3D2FB

Crystal structure of a complex of sse1p and hsp70
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the cooperation of Hsp70 and Hsp110 chaperones in protein folding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock protein homolog SSE1
molecule tags Chaperone
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 116
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3d2fB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2fB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2fB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3d2fB04
4CZEA 3CQXA 1HX1A 1S22A 2FSJA 2P9SB 1U2VB 1YXQA 3JXUA 4GNIA 3LM9A 4K25A 4QS7A 4EIAA 4B1UB 5AZJA 3UKRA 4M63C 3SMSA 3UKUA 4JAXA 5BN9A 3FR0A 4FWKA 1YAGA 1GLBG 4EFHA 1NGGA 1T6DA 5JMVA 2P9LA 4M7XA 4BR2A 4RWTA 1R59O 5LJWA 4BGAA 3C0BA 3VEVA 2IVPA 3VEOA 1GLLO 2P9KB 3VOVA 3LDOA 4DHYA 4BRQA 4QS8A 2QWNA 1XQSC 3MDQA 4BRFA 2GEMA 3VF6A 3D2EA 2D0OA 2A3ZA 1IJJA 2W40A 1HJOA 2GUPA 4FL9A 3C7NB 4Z94A 4JNEA 1MWKA 3O4WA 3CETA 5AQGA 3A5LC 2YHXA 4CZKA 2QW9A 4IXCA 4BRNA 2P9IB 2FLOA 3LL3A 2ITMA 2YHYA 1QZ5A 3VF4A 3HM8A 4WQ5C 5AQJA 4XH1A 3QFUA 2ASPA 1SZ2A 3AAPA 4A61A 5BRDA 4WQ5A 3RSEB 5BR9A 2A42A 3AY9A 1OKJA 3J8AA 5AQXA 4YDUC 2NZTA 3DWLA 3IFRA 4ISEA 2P9UA 2F9TA 4BR4A 3UB5A 4XH5A 1ESVA 3BP8A 3GE1A 3CIPA 4BR5A 5KPTA 1C0GA 3JS6A 2CGLA 3BF1A 2QM1A 3MN7A 3CQYA 3QBXA 4PL7A 5ADXA 1Z6RA 3DXMB 5ELZA 1BUPA 5TKYA 3WQUA 2Q31A 3F9MA 4FPAA 3R9PA 4FWMA 2FF3B 4I6MB 4M7YA 3FZLA 1KAYA 5B8HA 5EX5A 4A2BA 4CD1A 4A2AA 3HTVA 1TUYA 1ZC6A 3H45C 3L4IA 5EY4A 4H5WA 4C23A 2D1KA 2E1ZA 3H6EA 4B1VA 2QWLA 5LY3A 3GG4A 2P9SA 3TPQA 1U2VA 2QWRA 4H5TA 3LDLA 5JICA 2GTDA 4FOIA 3QDKA 1MDUB 5FPNA 3FZFA 2VCPA 3O08A 4JN4A 3H3NO 2ZGYA 4DQ8A 4AM6A 2A40A 3WXKA 3WUHA 3CJAA 3O6WA 3WEEB 3WXJA 1P8ZA 2UYTA 5AQUA 2IVOA 4MLHA 1G99A 4WYBA 5AQQA 5AQIA 5BPNA 4DCHA 5AFUH 