3GDQA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 1-like atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
379
structure length
376
Chain Sequence
GIAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPQNTVFDAKRLIGRKFNDPVVQADMKLWPFQVINEGGKPKVLVSYKGENKAFYPEEISSMVLTKLKETAEAFLGHPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKGERHVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQANLEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELCADLFRGTLEPVEKALRDAKMDKAKIHDIVLVGGSTRIPKVQRLLQDYFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1-like
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 376
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3gdqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gdqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gdqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3gdqA04
2E8AA 3CJAA 1MDUB 3CIPA 3H45C 3UKUB 1T6DA 1ATNA 2OANA 1HLUA 5CE3A 5E84A 4FL9A 2QWQA 4L3QA 3SLCA 1HKBA 2E2PA 1ZC6A 2P9NB 2QWNA 2FF3B 3D2EB 3M3ZA 3H1QA 3SMSA 1GLDG 4MO4A 4H0OA 3G25A 2EWSA 4F9OA 4MO5A 2VCPA 2Q36A 3UKRA 4BGBA 2YHWA 3DXKB 4RTFD 3WXLA 4K25A 4DB3A 3S41A 2ZF5O 4CJ7A 3A5OC 1BA0A 3EZWA 2YJEA 3BEXA 3SJHA 4BG9A 3H46O 5BPMA 3AAPA 3AARA 3L6QA 3FZMA 2NRHA 1KAZA 4BREA 1XUPO 2FF6A 5AZIB 4AM7A 4H03B 3IMXA 2P9IB 4GY2B 4C23A 4E1JA 3D7EO 5EY4A 4CZKA 4FO0A 4Y0WA 2V7ZA 1P8ZA 3QDKA 1BWFO 2QW9A 4NB4A 3I33A 1RDWX 2H3GX 3UE5A 3UKUA 2AP1A 5F2RA 2ZWHA 3C7NA 4ISGA 1HPMA 1T6CA 3SK3A 2VWBA 3OHRA 4BC4A 4Z94A 4KBOA 1T44A 4FOIA 4WQ4A 1X3NA 3FZHA 2P9NA 3A8YA 4PL8A 1BDGA 2IVPA 2D0PA 3D2EA 3HTVA 3MN5A 1QQMA 2I7NA 3CERA 1NGDA 1HKGA 4BR9A 3LDQA 5EOYA 1BOTO 3LDOA 4MLHA 5B8HA 1KXPA 5JICA 3A5NC 4BQZA 1E4FT 3DXKA 4H5TA 1C0GA 4MLEA 3MN6A 5ADXH 1K8KB 1MWMA 5EVZA 4CZFA 5AQMA 2FLOA 2GEMA 3UB5A 3O80A 2QWOA 5BRHA 4XH1A 5EX5A 4FWOA 1TUYA 3ZETB 5AQYA 5BRFA 4CZJA 3QFUA 5AFUH 