3FE1A

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 6 (hsp70b') atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQAALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVRVCYRGEDKTFYPEEISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRRGAGERNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAKRTLSSSTQATLEIDSLFEGVDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDVVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 6
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 128
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3fe1A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fe1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fe1A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3fe1A04
3MN5A 3LDPA 3A5OC 4BR9A 2YJEA 1Y64A 4BC2A 2IVOA 1XQSC 3WXLA 4M7XA 3ATUA 4Y0WA 2P9SA 2IIRA 2HMPA 3B8AX 3TU5A 3GDQA 3FGUA 3SLCA 3M1FA 4H5TA 1C0GA 4IJAA 3VEYA 4DCHA 4FWOA 3EZWA 3JS6A 2GUPA 2VCPA 4CZIA 1ATSA 5BPLA 5AQPA 2ZWHA 3SK3A 2E1ZA 3IFRA 3BP8A 4NB4A 4H5WA 3W0LA 1HKCA 4B1XB 5AQSA 4FL9A 4BRAA 4EHTA 5EY4A 1BDGA 3QFPA 4C23A 3KZBA 4FWNA 1KAXA 2QWOA 3H1VX 1XUPO 3RSEA 4YDUC 1LOTB 4ISGA 4B1ZA 2E2NA 1HUXA 3QDKA 5KQ8A 4JD2B 1MWKA 3I33A 2NLXA 3H45C 3WEEA 2F9WA 2J4RA 4I6MA 2IVNA 1JCGA 5AR0A 5ELZA 5AQMA 1T6DA 3EO3A 1SAZA 1ZXOA 3MK6A 1QQMA 2P9PB 2IVPA 3LDQA 4BG9A 2A6AA 3QFUA 3A8YA 5EXWA 4O8KA 3IDHA 5BN8A 4FWQA 1SZ2A 4L3QA 3R6MA 3VOVA 5E84A 3LL3A 4WQ5A 3CQYA 5AQUA 1H1VA 5B8HA 1JCEA 1ZC6A 1TYQB 2FLOA 1ATRA 2E2QA 3BF3A 3P4IA 3R9PA 3EL2A 3H3NO 5LJWA 1BG3A 2I7PA 3WQTA 4CD3A 3R8EA 3H6EA 5BRDA 3WT0A 4XEIA 3FR0A 4DB3A 4QS8A 5AQLA 4M63C 1NGGA 1YVNA 2Q1NA 3MN9A 4A62A 4JD2A 4BVPA 4WQ4A 4A61A 3U9DA 4MLHA 1K8KA 1BOTO 3O8MA 2V7ZA 5JLHA 1NWKA 2H3GX 3FZHA 1BA0A 3D7EO 2A3ZA 2CGLA 3MN6A 3FZFA 4PKHA 3UKRB 5KQDA 3DXKA 2QWNA 1GLLO 2P9IA 3FZLA 4JAXA 4K25A 3H3OB 2AA4A 1HPMA 