2QWRA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the amppnp intact form
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
molecule tags Chaperone
source organism Bos taurus
total genus 118
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwrA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwrA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwrA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwrA04
3QICA 2V52B 1TYQB 3M1FA 3O8MA 1V4TA 1E4FT 3VEZA 2ZGZA 5ADXA 5JLHA 3IFRA 1X3MA 1HUXA 4IJAA 2CH6A 3QBXA 3C0BA 1NGIA 1QQMA 1EQYA 1K8KA 4FWRA 4K43A 3CETA 3DXKB 1DGKN 3RSEB 5AQUA 2I7NA 3EN9A 3WQTA 5AQSA 3IMXA 2P9NA 2Q97A 1NGBA 4B1WB 4H5NA 3TU5A 2E1ZA 3L6QA 3O08A 1KAZA 3FZMA 4BRPA 1GLBG 4CZEA 3QBWA 5EY4A 5AQTA 3H1QA 3U9DA 2QXLA 3C7NA 4FWQA 4RCHA 2P9UB 2V7YA 3FZKA 3ZEUA 3QFPA 4BVPA 3SLCA 4CBXA 1LCUA 4YDUC 1NGFA 1HKCA 1NLVA 4EIAA 1JCFA 1ESVA 5BRFA 3QFUA 5KPZA 4H0OA 3ZX2A 4Z94A 4FWKA 5AQRA 5AZIB 1LOTB 4BG8A 1NWKA 3DXMB 2Q0UA 3CJ9A 5AZJA 2A41A 1GLLO 2QWQA 3A0IX 2P9IB 3VEWA 2PBDA 3A5MC 4B1YB 3VESA 4MO4A 3G25A 4WYBA 3S41A 4H0TB 4FWPA 1H1VA 5I9EB 1T6DA 1NGJA 3WEEA 3UKRB 3AY9A 4FWOA 3D2EA 5LJVA 2P9KA 4H5RA 4FOIA 1T6CA 3WXKA 5LY3A 1YUWA 1X3NA 1X9JA 4JD2B 4JHDA 4CZKA 2GELA 1Z05A 3H1VX 2E88A 1MWMA 3EZWA 3CJCA 4M63C 3WXIA 3LDPA 2CH5A 5BN8A 2FF3B 2FXUA 3CJ1A 1SQKA 2FSNA 1GLAG 3ULEA 3O80A 4B1XB 5FPDA 5F2RA 1YVNA 5FPNA 2NLXA 2E8AA 1V4SA 1OKJA 3CERA 3FZLA 5AQJA 1NGAA 3AARA 3QMLA 4GY2B 3MMVA 1Q18A 1ZXOA 4WQ5C 3VEVA 4BRAA 5BN9A 2NRHA 2QWOA 4JN4A 2CGJA 2E1YA 2QW9A 3B8AX 3VOVA 4BR7A 2P9SA 1TYQA 1SAZA 5JICA 1E4GT 4QS8A 1BO5O 3BF3A 2IIRA 1GLCG 2YCHA 2P9PA 3VEYA 3FZFA 4IWVA 4YDUA 4BRFA 2HMPA 5EVZA 5ADXH 2KHOA 5FPEA 1RFQA 2CGLA 3H3NO 4CZGA 5KQDA 3FLCO 4EHUA 3DXKA 4I6MB 4WQ4C 4QS9A 5BPLA 5AR0A 3ZETB 1YAGA 2ASMA 