1A 3P31A 2XY5A 5AQFA 2QA4N 3KC6A 3AVBA 3SBTA 1VQON 2YKNA 4GVMA 3K5MA 4A2AA 5GINA 5FRMA 1ZYWA 1NRBA 4N76A 4KO0A 5J2PA 1OVQA 4FLWA 4ZHRA 3AO3A 4WQ4A 4B9TA 4BRDA 2UXBK 3U6FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1D9D A;  1ZU3 A;  4FLY A;  1KLN A;  3O4Q A;  2AP1 A;  4DV5 K;  1TKT A;  3HST B;  2FBV A;  4XH5 A;  4BE7 B;  5ELZ A;  3M1F A;  1LAW A;  4B1W B;  1RT5 A;  5IT9 O;  2OZS A;  4DV1 K;  2LSN A;  3F2K A;  1RDU A;  1ZBU A;  3OYK A;  5KGX A;  3VEN A;  3W3D A;  2KGQ A;  4CK3 A;  3CC4 N;  1KRP A;  1RBR A;  3QNO A;  1D4X A;  4BRK A;  3K2P A;  2NRW A;  1OH7 A;  3G25 A;  3LAM A;  4LFA K;  4E72 A;  3MXJ A;  3TR8 A;  1RBU A;  1SN1 A;  2P51 A;  3GDQ A;  5JMV A;  1HNX K;  3ULE A;  1PX9 A;  4NO7 A;  2HBM A;  3DJC A;  1OVY A;  3OYI A;  4FJI A;  1LW0 A;  4AQY K;  4FLX A;  4WQ4 C;  4ZTF A;  2Q1N A;  3KLE A;  1DQ7 A;  4HUF A;  3T1A A;  3VQ9 A;  4AHR A;  3AA3 A;  3OW2 M;  1NJX A;  3IAY A;  3QIO A;  3TAN A;  3HPG A;  2VGM A;  4FPB A;  2C1G A;  3DMJ A;  3B8A X;  3CJ7 A;  3BF1 A;  1I94 K;  3CQX A;  4O44 A;  4Y0W A;  4UY8 O;  4IWV A;  3ZEU B;  1JZB A;  3HOT A;  3CMA N;  3U9Z A;  4BEB A;  4B8C A;  1NJI O;  3NMU A;  1SL1 A;  1OH8 A;  5CZ1 A;  3QEW A;  1XMO K;  4RW7 A;  3QES A;  3O9R A;  1GOA A;  4CJE A;  5CY0 A;  4CEC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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