4H0TB 5F1XA 5EOYA 5AFUH 2ITMA 3U4LA 3UKUB 2OANA 3OHRA 3VETA 4AM7A 4IZ9A 1HJOA 3VEZA 3L6QA 1Z05A 4H0VB 3F9MA 4XH1A 3CJCA 3BF1A 3JXUA 1DKGD 2D4WA 5BPNA 3VPZA 1V4SA 4H5NA 3U9ZA 4CBWA 5AQWA 3VEOA 1BWFO 1V4TA 2V7YA 3FZMA 3WXJA 1YXQA 4EFHA 4J8FA 4BR2A 5TKYA 4B1VA 2V52B 3LDNA 4FWSA 1HLUA 1MDUB 4FO0A 4BRQA 3GE1A 4O5FA 3O4WA 3O1WA 3D2EB 3D2FA 3KHYA 4H0YB 1MWMA 3CJBA 3HI0A 5AFUA 3MCPA 5I9EB 3LDLA 4RWTA 2Q97A 2AP1A 3VF6A 1HX1A 1DGKN 3M6GA 4HWIA 2QWMA 4BRCA 3QBWA 3ULEA 2BTFA 4CBXA 3CI5A 1Q18A 1D4XA 4H03B 2Q2RA 4JHDB 2P9KB 2YHWA 3C7NB 3AAQA 5AQRA 3FFKB 4BRLA 4WQ4C 3UKRA 5AZJA 5BR9A 2P9UB 5KPZA 5AQJA 5JMVA 4B1YB 2FXUA 1NGJA 4RTFD 4BR5A 2F9TA 3UKUA 5EVZA 3CIPA 3LDOA 3I8BA 2I7NA 2Q0RA 3WXIA 4BROA 4BVOA 4AM6A 3ZEUB 4BRPA 1R59O 2ZGZA 5KPTA 1XC3A 4MLEA 5CE3A 2A40A 1BA1A 2CH5A 3CETA 2P9NB 1SQKA 3CJ9A 2ASOA 4WYBA 4BRKA 3VGLA 4BG8A 4PL7A 2QWQA 4FOIA 3ATVA 4BRGA 4BC5A 3TPQA 2P9LB 2ASPA 1KXPA 3VGMA 2DPNA 1JCFA 1GLJO 3FLCO 1ATNA 1NGHA 5AQVA 4CZJA 5AQGA 1BU6O 5FPNA 4Z94A 3HTVA 4CZFA 5AQQA 2YI1A 2FSNA 4GY2B 3W3DA 4JHDA 1QZ6A 2A42A 2QWLA 2P9KA 2HF3A 3VF2A 4FWRA 4IWVA 4JNEA 4DQ8A 1WOQA 4BRIA 3BEXA 1TUUA 1C0FA 1EQYA 4QS7A 2QWPA 3VERA 2FSKA 2E88A 4H5RA 2QXLA 5AZIB 5BREA 3O5BA 1NGAA 3VEVA 2P9NA 3ZX0A 1GLAG 1E4GT 2HF4A 5AQHA 1HKGA 5F2RA 4DHYA 4XH5A 1ZBSA 3LM9A 5BRFA 5AQZA 3GOIA 1S22A 2P9PA 4H5VA 2P9SB 4RCHA 3FZKA 4PKGA 2D0OA 4FPBA 4BRMA 4CJ7A 3SMPA 1NGFA 5AQOA 3DWLA 1YUWA 2UYTA 4H0PA 1TYQA 3VGKA 4EAHD 1TUYA 3ENHA 1ESVA 1QHAA 1RDWX 3LM2A 3WUHA 4K41A 5FPMA 3GBTA 5KPRA 3SJHA 2CGKA 2WUSA 3VEXA 2ZGYA 4FWMA 3O6WA 3CJ7A 4WQ5C 5E26A 4B1UB 5ADXH 4PL8A 4XH4A 1E4FT 3UB5A 2GWJA 2FF3B 1LCUA 3GG4A 5BPMA 4BGAA 4A2AA 3O1BA 1U6ZA 1OKJA 5BN9A 2E1YA 2VWBA 3HM8A 4B9QA 4CZMA 1GLBG 3MN7A 5AQKA 1NGDA 4FSVA 4JN4A 2Q0UA 3AY9A 3A0IX 3MDQA 2GELA 4EIAA 4QS9A 3RSEB 2A41A 4BREA 5ADXA 1BO5O 2D1KA 3WEEB 4I6MB 4FPAA 2CH6A 2YJFA 