2ZWHA 3HI0A 3R8EA 5BRFA 3CJ1A 5F1XA 1KAXA 4MLEA 3HBTA 3R6MA 4FO0A 3HZ6A 1HPMA 2I7NA 3BF3A 4JD2A 3ZETB 1T44A 4BRLA 5BRHA 1RGIA 2J4RA 1DEJA 4K41A 2QXLA 3VGKA 1YUWA 1ATNA 3FZKA 3LDNA 2GWJA 3M6GA 2YHWA 2EWSA 3KHYA 1TYQA 3UE5A 1J6ZA 4ISGA 3S41A 2Q0UA 2KHOA 3A0IX 4LC9B 3CJCA 5LJVA 3EKSA 4HTLA 3RSEA 3EKUA 4CBUA 1V4SA 1JCEA 4CBWA 3SLCA 2DPNA 3B8AX 3I33A 3U4LA 1NGEA 1JCFA 3WXLA 3EN9A 4IJAA 4BC2A 5F2RA 4BQZA 4ISFA 2NRHA 1E4GT 3ZX0A 1S3XA 1WUAA 1MA9B 1K8KB 1GLEG 4H0XB 4BG9A 4WQ4C 3DAWA 2D0PA 3VEWA 3CERA 1X9JA 3O1BA 4RTFD 2E2PA 1XC3A 2BUPA 1IG8A 2P9NB 3H46O 4BR7A 4IZ9A 5CE3A 5EVZA 4XH4A 5BN8A 3AAQA 2IVNA 3OHRA 2W41A 4BRPA 4BRHA 2HMPA 3MN6A 1BOTO 3VENA 4PKGA 3O8MA 4DB3A 1GLJO 2YJEA 5BREA 2FXUA 4NO7A 3QMLA 4KBOA 3W3DA 2PAVA 4H0PA 4BC3A 1HLUA 5AQWA 2CH5A 4JHDB 4YDUA 2VWBA 4EHTA 1QQOA 4FWPA 4BRMA 3O1WA 3WEEA 2ASOA 3CJ7A 3U9DA 2Q2RA 5AQKA 3VEYA 2OANA 2H3GX 4L3QA 4QS9A 4IWVA 3VEZA 1NGBA 1NGFA 3VPZA 2P9LB 1U6ZA 3L6QA 5AR0A 3ULEB 1WOQA 2P9PA 4BRCA 4J8FA 5E84A 3LDQA 2I7PA 3H1QA 3ENOA 5I9EB 1KXPA 4F9OA 4BR0A 3WT0A 1YVNA 3MN5A 2QWMA 1X3MA 3MMVA 4IJNA 2GELA 2A5XA 3MCPA 1E4FT 5AQNA 4BR9A 2HF4A 4B1WB 1ZXOA 2Q36A 3VF2A 1T6CA 4PKHA 2F9WA 1CZAN 1TUUA 3GBTA 3VEXA 2V51B 4PL8A 1GLDG 4EAHD 5BPMA 3U9ZA 2D4WA 4FWSA 5JLHA 5KQ8A 1EQYA 3VERA 2YJFA 3QB0A 3BUZB 3HSCA 2E2NA 2P9KA 4MO5A 5BPLA 3FE1A 4BQLA 3MK6A 2E88A 5AZIB 4BC5A 3A5MC 3A8YA 1NM1A 3C7NA 3M1FA 4O5FA 1BA0A 4MO4A 5AQPA 1GLCG 1HKCA 2YI1A 4FWLA 4H0TB 4BC4A 4FOEA 4H0VB 2E8AA 2GWKA 3WQTA 3EO3A 4H5VA 2P9IA 2ASMA 3EZWA 1C0FA 1GLFO 3GOIA 1QQNA 3W0LA 1SQKA 4BVOA 4GY2B 3G25A 3FLCO 4CJ7A 3BEXA 2V52B 4FWOA 1LCUA 2V7YA 3FGUA 3D2FB 4H0YB 3QFPA 5KQDA 4BRAA 2Q0RA 3GDQA 4BRKA 2VYPA 4CZHA 3I8BA 2WUSA 3CHWA 3SMPA 4A62A 3O80A 1QQMA 1HKGA 2ZGZA 3LM2A 3FZHA 3SJHA 4BGBA 5FPEA 1H1VA 2E1YA 4BRDA 2FSKA 5AQSA 1DGKN 3M3ZA 4B1YB 5AQFA 4CBXA 1NWKA 