3FE1A

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 6 (hsp70b') atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQAALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVRVCYRGEDKTFYPEEISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRRGAGERNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAKRTLSSSTQATLEIDSLFEGVDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDVVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 6
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 128
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3fe1A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fe1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fe1A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3fe1A04
5BRFA 3BUZB 3VERA 2P9LB 4H5WA 3ULEA 1U6ZA 2P9UA 2GWKA 3O08A 2FLOA 2FSJA 1IJJA 4H03B 4XH4A 5AQKA 3VEWA 3ATVA 1K8KA 4A62A 1NGAA 3GG4A 5FPDA 3FE1A 4CZFA 1C0GA 4FPAA 3EO3A 3CI5A 3O1BA 1BA0A 4B1XB 4PL7A 4FOIA 2BTFA 2E2QA 4FPBA 3L0QA 2CGLA 2P9PB 2Q31A 1ATRA 3KHYA 3ZEUA 2PBDA 4BRIA 4BRFA 4B1WB 5EY4A 4NO7A 3U9ZA 3W3DA 3GOIA 3U4LA 1GLFO 3J8AA 4H0PA 2CH6A 1NGJA 2QWOA 4Y0WA 2A3ZA 5BREA 3LDLA 1T6DA 4CZJA 3DXKB 5KQDA 5EX5A 4F9OA 2ASOA 2E1ZA 2YHYA 3A5LC 2P9NB 4JAXA 3ZETB 1JCEA 1E4FT 3RSEB 4CZMA 1DGKN 5EXWA 4FWSA 4E1JA 4LC9B 3HBTA 5AQVA 3LM9A 4WQ4A 5JLHA 1YUWA 3CJ7A 1NGDA 1D4XA 3A5NC 4JNEA 1XQSC 5EOYA 2A5XA 3VEOA 5AQMA 3CERA 1NGFA 4FWQA 4H0VB 3VF2A 3M3ZA 3CJ1A 3FZMA 1ATSA 3JXUA 4BR0A 1NM1A 2YHWA 4HWIA 3CJ9A 1J6ZA 1G99A 2A41A 2CH5A 5BPMA 1ESVA 1MWMA 4A2AA 3LDPA 3WXJA 3F9MA 5FPNA 2OANA 2YHXA 4DCHA 2QM1A 4CZIA 1BO5O 3CJBA 5BN8A 4CD3A 3FZFA 3DJCA 4FWNA 3L4IA 5AQWA 4QS8A 4XEIA 5BPLA 1KAZA 4M7XA 5BRDA 1WOQA 5KPTA 5EVZA 3SMPA 2DPNA 2YJEA 4B1ZA 1KAXA 3UKRA 3KVGA 3QICA 1EQYA 3QDKA 3C7NA 4FWMA 1QQOA 4A61A 4ISEA 4J8FA 1GLDG 2QWQA 5AR0A 4NB4A 4BG8A 3O1WA 1BOTO 3MDQA 1SAZA 4KBOA 2J4RA 3WXKA 1IG8A 3QMLA 1Z6RA 4H0OA 1ATNA 1S22A 3ENOA 1Q18A 5F0XA 5F2RA 3QFPA 3ZX3A 2E2PA 2QWLA 3TPQA 3SJHA 2GTDA 1TUYA 3WT0A 4ISFA 3VPZA 3EL2A 3H45C 4CZEA 1P8ZA 2P9UB 3A5MC 4Z94A 4FWKA 3O80A 3P4IA 5AFUA 3FFKB 