2QWNA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-386aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the adp*pi state
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
molecule tags Chaperone
source organism Bos taurus
total genus 119
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwnA04
4MLEA 2CGKA 5AFUH 5FPEA 4JN4A 4CBUA 1S22A 5AQRA 1H1VA 2HF3A 3VGMA 4F9OA 4A2AA 1Z05A 1TYQB 4M7YA 4CZLA 1Q18A 3WUHA 2A42A 3GDQA 4IO8A 5BPNA 1BA1A 2ASPA 3L6QA 3EN9A 3O6WA 3QBXA 4QS8A 4NB4A 5AZIB 4DQ8A 2DPNA 2GUPA 3DJCA 2CH6A 4IJNA 4PKIA 5LJWA 3LM9A 4WQ4C 1QQMA 1MDUB 4H0TB 3EKSA 2IIRA 3C7NA 4FOIA 4BRCA 5AQUA 2P9SA 1GLLO 2QWOA 4JHDB 2P9IA 2FF6A 3ZETB 2P9SB 4FWLA 3VEOA 3D2FA 3VF2A 3ZEUA 1KAYA 3I33A 3EL2A 3CJ7A 5AQNA 4H03B 5KPTA 3D2FB 5EVZA 2AP1A 4FOEA 5AQMA 5ADXH 4H0PA 1YVNA 1NGFA 1BDGA 1NM1A 3HI0A 1P8ZA 2Q0RA 1C0FA 4C23A 4K42A 3H6EA 4J8FA 3H3NO 2FSKA 4RTFD 4QS7A 1CZAN 4FWPA 1TUUA 3VEXA 4CZIA 5BRFA 1LOTB 4B1ZA 2Q31A 4CZJA 5B8HA 4B1YB 4A2BA 2FLOA 3ID8A 4GY2B 2A6AA 4FWSA 5AQSA 5CE3A 3VEWA 2FSNA 5AQOA 4B1WB 4I6MB 3UKUB 2IVNA 3FFKB 1RGIA 1X3NA 3ENHA 4ISGA 3WEEB 2AA4A 2YHXA 3VGLA 1XUPO 3IMXA 1JCEA 3QB0A 3RSEA 2YJEA 5I9EB 5E26A 4BRLA 2D1KA 1Y64A 3A0IX 4B1XB 2A40A 2QWPA 1TUYA 1NGGA 4H0XB 3O80A 3WXKA 4BR5A 3FE1A 4BRMA 4BROA 1MA9B 4HWIA 1WUAA 1DEJA 3MN6A 1BU6O 3EO3A 4BG8A 3CIPA 5LJVA 4JNEA 2V51B 4IJAA 2E88A 1BUPA 1RDWX 5FPNA 2V52B 3ATVA 5AQGA 2P9LA 3SMSA 1HUXA 3TPQA 3VESA 1HX1A 4E1JA 1KAZA 3GE1A 1HKGA 5ELZA 2YI1A 3HZ6A 5AR0A 2A5XA 3HTVA 2ASOA 3A8YA 4IZ9A 3BF1A 4BVOA 5AQPA 3QDKA 4YDUC 4BRKA 4B9QA 1NMDA 2E2PA 3LL3A 1NGAA 1QQNA 2YJFA 2HOEA 1HKCA 3VEYA 4EHUA 2Q0UA 3IFRA 3VGKA 3LDQA 3GOIA 1NLVA 5BPMA 3H1QA 5FPDA 4K41A 5JICA 1V4SA 1NGJA 1TYQA 1SQKA 2BTFA 4CZEA 5AQWA 3DXKB 1E4FT 5KQDA 2ZWHA 4CD3A 3VPZA 