4M7YA 2W40A 1GLCG 1X3MA 2FSJA 3A5LC 2GTDA 5AQFA 3VF4A 4ISEA 1CZAN 3QICA 5FPDA 2Q36A 3ZX3A 3MMVA 1QQNA 4BR7A 3EKUA 3O80A 4PKIA 4BC3A 4BQLA 1NGCA 3ZETB 4GNIA 1NLVA 2W41A 1Z6RA 2QWRA 1HKBA 1T44A 3DAWA 3D2EA 2E2PA 5F0XA 4CZHA 2PBDA 4IXCA 1IG8A 4FWKA 1KAZA 1MA9B 4ISFA 3EKSA 3HZ6A 4H0XB 4IO8A 1GLDG 1IJJA 2YCHA 4BQZA 4F9OA 4HTLA 5AQXA 2A5XA 3ID8A 1T6CA 3WQUA 2GEMA 3VENA 3C7NA 3ENOA 3HBTA 1K8KB 1U2VB 4K43A 2P9UA 3EN9A 3DJCA 3SMSA 4A2BA 5AQYA 1P8ZA 3DXMB 4CZKA 3QBXA 4BC4A 3L4IA 3BUZB 5JLFA 2YHYA 1DEJA 1G99A 1NBWA 2QM1A 3S41A 3C0BA 3O08A 4E1JA 5AQIA 5EX5A 2PAVA 2E8AA 1QZ5A 2D0PA 2YHXA 3DXKB 3ZEUA 4B1WB 2P9IB 1RFQA 1GLFO 1NM1A 4LC9B 4CZEA 1RGIA 2VYPA 1GLEG 3ZETA 3U8XA 3UE5A 4BRNA 5AQTA 3L0QA 3WXKA 4CD1A 1NGIA 3G25A 2FF6A 5JICA 4FWLA 2NRHA 2P9LA 3AARA 2GWKA 1BUPA 4K42A 1YAGA 3KVGA 4H0OA 2CGJA 3ZX2A 3M3ZA 4FOEA 2ASMA 2EWSA 2Q31A 3IUCA 3CJAA 3CERA 1X9JA 3GL1A 3D2FB 4BRDA 4BRFA 1NGEA 4IJNA 3AAPA 3J8AA 1J6ZA 1QQOA 2KHOA 3QB0A 4CI6A 3VESA 1KAYA 1U2VA 3H46O 3VEWA 2HOEA 3IMXA 4MO4A 1NMDA 3DXMA 2ZF5O 3ULEB 4CZGA 3HSCA 1X3NA 3CHWA 2QW9A 5LJVA 2V51B 3CJ1A 5AZJB 2E20A 3QMLA 4NO7A 3CQXA 1S3XA 2BUPA 4BGBA 5AZIA 4YDUA 4BR0A 4MO5A 4CZLA 4BR4A 1WUAA 3A5MC 4FWPA 5BRHA 5AQNA 4BRHA 5LY3A 1NGBA 2E2OA 3A5NC 2NZTA 3H1QA 4CBUA 4EHUA 4KBOA 3FE1A 5FPEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZVGA 3LDPA 2QKKA 4PQUA 2KKZA 2YJEA 3VQAA 2HSTA 2YX6A 4BC2A 1YJWN 3O9TA 5FRNA 3GDQA 3FGUA 3SLCA 4AILC 4E1MA 3VEYA 4FWOA 3FFIA 1NJYA 2G8UA 2LY6A 4B8AB 3QO9A 1ATSA 1GPSA 1TGOA 3HVTA 5AQPA 3SK3A 2SN3A 3A2FA 2IS3A 1TV6A 1WAJA 1NRAA 1KC8O 1HKCA 4B1XB 5AQSA 1RDCA 4FL9A 1NK6A 2QTDA 4BRAA 2E3FA 1B92A 1XNRK 3TSQA 2NRZA 1NG9A 4FZYA 1BDGA 4W5NA 3QFPA 4C23A 1T7BA 1XUPO 4UQGA 5GINA 2HHWA 4F3OA 1LOTB 4ISGA 3QDKA 4KKOA 4HUEA 1MWKA 1NOYA 3SPYA 4KPYA 1U4BA 4CJEA 1JCGA 3VMFB 1TVRA 5M1QA 3O9SA 4LF6K 1QQMA 2IVPA 4E89A 1NRBA 