2QWNA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-386aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the adp*pi state
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
molecule tags Chaperone
source organism Bos taurus
total genus 119
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwnA04
5AQQA 5EX5A 4B1UB 3O4WA 4CZMA 3FZFA 5AQJA 1JCFA 2A3ZA 3VEOA 2ZWHA 4FPAA 1HJOA 4JD2A 3IUCA 1JCGA 3GOIA 3WXKA 3KHYA 4FWQA 2J4RA 4BRCA 4BRIA 5AQMA 1J6ZA 4YDUA 4PKHA 3WEEA 2P9LB 4Y0WA 5KQDA 3W0LA 1NM1A 4FWMA 2IVOA 1R59O 3RSEA 4BROA 3VGMA 1LOTB 4BR2A 2UYTA 3FZKA 1T6DA 1QQOA 3QBWA 1NGJA 2D0OA 3QB0A 3SMSA 4WQ5C 3O8MA 1BU6O 3R6MA 3ZETB 1NGGA 2HF3A 3CI5A 4H0OA 2YCHA 3QFUA 1NLVA 4EHTA 2Q2RA 2P9LA 2FSJA 3R8EA 3C0BA 4AM6A 1KAXA 1HUXA 1XQSC 4B9QA 1KAYA 5AQOA 2Q36A 3GG4A 4A2BA 4BRPA 5FPEA 4K43A 1NGAA 3EZWA 4IO8A 3HM8A 3ZX2A 5E26A 4FWRA 5KQ8A 1E4GT 3BEXA 3WXIA 4CZGA 3ID8A 2E8AA 3H3NO 2E2NA 4BR4A 4BRMA 4B1YB 3VENA 4XH1A 3UKRB 3VEXA 5LJVA 3VEWA 3ZETA 3LDLA 3HZ6A 4M63C 2FLOA 1NGEA 2V51B 3BP8A 4B1XB 3F9MA 1V4SA 1H1VA 3GBTA 1BOTO 5AZIB 4BC5A 4MLHA 2P9NA 4K25A 2ITMA 5AFUA 1Q18A 2HOEA 1YXQA 1NGFA 2W41A 1NBWA 1DGKN 5E84A 1X3MA 4ISGA 3AY9A 4CZLA 4EHUA 3EO3A 3VF2A 4BR9A 4EFHA 3BF3A 2CGKA 3BUZB 1P8ZA 5AQVA 3CETA 4H5RA 3UKRA 3KVGA 1NGCA 1TUYA 5LJWA 2A40A 1WOQA 2PBDA 2QW9A 3O1BA 3L0QA 2E2OA 1QQMA 1S3XA 1DEJA 3MN9A 3DWLA 3AAPA 1GLDG 4A2AA 3ENOA 1BA0A 5EOYA 1SQKA 4O5FA 4WQ4A 5AZJB 3HI0A 3VERA 4MLEA 4RCHA 5JICA 1JCEA 2DPNA 3U9DA 1GLBG 1T44A 2ASPA 3EKUA 3QFPA 4H5WA 1C0GA 3VEVA 5BR9A 3CJAA 4CD1A 3M3ZA 5F1XA 2A42A 4BRKA 4B1ZA 5BRDA 2E2PA 1U2VB 4F9OA 3M6GA 4BVOA 1S22A 5AQZA 4H03B 3VOVA 2Q0UA 3U4LA 3D7EO 3ZX0A 4A61A 4FWLA 5JLHA 3A8YA 3UKUB 1NWKA 4KBOA 2GUPA 3SJHA 4BR7A 4E1JA 2P9KA 2QWLA 3VEZA 1MDUB 5EVZA 2W40A 