2P9KA 4FWLA 3WEEB 4BRDA 2Q1NA 4GNIA 4BRPA 4ISGA 3UB5A 1K8KB 3WQUA 3CJCA 3KZBA 1RGIA 1X3NA 3QBXA 3DWLA 4CJ7A 3W0LA 1LCUA 1QQMA 3U8XA 2IIRA 4XH1A 3AAPA 2AA4A 3OHRA 1TYQB 2VWBA 3ZEUB 3ID8A 3EN9A 3O8MA 4PKGA 4BR9A 4EIAA 1LOTB 5E84A 1KAYA 4BR7A 5AQZA 3M6GA 3CQYA 1QZ6A 1NMDA 1XC3A 3WQTA 2ZWHA 4JN4A 1R59O 4MO5A 4WQ5A 4IO8A 3MN5A 3GBTA 3MK6A 3AARA 2V52B 3SK3A 4BRCA 5FPMA 4CD1A 3WXLA 3I8BA 4B1UB 4BG9A 4CZKA 2IVNA 3D2FA 3A5OC 5AQIA 1SZ2A 3SLCA 4BREA 4BRQA 2CGKA 2FSKA 1S3XA 3SMSA 5BPNA 2E20A 2FF6A 3B8AX 1HJOA 2ZF5O 3ENHA 3HZ6A 4BRNA 3H6EA 2QXLA 3AAQA 4BC5A 3BP8A 4B1YB 5AQQA 2AP1A 2HOEA 4CI6A 3WXIA 5JMVA 3D2EA 4RTFD 2V7YA 3H1VX 2P9IA 2NZTA 4BRAA 1BDGA 1U2VB 4K43A 1KXPA 2ITMA 3DXKA 1HX1A 4H0YB 4EFHA 5AQUA 2P9NA 4H5NA 5AQSA 3ZETA 1BU6O 4BC2A 1GLEG 2VYPA 1NGBA 1WUAA 3O4WA 5AZJB 3FGUA 3FR0A 3UKRB 1Y64A 4MLEA 4QS7A 4FOEA 3VGMA 3C7NB 1JCGA 4BQZA 1H1VA 1TUUA 4PKHA 3ATUA 2P9SA 2I7NA 2GELA 3GE1A 1Z05A 4JHDA 4JD2A 5ADXA 5AQHA 1V4SA 2IVOA 1HPMA 4I6MA 3CIPA 3VEXA 4BQLA 3GDQA 5ELZA 3CHWA 3VOVA 2ZGYA 5AQTA 2E8AA 3VESA 3EZWA 3MN6A 2HMPA 1HKGA 2KHOA 4IXCA 1RFQA 5BRHA 1X3MA 4DQ8A 1GLJO 4CBWA 4BR2A 4EAHD 2GUPA 2VCPA 1YXQA 2QW9A 4PL8A 2CGJA 5KPRA 4H0TB 1ZC6A 1NGGA 3LDQA 4YDUC 1YAGA 4M63C 1T44A 2IVPA 2P9KB 4C23A 3H3OB 4IWVA 4GY2B 4K25A 2A40A 3ULEB 4FWRA 4B9QA 3IUCA 5AQRA 1BG3A 2D4WA 5I9EB 3G25A 5AQOA 3VEYA 4BRMA 4AM7A 1HLUA 4BC3A 3VF4A 1NLVA 5JICA 3LDNA 4O8KA 4DB3A 3EKSA 3FZHA 5FPEA 1X9JA 5F1XA 4O5FA 4PKIA 5LJWA 3UE5A 3R8EA 3R9PA 3LL3A 2FF3B 5AZIA 5AQJA 3CQXA 5KQ8A 4CZHA 2Q36A 1GLCG 2H3GX 3O6WA 3FZKA 4HTLA 3UKUA 3D7EO 3MMVA 3R6MA 3AY9A 4BGBA 4BR5A 3LDOA 2FSNA 4FL9A 1HKCA 4FWPA 3HI0A 3DXMA 1T6CA 1JCFA 3D2FB 5BR9A 1MDUB 5LJVA 2YI1A 3EKUA 2Q97A 3CJAA 3WEEA 3H1QA 5CE3A 2P9LA 5AQPA 4K42A 2YCHA 2E1YA 5E26A 1QZ5A 3U9DA 3A0IX 1MA9B 4H0XB 2V7ZA 4DHYA 4IZ9A 1OKJA 2UYTA 2W41A 2NLXA 2PAVA 2QWRA 2V51B 4L3QA 1TYQA 4H5VA 5TKYA 4BVOA 1C0FA 3VGKA 2GEMA 4K41A 4MO4A 3HSCA 4BROA 3D2EB 1GLBG 2QWPA 2P9IB 1E4GT 2P9PA 2QWMA 3QFUA 2WUSA 2GWJA 1RDWX 4YDUA 2HF3A 4QS9A 3FLCO 1NGEA 2QWNA 4XH5A 1QQNA 3ZX0A 5BN9A 4M7YA 3BF3A 4CBXA 3L6QA 2NRHA 