5EXWA 4O8KA 3IDHA 4FWQA 1RTHA 3R6MA 2KW4A 3SUQA 1CN2A 3DLEA 3CQYA 1H1VA 5HRRA 1JCEA 4Q0BA 1TYQB 4AHUA 1TL1A 2E2QA 5TKWA 5LJWA 2HBJA 4CGJA 2I61A 4E7LA 3AA4A 4CD3A 3R8EA 2E3GA 2X78A 1RBVA 3QEVA 4CEFA 3HSTB 4JKEA 1WT7A 2MN5A 2VQFK 1KFSA 3NF9A 3E01A 3KWIA 4FLZA 1YVNA 3AVGA 4AB0A 3C6UA 3CMEN 4CF8A 2HHXA 2G2KA 4JD2A 4CQKA 1KVBA 1T7AA 4CJUA 3BZCA 1KCFA 1UAXA 3O8MA 4ZHRA 3ZSYA 2QA4N 5JLHA 1POIA 3E9PA 5CR4A 3FZHA 1BA0A 3TAPA 2O8CB 1OH7A 3OJSA 1VQ4N 3KLIA 4FJNA 3CFOA 1IKYA 4PKHA 3KLHA 1LQIA 3DXKA 3EYZA 2P9IA 3U4LA 5F1XA 3VETA 3VTIA 3V1QA 3OHRA 4DMNA 4IZ9A 2OTJN 3KJVA 1ASVA 3L6QA 3T1AA 4H0VB 1TK8A 3J7YP 1D8YA 3CJCA 2O8DB 1RT5A 1V4SA 3U9ZA 4CBWA 1BWFO 1V4TA 3WXMB 1NKCA 1VQ5N 2G8FA 2O4GA 4FW2A 4J8FA 3LP1A 1DTTA 4B1VA 3KK3A 4YNQA 3OYDA 1FJGK 3O4WA 4H4MA 3I55N 3D2FA 4H0YB 3CJBA 3DLRA 3HI0A 4FJJA 4CESA 4FM1A 4RWTA 3O9UA 4ID1A 1HX1A 3OYJA 4DTSA 2QWMA 4DR6K 3QBWA 1LWEA 1VQKN 4JI2K 4GV9A 1NPIA 2Q2RA 3E9LA 3P5JA 4FJ5A 4WQ4C 5AZJA 4OJRA 4B1YB 1PTXA 2FXUA 2KYQA 4BR5A 5EVZA 3CIPA 3LDOA 2Q0RA 2Z1GA 1WSHA 4CJKA 2LSNA 4NLCA 2LI7A 3ZEUB 3QEIA 1R59O 1T05A 1XC3A 5CE3A 1BA1A 3TAFA 2CH5A 3CETA 3VQ9A 3L3VA 4W5QA 2QWQA 3MX2A 2JWKA 1Q86O 2ASPA 3I0RA 2Y1JA 1IV0A 1GLJO 3JSMA 1LV5A 3KC6A 2PYLA 3V1OA 4CZJA 3LWMA 1BU6O 5FPNA 1TKTA 4CZFA 5AQQA 2FSNA 4GY2B 4CJPA 4JK7A 3W3DA 2QWLA 4BE0A 3HP6A 4IWVA 3SPZA 4CF9A 3K0SA 2JDQD 3NHGA 4CHZA 3D45A 4BRIA 3BEXA 2UXBK 1TUUA 2BGGA 1EQYA 1RILA 2LJ7A 4QS7A 1I2UA 4O0IA 4QOZB 2ITGA 1S6PA 4IG0A 4W5RA 3NH0A 3KWGA 3OYNA 4CGFA 2P9NA 4Z4HA 1OVYA 4DR7K 1VSKA 2HF4A 3KTQA 5AQHA 4Z4IA 2NRTA 4DHYA 3SQ4A 5KRTA 5AQZA 3KD5E 1XHZA 2KBHA 2MBKA 3TAQA 4E0DA 1GOBA 3SZ2A 4UAFE 2XY7A 4KHNA 1HNXK 1BCGA 3JAMO 2D0OA 3K58A 3AVHA 1YUWA 3VGKA 5C15A 3I8DA 1RDWX 3U3YA 3LM2A 3OYFA 2ZJPL 5FPMA 3GBTA 3SJJA 1HYSA 1S1XA 4IFYA 4LSNA 3EEQA 4WQ5C 4B1UB 1E4FT 1JZAA 2GWJA 5HL7L 2FF3B 4BACA 1TAUA 1LCUA 1YTUA 