3AY9A

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp-, mg ion-, and k ion-bound state
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ay9A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ay9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ay9A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ay9A04
3D2EB 2E2OA 3D7EO 2D0OA 2ZGYA 3WXLA 1DKGD 4CD1A 1SZ2A 4BC4A 2P9IA 1X3NA 1NGJA 2V52B 2YJFA 3QBXA 4H5VA 1MWKA 3HZ6A 2P9UA 3BP8A 3O4WA 2FSKA 3KZBA 4H5RA 3ULEA 2Q2RA 5AFUH 1GLBG 2I7NA 4FOEA 3U4LA 1K8KA 1NGBA 5B8HA 3M6GA 3UKRB 1Y64A 3BEXA 4MO5A 3O8MA 1QHAA 3CJ1A 3QDKA 3CHWA 3UKUA 2GEMA 3ATUA 1MDUB 3DWLA 3FR0A 3DXKB 2QW9A 3S41A 3VPZA 4FO0A 2FF3B 4EHUA 4FWSA 4H5TA 4EHTA 4CZEA 4JAXA 2D4WA 3TU5A 2QXLA 1V4SA 4DCHA 1JCFA 4BRPA 3C7NA 1QZ6A 2IIRA 1BA1A 3VGMA 3A8YA 4CZKA 2QWMA 4BRMA 2P9NA 3A5NC 4YDUA 1LCUA 4NO7A 4BR5A 3VGLA 4H0TB 1V4TA 4FWNA 3MK6A 5BRFA 3DAWA 2ASOA 2CGJA 1K8KB 3QFPA 3H46O 5I9EB 1YAGA 4K43A 2A5XA 3DXMA 5JLHA 2P9SA 1HKBA 4BQZA 5BRDA 4XH5A 4JNEA 2E20A 3O1WA 2W40A 3VESA 1MWMA 4A62A 2OANA 4CZMA 4FSVA 5AFUA 1LOTB 5AQMA 2AA4A 4QS7A 4BRLA 3ZEUB 2FF6A 5JICA 4FWPA 3UE5A 2UYTA 4IZ9A 3HBTA 2HOEA 3W0LA 1JCEA 1G99A 2F9TA 5LJWA 4FPAA 4CI6A 5F1XA 4JHDA 2GTDA 2YHWA 5KPTA 4BRNA 4RWTA 2QWQA 3H1VX 4CZHA 3SLCA 3VEOA 4BR0A 5AQWA 4B1ZA 4HWIA 4PKHA 1BWFO 5AQOA 1RFQA 5AZIB 3ZX3A 2BTFA 5BRHA 1DEJA 4EAHD 5AQFA 1NM1A 3SK3A 5CE3A 3D2EA 1S22A 1GLCG 4I6MB 2GWJA 4AM7A 3WEEB 4WQ5C 1HUXA 4PL8A 2YJEA 1QQNA 2ASMA 1T44A 2IVPA 1E4GT 1ZBSA 4BRIA 4A2AA 2CGLA 4PKIA 3VERA 2V51B 4PL7A 3FLCO 5FPNA 3FZLA 3LDLA 3U9DA 1RDWX 3FGUA 2QWOA 3FZMA 4Y0WA 5AQUA 3CIPA 3O08A 3UKRA 1ATSA 2E1YA 4F9OA 3LDOA 3BUZB 3KVGA 2A41A 4J8FA 1E4FT 1DGKN 3DXKA 3G25A 1NGFA 3JS6A 5F2RA 1J6ZA 1Q18A 1GLFO 4BG8A 3FE1A 2Q31A 5EOYA 4NB4A 2Q1NA 3SJHA 