2QWRA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the amppnp intact form
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 118
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwrA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwrA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwrA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwrA04
3RSEA 3U9DA 4CZMA 2UYTA 5AQIA 3O6WA 2QWNA 3A5MC 4IJNA 3SMSA 1NGEA 4IWVA 4M63C 3O08A 3MN5A 3A5LC 2P9NB 3QB0A 4QS8A 4CBXA 3IFRA 2A41A 4CZGA 2PBDA 5EXWA 2A40A 4BR4A 1TUYA 2V7YA 3AAQA 5JLFA 1ZBSA 3LL3A 1YAGA 3CJCA 3DXKB 3FR0A 5F0XA 4FWSA 4MO4A 4JD2A 3VGMA 1SAZA 2AP1A 4CJ7A 4H0VB 3UE5A 2ZGZA 3VEYA 1RFQA 5BREA 2VWBA 3H1VX 4XEIA 3R6MA 3CJAA 3U9ZA 5FPNA 1LCUA 3UKUA 5JMVA 5AZJB 3M1FA 2ZF5O 3LM9A 3ZETA 1NGAA 5AZIB 3SLCA 4FOIA 4M7XA 4AM6A 3SJHA 3L4IA 4H5VA 1IG8A 1X3NA 2D0OA 5BPNA 4QS7A 2Q2RA 1C0GA 3VGKA 4DCHA 3G25A 5AQUA 3VETA 4NO7A 3VF6A 4ISEA 3F9MA 3WXIA 1YVNA 2IVNA 3TPQA 3AY9A 3H3NO 5ADXA 2E1ZA 1QQMA 3D2FB 5AQSA 2QWOA 3QFPA 2HMPA 1NGIA 1DEJA 4JNEA 4B1UB 4WYBA 2Q0UA 4K41A 2IVPA 4HWIA 4BRQA 3A5OC 5TKYA 2YJEA 4BQZA 2D0PA 1Z05A 3MMVA 2ASOA 5EOYA 5F2RA 3VEVA 3GE1A 2CGKA 1V4TA 4O5FA 1SZ2A 4PKGA 3VESA 4BRKA 1NGBA 1XUPO 3KHYA 3FLCO 1QQNA 4FWLA 4BRLA 2YI1A 4A2BA 4IJAA 4PL7A 4EFHA 3O4WA 4FWPA 4B1VA 2P9IB 5KQ8A 1BA0A 3DJCA 1TYQA 1CZAN 3RSEB 3VEZA 1WOQA 1KXPA 5AQYA 3DXMA 3WT0A 1GLBG 3CJ1A 2D1KA 4H0TB 4JHDA 5JLHA 1QZ5A 3SK3A 3VF4A 3HSCA 4Z94A 3ENOA 3VERA 1GLAG 4FOEA 4FWOA 3D2EA 4B1WB 2A3ZA 3ZEUA 1S22A 3I33A 1U6ZA 3H6EA 3O1WA 3BF1A 3HTVA 4FO0A 4BRCA 5KQDA 2HOEA 4JD2B 4A2AA 5BN8A 1NWKA 1HPMA 3FZFA 3HBTA 2FLOA 3FZKA 2PAVA 1JCGA 4Y0WA 4RTFD 4BRFA 3IDHA 1SQKA 3UKUB 2IVOA 4ISGA 3H45C 2HF3A 3WXLA 3ZETB 5AFUA 1LOTB 4PKHA 1GLEG 3O1BA 1NGCA 1BOTO 4FWNA 1RGIA 1HKGA 2QWLA 