3EKSA 4JHDB 4FWSA 4BRDA 3VPZA 3ATVA 3LDNA 3LDPA 4BRLA 1U2VA 3HSCA 4DHYA 4XH4A 5I9EB 3O80A 3FZMA 5AQWA 3UB5A 4WYBA 2V7YA 1ZXOA 2IVNA 3UKUA 1SZ2A 4DB3A 4CZKA 3MDQA 1GLLO 5BN9A 4BRAA 2EWSA 1TYQB 4M7XA 5KPTA 2QWPA 3L4IA 3I33A 2WUSA 3VF4A 4H0PA 2BUPA 4IZ9A 4BRGA 1E4FT 1YUWA 3FLCO 5B8HA 4IJAA 4O8KA 2Q1NA 2YI1A 2E88A 4FWNA 4K41A 4BGAA 2A5XA 3WQUA 4CD3A 3GDQA 2P9UB 4FL9A 2YHWA 3DAWA 2H3GX 3U8XA 3WUHA 3ATUA 1BO5O 2I7NA 4M7YA 3H3OB 5BPMA 2YHXA 1TYQA 3MN6A 4MO5A 3FGUA 4L3QA 2OANA 3HBTA 3ZEUB 4IXCA 1QZ6A 3KZBA 1NMDA 2V52B 1Z6RA 3CJ1A 4H0XB 4DCHA 3J8AA 3IMXA 3D2EB 5AQNA 2FF3B 3FFKB 4BQLA 2E1ZA 2ZGZA 4IWVA 3MMVA 4CZFA 1C0FA 4FPBA 1IG8A 2NRHA 1KAZA 1ZBSA 3VETA 1QHAA 1GLJO 3HTVA 2AA4A 1BG3A 1CZAN 5BREA 2VCPA 4WQ5A 2P9UA 5KPRA 3IDHA 3C7NB 3OHRA 4HWIA 1NGHA 1RFQA 3LM9A 4CZEA 4Z94A 3WT0A 5FPDA 2F9TA 3I8BA 4NB4A 3P4IA 4JN4A 3ZEUA 2A41A 5AQUA 5AZIA 4ISFA 4I6MB 3TU5A 2FF6A 3TPQA 3FZLA 2QWOA 3D2EA 3IFRA 1GLAG 4YDUC 5LY3A 3CJ9A 3AARA 4HTLA 3SK3A 2D1KA 3LM2A 1Z05A 3BF1A 4RWTA 5FPNA 2F9WA 4FSVA 5ADXH 1LCUA 1XC3A 4H5NA 1QQNA 2PAVA 2YJEA 3CQYA 2HF4A 2A6AA 1KXPA 3O08A 3CIPA 3ENHA 5AQHA 3UE5A 2E20A 4FWOA 4JD2B 3FE1A 5AQXA 5AQIA 2CH5A 5F2RA 1YVNA 5BPNA 3O6WA 4CZHA 4ISEA 3CERA 4FO0A 2I7PA 2E1YA 4I6MA 2QWQA 5AQRA 4EAHD 2FSNA 1OKJA 1YAGA 2QWMA 4H0VB 3DXKB 5ELZA 2D0PA 4BRNA 5AZJA 1RGIA 4H5TA 5AQGA 1ZC6A 2VYPA 2YHYA 4BRQA 1GLCG 1U6ZA 2AP1A 3JS6A 4RTFD 3WQTA 2QWNA 1BDGA 1BA1A 5EXWA 5F0XA 1ATRA 5BRFA 2IIRA 2NLXA 4CZIA 1MWKA 2ZF5O 1XUPO 5JMVA 3D2FB 3MN5A 4J8FA 4BR5A 1SAZA 3WXLA 5TKYA 3DXMB 2P9IB 4JNEA 4BG9A 2QWRA 2D4WA 4JAXA 3W3DA 4CBWA 3WXJA 4BVPA 4QS8A 3S41A 1BWFO 4LC9B 2FXUA 4PKIA 5FPMA 2BTFA 3FZHA 3QBXA 3DXKA 2ASOA 4DQ8A 4BRFA 3VEYA 3LDQA 1X3NA 2YJFA 4PL7A 1HKCA 3A0IX 4BGBA 4AM7A 3G25A 3O1WA 3A5NC 4JHDA 3H1QA 5BRHA 