3ATVA

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp-bound and mg ion-free state
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
total genus 122
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3atvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3atvA04
1MWMA 4FOIA 1HJOA 3MK6A 3IDHA 3AAQA 3ZEUA 1J6ZA 1BA1A 3MMVA 5AQIA 2P9LA 3TPQA 4FL9A 3HZ6A 4JD2B 4EIAA 3BF3A 4H5WA 2Q97A 1BUPA 1ZXOA 4FOEA 4WQ4C 4L3QA 3HSCA 5AQYA 3O8MA 5B8HA 1ZC6A 2GTDA 4DB3A 3IMXA 3WQUA 4EHTA 4RTFD 3MN9A 2QXLA 3IFRA 4A62A 1NGEA 3HTVA 3O1WA 5ELZA 5ADXH 1NGJA 2EWSA 4PKHA 1S3XA 2FF6A 1MWKA 5KQDA 3O1BA 2FF3B 2GWKA 3DXKB 5AQQA 4CZKA 4BVPA 2QWMA 4K43A 5BPMA 1KAXA 4I6MA 3WXKA 3MDQA 3L4IA 3QFPA 3FLCO 2A40A 3GE1A 4CI6A 1NGBA 3ID8A 3O4WA 3CJ7A 2NZTA 3UKRA 4BRPA 4IZ9A 4FO0A 3BUZB 1NGFA 1QQMA 2IVPA 1NMDA 1QHAA 1C0GA 3I33A 2VWBA 3U9ZA 2BUPA 4A2AA 4BR0A 5F1XA 3GBTA 3CQXA 4B9QA 3A5LC 2QWQA 2A6AA 3BP8A 2FSJA 3VF2A 3SMSA 4JHDB 4BRQA 3VOVA 2VYPA 2Q2RA 2YJEA 1GLDG 1NWKA 1D4XA 2P9NA 4K41A 1ESVA 1JCEA 5AQUA 2P9KA 2QW9A 3AAPA 4J8FA 2PBDA 4H03B 3VGKA 5AZJA 3QBXA 1TYQA 3VESA 5AQHA 2CH5A 3DWLA 5AQFA 3JS6A 4FWKA 5LJWA 2UYTA 1EQYA 4FPBA 1NGDA 5FPMA 3L0QA 4BC3A 5JMVA 3UKUB 3GG4A 5FPNA 2FLOA 4Y0WA 2YCHA 3WXIA 4BC5A 3EO3A 3KZBA 5AFUH 4AM6A 1IG8A 3QB0A 2QWLA 1ZBSA 1ATRA 3FZHA 4H5VA 4BROA 4I6MB 1SAZA 1BU6O 3WEEA 1GLLO 2IVNA 3VEYA 3VETA 5BRHA 3CQYA 2E1ZA 3W3DA 5AQGA 3TU5A 1KAZA 3H1QA 2ASOA 3IUCA 3UKRB 4IO8A 4HWIA 2P9IB 2GUPA 3VEWA 3FZKA 1RDWX 2V51B 4BREA 4BRMA 3VGLA 4FWMA 4CZIA 3HM8A 3CI5A 1QZ6A 2ASMA 3ULEA 3C7NA 4H5NA 5AQSA 2D0PA 2A42A 2IVOA 5CE3A 4IJNA 3D2FB 4BQLA 3JXUA 4GY2B 1XUPO 4C23A 2FSKA 4CD1A 2V52B 4RCHA 4A61A 3CJCA 5ADXA 3VENA 1C0FA 4QS9A 3R9PA 2Q0UA 1NGHA 2E1YA 4FWRA 4BC4A 3KVGA 2GWJA 4EFHA 5BR9A 3LDQA 5AQVA 5FPDA 