4Y0WA 4GNIA 3UE5A 3FZKA 5AZIA 4XEIA 3FZFA 2Q2RA 3H1VX 1K8KB 3WQTA 2Q97A 3GBTA 3D2EB 1NGDA 3ATUA 3O1BA 2H3GX 4BC2A 3LDPA 4RCHA 4MLHA 1GLJO 4JHDA 3ZX2A 3ZETA 4DHYA 2QWNA 5JLFA 3U8XA 1J6ZA 4H5VA 3DXMB 4BR2A 1DKGD 3WQUA 2GELA 1NBWA 3AAPA 4XH5A 4BRIA 5KPZA 3ZX3A 1GLFO 2FXUA 3U4LA 2E1ZA 3B8AX 3DWLA 3I8BA 5AQHA 3W0LA 3R8EA 1BWFO 2ASMA 3H3OB 4BG9A 2Q1NA 5ADXA 5AQZA 1JCFA 3ZX0A 3VF6A 3SK3A 2VCPA 1LCUA 1GLDG 2F9WA 3UKRA 4CD1A 2GWKA 1DGKN 3VETA 4JD2B 2P9UB 4RWTA 3UKRB 5AQVA 3R6MA 3M3ZA 5AQFA 5E84A 4H5TA 4EFHA 2QXLA 4BC4A 3MN5A 1X3MA 3EKUA 5AZJB 2QW9A 2V7ZA 2IVOA 3M6GA 4PL8A 2GEMA 3S41A 1HJOA 2E2QA 2E2NA 5BRHA 4H0YB 4IWVA 4I6MA 3FZLA 3FZMA 1EQYA 4K43A 3UKUA 1BG3A 2E2OA 5AQTA 1NGBA 4A61A 3CQXA 3WEEA 2CH5A 4BR0A 3QICA 1KAXA 4BRNA 4BC5A 4H5RA 1JCGA 5FPMA 4K25A 4XH1A 2VYPA 5JMVA 2D0OA 4FWNA 1ZBSA 3VENA 3G25A 2GWJA 2BUPA 1GLAG 4H5WA 3ULEB 2CGLA 2E8AA 4Z94A 2FSJA 4DB3A 2I7NA 5EXWA 3SMPA 2P9KB 3M1FA 1U6ZA 5AQIA 3LDLA 1QZ5A 3VOVA 2FF3B 2HF4A 3CJCA 1HPMA 5KQ8A 2F9TA 3CI5A 5BREA 5KPRA 4H0VB 3MMVA 5EY4A 3BP8A 1ESVA 4BRDA 5AQYA 4CBWA 3CJ1A 3CERA 5AQXA 4BQLA 4EAHD 2HMPA 3BEXA 3WXLA 3QBWA 1YAGA 4BVPA 1GLCG 4NO7A 1ZC6A 4O5FA 4BR7A 5JLHA 2VWBA 4FO0A 2NRHA 4ISFA 2Q36A 4BGAA 2GTDA 2E1YA 2P9PB 1GLEG 4HTLA 4BREA 2YCHA 3QFPA 1MWMA 3DXKA 2P9NB 4FWOA 4FWQA 4M63C 4FWMA 4BR9A 4CZKA 1T6CA 2A3ZA 5F0XA 4AM7A 2QWLA 4DCHA 3MK6A 1KXPA 1K8KA 3H46O 4XH4A 4PL7A 2EWSA 1ATSA 3D2EA 3ENOA 3L0QA 3LDNA 4KBOA 3KHYA 5AQKA 5AQQA 3VEZA 3FR0A 4BRQA 1V4TA 3KZBA 4MO4A 3HM8A 4FWKA 2W40A 1T6DA 4FPBA 2D0PA 3DXMA 2WUSA 3DAWA 3O5BA 4WQ5A 2UYTA 5EOYA 2QWMA 1SAZA 1G99A 4LC9B 4B1UB 3U9DA 3TU5A 2YHYA 4CI6A 3VERA 3U9ZA 3CJBA 3A5NC 5TKYA 2J4RA 1ZXOA 3FZHA 3MN9A 5BN9A 4IXCA 2IVPA 3CJ9A 3AAQA 3CQYA 3CJAA 3UB5A 2V7YA 3LDOA 2ZGYA 1R59O 3BF3A 4EIAA 3IUCA 4JD2A 5F1XA 