3AY9A

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp-, mg ion-, and k ion-bound state
Total Genus 122
50100150200250300350020406080100120
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
5010015020025030035035030025020015010050
020406080100120Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS2 (15-22)S11 (141-146)S1 (7-11)S7 (66-68)AH1 (53-58)TI1 (12-15)AH7 (257-275)TVIII1 (35-38)S4 (37-39)TI2 (31-34)S3 (25-28)S6 (49-51)TVIII3 (361-364)TI6 (62-65)TI3 (45-48)S5 (41-44)TI4 (58-61)TI5 (59-62)S9 (100-107)TIV2 (60-63)AH2 (81-88)S12 (168-174)S15 (216-225)3H1 (70-72)TII1 (73-76)TI9 (147-150)TI8 (77-80)TIV3 (96-99)S10 (110-114)TIV4 (106-109)AH4 (152-165)AH5 (175-183)3H2 (328-330)S13 (192-200)TI11 (201-204)S14 (205-213)TIV5 (212-215)TIV6 (225-228)AH6 (230-249)S17 (291-298)S16 (279-288)TI12 (253-256)3H3 (339-342)TIV8 (287-290)TVIII2 (286-289)TI'6 (354-357)S18 (333-337)3H4 (365-367)AH10 (368-381)TIV1 (21-24)S8 (93-97)TI10 (184-187)AH8 (299-324)AH3 (116-135)AH9 (344-354)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
total genus 122
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ay9A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ay9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ay9A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ay9A04
3MK6A 4H5NA 2E1YA 3IDHA 3UKRA 4BRIA 2FSKA 3CJ1A 3O5BA 4H0XB 4MLHA 4BRNA 4CJ7A 5AQHA 4CZKA 4FWMA 1TUUA 1KXPA 4BR0A 2E88A 3D2FA 2GELA 1NGAA 4DHYA 2FSJA 4M7YA 5KQ8A 3SJHA 1SZ2A 1J6ZA 2ITMA 2HOEA 1MWKA 3CJ7A 1KAZA 3SLCA 4A2AA 3R8EA 2CH6A 3SMSA 3WXLA 5I9EB 1V4SA 4GY2B 1ATNA 2YHXA 1P8ZA 1YXQA 4DQ8A 1GLBG 4EAHD 3AAPA 4H0VB 3WQTA 3DJCA 2FF3B 1GLDG 2A40A 2VCPA 1BOTO 2AA4A 1NMDA 4CZLA 5BREA 5LJWA 2Q0UA 2QWMA 2QWPA 2ASMA 1MA9B 3A5OC 3EL2A 3FLCO 2P9KB 4MO4A 4EHTA 2P9SB 1NGGA 3MDQA 4QS8A 1QQNA 4JNEA 5AQGA 3KVGA 2D4WA 4CZFA 5JLFA 2D1KA 5BN8A 3VGLA 5EX5A 2P9IA 2NZTA 1E4FT 2P9KA 5BRHA 2P9SA 1ATSA 2E1ZA 4BROA 3H46O 4CD3A 3GL1A 5E84A 4JHDA 2QWNA 1GLCG 4JD2A 3A0IX 3SK3A 4BG8A 1E4GT 3VEWA 5AQTA 1NGHA 3U9ZA 4IWVA 4BRLA 1BDGA 3ZX3A 4CZHA 3I33A 2H3GX 3VERA 4F9OA 3VGKA 3MN6A 5AQFA 3JXUA 3M6GA 3BP8A 1TYQB 4BGBA 5AQRA 2ZF5O 3ZEUB 2NLXA 5AZJA 1HKGA 3VEZA 