3FZKA

Crystal structures of hsc70/bag1 in complex with small molecule inhibitors
Total Genus 114
50100150200250300350020406080100120
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
PAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
5010015020025030035035030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS2 (15-21)S1 (6-11)S7 (66-67)TI1 (12-15)TVIII1 (35-38)TI'1 (22-25)AH3 (116-135)S3 (26-29)S6 (49-51)TI2 (31-34)S4 (37-39)TIV2 (60-63)TI3 (45-48)AH1 (53-57)TI4 (58-61)TI5 (59-62)S9 (100-107)TI6 (62-65)AH2 (81-88)3H1 (70-72)S12 (168-174)TI9 (147-150)TII1 (73-76)S8 (93-97)TIV3 (96-99)S10 (110-114)TIV4 (106-109)S11 (141-146)TI13 (328-331)S13 (193-200)S14 (205-213)TIV6 (212-215)AH8 (299-324)S15 (216-225)TIV7 (225-228)AH7 (257-274)AH6 (230-249)S17 (291-298)S16 (279-288)TVIII2 (286-289)TIV9 (287-290)AH9 (344-353)TIV10 (353-356)S18 (333-337)3H3 (339-342)AH10 (367-380)TIV1 (21-24)S5 (42-44)TI8 (77-80)AH5 (175-183)TIV5 (201-204)TI11 (274-277)TI12 (327-330)AH4 (152-165)O1 (201-259)TI10 (253-256)TI14 (364-367)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title Novel adenosine-derived inhibitors of 70 kDa heat shock protein, discovered through structure-based design
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
total genus 114
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3fzkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fzkA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fzkA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3fzkA04
1K8KA 3FZKA 2YJFA 1HKGA 4JAXA 3GG4A 1E4FT 4EHTA 1YXQA 1YAGA 4BRIA 1ESVA 1Z6RA 1RFQA 4BROA 5KPZA 2QXLA 3EN9A 4FWOA 4FOEA 2P9LB 3LDLA 4FPAA 3ENOA 4CBUA 2E2PA 2I7PA 5AZJA 3ENHA 1TUUA 2P9NB 5LY3A 2BUPA 5F2RA 4WQ4C 3LDPA 1ATRA 1C0FA 4WQ5A 4XH4A 1OKJA 4BC5A 3GBTA 1TYQA 2ASOA 2P9PA 3MK6A 1QQNA 3FR0A 4A2AA 4BQZA 1HUXA 3A5OC 3SK3A 3HI0A 2QWPA 2QWRA 5AZJB 3DJCA 4CZGA 3CERA 3WQUA 5AQZA 5E84A 3H6EA 1HKBA 4MLHA 1X3NA 2YI1A 4KBOA 3H46O 1TYQB 2D0PA 2P9PB 5AQMA 4H0XB 4CI6A 