1D4XA 4IJNA 1RDWX 3VESA 3VGKA 1DKGD 1MWMA 4H0TB 2ZGYA 3D2FA 3AAQA 1ATNA 4XH5A 4GY2B 3A5MC 3DXMA 1G99A 2P9IA 1ATSA 4NO7A 4CJ7A 4CBXA 2KHOA 3MK6A 5AQKA 3QICA 5AQPA 3ULEB 2CH6A 4FWPA 3DJCA 1MA9B 2P9NB 1HKGA 1WUAA 3SMPA 4BRHA 5EY4A 3H46O 3LL3A 2Q0RA 1QZ5A 2VWBA 2GEMA 4QS7A 4WQ4C 4FOIA 3QDKA 3L6QA 4B1VA 5AFUH 1X9JA 3EL2A 4C23A 3JXUA 3GE1A 2HMPA 5JLFA 5BN8A 2IVPA 2ASMA 4BC3A 4MO4A 3SLCA 3LDOA 4PKGA 4GNIA 4BG8A 5AQYA 2Q31A 4BC4A 3ULEA 1Y64A 3H6EA 1GLFO 4XEIA 4BR0A 4BREA 3A5OC 2P9SB 1V4TA 3B8AX 1NGBA 4QS9A 3R9PA 3ZX3A 4BQZA 5BPLA 5KPZA 1K8KB 5AQTA 3O5BA 1HLUA 1HX1A 2P9PB 3EN9A 3MN7A 5AQSA 3H1VX 4PL8A 1BUPA 4FWKA 4K42A 2QXLA 3QMLA 4A62A 3U9ZA 3H45C 3CJCA 4EIAA 1TUUA 2E2QA 3C7NA 4H5VA 3MCPA 4CZJA 3CQXA 1IJJA 2CGJA 2FSKA 5AQFA 4B1WB 4FOEA 2NZTA 5AQLA 2GWJA 2P9KB 2GELA 1HPMA 2QM1A 1GLEG 3GL1A 3VGLA 1NGDA 2GWKA 3M1FA 2V7ZA 4H0YB 3CJ7A 2P9SA 1HKBA 3WEEB 3CJBA 4BC2A 4CBUA 5ADXA 3A5LC 3FR0A 1K8KA 1ESVA 4CI6A 3RSEB 2P9PA 5AR0A 2CGLA 3CHWA 2Q97A 1T6CA 2GTDA 3VF6A 1EQYA 1NGIA 5CE3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AQQA 1RTJA 1K73O 3VEOA 1SN4A 1RBUA 3TABA 3IUCA 3GOIA 4E1MA 4AB0A 5AQMA 3QINA 4C8NA 2B68A 1NM1A 1QE1A 2IVOA 1R59O 3O4QA 3RSEA 4FCYA 1U4BA 2E3FA 4DS5A 3VGMA 1IBMK 1LOTB 4BR2A 2BE2A 2UYTA 1T6DA 2X78A 3OYFA 1JXBA 1Q8IA 1VAZA 4JKGA 3QI7A 4DFMA 3ULDA 3K9JA 1X9MA 3R6MA 2NRWA 1NGGA 4OJRA 4CF2A 1NH5A 3HT3A 4EHTA 3WXMB 2KBKA 4AM6A 3PIPL 4M3UA 5CZ2A 4DMNA 3O4NA 2N2QA 4B9QA 1KAYA 2Q36A 1NRAA 1K8AO 5FPEA 4ID1A 3BDPA 4E3SA 3PV8A 3VQDA 1A5VA 4JI1K 4B3RK 2JWKA 3H3NO 2MN5A 4KB0A 3G10A 1ZBIA 4JRQA 3LDSA 3ZETA 3KLGA 3TAEA 3VTIA 2FBXA 1HPZA 3HZ6A 2Z1JA 3BP8A 4B1XB 2ASCA 4FVMA 3ZT2A 1LW0A 4DTSA 4EP4A 4BC5A 5M1OA 1EWQA 4H4OA 5AFUA 3CMAN 5HL7L 3HVTA 3M8PA 1DGKN 4O4GA 2UUBK 1K6YA 3AY9A 4CZLA 