3QFUA 3C7NA 4BRMA 1RFQA 3LDOA 3CJAA 1JCGA 3QMLA 3VPZA 1ESVA 2YHYA 3EKUA 5AQKA 2F9TA 3FGUA 5AZIB 2CGLA 5EXWA 2Q97A 1TUYA 3O8MA 5ADXA 3CETA 4IJNA 1TYQA 2IVPA 4B1ZA 2QXLA 4CI6A 3I8BA 2F9WA 3H3OB 4FOEA 4YDUC 2CH5A 5AQLA 5LJVA 1GLFO 3VENA 4BR5A 4BR7A 4FWLA 5BR9A 4FL9A 4PL8A 1NM1A 4FSVA 3AAQA 2V52B 1BA0A 3B8AX 3IMXA 4E1JA 2AP1A 3LDLA 2W40A 5BRFA 2V7YA 4XH5A 4BRQA 5AQJA 4WQ5C 3J8AA 3ZETB 1OKJA 3D2EB 1NLVA 4B9QA 4FOIA 3VF6A 3DXKA 2P9PB 1XQSC 1K8KA 4A61A 1MDUB 4FO0A 2E20A 4QS7A 1XC3A 1Y64A 5BN9A 1BO5O 3ID8A 1SAZA 4MLEA 3WEEB 1NWKA 4Z94A 4BG9A 3M1FA 4FPAA 1IG8A 3U4LA 3VF4A 2WUSA 3QICA 3A5LC 2E8AA 1C0FA 4NO7A 1ZBSA 5ELZA 3WQUA 3GDQA 3CJ9A 4KBOA 2Q36A 1H1VA 2OANA 3WUHA 5AQIA 4BRGA 1YUWA 3O08A 4BC3A 3RSEB 2GEMA 4O8KA 4XH4A 3H1VX 4CZEA 3WEEA 4IZ9A 3H45C 3HSCA 3QBXA 4DCHA 5FPEA 2YHWA 2EWSA 2VWBA 3QDKA 4ISEA 3GE1A 3H1QA 2I7PA 2IVNA 3HI0A 5KPZA 5F2RA 3LDQA 2QWOA 3GG4A 1Q18A 4EIAA 4WQ5A 3MCPA 5JICA 4ISGA 1X9JA 4H0PA 3VF2A 4H5VA 2GTDA 3VEXA 1JCFA 5ADXH 5AFUA 1T6DA 1X3MA 1GLAG 3EO3A 5BPNA 1HPMA 3BUZB 3CIPA 3CJBA 4BRDA 2IIRA 2E2PA 2QWLA 3O80A 3KHYA 4BQLA 4BRCA 3A5NC 3CQXA 5AQZA 5AQMA 3P4IA 1MWMA 4QS9A 1IJJA 3WXIA 3WXKA 2A6AA 4XEIA 3UB5A 1CZAN 3DAWA 4RWTA 3ATVA 3R9PA 2V7ZA 2GWJA 2HMPA 4ISFA 4K25A 3A8YA 3LDPA 3O1BA 4BVPA 2NRHA 3MN7A 4H03B 1EQYA 1NGEA 2DPNA 2QWRA 3OHRA 3SMPA 2D0PA 4EHUA 1JCEA 3CJCA 1T44A 3VEYA 5AQSA 1BWFO 4H0YB 4A2BA 4PKGA 3CI5A 3IUCA 5AQYA 5EVZA 5B8HA 4A62A 4B1WB 2FLOA 3FFKB 4LC9B 3LM9A 3UKUB 3VETA 3L6QA 2Q1NA 3QB0A 3FZFA 3VEOA 4FWOA 2UYTA 4H5WA 3GOIA 3LM2A 1NBWA 3FZKA 1QQMA 4H5TA 4MO5A 3HBTA 3ZEUA 3JS6A 2CGJA 4AM6A 1HLUA 1QZ6A 1ZXOA 1YVNA 3AARA 3EZWA 5AQNA 4WQ4C 5AZIA 5E26A 5JMVA 3BF3A 3TU5A 5FPNA 3DXMB 3ULEB 2E2QA 4BR4A 1WOQA 3U8XA 5AQQA 4K41A 4PKIA 4FPBA 1U6ZA 4C23A 4BRFA 3IFRA 1ZC6A 3QBWA 3O4WA 2FF6A 5BPMA 1ATRA 5JLHA 1NGFA 1G99A 1NGIA 3CQYA 3CERA 5AFUH 2A42A 3WT0A 3H6EA 1BA1A 4EFHA 3ATUA 3UKRB 4CD1A 4JAXA 3W3DA 2D0OA 2GUPA 3DXMA 5AQOA 5KPRA 4FWRA 4FWQA 4K43A 4BVOA 3L0QA 3ZETA 3D2FB 3D2EA 2E2NA 4WYBA 2Q2RA 4NB4A 2A5XA 4HTLA 1DKGD 3O6WA 2QWQA 4H5RA 2I7NA 3HZ6A 3S41A 2P9PA 4XH1A 3ZX2A 5AQXA 2HF3A 2V51B 3FZHA 2A3ZA 5AR0A 1LOTB 4YDUA 4PL7A 2FSNA 5CE3A 1XUPO 2P9UB 2A41A 4WQ4A 2KHOA 4I6MB 4BC5A 1DGKN 