5LY3A 4FO0A 3TU5A 2ASMA 4FWOA 2F9WA 3IFRA 4AM6A 1GLAG 3MN9A 3H3NO 3RSEA 4CZLA 3VETA 5B8HA 2P9SB 2ZGZA 3O5BA 3C0BA 3VEZA 5ADXH 1NGIA 1MWKA 3WUHA 5AQFA 4JHDB 4BVPA 3FZLA 1ZBSA 1QHAA 4JD2B 1CZAN 3HM8A 4RCHA 3VEVA 1YVNA 2I7PA 4I6MB 2Q2RA 1BA1A 5AQLA 3MCPA 1XUPO 5AQXA 1HKBA 3I33A 3M1FA 4CBUA 1U2VA 2D0OA 4EHUA 2A42A 3JS6A 2W40A 1SQKA 4EHTA 5KPZA 3VF6A 3MN7A 4B1VA 2FXUA 5AZJA 3S41A 2E2NA 3H46O 4WQ5C 3VENA 3ZX2A 5AQGA 4WYBA 4IJNA 3BEXA 4BR4A 2YJFA 4BRKA 1DEJA 5AFUH 1BUPA 1DKGD 3A8YA 2Q0RA 4BGAA 3BF1A 4IJAA 5JLFA 3DAWA 2F9TA 3HTVA 4BRLA 2BUPA 3VGLA 3IMXA 4BRGA 1ZXOA 5AQYA 1NBWA 4MLHA 3IDHA 4CZGA 2A6AA 3CETA 2E88A 4BC4A 4WQ4C 2HF4A 5AZIB 2EWSA 1HUXA 2ASPA 4BRHA 1NGCA 2Q0UA 3UKUB 4A2BA 5AQNA 4RWTA 3GL1A 1NGHA 4H5RA 3QBWA 3QB0A 1NWKA 2D0PA 4H5TA 3DXMB 3LM2A 1V4TA 1GLLO 4FSVA 2D1KA 2E2OA 1BWFO
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PX0A 4M45A 1N8RO 4LF5K 4JK7A 2FSJA 1M1KO 2HB5A 4XH4A 2JDQD 3VQDA 4RW7A 3OYDA 2PY5A 3GG4A 2UXBK 3VQ9A 3EO3A 2YNHA 2NY9X 4FJGA 4FOIA 5SWMA 2BTFA 3ID6A 1LWCA 3L0QA 2RN2A 2KSKA 2P9PB 4DUYK 5K14A 4BRFA 4GVEA 4J2AA 4EP4A 4OKKA 4AEIA 3W3DA 3U4LA 3V1RA 3J8AA 4H0PA 1TKTA 3DXKB 5KQDA 4F9OA 3EE8A 3A5LC 2BRZA 3FFIA 2LY6A 3SZ2A 3MX5A 5M1NA 4CZMA 4CJ3A 3AVHA 2WOMA 4WQ4A 3SV3A 2QXFA 3A5NC 1XQSC 4BWJA 3KOZA 1OZZA 1C0UA 2YKNA 5AQMA 2Z1IA 4B3SK 2E6LA 5KTQA 3SPYA 3V9ZA 3JXUA 1O13A 4BR0A 4BEBA 3KLGA 1BIZA 3DLEA 2YBRC 4F3OA 5BPMA 1ESVA 2OPQA 2ZE2A 2OZSA 1POIA 1JZBA 3MWPA 4FJ9A 4OPJA 1RT6A 2YEOA 2ZQBA 3S3OA 2A7TA 1BO5O 5BN8A 1TL1A 4XEIA 2N2QA 3HPOA 4NYNA 5GIOA 1WOQA 4CF2A 2YV0X 2VWJA 5CY0A 1U47A 4O4GA 3SAGA 3QERA 3SPZA 3CCLN 3OYNA 3UKRA 3HK2A 4NCAA 4ISEA 4Z4HA 3RMAA 4KI4A 3L4QA 1KVBA 2X74A 3AO3A 4CEZA 3F9KA 4NB4A 1WAFA 3VA3A 3MDQA 1BIUA 4DV5K 5HROA 3G71N 4CJVA 3TSPA 4DV1K 1RTJA 3VMFB 3SQ2A 1BI4B 2G2KA 3AVBA 1PX9A 1FXXA 4Y1CA 1C1BA 3BZCA 4E19A 4OPAA 5C2DA 3DRPA 3DLRA 3P38A 1XC9A 1CZ9A 3TSUA 3EL2A 5JENA 1S1XA 1P8ZA 3DM2A 4CJUA 2VQEK 3HOTA 2D5RA 4DU1A 4JKGA 3SCXA 3CD6N 4FWKA 5AFUA 1ZVGA 3FFKB 4BRDA 2Q1NA 4I9LA 1WLJA 3T1AA 1K8KB 4CIFA 3KZBA 1P0AA 1X3NA 3QBXA 3DWLA 1HYSA 1BISA 