3ATUA

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp- and mg ion-bound state
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3atuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3atuA04
5AQTA 3WEEB 4YDUC 2P9PB 4A61A 1GLCG 5JLFA 3I8BA 3EL2A 4JNEA 4BC5A 4K43A 2FSNA 4JHDA 3QMLA 5FPDA 5AQOA 1NGAA 3A5LC 3VPZA 4FWMA 1BU6O 1H1VA 3C0BA 5ADXH 2NRHA 4B1VA 4Y0WA 1WUAA 3D7EO 3TU5A 4H0OA 2YJFA 3CJ7A 4BRFA 4CI6A 4BC2A 3M1FA 2A5XA 3GBTA 3GOIA 3H3OB 1P8ZA 3MK6A 4QS7A 5ELZA 4BRGA 1NMDA 1X9JA 4XH1A 3BF1A 5AQPA 3LDNA 1V4TA 2A6AA 3QB0A 1YVNA 5E84A 2QWNA 3SJHA 4BRAA 3WQUA 1NGFA 2P9IA 3F9MA 2P9UB 4BR4A 3ULEA 4CBUA 4CZGA 4EFHA 2ASOA 3EZWA 3C7NA 4BR0A 2IVOA 2E8AA 2GEMA 4IZ9A 5AQVA 4H0XB 4B9QA 2HMPA 3WEEA 4YDUA 3RSEB 1HKGA 4K41A 2D0OA 3UKUA 2UYTA 2ZWHA 5E26A 1Y64A 2QXLA 3QFPA 5AQXA 2VYPA 1XUPO 3O4WA 5EOYA 2YI1A 1MA9B 1KAZA 2P9LB 3GE1A 3VEWA 2D1KA 2FSKA 3ZEUB 2GWJA 1DEJA 4FSVA 3KZBA 2ZGZA 2Q2RA 1KAXA 4M63C 1K8KA 1J6ZA 1HKBA 2E20A 1JCFA 4XH5A 1U2VB 3AY9A 5AR0A 2FF6A 3LM9A 2E2QA 4CZMA 4A2BA 4NO7A 5AQHA 3L0QA 4FL9A 3LDOA 3DXMB 4FWSA 3DJCA 5BPLA 3VESA 3QICA 4FWOA 3VERA 3AAPA 3IDHA 1NGJA 3IMXA 2IVPA 3P4IA 4IWVA 2V52B 3FZLA 2QM1A 1CZAN 4BRLA 3WXKA 4C23A 4BC3A 3M6GA 5BN8A 3RSEA 4FOEA 1RGIA 3EN9A 1BG3A 3H45C 3WT0A 3VOVA 4KBOA 1GLBG 3UE5A 2E2NA 3MCPA 3CQXA 1NGHA 2KHOA 1T44A 4HTLA 3BF3A 4B1YB 1NBWA 2YCHA 1NWKA 3EKUA 3VEVA 2FXUA 4H5RA 2P9LA 1LCUA 4XH4A 2A3ZA 3ZEUA 3CJAA 4IJAA 3VEXA 1NGCA 4AM7A 1S22A 3JS6A 2QWOA 5AFUH 2AP1A 5LJWA 3QBWA 3CIPA 2BUPA 3SMSA 3D2FB 1HJOA 4BC4A 1ATNA 4BG9A 3C7NB 1QZ5A 3DWLA 4H0TB 5EX5A 3QBXA 2PBDA 2YHYA 4RCHA 2DPNA 4IO8A 3ENHA 4NB4A 3DXMA 3UKUB 5KPTA 3GG4A 5JMVA 3VEOA 1NLVA 3A5MC 5BPNA 2ASPA 3LDPA 4BRKA 5AQJA 4BR2A 1NGIA 2HF3A 3O6WA 2I7NA 3FGUA 1Z6RA 4O8KA 4M7XA 