4ISEA 3R9PA 4K43A 1JCFA 4QS8A 3C7NA 2FLOA 1RGIA 3LL3A 5LJWA 2WUSA 1Q18A 4H5TA 3CJ1A 4B1UB 4BG9A 4IWVA 4CJ7A 5AZIA 3DXKA 4IZ9A 2IVOA 1V4SA 3CJ9A 4A2BA 1YUWA 3WXLA 5ADXH 1NGBA 4BR0A 3LM2A 3BP8A 4FWRA 3QB0A 3WQTA 2CGLA 3O80A 2P9UA 5EVZA 4QS7A 3D2EA 1BDGA 2GEMA 3GDQA 2A6AA 4PKHA 3LDQA 3W3DA 3ZX3A 4B1YB 3TU5A 4BRFA 3CJCA 5AQKA 3MN6A 2E1YA 1SAZA 3CETA 3VEWA 4H5NA 4F9OA 3UE5A 2YCHA 5AZIB 4Y0WA 3DXKB 3AAPA 3CQYA 2QWNA 4FO0A 1ZC6A 2ZWHA 4H0OA 2V51B 2QW9A 5BN8A 3MCPA 2I7NA 3VF4A 3M1FA 4IO8A 1X3MA 1RDWX 1NGGA 3QICA 4QS9A 3D2EB 3LDNA 2HMPA 2OANA 3VEVA 3BF1A 2J4RA 3ID8A 2E88A 2UYTA 4WQ4A 2P9KA 3MN9A 5KPRA 4E1JA 1ZBSA 2QWMA 1E4GT 1BUPA 2Q31A 2VCPA 1CZAN 4FWKA 4FPBA 5AQXA 4DB3A 3HSCA 1DGKN 4JD2A 4O8KA 3GOIA 1QQMA 1P8ZA 4BQLA 1IJJA 4CZMA 3KHYA 1XUPO 4PKGA 2E20A 4BRAA 5AQPA 4B1XB 4CBWA 4NO7A 5BPNA 3FGUA 2P9KB 3O8MA 4GY2B 4RCHA 1S22A 3RSEB 4BRCA 4BVPA 4M7YA 4JNEA 3WXKA 4JN4A 4L3QA 5AQSA 1QHAA 3O6WA 1DEJA 2QM1A 4FOIA 3DXMA 5AQUA 3L6QA 4PL8A 3CIPA 3H3OB 2IVNA 4BGAA 4NB4A 4B1ZA 2E2OA 3D7EO 2GWJA 3JXUA 5ELZA 1SQKA 3UB5A 1K8KB 4K25A 2Q36A 5TKYA 4HTLA 3R8EA 3VEOA 4BR4A 1NGEA 3QBXA 3VEZA 2ASMA 4YDUC 1QZ6A 3DXMB 4CD3A 5AQLA 5EX5A 4HWIA 4BGBA 5AQYA 1MWMA 1GLEG 3M6GA 1NGJA 5FPEA 3CJAA 1T6CA 1BA1A 5AQOA 4M63C 5KQ8A 3EKUA 3A0IX 3HZ6A 4O5FA 5AQGA 3H45C 4BRKA 1NMDA 4DCHA 3CJ7A 3ZX2A 1LCUA 1GLLO 3VETA 5AQJA 2CH6A 1MDUB 3D2FA 5EOYA 3BUZB 4BRQA 5ADXA 5BR9A 3TPQA 4B1VA 1GLCG 2ZGYA 3QBWA 5JLFA 2NLXA 2YHXA 4BREA 4EIAA 5AQNA 1NGDA 1V4TA 3FLCO 4BVOA 1NGHA 2A3ZA 2FF3B 3EZWA 1HJOA 3UKUA 4K42A 1BWFO 3AAQA 1YVNA 2IIRA 2A40A 1WOQA 5AFUA 3VOVA 4BR7A 4BR9A 4BRLA 2Q1NA 5I9EB 2E2QA 4CD1A 4H03B 3L4IA 2H3GX 4XEIA 2A5XA 1XC3A 2PAVA 3EKSA 1H1VA 3HBTA 3C7NB 5AQVA 2Q0RA 3WXJA 5AQRA 1QQOA 4PKIA 1T6DA 1JCEA 1GLAG 3UKUB 4FWQA 4CBXA 5AFUH 1KXPA 3G25A 4GNIA 4ISFA 5F0XA 3MMVA 3O1BA 2P9UB 1ATSA 2QWOA 2P9SA 4CZLA 3HM8A 2D0OA 3O5BA 2F9TA 4XH5A 2ITMA 3FZFA 3DAWA 3ZETA 2DPNA 4RTFD 3KVGA 4FL9A 1HKCA 3BEXA 5KPTA 3IDHA 1QZ5A 4IJAA 4YDUA 2A41A 4IXCA 3FZHA 2D1KA 3F9MA 4JHDA 4M7XA 2PBDA 3LM9A 