5FPEA 3LDLA 1NGAA 4BROA 4DQ8A 5AQTA 4CZEA 2D4WA 1NGJA 1GLFO 1HUXA 2YI1A 3EN9A 5AQXA 5AQFA 2ITMA 2WUSA 3DAWA 1V4TA 4BVOA 3QFPA 4AM6A 1TYQA 3CI5A 5AQSA 2P9LA 2BUPA 1NGBA 5AQOA 2QWRA 3QBXA 1Z05A 1BO5O 2Q31A 3FFKB 5BR9A 3VEYA 2J4RA 4DHYA 5AZJB 4WQ4C 5AQRA 5BPLA 3CETA 3VF4A 3EKSA 3BF3A 4BRLA 3ID8A 1RGIA 3MN7A 5JLHA 1X3MA 4BRPA 3L4IA 2DPNA 5FPNA 3VEVA 1C0FA 3C7NB 3IUCA 5AQGA 3R6MA 4RWTA 2YJFA 3QICA 3VETA 5KQDA 2IVNA 3CJCA 4JHDA 5I9EB 1K8KA 2W41A 4CBUA 3WQTA 2F9TA 2FXUA 4A2BA 4ISFA 4HWIA 4IZ9A 4BRFA 4BR2A 3IDHA 5LY3A 3BP8A 4NO7A 3W0LA 2V52B 5LJWA 3ENOA 3ZETA 5ELZA 3O1WA 3L0QA 4CZIA 1QHAA 4EHUA 1J6ZA 2A40A 5AQWA 3MCPA 3A5LC 3VPZA 5BN9A 1SQKA 3O6WA 3ATUA 3U8XA 4EFHA 3FR0A 3O8MA 4H0YB 2Q1NA 5F0XA 1XQSC 5BREA 3CJ9A 4BRMA 5AQNA 2QWLA 3LM2A 5AZJA 4FWRA 1NGGA 4H5RA 5AQLA 1X9JA 2HMPA 2P9PB 4A62A 4LC9B 4B1ZA 1LOTB 3CJ7A 3H3OB 4J8FA 4BR0A 1NGIA 1QZ5A 3FZFA 3DWLA 1CZAN 1U2VB 1GLEG 3GBTA 1TYQB 1BUPA 2PBDA 4B1VA 2UYTA 4IJAA 2P9LB 3C0BA 3AAQA 2FSNA 3LL3A 3TU5A 4YDUC 3CHWA 3VEZA 1NGEA 4A2AA 4H5WA 1QQNA 3LDPA 5BN8A 4QS9A 4GNIA 5AFUA 1DEJA 3M6GA 3WQUA 4BC2A 3EKUA 1LCUA 2W40A 3GE1A 3VGKA 4IJNA 1V4SA 5BRDA 1ESVA 2GWKA 4H0VB 4JN4A 3ATVA 3B8AX 2Q0RA 4JHDB 4M7XA 3LDNA 4M7YA 2A42A 1S22A 1ZBSA 4CD1A 4BRCA 1Q18A 4BR7A 4CD3A 3VGLA 2D0OA 1YVNA 4HTLA 2E2OA 3VGMA 4B1UB 3VEOA 4IWVA 2GELA 4FOEA 3HZ6A 3D2FB 2E2NA 5KPTA 3WUHA 4FSVA 1KAXA 1R59O 4PL7A 2Q2RA 2PAVA 5BPNA 2P9PA 3FE1A 2FSKA 2Q97A 3QB0A 4A61A 4B9QA 1BA1A 5AQUA 3GOIA 2IVOA 3H3NO 1WOQA 3H6EA 5AR0A 3FLCO 4BRDA 4CZGA 3JS6A 4H0PA 4CZMA 2QWPA 3R9PA 1U2VA 3IFRA 4B1YB 1NWKA 1NM1A 4RCHA 3BF1A 3ULEB 3FGUA 3R8EA 2A6AA 2CGLA 2E20A 1QZ6A 3GDQA 1GLJO 4BR4A 4H0TB 1IJJA 1QQOA 3WT0A 3ZX2A 1NMDA 1NGCA 2ZGYA 4FWSA 4CBXA 2GUPA 1MA9B 4I6MA 4CBWA 3LM9A 5FPMA 2E2QA 3M1FA 4WQ5C 1RFQA 1HKCA 3DJCA 4BRHA 3ZEUA 1NGFA 1HJOA 1YXQA 3MMVA 4YDUA 1XC3A 3U9ZA 3ZX3A 5JLFA 3CJ1A 4BR5A 2QXLA 2YHXA 2AA4A 2BTFA 