3GL1A

Crystal structure of atpase domain of ssb1 chaperone, a member of the hsp70 family, from saccharomyces cerevisiae
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
AEGVFQGAIGIDLGTTYSCVATYESSVEIIANEQGNRVTPSFVAFTPEERLIGDAAKNQAALNPRNTVFDAKRLIGRRFDDESVQKDMKTWPFKVIDVDGNPVIEVQYLEETKTFSPQEISAMVLTKMKEIAEAKIGKKVEKAVITVPAYFNDAQRQATKDAGAISGLNVLRIINEPTAAAIAYGLGAGKSEKERHVLIFDLGGGTFDVSLLHIAGGVYTVKSTSGNTHLGGQDFDTNLLEHFKAEFKKKTGLDISDDARALRRLRTAAERAKRTLSSVTQTTVEVDSLFDGEDFESSLTRARFEDLNAALFKSTLEPVEQVLKDAKISKSQIDEVVLVGGSTRIPKVQKLLSDFFDGKQLEKSINPDEAVAYGAAVQGAILT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of ATPase domain of Ssb1 chaperone, member of the HSP70 family from Saccharomyces cerevisiae.
rcsb
molecule keywords Heat shock protein SSB1
molecule tags Chaperone
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 124
structure length 383
sequence length 383
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2009-03-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3gl1A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gl1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gl1A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3gl1A04
2I7NA 5AQMA 3W3DA 5AFUA 3ZEUA 2GELA 5BPLA 1QZ6A 3IFRA 3ZETA 3LDOA 4H03B 1YXQA 4CZHA 1BDGA 4XEIA 4K43A 3TU5A 4J8FA 3LDNA 1HKBA 1NGBA 3ATVA 5AFUH 4BG8A 1J6ZA 2V7ZA 1NGFA 4PKIA 2D4WA 4BR5A 2HMPA 3H1VX 1JCEA 4NO7A 2Q1NA 2ASMA 2P9LA 4QS7A 5EOYA 3VF2A 5FPDA 3H3NO 3R9PA 3AARA 2FSNA 2E2NA 3VPZA 4PKHA 2ZF5O 3I33A 4JNEA 3C0BA 2WUSA 2YHWA 3MMVA 1GLFO 1TUUA 5BPMA 3R6MA 2CGKA 1TYQA 2D0PA 1HJOA 4LC9B 4IJAA 4B1VA 3UKUB 4RWTA 2ZGYA 4QS8A 3GE1A 4EHUA 5BREA 5EVZA 3AAPA 3CERA 1YUWA 2YCHA 3G25A 3GG4A 2YHXA 2VCPA 3FLCO 2E88A 5AQOA 5AQUA 4BROA 5FPEA 4FWSA 4BQLA 4CZEA 4BR7A 4H0PA 4WYBA 4BC4A 3QBXA 4CJ7A 3LDQA 3HZ6A 3EO3A 4M7XA 1S22A 5AQXA 1NGEA 3FZLA 1DGKN 5ADXA 4K42A 4BRCA 4PL7A 3F9MA 3DXMB 4I6MB 1Z05A 2FLOA 4H5VA 4JHDB 3VEYA 