3IUCA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 5 (bip/grp78) atpase domain in complex with adp
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
GTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70kDa protein 5 (Glucose-regulated protein, 78kDa
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 113
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2009-08-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3iucA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3iucA04
3MK6A 3FFKB 2P9LB 4BG9A 3SLCA 3O4WA 1NM1A 4BR4A 3ATVA 3MN7A 4H0TB 1GLEG 3FZKA 3U9ZA 4BRKA 5AQGA 3CJBA 2QWMA 1NWKA 2KHOA 2WUSA 4CZHA 4CZEA 1Z05A 3SJHA 4K41A 4BC4A 4H5VA 1NGEA 2HF4A 2E2OA 2HOEA 5KQDA 2A6AA 3VF4A 4H0YB 2ASOA 3MN6A 1E4FT 4JNEA 4EIAA 2CGJA 2UYTA 4MLHA 3P4IA 4FWMA 1JCEA 5FPMA 2F9TA 3VENA 3VEWA 3LDOA 2V52B 5AQRA 4PKHA 3U9DA 3ID8A 4BGBA 3A5MC 2FLOA 3MN5A 2A5XA 3LL3A 2Q1NA 1YUWA 2QXLA 5CE3A 5FPDA 5AQLA 4A61A 1NGFA 4CI6A 5LY3A 4WQ4C 2H3GX 3UKUA 3H6EA 1KAZA 3MMVA 3UKRA 4WQ5C 4A2AA 3MN9A 4EHUA 3UKUB 3C0BA 1V4SA 3UKRB 5FPNA 4M7XA 5EVZA 3CJ7A 1JCGA 3O08A 1U6ZA 4BVPA 2QM1A 3LM2A 4H0XB 5AFUH 4B1ZA 4BC2A 4MO5A 5AQTA 5JMVA 5LJWA 1GLCG 4QS9A 4DCHA 4QS7A 4FPBA 3GBTA 5AR0A 3A5LC 3QB0A 5I9EB 4CZIA 3ATUA 3H45C 5AQFA 2W41A 3BF1A 3AAQA 4XH1A 3CERA 2QW9A 2E8AA 2A40A 4HTLA 2BUPA 2QWPA 2P9PA 4WQ4A 2IVOA 4BRIA 2QWLA 4WQ5A 2E2QA 2P9PB 3IFRA 1T6CA 4ISFA 3VEYA 1C0FA 2Q0RA 3HSCA 2FF3B 4JD2A 2CGKA 2HF3A 5AZIA 3VEXA 3ZX0A 3AAPA 1EQYA 4JD2B 1NGAA 3ZX2A 3HM8A 3JS6A 5AZIB 1ZBSA 5BREA 2E88A 3CETA 3QBXA 4FWPA 4BQLA 5ELZA 1NGHA 4JN4A 4MLEA 2D0OA 3VF2A 5AQOA 3VEVA 3IUCA 3OHRA 2YCHA 1J6ZA 4PL7A 2E20A 4IO8A 1DEJA 3W0LA 4AM6A 2GWJA 3VEOA 2E2PA 1RDWX 2QWNA 2ASPA 2P9SA 2NZTA 1BUPA 1S22A 4B1WB 2V7YA 4EHTA 4F9OA 2Q0UA 1X3MA 1OKJA 2P9SB 2YJEA 3O1BA 4K25A 2A3ZA 2FSJA 1RFQA 4CZGA 3LDLA 3TU5A 3WQUA 1TYQA 2FSKA 4PKGA 5AZJA 2P9KA 2ZWHA 1TYQB 3BF3A 2IIRA 5F0XA 4Y0WA 5EOYA 5AZJB 2P9KB 3BUZB 2P9UA 3FLCO 4FWKA 3ZEUA 1KAXA 2P9UB 3GE1A 4RWTA 4BRFA 3ZEUB 3SK3A 1YXQA 2E2NA 4CD1A 4BR7A 1HUXA 3CJ1A 3CJCA 2AA4A 2Q31A 3CJ9A 4XH4A 3O5BA 2I7NA 4FWNA 1TUYA 3B8AX 3HTVA 3QICA 3UB5A 3RSEA 4FWRA 1DGKN 1BA0A 1Y64A 4IWVA 3RSEB 1DKGD 4DHYA 4M63C 4IZ9A 2FF6A 4RTFD 