3AARA 2FF6A 5E26A 1SAZA 1QHAA 1MWMA 3DXMA 3QICA 4K43A 3ENHA 4BG8A 5ADXH 4K42A 1DKGD 3ZX3A 3H1VX 2NLXA 4I6MA 4CZIA 5AQVA 1NLVA 3ULEA 3VESA 3MN9A 5KPRA 4WQ4A 4CI6A 2Q1NA 3FFKB 5AFUA 1ZBSA 4BRGA 5AQHA 3D7EO 3IUCA 3CJ9A 3DXKB 4JD2B 3SK3A 4CZJA 3L0QA 3FZMA 4B1ZA 3WXIA 5AQMA 4FSVA 3ZEUB 4EHUA 3IMXA 5AQZA 4HWIA 2E20A 2IIRA 5AQLA 3A5NC 3DJCA 4AM7A 1TYQB 1HKBA 2AP1A 3ATVA 1Y64A 1RFQA 4H03B 1X3NA 5AZJB 3UKRB 4B9QA 1Q18A 3VGLA 3UKUB 3CI5A 4XEIA 4BRIA 1V4TA 3ZX2A 2A41A 5AZIA 3TU5A 3P4IA 2FSNA 2CGJA 5F0XA 4H5RA 1ATSA 3IDHA 5FPDA 3ZETA 2PBDA 4Y0WA 4FPBA 3KZBA 3EL2A 3VGMA 1XUPO 3D2EB 1NGDA 2QWPA 1NMDA 5AQYA 1LOTB 1GLAG 4CZFA 4BREA 1HUXA 4PKIA 3ID8A 5AQOA 1BO5O 5FPMA 2E2OA 4BVPA 3D2FA 2E2QA 4CD3A 1BU6O 4CZLA 4H0OA 3KVGA 2QWQA 3ATUA 5KPZA 1BDGA 3H3OB 3QBWA 4B1XB 4RCHA 3GL1A 1JCGA 1NBWA 1RDWX 2Q97A 1NGCA 5AQTA 5AQRA 1K8KA 1QZ6A 4H5NA 1BWFO 1Z05A 2P9UB 4O8KA 5EOYA 2V7ZA 1D4XA 4CZGA 2CGKA 1KAZA 1BA1A 4FWRA 2QWOA 2P9NA 4E1JA 2A6AA 1BG3A 5EXWA 3VETA 3CJBA 2CH6A 1NGAA 4FWNA 3A5OC 4FWQA 1NGJA 2P9PB 3O5BA 4BROA 4NB4A 1ATRA 4CZMA 5JLFA 3LDPA 2AA4A 3DXKA 1NGHA 3U8XA 2HF3A 2YCHA 1NGIA 2HOEA 2ZF5O 3ZEUA 2BTFA 4JHDA 4IO8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CQXA 1KFSA 2P9SB 1YXQA 4EIAA 4DR4K 3UKUA 1DJTA 5BN9A 3QEXA 3FR0A 1YAGA 2ASCA 1NGGA 1VSLA 3HK2A 5JMVA 4M7XA 3CM5A 2UXCK 1VSKA 3NH2A 1ZBUA 2C1IA 1YT3A 2IVPA 3LDOA 1BIZA 4RW9A 4CERA 3VF6A 1IJJA 4JKFA 5C24A 2G8KA 3C7NB 4KTZA 3OBYA 2X6NA 3GKUA 2LJMA 1W97L 4CZKA 4IXCA 4B8AB 4DQRA 1WSGA 4LSLA 2F4VK 3LL3A 2ITMA 3HM8A 1KC8O 4IOXA 2YILA 1SZ2A 4LF6K 2GX9A 3S3NA 5BR9A 4LFCK 5C15A 4NXNK 4IFYA 2DFHA 1KQSM 1NPIA 3DWLA 3OJSA 4BR4A 2F9TA 4H4MA 3UB5A 3V9SA 3SCXA 3CIPA 1C0GA 3OYIA 4LF8K 4B9UA 3S5TA 3LANA 3VQBA 4N56A 1Z6RA 3WQUA 3R9PA 3F9MA 4GV6A 4M7YA 1KAYA 3FZLA 4LH5A 3HTVA 3ID6A 3H45C 4H4OA 5EY4A 1C0UA 2O8FA 1C6VA 2D1KA 