1Q18A 4JD2A 1KXPA 3OHRA 1K8KB 5LY3A 2E2OA 2QWPA 3MN6A 1MWKA 5BPMA 5AQKA 4FWPA 5B8HA 3GDQA 5AQZA 4FWKA 3ZX2A 1ATSA 3MDQA 3SK3A 1G99A 2V7YA 5CE3A 2Q36A 2QWLA 4BRMA 2FSJA 2ASMA 5TKYA 2Q97A 4H0YB 4I6MB 4PKGA 3R6MA 1NM1A 5F0XA 1NGBA 2YHXA 4H5NA 2GUPA 4IJNA 1TYQB 3ATVA 4GY2B 3D2FA 2D0PA 2GELA 3ZX0A 3VGMA 5AQSA 3S41A 5AQWA 2Q1NA 4JN4A 3FZKA 2GTDA 3R8EA 2E2PA 3U9DA 4ISFA 3LM2A 5AQMA 3CJCA 4DQ8A 5AQQA 5FPEA 1NGGA 2W41A 3FZMA 1BWFO 3AARA 5I9EB 4BRDA 5AQIA 3VETA 4CJ7A 1HPMA 3U8XA 3O1WA 4BGBA 1ZBSA 2IIRA 3MN9A 3HM8A 3VF6A 4QS9A 5F2RA 4WYBA 3H1VX 1V4SA 5AQYA 3DXKA 4CZJA 1BA0A 1XC3A 5KQ8A 4CBXA 3EKSA 3CETA 4B1XB 3B8AX 1BA1A 4L3QA 2F9TA 4MO4A 4I6MA 5AZJA 3MN5A 1DGKN 5F1XA 1E4GT 2P9SB 2ITMA 1TUYA 3A0IX 2E88A 1X3MA 2IVNA 4CZFA 1TYQA 2QW9A 3I33A 5AQLA 3G25A 3LDQA 1SAZA 3IFRA 4BRNA 2V7ZA 3CJ1A 5BN9A 4PL8A 3FE1A 4BR7A 1QQNA 4JD2B 3WUHA 3ZX3A 2FF3B 4FPAA 3D2EA 3SLCA 4PKHA 1SQKA 2P9NB 1QZ6A 3VEZA 4LC9B 4E1JA 2AA4A 4EIAA 3O8MA 1NGEA 3CQYA 1YUWA 3ZETB 4B1ZA 4BREA 1JCGA 3CJ9A 1GLLO 2W40A 4MO5A 2CGKA 4EAHD 4M7YA 1C0FA 3J8AA 3W3DA 1ZXOA 1ESVA 2CH6A 4BRCA 1QQMA 5AQGA 4DHYA 2Q31A 3QFUA 5EXWA 1GLJO 1KAYA 4BRHA 3ATUA 4BQLA 4BQZA 4CD1A 3BUZB 2YJEA 2VWBA 3QDKA 4BVOA 2CH5A 5KPZA 3O1BA 4JAXA 4CZIA 5LJVA 2P9SA 2VCPA 3LL3A 3KVGA 2H3GX 1DKGD 1D4XA 4FO0A 2FLOA 3WXLA 4A62A 4WQ4C 2QWMA 3LDLA 5ADXA 2PAVA 5FPMA 3H6EA 1WOQA 4EHTA 2NLXA 2YHWA 3IUCA 4BRIA 5AQUA 2P9NA 1RFQA 4B1UB 4QS8A 5BREA 3W0LA 3DXKB 3CJBA 3FZFA 4FWNA 3O08A 3WXJA 5AQNA 3U4LA 3O80A 4K42A 1U6ZA 1LOTB 3L6QA 3ZETA 2E1ZA 4DB3A 4FPBA 5AZJB 1NGDA 2OANA 5BRDA 5EY4A 1TUUA 4A2AA 4BG8A 5AZIB 3VF4A 3CERA 4BRQA 2Q0UA 2ZF5O 4K25A 5JICA 4WQ5C 3ENOA 4J8FA 2V51B 2CGJA 3ID8A 1HLUA 2F9WA 3H1QA 1T6CA 3FZHA 4F9OA 2E1YA 1EQYA 3A5OC 3D2EB 3H3NO 4CD3A 3FFKB 1GLDG 4PL7A 