2QWQA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the amppnp hydrolyzed form
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Bos taurus
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
total genus 115
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwqA04
4RWTA 2A6AA 3GBTA 4KBOA 4XEIA 3UB5A 4M7YA 1MWKA 4WQ5C 1NM1A 2Q1NA 3FR0A 3MN9A 2VCPA 2IVOA 2HF3A 3KHYA 4CZEA 1NGIA 5AZIA 1U2VA 1HUXA 5JMVA 2P9IA 2PAVA 3QBWA 2P9KA 4BC2A 4B1YB 5AFUA 2A3ZA 4QS9A 1D4XA 4B1ZA 2BUPA 1MA9B 4BG9A 3U8XA 3I8BA 1RGIA 1LCUA 3VPZA 2QWMA 1TYQB 3HTVA 1BUPA 3VETA 2ASMA 1NGJA 2GUPA 2E1ZA 1BDGA 3VEOA 1K8KA 5AQLA 1RDWX 3O1BA 5EVZA 4CZKA 5E84A 3AARA 3FFKB 3TU5A 3VOVA 2E88A 4BRPA 2GEMA 3WEEB 1NGDA 5AZJB 2GWJA 2NRHA 3MN7A 4WQ4A 3VEYA 3H6EA 3ULEB 5AQTA 3M1FA 1T6DA 5BPMA 2P9SA 3A5LC 4DQ8A 4MLEA 3VGKA 4WQ4C 2E2PA 3DXMB 2QWLA 1HPMA 5F1XA 2D0PA 1YAGA 4CBWA 3RSEA 4B9QA 4WYBA 3QICA 4BGAA 4CBXA 4BVOA 4CD3A 3GE1A 3FE1A 1X9JA 5AQVA 1NBWA 4K25A 4DB3A 5JLHA 1U6ZA 4A61A 2Q97A 1T44A 4FWOA 3DWLA 3VENA 5FPEA 3LDQA 3WXIA 4IO8A 1KXPA 2GWKA 4BRIA 3FLCO 3H1VX 1ZBSA 1Y64A 3QFPA 3O4WA 1KAZA 2E8AA 5AQGA 2CH5A 5JLFA 4K42A 4EAHD 4BRQA 3D2FB 1R59O 4FPBA 1SZ2A 4PKGA 3GDQA 1KAXA 4M7XA 3BUZB 4RTFD 3ENOA 3KVGA 1GLJO 2J4RA 3ENHA 4A2BA 5AQZA 1OKJA 3O8MA 4AM6A 1HX1A 3O08A 5AQFA 1IG8A 2VWBA 1NGCA 1TYQA 5EX5A 3MCPA 2QWQA 5KPRA 4MLHA 3LDPA 5FPNA 2ZF5O 3JS6A 3U4LA 4B1WB 4XH4A 1YUWA 1E4GT 3I33A 4BC3A 5AQXA 1IJJA 2ZGYA 4BR0A 3R9PA 3U9ZA 1GLLO 1HKCA 4PKHA 4ISGA 3HM8A 4ISFA 4BC5A 1QQMA 3VERA 2FXUA 2P9UA 3LDOA 3GL1A 3CJCA 3DXKB 3ATVA 3QB0A 3ULEA 3MMVA 4MO4A 2WUSA 2QM1A 1BG3A 3EZWA 1JCEA 2P9PB 3DXMA 1GLDG 3ZX2A 1WOQA 2ASPA 1H1VA 5AQHA 4CZHA 2Q0UA 3AY9A 4A2AA 4WQ5A 3WQTA 3KZBA 3VGLA 5ADXH 4J8FA 4AM7A 1QHAA 3D7EO 5AQMA 3QDKA 4BQZA 4H0XB 4IJNA 