1HPMA 2AA4A 2P9IA 3ZEUA 1DKGD 3VERA 3VGMA 3VENA 5LJVA 3JS6A 3QMLA 1D4XA 5CE3A 5BPLA 4FWPA 3ZETB 5AQHA 2D4WA 3AY9A 1ZXOA 2Q0UA 3O08A 2W41A 3CJBA 4BRHA 5JICA 1WUAA 3U9DA 2CGJA 5EXWA 4JHDB 1XQSC 5FPNA 3CHWA 1LOTB 2P9IB 4JD2B 3ZEUB 3QFUA 2IVPA 2EWSA 2FSJA 5B8HA 4BRPA 3CI5A 3H1VX 2CGKA 1U2VA 3UKRA 4EAHD 3O1WA 4ISGA 2P9NA 5AQFA 1JCGA 1NGCA 1NGFA 1BG3A 2NZTA 3VGLA 1KAYA 1NLVA 5JLHA 2YJEA 3WT0A 4BRMA 4DHYA 3QDKA 3ATUA 3FE1A 4H0TB 2QWLA 3GL1A 4MO4A 2GELA 2QWQA 4CZKA 3IMXA 1U2VB 3UKRB 5AQWA 4FWLA 1BU6O 2KHOA 4I6MA 4BC3A 5AR0A 2BTFA 3A5LC 3A8YA 1NGAA 1NM1A 4MO5A 1R59O 2Q97A 4FSVA 5E26A 3KZBA 2HOEA 3AARA 4RWTA 3U9ZA 1S3XA 5FPMA 3QFPA 3FFKB 3A5MC 2Q2RA 3VF2A 2NRHA 1EQYA 5AQIA 3ULEA 4H5VA 2VWBA 3J8AA 4AM6A 4K41A 3IUCA 4BC2A 3LDOA 1MA9B 3C0BA 2ASPA 3BF3A 4I6MB 5F1XA 5JMVA 3H3NO 1BA0A 3VPZA 4B1WB 3D2FB 4XH1A 3GE1A 5AQQA 3I8BA 4J8FA 4CZFA 4B9QA 2E1ZA 2HF4A 4BG8A 5FPDA 2YHWA 3MN7A 3ULEB 3EO3A 1T44A 4H5RA 4WYBA 4FWSA 3VESA 3SMPA 2A42A 1GLJO 1NWKA 4DQ8A 1HX1A 4IJNA 2AP1A 3ZX0A 4A61A 4PL7A 1BOTO 3VEXA 1Y64A 2E8AA 4H0VB 5BRDA 5AQTA 1J6ZA 3S41A 3B8AX 4CZHA 1GLBG 5BRHA 2ZF5O 2V7YA 1C0GA 5BPMA 4H0YB 1SZ2A 4CZIA 5BRFA 4WQ5C 3CQXA 3VF6A 2CH5A 1KAXA 2FSKA 3SLCA 2E2NA 3ATVA 3U4LA 3DWLA 3R6MA 3WEEA 2V52B 2F9WA 3VEYA 3FZMA 3I33A 1X9JA 2YHYA 3L0QA 4Z94A 4FWMA 5BREA 2FF6A 4H0PA 2HF3A 4CZJA 1GLFO 5EY4A 3SMSA 2FXUA 4BR2A 2P9SB 2GUPA 3M3ZA 1ATNA 2GWKA 2ZGZA 1NBWA 4AM7A 1G99A 4BR5A 4LC9B 4EFHA 3MN5A 4CZEA 1MWKA 3P4IA 3HTVA 3U8XA 3WEEB 1NGIA 3RSEA 3WUHA 4EHUA 3MDQA 1KAZA 1IG8A 3FZLA 1TUYA 3A5NC 1BO5O 2GTDA 3IFRA 3OHRA 5KQDA 3EL2A 1GLDG 2VYPA 2V7ZA 4H5WA 4BRGA 3SJHA 4BRDA 4BC4A 4BRNA 3O4WA 3VGKA 1U6ZA 4A62A 2P9LA 3H1QA 2W40A 4MLEA 4FWNA 2FSNA 1Z05A 4C23A 3WXIA 5BN9A 3W0LA 1HLUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1K8KA 3K9KA 3ZT0A 1YT3A 3FZKA 1C1CA 1QVFM 1TL3A 4M45A 1E4FT 4EHTA 3O9TA 1YXQA 2ATBA 4WFAL 3Q7CA 3RMCA 4OPJA 1BI4B 3M8QA 2VGMA 3UIQA 1NJXA 5KPZA 4FLTA 1U48A 1X9SA 2HVHA 3CCMN 3QINA 3EN9A 1K6YA 4GV3A 4FJMA 5EU7A 4FPAA 2UU9K 1RT3A 2LJ7A 3BK3C 