3FZMA

Crystal structures of hsc70/bag1 in complex with small molecule inhibitors
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
PAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Novel adenosine-derived inhibitors of 70 kDa heat shock protein, discovered through structure-based design
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 115
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3fzmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fzmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3fzmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3fzmA04
2P9PA 4RWTA 4BRIA 4H5TA 1GLJO 3SMSA 3FZFA 5FPEA 1HUXA 1U6ZA 1QQNA 3CJ7A 3MN7A 4Z94A 5BRFA 1WUAA 4CZHA 5AFUH 5AQKA 3IUCA 3M3ZA 1ATNA 1GLCG 5EVZA 5FPNA 4PKGA 3UE5A 1SAZA 1BUPA 4M7XA 3LDPA 3ZEUB 1HKGA 1X3NA 4HTLA 2E8AA 2J4RA 2FF6A 2P9KA 4RTFD 4FSVA 1CZAN 4CZLA 3O6WA 1ZBSA 1NGDA 3CIPA 5ADXH 4PKIA 4MLEA 3CHWA 4BC2A 3VERA 3DXKB 3D2FB 1YAGA 4H0YB 3W3DA 1IG8A 1DKGD 3WQTA 4QS8A 1S22A 2QWPA 3AY9A 2CGJA 2ZWHA 4EIAA 1XUPO 2Q31A 1J6ZA 2V51B 1QQOA 1G99A 3HM8A 2IVPA 3FGUA 3HBTA 4YDUA 5AQLA 2GWJA 4L3QA 1ESVA 3H6EA 1BO5O 2NZTA 4EHTA 3C7NB 4LC9B 5AQHA 4BG9A 1ZC6A 3FZLA 3CERA 2AP1A 2FLOA 4IZ9A 3GDQA 2YCHA 5BR9A 5AQNA 2D1KA 4H0TB 3WUHA 3RSEB 3LL3A 3VGMA 4BRAA 3A5NC 4H0VB 2BUPA 5F0XA 4BR0A 3AARA 4BR7A 2Q0UA 4GY2B 3EN9A 4QS9A 1HX1A 1TUYA 4CBWA 2PAVA 1BOTO 3JS6A 3UKUA 1TYQB 5AZJA 3DWLA 2ZF5O 4JAXA 3GG4A 1S3XA 1H1VA 3DXMA 5AQIA 3H3OB 5AQSA 1Q18A 4IWVA 4FL9A 3SMPA 4C23A 2GTDA 3UKRB 4ISFA 5BPLA 1NMDA 5KQ8A 3R6MA 5TKYA 4NO7A 3MMVA 1C0GA 3ATVA 3VETA 4CZKA 2E2NA 1HKCA 1Y64A 3MN9A 5AQGA 5E26A 3BP8A 4CJ7A 5KPTA 1YXQA 1R59O 2ASPA 4ISEA 3QFPA 1QZ6A 4BVPA 4FOEA 3JXUA 4FO0A 4BR2A 1LCUA 3A0IX 3DAWA 4BC5A 3WQUA 4BRNA 5KQDA 3UB5A 3QMLA 4DHYA 4E1JA 4PL7A 5BREA 4CZIA 1SZ2A 4K25A 4MO5A 4BRLA 3CJ1A 4EHUA 1JCGA 