4BRDA 4NO7A 3CQXA 3MK6A 2CGJA 5BREA 3EO3A 4XH1A 3VEZA 4BRMA 5LJVA 1YXQA 3GOIA 3WXJA 3D2EB 1YVNA 1DKGD 3W0LA 3EN9A 3SMSA 3ZX3A 2D1KA 1ESVA 4ISEA 4H5RA 5AQOA 5FPDA 3BF1A 3UKUB 3MN6A 2ZGZA 1XQSC 1Z6RA 4NB4A 5BRHA 3VF4A 2ITMA 3H3OB 1SQKA 3ZETB 3UE5A 2IVPA 4O8KA 2YHXA 3CJ1A 4JD2B 4CZGA 2V7YA 1BO5O 1BOTO 3EL2A 4GY2B 4CI6A 1X3MA 1S3XA 3LL3A 1C0GA 4CJ7A 3C7NB 4EHTA 3A5OC 5AR0A 1NGBA 5BPLA 3QBXA 4EFHA 2YJEA 2YI1A 1MDUB 5AQSA 2A42A 2GELA 4CZJA 3F9MA 1MWMA 2EWSA 5ADXA 3ZEUB 2P9PA 3CERA 2FSJA 4BC4A 1GLCG 1GLAG 3BF3A 5AQWA 3H46O 4CZFA 5AQNA 3M3ZA 2HOEA 3P4IA 4I6MB 4QS7A 4BRLA 2QWOA 3DAWA 3R6MA 1GLEG 2V7ZA 3FZFA 2E1YA 4FWNA 4IWVA 2A5XA 3DJCA 1ZC6A 3VESA 1X3NA 2Q0RA 1Q18A 3VF6A 4PL8A 3AAQA 1BA1A 4K43A 1V4TA 3H45C 2HMPA 4JHDB 2A41A 5F0XA 4FOIA 2P9IB 3D2EA 4BR9A 1NGHA 2KHOA 5E26A 4B1UB 3G25A 4CBUA 4L3QA 1QQNA 1HLUA 2V51B 3CQYA 3GG4A 4H03B 2CH6A 4H0OA 5AQJA 2YHWA 3UKUA 1NGEA 1WUAA 2E2QA 4Z94A 3O6WA 4FO0A 1NGFA 5AQRA 4JAXA 2IIRA 4BGBA 3VF2A 1TUYA 5AQPA 2D0OA 3WEEA 1XUPO 2W41A 5CE3A 4BR5A 5AZJA 5LY3A 3M6GA 3ZETA 1ATSA 5BN9A 4JN4A 1T6CA 2E2NA 4HWIA 2FSNA 5F2RA 5I9EB 5TKYA 4FWRA 2I7PA 4JD2A 4B1VA 2NLXA 2OANA 4CD1A 2F9TA 4CZLA 4EHUA 2P9LB 3S41A 3SLCA 3OHRA 3L4IA 5JICA 3C7NA 2YJFA 2P9NB 4H5WA 2E20A 4M63C 1G99A 2NZTA 4H0PA 2IVNA 4BRGA 1HKGA 4RCHA 1GLBG 3CHWA 3A5NC 2H3GX 1DEJA 4BROA 3A5MC 2Q2RA 2ZWHA 1LOTB 2QWPA 5EY4A 1BA0A 3LM2A 3VEVA 4BQLA 1TUUA 3LM9A 3VGMA 2V52B 4BRKA 2I7NA 3AAPA 3CI5A 3SJHA 2D4WA 2Q36A 3QMLA 3J8AA 3D2FA 3H3NO 4IXCA 4FSVA 2AA4A 4FWSA 2VYPA 1BU6O 4JHDA 1NLVA 1HKBA 1JCFA 4DCHA 3L6QA 2F9WA 3HBTA 5KPZA 3SK3A 5EOYA 4BRAA 2CGLA 4FWQA 1HJOA 1NGAA 1Z05A 2UYTA 4A62A 3A0IX 1SAZA 2YCHA 5BN8A 5AQQA 4IZ9A 3ID8A 2QW9A 4FOEA 3IUCA 3WXKA 4GNIA 5FPMA 4FWLA 2FSKA 3VEWA 3W3DA 3C0BA 4FWPA 2QWNA 1ATRA 1RFQA 3BEXA 