2V7ZA

Crystal structure of the 70-kda heat shock cognate protein from rattus norvegicus in post-atp hydrolysis state
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
SKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQAAKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVRAERNVLIFDLGGGTFDVSILTTEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of the 70-kDa Heat Shock Proteins in Domain Disjoining Conformation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
molecule tags Chaperone
source organism Rattus norvegicus
total genus 97
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2v7zA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2v7zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2v7zA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2v7zA04
2Q0UA 3QFUA 1E4FT 5F2RA 3CI5A 1GLDG 4DQ8A 1LCUA 2VYPA 3ATUA 1HKCA 2P9KB 4QS9A 2YHYA 4H0PA 2H3GX 1OKJA 4BG8A 3A8YA 1HUXA 4K43A 5LY3A 3M6GA 3ATVA 4BREA 2EWSA 3DXKA 4XH1A 4QS7A 1MWKA 2V52B 2GELA 3AARA 3HZ6A 3O6WA 4JAXA 3WXKA 3JS6A 4K41A 5KQDA 2CH6A 3FE1A 2QWQA 4ISEA 2KHOA 1C0GA 4LC9B 1MDUB 5ADXH 4FOIA 5BR9A 2FSNA 4CZEA 1HKGA 1WUAA 3KZBA 3TPQA 1EQYA 5EX5A 4BR5A 4WQ4C 4H5RA 2V7YA 5E84A 3AAQA 3D2EA 4CZJA 4FWSA 4QS8A 4H5VA 1IJJA 1RDWX 3B8AX 4AM7A 3VEOA 3ZX0A 2I7PA 5AQMA 5AQUA 4CI6A 3GG4A 1NM1A 3C0BA 4CZLA 4BG9A 1ZC6A 2GUPA 2P9SB 4HTLA 2QWRA 1BWFO 1IG8A 1WOQA 3O1BA 3RSEB 1NLVA 5BRDA 3VOVA 4FOEA 4JD2A 3L6QA 1JCEA 2W40A 2YJFA 2J4RA 4B1UB 4CZGA 4CBUA 1P8ZA 3U4LA 1QQMA 4BQLA 5LJVA 4IJNA 4EHUA 3DJCA 1KAYA 4PKHA 3CERA 4BRAA 1MWMA 5FPDA 2W41A 4H0TB 2P9IB 1BA1A 1GLLO 5EVZA 2ITMA 3SJHA 4PL7A 3U9ZA 4A61A 2YHWA 1T6DA 3O08A 2HOEA 1JCGA 2D4WA 1J6ZA 4CJ7A 4CBXA 3HI0A 5AQSA 4FL9A 5JLHA 3WXJA 3UKUB 3I33A 5BPMA 3VGKA 2YHXA 5F1XA 5AQGA 4A2BA 4WYBA 3ZETB 3D2EB 4BRIA 1BG3A 3WXLA 3QB0A 1QZ5A 4FPBA 3O1WA 2DPNA 3LDLA 2FF6A 1Z05A 1DEJA 2P9LB 