4CZFA 1SQKA 4H0YB 3WEEB 2Q0UA 5BRFA 5ADXH 4BRQA 3H1QA 5LJWA 2QW9A 4L3QA 1R59O 3QDKA 4B1ZA 4DCHA 5EXWA 3CQXA 1YAGA 3H46O 2QWPA 3WEEA 1X9JA 3MN9A 3WUHA 1QQOA 2E20A 1OKJA 1BU6O 3EN9A 5KPTA 5AQWA 2ZGZA 4E1JA 4H0VB 2A41A 2GUPA 3CJCA 2P9SB 2FSKA 4RTFD 3BEXA 2F9WA 5FPNA 4RCHA 2E2PA 3ENHA 4O5FA 3A8YA 1KXPA 4IJNA 2P9SA 4BC3A 3IMXA 2YJFA 5AZIB 3VF6A 3DWLA 3P4IA 5E84A 2H3GX 1Z6RA 2CH5A 3BF3A 2ZWHA 1NM1A 3LDLA 2E2QA 5AQHA 2QM1A 3FZHA 4BRIA 4BG9A 4FWRA 3ZEUB 3VF4A 1WOQA 3WQTA 3ZETB 3CI5A 3CETA 3WXLA 4ISGA 2P9UB 5JICA 2QWOA 1MDUB 3EKSA 2P9KA 3KVGA 1U2VA 4H5RA 3WXJA 4BREA 4BVOA 3UE5A 2P9UA 2V52B 3J8AA 2GTDA 1EQYA 3H6EA 1LOTB 2IIRA 3FFKB 1P8ZA 4JN4A 2QWLA 3ATUA 4XH5A 3A5NC 3VOVA 2P9LB 2HF4A 5AQQA 1RGIA 2I7PA 4CBUA 4FPAA 3VESA 1NGAA 2QWNA 3S41A 4B1WB 4CD3A 4MLHA 4EAHD 2AP1A 3U9DA 1MWMA 4CZIA 3DXKA 4CZKA 2CGLA 3MN7A 1HPMA 4CBXA 3GDQA 2HF3A 5BPNA 2NZTA 3EKUA 1SZ2A 3D2FA 1TYQB 4DB3A 3LM9A 4FWNA 5AQJA 5FPMA 1RFQA 3OHRA 4XH4A 3U8XA 4Y0WA 4BRFA 4BRMA 4AM6A 5BN9A 5F1XA 1YVNA 2Q0RA 3QFUA 3MK6A 3HBTA 3WXIA 1ATSA 4IZ9A 4PKGA 3CHWA 3M3ZA 2BUPA 2Q2RA 5BR9A 1IJJA 3SLCA 1BG3A 2QWMA 2HOEA 1NGDA 5E26A 4K25A 4H5WA 1RDWX 3SMSA 4FWOA 3BUZB 3DAWA 2FXUA 4CZLA 2ITMA 2NLXA 5AQFA 2FSJA 3VENA 5EX5A 2V51B 4BRAA 2P9IA 4BGBA 4CZMA 2IVNA 5AQPA 1KAYA 4FWQA 1BOTO 4H5NA 3U9ZA 3CJ9A 1NGCA 2F9TA 1GLDG 1GLLO 4BGAA 5BN8A 4BRLA 1DEJA 4CBWA 4H0XB 3D7EO 3ULEB 5JLFA 1ATNA 3LM2A 2GWKA 3A0IX 5ELZA 1XQSC 5AQTA 3H3OB 4YDUA 4BR0A 3ULEA 1NGJA 4FWMA 1GLBG 2KHOA 1Q18A 3CIPA 3KHYA 4BC5A 1U6ZA 1IG8A 3I8BA 4MO4A 4DQ8A 2PAVA 3CJ1A 5AQSA 5KPZA 3TPQA 1HLUA 5F2RA 3ENOA 2W40A 1GLCG 3H45C 3C7NA 1XUPO 2BTFA 1KAZA 3A5OC 2QWQA 5TKYA 2D0OA 2GWJA 3VGMA 2ASPA 4FO0A 2YJEA 2V7YA 3D2EA 1CZAN 1X3NA 2UYTA 2FF3B 4BRNA 4CZGA 2P9NB 4BRDA 1LCUA 1NMDA 2W41A 4WQ5A 4FOIA 1QZ5A 1DKGD 1BO5O 2E1ZA 3WXKA 4DHYA 3O80A 3W0LA 4XH1A 1ZBSA 3RSEA 4CI6A 4BRGA 2P9NA 5AR0A 3MN5A 2IVPA 3ZX2A 3GL1A 1ZC6A 1K8KA 2P9KB 3HI0A 1U2VB 3MCPA 3EL2A 4BR4A 4JAXA 