1U2VB 3CJCA 5FPDA 3VEZA 5ADXA 3EL2A 2CH5A 1WOQA 3R8EA 3O5BA 4FWOA 3AAQA 3CQXA 5BPNA 1RFQA 5AQJA 3L4IA 5BRHA 2P9UB 1MWMA 1BU6O 1YUWA 3LDOA 1K8KA 2V52B 4FWLA 5AQZA 3L0QA 3QDKA 3ZETA 3O08A 1NGAA 1RGIA 3H1VX 4B1VA 2E88A 4H5NA 2FSNA 4B1ZA 4BQLA 4BRPA 2WUSA 1GLLO 4JD2A 5FPMA 3WEEA 3CJ9A 2ZGZA 2Q36A 3VEYA 4H03B 1HLUA 1GLFO 4BR5A 3ENOA 3LM9A 4B1WB 1BWFO 2CGKA 2P9IB 1BDGA 3HTVA 4PKHA 3BUZB 1KAXA 1NGGA 3D2EA 2IIRA 2VWBA 1HJOA 4CD1A 1TUUA 2P9NB 1GLDG 4A62A 4H5VA 2P9LB 1NGEA 1T6DA 3QICA 5AQWA 2QXLA 3IFRA 2P9PB 3KVGA 4AM7A 3VF2A 5I9EB 2A42A 3D7EO 4FWRA 3O1BA 5JLFA 3W0LA 1ZXOA 3VESA 1MDUB 4FOIA 2FSKA 4DCHA 3O1WA 5JMVA 5AQMA 3HI0A 4B1UB 5LJVA 4WQ4A 3GL1A 1NGBA 1JCEA 3VENA 2CGLA 4FPAA 5AQPA 2QWNA 1EQYA 1RDWX 4IXCA 3FZKA 4JNEA 5LY3A 1DEJA 1GLBG 2Q1NA 2P9SA 4BQZA 2W41A 3TU5A 1BA1A 3SLCA 3LDNA 1E4FT 3EO3A 4B1XB 5AZIA 3LDQA 4NB4A 2A3ZA 4H5WA 2QWLA 3WT0A 3GBTA 2EWSA 5LJWA 1GLAG 4JHDA 3VEOA 3FFKB 4Y0WA 3WXLA 4BREA 3WXKA 2YHYA 3TPQA 4BG8A 4WQ4C 2ITMA 3VEWA 3B8AX 1V4TA 3ULEA 1C0FA 2YHWA 3CETA 2F9WA 1DGKN 4BR9A 3VGKA 4A61A 5AQFA 5AQQA 1QHAA 2HF4A 3MN5A 3H46O 3BF1A 5AQTA 2YI1A 4B9QA 3S41A 4FWKA 3CQYA 1X3MA 4H0PA 4QS7A 4FPBA 4BRQA 2UYTA 2QWRA 1KAZA 4FWQA 4H5RA 2Q2RA 3KHYA 4HWIA 1IJJA 4CZMA 5BPMA 4J8FA 1ATSA 2CH6A 5AFUA 2E1YA 5BRDA 2FSJA 5AR0A 3ZX2A 2Q0RA 4XH5A 4FWSA 4DB3A 5F2RA 3UKUB 1E4GT 5AZJB 1Z05A 3M1FA 2E20A 3A8YA 2V7YA 5AQUA 3DXMB 1XQSC 2QW9A 3L6QA 3WXJA 3WXIA 4I6MA 4M63C 2P9UA 3EZWA 4BGBA 1KXPA 3QB0A 3IMXA 1MWKA 4K41A 3MCPA 4O8KA 3EKUA 1ATRA 2A41A 4BRKA 2OANA 4BRHA 1KAYA 3ID8A 3EKSA 5EOYA 2QWMA 3QFUA 2NLXA 3LM2A 3ZEUA 3FZMA 2VYPA 4CZJA 4EAHD 4FWMA 4IJNA 4BR4A 4K43A 4M7YA 3R9PA 2HMPA 4RCHA 2GWKA 4WQ5A 2A5XA 3U4LA 3G25A 2F9TA 3U9ZA 2AA4A 4BRDA 3DXKA 3D2FA 3VEXA 1NM1A 1MA9B 4A2AA 2GELA 4CZEA 2DPNA 4K42A 4PL8A 5AQOA 2E1ZA 4CBUA 1NBWA 2E2QA 2QWQA 1K8KB 2FXUA 3I33A 1HKBA 