2I7PA 1ATRA 1SAZA 4FWSA 3L6QA 1MWKA 2NLXA 1ESVA 5AQWA 5AQVA 1H1VA 1BU6O 1U2VA 5F2RA 2ZGYA 5BRFA 3A8YA 1C0GA 1K8KA 1U2VB 1JCFA 3QDKA 3WXIA 1E4GT 5AQMA 1S3XA 1NGIA 1Q18A 2D0PA 1K8KB 4B1UB 2W40A 3EZWA 4B1XB 5AQSA 4H03B 5JLFA 5KPTA 3DWLA 3FZMA 2EWSA 4BC3A 4CBUA 1XQSC 5ADXH 2J4RA 1WOQA 4BGAA 3H46O 4FPAA 3VGLA 3DXKA 5AQPA 3M1FA 4NO7A 3DXKB 2GEMA 2IVNA 2QWQA 3CQXA 3CJAA 4J8FA 3DXMA 1IJJA 3IDHA 4ISEA 1MA9B 1V4TA 2P9IA 5AQQA 2PAVA 1XC3A 3DXMB 3CIPA 3QFUA 3CQYA 3VPZA 5AQXA 1NGGA 2P9IB 3LDPA 4E1JA 3R6MA 5AQUA 5AQYA 3WQTA 2AP1A 4H0PA 3MDQA 3QBWA 1KXPA 3VF6A 4H5RA 2QWOA 4FWQA 4BREA 1HLUA 3VERA 1NGJA 1T44A 4YDUC 1MDUB 3CHWA 1ATSA 3GL1A 4H0VB 3H1QA 4FOIA 1T6DA 3M3ZA 2NRHA 1IG8A 4EAHD 3WXLA 3GOIA 5AQNA 3GDQA 4BRGA 4BRCA 4LC9B 3I8BA 2D4WA 3CI5A 3O8MA 2FXUA 2Q2RA 4B1YB 4PKIA 5AQKA 1BDGA 1BWFO 1NBWA 4A62A 4BRLA 1GLFO 3D7EO 4BRNA 5BRDA 3JXUA 4H5TA 3L4IA 2P9NA 4YDUA 3R8EA 1X3NA 5AQHA 4BRDA 2P9NB 3H3NO 1QQNA 1HKCA 4GY2B 3UE5A 5AQJA 5BN9A 4HWIA 3HZ6A 3U4LA 2ASMA 1P8ZA 4NB4A 1QQMA 5KQ8A 1HKBA 3VESA 3I33A 3WT0A 1LCUA 3WEEA 4JHDA 1QHAA 3HBTA 3WEEB 3AARA 4CD3A 1XUPO 2CGLA 4JHDB 3FZFA 1HPMA 1HX1A 2HMPA 4BQZA 4DB3A 5AFUA 3EN9A 1WUAA 5BR9A 3F9MA 2VCPA 1BO5O 4BR0A 1CZAN 1BA1A 3H1VX 4CZKA 2V51B 4CZLA 3M6GA 1SQKA 3ZETA 3O80A 1BOTO 3A0IX 3DJCA 3EKSA 3ZETB 4O5FA 4BRQA 5BPNA 4IJAA 4IXCA 1RGIA 3G25A 4BRMA 4CBWA 3FZLA 2A41A 2CH5A 2PBDA 1D4XA 3FR0A 4AM7A 3VOVA 2Q36A 5BPMA 4DQ8A 4IJNA 1TUUA 3EL2A 4L3QA 2YHYA 1NGBA 3KHYA 3IMXA 3EO3A 4Z94A 1KAYA 1YAGA 1ATNA 4FWLA 1NGCA 5E84A 3A5NC 3WXJA 2DPNA 2A42A 3H3OB 3D2FA 2GWKA 4BR9A 4EFHA 3O1WA 3D2FB 1NGDA 2FSNA 4K43A 4FWOA 2IVPA 1QZ6A 2YHXA 5EX5A 3SMSA 2E1YA 1QZ5A 2CH6A 3WUHA 3O6WA 5AQZA 4H5NA 4CZJA 4BROA 4C23A 1GLAG 5KPRA 1LOTB 3BEXA 1NMDA 2GUPA 4ISGA 4I6MA 4CBXA 4CJ7A 2E1ZA 4CZFA 1BG3A 2YHWA 4JAXA 4I6MB 5E26A 4RCHA 3W3DA 2YI1A 4XH5A 5KPZA 3TPQA 3LM9A 4XEIA 3S41A 2ZF5O 3VGMA 3J8AA 5EXWA 1GLDG 4A2BA 2OANA 1GLBG 1ZC6A 1Z6RA 2VYPA 3FGUA 3MCPA 4K42A 5TKYA 3R9PA 4GNIA 2F9WA 4FO0A 4BR5A 3C7NA 3FZHA 4BRHA 3VEZA 1ZXOA 3C7NB 4WYBA 5JICA 2GTDA 3WXKA 3EKUA 3QMLA 4BRAA 3BP8A 1GLLO 3L0QA 4H5WA 4H0OA 4M7YA 5BRHA 4B1VA 1HKGA 3DAWA 3VETA 5B8HA 3LDQA 2QWRA 1MWMA 3VGKA 1SZ2A 3U8XA 1G99A 2Q97A 3GG4A 4B9QA 4BR2A 2ZGZA 