3FZFA 4JN4A 1TUUA 2IVNA 2NZTA 2P9PA 2QWOA 3QICA 3A5NC 1YXQA 4FSVA 1HLUA 3EKUA 4A2AA 2E1YA 1GLJO 3H3OB 1ATSA 2F9WA 3CQYA 4CD3A 3GL1A 3RSEA 4KBOA 1G99A 3A5OC 2F9TA 3UB5A 1RFQA 3C7NB 1ZXOA 5ELZA 3SK3A 1NWKA 4M63C 5KPTA 3S41A 4BRCA 4BQZA 1ESVA 4BRFA 1NGAA 5AQRA 3CHWA 1BU6O 1YAGA 1KAXA 3LDNA 1U2VB 4H03B 2P9IA 3R8EA 3CQXA 3H1QA 3O80A 5BN8A 4ISGA 4BGAA 3CJAA 3GOIA 3MN5A 4FWRA 1S22A 1TUYA 5BPLA 3M1FA 1JCFA 1NGIA 5EXWA 3D2FB 3ZX2A 1HJOA 4CZFA 3CJ7A 3ID8A 3FZKA 3UKUA 1U6ZA 3MK6A 4BC4A 4O8KA 3FZLA 2ASOA 4I6MA 1BA0A 3MN6A 3ZETA 4BR2A 1Y64A 5AZIA 2ZF5O 3O4WA 4BR9A 4IZ9A 4NB4A 2ZWHA 2Q1NA 4BC2A 2A40A 2GWKA 2YJEA 2QWLA 2V7ZA 3W3DA 2QWPA 3DWLA 2P9PB 3LL3A 3JXUA 4EIAA 4BR7A 1GLEG 5AFUH 3VGMA 4BC5A 2P9LA 3L0QA 2D0PA 3BEXA 3HTVA 4BVPA 4CD1A 2YI1A 1HPMA 1S3XA 1DGKN 2AA4A 2D0OA 3WQTA 3L4IA 1SAZA 1QQOA 4GNIA 5AR0A 4FWNA 2FSKA 2A3ZA 3D7EO 3W0LA 2QM1A 2A6AA 3ZX3A 3AY9A 1XUPO 3H45C 1NBWA 3QMLA 4CBWA 3C7NA 5AQKA 3KVGA 4BVOA 4BRMA 5KPZA 2Q97A 3A0IX 1MA9B 3VESA 3SMPA 4M7XA 5BREA 3I8BA 3SLCA 1KXPA 2AP1A 5AQVA 4RCHA 4WQ5A 1BUPA 1U2VA 4BRLA 4CZKA 2NLXA 2Q0RA 5BPNA 1TYQA 3IUCA 3MN7A 4MLHA 4FWLA 4BRKA 3VPZA 1BDGA 5AQXA 4H5NA 3EL2A 4PKIA 1QZ6A 3D2FA 5AQNA 5AQZA 3A5LC 5B8HA 3VEYA 5BRFA 3VGLA 4I6MB 2IVPA 3VEVA 5AZIB 3LDPA 2E88A 3BUZB 3WXIA 3TU5A 2HF3A 4BR4A 1GLCG 2Q31A 2CGLA 4FPAA 4EAHD 2P9NB 1NGHA 1BO5O 1T6CA 3EZWA 3CIPA 2D1KA 2P9UB 2HF4A 4CZIA 3G25A 2VCPA 1HX1A 4IWVA 2PBDA 3SMSA 5AQOA 3R9PA 3ULEB 1BOTO 1DKGD 1ZBSA 4J8FA 1D4XA 4F9OA 2NRHA 1KAZA 5ADXA 3WQUA 3M3ZA 4B1XB 3VEZA 4EFHA 1RGIA 1SQKA 5AQIA 5AQJA 2PAVA 2E1ZA 1QHAA 3DAWA 1NGJA 2Q2RA 3CJBA 4YDUA 4K25A 5AQTA 1K8KB 5I9EB 5TKYA 5JMVA 4Y0WA 4FWMA 2GEMA 3EKSA 5JICA 5JLFA 3A5MC 3BF1A 1NMDA 4IJAA 1NGBA 4WQ5C 1HKBA 3VEWA 1TYQB 4CZHA 3MDQA 4M7YA 3CJ9A 1GLBG 2A41A 3P4IA 5AQPA 3QBXA 1X9JA 4E1JA 1GLFO 2V51B 3QDKA 1CZAN 4B1WB 4JHDA 5BN9A 3HM8A 3LM2A 3CETA 2HMPA 4L3QA 3EN9A 