1QQOA 1QZ5A 4CBWA 3MN5A 4BC4A 3VGMA 4H0TB 4RTFD 3W0LA 2J4RA 3RSEA 3R6MA 5AQVA 4RCHA 2P9UA 4FWKA 2ASPA 4I6MA 1NGCA 2CGKA 1SQKA 4B1XB 4FWSA 2Q0RA 5FPMA 5AQWA 3DWLA 3ZX0A 4BREA 2Q31A 1HKBA 1NGBA 4JN4A 3QFPA 1Z6RA 2HF4A 4BR2A 4BRHA 1GLJO 5F1XA 2P9IB 4B1UB 5LY3A 4CZJA 3LDNA 4FWNA 4CBUA 5KQDA 1HUXA 2VYPA 3HM8A 2P9NB 1DEJA 2PBDA 4JHDB 4JD2B 5TKYA 2YCHA 1HJOA 4DB3A 4GNIA 4FWPA 3M3ZA 2YJFA 4BRPA 2ASOA 2QW9A 3MMVA 3ENHA 3EN9A 1NGJA 1BG3A 4BRKA 3U9DA 4Y0WA 2P9NA 4BGAA 5BRDA 4IXCA 5AZJB 4BRAA 1U2VB 1GLLO 4IJAA 1KAXA 3C7NB 4CZGA 5AQUA 1X3NA 4B1VA 3FZMA 4IO8A 3VEVA 1C0GA 3ENOA 4B1YB 4L3QA 3TPQA 1RDWX 2BTFA 1HX1A 3CHWA 2YI1A 3C0BA 3G25A 3GBTA 1LCUA 3O1WA 1KAYA 1S22A 1U2VA 4O5FA 3UKUA 5FPDA 2PAVA 4CZMA 3A5MC 3WXJA 1WUAA 2P9LB 2W41A 3BF1A 3VESA 4CZIA 4J8FA 1S3XA 3L4IA 2QM1A 3MN9A 1T6CA 4CBXA 1BU6O 4PKHA 2FXUA 3FE1A 3D7EO 3AY9A 4M7XA 3H3NO 3FZLA 1BUPA 1V4TA 2GWKA 1QHAA 1R59O 4BR9A 3KZBA 1Z05A 5AQPA 2ZGYA 4K42A 4H0OA 2ZGZA 2P9LA 4BC2A 3DXKB 3BEXA 1HKCA 3ULEA 4AM7A 3F9MA 3UE5A 2IVOA 2ZWHA 3EKSA 1D4XA 5EY4A 1K8KB 2E2OA 3LL3A 3VOVA 5KPTA 5BPLA 1GLEG 4HWIA 2YJEA 2BUPA 4M63C 5F0XA 3HTVA 5EOYA 4BQZA 1NGDA 3FR0A 1RGIA 1YAGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2PFUA 3IDHA 1LQQA 2FSKA 3CJ1A 4H0XB 1LQHA 4BRNA 2GUIA 4BECA 3EZ5A 4CJ7A 4CZKA 3O3HA 3OYEA 1KXPA 1ILYA 1I39A 1W7AA 3DRPA 3HP6A 4DR3K 1WSGA 2LI7A 2BH1A 2IGIA 4OPHA 2D0BA 3C6TA 4FJ9A 1SZ2A 3I0SA 3C94A 4DF4A 2GV9A 1OH5A 1VSDA 1ZBHA 2ETJA 4A2AA 3R8EA 3SMSA 2G8HA 5I9EB 4DSLA 3U3GA 2YHXA 2KTQA 3K57A 4EAHD 2E0HA 3V9SA 2YEOA 2X6NA 5FROA 4ZHRA 3KK1A 2YKNA 2HBJA 5I42A 1C0MA 1NMDA 4B9LA 4HCCA 5BREA 4IOAL 4ZTJA 5LJWA 1T03A 2ASMA 2KKZA 3T1AA 2P9KB 3SAFA 4X62K 4LFAK 2NRZA 2YX6A 4KTZA 3RTVA 5H1SQ 4C8LA 3LP0A 1TKXA 2GMOA 3E7UX 1QQNA 5AQGA 1KLMA 3PIOL 2D1KA 4GKKK 1POIA 4IEIA 3ZCMA 5EX5A 2Y1JA 3O3GA 3NF9A 2P9KA 5BRHA 1ATSA 2E1ZA 1GLCG 1A5XA 2O8EB 4CGFA 1E4GT 1TAQA 1RT6A 3U9ZA 4IWVA 1B92A 2RF2A 4Z4GA 2B5JA 3LPUA 3ZX3A 2YV0X 3DLLL 3ZT1A 2W42A 4DV5K 3LWMA 3MECA 2I61A 4M45A 5T7BA 5AQRA 2VQFK 1QSYA 2O8EA 3CFRA 2OCEA 3CJAA 1JCGA 3HOTA 2YHYA 3EKUA 2F9TA 1N8RO 4CF8A 1S5JA 5HOOA 2HHTA 2Q97A 3KP1A 4DU1A 4DV3K 3ZSVA 1DLOA 3VQ7A 4W5OA 2VG6A 1OH7A 4CI6A 4JI1K 2E5LK 2LJ7A 2F9WA 