2E2PA 3B6OA 3TSQA 3TAFA 2P9NB 2BUPA 4WQ4C 1PX9A 3ENBA 4CGGA 1FH3A 1XHZA 3LP2A 2ASOA 1SUQA 3FR0A 4KKOA 4CJLA 3A5OC 3SK3A 1YTAA 2QWPA 1A5VA 3SV3A 3AA2A 3AVHA 4N41A 1XHXA 1HNVA 2M8BB 3J7AP 3DJCA 4E7HA 3OYCA 1ZU3A 3CERA 1GPTA 4MLHA 2YHBA 1NE5A 3LALA 4CJTA 4IOAL 2YI1A 4KBOA 3H46O 3V9WA 2D0PA 2P9PB 4JRQA 3TANA 4LF7K 2NY9X 1IBMK 4OPKA 3O3GA 4U67L 3OYAA 2FLOA 3HOTA 3HYFA 2XY5A 3K5MA 4B1UB 3F5TA 2WTUA 1C1BA 3MX2A 4DTRA 5M1FA 1V4SA 1PE4A 3WNHA 1YUWA 1OH7A 4B3MK 5ADXH 4W5NA 1IO2A 2CGLA 2YNFA 2Y1JA 4I2PA 4QS7A 3OJSA 2QK9A 3GDQA 2A6AA 3LDQA 4J2EA 3ZX3A 4B1YB 5J2QA 1T05A 5TKWA 3CJCA 3DRSA 4B3SK 2E1YA 1HNIA 1J54A 3L56A 1JZBA 4FK2A 4E1MA 3VQEA 1Q7YO 4C8NA 3DXKB 3CQYA 2QWNA 4FO0A 5CY4A 4DTOA 4H0OA 3EEQA 5CYMA 2QW9A 3L8BA 4B9MA 3CF5L 4IO8A 1X3MA 4JKDA 3S3OA 1NGGA 3IG1A 4DV6K 2WOMA 4QS9A 3OYBA 2W00A 2OANA 1I2VA 4O0IA 4CHZA 3KOXA 1M1KO 5FLXO 1KV0A 3V1OA 1ZBSA 1S9GA 1YHQN 3HPGA 1E4GT 1BUPA 2Q31A 3CMEN 5HP1A 4FPBA 5AQXA 3HSCA 1DGKN 4YNQA 2ASCA 1P8ZA 3AGRA 4CZMA 3OYIA 1SN1A 1N34K 5DK5A 3L2QA 1ZBLA 1Q86O 1WN7A 2E20A 2D5RA 4CBWA 1WB9A 3NVKA 3FGUA 2P9KB 4GY2B 1RDAA 3RSEB 1ZYWA 1Q81O 4L3QA 5AQSA 4E1NA 3DXMA 4OKKA 2KYQA 3THWB 3NBPA 1GOBA 3MEGA 2IVNA 4BGAA 1S72N 4DF4A 1JLEA 4E19A 2O8BB 1G15A 2QTDA 4LY7A 3UB5A 3CD6N 4PWDA 2O8EA 1RT4A 3L3VA 3R8EA 3VQCA 4OKEA 3VEZA 1NRBA 4GMJB 4CD3A 4JI0K 1VRUA 2N66A 3CYGA 4WFNL 5FPEA 1VQ6N 1T6CA 4PY5A 4DLEA 3A0IX 1S1WA 2W6KA 5AQGA 4FCYA 1NNEA 3ZX2A 1LCUA 2VQEK 1GLLO 5I42A 1S9EA 2HHVA 3M8PA 4F2SA 1LAVA 5C42A 2VWJA 2KBHA 3QBWA 2KW4A 4ICLA 1Q9YA 2MN5A 4ID5A 4EIAA 1V4TA 2ETJA 3FLCO 4B8AB 4CEDA 2A1RA 2VG7A 1NGHA 4IG0A 1U49A 2HNDA 1XC9A 1AYJA 1KCFA 4XIUA 3ZCMA 4C1NI 4AH9A 2E6MA 4E72A 4BR7A 1RBUA 4BRLA 2NUBA 5I9EB 4I9LA 4DTSA 2I61A 1K73O 4CD1A 4Y1DA 3VTHA 4RW7A 4XEIA 4DQQA 1BIZA 2Q0RA 2Q3SA 2D0BA 1HNXK 1JCEA 3AVBA 3KK3A 2BE2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1K8K A;  3FZK A;  2YJF A;  1HKG A;  4JAX A;  3GG4 A;  1E4F T;  4EHT A;  1YXQ A;  1YAG A;  4BRI A;  1ESV A;  1Z6R A;  1RFQ A;  4BRO A;  5KPZ A;  2QXL A;  3EN9 