5AQWA 4B1YB 2GTDA 3H3NO 4XH5A 4FWOA 3VF2A 2WUSA 3DXMB 4Z94A 5AQLA 3CJCA 2UYTA 2YCHA 1V4SA 3ZEUB 1YVNA 4BGBA 4NO7A 3VENA 2P9NA 5FPMA 4EHTA 3WEEA 2P9UA 4IO8A 3AAPA 3LM9A 5FPEA 3WT0A 3ULEA 1C0FA 3H1VX 3FZHA 1X3NA 2QWNA 4PL8A 5AQQA 5EOYA 1ATRA 2E2QA 3O8MA 4B1ZA 3MN9A 3BF3A 3GE1A 4MLEA 1LOTB 2A42A 1R59O 2VWBA 1E4GT 4YDUC 2CH5A 1NGDA 5LJWA 3HBTA 3UKRB 1X3MA 2OANA 1XC3A 1K8KA 3VF6A 3UE5A 4HWIA 3HSCA 2QWMA 4B1VA 5AZJB 1GLAG 4H5TA 3LDOA 2E20A 5EY4A 5KPRA 4O5FA 2I7NA 4RTFD 4H5WA 1T44A 5CE3A 5AQHA 4CZMA 4BR0A 3FR0A 3IDHA 4JHDB 4MO4A 4MO5A 4K42A 4C23A 3EO3A 5F0XA 3FFKB 3R6MA 3MMVA 5AQYA 2ZGZA 4IXCA 3IMXA 1QQNA 2FF3B 3QFPA 2P9KA 3DXKB 4B9QA 2IVOA 3VEXA 3MCPA 2A5XA 1NGCA 4H0VB 2QW9A 3BP8A 3J8AA 2FXUA 4DCHA 3DXMA 3GBTA 2ASMA 3VETA 3WEEB 3GDQA 1NGGA 2CGJA 3QBWA 3U8XA 3ZEUA 4DHYA 3ENOA 3FZMA 2E8AA 4BRDA 1NGFA 2GWJA 5BRHA 3VF4A 4AM6A 3VERA 4PKGA 2IIRA 2Q36A 2E2OA 3FGUA 1YUWA 2ASPA 4JNEA 1Z6RA 4FWQA 4FWKA 1NGEA 4H0YB 4WQ4A 3OHRA 2CGKA 2FSJA 1ATNA 5FPNA 2E2PA 2QXLA 3KHYA 4BC3A 4FO0A 1H1VA 3CJ1A 3LDQA 4BRHA 4BRPA 3WUHA 3H46O 3UKRA 2BUPA 5KQ8A 4FWPA 4BRNA 5AFUA 4A62A 3O5BA 3H6EA 2P9SA 4H0XB 4H0OA 4DB3A 3ENHA 4JD2B 1SZ2A 4ISFA 4GY2B 1Q18A 2E2NA 3F9MA 5AQFA 3FLCO 2BTFA 5AZJA 3U9DA 5E26A 4BROA 4BRGA 2ZGYA 1XQSC 4BRQA 3IFRA 4XH4A 4XEIA 4RWTA 2FLOA 1V4TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Q0UA 4CEEA 5F2RA 3HPHA 1NRAA 3KLHA 1VHXA 2UU9K 1HUXA 4AHTA 1X9MA 4ELUA 1WSHA 2HBJA 1N33K 1ZBUA 5C10A 3PO4A 5HRNA 4CFCA 3DXKA 1WNSA 4QS7A 2V52B 1NJXA 2GELA 3NVMA 3JS6A 3NGIA 5JENA 4DS4A 1KFDA 2KHOA 1KFSA 1C0GA 1KTQA 5HROA 1RTHA 4A5AA 5BR9A 2YILA 1WUAA 3KZBA 3AGRA 3MWTA 4IFVA 4NCGA 3D2EA 4CZJA 3M5RA 4MDBA 4FWSA 1RDWX 4KFBA 1GPTA 3ZX0A 4X65K 4OJRA 1EETA 1RTIA 2IS3A 5AQMA 4CI6A 1FH3A 3P1GA 5A2QO 1C1AA 3C0BA 4KB0A 3K59A 1IH7A 2P9SB 3VQ4A 2FC0A 3O1BA 4CEQA 1NLVA 3SQ2A 3EZ5A 4JD2A 1JCEA 2J4RA 4CBUA 3TAQA 4IOXA 2XY7A 