4H0OA 3ZX3A 3QBWA 3ZETB 3VGLA 3VEVA 1NGFA 2I7PA 4CZFA 4XH4A 4WQ5C 4JD2B 3C7NA 3WEEB 2IVNA 5EX5A 5B8HA 3VPZA 4GNIA 1Z6RA 3BF3A 2D0PA 3ATUA 2P9KB 2QM1A 3OHRA 5KPZA 1JCFA 5ELZA 3U8XA 3D2EB 3RSEA 3IDHA 4CD3A 5AQXA 3LDLA 2I7NA 4CZGA 3FR0A 3FLCO 2GUPA 4BRMA 3GOIA 5BN9A 4BVOA 1NGHA 1T44A 2ASOA 1QQMA 1NLVA 5AQYA 4ISGA 1TYQA 3SJHA 4EFHA 3A5LC 3VF6A 4B1YB 3CJBA 1SQKA 3UKRA 1V4SA 4BRGA 3H1QA 5E84A 3J8AA 4CI6A 5AQVA 3A5OC 2D4WA 2IVOA 4O5FA 4IJAA 3MN6A 4FWPA 2BTFA 1NWKA 2YJEA 4BC4A 1NGIA 2P9SB 2KHOA 3A5MC 4IO8A 3HZ6A 1D4XA 4YDUC 5AZIB 3MDQA 3O4WA 3BEXA 4BC3A 2YJFA 1HPMA 5KPRA 5AQRA 2HF3A 2E2PA 4MLHA 4JHDB 2D0OA 1YVNA 3F9MA 2H3GX 2ZGYA 4BGAA 1U2VA 3H45C 3ENHA 3I8BA 4DQ8A 4XH1A 3CI5A 1OKJA 3ULEB 1QZ5A 2Q97A 1X9JA 4BROA 4F9OA 4CBXA 1LOTB 2ASMA 4FWNA 3DJCA 1P8ZA 3QBXA 5JICA 2PBDA 3H3NO 2HOEA 3M6GA 4BRCA 2GEMA 5CE3A 2E2OA 5BN8A 2VCPA 3FZHA 3SK3A 3P4IA 3KZBA 3O8MA 3GE1A 1NGCA 3U9DA 1T6CA 4H0XB 4A2BA 3VF4A 2YHXA 3ZX0A 5EXWA 3VOVA 1NGJA 1BG3A 1XC3A 5EY4A 2W40A 4JN4A 2NRHA 1GLEG 2P9IA 3O80A 4KBOA 5JLHA 2QWOA 3AAPA 2V7ZA 2A40A 3HSCA 5F1XA 2A6AA 4BRFA 4WYBA 3FE1A 2FF3B 2P9NA 3C0BA 3MK6A 4MO4A 4I6MB 3CJAA 2P9LA 1BA0A 4AM6A 4XEIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JLGA 4H5TA 1IKXA 3SMSA 3CM5A 4UQGA 4Z94A 5BRFA 3RR7A 3OYCA 1REVA 4NXNK 1KC8O 5AQKA 3IUCA 3M3ZA 4CEAA 1IKWA 4PKGA 3UE5A 4DFJA 2E8AA 2J4RA 3THYA 2D56A 4CZLA 3AGRA 1NGDA 2HMIA 4ELUA 4DU1A 2LJ7A 4CJVA 2YKMA 4MLEA 4DQRA 3O9TA 4DUYK 4BC2A 5CY0A 4DS5A 3VERA 3ZLJA 1RT4A 4CJKA 4FCYA 1YAGA 4H0YB 4IBNA 4O8UA 5KRTA 1VRTA 3WQTA 1SNBA 2QWPA 1LQQA 1EWRA 1KCFA 4CEFA 4DU4A 1WAFA 2Q31A 1TKZA 3OYLA 4IEEA 1QQOA 3TANA 3HVRA 1N33K 3HBTA 2ETJA 5LL6Z 3H6EA 2GL1A 4M41A 3FFIA 4EHTA 2QK9A 5HRPA 3TI0A 2UXBK 1VQ4N 3RMBA 4DSEA 4YOUA 2LT8A 2KBJA 1ZU3A 2OTLN 5IT9O 4BDZA 2FLOA 3SV4A 3GDQA 1VQ7N 3TAGA 5AQNA 3DM2A 4KV8A 1HYSA 