4XH4A 3CJBA 1HX1A 5AQIA 3KZBA 1NLVA 3O1BA 5AQJA 1DGKN 4FWKA 4CI6A 3ZX0A 3JXUA 4QS8A 1Z6RA 2CH6A 1OKJA 4JNEA 5AQKA 5AQPA 3D2FA 2E88A 3ENHA 4IO8A 4FWNA 3O08A 2HOEA 3AY9A 3VENA 1SZ2A 4FWQA 2QWMA 5KPRA 2YHYA 2GTDA 2ASPA 2A5XA 5AQQA 4JD2B 3CQYA 4H5VA 2YCHA 1H1VA 2F9WA 1ATSA 5JMVA 2FSJA 3VERA 1JCGA 2VYPA 1GLBG 3ULEA 1Y64A 2A3ZA 2P9SB 3VESA 2IIRA 4CZHA 1WUAA 1KAYA 1ATRA 3U9DA 1NGHA 5EXWA 4EAHD 1BG3A 1SAZA 4K43A 1MWKA 4BGAA 4M63C 4FWPA 3MN9A 1JCEA 3HI0A 3WXIA 5ADXA 4QS7A 2E1YA 4BRNA 4XEIA 2P9KB 3RSEB 4BRIA 2KHOA 4O8KA 1E4GT 3CQXA 3DXMB 1TUUA 4FWMA 4WQ5A 1GLAG 4I6MB 3W3DA 5LJVA 2I7PA 1U6ZA 1ZXOA 3SMPA 3P4IA 1JCFA 3ZEUB 1GLCG 5F1XA 3EO3A 3H1VX 2GWJA 1YAGA 1NBWA 2P9UB 4BQLA 2QM1A 2D1KA 3HM8A 3J8AA 3U4LA 3O5BA 4K42A 4JD2A 4JAXA 1BU6O 3I8BA 1EQYA 3FZLA 4FWLA 1YUWA 4B1XB 2Q0UA 4PKGA 3MK6A 1GLLO 3WEEB 4XH5A 3VEWA 4BC5A 4DCHA 5AQVA 2P9SA 4WYBA 4ISEA 2HF3A 2CGJA 4PKIA 3WXKA 3EL2A 3QBWA 4CZLA 4BRAA 1DKGD 3VF6A 5E26A 2ZGZA 5FPDA 3O4WA 4BRGA 1S3XA 2HF4A 3VOVA 3WXJA 4EIAA 3KHYA 2NZTA 2P9KA 3RSEA 2ASOA 3VF2A 3VEXA 2NLXA 5AZIA 4IXCA 4H5NA 3UKRB 3DXMA 2P9IA 2V7YA 4O5FA 2CGKA 3BUZB 5AQZA 1D4XA 2A41A 5KQ8A 5AQHA 3GG4A 3HSCA 3FZKA 2ASMA 3HBTA 3GL1A 5TKYA 3QMLA 2P9UA 3A0IX 3F9MA 4FPAA 4FPBA 4B1WB 2V51B 3KVGA 2CH5A 1G99A 4BRQA 5KPZA 1IG8A 4BC3A 3TPQA 2E1ZA 4BVPA 4BRKA 3A5MC 3MDQA 4H0XB 4BG8A 3WEEA 4PKHA 4EHTA 4K41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SUOA 1EO1A 3S3OA 3H45C 3UKUB 3SQ0A 1XRSB 2P5GA 1N5YA 1D9DA 4DSJA 3THVA 4EZ6A 2E2PA 1U45A 3QETA 3M3ZA 2F8SA 1G15A 4MO4A 4H0OA 5HRRA 4F9OA 2N66A 2LJ7A 2Q36A 3UKRA 3N4PA 3K2PA 3QIPA 3ZT3A 1XMOK 4M3XA 3NF8A 3OYGA 1S1VA 4DB3A 3LDSA 1XNRK 3S41A 2ZF5O 3O9UA 3VQBA 2HHUA 2NY8X 2YJEA 3BEXA 1OVYA 3H46O 3L6QA 4CJWA 2NRHA 1R0AA 1C56A 4BREA 1XUPO 2W6KA 2O8BA 4AM7A 3IMXA 1Q86O 3MEEA 2GMOA 1NK0A 5EY4A 3AVJA 4CZKA 4AHTA 4FO0A 1WBBA 2V7ZA 1CZ9A 1P8ZA 1BWFO 3D6RA 3DRRA 5IWAK 