5AQWA 1U2VB 3O4WA 1BUPA 3M3ZA 3CI5A 4BC4A 1GLFO 4EAHD 5AQVA 4IZ9A 1U6ZA 5FPMA 3LDLA 3W0LA 2P9LB 4B9QA 3SMPA 1QHAA 2Q1NA 3WXJA 3UKUA 4FWSA 3VGKA 3FZHA 3LDQA 1ZC6A 2D1KA 1NBWA 4GNIA 5EXWA 3ENOA 3VENA 4BREA 3DWLA 1HKBA 4PKGA 3OHRA 1P8ZA 1ATNA 1YXQA 3M6GA 4J8FA 3O6WA 3WT0A 5AZIA 1JCGA 4BRKA 4ISGA 3WUHA 4BRCA 3DXMA 2A3ZA 4BQLA 3DJCA 1NMDA 3VETA 2P9IA 1S3XA 4BVOA 2PAVA 3LDOA 4XEIA 4XH5A 3U8XA 5AQLA 3VF6A 4WQ5A 5B8HA 2IVOA 1C0FA 1QQOA 2GEMA 3IDHA 4BROA 4B1UB 3R6MA 4FWNA 3VERA 4JAXA 4BR0A 5AQIA 3H45C 3VF4A 4CZFA 3EKSA 4PKIA 1BA0A 3VPZA 4DCHA 1Z6RA 2Q2RA 1HLUA 4L3QA 1ATSA 1HKGA 2FSJA 5AQQA 3D2FA 3IUCA 4FWMA 4NB4A 2P9NB 4CD1A 2QWLA 4H0XB 3F9MA 3H3OB 3L4IA 2YHYA 3UE5A 3O1BA 2J4RA 5AQGA 5KPRA 3JXUA 4AM7A 2ZGYA 2VCPA 3C7NB 2E2QA 3GBTA 3R8EA 3ZX0A 3ZEUB 1RGIA 2HF3A 2AP1A 1HPMA 2YI1A 3BUZB 4C23A 3BEXA 3LDNA 1QZ6A 1G99A 1TUUA 4H0YB 3SMSA 4CBUA 1GLEG 1D4XA 2E20A 4IO8A 2A40A 5BPMA 2GWJA 3A5NC 4CBWA 4PL7A 4HTLA 2QWPA 3CQXA 2ASOA 2ZWHA 3LL3A 1JCEA 4BGBA 3I33A 5AZJB 4A2AA 4BC2A 1GLJO 1MDUB 3KZBA 3EL2A 5ELZA 3AAQA 2D4WA 4QS7A 1BA1A 2GWKA 4BRNA 4M7XA 4K25A 3P4IA 5KPTA 1RDWX 1XUPO 3MK6A 4BR5A 3D2EB 2I7PA 2P9KB 5BREA 3MDQA 3A8YA 1WUAA 3A5LC 3JS6A 4JNEA 4FL9A 3EO3A 4BRHA 1BDGA 1BU6O 4JHDB 4CZHA 2A42A 4DHYA 5AQFA 5F1XA 5AQYA 4RWTA 3GE1A 2H3GX 4LC9B 4B1ZA 2OANA 2VYPA 3CJ7A 1C0GA 3AAPA 4BR2A 5TKYA 4BRGA 3SK3A 3W3DA 3RSEA 1SZ2A 5AQHA 3KVGA 4FWLA 3LM2A 4BRDA 3CIPA 1NGCA 4CI6A 3A5OC 4CZMA 4FOEA 5AFUA 1IG8A 5BPNA 1MWKA 4CZJA 4ISEA 1KAXA 2E2OA 1QQNA 5AQOA 3CJBA 2P9SB 2FLOA 2VWBA 4F9OA 2A5XA 2P9UA 4ISFA 1ATRA 1T44A 3VEOA 5AQMA 2UYTA 2P9PB 3ZX3A 4H5TA 1TUYA 4PKHA 4O8KA 2YJEA 2IVPA 3TPQA 2BUPA 4H0PA 4M7YA 4BRIA 3MN7A 2DPNA 3FR0A 3DAWA 1HX1A 4H5WA 1KXPA 5E26A 4BC3A 2QM1A 4CJ7A 3ENHA 3HI0A 2YJFA 1XQSC 2HOEA 2ZF5O 3HM8A 3QDKA 1NGEA 3VGMA 3U4LA 