3AY9A

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp-, mg ion-, and k ion-bound state
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ay9A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ay9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ay9A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ay9A04
3L6QA 4WQ5C 1HKCA 5AQIA 2D1KA 2HMPA 3I33A 1HJOA 4B1WB 4NB4A 4WYBA 3AAQA 3FZHA 2V51B 4CZEA 5AQYA 2D4WA 1QQNA 2A3ZA 3ZX0A 2BUPA 2FSNA 2V7YA 4FPBA 2EWSA 1LOTB 4RWTA 4YDUA 4BRIA 4JN4A 4BRQA 3HZ6A 2ASPA 1KAYA 1QQOA 4H5NA 3A8YA 3UKRB 3QICA 2NRHA 2P9SB 3HM8A 2QWQA 2A5XA 1XUPO 3C7NB 3LDPA 3B8AX 3MN6A 3L4IA 2E1YA 1T6CA 2VWBA 5AFUH 3VPZA 5BPNA 1S22A 5EOYA 2V7ZA 3WXLA 1QQMA 5BPMA 4BVOA 3WXJA 3VGMA 3U9ZA 1YUWA 4FWNA 1K8KA 3CIPA 3ULEB 3ZX3A 4RCHA 3P4IA 3LDLA 4EHTA 4JD2B 3A5OC 3FZMA 3GDQA 5AQRA 1HKGA 2P9KB 3A0IX 4Z94A 3R8EA 3UKUA 1NGBA 4H5WA 1NGEA 4PKGA 2CGJA 5BN8A 2Q0RA 3ZEUB 1NGDA 3H45C 2FXUA 3ZETB 1RGIA 3MDQA 1K8KB 4K43A 3H1VX 3WUHA 5KPZA 2QWRA 3O1WA 3AARA 1GLLO 1MA9B 4IO8A 4FO0A 5BN9A 3SJHA 4K41A 4CZHA 3H3OB 3M3ZA 5FPMA 4BQLA 4M7YA 5CE3A 1ATRA 3ZX2A 1NGCA 2P9NB 4CZFA 2IVPA 3HBTA 1P8ZA 3HI0A 3O80A 1U2VA 3O8MA 2P9UA 2QWMA 2YI1A 3ENOA 3GE1A 3ENHA 3GOIA 3QBWA 1ZXOA 4FWSA 4BRGA 1SAZA 1BUPA 3L0QA 2P9PB 2A40A 4L3QA 2PBDA 4BG9A 2E8AA 4FWQA 4M63C 4H5TA 4BR5A 1NGHA 4H0PA 4BQZA 4H03B 2E88A 3MK6A 1TUUA 2F9TA 5AQMA 3EKUA 3IMXA 5TKYA 3UE5A 2PAVA 3FZKA 1GLFO 3EZWA 5AQNA 2P9UB 4BRCA 3F9MA 5B8HA 5LJWA 2FLOA 3EO3A 4BRFA 4CZMA 3O4WA 5AQZA 2GWJA 1TUYA 4BRKA 1NMDA 4JHDA 2E2QA 3EL2A 3KVGA 3O6WA 1HKBA 2P9LA 2FSJA 3O5BA 4WQ5A 4PL7A 5AQKA 5AZIA 3BEXA 4CZJA 4I6MA 4QS8A 4ISGA 1BU6O 3DXMA 1QZ6A 2IVOA 4PKIA 3FLCO 3LDQA 2VYPA 3RSEB 3QFPA 4F9OA 3A5NC 3G25A 1V4SA 1X3MA 4CBUA 4XEIA 2ITMA 4GNIA 2FSKA 5BREA 2HOEA 4IZ9A 