3LDNA 2P9KB 5E84A 3SMPA 4XEIA 3VEVA 4BR9A 2FSNA 4H0OA 3MN5A 4BRQA 4RTFD 3A5OC 2J4RA 1ESVA 1HX1A 4RCHA 1HJOA 5ELZA 4B1XB 3WXJA 4FWQA 4BRHA 1OKJA 3O5BA 3H6EA 5FPEA 5BPLA 1BOTO 2NLXA 1C0FA 4WQ5A 5AQYA 1YUWA 5BN8A 1NGHA 2WUSA 4BRAA 3WXKA 2GUPA 2V7ZA 1P8ZA 3QFUA 3WQUA 3AAPA 3CJ7A 3D2FA 4BGAA 1HLUA 3JXUA 3I8BA 3CI5A 1GLEG 3R9PA 4CD3A 3H45C 2ZWHA 1XC3A 2Q97A 3ZEUA 2QM1A 3MDQA 3VETA 2QWLA 1TUUA 1XUPO 1GLLO 4B1WB 4B1YB 4WQ4C 2Q0RA 5FPMA 1R59O 3QMLA 2AP1A 2FSJA 2HF3A 4QS8A 1TUYA 3RSEA 3H3OB 1NGDA 5AZIA 3QB0A 2I7PA 5AQPA 4FWLA 4MO4A 1KXPA 1BDGA 4IJNA 4I6MA 4C23A 3WEEA 3R8EA 2EWSA 2CGKA 1HKGA 1GLJO 4CZGA 1BO5O 1QZ5A 3D2FB 2NRHA 1XQSC 5BN9A 3GDQA 3F9MA 1GLAG 1NWKA 3CQXA 4MLEA 3WT0A 4DB3A 2A42A 5AQRA 4GNIA 2Q36A 2HF4A 1HPMA 1NLVA 4BRCA 1ATNA 5JMVA 5AQZA 1ZC6A 1D4XA 4WYBA 2VCPA 1BU6O 4H03B 5AQXA 4KBOA 3ZETB 3EKSA 4A61A 3RSEB 3L4IA 3A0IX 1NGEA 1EQYA 4CBWA 1BG3A 4B9QA 2E2PA 4IWVA 5EY4A 3IDHA 3R6MA 3VOVA 5LJVA 2E88A 3WQTA 3UB5A 5EXWA 2BUPA 2P9KA 3TPQA 1IG8A 2P9LB 4WQ4A 3O1BA 5AQLA 5AQJA 1T6CA 2ZF5O 4A2BA 4E1JA 1U2VB 3ZX2A 1NGAA 2NZTA 4JD2B 4M7XA 3QBWA 2W41A 5AQQA 5BR9A 5KQDA 1HKCA 3EZWA 1SAZA 3C0BA 1TYQB 4O5FA 3WXIA 2Q0UA 1QQMA 2V7YA 3VEZA 4CZIA 3IMXA 5ADXA 2E1ZA 2F9WA 3MN6A 4H5WA 3QICA 3BF3A 1X3MA 2YHXA 2DPNA 3ID8A 4K42A 1ATRA 5F0XA 4FWOA 3IUCA 2ZGZA 5TKYA 3LM2A 5BPNA 3ATVA 2A3ZA 4BRFA 2P9PB 3CERA 3DJCA 4BC2A 4H5NA 3VGKA 4GY2B 3IFRA 4QS9A 3WUHA 5JLFA 1NGGA 3L6QA 3H1QA 2YCHA 4YDUC 5AQVA 3GG4A 4BR4A 2VYPA 3VF4A 1NGCA 5AZJB 5BPMA 5AQGA 4ISFA 3A5LC 2YI1A 3VEXA 4K25A 4DHYA 4EIAA 2HMPA 3U9ZA 1MA9B 4IJAA 2FXUA 4O8KA 3BF1A 1KAXA 3M3ZA 3CJBA 3LL3A 1JCGA 4B1VA 3H3NO 3VF6A 4PKGA 4BRKA 4BC5A 4BRDA 3FZKA 1Z6RA 4Z94A 1WOQA 3ENOA 1ZXOA 3ZETA 5AQHA 3MCPA 4B1UB 3B8AX 3CJCA 3GE1A 1Z05A 3AARA 3ENHA 1GLDG 3EN9A 3AY9A 3MN9A 4CZLA 