3FZMA 1Z6RA 4HTLA 4BR9A 4BRNA 3GDQA 1IJJA 4H03B 4FSVA 5BRHA 4BR7A 4FWMA 2P9LA 5LJWA 4BRPA 4IXCA 2F9WA 3CJBA 3H1QA 3TU5A 3AARA 1NGJA 4BRGA 1DKGD 1NM1A 2WUSA 3L0QA 1BWFO 3ENHA 4CZJA 3MN9A 4O8KA 3ATUA 3UKRB 5AQHA 2P9UB 1BG3A 2A6AA 2YHYA 3MCPA 2V7ZA 2IIRA 4A61A 4WQ4A 2QWPA 3OHRA 4WQ5C 3LDPA 4BREA 1QHAA 2AA4A 4B1XB 1TYQB 1NGDA 3VOVA 5AQXA 2V52B 4J8FA 5EVZA 2ZGYA 3DXMB 3VEWA 4MLHA 2E2NA 4B9QA 4JHDB 3C7NA 3U8XA 2Q97A 3JS6A 3HM8A 3FFKB 3WEEB 3WQUA 1NGHA 4XH1A 3W3DA 2GUPA 3D2EB 3BP8A 4BVPA 5CE3A 2I7NA 2FSJA 3A0IX 5AQQA 3ZEUB 3GL1A 5AQOA 1NLVA 5AR0A 3QBXA 2FF6A 4LC9B 2A5XA 1K8KA 3ID8A 1NGFA 1J6ZA 3CERA 3VF2A 4BVOA 2HF4A 3FZHA 4CD1A 3VPZA 3GOIA 1D4XA 1U2VA 4CD3A 5EX5A 5ELZA 3ZX2A 1C0FA 3CJ9A 3CQYA 4C23A 2I7PA 4BGAA 3WUHA 1P8ZA 5AQFA 1GLLO 3H46O 2GELA 1YUWA 5ADXH 2CH5A 2VCPA 4I6MA 5FPMA 2KHOA 4FPBA 4NB4A 2P9LB 4GNIA 3O8MA 4JN4A 4DB3A 1ESVA 5AQMA 2QXLA 1V4SA 3KVGA 3LDOA 3FZLA 1R59O 3DAWA 1ATNA 4BRAA 4H5RA 3VENA 3VEOA 5LY3A 3FGUA 4DHYA 4CBWA 2NZTA 3QMLA 2P9SA 4BR0A 5KPZA 3BEXA 3CIPA 2DPNA 3EO3A 5FPDA 2ASPA 2YCHA 3H3OB 4KBOA 3CJ7A 4BRIA 1BUPA 5AQPA 4M7YA 1HJOA 2E20A 4FWQA 3LDLA 3WXJA 3A8YA 1DGKN 1XQSC 3KZBA 2CGLA 4BC4A 3QFUA 2GTDA 2OANA 1MDUB 4CBUA 3C7NB 4CZLA 3VGLA 5BPMA 1BDGA 3J8AA 5AQGA 1GLJO 2ITMA 5LJVA 3D7EO 1NMDA 4FWKA 3ATVA 2QWQA 3HI0A 5AQKA 4EHTA 2QM1A 3EN9A 3MN6A 3AAPA 2Q31A 4K43A 1K8KB 3CI5A 1TUUA 3P4IA 4BG9A 5AFUH 3O80A 2QWMA 4EAHD 1ZXOA 4K42A 1KAYA 2EWSA 3ZX0A 1U2VB 1OKJA 2P9KA 3CHWA 3GG4A 4BROA 3VEXA 3FE1A 4H0OA 4XH5A 5BRDA 3EZWA 2GWJA 3LDQA 1H1VA 5AQRA 1ATRA 4XH4A 3MN7A 3GBTA 4CZFA 3WQTA 1KAZA 5FPEA 4I6MB 3HZ6A 3IMXA 2V51B 3M6GA 4BGBA 4RCHA 2J4RA 2FF3B 1BO5O 1GLDG 1T44A 1X9JA 2D4WA 2YJFA 4H0YB 4B1ZA 4EIAA 1BU6O 2NRHA 2FSNA 5E26A 1QQOA 3R9PA 1JCEA 1X3MA 1T6DA 1EQYA 5AQWA 3MK6A 3S41A 1YXQA 2P9PA 3I8BA 1WUAA 