4IG3A 3SK3A 5GIPA 4YNQA 1FH3A 2VWBA 3QNOA 1OZZA 3I0SA 3OBYA 1DJTA 1TAQA 4FLYA 1XC9A 3KC6A 1T3VA 4NCAA 4M42A 2P9NA 3A8YA 2QKKA 2B3CA 3CERA 4BR9A 4CJQA 1HKGA 4MLHA 4H4MA 3OYDA 4JK8A 5HOOA 3HL8A 1E4FT 1S1UA 1WSEA 4X64K 4GV6A 1K8KB 4DSEA 5AQMA 2FLOA 2GEMA 3UB5A 3OYHA 3MWTA 2M8BB 4IDKA 2KBHA 4CZJA 1NMNA 1GOAA 5AFUH 3L2RA 4DQ8A 4BROA 4F2SA 4CZEA 1NGJA 1HUXA 4ZTFA 5LMUK 1IKWA 4JI4K 3ZYYX 2WUSA 4C1NI 4JEPA 3SI6A 4RW9A 3PIPL 4KB1A 1NJXA 1NGBA 4Z4FA 1YT3A 5C0YA 3QBXA 1FJGK 1BO5O 2WC9A 5BR9A 4CGGA 3O4NA 5AQRA 3CETA 3SCXA 2ZJRL 2BDPA 5M1PA 1KSPA 1X3MA 1VRTA 4JV5K 3C65A 3JYTA 5FPNA 3VEVA 1C0FA 2O8DB 3C7NB 4K8XA 5AQGA 2YJFA 3QICA 4CK2A 1JXCA 5I9EB 1VSIA 2JDQD 4W5RA 4DQRA 2O8FB 3WQTA 3KP1A 1X9SA 2FXUA 4A2BA 4WCEL 3NVKA 4IZ9A 1VQ8N 4E7LA 3IDHA 5C12A 1EETA 4O0JA 3LANA 4NO7A 4CK3A 2V52B 2LJMA 4CZIA 1NPIA 3ZSRA 3ITHA 4ELVA 3F5TA 1J6ZA 1UAXA 1KC8O 5KGXA 3QO9A 4JKEA 4AF1A 3CYGA 3NGYA 1PX9A 4FK4A 4B9VA 4CF8A 4Y1CA 1RILA 3TSUA 3VTHA 4WF9L 2Q1NA 5F0XA 3K57A 1VNAA 3CJ9A 1CXUA 5AQNA 4JKGB 4XIUA 3MCAB 3QINA 3TWHA 2FBVA 3DM2A 4CEZA 1BK8A 4FJMA 5AQLA 2VG5A 1X9JA 2HMPA 4B1ZA 3HPOA 1LAWA 1CHZA 1RDUA 1TI5A 3V81A 2NRVA 1QZ5A 5AJ3K 4OO1J 3FZFA 1YF5L 1CZAN 3NF9A 4FW1A 1TYQB 4DR2K 4B9NA 3AO4A 4IJAA 2P9LB 3R1XA 3OBWA 1LQQA 2HBMA 3VEZA 2D0AA 3LDPA 5BN8A 3NH1A 1AYJA 4GNIA 1Q8IA 4DTPA 1DEJA 3WQUA 4KHSA 2KSKA 4RW8A 4CVNE 2GWKA 4BE0A 1RDDA 2GL1A 2O8CB 4CFCA 2Q0RA 4JHDB 4M7XA 4CEQA 4A57A 2HHQA 4JI7K 3SPYA 2VGNA 1ZBSA 4DLGA 4CD1A 1Q18A 4WE1A 3VGLA 3VGMA 3MEDA 1LQIA 2E2OA 2NY9X 3OYFA 3E1YA 3O4QA 4E7IA 2P51A 4IWVA 4FLWA 4KHYA 3E9OA 3HZ6A 4DV5K 3C6AA 4CW7B 2RKIA 1C55A 3RMDA 5BPNA 2FSKA 2Q97A 5LL6Z 5AQUA 3GOIA 5DMRA 3H3NO 4BRDA 5AR0A 3O3FA 1DT9A 4MFBA 3IFRA 4LH4A 4I2QA 5KRTA 3SQ2A 3HJFA 1GPSA 1A5XA 1QTMA 4X66K 1IKVA 4YOXA 1KVAA 3GDQA 1K8BA 2NNWA 4FJ5A 1NMDA 1NGCA 2ZGYA 4WFNL 3OS1A 4DS5A 2GUPA 4NXMK 3AV9A 3DJCA 1I94K 4BRHA 4E19A 3ZSXA 