5F0XA 3P31A 5LMNK 4F8RA 3NGIA 4LF5K 4GY2B 3EN9A 4QS9A 4YORA 3THWA 4CBWA 4AH9A 1YI2N 3EE9A 1S1TA 1Y97A 4JAXA 2VG7A 2NRZA 3GG4A 2O8EA 3H3OB 4Z0UA 5C15A 4Z4IA 2DTUA 5AQSA 4JV5K 4FL9A 1XNQK 4KHPK 2GMOA 5TKYA 5HOOA 4NCBA 1VQ6N 4NO7A 1C6VA 3CMAN 4DG1A 1SL0A 1Y64A 1NJYA 3S5TA 1YVUA 3I56N 4N76A 1U49A 1RILA 3ISNC 4IG3A 5KPTA 1KRPA 2PY5A 1R59O 2ASPA 4B8CA 1VQ9N 3QFPA 1QZ6A 1KLNA 4FO0A 3SQ2A 1LCUA 3A0IX 3MXJA 3DAWA 4BC5A 3PV8A 3ZSVA 5M1PA 3KP1A 1LWFA 4LF9K 4DHYA 4E1JA 3ZSZA 3TWHA 3H08A 4MO5A 4JI1K 3CFRA 3CJCA 1BK8A 3NE6A 4OPJA 2HNYA 3O5BA 5BPNA 3NHGA 2K35A 3LDOA 1K8KA 2O8BA 2V52B 4CEEA 4KKOA 3O08A 1RGIA 4E1NA 4H5NA 3OS1A 4BQLA 2VGMA 1ZFUA 4B9SA 3TAEA 5HRSA 4OKJA 4EZ6A 1HLUA 2F8TA 4Z4HA 5J1EA 4JKEA 3TSQA 3KK1A 1O13A 1XHXA 4CEBA 4PKHA 3J7YP 1P0AA 1TKTA 4C8LA 4JK7A 4CD1A 1OH6A 4IDHA 5DMRA 5AQWA 1CHZA 1TVRA 2P9PB 3AVIA 3NDKA 3VQEA 3SZ2A 4BECA 3VQAA 4JEPA 4ICLA 1L3VA 3OW2M 4YOWA 3W0LA 3KOWA 1MDUB 1ASVA 4CE9A 1J5EK 4O4GA 3SCXA 3V1OA 3CYGA 1EP4A 3HI0A 3OJUA 3JAMO 1NGBA 1Q82O 5AQPA 2QWNA 4IXCA 3DYAA 3FZKA 4JNEA 3NMUA 4LFAK 4V1DC 1GLBG 2Q1NA 1QTMA 2P9SA 3LP1A 4FYDA 4NXMK 3CCLN 4E89A 3KOZA 4IOXA 3E7RL 3V9ZA 2A3ZA 4H5WA 3HPHA 3GBTA 3PX4A 4JI2K 3VEOA 3WXLA 2O8DA 4GVMA 2A7TA 2YHYA 4DQSA 2B68A 2ITMA 1V4TA 2UUBK 1SUQA 3AVFA 3ULEA 2YHWA 3RRHA 2G8FA 3AVJA 2F9WA 1DGKN 1ASUA 2PYLA 4BR9A 3E9LA 3VGKA 1C0MA 5FDLA 5AQFA 1BISA 3KIOA 1T05A 2YI1A 4B9QA 4W5OA 4KFBA 4E7JA 3O4QA 3ZCMA 1Q8IA 2UYTA 2Q2RA 1D9FA 3KOXA 2A1RA 2G8VA 4FJMA 1IJJA 4CZMA 2QEXN 5BPMA 4J8FA 1U48A 3HO1A 1ATSA 2FC0A 4H8KA 2QI2A 4UAFE 1S1UA 1RBRA 1RT6A 5BRDA 3D6RA 4ID5A 2FSJA 3ZX2A 3SAGA 3HL8A 5HBMA 5F2RA 4HVJA 2E20A 1SKSA 3A8YA 1B9DA 5AQUA 1RT3A 2QW9A 1JL2A 4I6MA 2QTDA 1KXPA 4C8NA 4CCHA 1PTXA 3IMXA 4AHUA 3SNNA 1TKXA 4DSJA 3EKUA 2GV9A 1TGOA 2A41A 1HRHA 4JI4K 4BRKA 4JKHA 4JYAK 2KKZA 3QEXA 3EKSA 2WC9A 3QFUA 4BE1A 4CZJA 