1NWKA 3WT0A 2A40A 3O6WA 5AZJA 5I9EB 5LJVA 3A5MC 5AQIA 5F0XA 1D4XA 3HTVA 3QBWA 1NBWA 2EWSA 4FWKA 3O1BA 5B8HA 1QQNA 2VWBA 4KBOA 4IXCA 4GY2B 4Z94A 2E1YA 3MN6A 4WQ4A 4C23A 4H5TA 4K41A 2A42A 1HX1A 3O4WA 2VYPA 3UB5A 2QXLA 2ASOA 1NGHA 3VEVA 3L0QA 3ID8A 5AQRA 2AA4A 3M1FA 4HWIA 3QICA 1V4TA 3UKRB 4B1YB 1WUAA 4FOEA 4EIAA 2DPNA 4M7YA 2P9PA 4BC2A 3DXKB 1T44A 3ZX3A 3GBTA 1BWFO 1BUPA 1H1VA 1QHAA 3UKRA 4EHTA 4A62A 4A2AA 1E4FT 4JD2A 3D2FB 1NLVA 3LL3A 1V4SA 2IVOA 5KPRA 1KAXA 3VETA 4B1UB 2CGJA 4EFHA 4QS9A 3QMLA 3FZMA 1TUYA 4FWPA 3VEXA 4CD1A 5LY3A 1BA0A 2OANA 3KZBA 2FF6A 3LDPA 4CZJA 4H0OA 4BVPA 1T6CA 5JLHA 3CQYA 4FL9A 3FR0A 5KQDA 4FPBA 3M6GA 2A3ZA 4BRHA 5AQYA 5BRHA 3VGKA 2P9IB 4MO5A 1QQMA 3O5BA 3FZFA 3JXUA 3B8AX 2J4RA 1NGIA 3QB0A 4ISFA 3EZWA 1T6DA 3BP8A 4M63C 5AQLA 5JMVA 2Q36A 3MDQA 2YI1A 4H0TB 3CJ7A 4FSVA 3HSCA 1HKGA 4YDUC 3VGLA 3UKUA 4NB4A 4O8KA 3QFPA 1HUXA 2Q97A 3AY9A 3JS6A 3VEZA 3R8EA 4A2BA 1MWKA 4BQZA 3VEOA 4HTLA 4ISEA 4BRPA 3U4LA 4MLEA 3C7NB 4FWLA 1ESVA 5KQ8A 3FE1A 1Y64A 3CJBA 2D1KA 2PBDA 3ZX0A 4BRKA 5BRDA 3D2EB 1BA1A 3AAQA 1C0GA 3HM8A 4B9QA 4WQ5C 3VEWA 3FZKA 1X3MA 2E2OA 2GEMA 3VERA 1S3XA 2Q31A 2A5XA 3DXMA 3IUCA 4I6MA 2A6AA 3CJAA 2YHYA 4F9OA 4JHDA 5EY4A 3RSEB 5AQNA 1JCFA 1HKCA 3FGUA 2NRHA 3SK3A 5CE3A 1K8KB 3O08A 1ATRA 3BF1A 5AQGA 4PL8A 4IO8A 3O8MA 3WQUA 4B1XB 1NGGA 2QWRA 1GLJO 1XC3A 5AZJB 5AQVA 4BR9A 5AQKA 3SMPA 4GNIA 3O1WA 4WQ4C 3L4IA 1C0FA 1MA9B 1JCGA 2E8AA 4IWVA 4BR2A 3DJCA 3A5LC 3IDHA 3GOIA 1SAZA 4A61A 2P9PB 1E4GT 5AZIA 1GLEG 3SJHA 1GLAG 1ZXOA 5AQZA 4AM7A 2CH6A 4JD2B 1G99A 3L6QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZBLA 3W3DA 5AFUA 5J2MA 3ITHA 1UA0A 1QZ6A 3IFRA 1N5YA 4JKEA 4H03B 4V19S 4BACA 2QK9A 3K5OA 1OMYA 3TU5A 1HMVA 4UQGA 1DT9A 4M3WA 3NE6A 3ATVA 1J6ZA 4GW6A 2D4WA 3NH0A 3H1VX 1WAFA 3HSTB 1GOBA 2WFBA 4NO7A 3PIPL 1EP4A 1CHZA 2Q1NA 1T03A 2O8FB 3J7AP 3VF2A 4LF8K 3R9PA 2KSKA 2GV9A 4FLTA 2E2NA 3VPZA 4E7JA 5CZ2A 4PKHA 5HBMA 2ZF5O 4CHNA 4YNQA 4JNEA 