3OS2A 3EO3A 4FLWA 3VF2A 2ATBA 3BF3A 1P8ZA 2G8UA 4JKBA 3CCJN 3CETA 1P0AA 1NJYA 4KHSA 4AH9A 5M1FA 3KVGA 1NGCA 2HMIA 2A40A 4CCHA 4A59A 2GV9A 3SQ0A 2PBDA 3LWMA 4DQPA 3AVKA 1DEJA 1C1AA 2VWKA 3JYTA 3OY9A 1A5XA 3D6RA 3ENOA 2PY5A 3E1YA 1GPSA 1CHZA 4CGIA 1DTTA 4MLEA 1C55A 1Q86O 2OPSA 5HRSA 2DPNA 4AHRA 4BE0A 3SAFA 1XHXA 1GLBG 1T44A 2O8FA 3G4SN 1FW6A 5C15A 2LJMA 3E9LA 4AHCA 3NVKA 4Z4GA 4KHQA 1IKVA 3E9OA 4BVOA 1ZVGA 5AQZA 2HNDA 3A8YA 4OO1J 4O8UA 3DRPA 3T7ZA 4CEOA 3CCSN 2GUPA 2QWLA 4IBNA 4JK7A 5HROA 5EVZA 4CHZA 4XJXA 5FROA 3L2RA 4RW9A 4FWSA 3IS9A 1SKWA 3KD5E 1RT6A 4BRDA 3T1YK 1VQ6N 4QCLA 1LQQA 2JGUA 4NXNK 1XC9A 2D0AA 2GX9A 2G8IA 1WSEA 1L3UA 5AQWA 3V1RA 3UB5A 3DLLL 4FZYA 2HHIA 2ZD1A 3U3GA 1BCMA 3IKMA 3MXMA 5BN9A 2KSKA 1JL1A 1QS4A 4M3ZA 1B9FA 1J5OA 2QWPA 4IFYA 3KOWA 3OYIA 1SL1A 2MBKA 2P5GA 3MCAB 1IKYA 1GOCA 2BUPA 2G8KA 4CJKA 2Q1NA 3I8DA 4FWNA 4BGAA 4CJ5A 3GKUA 2JLEA 4E89A 3UIQA 3SI6A 3DLKA 2H3GX 3ATUA 1BO5O 3H3OB 4CJLA 1TYQA 1LAWA 3OYLA 3AO5A 2P5OA 4JI0K 4L3QA 4IXCA 2O8CA 1X1PA 1SKSA 3KZBA 1NMDA 3HL8A 4IO9L 3Q7BA 2HSTA 2VQEK 4H0XB 4DUYK 3FFKB 2FF3B 1XHZA 2BGGA 4CHPA 3JAMO 2YKNA 4CHQA 4LSLA 4CGDA 4JS4A 1NKEA 4KFBA 3HO1A 4FPBA 1QHAA 3CM6A 3HTVA 1BG3A 1CZAN 2VCPA 3CC4N 3ZYYX 1U45A 2AJQA 3KOXA 3K5NA 1SEGA 1RFQA 3K58A 4FLZA 2XY7A 5FPDA 1Q82O 1B7DA 4UJ0A 1VSLA 4IDHA 4YOTA 1ILYA 3P4IA 2QA4N 3ZEUA 1RTIA 1S72N 1BQMA 5AZIA 4DV3K 2FF6A 4KKOA 3QIOA 3TPQA 1D5AA 3ZSOA 3ZT0A 4W5NA 3FZLA 2QWOA 3TSUA 1T7EA 3CJ9A 3AARA 1X9SA 3HVRA 3P38A 2VY6A 2OZMA 4RWTA 5FPNA 4YOUA 2F9WA 4B9TA 5CZ1A 3QEWA 1LCUA 1RCHA 2DFFA 4FJGA 1XC3A 4H5NA 2OPPA 3IAYA 3CIPA 3SPYA 1KTQA 4KB1A 5AQHA 3PX4A 4JD2B 4AEIA 2CH5A 5F2RA 2XRIA 3MECA 1S1VA 1IKXA 2I7PA 4E7KA 3Q7CA 1K8BA 2E1YA 3P5JA 4A5BA 4EAHD 2QWMA 1WBBA 3DXKB 2KTQA 2UUCK 2D0PA 5C2DA 3J7AP 