2HHTA 1ZFUA 4DTSA 1RT3A 1XC3A 2FBYA 1C0TA 3U9ZA 4CJPA 5JLFA 2MBKA 4BR5A 3SUPA 4KHNA 2BTFA 2BE2A 2G8VA 4Q5VA 3SPZA 5AQIA 3KZBA 1I6GA 3M5RA 4Y1DA 1DGKN 4DTXA 2XY6A 3ZX0A 2CH6A 2HHXA 3AA3A 3D2FA 2G8FA 1IV0A 3AY9A 3NH0A 2A5XA 4U7BA 4BE7B 4B3OA 5KTQA 2YV0X 2YCHA 4DV6K 1H1VA 2F9WA 2UXCK 2FSJA 1SKRA 4UQGA 2VYPA 1UGLA 4CEOA 4O5BA 3TTFA 1Q82O 4HE7A 2B5JA 4CZHA 4OPKA 1WUAA 4FK2A 3AGRA 3V1RA 3U9DA 2XY8A 2UUCK 2PYLA 4KI6A 4DQQA 4HVJA 4FXDA 2IDOA 2F96A 4ID5A 3THWB 3LALA 1YJ9N 4J2AA 4DV1K 1VAZA 3CCQN 2E6LA 3SV3A 3KOYA 3QEWA 1JKHA 1RTJA 4M63C 5HRPA 4QS7A 3ZT2A 5GADP 4JI1K 4BRIA 3EE8A 3ZSWA 3E9PA 4KFBA 1S1XA 4B3TK 4CGFA 1L4VA 4W5OA 2LT8A 3W3DA 3PY8A 3L4QA 1U6ZA 4DWIA 4BDPA 2NRXA 1JCFA 3CC4N 4LF5K 1GLCG 4JS4A 3CFPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3SUO A;  1EO1 A;  3S3O A;  3H45 C;  3UKU B;  3SQ0 A;  1XRS B;  2P5G A;  1N5Y A;  1D9D A;  4DSJ A;  3THV A;  4EZ6 A;  2E2P A;  1U45 A;  3QET A;  3M3Z A;  2F8S A;  1G15 A;  4MO4 A;  4H0O A;  5HRR A;  4F9O A;  2N66 A;  2LJ7 A;  2Q36 A;  3UKR A;  3N4P A;  3K2P A;  3QIP A;  3ZT3 A;  1XMO K;  4M3X A;  3NF8 A;  3OYG A;  1S1V A;  4DB3 A;  3LDS A;  1XNR K;  3S41 A;  2ZF5 O;  3O9U A;  3VQB A;  2HHU A;  2NY8 X;  2YJE A;  3BEX A;  1OVY A;  3H46 O;  3L6Q A;  4CJW A;  2NRH A;  1R0A A;  1C56 A;  4BRE A;  1XUP O;  2W6K A;  2O8B A;  4AM7 A;  3IMX A;  1Q86 O;  3MEE A;  2GMO A;  1NK0 A;  5EY4 A;  3AVJ A;  4CZK A;  4AHT A;  4FO0 A;  1WBB A;  2V7Z A;  1CZ9 A;  1P8Z A;  1BWF O;  3D6R A;  3DRR A;  5IWA K;  4IG3 A;  3SK3 A;  5GIP A;  4YNQ A;  1FH3 A;  2VWB A;  3QNO A;  1OZZ A;  3I0S A;  3OBY A;  1DJT A;  1TAQ A;  4FLY A;  1XC9 A;  3KC6 A;  1T3V A;  4NCA A;  4M42 A;  2P9N A;  3A8Y A;  2QKK A;  2B3C A;  3CER A;  4BR9 A;  4CJQ A;  1HKG A;  4MLH A;  4H4M A;  3OYD A;  4JK8 A;  5HOO A;  3HL8 A;  1E4F T;  1S1U A;  1WSE A; 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