1NOYA 3ZT3A 3K59A 1X9MA 4CIFA 1TUUA 5BPMA 4Q5VA 3T69A 2KFZA 4DSEA 1K8BA 4LH5A 1KFSA 1OH5A 3LZIA 2G8KA 4B1VA 1NU0A 1SN4A 2KBHA 4Z4FA 2X74A 3OBYA 4QS8A 4DF8A 4N76A 1VSKA 3AO2A 3GG4A 3SUNA 1D5AA 2YHXA 1QTMA 4LF6K 2KZZA 2BANA 3DI6A 1S1VA 4PUOA 5AQUA 4A5BA 2E3FA 1D9DA 4FWSA 3OYNA 4CHYA 4WYBA 4BC4A 3QBXA 3ASMA 4CJ7A 3HZ6A 3MEGA 3OW2M 1C55A 1OH6A 5KRSA 1JLFA 3T7ZA 1IKYA 4HUFA 3FZLA 4DTPA 4BRCA 4PL7A 3F9MA 1CZBA 1M1KO 4WCEL 4M3UA 3DXMB 3NMUA 4DR3K 4H5VA 1ZYQA 4PY5A 1AYJA 5BRFA 4L3QA 3DLRA 4DCHA 3H46O 4JKCA 1POIA 3MN9A 1QQOA 2F96A 5KPTA 3BGRA 1SS6A 5AQWA 3TSQA 2O8BA 2GUPA 1UAXA 4WFNL 2P9SB 1KSPA 1WSIA 5FPNA 3AVLA 4RCHA 1S5JA 2ASCA 1NJWA 2P9SA 4CGDA 3IMXA 1TAUA 3VF6A 2GX9A 2H3GX 3BF3A 4BDZA 1RBVA 2RE2A 3CPWM 4FWRA 2HHHK 2KLAA 4PHTX 3ZEUB 1ZBUA 3RMCA 1MR4A 3VF4A 1WOQA 2XY7A 1Z26A 3ZETB 1NOZA 2ZJQL 3KLIA 4OX9K 4N41A 4KHPK 3OYGA 1TKDA 2MN5A 2QWOA 3KVGA 4OGEA 3MEEA 4CHZA 1FH3A 1LWFA 3WXJA 3L8BA 1FW6A 3UE5A 2V52B 1HYVA 3H6EA 4LFAK 3OBWA 4KO0A 1Y97A 4FCYA 3NGIA 3CPEA 1ZU3A 2HF4A 1RGIA 1Q9XA 4M3RA 4CJ4A 3SUOA 3S41A 4B1WB 3G71N 4QOZB 4AHVA 5C24A 3O3FA 2BDPA 1YJNN 2NRXA 1S1XA 1D9FA 1JKHA 2GL1A 2CGLA 4FJ9A 3J7YP 2HF3A 3EKUA 4GKKK 3VQ8A 1SZ2A 3LM9A 3E66A 5HRNA 4ELVA 2N69A 2XHBA 5FPMA 4RW7A 3SZ2A 3TSPA 1TV6A 4AM6A 1JL1A 1W2BM 3IG1A 5BR9A 1IJJA 3ZSYA 1BG3A 2HOEA 1L5UA 2P5GA 3I8DA 3KC6A 4OO1J 3KTQA 3QEVA 4K25A 1EXQA 1RT1A 3SBGA 3BUZB 1YTAA 3CC4N 2W6LA 4A57A 3QEXA 4YOVA 2ITMA 1HQUA 4CJUA 3BDPA 4KTQA 5DM6L 3DRSA 2P9IA 4FW2A 4CJFA 2VG5A 1NRBA 4E19A 5C10A 4B9MA 3PIOL 2ZQBA 4FJMA 5BN8A 3ZT1A 1L3VA 2WC9A 3ULEB 3C6AA 4JI6K 4FK0A 3SJJA 3LM2A 3MCAB 3JSMA 2HHUA 2YILA 3O9UA 4CGIA 4N56A 3EEQA 3ULEA 3KHYA 3DLEA 3I8BA 3CG7A 4DQ8A 2PAVA 2NRVA 3AGRA 5AQSA 2E2FA 3EE8A 3ZCMA 4CEDA 1IBMK 3EY1A 3ENOA 2W40A 1GLCG 3C7NA 3PY8A 1EWQA 1XUPO 5BR8K 4KB1A 3L3UA 2D0OA 1TK0A 2ASPA 2YJEA 2V7YA 3HJFA 1VNAA 2YIPA 3LWMA 4M3ZA 2W41A 4LF9K 3CMEN 4AF1A 1QZ5A 1BO5O 4CJPA 3KKSA 2I5JA 4BRGA 3VQPA 2LI7A 3NDKA 3V4IA 