4CFDA 1U6ZA 4N56A 3JS6A 5J2QA 3AA5X 4MDAA 3NGZA 3S3MA 1BDGA 5F0XA 5BRFA 1UA0A 2O4GA 3V9XA 4G9ZA 2HHWA 2LT8A 3ZSXA 3PUFA 4DFKA 1M1KO 1EWRA 4CEEA 3WXLA 3DXMB 1B3CA 3T3FA 4BG9A 1VQPN 3OYBA 2KYQA 4FK4A 3S41A 2HBMA 1BWFO 5A2QO 4CGGA 2SN3A 4IFEA 3TANA 5FPMA 1I2UA 4AF1A 2ASOA 3EY1A 1BMRA 3NF8A 2YJFA 5J2MA 3AGRA 3OA9A 3A0IX 4BGBA 4K0KK 3G25A 5I3UA 2O8BB 1WAFA 5BRHA 4OX9K 1AYJA 4N47A 2KBJA 4E7JA 1NK0A 1DKGD 3G0ZA 4JI7K 3D2FA 4XH5A 2F96A 3IRXA 3O9RA 4TSXA 3A5MC 4NO7A 1ATSA 4CJ7A 3MXIA 5SZTA 4HHTA 2W42A 3E66A 1R0AA 4DFPA 2CH6A 4FWPA 2XY6A 1WUAA 4V19S 3RR8A 3TTCA 4GMJB 4O5BA 3R3LA 3ZSRA 3ASMA 2XY8A 4QS7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5AQQ A;  1RTJ A;  1K73 O;  3VEO A;  1SN4 A;  1RBU A;  3TAB A;  3IUC A;  3GOI A;  4E1M A;  4AB0 A;  5AQM A;  3QIN A;  4C8N A;  2B68 A;  1NM1 A;  1QE1 A;  2IVO A;  1R59 O;  3O4Q A;  3RSE A;  4FCY A;  1U4B A;  2E3F A;  4DS5 A;  3VGM A;  1IBM K;  1LOT B;  4BR2 A;  2BE2 A;  2UYT A;  1T6D A;  2X78 A;  3OYF A;  1JXB A;  1Q8I A;  1VAZ A;  4JKG A;  3QI7 A;  4DFM A;  3ULD A;  3K9J A;  1X9M A;  3R6M A;  2NRW A;  1NGG A;  4OJR A;  4CF2 A;  1NH5 A;  3HT3 A;  4EHT A;  3WXM B;  2KBK A;  4AM6 A;  3PIP L;  4M3U A;  5CZ2 A;  4DMN A;  3O4N A;  2N2Q A;  4B9Q A;  1KAY A;  2Q36 A;  1NRA A;  1K8A O;  5FPE A;  4ID1 A;  3BDP A;  4E3S A;  3PV8 A;  3VQD A;  1A5V A;  4JI1 K;  4B3R K;  2JWK A;  3H3N O;  2MN5 A;  4KB0 A;  3G10 A;  1ZBI A;  4JRQ A;  3LDS A;  3ZET A;  3KLG A;  3TAE A;  3VTI A;  2FBX A;  1HPZ A;  3HZ6 A;  2Z1J A;  3BP8 A;  4B1X B;  2ASC A;  4FVM A;  3ZT2 A;  1LW0 A;  4DTS A;  4EP4 A;  4BC5 A;  5M1O A;  1EWQ A;  4H4O A;  5AFU A;  3CMA N;  5HL7 L;  3HVT A;  3M8P A;  1DGK N;  4O4G A;  2UUB K;  1K6Y A;  3AY9 A; 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