3ULDA 3EYZA 4ILGB 1QQMA 3AVAA 4MDAA 4AHCA 3ID8A 3U3YA 1EETA 1IKXA 3TI0A 1IH7A 4N76A 2G8WA 4UQGA 1QZ6A 1NMDA 4X62K 2HHTA 4MO5A 3HT3A 3O9UA 4IO8A 1UA0A 3ZSVA 4BRCA 4CEDA 2FBXA 3MWTA 4KHWA 1SZ2A 1NJZA 2KBJA 3RMBA 4E7JA 3Q7BA 3O3FA 4ZTFA 2CGKA 2FSKA 4LY7A 3CG7A 5FROA 3OBWA 5I3UA 2O8FB 1MR4A 1XI1A 3KOXA 3B8AX 2ZF5O 5HRSA 3ENHA 3I0SA 4E7KA 4UY8O 4OX9K 3QINA 1FJGK 2FBTA 2HBKA 5HRNA 3EY1A 1QQCA 2E0HA 4O0IA 4B1YB 3J7YP 4CI6A 2HOEA 2W6LA 5M1FA 1T0ZA 3D2EA 2V7YA 1P90A 1CXQA 3E9OA 1U2VB 4WFNL 4K43A 1JLBA 2X78A 1MU2A 4Z4CA 2UXDK 3DXKA 4EFHA 3QEVA 2ZD1A 1JLFA 4HHFA 3M8RA 1BU6O 4LF6K 1Y64A 4MLEA 1VSKA 4FOEA 4IDHA 3TAMA 2KBKA 1B9DA 1JCGA 2DY4A 4C1NK 3ZSQA 1OH5A 3ATUA 3K5OA 1ZBLA 5JS1A 3LPTA 3AGRA 4JD2A 1V4SA 1GOCA 2IDOA 3OJUA 3CCRN 3VEXA 3TAQA 2RKIA 3WNEA 3GDQA 1VAZA 5ELZA 3CHWA 3VOVA 5AQTA 3KLHA 2LT8A 3EZWA 1Q9YA 3MN6A 1VQ8N 2HMPA 2O4GA 2KHOA 1RFQA 4HCCA 1A5XA 3HPHA 3ZT2A 4DR2K 3NGZA 4LH4A 3NF8A 1GLJO 4BR2A 4EAHD 1NU0A 2GUPA 2G8FA 3AVMA 3SAHA 2LY5A 1YXQA 3T7ZA 2QW9A 3E9LA 4G9ZA 1NGGA 1YAGA 2BE2A 4DLEA 1HQUA 4C23A 2A1RA 4YOUA 3H3OB 4IWVA 2YNGA 1NMNA 4B9QA 3IUCA 4X64K 4Z4FA 5AQRA 2D4WA 5C12A 4LFBK 3HL8A 1SNBA 4AHTA 2YHBA 3PO4A 4BRMA 3OYKA 1BI4A 4BC3A 2E6MA 5JICA 3NVMA 4O8KA 4DB3A 3EKSA 3KK1A 3SBGA 3KP1A 3S5TA 2KFNA 3OYGA 2HHSA 2HHVA 2YC1C 4O5BA 2Z1JA 3NE6A 1VQ4N 2Q36A 4HTLA 3FZKA 3HYFA 4DV4K 4C1NI 2VWKA 4CJKA 4FL9A 3TAPA 1T6CA 1VK0A 3RR8A 1RNHA 1NJWA 5BR9A 3EEQA 3OYCA 4KREA 3H1QA 4DQQA 5HBMA 5JVHL 4NLBA 1Z25A 2ASCA 5CY4A 1QZ5A 4I9QA 2V7ZA 4YFUA 2GV9A 1XMOK 1OKJA 2UYTA 3TAFA 3U6FA 1NH5A 4OJRA 4UJ0A 3R2VA 1D5AA 2V51B 3CCQN 4OVLA 4H5VA 5TKYA 3S9HA 4JI8K 4CESA 3SQ0A 4JRPA 2HHUA 4K41A 4WE1A 5GADP 3DRSA 1ITGA 2YNIA 4JV5K 3QFUA 4DFKA 2RPIA 2O8BB 4QS9A 3THYB 4KB1A 1KQSM 1WWNA 4CGJA 3QIPA 4FJXA 4M7YA 2NRHA 1VSFA 3WNGA 2HHHK 1TV6A 2QEXN 4FO0A 4FWOA 2F9WA 3IFRA 1REVA 3D6RA 4AM6A 4XJXA 3SI6A 1Z26A 3AVJA 3VQ4A 3H3NO 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3RSE A;  4CZL A;  3VET A;  5B8H A;  2P9S B;  2ZGZ A;  3O5B A;  3C0B A;  3VEZ A;  5ADX H;  1NGI A;  1MWK A;  3WUH A;  5AQF A;  4JHD B;  4BVP A;  3FZL