3GL1A 3EZWA 2P9UA 3VEVA 3C7NB 3AY9A 3A5LC 4PKGA 1QQOA 3O4WA 1ATNA 3MN7A 1RFQA 1T44A 3WXIA 2W41A 5AZJA 2CGJA 1BOTO 2NLXA 4YDUA 2P9IB 4H5NA 2QWRA 1D4XA 2NZTA 2QM1A 3H45C 4BC3A 1QZ6A 4BRPA 3O1WA 4M7XA 3SJHA 3F9MA 3A5MC 4CZGA 3ZEUB 3CHWA 3FLCO 3GG4A 2OANA 1IJJA 1ATRA 1SZ2A 4BRHA 5BPLA 1NWKA 4CBXA 3O08A 4CZFA 1U2VA 5LY3A 4BQZA 4FWRA 3ULEA 4ISEA 3CETA 2YHWA 2E20A 3FGUA 1U2VB 3HBTA 3QMLA 1OKJA 1YXQA 4JAXA 1C0GA 3KVGA 2P9KA 3P4IA 4FL9A 3BUZB 1E4GT 3J8AA 1NGHA 4PKHA 2PBDA 4AM6A 1XC3A 3JS6A 4BRAA 4WQ4A 5AQJA 3WXJA 4MO5A 4B1VA 4BRGA 3AARA 2I7PA 4H0OA 5F2RA 1QHAA 4EHTA 5BR9A 1YUWA 4QS9A 3MCPA 3SLCA 4FPAA 1S3XA 4FSVA 3OHRA 4WQ5C 4BR4A 1NGEA 3LM2A 3C0BA 3RSEB 1Z6RA 2PAVA 4L3QA 3W3DA 1BO5O 1GLBG 2D4WA 3L4IA 4CJ7A 1NGCA 2A41A 2P9PA 4BRFA 1HLUA 3MDQA 4CZMA 3QFUA 1NGIA 3HSCA 2ITMA 4A62A 1BA0A 2QWQA 3D7EO 3JXUA 2P9NA 4CZHA 3O8MA 1XQSC 5AQLA 1IG8A 1X9JA 2ZF5O 1MWKA 2ZGZA 5BN8A 2P9LB 4WYBA 4BGBA 1HKBA 5BRDA 4O8KA 3A5OC 3VF4A 1WOQA 3WT0A 2KHOA 5EX5A 3IDHA 5AFUA 3R9PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KFZA 5AFUH 1T03A 1EO1A 3SAHA 4JN4A 4CBUA 1XRSB 1W9HA 3A2FA 4DSLA 3PX0A 4KHSA 3NF7A 2F8TA 4HTUA 4F9OA 2JWKA 5CY0A 4FJKA 4GV6A 1TYQB 3ENBA 1QE1A 4CFDA 3DLGA 3NBPA 3GDQA 4IO8A 4LF9K 5BPNA 3LP0A 4DSJA 2G8FA 4ILGB 3N4PA 4DS4A 2YNFA 2YX6A 2JGUA 3NVMA 1VQLN 4QS8A 3QESA 4LY7A 3TAFA 4M3TA 1N33K 4DR4K 3LM9A 3L8BA 4EP5A 1MDUB 3KOWA 1BI4B 1FKPA 2HVIA 4FOIA 5AQUA 3VQCA 4HCBA 1BMRA 4JHDB 4NCAA 3TABA 4ILJA 4YNQA 4CERA 3AO3A 1L3TA 3HM9A 1YIJN 1AHOA 3O3HA 3E9PA 3VQBA 1OH5A 4PA1A 5AQNA 5SWMA 1D9FA 1POIA 4AH9A 2NY9X 1HNXK 4KPYA 1BK8A 1BDGA 3T69A 2Q0RA 3OS0A 4Z0UA 2SN3A 4FJIA 5KI6A 1NMNA 3QINA 3E7UX 1IKXA 1CZAN 3AVGA 1TUUA 4FWPA 3MXMA 1ICAA 5C2DA 2IOCA 2O8FB 4FZYA 4KHPK 1RT7A 4O8UA 3P31A 2O8CB 1BGXT 4GVEA 4CZJA 5B8HA 