2GTDA 4CD1A 2Q31A 1DEJA 4BROA 1V4TA 2I7PA 4BR4A 2CH5A 2P9LB 1X3NA 2ZWHA 3VF2A 2QM1A 2ZGZA 1DGKN 5AQXA 3WXKA 3VEVA 4PKHA 2A41A 4AM6A 1NGIA 3UB5A 5ADXA 3VERA 1GLDG 3BF3A 1X9JA 3VOVA 2A6AA 4EAHD 1YXQA 4DHYA 3O1BA 2HF4A 1E4FT 3I8BA 2D0OA 2IVNA 4B1UB 5AQLA 5AQHA 2E2NA 4BREA 3M1FA 4O5FA 4BG8A 1RDWX 2NZTA 3CJCA 3MN9A 1KAXA 4B1ZA 1BWFO 2AP1A 2GWKA 1YVNA 2E20A 1NGGA 4IJNA 3VEXA 3BF1A 3IUCA 2CH6A 4CBWA 3MN7A 1GLCG 4ISFA 5BRFA 3ATUA 1JCFA 4BRMA 2E2PA 1G99A 1IJJA 5AQOA 1NLVA 2W41A 1R59O 4BRNA 4Y0WA 2ZF5O 4HWIA 2DPNA 4BR0A 1T6DA 5KPRA 1S3XA 5AQSA 4H5RA 5LJVA 1Z6RA 1HUXA 3FZLA 1HX1A 2YHYA 5EXWA 5AQWA 1MDUB 5JICA 5AQGA 1WOQA 3VF4A 1SZ2A 4RTFD 3SMSA 5F1XA 4FWRA 3UKUB 4MO4A 2OANA 2H3GX 3AY9A 2KHOA 4CZIA 3DXKA 3KZBA 4H0XB 3SLCA 3VEWA 1KAZA 5ADXH 3GG4A 2FF6A 4K42A 5EX5A 3VESA 4A62A 3WEEA 1ZBSA 4BC4A 4FWKA 4XH5A 4QS9A 3VEOA 5I9EB 3WQUA 3GL1A 4BR9A 5AQQA 4IXCA 4BR2A 5AZJA 1WUAA 1RFQA 2CGLA 3EKSA 1BA0A 5E26A 4AM7A 2J4RA 4K25A 1C0FA 5AQJA 3D2EA 4WQ4C 1XQSC 2VCPA 4H5VA 1U2VB 1NWKA 3DWLA 1HLUA 3WXIA 4MO5A 3CJBA 3LM9A 4BC2A 4CZGA 3VGLA 4BGBA 3CI5A 4NO7A 2QW9A 3EN9A 2Q0UA 1IG8A 3GBTA 2BTFA 5F2RA 2YJFA 3SK3A 3QMLA 4BRLA 3KHYA 3U9DA 5JMVA 3FR0A 1GLBG 4FWPA 4BRDA 5KQ8A 2ASOA 1Z05A 3WT0A 2Q36A 3IDHA 3A5LC 3HSCA 1GLAG 4H0VB 1T44A 3WQTA 4JAXA 4FPAA 4BC5A 4FOIA 1U6ZA 1YAGA 3H6EA 4H0TB 5FPNA 2WUSA 1GLJO 3VGKA 4JHDB 4KBOA 1MWKA 3CJ7A 2YHWA 3UKRA 4A2AA 3BUZB 3FFKB 5AZIB 4DB3A 2P9SA 3ID8A 2Q2RA 1BA1A 4I6MB 4ISEA 1J6ZA 3SMPA 3C7NA 4FWLA 4GY2B 3DXMB 3VEYA 5FPDA 3R9PA 1HPMA 4CJ7A 2CGKA 3OHRA 1Q18A 1NGAA 5AR0A 4YDUC 4A61A 4BR7A 1BO5O 2I7NA 3D7EO 3ULEA 3CJAA 3LDOA 4B9QA 2HF3A 2YHXA 1ZC6A 3CQYA 4FWOA 3VEZA 2QWNA 5BRHA 2QWOA 3CETA 2YCHA 3MMVA 3C0BA 4MLEA 4BRPA 4JD2A 5AQPA 1NGFA 5AQFA 4H0YB 3FE1A 5EVZA 3CERA 4IWVA 1QHAA 3JS6A 3MN5A 3LL3A 