3OHRA 4BRKA 4GNIA 4YDUA 4AM7A 2AA4A 1CZAN 5AQJA 5AQPA 3EN9A 4CJ7A 1BG3A 2W41A 1MA9B 5AZJB 1K8KA 4FWNA 5AR0A 2YJFA 2ZWHA 1Q18A 4B1UB 4DQ8A 4CBUA 3ZETA 2KHOA 4ISFA 3G25A 5KQ8A 1YXQA 5KPZA 3VF6A 5AZIB 5JICA 3ENOA 4BRIA 1GLCG 2VCPA 4LC9B 2QWOA 1H1VA 4BR5A 4K42A 1NGCA 1GLJO 4MO4A 5LJVA 3LDOA 1GLEG 3ATUA 3SJHA 5AQOA 4BR4A 3P4IA 2E20A 4IJAA 4EHUA 3U8XA 2P9UA 5EX5A 4FWQA 4FSVA 1T6CA 3R8EA 3WQTA 3WEEB 2P9SA 4QS7A 3DJCA 4M7YA 2E2QA 1YUWA 2YHYA 4BC2A 3W0LA 3H46O 2ITMA 3QMLA 1BWFO 2QWPA 2A41A 2ZGYA 4WQ4A 3H45C 3ULEB 3C7NB 3A5OC 4B1YB 3WXLA 1KAYA 4MLHA 4ISGA 1SQKA 1YVNA 5TKYA 2OANA 3ZEUB 1XC3A 5EOYA 3H3NO 3CIPA 4CBXA 4H0VB 1NGAA 2P9LB 4BRDA 4CZFA 5AFUA 1BO5O 4BVOA 5LY3A 4BRLA 1HLUA 3AY9A 1T44A 3F9MA 3VEVA 3ZX0A 5F0XA 2YI1A 4BRAA 2F9TA 3VGMA 3B8AX 4WQ5C 2GEMA 1K8KB 4CZMA 2H3GX 2E2OA 5AQTA 2QWRA 3EKUA 3H6EA 3M6GA 3ZETB 5BRDA 1ATSA 1WUAA 4B1ZA 3FGUA 2DPNA 4PKGA 4H5TA 1V4TA 3O08A 1GLAG 4QS8A 4JAXA 3U4LA 2E2NA 5AQRA 5AQNA 4EAHD 2PAVA 4HTLA 4H5RA 4BGBA 5KPRA 2Q31A 2Q36A 3WUHA 4H0OA 4PL8A 3S41A 2FSNA 3D2EA 4F9OA 4H0TB 4RWTA 1RFQA 2P9UB 3D7EO 3J8AA 1NM1A 3O5BA 2D1KA 2ZF5O 2E8AA 3LM9A 4PL7A 2I7PA 2HF4A 4BRFA 4B1XB 3ZX3A 3L6QA 2BTFA 5AQXA 2A5XA 2Q1NA 3FZMA 4BG9A 3ZX2A 3EL2A 4FWLA 3C0BA 5BREA 1U6ZA 1BA0A 2P9NB 3SK3A 1QZ5A 3SLCA 4CD3A 2HMPA 1SZ2A 2P9KB 3O6WA 4JHDA 2Q0RA 4JN4A 3CERA 3LDLA 3QBWA 1NGGA 4H0YB 3FR0A 1LOTB 1Z6RA 3I8BA 4A2BA 3MN6A 1MDUB 1U2VA 1X3NA 3QDKA 3R6MA 1Z05A 5AQMA 1BDGA 3FE1A 3CJ1A 5E26A 5AQLA 1QQOA 1NGIA 2V7ZA 1HPMA 1TYQB 4H0PA 4XH5A 5BN8A 4M7XA 3VEOA 4BR2A 3A0IX 1NLVA 4CZHA 1G99A 4FWSA 4CBWA 4CZEA 2HF3A 3A5NC 3FFKB 4E1JA 1E4FT 1HUXA 1NBWA 2F9WA 1S22A 3SMPA 1GLBG 3MN5A 1X3MA 3CJAA 2J4RA 4IWVA 3UKUA 1KXPA 1HX1A 1Y64A 4BR9A 4CZLA 2P9PA 4O8KA 5KPTA 4BQZA 3WXJA 2IIRA 5FPEA 1QQNA 1HKCA 2GELA 