3LDQA 2CH6A 3U8XA 5ADXH 5AQKA 4BG9A 4M63C 3HTVA 1QQOA 1NMDA 2QWPA 2P9IB 5FPDA 4BQLA 4FWMA 4HTLA 4AM6A 4ISEA 2P9UB 2P9LA 4LC9B 5AQTA 3CJ9A 3LDPA 4BR2A 3HM8A 1YXQA 1U2VA 3ULEB 4CBUA 2E2QA 3GL1A 4ISGA 4BROA 3A5MC 4JD2A 4H0XB 3FZFA 4FL9A 2D0PA 3FFKB 4BVPA 4DQ8A 1NGIA 1TYQA 3EO3A 3VEYA 1IJJA 4M7YA 3EL2A 1CZAN 5KPRA 5AQSA 2YHYA 3UKUB 3HI0A 3CJAA 2KHOA 3VF2A 2GWKA 3W3DA 2CH5A 2E8AA 3VEWA 5BREA 4CBXA 5E26A 3CETA 1U6ZA 2E2NA 4IO8A 3MN7A 2A6AA 2IVNA 3LM9A 4XH1A 4CJ7A 4CZFA 5KQ8A 4L3QA 1T6DA 1KAZA 3C7NB 4CZJA 4FWRA 4H0PA 2PBDA 4FOIA 5KPZA 2FLOA 2P9NB 2P9PA 4EFHA 2QWRA 4BREA 1H1VA 2IVOA 1C0GA 3MMVA 1YVNA 4IXCA 4BR7A 3L0QA 4H0VB 3O80A 1SQKA 2ITMA 4BC3A 3DXMB 2P9SB 5EX5A 5EVZA 3ZX0A 3I33A 1NBWA 4JN4A 3GBTA 2A40A 3CQYA 4BVOA 3VENA 3O6WA 3HSCA 3M1FA 5AZJA 3P4IA 5AQNA 3EKUA 3SMSA 3J8AA 2GELA 3KHYA 3AAQA 4XH4A 4MLHA 4K41A 1X9JA 2D1KA 2PAVA 2QWNA 2VWBA 5AR0A 1S3XA 2ASPA 1BUPA 4JHDB 5LY3A 4FWKA 1WUAA 3FZHA 1BA0A 1KAYA 2H3GX 1RGIA 3OHRA 3GOIA 4H0YB 4BRGA 4BGBA 5AQIA 4FPBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SN4A 2NY9X 1TVRA 2G8WA 5CZ1A 2IAJA 2D0OA 3CMAN 2ZGYA 3OYCA 2X6NA 5J2PA 1S9EA 4H5VA 1MWKA 3CQ8A 3QERA 2OZMA 3BP8A 3O4WA 5K14A 1ZYQA 4ZHRA 3AO2A 2KSKA 1JLEA 2FSKA 1Q9YA 1GLBG 2I7NA 2JWKA 3P1GA 2P5GA 1K8KA 2NRZA 3ZT4A 1XNQK 3M6GA 3BK3C 1VRUA 1Y64A 3CMEN 3HRGA 1T8EA 3O8MA 1QHAA 2B4JA 4DSIA 3CHWA 3UKUA 2ZQBA 1R0AA 1KVCA 3FR0A 1EETA 3L2UA 2QW9A 2LJ7A 2KKZA 3ID6A 1Z25A 1WAJA 4NCBA 2FF3B 1F21A 2XY5A 4EHTA 2XY7A 3KOZA 1ZVGA 3SQ2A 4JAXA 1P0AA 4NYFA 1QSLA 3HP9A 2Q3SA 4OPAA 2IIRA 3CFOA 3VGMA 4BRPA 1X9SA 3LP2A 3OYMA 3ZSQA 1RNHA 4EZ6A 3VGLA 3OYAA 4FWNA 1JXEA 1ITGA 3U3YA 4B3OA 5CYMA 1YAGA 4K43A 2A5XA 4BQZA 1FXXA 4DR7K 2IS3A 3CPWM 3S3MA 3GKUA 4JNEA 1EO1A 4CEAA 5I3UA 3ENBA 4KPYA 3PLAA 3HM9A 2WBNA 4A62A 4FSVA 