2FF6A 3VEXA 2YHYA 5BPNA 5AQIA 3EKSA 3DXKA 3WT0A 2P9UB 1GLFO 2A40A 4BRFA 3MN5A 4F9OA 3IDHA 4BR2A 4C23A 4E1JA 3FZHA 3JXUA 2FF3B 4JNEA 2P9LA 1QQOA 1P8ZA 1JCGA 4PKIA 4H5TA 4BRNA 5ELZA 4FL9A 4QS8A 4O5FA 1E4FT 4B1XB 1QZ6A 3UKRB 2P9NA 3R8EA 5BRDA 5AQUA 4BRCA 1DGKN 3O80A 1V4SA 3O5BA 3LDLA 4YDUA 5AQYA 2HF4A 5BR9A 2ASOA 4K41A 3CJ7A 3CJBA 1U2VB 5AZIB 2DPNA 4YDUC 4EIAA 4PL7A 3A8YA 2P9KB 5EXWA 3FZKA 2QWRA 4FWKA 4CZIA 3ATUA 5BRFA 1ZXOA 4H0YB 3QFUA 1J6ZA 3LDNA 5AFUH 4CZMA 4FPAA 4H0TB 1KAYA 4H0VB 2CGKA 4IJAA 3ZX0A 5B8HA 2GTDA 3UKRA 4BVPA 3TPQA 1K8KB 4LC9B 3IFRA 4MO5A 4BR7A 4BG8A 5KQ8A 5AQKA 1S22A 2E2OA 1EQYA 3CJ9A 2AP1A 2FLOA 3B8AX 1NMDA 3U9DA 4XH5A 3WQUA 2P9SB 3L0QA 3CJAA 2Q31A 3FGUA 3FZMA 3WXLA 1NGGA 3WUHA 3SMPA 3EKUA 1CZAN 3HI0A 2W40A 3RSEB 1ATNA 4BRHA 5LJWA 4BR4A 3BP8A 4FWMA 3CIPA 4H5NA 1QZ5A 3HSCA 1C0FA 4H5VA 3ZEUA 3IMXA 3CETA 1XC3A 3FZLA 1BWFO 5KQDA 3HZ6A 4DHYA 3MDQA 5KPTA 2QXLA 2BTFA 4Y0WA 3O1WA 4I6MA 4BREA 1NWKA 3H1QA 2PBDA 4HTLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2A6AA 4FM0A 1W7AA 4WQ5C 3HVTA 4FZYA 1C55A 1W2BM 1IBKK 2LY6A 3FR0A 5E41A 2VCPA 1D5AA 2QEXN 4OX9K 1WN7A 4DV4K 4KB0A 1NGIA 4FVMA 5LMUK 5JMVA 2PAVA 2QK9A 2P9KA 2DTUA 4B1ZA 1TAUA 1MA9B 4BG9A 3F73A 5HRNA 3SQ0A 1POIA 1ZBLA 2P51A 1ZUTA 4M3TA 1BUPA 4C1NI 4EP5A 1TK8A 2ITGA 2GUPA 1HYSA 3VQQA 3VEOA 1K8KA 3RWUA 3AARA 3I56N 2GEMA 3WEEB 3HPGA 4CEOA 3KK3A 4CGHA 5AQTA 4DQ8A 3S3MA 4F2SA 3VGKA 3SUQA 1RT4A 3DXMB 4FJLA 3CCQN 5F1XA 5K14A 1HMVA 1YAGA 4UY8O 2P1JA 4OKJA 3MXIA 4O44A 4CK1A 2DFHA 4WYBA 4BGAA 1ZBHA 3Q7CA 1JLAA 2BE2A 4K25A 4DSFA 3UIQA 1BCGA 4M3YA 3ISNC 4FWOA 1QQCA 3LDQA 3KOWA 3TR8A 3AGKA 4Z0UA 1VQ7N 2HW3A 2HHWA 3FLCO 2A1RA 1WAJA 2O8FA 1NKBA 3QFPA 3NE6A 2E8AA 4BWMA 3OYFA 3AVAA 4M3UA 1R59O 4FLXA 3IRXA 4KHYA 1EX4A 3KVGA 3HOTA 4JV5K 