3VEZA 4B1VA 3A8YA 3BEXA 3HBTA 5BN9A 3LM2A 5EY4A 2HOEA 4FWPA 2CGJA 1IJJA 5AQZA 2E2PA 1T6DA 3VEXA 4BG8A 4KBOA 2YHXA 5EVZA 3D2EB 2CH6A 1JCFA 3LDPA 1OKJA 1YAGA 4K25A 4Z94A 3FZLA 4BR7A 3DXMA 1TUUA 1TUYA 2D0OA 5JLFA 2E88A 2P9IA 4MLEA 3VPZA 4PKIA 1HKGA 1R59O 2A3ZA 3ATVA 3RSEA 3LL3A 1GLFO 3M3ZA 4BRCA 3QICA 4XEIA 3AARA 3D2FA 1E4GT 2I7NA 4NO7A 4DCHA 2D4WA 4IXCA 2QWNA 4XH4A 3VF4A 2QM1A 1RGIA 3UB5A 3WT0A 3HI0A 4NB4A 4JD2A 5BPLA 1U2VB 5E84A 4DHYA 4FWOA 4BRNA 4BRGA 3LDNA 3EZWA 4ISEA 3QFUA 1X9JA 2ZGZA 2ASPA 3BF1A 1LCUA 1XQSC 4H0XB 2CGKA 1HKBA 2CGLA 4MO5A 5BRFA 1JCGA 3DXKA 4JNEA 4XH1A 1ATNA 3FZFA 2WUSA 3M1FA 3MN7A 4BGAA 5AZIA 2W40A 3CHWA 3MCPA 3VERA 3EKSA 5AQKA 3GDQA 2P9PB 4YDUC 4CZJA 2NLXA 5AQWA 1DKGD 3UE5A 2P9SB 4BRHA 3H3OB 5F2RA 2YHWA 3DAWA 1DGKN 3U9DA 4WYBA 3H1VX 1P8ZA 1V4SA 2AP1A 1BOTO 2FXUA 3CJ9A 4M63C 4CZGA 3KHYA 2NRHA 3CJBA 5JLHA 3DXMB 1WOQA 3A5MC 1DEJA 3GL1A 5EXWA 4WQ5A 5I9EB 3ENHA 3RSEB 3CETA 3O80A 5BPNA 4O5FA 4B1WB 2V7YA 4FPAA 3GOIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WAJA 1VSEA 4OKKA 3AAQA 3ZEUA 1JL1A 3MMVA 2HW3A 4HHFA 5MLCQ 3J81O 4FL9A 3HZ6A 4IBNA 1TKTA 3ASMA 4CHQA 2WTUA 3BF3A 3EYZA 4AILC 4IOAL 1VQPN 4KO0A 4O55A 5B8HA 1ZC6A 4DFMA 4KI6A 4RTFD 1JLGA 4ZTJA 1VQ7N 2QXLA 1BI4A 4DQIA 3HTVA 4FZYA 4CF9A 3AVLA 3NH0A 5KQDA 3O1BA 5D3GA 2P5OA 1NKCA 4BY9C 4CZKA 4BVPA 4CFAA 3LAKA 1GOAA 4DV5K 4K43A 4ELUA 5IWAK 5BPMA 2ZJRL 1KAXA 3L4IA 3QFPA 3KKSA 3GE1A 3OJSA 2KTQA 3ALYA 2X6SA 4IZ9A 1ASVA 4LH5A 3SBTA 5CYQA 2D0AA 4DR7K 3TSUA 4BDYA 3OYLA 3VA0A 4FLUA 4KTWA 1NMDA 5C42A 2G2KA 4JK9A 2BUPA 4A2AA 1ASUA 1NJIO 4KFBA 4B9QA 3RMDA 3IS9A 3KTQA 1IKWA 3EE8A 3WNGA 3BP8A 3IRXA 3NF7A 4V19S 3LWLA 2VYPA 5C10A 2Q2RA 3KP1A 1D4XA 4ELVA 1ESVA 4DUYK 1JCEA 3ENBA 2E6LA 4FJMA 4J8FA 4KHYA 1TK0A 2PBDA 4N5SA 4Z4GA 1JLFA 3VESA 