1E4FT 1X3NA 1HKCA 3EO3A 2CGLA 3VEYA 1IJJA 1IG8A 4FWLA 2Q0RA 4ISGA 2BTFA 2WUSA 4WQ4A 4BRPA 5KQDA 4XEIA 1BDGA 4B1WB 1GLEG 4BGAA 1XQSC 1T6DA 1ATRA 3TPQA 2HOEA 4AM6A 2P9PA 3U9ZA 3A5NC 1OKJA 1MWMA 3VGKA 4CZKA 1JCEA 3JXUA 3M3ZA 1YXQA 2GWKA 4BR9A 4CZEA 4PKIA 2D4WA 3FR0A 1ZC6A 5KPRA 2QWRA 4BROA 3O5BA 5FPNA 5AZIA 3WQTA 5AQRA 3CI5A 3BP8A 3DAWA 3HI0A 3R9PA 4WQ5A 5EVZA 1SZ2A 2HF4A 1C0GA 1HUXA 3UB5A 3KHYA 3AAQA 3CHWA 3UKRB 4CZHA 1GLFO 2P9KB 4Z94A 1YAGA 3BEXA 3HTVA 1HX1A 4FWRA 3WXIA 3FLCO 4EHUA 4MLHA 4FOIA 1BOTO 2ZGYA 1RDWX 3L4IA 2EWSA 4JHDB 3VF2A 4DCHA 3HSCA 4H0PA 4H5VA 4RTFD 4FWQA 3A8YA 2P9UA 2A41A 4H5TA 1QQOA 3SMPA 2QWQA 4BR5A 2A40A 4BVPA 5BRHA 5AFUA 3HBTA 3GL1A 1MDUB 3MMVA 1Z05A 1BUPA 4MLEA 5AQFA 3MN7A 5BRFA 5BR9A 1R59O 4H03B 4RWTA 1S3XA 3HZ6A 4CBWA 2A42A 2I7PA 1GLAG 3VGLA 1QHAA 2NZTA 4H0VB 5JLHA 4CZLA 4ISEA 3VENA 4H5WA 4GNIA 4O5FA 4IXCA 1U2VA 2P9IB 3ULEB 4HWIA 3UKRA 3H46O 2P9KA 1BO5O 2J4RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CHZA 2HBKA 1J5EK 3GKUA 1KLNA 4CHNA 2FSNA 1T7EA 3QMLA 5FPDA 4AQYK 1OZZA 4FW2A 4RG8A 1RTIA 4KH6A 3SBTA 1IG9A 1H1VA 3LP1A 5HRNA 4Y0WA 4I9QA 2YNHA 4KV8A 1LQHA 4DTSA 2LI7A 2KZZA 4IFVA 3G10A 1YJ9N 2ZJRL 5KTQA 4BC2A 4Y1DA 4E19A 3BZCA 2A5XA 4OLBA 3M8RA 5KRSA 1KQSM 4DV6K 1OVYA 3CYMA 2QEXN 5AQPA 3LP3A 5CYMA 3VQ8A 3P39A 2QWNA 2MBKA 3P5JA 1NGFA 2QXFA 3ZSQA 4FLZA 2YNFA 1ZYVA 2GEMA 2JWKA 3RSEB 3UKUA 4K41A 2D0OA 4DTRA 4KO0A 1HYZA 4E7HA 1XI1A 4DU3A 4J2BA 3TTCA 4E7LA 1Q9YA 2XY5A 4JI5K 1TAUA 3KOZA 1MA9B 3SUQA 4KYPA 3TANA 2FSKA 3KZBA 3VQDA 4PA1A 4CEBA 4UY8O 1KAXA 4M63C 4CFDA 2WOMA 4Z4GA 1WSJA 1ITGA 2E20A 3AVCA 3M5RA 1R0AA 4DR7K 1U4BA 1CZBA 4OJRA 2RF2A 2KQ2A 4CZMA 3PO4A 5AQHA 3NVMA 1GPSA 4IOXA 4CJVA 4HCCA 3T69A 1Z25A 4FWSA 1KFSA 4PY5A 2O8BB 4DTXA 4FWOA 4CJFA 