3TSQA 2G8VA 1RBTA 3BZKA 4DFMA 1XHXA 5AQZA 1OKJA 3O8MA 4JI6K 1KSPA 3AA5X 1I2VA 2KYQA 3KLGA 1IG8A 4KHWA 4DQPA 4CQKA 1TYQA 4IOCL 2HBJA 3JS6A 4HVJA 5C2DA 1GOAA 2HHSA 1E4GT 1ZYVA 1BQMA 3U9ZA 2VG5A 1GLLO 1W9HA 4ISGA 3HM8A 4ISFA 1LQQA 1QQMA 3VN5A 3OYIA 3CJCA 3LDOA 4NCAA 3V81A 3DLGA 3ULEA 2VG7A 1S1XA 3L3VA 1IV0A 3OA9A 4GKKK 2P9PB 4JK7A 2UUAK 1SV5A 1TKZA 1YJNN 5C0YA 4CZHA 3D45A 4J2BA 4KPYA 1VQ9N 1QSSA 4AM7A 3CW4A 2JWLA 3S9HA 4H0XB 4B3OA 3MK6A 3N4QA 3TTDA 3MEGA 5GINA 1JL1A 4O0IA 4CF1A 3NDKA 1HYVA 4DSLA 4NYNA 4E1MA 4AHVA 4JS4A 3NH0A 1ZYWA 2OTJN 3DLEA 4ISEA 3EE8A 1NK4A 3ULDA 1MU2A 2O8BA 4CJVA 3UKUB 1Z6RA 4JI8K 2WFBA 5BRHA 2BDPA 4BDYA 4HCBA 4NLCA 1ZBFA 2V7YA 3EEQA 3LZIA 1KFSA 4B3MK 3PUFA 4JKFA 4B9LA 4JKEA 3LL3A 1OVYA 4CJ7A 4DUYK 3OS2A 1K8AO 4B9SA 2F96A 3ZLJA 1FJGK 3LDSA 1MWMA 2EWSA 3ZYYX 1GLCG 1GLAG 5AQWA 2NRRA 4FVUA 4CZFA 1OH7A 3LZJA 3KOZA 4PA1A 4BRLA 4YY3K 2IAJA 3QNNA 2GX9A 4XIUA 1ZC6A 3CFPA 3VF6A 2HMPA 1EKEA 4E1NA 2A41A 4LY7A 2P9IB 3TAPA 3AVJA 5E26A 4UAEF 4CIGA 4DSJA 2UXDK 4B8CA 1LAWA 1KLNA 4CEZA 3LP3A 1PTXA 4CFBA 1KD1O 3L8BA 2D5RA 2V51B 2NRXA 3CM5A 3CQYA 2CH6A 4H03B 4JI4K 1XNRK 4LF4K 3P1GA 1WUAA 2E2QA 3RTVA 3O9UA 5J2NA 5MLCQ 1YI2N 4C8LA 4DF4A 1NK9A 4Z4EA 3AO1A 2D0OA 3WEEA 5CE3A 2VY6A 1ZFUA 4BR5A 1RT7A 3DLLL 1K73O 4J2EA 3TAFA 4UADE 2EX3A 3L2RA 2KFNA 3AA4A 4N41A 5GAHP 2F9TA 4CZLA 2HVHA 3L4IA 3C7NA 4IFEA 1TL3A 4F8RA 2ZJRL 1VK0A 1RT6A 4H5WA 3CCMN 2E20A 4M63C 3CCSN 2G8HA 4CJ4A 4KREA 2HHHK 4DR7K 4H0PA 3E66A 4JKAA 4OJRA 3IKMA 4BRGA 3ZT4A 4FYDA 3A5MC 2JGUA 4E7LA 4BQLA 3VEVA 2P5OA 1TUUA 3LM9A 1ZBIA 2KLAA 2V52B 3E01A 2I7NA 3AAPA 3SJHA 1EETA 4PY5A 2E4LA 5M1PA 5JVHL 3RVCA 4ZTJA 1S5JA 3H3NO 1RILA 2UUBK 1NK8A 2Z1GA 4FWSA 4YNQA 5GADP 1R0AA 1NLVA 3SUPA 3J80O 3AVBA 2OPRA 3V9SA 3RRGA 4EZ6A 1NGAA 5C24A 3A0IX 