3AVJA 1P0AA 3LDSA 5AQHA 2HHTA 3NAEA 3DYAA 3VN5A 4JRPA 4HUEA 5LJWA 3ZCMA 3O3HA 3AGRA 3L0QA 3OS1A 3P1GA 2ETJA 2KBJA 1BI4B 1WSIA 4JKBA 1N5YA 2OCEA 1VQ5N 2YBRC 3CPEA 1NJWA 4UAFE 3EO3A 5CZ2A 5TKWA 1ZBSA 1GPSA 3CM6A 3FZHA 4H5VA 1RDCA 3WEEA 4B3MK 3AVNA 3L8BA 3CF5L 5BRHA 1I2UA 5M1NA 3CQYA 3CCVN 3W3DA 5AQGA 3TU5A 4NYFA 3KLHA 4W5TA 4YORA 2GUPA 1KRPA 2WOMA 4BRMA 4DV1K 1CHZA 4FM2A 1DTQA 4H5NA 3OYBA 1HQUA 3NHGA 1UOCA 4KH4A 1VQKN 4CEDA 4W5RA 4CK1A 3HPHA 3THYA 4A61A 4DLEA 5M1QA 5ADXA 3NH1A 5C0YA 3VENA 1C0FA 3KVGA 3PV8A 2EHGA 2YNIA 5AQVA 4BRKA 3OHRA 5GAEP 4HCBA 2FC0A 4GNIA 2LSNA 4YDUA 3E9PA 1AYJA 2RE2A 3EN9A 1ZVGA 4B3SK 3O4QA 4DV0K 2W41A 4FWNA 5AR0A 4GKJK 4DFJA 1Q18A 4B1UB 4DQ8A 3L3UA 2O8BA 3ZETA 2KHOA 3SUQA 1G15A 5KQ8A 4CF0A 2I5JA 4KH5A 2VCPA 5HROA 4ZHRA 3CCLN 4JS4A 2QWOA 1H1VA 3O9SA 1NGCA 4BACA 4M3TA 2LJ7A 3V9SA 3SJHA 1HR0K 3T7ZA 1RBUA 4JKEA 1KVAA 3LPUA 4BR4A 3J7YP 2D0BA 4DTSA 4KHSA 1ZBIA 4FSVA 4Y1DA 3WEEB 3CMAN 4M7YA 4DV6K 4PUOA 4EP5A 2ITMA 3ULDA 3DRPA 3PX4A 4F2RA 1HNVA 1HMVA 3H45C 4LF7K 2KZMA 3NCIA 3O9TA 4N41A 3N4QA 4KTQA 3FFIA 5HRRA 4FJKA 4DWIA 4Z4IA 1YVNA 3HXMA 1HPZA 2OANA 3P31A 3THYB 3SUNA 4JV5K 3MECA 2OTJN 4BRDA 3KIOA 1C55A 3HOTA 4M3YA 3NVMA 3AA3A 5AFUA 3WXMB 4BVOA 4W5OA 1VQMN 3AY9A 3N4PA 3ZX0A 4FJ7A 1ZYVA 1LWFA 1HNIA 4IKFA 3NGYA 3NF8A 4DMNA 3R3LA 4Z0UA 1X9SA 1EWRA 4CHYA 1ZBUA 3EKUA 3M6GA 4E3SA 3ZETB 5BRDA 2O8BB 2X78A 3DLKA 4HUFA 4CIFA 2B68A 4B1ZA 4CQKA 2BH1A 4PKGA 1GLAG 4QS8A 5CY4A 1JLQA 3DLHA 1VSHA 4LY7A 1CN2A 5KPRA 1BRZA 3WUHA 1WSHA 3O9QA 4KHNA 2E4LA 4RW8A 3AO3A 1YVUA 2ATBA 1VHXA 4DR5K 4C8NA 1HYSA 4H8KA 2ZF5O 3HO1A 1REVA 4B3RK 3LM9A 4PL7A 3V9WA 2I7PA 3QNOA 4B1XB 2O8CB 2BTFA 2A5XA 2Q1NA 3FZMA 3O9RA 2HSTA 4FWLA 2G8UA 4DR6K 4GW6A 1KVBA 3MAQA 3D0PA 3AVMA 2P9NB 3BGRA 4DFPA 3SLCA 1SZ2A 2P9KB 