2P9KA 5BR9A 4BGAA 5BRDA 1TYQA 3FGUA 3J8AA 5LY3A 1SQKA 2Q97A 4JNEA 4FWMA 3QDKA 5E84A 4BC3A 3ZEUA 5BPLA 3CJ1A 3FZFA 3ZETA 2FF3B 3D2FA 4FSVA 3CHWA 1JCEA 3A5MC 3S41A 3JXUA 3QBXA 2IIRA 2QWLA 2P9IA 3H1QA 1D4XA 3IFRA 1E4GT 4XH1A 2F9WA 1ATNA 4B1YB 1KXPA 4DCHA 1TYQB 4M7XA 3VETA 1MWMA 2P9NA 1NBWA 2E2OA 4FL9A 3CJ9A 4QS7A 4B1XB 4DQ8A 5EY4A 1EQYA 4B1VA 3D2FB 3DAWA 5AQVA 2ASMA 5ELZA 1ATSA 4CD3A 4O8KA 5JLFA 1C0GA 3CQXA 3LM2A 4BRAA 5F0XA 3VF6A 4CI6A 2P9IB 1QZ5A 4MLHA 4EIAA 2P9PA 5AQUA 2V52B 5FPEA 1JCGA 4PL8A 4FOEA 4EFHA 5JLHA 3TPQA 2W40A 4XH4A 3VENA 4BVPA 3U4LA 5KPTA 4HTLA 3QFUA 2YJEA 3DXKB 4EHUA 3M6GA 4BRHA 3LDNA 3O08A 3MCPA 4WQ4A 1H1VA 1BG3A 4IJAA 2A42A 4CZLA 4CZKA 1OKJA 3WEEB 4E1JA 1NGJA 4LC9B 1LCUA 3AAPA 3DJCA 4CBXA 2Q1NA 1BDGA 5AFUA 1ESVA 2NLXA 2GUPA 3ATVA 3W3DA 2GELA 5AZJB 3QB0A 3W0LA 2UYTA 1CZAN 1NM1A 4C23A 2D0PA 2AA4A 3R6MA 3D2EB 3HTVA 4J8FA 4A2BA 3U8XA 4H0OA 1Y64A 3H46O 2GEMA 2QWPA 2ZGYA 1DKGD 3RSEA 5AQTA 1GLEG 3H3NO 2E1ZA 2QXLA 1BOTO 3BP8A 1XC3A 5KQDA 3TU5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UIQA 3L6QA 3ITHA 4FVMA 1JJ2M 1YJWN 5AQIA 3AGRA 4CJEA 1RTHA 5JENA 2WTUA 1WBBA 3TAPA 4LF5K 2Z1IA 5LMNK 1T7EA 4WE1A 1TL1A 3NGIA 3KOXA 2KGQA 3CXCM 3ZX0A 3AVKA 2V7YA 1NJIO 2LSNA 4RWTA 3TSQA 2ZJPL 1ZVEA 1WAJA 3NH1A 1KAYA 3KK7A 4E7KA 2F4VK 4O8UA 2ATBA 2P9SB 3HM8A 4EZ6A 2XY6A 2A5XA 3DLBA 4W5OA 5AFUH 3MN6A 1HR0K 3L4IA 1REVA 4CF2A 1QSYA 3L3VA 1ZYWA 5JS1A 2N66A 1QQMA 3WXJA 2ZQBA 1QQCA 1K8KA 5GADP 1RTIA 4RCHA 4LFBK 1AYJA 1S1WA 3LDLA 4EHTA 4FJXA 2OTJN 1VQ4N 3FZMA 1EKEA 2XO7A 4MFBA 2Q3SA 3A0IX 3M8SA 3UKUA 4CGDA 1NGEA 1UWBA 3CCSN 4UQGA 4DV7K 3LZIA 3ZETB 3MDQA 1K8KB 1B7DA 2E3GA 5H1SQ 5KPZA 2QWRA 1VQLN 4ID1A 5A2QO 2RF2A 3TANA 3PO5A 4GVMA 3VQQA 5GIPA 3J7ZO 4KH6A 2KBHA 5BN9A 1AHOA 3K0SA 4K41A 4LH4A 1NE5A 4CZHA 