1GLFO 2P9SB 2CH6A 4PKIA 3C0BA 1E4GT 1ZC6A 4BRDA 4CZIA 4CZEA 4RWTA 4MO5A 3ULEA 3CETA 5KPRA 1HKBA 5EY4A 4YDUC 2GWKA 3A5NC 4BRMA 3IUCA 3QICA 4H0XB 2QW9A 4QS9A 3MDQA 4BR2A 1G99A 3W0LA 2ZWHA 3ZX3A 4K25A 1HKCA 2CGJA 1MA9B 4DQ8A 5JICA 5KPTA 2P9NA 1T6CA 5BR9A 5BPLA 5AQVA 2W41A 4IO8A 4MLEA 3WXKA 4EHUA 3QDKA 1Q18A 3DWLA 1HX1A 2A42A 4GY2B 4A62A 4ISFA 3CQXA 2BTFA 2FSKA 5AQTA 1JCFA 3DXKA 4FPAA 3R8EA 4CZHA 1NGGA 3UKRA 4JAXA 1S3XA 2P9UA 2Q36A 1QZ6A 4BRHA 1E4FT 4H5TA 2E2OA 3BF3A 4BR5A 5E84A 2GEMA 4WQ4C 5AZJA 3JXUA 2YHXA 1HLUA 3O5BA 2P9KB 5AZIA 5AQNA 4FWRA 3M3ZA 4BG8A 4BC3A 5AQLA 2W40A 1HUXA 3SMPA 5B8HA 3U4LA 1XC3A 4E1JA 4H0PA 4WQ5A 2YHWA 1BA1A 1KAXA 3WEEA 2VYPA 1MWKA 3EL2A 4F9OA 3EKSA 5AQJA 4CZKA 3D2FA 3LM2A 4H5WA 4BC2A 3BUZB 2QWRA 5F1XA 1Y64A 4CI6A 4PL8A 2NLXA 2ASMA 5AQZA 4AM7A 4BQLA 2E2PA 1MWMA 1ATSA 2E2QA 4L3QA 4B1YB 2P9PB 4IZ9A 1NBWA 4H5NA 2E88A 2Q0RA 3EKUA 2Q1NA 1GLCG 2BUPA 4YDUA 4BC5A 3LDNA 2FXUA 4FL9A 3ULEB 1RDWX 2H3GX 5BRFA 3UB5A 2P9IA 2E1YA 3QBWA 5I9EB 2E8AA 5BN9A 2F9TA 3L6QA 3B8AX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IKXA 1IO2A 5BR8K 1N4NA 4OVLA 4M3ZA 2QWNA 5LMNK 2M8BB 4IWVA 4M63C 3K57A 4QS8A 3A5LC 4JI7K 1TUYA 3CD6N 4B9TA 3ZCMA 5F0XA 4CF0A 3OBYA 4FWSA 2OPQA 1XNRK 3DRRA 4A5BA 4H0VB 3VEYA 4JKAA 3WNEA 1RFQA 2ETJA 3DRSA 1RBVA 1DTQA 3U9ZA 3UKUA 2HBMA 2FBXA 5AZJB 3M1FA 3AVFA 4AQYK 3THXB 3KHWA 5AZIB 3SPYA 2XY8A 3KTQA 4M7XA 1EX4A 3SJHA 3L4IA 1T0ZA 4CHYA 4DCHA 4UQGA 3G25A 4FJIA 1ILYA 1K73O 1I39A 3VF6A 2G8KA 3L2QA 2O8FB 3WXIA 2IVNA 1VQON 2QI2A 4CJQA 5ADXA 1QQMA 3D2FB 3NCIA 3M8PA 2VG5A 2P5GA 4FM0A 3M5RA 3QFPA 2D5RA 3WXMB 3KWIA 4F3TA 4JNEA 1VSKA 3O9QA 4WYBA 4B1UB 1GPTA 4YOWA 3TANA 4K41A 3K59A 3SJJA 1KLNA 2YJEA 4BE7B 3MMVA 1N32K 3OYJA 2G2KA 3C6TA 1KVCA 1NNEA 4FLZA 4J2EA 1C55A 4HE7A 4PKGA 2LI7A 3VESA 4BRKA 