4UJ0A 2NRTA 4DFMA 4K43A 5DM6L 5HROA 4M7YA 1T0ZA 3TAPA 2GWKA 3IAYA 3TTCA 3U4LA 1RBVA 1BHLA 2JWKA 2RHKA 2F9TA 4DR3K 1KFSA 2AA4A 4BRDA 3HVTA 1XMOK 4FJLA 1MA9B 3MEDA 4RW8A 4LF7K 3EZ5A 3TR8A 1Q9XA 4PL8A 4B3OA 2E1ZA 5C0YA 4CF8A 1NBWA 4GV6A 3LZJA 3DOLA 3QBWA 3LDSA 3ZETB 4HUGA 3VGLA 1W9HA 1WSGA 1W2BM 4WFNL 4XH4A 4BDPA 3HJFA 4JD2B 2NNWA 3KHWA 1DT9A 4OGEA 4AILC 1RT2A 4J2AA 3DMJA 4I2PA 4B9MA 3N4QA 3VQ4A 5M1QA 3THYB 3VQ7A 3CD6N 1WSJA 4UAEF 3KLHA 2LKBA 4O0JA 3D2EB 1S1VA 3BGRA 4JKAA 5D3GA 2RKIA 5AQXA 2I7NA 3AO5A 3FR0A 4CZGA 1JZBA 3PSMA 1VSMA 2GUPA 3ITHA 3GOIA 2UUCK 3WNFA 1VK0A 1NK9A 1NGHA 1HNXK 1HNWK 2ASOA 3TARA 5H1SQ 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1JLG A;  4H5T A;  1IKX A;  3SMS A;  3CM5 A;  4UQG A;  4Z94 A;  5BRF A;  3RR7 A;  3OYC A;  1REV A;  4NXN K;  1KC8 O;  5AQK A;  3IUC A;  3M3Z A;  4CEA A;  1IKW A;  4PKG A;  3UE5 A;  4DFJ A;  2E8A A;  2J4R A;  3THY A;  2D56 A;  4CZL A;  3AGR A;  1NGD A;  2HMI A;  4ELU A;  4DU1 A;  2LJ7 A;  4CJV A;  2YKM A;  4MLE A;  4DQR A;  3O9T A;  4DUY K;  4BC2 A;  5CY0 A;  4DS5 A;  3VER A;  3ZLJ A;  1RT4 A;  4CJK A;  4FCY A;  1YAG A;  4H0Y B;  4IBN A;  4O8U A;  5KRT A;  1VRT A;  3WQT A;  1SNB A;  2QWP A;  1LQQ A;  1EWR A;  1KCF A;  4CEF A;  4DU4 A;  1WAF A;  2Q31 A;  1TKZ A;  3OYL A;  4IEE A;  1QQO A;  3TAN A;  3HVR A;  1N33 K;  3HBT A;  2ETJ A;  5LL6 Z;  3H6E A;  2GL1 A;  4M41 A;  3FFI A;  4EHT A;  2QK9 A;  5HRP A;  3TI0 A;  2UXB K;  1VQ4 N;  3RMB A;  4DSE A;  4YOU A;  2LT8 A;  2KBJ A;  1ZU3 A;  2OTL N;  5IT9 O;  4BDZ A;  2FLO A;  3SV4 A;  3GDQ A;  1VQ7 N;  3TAG A;  5AQN A;  3DM2 A;  4KV8 A;  1HYS A;  5F0X A;  3P31 A;  5LMN K;  4F8R A;  3NGI A;  4LF5 K;  4GY2 B;  3EN9 A;  4QS9 A;  4YOR A;  3THW A;  4CBW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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