5AFUA 4QS7A 4CEBA 3UE5A 1WAFA 1DTQA 3IG1A 4LSLA 1OH7A 5CHIA 3MX5A 2JGUA 5KPTA 4BRNA 5IT9O 3H1VX 4CZHA 3SLCA 4BR0A 5AQWA 3RMBA 4HWIA 1UGLA 1BWFO 5AQOA 3L2VA 4UY8O 4OLAA 3ZX3A 1DEJA 4CEDA 4FJ5A 1O13A 3D2EA 3VA3A 4LH5A 4I6MB 2GWJA 1BI4A 1GOAA 3HVRA 1RCHA 1Q8IA 2YJEA 3O3HA 1N32K 3DLEA 3TAMA 3KLEA 2E6MA 1ZBSA 3ZSZA 4PKIA 1LV5A 2ZM6K 3QEIA 2QTDA 3FLCO 3DLBA 1HNIA 1KV0A 1ZBIA 2QWOA 5DM6L 3FZMA 2F96A 2M8BB 1CXUA 3DLRA 2HNYA 2KBKA 4B9MA 3O08A 4IG0A 1ATSA 2E1YA 3BUZB 2O4GA 4JEPA 4W5QA 3MXIA 2A41A 1VQON 4DS5A 1N5YA 2EX3A 3E66A 4I9LA 4CF8A 4CHPA 1N6QA 5M1PA 4XEIA 4DQQA 2AJQA 2FSNA 1A5XA 2NY8X 4H0OA 4AF1A 1RTDA 4RTFD 2MN5A 4YOYA 1VQ5N 1WSHA 1MYNA 3SZ2A 5GADP 1HX1A 3KK7A 4CGDA 3OBWA 3F5TA 3WXJA 3J81O 1IG9A 5C25A 4A5AA 5KI6A 4WQ5A 3WNEA 4CIFA 2WUSA 3V1RA 3IAYA 2GUPA 1P8ZA 1EWQA 3WQUA 2VY6A 4YOWA 3SCXA 4CFBA 1QVFM 3JXUA 4Y1CA 3ZYYX 2OA8A 3CW4A 1XC3A 3VQCA 2KW4A 1XHXA 1ZBHA 4B9UA 4OKKA 2O8BA 1TUUA 4AB0A 3T1HK 4WQ4C 2Q0RA 4C8NA 4CF1A 2ASCA 2E0HA 2AP1A 4ZTFA 1EXQA 3RSEA 2HHSA 4AQYK 2BDPA 1NGDA 2I7PA 5AQPA 1Q81O 1TI5A 2RE2A 3WEEA 4FVMA 5JENA 1HKGA 3SYZA 4CZGA 3V1QA 3D2FB 1MU2A 5FDLA 2NRHA 2BGGA 5BN9A 1XQSC 3ZSXA 4DU4A 4BY9C 1IKXA 1Z26A 3JYTA 1GLAG 4CIGA 3WT0A 1RT5A 1T0ZA 4DSEA 1Y97A 2Q36A 1HPMA 5SZTA 1I6GA 4Z4GA 1VQ4N 2G8FA 1NK9A 4H03B 4A5BA 3N4PA 2HHHK 3I55N 4N56A 2VGNA 3SV3A 3KOXA 1S6QA 3HT3A 3R6MA 3VOVA 1T7EA 3SQ0A 1M1KO 3UB5A 3C6UA 5JVHL 3O1BA 1FW6A 5AQLA 1T6CA 2ZF5O 4A2BA 4E1JA 4OPKA 3SF4D 3BY5A 4FLTA 3KKRA 3ZX2A 4FJ8A 1ZFUA 4JD2B 4M7XA 5BR9A 5FRNA 2HSTA 3R2VA 4DR1K 3OW2M 2VQFK 2K35A 2KYQA 1YVUA 2E1ZA 3CCJN 4KB0A 3CM5A 4X62K 3O3FA 3K0SA 2DPNA 3PSFA 1NRBA 4KH6A 2LT8A 2E2FA 1FK9A 4DUYK 4BE1A 2ZGZA 1VHXA 2VWJA 1U45A 2ZD1A 1RT6A 3O4QA 1JKZA 1YITN 1CZBA 1TKDA 4BC2A 3HPGA 1JL2A 4GY2B 3IFRA 3WUHA 3ZT3A 4LSNA 2YCHA 