3H3OB 4YDUC 4YFUA 3DOLA 1GLFO 4ZTFA 3HVTA 1WWNA 4DFJA 4NCAA 2AP1A 3SQ0A 1VRTA 2VWKA 2V7YA 4XH5A 1BCMA 4BRQA 5AQJA 4CHNA 4K8XA 1QVFM 4Z4HA 3B6OA 4FOIA 2B4JA 5CYQA 4AHTA 3RVCA 4JKGA 2KYQA 3TTCA 2WOMA 1T1TA 3HYFA 4BE0A 4J2AA 1XC3A 1Y64A 3DRRA 1IKWA 4Z94A 4BG9A 3KK2A 1IG8A 1NOZA 4JK8A 3VF4A 3WNGA 3DLHA 3DMJA 2E8AA 1WLJA 2HHXA 3BZKA 5ELZA 1OZZA 1ZYVA 4DR6K 1KSPA 4J2DA 4KBOA 2OANA 3WUHA 3J7YP 2ZQBA 3CCSN 4OPKA 1J54A 5DM7L 3H1VX 3OYLA 1VRUA 1J5EK 3HM9A 2Y1IA 3CYGA 3QDKA 3LAMA 3MCAB 5FLXO 4BDPA 2I7PA 5C15A 3HXMA 4E7IA 5GIPA 4EIAA 3M8QA 3NF7A 1CHZA 4DQSA 4H0PA 1ZBUA 4DU3A 3PSIA 2GTDA 3VEXA 5C24A 5AFUA 2KZMA 4CIEA 2P5GA 1C6VA 1T6DA 2AJQA 1BMRA 3CJBA 1QS4A 1BI4B 3IG1A 2NRRA 1L3VA 3KHYA 3ZSYA 4KPYA 5AQMA 3P4IA 4NXMK 1MWMA 4E7KA 4OGEA 4KHUA 4HCBA 2A6AA 4UADE 4I9LA 1JLQA 4FZXC 4CERA 4IOCL 3ATVA 4FK0A 3M8PA 4KAZA 5GAEP 3LDPA 3O1BA 3Q7CA 3OBWA 4IFEA 4OO1J 3PO5A 1NGEA 3OHRA 1L4VA 3LP1A 4IG3A 5AQYA 2WONA 4B3SK 1UGLA 3L6QA 4IFYA 4UY8O 3MWTA 2W6KA 1EO1A 1KFDA 3NAEA 3LM2A 1NBWA 3PSFA 3VQ4A 2O8FB 3FZKA 4OVLA 3V81A 2HNDA 4JKAA 2CGJA 4BACA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3MK6 A;  4H5N A;  2E1Y A;  3IDH A;  3UKR A;  4BRI A;  2FSK A;  3CJ1 A;  3O5B A;  4H0X B;  4MLH A;  4BRN A;  4CJ7 A;  5AQH A;  4CZK A;  4FWM A;  1TUU A;  1KXP A;  4BR0 A;  2E88 A;  3D2F A;  2GEL A;  1NGA A;  4DHY A;  2FSJ A;  4M7Y A;  5KQ8 A;  3SJH A;  1SZ2 A;  1J6Z A;  2ITM A;  2HOE A;  1MWK A;  3CJ7 A;  1KAZ A;  3SLC A;  4A2A A;  3R8E A;  2CH6 A;  3SMS A;  3WXL A;  5I9E B;  1V4S A;  4GY2 B;  1ATN A;  2YHX A;  1P8Z A;  1YXQ A;  4DQ8 A;  1GLB G;  4EAH D;  3AAP A;  4H0V B;  3WQT A;  3DJC A;  2FF3 B;  1GLD G;  2A40 A;  2VCP A;  1BOT O;  2AA4 A;  1NMD A;  4CZL A;  5BRE A;  5LJW A;  2Q0U A;  2QWM A;  2QWP A;  2ASM A;  1MA9 B;  3A5O C;  3EL2 A;  3FLC O;  2P9K B;  4MO4 A;  4EHT A;  2P9S B;  1NGG A;  3MDQ A;  4QS8 A;  1QQN A;  4JNE A;  5AQG A;  3KVG A;  2D4W A;  4CZF A;  5JLF A;  2D1K A;  5BN8 A;  3VGL A;  5EX5 A;  2P9I A;  2NZT A;  1E4F T;  2P9K A;  5BRH A;  2P9S A;  1ATS A;  2E1Z A;  4BRO A;  3H46 O;  4CD3 A;  3GL1 A;  5E84 A;  4JHD A;  2QWN A;  1GLC G;  4JD2 A;  3A0I X;  3SK3 A;  4BG8 A;  1E4G T; 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 