3O3HA 4FJLA 4X66K 4M7YA 3AVCA 3ZX2A 1VSJA 1NRBA 4O0IA 2P9NB 2YEOA 2HNYA 4CEFA 1JL2A 4V1DC 1YITN 1U2VA 3HM9A 2X6SA 1QSSA 2WBNA 3ENOA 3ENHA 3QBWA 1IO2A 5AJ3K 5JVGL 4LFCK 2P9PB 1WSIA 4BG9A 4B9SA 5M1NA 3K59A 2P5OA 4XIUA 4H5TA 3HPOA 3CFOA 3M8PA 4BQZA 3MECA 4H03B 3AA5X 1D5AA 3VQ4A 1N4NA 1KCFA 1TUUA 5T7BA 3HT3A 4KI4A 1JXCA 1DLOA 2PAVA 4M45A 4B3RK 3EZWA 1X9MA 3Q7BA 3F9MA 3NF9A 2HHUA 4V19S 3EO3A 3G71N 4BWJA 2GWJA 4KYPA 1TUYA 3L2VA 3OYNA 1JXEA 1IV0A 1NMDA 4CJPA 4DS4A 1CHZA 1LAWA 1HKBA 2Z1JA 4PL7A 5AZIA 3SQ0A 2KYQA 4CK2A 4ISGA 3DXMA 1WAFA 4PKIA 3QETA 1LW0A 3LDQA 2OA8A 3VQPA 4F9OA 3V9SA 3A5NC 3GKUA 4JI6K 4N76A 3P1GA 1T05A 3G25A 4DR2K 4Q0BA 5DM6L 3OYKA 2GTDA 3HYFA 1DEJA 3SV3A 3HRGA 1OVQA 2HVIA 4HHTA 1EX4A 2QM1A 1L5UA 3NE6A 5AQXA 5FRNA 3VEVA 4AM6A 2A7TA 1NGIA 3VQBA 4YOXA 1GLDG 4JI0K 1VSLA 1B92A 3AVNA 3BF3A 1A5VA 2ASCA 3I8DA 5C2DA 3TSPA 4DV2K 4Y1DA 1YXQA 1T7AA 2IVNA 3CMEN 2E2FA 2E2NA 4DLGA 3LAKA 3M1FA 4KB1A 4YOYA 3IRXA 4YNQA 4B08A 1BWFO 2HB5A 4CGHA 2AP1A 2GWKA 1YVNA 5J1EA 1RT2A 3IUCA 1KQSM 1GLCG 4ISFA 4Z0UA 4I2QA 3NCIA 5LL6Z 3E9PA 2NY8X 4DFJA 1NJWA 5AQOA 2G2KA 3ZT0A 4OLAA 4BRNA 1PX9A 2W6KA 2DPNA 1IBMK 3KP0A 4Z4CA 3O3GA 1TK8A 1HUXA 4RW4A 4IFEA 4JKGB 3AVJA 4F3TA 5AQWA 5M1FA 1YJNN 1QTMA 4JKCA 1SZ2A 3P83D 2QI2A 2I61A 1J5EK 1HMVA 1YF5L 3K5MA 4CJ4A 1BL3A 4B9TA 2OANA 3PY8A 4CEOA 3KZBA 2FBTA 4KHWA 4H0XB 4M3ZA 3ZT1A 3QINA 5HRRA 3VESA 3CC2N 2YNHA 4FWKA 3ZSYA 1MR4A 2IC3A 3GL1A 1I2UA 5AQQA 4IXCA 4ZHRA 3AVFA 3EKSA 4JI2K 3QI7A 4AM7A 3CPWM 1RNHA 4K25A 5AQJA 1D8YA 1SN4A 4E7IA 3L8BA 3DWLA 1U48A 4RW7A 3CJBA 4AQYK 1NNEA 3VQ8A 1L3UA 2C1IA 4IEIA 3CM6A 4NO7A 1IG8A 2BTFA 3DI6A 3QMLA 3KLHA 4H8KA 3KWIA 3MXJA 2G8IA 2VG5A 3FR0A 4CHPA 4K8ZA 3DM2A 1K8AO 2IAJA 1T44A 4FJGA 3J81O 2QXFA 3CPEA 3VN5A 4N5SA 1C1BA 4KH4A 1VAZA 1RT6A 4WF9L 1F21A 