4DFPA 4A2BA 1TK5A 2DFFA 4JI0K 5DMRA 4FWSA 5AQSA 5AQOA 1NK9A 3VA0A 3VQ6A 4JI8K 2IVNA 4FJ5A 1JLFA 1X3NA 3NCIA 3HJFA 1XUPO 2YJEA 5I9EB 4QAGA 4A59A 3SZ2A 3A0IX 2A40A 1TUYA 2ZQBA 4JS4A 3CCVN 4JK8A 3LDSA 4CJUA 3WXKA 1LWCA 4KB0A 4KO0A 1WUAA 1DEJA 3KK2A 4Y1DA 4OKEA 1OH8A 3EO3A 4BG8A 1WB9A 3DLHA 4JI7K 4IJAA 1WT7A 3OW2M 1RDWX 4Z4GA 3FFIA 2LY5A 3MX5A 2ATQA 4M45A 4Z4HA 5AQGA 2P9LA 3TAQA 1EP4A 4CJEA 3KHWA 4CIFA 3VESA 4OVLA 3NHGA 3O9TA 2OPPA 5KK4A 2A5XA 3BF1A 2YILA 1UOCA 3C95A 4YDUC 4BRKA 1NMDA 2HHSA 2YJFA 4ELVA 3BZCA 1TV6A 3EE8A 3ISNC 3DLBA 3VEYA 4EHUA 1QS4A 3IFRA 4CHYA 3VGKA 1NKCA 3P5JA 4E7LA 4G9ZA 1NU0A 4DU4A 3OBYA 5FPDA 3AVNA 3RR8A 4W5NA 4FJ7A 4LH5A 2ZWHA 2ZJRL 4KHUA 4O5BA 3UE5A 1QSLA 3IRXA 1XC9A 2WOMA 3THWB 2KGQA 3T1HK 3NVKA 4E72A 3H1VX 3WNFA 5JS1A 3SBGA 1EWRA 1VSMA 1LW0A 2XO7A 3J7AP 2YHAA 3LDPA 4FJGA 1ITGA 4M3XA 3LP1A 3AO5A 1GLJO 2LT8A 1J6ZA 3G10A 3L2UA 1DJTA 4B8CA 4FLXA 3O9RA 2GELA 1WSJA 4DF8A 4DV5K 1T0ZA 2FXUA 4CJKA 3DWLA 2VGMA 1X9WA 3CD6N 3R8EA 1BWFO 2KBHA 2ASMA 4DQPA 1BCMA 4BG9A 4BE2A 1TKZA 3DMJA 1REVA 3VF6A 1RTIA 2DY4A 1LCUA 4HUFA 2F9WA 3UKRA 4CD1A 5JVHL 2P9UB 1NK7A 3R6MA 2NRTA 3M3ZA 5CHIA 2NY8X 5AQFA 1T7PA 4CIEA 3JAMO 2HHTA 3VQ4A 3MN5A 4CQKA 1JL1A 2O8EA 4PL8A 3S41A 3TI0A 3WNGA 4M42A 5HP1A 1FXXA 1YJNN 3UKUA 3FZMA 1KSPA 3AVKA 2E2OA 1Y97A 4F3OA 4ID1A 4N5SA 4J2DA 4E19A 3T19A 4A61A 3WEEA 4BR0A 4BC5A 2G2KA 4H5RA 2WBNA 5JMVA 4WFAL 1VRTA 5J2NA 3K57A 4CVNE 3F9KA 4X64K 4H5WA 1BL3A 2CGLA 5CY4A 1CLQA 4KTZA 1NK8A 4OKJA 4B9UA 1ZU3A 4DR6K 3O3FA 4ID5A 5AQIA 1JXEA 3OYKA 2HF4A 1XI1A 3CJCA 2F9TA 4F8RA 3ITHA 3K9KA 4GMJB 2HNDA 4DTPA 1S9GA 4BRDA 3PSFA 1GOCA 1JKHA 3QBWA 2BGGA 4YHHK 1QHTA 4NCBA 3OYEA 3D6RA 3ZSYA 3CF5L 4F2RA 2GTDA 4DV2K 2P9PB 4A5AA 4FJLA 1BQMA 1I6FA 2YCHA 4K8XA 4CJPA 1MWMA 3DXKA 2P9NB 4JI4K 4O44A 4IFVA 