2E1ZA 4B1VA 5LY3A 1CHZA 1WSIA 1VSMA 3KKSA 2P9SA 3DOLA 3LDLA 3QDKA 3QNNA 1NRAA 4BECA 2VCPA 3LPTA 3H3NO 2A40A 1BL3A 3WXKA 4MQ3A 1KLMA 5AQUA 2IVOA 4JI2K 2E5LK 1G99A 3G10A 5BR8K 1VSJA 3RR8A 4OPAA 4FYDA 3HI0A 4JKGA 4FK4A 5BRFA 5F1XA 2O8CA 2OPRA 1HPMA 4M3UA 4JD2A 1HYSA 3NMUA 4BRLA 4DR7K 2J4RA 4RG8A 2QXLA 2GV9A 4OLAA 1ATNA 1SL1A 4DU3A 3DLHA 4O8UA 1TYQA 3O4NA 3QETA 3QO9A 3RRHA 2KHOA 4Z0UA 4HTLA 4N41A 2FBVA 4DFJA 1Q82O 1PTXA 2MZ0A 3L3VA 4KB1A 4I2QA 1U49A 2ZJPL 3I33A 3U4LA 3L2RA 3HOSA 2AJQA 4DUZK 4BC2A 1BHLA 4ISFA 1E4GT 1BCMA 3D45A 1MA9B 5C25A 2O4IA 4CEQA 4BG9A 2EX3A 3OYMA 3DAWA 3VEWA 1X9JA 1QE1A 2HHSA 4NLBA 1KSPA 5EVZA 4XH4A 3D0PA 5GAGP 1IKXA 3OYJA 1XI1A 1FH3A 3AAQA 5C12A 4CJWA 3CYGA 2W41A 4BRHA 2BGGA 3MEEA 4FM1A 3HVTA 4H8KA 4FJHA 2YHBA 3L4QA 1ZBLA 4DB3A 1VQ7N 1W2BM 3G71N 4KBOA 1U45A 2PAVA 3L2UA 1BRZA 4FJ9A 4ICLA 3V9ZA 1B7DA 2HNZA 3VTHA 1EWRA 2ATQA 2OZMA 4FZXC 2VWBA 1ZYQA 2FC0A 4BRMA 2ITGA 3VQPA 3CJ7A 2NNWA 4Y1CA 4HE7A 2OANA 2H3GX 3SYZA 3J7AP 3C95A 5JVGL 1NGFA 3T69A 3CCEN 3PX4A 4KAZA 3NHGA 5I9EB 4UJ0A 1AHOA 3NF9A 1YTUA 2ZD1A 3WT0A 3MN5A 1ICAA 5GIOA 4ELTA 4DMNA 4IJNA 1S9GA 2YEOA 2GELA 2XY6A 3MCPA 2RE2A 2UU9K 5AQNA 1R0AA 3V4IA 1NJYA 3V6DA 2HHVA 4N76A 1POIA 2QI2A 4FJGA 3S3MA 1T7EA 2VWKA 3VEXA 1ZYWA 4CF2A 1UOCA 1I94K 1VQMN 4JKHA 4UY8O 4O0JA 1WSHA 4EAHD 5CR4A 1HMVA 3AVNA 3VERA 3EY1A 1SL2A 3BUZB 3ITHA 1I2VA 2E88A 3A5MC 3M1FA 2XY5A 5CHIA 1BA0A 1GLCG 2YI1A 4FWLA 4TSXA 4N5SA 2E8AA 3O9QA 4F4KA 3EO3A 2KZZA 4AB0A 3ZT2A 2NY8X 4DTUA 1L4VA 1GLFO 3GOIA 4GKJK 3K0SA 3C94A 3G25A 4CJ7A 4DR1K 4A57A 3FGUA 2ZJQL 1N36K 3L2QA 2O4GA 2VYPA 4M3YA 4A62A 2Z1GA 1D9FA 3SF4D 1QQMA 1WT7A 3AVFA 2NRVA 3O80A 2HMIA 3HJFA 4MDBA 4CESA 1QQCA 3CCQN 5KRSA 3OS2A 2HHXA 2WC9A 3LWMA 4CBXA 1XC9A 4I2PA 3J80O 2FF6A 4ILGB 1SAZA 4DU1A 1MWMA 3DXMA 3QICA 5ADXH 3ENHA 3MX2A 1N32K 3F9KA 4I6MA 5AQVA 3OA9A 