2OCEA 1NKEA 3GL1A 1P00A 1K8KA 1ZC6A 3LP3A 3DRRA 3ENBA 1U2VB 2ZJRL 4OPHA 2A40A 4IKFA 1TI5A 4FWKA 3O1BA 3QEIA 3OJUA 4KBOA 5CZ1A 4DLEA 4GY2B 2E1YA 1NK5A 2ZD1A 4DTUA 3O4WA 2VYPA 1C1AA 1MYNA 3VEVA 2ASOA 1NGHA 3L0QA 1JLBA 3WNGA 2QKBA 3KOZA 1B9FA 3KIOA 5GAHP 3QICA 4HWIA 1V4TA 4B1YB 4F3OA 1VQLN 1S6PA 5M1PA 4CECA 3DXKB 1GOAA 2W6KA 1JL2A 1RTIA 3GBTA 1BUPA 1H1VA 4EHTA 1JXEA 4HCBA 4M3YA 4C8KA 1FKPA 1RBTA 4BY9C 1V4SA 5C0YA 4FZXC 1NPIA 3CCVN 1VSDA 3VETA 4E3SA 4B1UB 5SZTA 2UXCK 4I7FA 5GINA 4B3MK 3QMLA 3QIOA 1IKXA 2KGQA 5CY4A 1WSFA 3K9JA 1ZUTA 4LF4K 4BECA 4ICLA 4F8RA 2VWKA 1T6CA 4DR1K 2X6NA 3JAMO 3DRPA 3DMJA 2SN3A 1A5XA 4FM1A 4FJIA 5AQYA 2B6AA 4R79A 4B08A 1I2UA 4OKEA 1LV5A 2OA8A 1GPSA 1KQSM 3JXUA 2Y1IA 2BRZA 4ISFA 4Z4CA 3VA3A 4FJ5A 3BP8A 4DQQA 2HBJA 1TL3A 2VGMA 1Q81O 3HXMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ZBL A;  3W3D A;  5AFU A;  5J2M A;  3ITH A;  1UA0 A;  1QZ6 A;  3IFR A;  1N5Y A;  4JKE A;  4H03 B;  4V19 S;  4BAC A;  2QK9 A;  3K5O A;  1OMY A;  3TU5 A;  1HMV A;  4UQG A;  1DT9 A;  4M3W A;  3NE6 A;  3ATV A;  1J6Z A;  4GW6 A;  2D4W A;  3NH0 A;  3H1V X;  1WAF A;  3HST B;  1GOB A;  2WFB A;  4NO7 A;  3PIP L;  1EP4 A;  1CHZ A;  2Q1N A;  1T03 A;  2O8F B;  3J7A P;  3VF2 A;  4LF8 K;  3R9P A;  2KSK A;  2GV9 A;  4FLT A;  2E2N A;  3VPZ A;  4E7J A;  5CZ2 A;  4PKH A;  5HBM A;  2ZF5 O;  4CHN A;  4YNQ A;  4JNE A;  1NOY A;  3ZT3 A;  3K59 A;  1X9M A;  4CIF A;  1TUU A;  5BPM A;  4Q5V A;  3T69 A;  2KFZ A;  4DSE A;  1K8B A;  4LH5 A;  1KFS A;  1OH5 A;  3LZI A;  2G8K A;  4B1V A;  1NU0 A;  1SN4 A;  2KBH A;  4Z4F A;  2X74 A;  3OBY A;  4QS8 A;  4DF8 A;  4N76 A;  1VSK A;  3AO2 A;  3GG4 A;  3SUN A;  1D5A A;  2YHX A;  1QTM A;  4LF6 K;  2KZZ A;  2BAN A;  3DI6 A;  1S1V A;  4PUO A;  5AQU A;  4A5B A;  2E3F A;  1D9D A;  4FWS A;  3OYN A;  4CHY A;  4WYB A;  4BC4 A;  3QBX A;  3ASM A;  4CJ7 A;  3HZ6 A;  3MEG A;  3OW2 M;  1C55 A; 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