3IUCA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 5 (bip/grp78) atpase domain in complex with adp
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
GTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70kDa protein 5 (Glucose-regulated protein, 78kDa
total genus 113
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2009-08-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3iucA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3iucA04
2A42A 1NGIA 2I7NA 3RSEA 1ZC6A 5E26A 4BVOA 3IFRA 1U2VA 3IMXA 4H5WA 1DKGD 1S3XA 1TUYA 1T6CA 3MN9A 4MO5A 5ELZA 3QFPA 1IJJA 3MDQA 4BC3A 3GL1A 1GLEG 1BUPA 2P9SB 1IG8A 3VEWA 4A62A 1XQSC 3KZBA 4A2AA 5FPMA 1GLBG 4CD1A 2ASPA 1XUPO 2CGLA 4XH4A 1K8KA 1NGJA 2UYTA 1S22A 1X3MA 1C0GA 4WYBA 3VGMA 2P9IB 4M63C 3FGUA 3AAPA 5FPNA 2QWQA 4NB4A 3EKSA 3LDNA 3ZETA 2NRHA 3U9ZA 5ADXA 2VCPA 1V4SA 3G25A 2E2OA 3O1BA 2QW9A 1E4FT 1OKJA 4JHDB 4FWSA 5AQQA 4BVPA 3WXJA 5KQ8A 4K42A 2E1YA 3ATUA 3QBXA 3ZEUA 5F2RA 1HLUA 1LOTB 5AQWA 4CJ7A 3DXKA 5AZJB 4WQ4A 4KBOA 4H0VB 4JD2A 1YVNA 3W3DA 4BRAA 3M6GA 2CH5A 4CZJA 1NGGA 3FE1A 4DB3A 1WUAA 4NO7A 1D4XA 3B8AX 2FLOA 3BEXA 3A5OC 3H45C 4BR4A 3KVGA 1U6ZA 4WQ5A 2HMPA 2V51B 3JS6A 1BWFO 4H5VA 2P9PA 1H1VA 3UB5A 3CQXA 2YJEA 4CBUA 3CIPA 1NGBA 5CE3A 3WXKA 4RWTA 3FZLA 5KPTA 3WUHA 2NLXA 5EVZA 3MCPA 4CZGA 2P9UB 2D4WA 2IIRA 2Q0UA 5AFUH 2PBDA 3O1WA 4FOIA 2P9KA 4BR9A 3WQUA 4K41A 4BR2A 2A6AA 4CZFA 3SLCA 4EIAA 3VEOA 4HWIA 3D2EB 2VYPA 3BP8A 3LDPA 1MWMA 1NGFA 4B1UB 2HOEA 2NZTA 3L4IA 4O8KA 3HM8A 3UE5A 2GUPA 3FFKB 1QHAA 4YDUA 4A2BA 4BR7A 4FWMA 1NGEA 3H46O 5F0XA 5AQOA 3GBTA 5FPEA 4Y0WA 1Z05A 2F9TA 2A40A 1DEJA 3MK6A 4K25A 1X9JA 3O8MA 1MWKA 4ISGA 3J8AA 4GY2B 4CZEA 3DXMA 3FZHA 2YJFA 4BG8A 1NGDA 2P9NA 5BREA 3OHRA 2GWKA 3SK3A 4JAXA 4EHTA 3D2FA 4Z94A 1Z6RA 3GE1A 2QWLA 3W0LA 5AQRA 1HKBA 4H0OA 3VERA 