2LR3A 1C1CA 4JHDA 3WNEA 4KPYA 4JN4A 3CERA 4H0YB 4O0JA 1JKHA 3MN6A 1MDUB 3ZT0A 1U2VA 1X3NA 3QDKA 2KGQA 3P39A 3DLLL 3FE1A 2OZSA 1TV6A 4CHOA 2V7ZA 1TYQB 2YEOA 4XH5A 4CEEA 1W97L 2DFFA 5DMRA 2Q3SA 1VSLA 3M8SA 4AF1A 4CZHA 3KJVA 4Q0BA 4CBWA 4G1QA 4E1JA 3T1YK 4NLCA 1ZBFA 1NBWA 1KC8O 2UXBK 3QEXA 2F9WA 3G10A 2OZMA 4KHUA 5M1PA 4X65K 2J4RA 4NCGA 3UKUA 2VGMA 3HJFA 1EWQA 3SQ2A 4O8KA 5KPTA 5KTQA 1ZBLA 2IIRA 1U49A 2O8EB 1HKCA 4JI1K 1JXCA 1P00A 3BEXA 5BN9A 5EY4A 4FWPA 3DLGA 1IJJA 5AQZA 3L4QA 1VQ4N 2O4GA 1WNSA 2W42A 1XNQK 4Z94A 4AHSA 3OYKA 3FZLA 2PYJA 4DSLA 4CJPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1WAJ A;  1VSE A;  4OKK A;  3AAQ A;  3ZEU A;  1JL1 A;  3MMV A;  2HW3 A;  4HHF A;  5MLC Q;  3J81 O;  4FL9 A;  3HZ6 A;  4IBN A;  1TKT A;  3ASM A;  4CHQ A;  2WTU A;  3BF3 A;  3EYZ A;  4AIL C;  4IOA L;  1VQP N;  4KO0 A;  4O55 A;  5B8H A;  1ZC6 A;  4DFM A;  4KI6 A;  4RTF D;  1JLG A;  4ZTJ A;  1VQ7 N;  2QXL A;  1BI4 A;  4DQI A;  3HTV A;  4FZY A;  4CF9 A;  3AVL A;  3NH0 A;  5KQD A;  3O1B A;  5D3G A;  2P5O A;  1NKC A;  4BY9 C;  4CZK A;  4BVP A;  4CFA A;  3LAK A;  1GOA A;  4DV5 K;  4K43 A;  4ELU A;  5IWA K;  5BPM A;  2ZJR L;  1KAX A;  3L4I A;  3QFP A;  3KKS A;  3GE1 A;  3OJS A;  2KTQ A;  3ALY A;  2X6S A;  4IZ9 A;  1ASV A;  4LH5 A;  3SBT A;  5CYQ A;  2D0A A;  4DR7 K;  3TSU A;  4BDY A;  3OYL A;  3VA0 A;  4FLU A;  4KTW A;  1NMD A;  5C42 A;  2G2K A;  4JK9 A;  2BUP A;  4A2A A;  1ASU A;  1NJI O;  4KFB A;  4B9Q A;  3RMD A;  3IS9 A;  3KTQ A;  1IKW A;  3EE8 A;  3WNG A;  3BP8 A;  3IRX A;  3NF7 A;  4V19 S;  3LWL A;  2VYP A;  5C10 A;  2Q2R A;  3KP1 A;  1D4X A;  4ELV A;  1ESV A;  4DUY K;  1JCE A;  3ENB A;  2E6L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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