2PYJA 4IJAA 1WMTA 1T7EA 1SV5A 5JVHL 3NGYA 2WFBA 4E19A 3TWHA 2KTQA 1B9DA 1TYQA 1CZAN 2ASCA 4K8ZA 3AGKA 1WOQA 3I0SA 4BE1A 5M1OA 5AQYA 1GLBG 1VSLA 2PY5A 4DQRA 5JLHA 1Q7YO 4I9LA 3KK2A 4Z94A 4LH4A 4FOEA 3D2EA 4B1WB 4BACA 2X6SA 3K9KA 3ZEUA 4A57A 2O8CA 1YHQN 4CJKA 4M3WA 3VA0A 3H6EA 3BF1A 5KQDA 4JD2B 4A2AA 1NWKA 1HPMA 1LQHA 4RTFD 2FC0A 3CCVN 4ISGA 4GV9A 5A2QO 2HF3A 3O9TA 2QEXN 2KFNA 3JYTA 1GLEG 5LMUK 3MEGA 1NGCA 1HKGA 4CJEA 1HR0K 3FZMA 1NJWA 2B3CA 4BR9A 4FLXA 3GDQA 4FSVA 4YFUA 3RRGA 4FJNA 4AILC 1VAZA 4FVUA 4BRPA 3NE6A 1P00A 3AARA 4M3TA 4KRFA 1NGJA 3C6AA 4DR3K 5IT9O 1CLQA 3OW2M 3K0SA 4RW6A 2N69A 2I61A 2P9UB 3B6PA 2R7YA 4O55A 3MCPA 5TKWA 2IIRA 4N5SA 1D5AA 4JKGA 1L3TA 3VA3A 2QWPA 2LT8A 3NDKA 4WQ5C 2B68A 3LDPA 2AA4A 1NKEA 5HRSA 2NRXA 2FBYA 3LZIA 3EEQA 4PY5A 2V52B 2ZGYA 4JHDB 3K5LA 1HQUA 2Q97A 3Q7BA 3KJVA 4DWIA 3VQBA 1BCGA 1J9AA 4GV6A 4XH1A 1ZBHA 4BVPA 1NKCA 3RMDA 5AQQA 1HRHA 1ASWA 3GL1A 5HRPA 1L5UA 3TARA 1LW0A 2A5XA 1K8KA 3ID8A 2ZJPL 3HRGA 3CERA 5HRRA 1QSSA 1EO1A 2KBJA 5GIPA 3V9XA 4CJ3A 3VPZA 3GOIA 1U2VA 3KKSA 4J2DA 4AHUA 3MEDA 4CHQA 3CJ9A 3E9OA 1CXQA 1LV5A 3VQ8A 1GLLO 1W2BM 3THYB 1TK5A 4RG8A 5GIOA 2UUAK 3SAFA 1YF5L 1RDBA 1S1XA 1WSGA 5DM7L 4NB4A 2P9LB 4C8NA 1Q8IA 4E7HA 1V4SA 1K8AO 2XHBA 2E6MA 1R59O 2YKNA 4YOTA 2LY5A 4KPYA 3VQ9A 2KYQA 4CBWA 3M8RA 2NZTA 4BR0A 4C8MA 2DPNA 3TSPA 3DOKA 3AVIA 3D0PA 4O0JA 2ASPA 1BUPA 5AQPA 4M7YA 2G8IA 1HJOA 2E20A 1VRUA 3VQQA 3HOSA 3A8YA 2E5LK 2CGLA 4DTXA 1TK8A 4KO0A 1N36K 4UAFE 3K58A 2HHIA 1MDUB 2OPSA 4CBUA 3N4QA 2HW3A 5GAEP 1S1VA 3VGLA 5BPMA 3MXIA 4ELUA 5AQGA 1TL1A 3D7EO 3QO9A 3G0ZA 3ATVA 2YILA 4HUEA 3HI0A 1ZYVA 2QM1A 3QNOA 2G8FA 3ASMA 4DR7K 1VNAA 4HCBA 2KW4A 3CI5A 2ZJQL 1ZYQA 4CQKA 3ZT4A 1TUUA 4IO9L 4FLYA 4JEPA 2O4GA 3CF5L 4JI3K 5AFUH 4EAHD 1ZXOA 3AGRA 2NRRA 1P90A 2HSTA 2QK9A 4JS4A 