2ASO A;  2QW9 A;  3MMV A;  3ENH A;  3EN9 A;  1NGJ A;  1BG3 A;  4BRK A;  3U9D A;  4Y0W A;  2P9N A;  4BGA A;  5BRD A;  4IXC A;  5AZJ B;  4BRA A;  1U2V B;  1GLL O;  4IJA A;  1KAX A;  3C7N B;  4CZG A;  5AQU A;  1X3N A;  4B1V A;  3FZM A;  4IO8 A;  3VEV A;  1C0G A;  3ENO A;  4B1Y B;  4L3Q A;  3TPQ A;  1RDW X;  2BTF A;  1HX1 A;  3CHW A;  2YI1 A;  3C0B A;  3G25 A;  3GBT A;  1LCU A;  3O1W A;  1KAY A;  1S22 A;  1U2V A;  4O5F A;  3UKU A;  5FPD A;  2PAV A;  4CZM A;  3A5M C;  3WXJ A;  1WUA A;  2P9L B;  2W41 A;  3BF1 A;  3VES A;  4CZI A;  4J8F A;  1S3X A;  3L4I A;  2QM1 A;  3MN9 A;  1T6C A;  4CBX A;  1BU6 O;  4PKH A;  2FXU A;  3FE1 A;  3D7E O;  3AY9 A;  4M7X A;  3H3N O;  3FZL A;  1BUP A;  1V4T A;  2GWK A;  1QHA A;  1R59 O;  4BR9 A;  3KZB A;  1Z05 A;  5AQP A;  2ZGY A;  4K42 A;  4H0O A;  2ZGZ A;  2P9L A;  4BC2 A;  3DXK B;  3BEX A;  1HKC A;  3ULE A;  4AM7 A;  3F9M A;  3UE5 A;  2IVO A;  2ZWH A;  3EKS A;  1D4X A;  5EY4 A;  1K8K B;  2E2O A;  3LL3 A;  3VOV A;  5KPT A;  5BPL A;  1GLE G;  4HWI A;  2YJE A;  2BUP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2PFU A;  3IDH A;  1LQQ A;  2FSK A;  3CJ1 A;  4H0X B;  1LQH A;  4BRN A;  2GUI A;  4BEC A;  3EZ5 A;  4CJ7 A;  4CZK A;  3O3H A;  3OYE A;  1KXP A;  1ILY A;  1I39 A;  1W7A A;  3DRP A;  3HP6 A;  4DR3 K;  1WSG A;  2LI7 A;  2BH1 A;  2IGI A;  4OPH A;  2D0B A;  3C6T A;  4FJ9 A;  1SZ2 A;  3I0S A;  3C94 A;  4DF4 A;  2GV9 A;  1OH5 A;  1VSD A;  1ZBH A;  2ETJ A;  4A2A A;  3R8E A;  3SMS A;  2G8H A;  5I9E B;  4DSL A;  3U3G A;  2YHX A;  2KTQ A;  3K57 A;  4EAH D;  2E0H A;  3V9S A;  2YEO A;  2X6N A;  5FRO A;  4ZHR A;  3KK1 A;  2YKN A;  2HBJ A;  5I42 A;  1C0M A;  1NMD A;  4B9L A;  4HCC A;  5BRE A;  4IOA L;  4ZTJ A;  5LJW A;  1T03 A;  2ASM A;  2KKZ A;  3T1A A;  2P9K B;  3SAF A;  4X62 K;  4LFA K;  2NRZ A;  2YX6 A;  4KTZ A;  3RTV A;  5H1S Q;  4C8L A;  3LP0 A;  1TKX A;  2GMO A;  3E7U X;  1QQN A;  5AQG A;  1KLM A;  3PIO L;  2D1K A;  4GKK K;  1POI A;  4IEI A;  3ZCM A;  5EX5 A;  2Y1J A;  3O3G A;  3NF9 A;  2P9K A;  5BRH A;  1ATS A;  2E1Z A;  1GLC G;  1A5X A;  2O8E B;  4CGF A;  1E4G T;  1TAQ A;  1RT6 A;  3U9Z A;  4IWV A; 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