5FPNA 2KZMA 3VGKA 3THXA 2RN2A 3G10A 4FM2A 3Q7CA 4CF8A 4A2AA 3PIPL 1JLQA 2Q2RA 1BA1A 1C0UA 1NK0A 2KKZA 3C7NA 4FWLA 4CHQA 2N69A 3K5NA 5FDLA 5M1OA 1CZ9A 4YDUC 1PTXA 4BR7A 2VQEK 1LWFA 3RMBA 2HF3A 2YHXA 1TK5A 4KKOA 3CQYA 2F7TA 3VEZA 4LY7A 3CCLN 1QS4A 2YCHA 2JDQD 1NJYA 1BIZA 4JD2A 4DU1A 1VSMA 5AQFA 4ZTJA 2XY8A 1QHAA 3JS6A 3QESA 4FJMA 2P9KA 1C56A 4BGAA 5BRDA 1TYQA 3FGUA 5M1PA 1POIA 4DR3K 3QDKA 4DR1K 2QK9A 4CHYA 4AH9A 3FZFA 1VQNN 3BY5A 2N2QA 1JCEA 3B6PA 3S41A 2OTLN 3P5JA 3QBXA 1QVFM 4FJ9A 1DQ7A 4DV3K 3CCQN 2QWLA 3H1QA 4FK2A 4YORA 5DMRA 4OKKA 4A5AA 2F9WA 4DCHA 1TYQB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3UIQ A;  3L6Q A;  3ITH A;  4FVM A;  1JJ2 M;  1YJW N;  5AQI A;  3AGR A;  4CJE A;  1RTH A;  5JEN A;  2WTU A;  1WBB A;  3TAP A;  4LF5 K;  2Z1I A;  5LMN K;  1T7E A;  4WE1 A;  1TL1 A;  3NGI A;  3KOX A;  2KGQ A;  3CXC M;  3ZX0 A;  3AVK A;  2V7Y A;  1NJI O;  2LSN A;  4RWT A;  3TSQ A;  2ZJP L;  1ZVE A;  1WAJ A;  3NH1 A;  1KAY A;  3KK7 A;  4E7K A;  2F4V K;  4O8U A;  2ATB A;  2P9S B;  3HM8 A;  4EZ6 A;  2XY6 A;  2A5X A;  3DLB A;  4W5O A;  5AFU H;  3MN6 A;  1HR0 K;  3L4I A;  1REV A;  4CF2 A;  1QSY A;  3L3V A;  1ZYW A;  5JS1 A;  2N66 A;  1QQM A;  3WXJ A;  2ZQB A;  1QQC A;  1K8K A;  5GAD P;  1RTI A;  4RCH A;  4LFB K;  1AYJ A;  1S1W A;  3LDL A;  4EHT A;  4FJX A;  2OTJ N;  1VQ4 N;  3FZM A;  1EKE A;  2XO7 A;  4MFB A;  2Q3S A;  3A0I X;  3M8S A;  3UKU A;  4CGD A;  1NGE A;  1UWB A;  3CCS N;  4UQG A;  4DV7 K;  3LZI A;  3ZET B;  3MDQ A;  1K8K B;  1B7D A;  2E3G A;  5H1S Q;  5KPZ A;  2QWR A;  1VQL N;  4ID1 A;  5A2Q O;  2RF2 A;  3TAN A;  3PO5 A;  4GVM A;  3VQQ A;  5GIP A;  3J7Z O;  4KH6 A;  2KBH A;  5BN9 A;  1AHO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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