1Q9YA 3GG4A 4BGAA 4A2AA 1BCMA 4DV2K 4CZMA 3TAGA 4JRQA 1GLBG 3MN7A 5AQKA 1N34K 3AA3A 4M3WA 1IO2A 4CJVA 4FYDA 3O4NA 1NJWA 1HR0K 5M1PA 1Q9XA 4CE9A 1Q7YO 4OLBA 2D1KA 4R5PA 1TKZA 1KTQA 2HNDA 1GLCG 4YHHK 4JRPA 3VF4A 4ISEA 3CW4A 1CZAN 4N56A 3ZX3A 4BR7A 4DUYK 4FLTA 4PKIA 3P1GA 5H1SQ 4KREA 1P00A 4OKKA 1NLVA 2D56A 3V6DA 2PY5A 1Z6RA 4IOCL 1WSJA 1T44A 1VRUA 3DRRA 4ID5A 3MEGA 3LWLA 4LFCK 2VWKA 3DLLL 3G71N 4CZHA 3RMAA 3I56N 3DLHA 3KK1A 1Z25A 1I2VA 3SAFA 3RMDA 4NXMK 4NYNA 4CGHA 3R2VA 4CHPA 1QSLA 1OH6A 4BQZA 5CZ1A 4RW4A 5AQXA 2A5XA 1T8EA 3WQUA 2GEMA 1C0TA 1W0HA 4K43A 5CZ2A 3SMSA 4A2BA 5AQYA 2QEXN 4DF4A 2D0AA 4BC4A 3L4IA 2BDPA 3KLFA 1RTJA 4LFBK 4WFBL 1DEJA 3LANA 2Y1IA 2E6LA 3C0BA 4OPJA 4E1JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ZVG A;  3LDP A;  2QKK A;  4PQU A;  2KKZ A;  2YJE A;  3VQA A;  2HST A;  2YX6 A;  4BC2 A;  1YJW N;  3O9T A;  5FRN A;  3GDQ A;  3FGU A;  3SLC A;  4AIL C;  4E1M A;  3VEY A;  4FWO A;  3FFI A;  1NJY A;  2G8U A;  2LY6 A;  4B8A B;  3QO9 A;  1ATS A;  1GPS A;  1TGO A;  3HVT A;  5AQP A;  3SK3 A;  2SN3 A;  3A2F A;  2IS3 A;  1TV6 A;  1WAJ A;  1NRA A;  1KC8 O;  1HKC A;  4B1X B;  5AQS A;  1RDC A;  4FL9 A;  1NK6 A;  2QTD A;  4BRA A;  2E3F A;  1B92 A;  1XNR K;  3TSQ A;  2NRZ A;  1NG9 A;  4FZY A;  1BDG A;  4W5N A;  3QFP A;  4C23 A;  1T7B A;  1XUP O;  4UQG A;  5GIN A;  2HHW A;  4F3O A;  1LOT B;  4ISG A;  3QDK A;  4KKO A;  4HUE A;  1MWK A;  1NOY A;  3SPY A;  4KPY A;  1U4B A;  4CJE A;  1JCG A;  3VMF B;  1TVR A;  5M1Q A;  3O9S A;  4LF6 K;  1QQM A;  2IVP A;  4E89 A;  1NRB A;  5EXW A;  4O8K A;  3IDH A;  4FWQ A;  1RTH A;  3R6M A;  2KW4 A;  3SUQ A;  1CN2 A;  3DLE A;  3CQY A;  1H1V A;  5HRR A;  1JCE A;  4Q0B A;  1TYQ B;  4AHU A;  1TL1 A;  2E2Q A;  5TKW A;  5LJW A;  2HBJ A;  4CGJ A;  2I61 A;  4E7L A;  3AA4 A;  4CD3 A; 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