4CHNA 2K35A 4V19S 4BE1A 4B9SA 4DTPA 4DFMA 1B3CA 3CYGA 2GBZA 1JLGA 4R79A 3EE8A 5FPDA 2W41A 1E3MA 4F2RA 1GLLO 4PL7A 2F96A 1KCFA 4FJIA 1J6ZA 3QEPA 4EP4A 3HI0A 3SQ4A 1L3VA 4B8AB 4IKFA 2FBYA 5JLHA 5DM6L 2QEXN 5BPMA 3I0SA 5DMRA 4WFAL 3TTDA 3OTOK 4FJNA 4ILGB 4A2BA 4WCEL 3TAFA 3TAEA 4AEIA 4CE9A 4GKKK 3RR8A 5J2NA 4FPBA 4JK9A 3OYNA 2FF6A 1YJWN 3MEEA 3TANA 4KB1A 1C1CA 3TABA 2ZE2A 1BMRA 2IVNA 4E72A 2NZTA 2QWOA 3CM5A 2KPYA 3LWMA 1VQ6N 2RF2A 3A5NC 3DLBA 3DRPA 3SQ1A 4FJ5A 3KWIA 1VQ7N 4CK1A 4GKJK 1W2BM 3T1HK 1GOCA 3TAMA 1RFQA 4E0DA 5SWMA 3U3YA 2JLEA 3ZCMA 3O4QA 5EU7A 4ILJA 4BRCA 3K5MA 4ZHRA 4JK8A 5BR8K 1ESVA 1ILYA 1WSGA 5AQRA 1BU6O 3LDNA 4F3OA 3VQAA 1T7EA 4DQQA 3H1QA 4AAZA 4BGAA 3GOIA 3ZT2A 4B3TK 1ZFUA 3QEWA 2RN2A 4DQIA 1NK9A 1NGIA 1QSYA 4JS4A 5CYQA 2I61A 3FZKA 3FFIA 4BWJA 2DY4A 3UKUA 1N6QA 3U6FA 1HR0K 3H08A 4UY8O 3MN6A 3ZETA 4OPKA 1Y64A 4K8XA 4QCLA 1NK7A 1VSJA 4F8RA 4O8UA 4NB4A 3HVRA 4R5PA 3LL3A 2P9PB 2MZ0A 2M8BB 3AA2A 4CVNE 4Z4IA 3D0PA 3EE9A 3L0QA 4CIEA 3SCXA 4BVPA 4CD1A 4O0IA 1SS6A 1WAFA 4CFAA 3PSMA 2AA4A 1HNIA 1YF5L 3AA5X 3WQTA 3LPUA 1U4BA 1QQOA 2LJMA 3AVCA 1ZYVA 3D7EO 2A3ZA 3KD1E 2DTUA 1Y97A 3R1XA 4DU1A 5J2QA 2A6AA 2HBKA 4J2AA 1QE1A 1XUPO 3H45C 5AQKA 3TAPA 5KPZA 2QI2A 1T7PA 3U3GA 3SJJA 1N32K 3E1YA 2Z1GA 1QVFM 3VESA 1RT2A 3OS1A 5AQVA 2AP1A 4CJTA 1DLOA 4CZKA 3SUPA 1UA0A 4QOZB 3PO5A 4FWLA 1QTMA 1BDGA 2G8UA 2GMOA 2KKZA 3KP0A 5AQZA 4E7IA 3I56N 1NK5A 2OYQA 4LF5K 3DOLA 3VGLA 4WE1A 4OLAA 1VQLN 3OA9A 2YIPA 2PFUA 3VEVA 3LDPA 2E88A 2Q31A 3P31A 2P9NB 1TVRA 2G8VA 2KQ2A 4LF6K 1HPZA 1RDBA 4IWVA 4OGEA 5AQOA 4AHRA 3R9PA 4KH6A 1T3VA 1K8BA 1ZBSA 3JAMO 3DLGA 5ADXA 3P39A 4E1NA 3VEZA 4EFHA 4X66K 1TKTA 5AQJA 2PAVA 3KLIA 1QHAA 3GKUA 3O9SA 3QESA 3CJBA 3IG1A 4B9UA 5AQTA 1K8KB 4LFAK 3CCQN 1YT3A 4CGIA 1QQCA 1YTAA 5JICA 5JLFA 4C8NA 3A5MC 1I94K 3E9LA 1F21A 4Z4CA 3QO9A 5E41A 3KKSA 5KK4A 3MDQA 4AQYK 1HYZA 2LR3A 3MX5A 3ULDA 4KRFA 