3KOYA 2HNDA 2A1RA 4Z4IA 3GG4A 3F9KA 2VYPA 3KTQA 1RDBA 2C1IA 4O44A 3AA5X 3KLGA 4B3MK 4LY7A 1NJXA 3L3UA 3NFAA 4GVEA 4A57A 4FM0A 4J2DA 1BHLA 2HMPA 2UXDK 1BGXT 4BDZA 4M3ZA 1BCMA 3QINA 4PKGA 1JLGA 3IRXA 4BC5A 5AJ3K 1NKCA 3VQPA 4C1NK 5FLXO 4KHUA 3NGZA 2O8DA 1NMNA 2VG6A 3MCPA 3CJCA 3VQAA 4OO1J 3AARA 4KKOA 3AVKA 3EN9A 1ASWA 2O8FA 3U8XA 3FFIA 5ADXH 5HOOA 1NMDA 4DV1K 2QWPA 4KB1A 2F8SA 3NF8A 1NJYA 4Q5VA 2YNGA 1C0UA 2P9UB 1RBVA 3CJ9A 4BR2A 2UXBK 5J2NA 1WSGA 4IEEA 3ZT1A 3E1YA 4ISGA 4BROA 3A5MC 2P5OA 4ELUA 4H0XB 3FZFA 4FL9A 3O3GA 4BVPA 3RRHA 3TARA 1TYQA 3EO3A 3VEYA 4DTJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1SN4 A;  2NY9 X;  1TVR A;  2G8W A;  5CZ1 A;  2IAJ A;  2D0O A;  3CMA N;  2ZGY A;  3OYC A;  2X6N A;  5J2P A;  1S9E A;  4H5V A;  1MWK A;  3CQ8 A;  3QER A;  2OZM A;  3BP8 A;  3O4W A;  5K14 A;  1ZYQ A;  4ZHR A;  3AO2 A;  2KSK A;  1JLE A;  2FSK A;  1Q9Y A;  1GLB G;  2I7N A;  2JWK A;  3P1G A;  2P5G A;  1K8K A;  2NRZ A;  3ZT4 A;  1XNQ K;  3M6G A;  3BK3 C;  1VRU A;  1Y64 A;  3CME N;  3HRG A;  1T8E A;  3O8M A;  1QHA A;  2B4J A;  4DSI A;  3CHW A;  3UKU A;  2ZQB A;  1R0A A;  1KVC A;  3FR0 A;  1EET A;  3L2U A;  2QW9 A;  2LJ7 A;  2KKZ A;  3ID6 A;  1Z25 A;  1WAJ A;  4NCB A;  2FF3 B;  1F21 A;  2XY5 A;  4EHT A;  2XY7 A;  3KOZ A;  1ZVG A;  3SQ2 A;  4JAX A;  1P0A A;  4NYF A;  1QSL A;  3HP9 A;  2Q3S A;  4OPA A;  2IIR A;  3CFO A;  3VGM A;  4BRP A;  1X9S A;  3LP2 A;  3OYM A;  3ZSQ A;  1RNH A;  4EZ6 A;  3VGL A;  3OYA A;  4FWN A;  1JXE A;  1ITG A;  3U3Y A;  4B3O A;  5CYM A;  1YAG A;  4K43 A;  2A5X A;  4BQZ A;  1FXX A;  4DR7 K;  2IS3 A;  3CPW M;  3S3M A;  3GKU A;  4JNE A;  1EO1 A;  4CEA A;  5I3U A;  3ENB A;  4KPY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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