3HT3A 5AQQA 2GV9A 2D0BA 3NH1A 1NMNA 2YEOA 3VEWA 4DF8A 4ELUA 4FK0A 1BHLA 1PE4A 1IO2A 3BEXA 1N8RO 2FF6A 3MX5A 4DQRA 3VEXA 3ZT3A 2YHYA 4ZHRA 5BPNA 3DRPA 1ASWA 1FH3A 3CD6N 4BRFA 1K6YA 1KCFA 1UGLA 4GVMA 1EP4A 1S1UA 2NRVA 4JNEA 4OGEA 1JCGA 2JDQD 3BGRA 5ELZA 1NRAA 1XRSB 4FL9A 4QS8A 4RW7A 2P9NA 4DMNA 3ALYA 3R8EA 2RN2A 5CYQA 5CY4A 3IS9A 2ATQA 2DY4A 4Q0BA 4IG3A 3O80A 3TAMA 1V4SA 4X64K 3LDLA 4A57A 4ZTFA 5LMNK 4K41A 4OPAA 4EIAA 2X74A 3A8YA 2P9KB 1RNHA 4FJIA 1IH7A 3H08A 5EXWA 3CCLN 2QWRA 4ILHA 2KSKA 1Q9XA 4CZIA 3QETA 1JXEA 5DK5A 3V1RA 2OTLN 1EWQA 4ICLA 1KAYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2A6A A;  4FM0 A;  1W7A A;  4WQ5 C;  3HVT A;  4FZY A;  1C55 A;  1W2B M;  1IBK K;  2LY6 A;  3FR0 A;  5E41 A;  2VCP A;  1D5A A;  2QEX N;  4OX9 K;  1WN7 A;  4DV4 K;  4KB0 A;  1NGI A;  4FVM A;  5LMU K;  5JMV A;  2PAV A;  2QK9 A;  2P9K A;  2DTU A;  4B1Z A;  1TAU A;  1MA9 B;  4BG9 A;  3F73 A;  5HRN A;  3SQ0 A;  1POI A;  1ZBL A;  2P51 A;  1ZUT A;  4M3T A;  1BUP A;  4C1N I;  4EP5 A;  1TK8 A;  2ITG A;  2GUP A;  1HYS A;  3VQQ A;  3VEO A;  1K8K A;  3RWU A;  3AAR A;  3I56 N;  2GEM A;  3WEE B;  3HPG A;  4CEO A;  3KK3 A;  4CGH A;  5AQT A;  4DQ8 A;  3S3M A;  4F2S A;  3VGK A;  3SUQ A;  1RT4 A;  3DXM B;  4FJL A;  3CCQ N;  5F1X A;  5K14 A;  1HMV A;  1YAG A;  4UY8 O;  2P1J A;  4OKJ A;  3MXI A;  4O44 A;  4CK1 A;  2DFH A;  4WYB A;  4BGA A;  1ZBH A;  3Q7C A;  1JLA A;  2BE2 A;  4K25 A;  4DSF A;  3UIQ A;  1BCG A;  4M3Y A;  3ISN C;  4FWO A;  1QQC A;  3LDQ A;  3KOW A;  3TR8 A;  3AGK A;  4Z0U A;  1VQ7 N;  2HW3 A;  2HHW A;  3FLC O;  2A1R A;  1WAJ A;  2O8F A;  1NKB A;  3QFP A;  3NE6 A;  2E8A A;  4BWM A;  3OYF A;  3AVA A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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