1J9AA 4E1JA 3QDKA 1CZAN 3CXCM 1IKXA 3KHWA 1A5XA 2HMPA 4E1MA 4B1YB 4LF7K 3H3NO 2BRZA 4XH5A 2WUSA 1JZBA 3HT3A 3K0SA 5AQLA 2YCHA 1V4SA 1XWLA 3L56A 4KTZA 2E4LA 4BY9C 3AAPA 4CJ4A 3AV9A 1ZBLA 4KI4A 2RPIA 5FPEA 3CC4N 4E89A 4IG0A 2G8WA 1YVUA 3AO4A 1OZZA 3ULEA 3CCMN 1HNWK 1X3NA 2BANA 3QLHA 3J80O 3L3VA 1IKYA 2QXFA 3OYEA 3MEDA 4DV2K 4BWMA 2CH5A 3NF9A 5LJWA 3HBTA 4O55A 1XC3A 3VQCA 4M42A 2KJAA 4B1VA 2FBXA 3VQ8A 4O5FA 2I7NA 2O8CB 4RTFD 2YEOA 1RDCA 1T44A 3ZT1A 4JHDB 3S3NA 4MO5A 2Y1IA 1ASVA 3O9RA 2F7TA 3LP1A 2LY6A 1Q82O 4FK4A 2OZMA 5K14A 3MMVA 5AQYA 2ZGZA 4IXCA 3RWUA 4YY3K 3HJFA 1QQNA 1YIJN 4DTNA 1BCGA 1I6GA 3DXKB 2FXUA 1VSHA 2NRRA 4DV0K 2YHBA 1BHLA 3NCIA 2KFZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2Q0U A;  4CEE A;  5F2R A;  3HPH A;  1NRA A;  3KLH A;  1VHX A;  2UU9 K;  1HUX A;  4AHT A;  1X9M A;  4ELU A;  1WSH A;  2HBJ A;  1N33 K;  1ZBU A;  5C10 A;  3PO4 A;  5HRN A;  4CFC A;  3DXK A;  1WNS A;  4QS7 A;  2V52 B;  1NJX A;  2GEL A;  3NVM A;  3JS6 A;  3NGI A;  5JEN A;  4DS4 A;  1KFD A;  2KHO A;  1KFS A;  1C0G A;  1KTQ A;  5HRO A;  1RTH A;  4A5A A;  5BR9 A;  2YIL A;  1WUA A;  3KZB A;  3AGR A;  3MWT A;  4IFV A;  4NCG A;  3D2E A;  4CZJ A;  3M5R A;  4MDB A;  4FWS A;  1RDW X;  4KFB A;  1GPT A;  3ZX0 A;  4X65 K;  4OJR A;  1EET A;  1RTI A;  2IS3 A;  5AQM A;  4CI6 A;  1FH3 A;  3P1G A;  5A2Q O;  1C1A A;  3C0B A;  4KB0 A;  3K59 A;  1IH7 A;  2P9S B;  3VQ4 A;  2FC0 A;  3O1B A;  4CEQ A;  1NLV A;  3SQ2 A;  3EZ5 A;  4JD2 A;  1JCE A;  2J4R A;  4CBU A;  3TAQ A;  4IOX A;  2XY7 A;  4CHN A;  2K35 A;  4V19 S;  4BE1 A;  4B9S A;  4DTP A;  4DFM A;  1B3C A;  3CYG A;  2GBZ A;  1JLG A;  4R79 A;  3EE8 A;  5FPD A;  2W41 A;  1E3M A;  4F2R A;  1GLL O;  4PL7 A;  2F96 A;  1KCF A;  4FJI A;  1J6Z A;  3QEP A;  4EP4 A;  3HI0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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