A;  4FWO A;  4FOE A;  2P9L B;  3LDL A;  4FPA A;  3ENO A;  4CBU A;  2E2P A;  2I7P A;  5AZJ A;  3ENH A;  1TUU A;  2P9N B;  5LY3 A;  2BUP A;  5F2R A;  4WQ4 C;  3LDP A;  1ATR A;  1C0F A;  4WQ5 A;  4XH4 A;  1OKJ A;  4BC5 A;  3GBT A;  1TYQ A;  2ASO A;  2P9P A;  3MK6 A;  1QQN A;  3FR0 A;  4A2A A;  4BQZ A;  1HUX A;  3A5O C;  3SK3 A;  3HI0 A;  2QWP A;  2QWR A;  5AZJ B;  3DJC A;  4CZG A;  3CER A;  3WQU A;  5AQZ A;  5E84 A;  3H6E A;  1HKB A;  4MLH A;  1X3N A;  2YI1 A;  4KBO A;  3H46 O;  1TYQ B;  2D0P A;  2P9P B;  5AQM A;  4H0X B;  4CI6 A;  4ISE A;  3R9P A;  4K43 A;  1JCF A;  4QS8 A;  3C7N A;  2FLO A;  1RGI A;  3LL3 A;  5LJW A;  2WUS A;  1Q18 A;  4H5T A;  3CJ1 A;  4B1U B;  4BG9 A;  4IWV A;  4CJ7 A;  5AZI A;  3DXK A;  4IZ9 A;  2IVO A;  1V4S A;  3CJ9 A;  4A2B A;  1YUW A;  3WXL A;  5ADX H;  1NGB A;  4BR0 A;  3LM2 A;  3BP8 A;  4FWR A;  3QB0 A;  3WQT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1K8K A;  3K9K A;  3ZT0 A;  1YT3 A;  3FZK A;  1C1C A;  1QVF M;  1TL3 A;  4M45 A;  1E4F T;  4EHT A;  3O9T A;  1YXQ A;  2ATB A;  4WFA L;  3Q7C A;  3RMC A;  4OPJ A;  1BI4 B;  3M8Q A;  2VGM A;  3UIQ A;  1NJX A;  5KPZ A;  4FLT A;  1U48 A;  1X9S A;  2HVH A;  3CCM N;  3QIN A;  3EN9 A;  1K6Y A;  4GV3 A;  4FJM A;  5EU7 A;  4FPA A;  2UU9 K;  1RT3 A;  2LJ7 A;  3BK3 C;  2E2P A;  3B6O A;  3TSQ A;  3TAF A;  2P9N B;  2BUP A;  4WQ4 C;  1PX9 A;  3ENB A;  4CGG A;  1FH3 A;  1XHZ A;  3LP2 A;  2ASO A;  1SUQ A;  3FR0 A;  4KKO A;  4CJL A;  3A5O C;  3SK3 A;  1YTA A;  2QWP A;  1A5V A;  3SV3 A;  3AA2 A;  3AVH A;  4N41 A;  1XHX A;  1HNV A;  2M8B B;  3J7A P;  3DJC A;  4E7H A;  3OYC A;  1ZU3 A;  3CER A;  1GPT A;  4MLH A;  2YHB A;  1NE5 A;  3LAL A;  4CJT A;  4IOA L;  2YI1 A;  4KBO A;  3H46 O;  3V9W A;  2D0P A;  2P9P B;  4JRQ A;  3TAN A;  4LF7 K;  2NY9 X;  1IBM K;  4OPK A;  3O3G A;  4U67 L;  3OYA A;  2FLO A;  3HOT A;  3HYF A;  2XY5 A;  3K5M A;  4B1U B;  3F5T A;  2WTU A;  1C1B A;  3MX2 A;  4DTR A;  5M1F A;  1V4S A;  1PE4 A; 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