4CD3A 4EFHA 3WXLA 4H03B 1KAYA 3CJAA 4KBOA 3UB5A 4E1JA 3UKRA 5AQXA 1XC3A 4PL8A 1K8KB 3VF2A 5F0XA 4A61A 3R9PA 4DQ8A 5AQZA 3GL1A 4H0VB 4DB3A 1HJOA 2V51B 3ATVA 3UKUB 4IXCA 4EHTA 2QWNA 2QWRA 5EX5A 1BG3A 4O5FA 5BRDA 1NM1A 3FE1A 4JD2A 5CE3A 3U9ZA 4AM6A 4A62A 1R59O 3L0QA 1J6ZA 3QB0A 4CZIA 4RTFD 2YHXA 3I8BA 3MN5A 3H6EA 4XH1A 4BR4A 1S22A 3FGUA 3EKUA 2F9TA 1NGDA 2ASPA 3CHWA 3HBTA 2QWMA 4K42A 5AQNA 4MLEA 4WQ4A 5BR9A 5KQ8A 3WQUA 5JMVA 2Q31A 1CZAN 3BP8A 1ZBSA 2D0PA 4BRQA 5AQKA 5AQPA 2EWSA 2AA4A 3GOIA 5JLFA 2E2PA 3CQYA 2FSKA 4NO7A 4IJNA 3O1WA 4BRLA 3J8AA 1WOQA 3MN9A 4MLHA 2WUSA 4Y0WA 2E2NA 2GUPA 3D7EO 1NGHA 3FFKB 3D2FB 2CGKA 2NZTA 3LM9A 2YHWA 2HF4A 3HTVA 3BF1A 4BGAA 3GG4A 2D0OA 4XH4A 4BR9A 4BRMA 3VEXA 1NGGA 1IJJA 3WEEB 3GDQA 4I6MA 5BRHA 2BTFA 2IVNA 4FPAA 3KHYA 4FSVA 2Q36A 3VGLA 3HZ6A 4CZLA 1BOTO 4FPBA 3ZETA 2V7ZA 3MCPA 1U2VA 3H46O 4MO5A 4HWIA 4B1VA 5LJWA 2GTDA 3SJHA 4BG9A 3ATUA 2P9LA 3O5BA 1GLDG 1MA9B 3HSCA 3ULEB 4H5VA 5AFUH 2Q0RA 4BQZA 2W41A 1DKGD 2W40A 2A6AA 1QZ5A 3ID8A 5EOYA 3MN6A 4FO0A 4A2BA 2F9WA 4K41A 5E84A 4BC5A 1BWFO 1Y64A 1DEJA 2FF6A 2ITMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K58A 3QICA 4AB0A 2HHQA 1TYQB 2LKBA 3OBWA 2O4IA 2G8VA 1XNQK 4FK0A 3VEZA 1NG9A 3IFRA 4BE1A 1HUXA 1IG9A 1EQYA 1K8KA 2BH1A 3TAQA 3DXKB 1TAQA 4JI8K 1Z26A 3CCVN 3LAKA 1N5YA 1BMRA 3WQTA 2O8DA 1XHZA 3IMXA 2P9NA 1HYVA 2Q97A 3KK7A 4JI4K 3I55N 2RPIA 4F3TA 2PYJA 3ZT1A 4CZEA 1LQHA 4CF9A 1UA1A 3V4IA 4LF5K 4EP5A 3H1QA 3C7NA 4CHYA 2IOCA 4KH5A 4KAZA 1IBKK 5JS1A 3ZEUA 1TK8A 1NRAA 3EY1A 4BDZA 1HNWK 3BZCA 2BDPA 3V9UA 3AA2A 1SNBA 1NLVA 1ESVA 5BRFA 4LF4K 5DMRA 4FWKA 2ZJQL 5AQRA 5T7BA 4N41A 4OJRA 1X9WA 3G6EN 5AZJA 1ZBIA 1TGOA 3O3FA 1OMYA 3A5MC 2VWJA 4HUEA 3G25A 3OYDA 3THXA 4JEPA 4FWPA 3AO3A 2E3FA 1T6DA 1NH5A 2E2FA 1T7EA 3G4SN 4H4MA 2OTJN 4DG1A 4FJKA 