5AQMA 2QWOA 2AP1A 2Q0RA 3L0QA 2ASOA 4EAHD 2H3GX 4BRLA 4FL9A 4BQZA 3VF4A 2Q36A 1NM1A 4DQ8A 2BTFA 2P9LA 1K8KB 2YCHA 5AQTA 4IJAA 3GOIA 3UKUA 5AQYA 4FPAA 2EWSA 3CJ7A 4QS9A 3BF3A 3CJ9A 3A5MC 3MMVA 3ZETB 4DCHA 1NLVA 3LDLA 4BRPA 4BC5A 3DJCA 5BPLA 3C0BA 4CZKA 2A3ZA 4EHUA 2W41A 4RCHA 3CJCA 2E88A 1XC3A 2FSNA 3U8XA 4BREA 4BR0A 3CETA 3ZEUB 4FO0A 2YI1A 5AZIA 5KPZA 3DXKB 3VETA 4JN4A 5BRHA 4JD2B 4PL8A 1Q18A 3HBTA 4MO4A 4MLEA 1HUXA 3LDQA 5TKYA 2ITMA 2V7YA 3LM2A 3QB0A 3WEEA 3U4LA 2GTDA 1HJOA 4AM7A 3FLCO 3WXLA 4B1XB 1ZXOA 4H5TA 3BUZB 4CBXA 4F9OA 3CJ1A 3F9MA 2E2NA 2P9PB 5EX5A 5JLHA 3VEYA 5BN9A 5BRFA 4FOEA 4O5FA 1BA1A 1E4GT 1YAGA 2F9WA 1LCUA 1NMDA 2CGJA 3VPZA 3A0IX 2A41A 3QFUA 4CZMA 5AQZA 3M1FA 2E2QA 4B1WB 2KHOA 3UKRA 2VWBA 3AARA 2E8AA 4DHYA 1MDUB 2I7PA 5ADXH 1RGIA 4XH1A 4J8FA 1G99A 3IUCA 4FWNA 1SAZA 5JICA 1GLJO 3VF2A 1ATSA 2QWPA 4H0TB 4XH5A 1QQOA 4M7YA 1V4TA 3HI0A 5EY4A 1ESVA 4WQ4C 1P8ZA 2GWJA 4QS8A 3ATVA 3ENHA 1JCGA 2FF6A 2FSJA 2QWMA 4BR5A 2GEMA 4IXCA 4FWQA 3SMSA 4MLHA 4CD3A 2V7ZA 4WQ5C 3O5BA 1HKCA 5AQPA 5FPDA 2D0PA 4BRIA 5KPRA 1TUUA 3C7NA 3QMLA 3EN9A 3MN5A 1TYQB 3H6EA 5AQJA 3CQYA 2E2PA 3DWLA 2CGKA 1C0FA 3DXMB 4QS7A 3EKUA 3H3NO 4M7XA 1R59O 4FWLA 4GNIA 2IVOA 1JCFA 2P9NB 5AQUA 3CI5A 3RSEB 5LJWA 5JMVA 5AQGA 4H03B 3FZMA 4BRKA 5BPNA 2ZWHA 1U2VB 4BC2A 2QXLA 3QBWA 3WT0A 3ULEA 4C23A 2ZF5O 4PKIA 3VESA 3H3OB 2CH6A 3KHYA 2P9LB 4BRMA 3UKUB 4AM6A 1GLDG 1GLFO 3A5NC 3GG4A 1WOQA 3L6QA 5AQIA 2V52B 5F1XA 4FSVA 3EL2A 4BRNA 2AA4A 1EQYA 4IZ9A 3MN7A 3LL3A 3AY9A 3O80A 4A61A 3CJBA 2YHXA 2HF3A 3O6WA 4YDUC 1T6DA 2FSKA 5LJVA 2BUPA 3M3ZA 4BGAA 2WUSA 5AZIB 4I6MA 1HX1A 1GLCG 4JNEA 5AR0A 1Y64A 4H5RA 2E20A 3VEVA 1KAYA 4B9QA 1QQMA 2Q31A 3R9PA 4LC9B 1NGAA 3WEEB 3EZWA 3ZX3A 4H0PA 5AQFA 1NWKA 2PAVA 2QWRA 2GELA 3HSCA 1HKGA 3A5LC 2QM1A 3ENOA 2P9SA 1YUWA 4ISFA 2FF3B 2OANA 