3HSCA

Three-dimensional structure of the atpase fragment of a 70k heat-shock cognate protein
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Three-dimensional structure of the ATPase fragment of a 70K heat-shock cognate protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 7OKD PROTEIN
molecule tags Hydrolase (acting on acid anhydrides)
source organism Bos taurus
total genus 124
structure length 382
sequence length 382
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1995-03-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3hscA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hscA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hscA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3hscA04
1GLAG 4JD2B 4AM6A 5AQNA 1QQMA 4BC5A 3UKUA 4Z94A 1Y64A 3H1QA 4MO5A 2YHXA 5BPNA 4WQ4A 4BGAA 5E84A 3D2FB 1K8KB 3C0BA 5FPMA 1Q18A 3J8AA 4Y0WA 1BU6O 3WXJA 4MO4A 2UYTA 5KQ8A 2AA4A 5AQKA 1U2VB 3EL2A 5F0XA 3VERA 1MWKA 3VOVA 2IVPA 2VYPA 1GLFO 5AQFA 5AQQA 4CI6A 4CZIA 5AQHA 4DHYA 4BGBA 4HWIA 4A2AA 1NGEA 4JD2A 2EWSA 2NZTA 4NO7A 3FE1A 4BRCA 1QZ5A 3MN6A 3D2FA 1K8KA 3CJAA 4DCHA 2HF4A 3DWLA 2Q31A 4GY2B 4HTLA 4WQ5A 4BRKA 1JCGA 3CJ7A 2Q1NA 4A62A 3FZFA 3CHWA 5AQSA 4FPBA 4IJAA 5AZIB 5AQWA 4EHUA 3A5NC 3ENHA 2FF6A 3CQXA 1WOQA 3L0QA 3LDQA 1BUPA 2QWNA 3I33A 3QICA 5BPLA 3BUZB 2W41A 3ZEUB 4H5RA 2F9WA 2FSNA 2CGLA 2ZGYA 2GEMA 2A5XA 4B1YB 1GLEG 4O5FA 3SMSA 4BQLA 3WXIA 1ATRA 1NBWA 1U6ZA 2P9KB 1YVNA 3WXKA 3ATVA 5EX5A 3VF2A 4QS8A 2YJEA 4RWTA 5BN9A 3MDQA 5JLFA 3IMXA 4XH1A 2CGKA 4PL7A 5KPRA 4A2BA 5AZIA 1HPMA 2E8AA 2Q2RA 3MK6A 5BN8A 3WEEB 3VEXA 2PBDA 3GBTA 1GLCG 4JN4A 2P9IB 3WT0A 1XUPO 4CJ7A 1NGJA 3ZEUA 5FPDA 4K43A 1RGIA 2P9UA 4B1WB 2WUSA 3ZX3A 4B1VA 4LC9B 4BVOA 4EFHA 2HOEA 4BRMA 1ESVA 5BRHA 1NMDA 2D1KA 3U9DA 3ID8A 4O8KA 2A41A 3A0IX 3QMLA 1ATNA 2P9KA 3LDPA 5BRDA 5AQJA 1NM1A 1OKJA 2V52B 