4CEFA 3CCSN 3MN9A 1SKWA 3KLIA 1W7AA 5AFUA 3CC2N 3LDSA 3AVLA 1EP4A 3TAMA 3PIPL 3B6OA 3B6PA 1DQ7A 2NRXA 2WONA 3SK3A 4DQQA 1TKDA 4OJRA 2XHBA 3WXIA 1SS6A 1LWFA 5CY0A 3PUFA 3ZEUB 4EHUA 2EHGA 3IMXA 3RVCA 4HWIA 1XWLA 3P31A 2UXDK 3DLBA 3ATVA 1Y64A 4KHNA 1TKXA 1NK7A 1SKRA 1HJRA 1Q18A 1X1PA 3PY8A 1VSIA 4BRIA 2QEXN 1V4TA 4CHYA 4J2AA 2VG6A 2Y1JA 1HQEA 3OW2M 3P4IA 4H5RA 1ATSA 5FPDA 2PBDA 4YNQA 2LKBA 5AQYA 1TI5A 3KP1A 2FBYA 1LOTB 3PSFA 1B92A 1JZBA 4CZFA 4PKIA 3KTQA 1HPZA 3VQ6A 1QSLA 2E2OA 1U04A 1BK8A 1TK5A 1KCFA 4CZLA 4KTWA 3CC7N 3V1RA 4HHTA 3ATUA 5KGXA 1FW6A 5GAHP 2OTJN 5I3UA 4CGJA 3QBWA 2PYJA 4JEPA 4JKEA 1C1CA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3CQX A;  1KFS A;  2P9S B;  1YXQ A;  4EIA A;  4DR4 K;  3UKU A;  1DJT A;  5BN9 A;  3QEX A;  3FR0 A;  1YAG A;  2ASC A;  1NGG A;  1VSL A;  3HK2 A;  5JMV A;  4M7X A;  3CM5 A;  2UXC K;  1VSK A;  3NH2 A;  1ZBU A;  2C1I A;  1YT3 A;  2IVP A;  3LDO A;  1BIZ A;  4RW9 A;  4CER A;  3VF6 A;  1IJJ A;  4JKF A;  5C24 A;  2G8K A;  3C7N B;  4KTZ A;  3OBY A;  2X6N A;  3GKU A;  2LJM A;  1W97 L;  4CZK A;  4IXC A;  4B8A B;  4DQR A;  1WSG A;  4LSL A;  2F4V K;  3LL3 A;  2ITM A;  3HM8 A;  1KC8 O;  4IOX A;  2YIL A;  1SZ2 A;  4LF6 K;  2GX9 A;  3S3N A;  5BR9 A;  4LFC K;  5C15 A;  4NXN K;  4IFY A;  2DFH A;  1KQS M;  1NPI A;  3DWL A;  3OJS A;  4BR4 A;  2F9T A;  4H4M A;  3UB5 A;  3V9S A;  3SCX A;  3CIP A;  1C0G A;  3OYI A;  4LF8 K;  4B9U A;  3S5T A;  3LAN A;  3VQB A;  4N56 A;  1Z6R A;  3WQU A;  3R9P A;  3F9M A;  4GV6 A;  4M7Y A;  1KAY A;  3FZL A;  4LH5 A;  3HTV A;  3ID6 A;  3H45 C;  4H4O A;  5EY4 A;  1C0U A;  2O8F A;  1C6V A;  2D1K A;  2E1Z A;  4B1V A;  5LY3 A;  1CHZ A;  1WSI A;  1VSM A;  3KKS A;  2P9S A;  3DOL A;  3LDL A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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