4XH5A 4LD0A 3SUOA 3EZWA 4B3TK 1FKPA 1Q9XA 4Z4CA 4XH4A 3WQTA 1KD1O 3NFAA 5C12A 5KGXA 3H08A 3SV3A 1D9FA 3HP6A 1VSIA 1VQLN 2OA8A 3AVGA 3MAQA 1BO5O 5CYMA 4B3MK 1FK9A 2NRHA 1S1TA 2FSNA 4CFAA 5E26A 1IBMK 1JCEA 2QA4N 1X3MA 4FM1A 5AQWA 4IKFA 3QEWA 1YXQA 1JZAA 2RHKA 1WB9A 4W5TA 1C0MA 3U3YA 4JK8A 1ZC6A 1UOCA 4RW7A 4B9SA 5KPRA 3CETA 2IAJA 4CEEA 2HBLA 4JS5A 2E2FA 3IUCA 4LF4K 3QICA 1HYVA 3P31A 2JDQD 1IBKK 2JWLA 5J2MA 3AO2A 4DU3A 2CGJA 1MA9B 3NH2A 5H1SQ 3C6UA 1TKXA 1NK9A 5KPTA 4X66K 1PTXA 2P9NA 4J2AA 5BPLA 4IO8A 4IEEA 1Q18A 1HX1A 3CPEA 2A42A 4WFBL 4A62A 1OH8A 2BTFA 1T03A 4K0KK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IKX A;  1IO2 A;  5BR8 K;  1N4N A;  4OVL A;  4M3Z A;  2QWN A;  5LMN K;  2M8B B;  4IWV A;  4M63 C;  3K57 A;  4QS8 A;  3A5L C;  4JI7 K;  1TUY A;  3CD6 N;  4B9T A;  3ZCM A;  5F0X A;  4CF0 A;  3OBY A;  4FWS A;  2OPQ A;  1XNR K;  3DRR A;  4A5B A;  4H0V B;  3VEY A;  4JKA A;  3WNE A;  1RFQ A;  2ETJ A;  3DRS A;  1RBV A;  1DTQ A;  3U9Z A;  3UKU A;  2HBM A;  2FBX A;  5AZJ B;  3M1F A;  3AVF A;  4AQY K;  3THX B;  3KHW A;  5AZI B;  3SPY A;  2XY8 A;  3KTQ A;  4M7X A;  1EX4 A;  3SJH A;  3L4I A;  1T0Z A;  4CHY A;  4DCH A;  4UQG A;  3G25 A;  4FJI A;  1ILY A;  1K73 O;  1I39 A;  3VF6 A;  2G8K A;  3L2Q A;  2O8F B;  3WXI A;  2IVN A;  1VQO N;  2QI2 A;  4CJQ A;  5ADX A;  1QQM A;  3D2F B;  3NCI A;  3M8P A;  2VG5 A;  2P5G A;  4FM0 A;  3M5R A;  3QFP A;  2D5R A;  3WXM B;  3KWI A;  4F3T A;  4JNE A;  1VSK A;  3O9Q A;  4WYB A;  4B1U B;  1GPT A;  4YOW A;  3TAN A;  4K41 A;  3K59 A;  3SJJ A;  1KLN A;  2YJE A;  4BE7 B;  3MMV A;  1N32 K;  3OYJ A;  2G2K A;  3C6T A;  1KVC A;  1NNE A;  4FLZ A;  4J2E A;  1C55 A;  4HE7 A;  4PKG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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