5H1SQ 1A5VA 3HO1A 4CZKA 3TAPA 3V4IA 2ZM6K 4FJJA 1KXPA 2EWSA 3ENOA 3D2EA 3KLEA 4YY3K 4F4KA 2O8DB 4I9QA 4IFYA 3FR0A 1IKVA 3NGYA 3M8RA 3F73A 4FM2A 4CJ3A 1T6DA 4JI1K 2D0PA 3C6UA 1NJYA 1XWLA 1AYJA 2WUSA 3DAWA 4WQ5A 1T7AA 4OLAA 2HBMA 2VGNA 5J1EA 1S1UA 4B1UB 1Q8IA 2X6NA 1UAXA 3U9ZA 1NRBA 2P5GA 4DQQA 5BN9A 3PO4A 5DM7L 3CJ9A 2E3GA 5M1PA 2BANA 4YOVA 1R59O 1YI2N 3IUCA 3LAKA 4JD2A 3ALYA 4JLHA 4C1NK 3AY9A 1VQ7N 1DTQA 4IBNA 3WXIA 2W41A 5AZJA 3TTDA 4LFAK 3NH0A 2QWRA 1D4XA 1BISA 2QM1A 2OZSA 2YNIA 1QZ6A 1JLBA 3SJHA 1HQEA 4AHCA 4CZGA 3C6TA 4NYFA 1JZBA 3ZEUB 4M3ZA 4CJ4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2KFZ A;  5AFU H;  1T03 A;  1EO1 A;  3SAH A;  4JN4 A;  4CBU A;  1XRS B;  1W9H A;  3A2F A;  4DSL A;  3PX0 A;  4KHS A;  3NF7 A;  2F8T A;  4HTU A;  4F9O A;  2JWK A;  5CY0 A;  4FJK A;  4GV6 A;  1TYQ B;  3ENB A;  1QE1 A;  4CFD A;  3DLG A;  3NBP A;  3GDQ A;  4IO8 A;  4LF9 K;  5BPN A;  3LP0 A;  4DSJ A;  2G8F A;  4ILG B;  3N4P A;  4DS4 A;  2YNF A;  2YX6 A;  2JGU A;  3NVM A;  1VQL N;  4QS8 A;  3QES A;  4LY7 A;  3TAF A;  4M3T A;  1N33 K;  4DR4 K;  3LM9 A;  3L8B A;  4EP5 A;  1MDU B;  3KOW A;  1BI4 B;  1FKP A;  2HVI A;  4FOI A;  5AQU A;  3VQC A;  4HCB A;  1BMR A;  4JHD B;  4NCA A;  3TAB A;  4ILJ A;  4YNQ A;  4CER A;  3AO3 A;  1L3T A;  3HM9 A;  1YIJ N;  1AHO A;  3O3H A;  3E9P A;  3VQB A;  1OH5 A;  4PA1 A;  5AQN A;  5SWM A;  1D9F A;  1POI A;  4AH9 A;  2NY9 X;  1HNX K;  4KPY A;  1BK8 A;  1BDG A;  3T69 A;  2Q0R A;  3OS0 A;  4Z0U A;  2SN3 A;  4FJI A;  5KI6 A;  1NMN A;  3QIN A;  3E7U X;  1IKX A;  1CZA N;  3AVG A;  1TUU A;  4FWP A;  3MXM A;  1ICA A;  5C2D A;  2IOC A;  2O8F B;  4FZY A;  4KHP K;  1RT7 A;  4O8U A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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