4BRDA 2YHWA 3U9DA 1ATNA 3S41A 5E84A 3MN6A 1QQNA 1SZ2A 4BRFA 2D0OA 1ZBSA 3QICA 2HF4A 4BRGA 3VGLA 4FWRA 3R8EA 3UKRB 4IWVA 5KQDA 2P9IA 5AQXA 2E1ZA 3GDQA 3VENA 3VOVA 5AFUA 5AQKA 5AQSA 3QDKA 3D7EO 3ID8A 4L3QA 3LDOA 3SJHA 4BC4A 3H1VX 5BRDA 2P9KB 4JHDA 1QZ5A 2IVPA 4K43A 5AQVA 2ASMA 1X3NA 2Q97A 4BG9A 1BO5O 1YXQA 1GLAG 1NGHA 3EO3A 3I8BA 4IO8A 3LM9A 3TPQA 3WXIA 4B1VA 4BGBA 5AZJA 1HPMA 1RDWX 3CERA 5EOYA 4CZIA 4E1JA 3O4WA 2A5XA 1GLLO 4B1YB 2Q1NA 4FWPA 4BRHA 3FR0A 1NGCA 3R6MA 3WQTA 4H0XB 2D1KA 5AQHA 3VEZA 2W40A 3AAQA 1KXPA 1ATRA 4BRQA 3SMPA 1JCEA 1CZAN 3C7NB 1SQKA 5B8HA 3CJAA 4HTLA 4XEIA 3P4IA 5LY3A 2DPNA 3BF1A 3JXUA 5EXWA 4RTFD 2QWNA 1BG3A 4EFHA 3H1QA 1BU6O 3ZX0A 3A8YA 1J6ZA 5BR9A 2FXUA 5AQLA 1MA9B 2P9UA 1BA0A 1BOTO 4FWOA 1QZ6A 3ULEB 3VEXA 4BROA 3FZFA 1T44A 3TU5A 4IJNA 4ISEA 4PKHA 3D2FB 4B1ZA 3I33A 3ZX2A 4FWKA 1KAZA 5BPMA 5I9EB 4BRCA 2J4RA 4PKGA 5JLFA 1KAXA 1BDGA 4FPBA 5BN8A 3D2EA 2IVNA 3VF6A 4CI6A 1DGKN 3HZ6A 3VGKA 4BQLA 4CBWA 4H0YB 2Q2RA 2ZGZA 1RFQA 4H5NA 5AQNA 2ZGYA 3CHWA 3O08A 1TYQA 3DAWA 3HTVA 3IDHA 4PL7A 1NBWA 4I6MB 3FZKA 2YHYA 4CZLA 4CZHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YTAA 3DLHA 1ZC6A 4NXMK 3AVHA 3LAKA 3IFRA 3IKMA 3THWB 1VRUA 4M3UA 4KHQA 1S3XA 2ATQA 1T6CA 4KFBA 1W9HA 3CCQN 3VMFB 1K6YA 5FRMA 4BECA 1GPTA 4BC3A 3PIPL 2ZD1A 1JLBA 2VGNA 1XQSC 1RBTA 4KH6A 3E9OA 1HMVA 1UWBA 1S22A 1C0GA 3OS1A 1XMQK 2N2RA 5D3GA 4BWMA 3THXA 3SBGA 3ZSOA 4AHVA 2C1GA 3G25A 1T7BA 4AB0A 2QW9A 1WB9A 4FWSA 1Q82O 5KQ8A 4K42A 3DOLA 1CN2A 2KFZA 3O4NA 5F2RA 1HLUA 1LOTB 5AQWA 1ITGA 3DXKA 5AZJB 5BR8K 4E19A 4DB3A 2FBYA 2MZ0A 2FLOA 4DLEA 1K8AO 3A5OC 3ZSZA 3ISNC 2Z1HA 3M8SA 4ZTJA 4FJMA 4CK1A 3JS6A 4IDHA 4GV9A 3LP1A 3QEWA 1BWFO 4CBUA 3TTFA 3CIPA 1VQNN 4M3TA 5CE3A 1YJ9N 4GV6A 3QO9A 3AO5A 4RWTA 1Q86O 5GINA 1TK8A 1YF5L 5EVZA 3MCPA 2IIRA 4KH4A 2HBMA 