4BRLA 3D2EB 3CERA 5BPMA 2D0OA 2E1YA 3VF4A 5AQOA 4B1ZA 4CBXA 4FWMA 1BDGA 4PKIA 1TUYA 4C23A 4FWKA 4FWSA 5AZJB 3CJBA 3CQYA 3UB5A 5KPTA 1KAZA 4PKHA 3EO3A 5E26A 2FSKA 3WEEA 4I6MB 4CBUA 5ADXA 2HMPA 2P9IA 3ZX0A 1GLDG 4CD1A 1NGIA 2GTDA 3D7EO 3FGUA 1C0FA 4RCHA 1S3XA 3QBWA 5AFUA 1EQYA 3BF1A 2QM1A 4J8FA 1NWKA 4BR9A 5AQRA 3IDHA 4PKGA 4BR7A 1KAXA 1LCUA 3H3NO 5B8HA 1X3NA 2FLOA 1HKCA 5BRFA 3MCPA 3WQTA 3RSEB 1LOTB 3O5BA 1Z05A 3ULEA 4A61A 1DKGD 3VGLA 5AR0A 1WUAA 4CBWA 3C7NA 3CETA 1ZC6A 3D2EA 4BR4A 4FWQA 2Q0RA 3TU5A 3SLCA 5AZJA 3HI0A 4BC4A 2E2OA 2W40A 4I6MA 3UKRB 2FF3B 1S22A 2GWKA 5BREA 1NGGA 3GG4A 2IVOA 2ITMA 1GLJO 2Q36A 4WQ4C 3WXLA 3VEZA 2CGJA 4CZFA 2E88A 4BR2A 1BA0A 2BUPA 3A5OC 4BRDA 3L6QA 3GDQA 2ZGZA 1HKBA 3R9PA 3GE1A 3I8BA 4FL9A 5CE3A 3H45C 3RSEA 3O1BA 2IVNA 4BG9A 4BRQA 3W0LA 3W3DA 1MDUB 2E1ZA 1MWMA 1GLBG 5TKYA 1ATSA 4IWVA 1YUWA 4CZLA 3ATUA 2D4WA 1MA9B 4YDUA 1HJOA 3HTVA 5JLHA 4BRNA 3A5MC 3P4IA 3LDNA 2P9UB 4IXCA 3BF3A 1SQKA 3UKRA 4CZMA 4DQ8A 5AQIA 1NGBA 5AQGA 4IZ9A 4WYBA 3DJCA 1BO5O 1XQSC 1BG3A 2GELA 5AQLA 3DAWA 3VEVA 2ASOA 4JNEA 4B9QA 3GL1A 3MN7A 1T6DA 3LM2A 4WQ5C 3CI5A 5I9EB 3MN5A 2KHOA 3DXMB 4XH5A 3U9ZA 4M7XA 1J6ZA 1C0GA 4H5NA 1X3MA 3WUHA 2VCPA 2QXLA 3H46O 4H5WA 3HBTA 1QZ6A 1JCEA 1V4TA 2QWOA 2I7PA 3CJ9A 3VGKA 5FPNA 3FFKB 1QQOA 2D0PA 2PAVA 4FWNA 4B1UB 4BQZA 1IG8A 2P9LB 3AAPA 2A40A 1Z6RA 3M6GA 4H5TA 1HX1A 4ISEA 1BWFO 4H0PA 2H3GX 2P9SB 2I7NA 3JXUA 4H03B 4BR0A 5EXWA 2A3ZA 5LJWA 4F9OA 3FZHA 4BRIA 4FOEA 3SMPA 3QFPA 3CJCA 3ULEB 1V4SA 2OANA 3IFRA 4L3QA 5AQZA 3FZLA 5AQVA 3C7NB 1DGKN 2FSJA 3DXMA 4NB4A 4CZJA 4MLEA 2ASPA 1KAYA 1QQNA 2QWLA 2E20A 3QB0A 3QDKA 4BRAA 2NRHA 4IO8A 5JMVA 5BR9A 2CH5A 5EVZA 4MLHA 1R59O 3JS6A 3SJHA 3A8YA 4FSVA 3EKUA 3KHYA 1NGAA 2P9LA 2YHWA 4CZGA 4FOIA 3EZWA 3U8XA 4IJNA 4GNIA 1E4GT 4BROA 4CZEA 3QFUA 1TYQB 2P9SA 2CH6A 4ISFA 3LL3A 2AP1A 4K42A 1RFQA 3H3OB 1JCFA 