4B9LA 3O9RA 1TKDA 3FZLA 3R2VA 4H4OA 4C23A 4A57A 3M6GA 5BN8A 3OYKA 3BZKA 4ELTA 3V9SA 1WNSA 3EN9A 3H45C 1GLBG 3RR7A 1IH7A 2OCEA 3MCPA 1NGHA 2KHOA 1M90O 4HTLA 4FZYA 3IRXA 2OA8A 4FZXC 5DM7L 4JI1K 1LCUA 5CY4A 3ZEUA 1YHQN 2LY5A 3C6UA 3VEXA 1WBBA 3M8SA 4JKDA 3EZ5A 5AFUH 1FH3A 4F2RA 5J2QA 5LJWA 3KOXA 3L56A 4BC4A 5GAHP 1POIA 3KP0A 3V9UA 1QZ5A 3MXJA 4RCHA 2DPNA 3C6AA 2PFUA 1BCGA 3DXMA 3GG4A 5JMVA 4DV1K 3O3GA 4FJ9A 1NOYA 3LDPA 4E72A 3ULDA 3CG7A 3KKRA 3T1HK 3FGUA 4CJ4A 3CCJN 3QIOA 1VHXA 1K8KB 3K57A 5BPMA 4IG0A 4BEBA 3K9KA 4JKHA 4LFCK 3GDQA 1TK8A 5AQZA 1JL1A 4OLAA 2V7YA 3VMFB 2VGNA 3P83D 2ASMA 5C42A 1NRAA 4PKGA 5M1NA 2OTLN 4DV3K 3MEEA 1NM1A 4DSFA 3TSQA 2N69A 4JKGA 4U67L 1U04A 1NGBA 2YHXA 4KAZA 2GUPA 3TABA 4LF9K 4IJNA 1P90A 1VAZA 2GELA 2D0PA 1NK7A 1C0TA 3PX0A 2GTDA 3R8EA 3CC7N 1XRSB 1RNHA 3CJCA 3VQ4A 4IOCL 2DY4A 5FPEA 3AVKA 1NGGA 2VG6A 3T7ZA 1IKWA 2YNGA 3FZMA 1BWFO 3KK7A 2X74A 4CEQA 3R3LA 1NJIO 2JLEA 4CJ7A 1PTXA 3VETA 1SUQA 3U8XA 2PZSA 4GV6A 1BIUA 4JI2K 3CM5A 1C1CA 1C6VA 3ZYYX 4CZJA 1NK9A 1BA0A 4DV2K 3CETA 3KP1A 1BA1A 4MO4A 2XY6A 1TGOA 3ZSVA 3AO3A 4CIEA 1T7BA 1DGKN 2P9SB 3NF6A 2HHQA 1QSLA 1YT3A 1X3MA 4CJRA 3PX4A 2QW9A 4UAFE 4Z4HA 1RTHA 3LDQA 1FJGK 3KC6A 2HHVA 3CJ1A 1DLOA 1RCHA 1G15A 3FE1A 1REVA 2KLAA 3E01A 4YOVA 4DSKA 3ZT2A 2M8BB 4DWIA 4GMJB 4FYDA 4CF9A 4BACA 4LC9B 4E1JA 1LWEA 1D9DA 4IFEA 3AO5A 1YUWA 4B1ZA 4WFNL 3CCVN 1WBDA 1JCGA 3TAMA 3ZSRA 3ITHA 5JENA 3IS9A 4EAHD 1C0FA 3C6HA 3W3DA 4CJEA 1JXBA 4NXMK 2CH6A 4GVEA 4FJHA 4CJWA 2D0CA 5EXWA 1JLAA 2XY7A 1KAYA 3TTFA 4BQLA 1S6PA 4BQZA 1NNEA 3BUZB 3TTDA 3QLHA 4YFUA 3ZSOA 4CZIA 1DTQA 3LL3A 1LW2A 3VQAA 4MDAA 3RRGA 1DKGD 2NNWA 3HP9A 3AGRA 4FO0A 5M1KA 3WXLA 2QK9A 2QWMA 2LJ7A 4W5NA 2PAVA 3CXCM 1NKCA 3H6EA 4FK2A 4EHTA 2I5JA 2RHKA 3SPYA 4CGFA 4CJTA 