2X6NA 1QE1A 4KYPA 3L3UA 4R5PA 4B9SA 1F21A 3SLCA 2HHHK 3TWHA 4CF1A 4V19S 2YNHA 5M1KA 1QSYA 4M41A 4UAEF 4ID1A 3VQ8A 3D2EB 2VYPA 1MWMA 4Y1DA 4B1UB 1RT5A 2OPSA 2HOEA 4NCBA 1ZFUA 2B5JA 4I2QA 1B9DA 4YOTA 4IFEA 4KAZA 3HM8A 1C0UA 3UE5A 2GUPA 4OX9K 1JLEA 4YOUA 2YC1C 1BK8A 4IO9L 4J2DA 1YJNN 2P1JA 1TAQA 3H46O 5T7BA 2ASCA 2OPPA 4CGFA 1NOZA 3CCRN 3V1QA 5E41A 2Y1JA 1BISA 3BZKA 1MWKA 3J8AA 3C6HA 1RDUA 1YVUA 4CZEA 2YJFA 1LV5A 4LD0A 1BCOA 1NGDA 1BQNA 3SK3A 5FLXO 4EHTA 3GE1A 2QWLA 3K2PA 3QLHA 3W0LA 2OZSA 2QWOA 3OJUA 2E2FA 3L0QA 4CGGA 1I2VA 3T1YK 1TI5A 2BTFA 2HBJA 4IJAA 1AYJA 4FPAA 2EWSA 4HHFA 1EP4A 3OYHA 4C1NK 5HLFA 3A5MC 1JL1A 3CCVN 2B68A 4BRPA 4BC5A 1N5YA 4B9VA 2B4JA 3C0BA 4DQSA 4CJ3A 4FJIA 4YOYA 4O5BA 4JI5K 4CCHA 4BREA 4BR0A 3VQPA 3THWA 1RT1A 4C8KA 5BRHA 3VQDA 4JD2B 3T1AA 3HYFA 1LW2A 4MO4A 2V7YA 3LM2A 1BQMA 4KHUA 2GTDA 3MAQA 3FLCO 3WXLA 4B1XB 1ZXOA 2KKZA 3S3MA 3L2QA 5KGXA 3CJ1A 3F9MA 1N4NA 3SYZA 2HHUA 2P9PB 3A2FA 1XMOK 5C42A 5BRFA 3PSMA 4O5FA 1BA1A 3S9HA 3J7ZO 2G8UA 1LCUA 2CGJA 3VPZA 2A41A 4OKKA 1JXBA 4CZMA 3M1FA 2E2QA 4B1WB 3NF7A 1NJXA 2E8AA 2PYJA 4FLXA 2WFBA 4FWNA 3OYAA 3KLGA 1D8YA 1NE5A 4DFPA 1X9SA 3MXJA 3CC7N 1CXQA 1WAJA 2GWJA 4A57A 4KTWA 1JZBA 1NK0A 2VQFK 2QWMA 3ID6A 4BR5A 4IXCA 4MFBA 3SMSA 3CCMN 1CZ9A 3V81A 1U48A 1KVCA 3AVMA 5KPRA 2D0PA 4J2AA 4Z4FA 1LAVA 1TUUA 3C7NA 3QMLA 3EN9A 1HYZA 2OTLN 1DLOA 3G4SN 1TYQB 3LANA 3DWLA 3K5MA 2CGKA 2KPYA 1CXUA 3KOWA 1VQ8N 2HHQA 4DTNA 2IVOA 1JCFA 2P9NB 4CHZA 5AQUA 4KB1A 3AVBA 3DI6A 1IKYA 5CHIA 1VQLN 2ZWHA 3H08A 3MWTA 3WNFA 2ITGA 3O4QA 1P90A 3J7YP 4C23A 2IC3A 4RW8A 3EYZA 1HPZA 2CH6A 3E9LA 3K9JA 2YHBA 4FLWA 1WOQA 4YOVA 4MQ3A 3DLEA 1ILYA 2MN5A 2BH1A 3NFAA 3L8BA 1JXCA 1ZVEA 3T7ZA 4OGCA 4AEIA 4JK9A 5H1SQ 3AY9A 4NYNA 3O80A 3TTDA 3LALA 4KHNA 2HB5A 4BGAA 1TL3A 1KQSM 2QEXN 4F3TA 4BE7B 5HBMA 5AZIB 4CJ4A 4CHYA 