3FLCO 4BRGA 3VENA 3FR0A 1NGDA 4B1XB 2J4RA 4XEIA 1ZXOA 2Q0UA 1KXPA 2Q97A 3H1VX 4BC2A 1HUXA 1X9JA 5LY3A 2DPNA 1XC3A 1TUUA 3FZKA 3VGMA 3F9MA 1NGCA 3L4IA 3DXKB 2QWQA 3LDLA 4BG8A 2V51B 2E2NA 3VETA 1NLVA 4FWPA 4FWRA 4QS7A 3BP8A 3SK3A 1CZAN 2E2PA 1T44A 3R6MA 1YAGA 3AAQA 3GOIA 2YHYA 5AQMA 3G25A 1TYQA 3O6WA 4FWLA 2A42A 3OHRA 4EHTA 1HKGA 3KZBA 3M1FA 4FPAA 5KPZA 1P8ZA 5F1XA 2IIRA 3QBXA 2BTFA 3O1WA 1T6CA 5ADXH 3DXKA 1BA1A 2A6AA 4H0VB 5AFUH 2GUPA 4JHDB 4BREA 3H6EA 1D4XA 3VEYA 1SZ2A 3IUCA 3VEOA 1NGFA 3VF6A 4RTFD 4H0YB 3ZX2A 5AQTA 4FO0A 3KVGA 2GWJA 2P9NB 4M63C 2P9PB 3EN9A 3O80A 5EOYA 1U2VA 2F9TA 4DB3A 3VPZA 3O4WA 2HF3A 5LJVA 4K25A 3LDOA 4BRHA 2NLXA 4E1JA 1IJJA 3A5LC 3LM9A 2QW9A 2QWRA 4EAHD 1E4FT 3FZMA 1SAZA 3CJ1A 4YDUC 3R8EA 1GLLO 3ENOA 4BC3A 4CZHA 2QWPA 3AARA 5ELZA 3ZETB 3VEWA 4BVPA 4JHDA 5AQPA 4CD3A 2ZWHA 3CIPA 4K41A 3S41A 3HSCA 3O08A 4H0TB 2QWMA 4H0OA 3WQUA 2P9NA 4ISGA 2P9PA 3M3ZA 1HLUA 4H0XB 5KQDA 3EKSA 5JICA 2E2QA 4BRPA 1BOTO 3TPQA 4PL8A 1QHAA 4XH4A 1DEJA 3UKUB 4JAXA 2YCHA 4KBOA 2V7YA 2ASMA 5F2RA 5EY4A 4AM7A 3MN9A 3HZ6A 2V7ZA 5AQUA 2YI1A 4EIAA 4BR5A 1G99A 3ZETA 3BEXA 2YJFA 2FXUA 4M7YA 3HM8A 3AY9A 1NGHA 1YXQA 4H5VA 1RDWX 5AQXA 4QS9A 3MMVA 5FPEA 3VESA 5AQYA 3U4LA 3UE5A 4BRFA 4CZKA 3B8AX 4FWOA 1H1VA 2ZF5O 3O8MA 2VWBA 1ZBSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I7FA 2OPRA 3TSPA 1T7AA 1GLAG 4FLYA 5KTQA 3UKUA 2RPIA 2B6AA 4KHSA 4WQ4A 1GOCA 4Z4FA 5E84A 3CCVN 1DTQA 3MXMA 3TSQA 3KTQA 1DLOA 3VQ6A 1NE5A 4EZ9A 4DTRA 4LSNA 4Q5VA 4DUYK 3QERA 1MU2A 4CEDA 4XJXA 1LQIA 4AHTA 3VOVA 3PY8A 4CF1A 1GLFO 3LALA 4CI6A 2LJ7A 2G8FA 2A7TA 3DLHA 5AQHA 4Z4HA 1L3SA 1XNQK 4A2AA 2QKBA 1PE4A 5IWAK 1NGEA 3C94A 1J54A 3K9JA 3IS9A 4NO7A 3AGRA 3FE1A 2VQFK 1LV5A 5FROA 2Z1HA 4M3XA 1QSLA 4EZ6A 4DV5K 3R1XA 1RT6A 4CECA 4WQ5A 4FZYA 2DFHA 3KOWA 3CJ7A 3T1AA 3H08A 1DJTA 2O8EB 3CCSN 1N34K 2G8UA 2QTDA 3CQXA 4W5RA 