4KH4A 3K59A 4KI4A 2GELA 1Z05A 2XY7A 3THYB 5BN8A 2FXUA 4ILHA 4CGDA 1D9DA 1GLAG 1LWEA 3O80A 5FPDA 5F2RA 4OLBA 3WNEA 3KK2A 2E8AA 1HNVA 3KLFA 2XRIA 4IG0A 1T1TA 1VQON 4IBNA 4GY2B 3MMVA 3HJFA 1NOYA 4WQ5C 1SS6A 3VQEA 4U7BA 4BRAA 4CGJA 3UIQA 2IDOA 4IKFA 3BGRA 1N36K 3CF5L 1J5OA 1ZBLA 4CFCA 2PFUA 2ZQBA 3PIOL 3PX0A 4FZZA 4QS8A 2ASCA 4FZXC 3KP1A 3BF3A 1SN1A 2O8CA 2P9PA 1HYZA 1LW2A 3ZSQA 4IWVA 2F4VK 1NOZA 1YHQN 4HCBA 4FLZA 3CC4N 4E72A 2WOMA 2KJAA 1RDDA 2KHOA 2O8BA 5LL6Z 2CGLA 3HK2A 4JKHA 3DRSA 4I6MB 3PV8A 5J2QA 4O0JA 1A5WA 4WQ4C 5BPLA 4OPKA 1D8YA 5AQWA 1NK4A 1U2VB 3V1RA 2YKNA 4EAHD 1GLFO 1N8RO 3QIOA 5FPMA 3KWGA 1B9DA 4ZTFA 4LFCK 2E4LA 3C6HA 3LDQA 1ZYWA 2D1KA 4HHFA 1WSIA 2N66A 4B9VA 1C0TA 1N33K 2UXBK 4CJ3A 4DFKA 2QK9A 1T05A 3S9HA 1YXQA 4FXDA 3M6GA 4J8FA 2O4GA 1VQ6N 4CJ4A 3P5JA 3M8PA 3DXMA 2A3ZA 4DTJA 3R2VA 1RBUA 3VETA 1NMDA 1B3CA 1DT9A 2LSNA 3LDOA 4KPYA 3VF6A 5GIPA 2IVOA 2QA4N 3DMJA 1QQOA 4N56A 2HHVA 1OZZA 4DV6K 4CJUA 4Z4CA 4Z4GA 4PKIA 5KK4A 2G8IA 1Z6RA 1YTAA 4L3QA 1ZVGA 1U04A 4DFMA 3SUQA 3D2FA 1YJWN 1T03A 4FJIA 1J53A 2DFEA 3V1QA 4I9QA 2UUBK 3H3OB 4B8AB 5KTQA 5GADP 3L4IA 1NK6A 3V9WA 2UUCK 3TWHA 1BI4A 2LN8A 1WB9A 2RN2A 2B4JA 3T1AA 3R8EA 4Q0BA 2VG7A 1KCFA 1NK5A 2DFHA 2WTUA 2Z1HA 4FLXA 1NJXA 1YIJN 5JVGL 1G99A 2Z1IA 2A1RA 1GLEG 2E20A 2A40A 5BPMA 1WLJA 3A5NC 3AVHA 4DR5K 3F9KA 5SWMA 3TAMA 3M8SA 4BGBA 4BC2A 3L56A 2G8WA 3NH2A 3MXMA 1L5UA 1C0MA 3CC2N 3AO5A 3DLLL 2GWKA 3O3GA 4BRNA 4JRQA 4BWJA 1B7DA 4CJPA 4JKDA 1ASWA 4ID1A 4FJHA 4K25A 2F7TA 3D2EB 1J5EK 1JXBA 3CMAN 3A8YA 4JK9A 3SPZA 1WUAA 5HLFA 4E0DA 3JS6A 3DYAA 2D0BA 1ZBHA 4DSIA 3OYGA 1JLFA 2GX9A 1VAZA 4JI0K 4DHYA 1KLNA 2KTQA 4LC9B 4NYNA 1FKPA 2OANA 3CJ7A 5DM7L 1SL1A 5TKYA 2E6LA 4RW4A 1XNRK 1CXUA 2LY5A 1VK0A 3SF4D 1JLCA 3O9RA 1HR0K 3VQCA 4J2EA 2NRRA 1U49A 4IOXA 4OO1J 3OS0A 