4DV3K 3OYGA 4FK4A 3MXIA 4H5RA 3OVNA 1K9MO 3R9PA 3CYMA 3QIOA 2D56A 2JWKA 5CZ2A 1SKWA 2YILA 3KK1A 4HHTA 4PUOA 5AQFA 4H4MA 1NWKA 2PAVA 3E01A 1BCGA 4LSLA 4HVJA 4DUZK 1XWLA 1HKGA 4CQKA 4BDZA 4B9NA 4BY9C 1YUWA 2P5OA 3F5TA 2LR3A 4ILGB 2G8FA 2KFNA 1N34K 1ATNA 4A5BA 5LMUK 4BACA 1EWRA 3TAPA 1C1CA 2ETJA 2KQ2A 2P9IA 5AQXA 2E1ZA 3VOVA 3RTVA 1VQKN 4DMNA 2OZMA 3QDKA 3D7EO 3LDOA 1JLAA 3EE8A 3JSMA 1GOBA 1FKPA 2PYLA 1VSJA 3I0RA 4FZZA 3VQAA 1X3NA 2Q97A 3EO3A 1GLAG 4FJ5A 4B1VA 2KSKA 3G6EN 1JLGA 1P00A 2O8BA 2A5XA 3P5JA 3LWMA 3KLFA 2HHIA 3BZCA 4ELVA 1NGCA 2NUBA 2D1KA 3VEZA 3QEIA 4BRQA 1WSJA 1CZAN 3VQ6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1YTA A;  3DLH A;  1ZC6 A;  4NXM K;  3AVH A;  3LAK A;  3IFR A;  3IKM A;  3THW B;  1VRU A;  4M3U A;  4KHQ A;  1S3X A;  2ATQ A;  1T6C A;  4KFB A;  1W9H A;  3CCQ N;  3VMF B;  1K6Y A;  5FRM A;  4BEC A;  1GPT A;  4BC3 A;  3PIP L;  2ZD1 A;  1JLB A;  2VGN A;  1XQS C;  1RBT A;  4KH6 A;  3E9O A;  1HMV A;  1UWB A;  1S22 A;  1C0G A;  3OS1 A;  1XMQ K;  2N2R A;  5D3G A;  4BWM A;  3THX A;  3SBG A;  3ZSO A;  4AHV A;  2C1G A;  3G25 A;  1T7B A;  4AB0 A;  2QW9 A;  1WB9 A;  4FWS A;  1Q82 O;  5KQ8 A;  4K42 A;  3DOL A;  1CN2 A;  2KFZ A;  3O4N A;  5F2R A;  1HLU A;  1LOT B;  5AQW A;  1ITG A;  3DXK A;  5AZJ B;  5BR8 K;  4E19 A;  4DB3 A;  2FBY A;  2MZ0 A;  2FLO A;  4DLE A;  1K8A O;  3A5O C;  3ZSZ A;  3ISN C;  2Z1H A;  3M8S A;  4ZTJ A;  4FJM A;  4CK1 A;  3JS6 A;  4IDH A;  4GV9 A;  3LP1 A;  3QEW A;  1BWF O;  4CBU A;  3TTF A;  3CIP A;  1VQN N;  4M3T A;  5CE3 A;  1YJ9 N;  4GV6 A;  3QO9 A;  3AO5 A;  4RWT A;  1Q86 O;  5GIN A;  1TK8 A;  1YF5 L;  5EVZ A;  3MCP A;  2IIR A;  4KH4 A;  2HBM A;  2X6N A;  1QE1 A;  4KYP A;  3L3U A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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