4QS8A 4DSEA 1W0HA 3DXKB 3HXMA 4CK3A 1U45A 4DFMA 1CLQA 4UAEF 1OVQA 4K42A 4PHTX 5FLXO 2E1ZA 3KLFA 3VQBA 5AZJB 3K0SA 4JK9A 5BRDA 1C56A 1I2VA 1K73O 4C8OA 1T1TA 5C12A 5EY4A 4LF8K 4BE2A 3V81A 2LY6A 4BRQA 1X9MA 3IAYA 4WQ5C 3ENOA 1IKXA 2V51B 4R5PA 2CGJA 3DRPA 3H1QA 1FW6A 4JYAK 5CYQA 3D2EB 3PSMA 4PL7A 2O8FA 3EO3A 4DQIA 3I56N 4O8UA 3QEXA 2YC1C 4CERA 1IJJA 1N32K 2WUSA 1T7PA 5DM6L 1RDUA 5J2MA 4JKBA 5HL7L 1IBLK 2NY8X 4GVMA 1K8BA 1XQSC 1ATRA 2IDOA 3TPQA 2HOEA 4LH5A 3U9ZA 4DLGA 4LSLA 1VSJA 3NF8A 1BIZA 5KI6A 4FLYA 2GWKA 1ZYWA 5FDLA 4YY3K 4PKIA 3TAFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4CHZ A;  2HBK A;  1J5E K;  3GKU A;  1KLN A;  4CHN A;  2FSN A;  1T7E A;  3QML A;  5FPD A;  4AQY K;  1OZZ A;  4FW2 A;  4RG8 A;  1RTI A;  4KH6 A;  3SBT A;  1IG9 A;  1H1V A;  3LP1 A;  5HRN A;  4Y0W A;  4I9Q A;  2YNH A;  4KV8 A;  1LQH A;  4DTS A;  2LI7 A;  2KZZ A;  4IFV A;  3G10 A;  1YJ9 N;  2ZJR L;  5KTQ A;  4BC2 A;  4Y1D A;  4E19 A;  3BZC A;  2A5X A;  4OLB A;  3M8R A;  5KRS A;  1KQS M;  4DV6 K;  1OVY A;  3CYM A;  2QEX N;  5AQP A;  3LP3 A;  5CYM A;  3VQ8 A;  3P39 A;  2QWN A;  2MBK A;  3P5J A;  1NGF A;  2QXF A;  3ZSQ A;  4FLZ A;  2YNF A;  1ZYV A;  2GEM A;  2JWK A;  3RSE B;  3UKU A;  4K41 A;  2D0O A;  4DTR A;  4KO0 A;  1HYZ A;  4E7H A;  1XI1 A;  4DU3 A;  4J2B A;  3TTC A;  4E7L A;  1Q9Y A;  2XY5 A;  4JI5 K;  1TAU A;  3KOZ A;  1MA9 B;  3SUQ A;  4KYP A;  3TAN A;  2FSK A;  3KZB A;  3VQD A;  4PA1 A;  4CEB A;  4UY8 O;  1KAX A;  4M63 C;  4CFD A;  2WOM A;  4Z4G A;  1WSJ A;  1ITG A;  2E20 A;  3AVC A;  3M5R A;  1R0A A;  4DR7 K;  1U4B A;  1CZB A;  4OJR A;  2RF2 A;  2KQ2 A;  4CZM A;  3PO4 A;  5AQH A;  3NVM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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