A;  1ZBS A;  1QHA A;  4JD2 B;  1CZA N;  3HM8 A;  4RCH A;  3VEV A;  1YVN A;  2I7P A;  4I6M B;  2Q2R A;  1BA1 A;  5AQL A;  3MCP A;  1XUP O;  5AQX A;  1HKB A;  3I33 A;  3M1F A;  4CBU A;  1U2V A;  2D0O A;  4EHU A;  2A42 A;  3JS6 A;  2W40 A;  1SQK A;  4EHT A;  5KPZ A;  3VF6 A;  3MN7 A;  4B1V A;  2FXU A;  5AZJ A;  3S41 A;  2E2N A;  3H46 O;  4WQ5 C;  3VEN A;  3ZX2 A;  5AQG A;  4WYB A;  4IJN A;  3BEX A;  4BR4 A;  2YJF A;  4BRK A;  1DEJ A;  5AFU H;  1BUP A;  1DKG D;  3A8Y A;  2Q0R A;  4BGA A;  3BF1 A;  4IJA A;  5JLF A;  3DAW A;  2F9T A;  3HTV A;  4BRL A;  2BUP A;  3VGL A;  3IMX A;  4BRG A;  1ZXO A;  5AQY A;  1NBW A;  4MLH A;  3IDH A;  4CZG A;  2A6A A;  3CET A;  2E88 A;  4BC4 A;  4WQ4 C;  2HF4 A;  5AZI B;  2EWS A;  1HUX A;  2ASP A;  4BRH A;  1NGC A;  2Q0U A;  3UKU B;  4A2B A;  5AQN A;  4RWT A;  3GL1 A;  1NGH A;  4H5R A;  3QBW A;  3QB0 A;  1NWK A;  2D0P A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3PX0 A;  4M45 A;  1N8R O;  4LF5 K;  4JK7 A;  2FSJ A;  1M1K O;  2HB5 A;  4XH4 A;  2JDQ D;  3VQD A;  4RW7 A;  3OYD A;  2PY5 A;  3GG4 A;  2UXB K;  3VQ9 A;  3EO3 A;  2YNH A;  2NY9 X;  4FJG A;  4FOI A;  5SWM A;  2BTF A;  3ID6 A;  1LWC A;  3L0Q A;  2RN2 A;  2KSK A;  2P9P B;  4DUY K;  5K14 A;  4BRF A;  4GVE A;  4J2A A;  4EP4 A;  4OKK A;  4AEI A;  3W3D A;  3U4L A;  3V1R A;  3J8A A;  4H0P A;  1TKT A;  3DXK B;  5KQD A;  4F9O A;  3EE8 A;  3A5L C;  2BRZ A;  3FFI A;  2LY6 A;  3SZ2 A;  3MX5 A;  5M1N A;  4CZM A;  4CJ3 A;  3AVH A;  2WOM A;  4WQ4 A;  3SV3 A;  2QXF A;  3A5N C;  1XQS C;  4BWJ A;  3KOZ A;  1OZZ A;  1C0U A;  2YKN A;  5AQM A;  2Z1I A;  4B3S K;  2E6L A;  5KTQ A;  3SPY A;  3V9Z A;  3JXU A;  1O13 A;  4BR0 A;  4BEB A;  3KLG A;  1BIZ A;  3DLE A;  2YBR C;  4F3O A;  5BPM A;  1ESV A;  2OPQ A;  2ZE2 A;  2OZS A;  1POI A;  1JZB A;  3MWP A;  4FJ9 A;  4OPJ A;  1RT6 A;  2YEO A;  2ZQB A;  3S3O A;  2A7T A;  1BO5 O;  5BN8 A;  1TL1 A;  4XEI A;  2N2Q A;  3HPO A;  4NYN A;  5GIO A;  1WOQ A;  4CF2 A;  2YV0 X;  2VWJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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