1WOQA 1RDCA 4NYFA 4CEFA 1BUPA 2QWNA 1WSJA 3THVA 3OYDA 4H5RA 1RBTA 5GINA 3OW2M 3SNNA 1ZBIA 4FJ9A 3DLKA 1GLEG 4B1YB 5FLXO 1OVYA 2HBMA 1KFSA 1RT4A 4CHPA 3BDPA 4AHSA 3F9KA 1U6ZA 1YVNA 3CCLN 3WXKA 3S5TA 1P90A 2KGQA 3OYBA 2NRTA 3VF2A 1FJGK 2NY9X 2JLEA 3M8QA 5BN9A 3MDQA 4WE1A 3IMXA 3O3FA 2O8EA 1HPMA 4CFAA 1ZYVA 1WB9A 3E9LA 1RBRA 3LPTA 3S9HA 1LQQA 2YKNA 4R5PA 1XUPO 2HHVA 3LAMA 1SEGA 1W7AA 2WUSA 4BEBA 3ZX3A 4B1VA 4LC9B 3JAMO 2HOEA 1NMDA 3NH1A 3THYB 3OTOK 3ZSWA 1WNSA 1ZBUA 2A41A 4M3ZA 3NBPA 1ATNA 3ZSQA 1QSSA 5C42A 2D5RA 4RG8A 1SL1A 1KVCA 4DG1A 2KZMA 1IBLK 2OYQA 4NCBA 1TUYA 1JKZA 3UB5A 3CJBA 2YIOA 1WLJA 4CGJA 4DR7K 4I6MB 4CBUA 3QEIA 2GTDA 1VSHA 1GPTA 1C0FA 4DV1K 5HLFA 3QBWA 1U4BA 1XC9A 4CGDA 1EX4A 4FLZA 1B7DA 1JZBA 1RT5A 4NLCA 3E01A 1K9MO 1KAXA 1X3NA 3QETA 2Q3SA 1Z05A 3DOLA 1WUAA 4CEQA 3CETA 2N69A 1HR0K 3SCXA 1WBBA 2Q0RA 2W6KA 4PA1A 4CJ3A 3SLCA 3HI0A 4BE7B 5M1KA 4I6MA 3UKRB 3GKUA 3GG4A 2ITMA 4JI3K 2RHKA 3G4SN 2LSNA 4KV8A 1A5WA 4WQ4C 3VEZA 2E88A 3KOXA 1TGOA 4KI6A 4DTNA 3A5OC 1C56A 4BRDA 4FZXC 1HKBA 2W42A 3GE1A 3I8BA 4FL9A 3E7UX 3OYNA 1VQ4N 2HHUA 4BRQA 3ZT1A 2E1ZA 3WNHA 1MWMA 4O4GA 3VQPA 1L4VA 3AO3A 3ITHA 4U67L 3K5LA 2ZJRL 4CZLA 1NNEA 4BDPA 1B9DA 1QE1A 1HRHA 3LWLA 4FJGA 1FXXA 2XY5A 3MEGA 4CGHA 3UKRA 1EXQA 1SQKA 5AQIA 5AQGA 1VQPN 4H4OA 5C2FA 4WYBA 3THXB 4DTJA 4O8UA 2ATBA 1NRAA 4FK2A 3VEVA 1ITGA 4JNEA 1BCMA 4WQ5C 1T1TA 5I9EB 2Y1JA 3M8PA 3U9ZA 4J2DA 3QNNA 2VG7A 4H5NA 3WUHA 3C6TA 3HBTA 3TTDA 1JCEA 3MECA 1VQLN 2QWOA 3KK1A 3VGKA 1EWRA 3HM9A 3JSMA 5GAGP 3IG1A 4BE1A 3EE9A 3FFKB 4B1UB 4GVMA 3AVCA 3I8DA 4C8LA 4DTMA 1HNVA 4MDAA 1BWFO 1TKDA 2H3GX 2P9SB 4OPAA 4KTQA 4V19S 3SAGA 2A3ZA 5C24A 4DLEA 4BRIA 1IO2A 4DQPA 4JLHA 4DFMA 4MLEA 4NXNK 1KAYA 3CW4A 4CJKA 4CE9A 2QWLA 3QB0A 4BRAA 3G0ZA 3CF5L 2W00A 2ZJPL 4FZZA 4UAEF 3JS6A 5C25A 2UXDK 5HRPA 1ZVEA 2VWKA 3V6DA 1QVGM 3CG7A 1N5YA 4FJIA 4Y1DA 