4DU4A 3OS1A 4BRDA 1T7AA 1ZUTA 1WBBA 3NF9A 3A5OC 4CZMA 4FOEA 5AFUA 3RMBA 1VSJA 5BPNA 4CZJA 4ISEA 1FH3A 1RTJA 1T7BA 2E2OA 4DU3A 3ITHA 2YIPA 2G8KA 4ISFA 1ATRA 1PX9A 1G15A 2UYTA 2GMOA 4KO0A 4N47A 3QEPA 3KHWA 1I3AA 2E0HA 3DRPA 4YOTA 2YJEA 4DR6K 1KLMA 3VA3A 1JL1A 4H0PA 4ELVA 4M7YA 2QTDA 3THVA 5CHIA 4W5OA 5C10A 4BEBA 3CMEN 4CJ7A 2MZ0A 3ENHA 3HI0A 2YJFA 1TAUA 1OH8A 3HPHA 4X65K 2ZF5O 3U4LA 4H03B 4LF6K 3MWTA 1T7PA 1KFDA 1K8KB 3VF2A 3M8QA 4DQ8A 2HHSA 1BQMA 3ATVA 3UKUB 4EHTA 2LT8A 2QWNA 1VNBA 4I2QA 4AM6A 4YNQA 3L0QA 5HRNA 3E7RL 3THYA 2YHXA 1W0HA 4KTQA 1S22A 1C55A 3FGUA 4C8MA 1QSSA 3LZJA 4V1DC 3OYJA 3HBTA 4K8ZA 3WQUA 5JMVA 4LSNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3K58 A;  3QIC A;  4AB0 A;  2HHQ A;  1TYQ B;  2LKB A;  3OBW A;  2O4I A;  2G8V A;  1XNQ K;  4FK0 A;  3VEZ A;  1NG9 A;  3IFR A;  4BE1 A;  1HUX A;  1IG9 A;  1EQY A;  1K8K A;  2BH1 A;  3TAQ A;  3DXK B;  1TAQ A;  4JI8 K;  1Z26 A;  3CCV N;  3LAK A;  1N5Y A;  1BMR A;  3WQT A;  2O8D A;  1XHZ A;  3IMX A;  2P9N A;  1HYV A;  2Q97 A;  3KK7 A;  4JI4 K;  3I55 N;  2RPI A;  4F3T A;  2PYJ A;  3ZT1 A;  4CZE A;  1LQH A;  4CF9 A;  1UA1 A;  3V4I A;  4LF5 K;  4EP5 A;  3H1Q A;  3C7N A;  4CHY A;  2IOC A;  4KH5 A;  4KAZ A;  1IBK K;  5JS1 A;  3ZEU A;  1TK8 A;  1NRA A;  3EY1 A;  4BDZ A;  1HNW K;  3BZC A;  2BDP A;  3V9U A;  3AA2 A;  1SNB A;  1NLV A;  1ESV A;  5BRF A;  4LF4 K;  5DMR A;  4FWK A;  2ZJQ L;  5AQR A;  5T7B A;  4N41 A;  4OJR A;  1X9W A;  3G6E N;  5AZJ A;  1ZBI A;  1TGO A;  3O3F A;  1OMY A;  3A5M C;  2VWJ A;  4HUE A;  3G25 A;  3OYD A;  3THX A;  4JEP A;  4FWP A;  3AO3 A;  2E3F A;  1T6D A;  1NH5 A;  2E2F A;  1T7E A;  3G4S N;  4H4M A;  2OTJ N;  4DG1 A;  4FJK A;  4KH4 A;  3K59 A;  4KI4 A;  2GEL A;  1Z05 A;  2XY7 A; 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