4FOIA 4CIEA 3NGZA 4YFUA 4ELVA 4GNIA 3QFUA 2WBNA 2P9SA 4ISFA 4K42A 1IKVA 3C6AA 4BE0A 1WMTA 4B3OA 1NK7A 5M1NA 3QIPA 1VQ8N 4HCCA 4IFYA 2J4RA 4CJUA 3H1VX 1R0AA 3CC2N 4IEEA 3L3UA 3NDKA 4AHVA 4E3SA 3LP1A 1VQON 4B9NA 1VQNN 3L2QA 3LDLA 3QNOA 4ID5A 2V51B 4NCAA 3VETA 3CC7N 2HVIA 3NFAA 1CN2A 4LFAK 4FWRA 5IT9O 3SK3A 1CZAN 4DSJA 3G25A 1VSFA 3OHRA 4KHPK 4EHTA 4HHTA 4DSIA 3QEWA 1JXEA 2UUAK 3BZCA 3HRGA 4BECA 1P8ZA 5F1XA 2BRZA 4R79A 2IIRA 4N76A 3QBXA 1T0ZA 2X74A 4DSLA 3THWB 2YNFA 2LT8A 2FBXA 2IS3A 4DQSA 1BA1A 1VSDA 2A6AA 2Z1IA 1KV0A 5M1OA 2BGGA 4Z4IA 4CF0A 3VF6A 2Y1IA 1IBMK 5AQTA 3C6UA 4FO0A 2O8FB 4FJNA 3J7AP 3O80A 5EOYA 4WFNL 3VPZA 3O4WA 5CZ2A 2F8TA 3WNEA 4B3RK 3VQ9A 3PX6A 1S9EA 3LM9A 3KKSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4I7F A;  2OPR A;  3TSP A;  1T7A A;  1GLA G;  4FLY A;  5KTQ A;  3UKU A;  2RPI A;  2B6A A;  4KHS A;  4WQ4 A;  1GOC A;  4Z4F A;  5E84 A;  3CCV N;  1DTQ A;  3MXM A;  3TSQ A;  3KTQ A;  1DLO A;  3VQ6 A;  1NE5 A;  4EZ9 A;  4DTR A;  4LSN A;  4Q5V A;  4DUY K;  3QER A;  1MU2 A;  4CED A;  4XJX A;  1LQI A;  4AHT A;  3VOV A;  3PY8 A;  4CF1 A;  1GLF O;  3LAL A;  4CI6 A;  2LJ7 A;  2G8F A;  2A7T A;  3DLH A;  5AQH A;  4Z4H A;  1L3S A;  1XNQ K;  4A2A A;  2QKB A;  1PE4 A;  5IWA K;  1NGE A;  3C94 A;  1J54 A;  3K9J A;  3IS9 A;  4NO7 A;  3AGR A;  3FE1 A;  2VQF K;  1LV5 A;  5FRO A;  2Z1H A;  4M3X A;  1QSL A;  4EZ6 A;  4DV5 K;  3R1X A;  1RT6 A;  4CEC A;  4WQ5 A;  4FZY A;  2DFH A;  3KOW A;  3CJ7 A;  3T1A A;  3H08 A;  1DJT A;  2O8E B;  3CCS N;  1N34 K;  2G8U A;  2QTD A;  3CQX A;  4W5R A;  1WOQ A;  1RDC A;  4NYF A;  4CEF A;  1BUP A;  2QWN A;  1WSJ A;  3THV A;  3OYD A;  4H5R A;  1RBT A;  5GIN A;  3OW2 M;  3SNN A;  1ZBI A;  4FJ9 A;  3DLK A;  1GLE G;  4B1Y B;  5FLX O;  1OVY A;  2HBM A;  1KFS A;  1RT4 A;  4CHP A;  3BDP A; 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