3HI0A 5ADXA 5F1XA 3ENOA 4BVOA 3ZX3A 3A5OC 2ITMA 3AY9A 4FOEA 5FPEA 2V7ZA 4MO4A 3ULEA 4CZMA 5EY4A 3KVGA 3ENHA 3ULEB 1YVNA 5BPLA 5AQIA 2GELA 4BRPA 5LJVA 4KBOA 1QQOA 3SMPA 3D2EA 4FL9A 1HJOA 3KZBA 4PL8A 3FE1A 1X9JA 4BG8A 3LDNA 3D2EB 2D1KA 1GLJO 4BC5A 4QS8A 1R59O 2BTFA 3QFPA 4O8KA 5BN8A 2VWBA 5JLHA 4FSVA 1NLVA 2P9LA 2YJFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FLZA 3BZCA 4JS5A 2P9LB 4BG9A 1SEGA 3ZSRA 3BDPA 1BQMA 4HHFA 1WNSA 4BR4A 1EP4A 2D0AA 4ID1A 3NF7A 3ZSWA 3U9ZA 3I8DA 2YIPA 4CGDA 4DSLA 5AQGA 2WUSA 1NWKA 3KLIA 3HT3A 4Y1DA 3PSFA 1NK0A 1KVBA 1CZ9A 1C56A 4WF9L 3CM6A 1UOCA 1S1UA 2X6SA 4EIAA 3OS1A 5FPMA 4C8MA 4W5OA 1C55A 3E9PA 4UAFE 4UADE 5I3UA 5KRSA 1AHOA 3QINA 2HB5A 2NRRA 5GAGP 1JLGA 4OKKA 3LL3A 2Q1NA 5KK4A 1RTJA 3KIOA 5CE3A 1VQ9N 5FPDA 1NRAA 3L4QA 1NGFA 2BANA 3TTCA 5J2MA 2E5LK 1JLEA 1HYSA 3UKRA 4WQ5C 4DR4K 4KTWA 4CEQA 3V9SA 4HCBA 1VK0A 3OA9A 4NLBA 3V9WA 3KLHA 3LM2A 4H0XB 5AFUH 1GLCG 4FPBA 3GBTA 2XY8A 3KD1E 3H45C 2W41A 4O55A 3G6EN 2BUPA 4X66K 4WQ4A 4BRIA 1JXBA 3KC6A 2ZM6K 2E2QA 3TAQA 1CZBA 2P9PB 1EXQA 3JYTA 1N6QA 2FF3B 2CGKA 4FJ5A 1FKOA 3ZX0A 4DV2K 4R5PA 1YJNN 3JS6A 1VQMN 4FCYA 1ZBSA 4W5RA 3AA4A 4OGCA 3EE8A 4WCEL 1NGHA 4C8OA 4MLEA 3VF2A 4DLEA 1TV6A 1D9DA 2X78A 3OHRA 4GV6A 3TAFA 1J6ZA 4PL7A 3OYEA 1YJWN 1DEJA 4N41A 1P90A 1RDWX 4O4GA 3ZT4A 1BUPA 1S22A 4LSNA 4NYFA 1GPTA 4GVEA 4IFEA 2YHAA 1PX9A 1WWNA 4FJNA 3O9SA 4PKGA 1VSKA 3IAYA 1T3VA 4ILGB 1WSHA 1ZBHA 4CF9A 2HNZA 4RWTA 1RBSA 5HRRA 1ZYWA 4LFBK 1JL1A 4PQUA 3NFAA 1VQLN 3B6OA 3CJ1A 1GOCA 3CJ9A 4XH4A 4JI8K 2I7NA 5GADP 3NAEA 3QICA 4LF8K 1T7PA 3RSEA 3ZCMA 1XWLA 2YC1C 3J80O 3DYAA 3N4PA 4ZHRA 1DKGD 3VMFB 2FF6A 4K8XA 4DFPA 4DTNA 2ZJPL 2I7PA 1SAZA 3L6QA 3NBPA 3L2QA 3LZIA 5AQVA 1U2VA 4DU1A 1U04A 3QERA 1NOZA 2LJ7A 3P39A 4U7BA 5F2RA 2ZGYA 4KTZA 3A8YA 5BRFA 1K8KA 1NGIA 4B1UB 3FFIA 2W40A 3EZWA 2OPPA 4I9QA 1D5AA 2PFUA 3HVTA 4AHRA 2DFEA 2O8EA 2VG6A 5KPTA 3DWLA 4CF0A 3LP0A 4CCHA 4BC3A 1XQSC 4R79A 2YIOA 2J4RA 4BGAA 3AVJA 2E4LA 3L2VA 3D45A 2B3CA 4AQYK 1QS4A 3M1FA 3PV8A 3DXKB 3E9LA 3CQXA 2JLEA 3LWMA 3VQ5A 3SQ4A 1HNXK 1IO2A 1IJJA 3TAPA 3DXMB 1KTQA 1XC3A 3CQYA 5AQXA 4E1JA 1VSDA 3R6MA 2VQEK 5GIOA 4PY5A 5AQYA 3AA5X 3Q7BA 4X64K 5JS2A 4B3OA 2AP1A 2PZSA 3A2FA 4IFVA 4ELUA 1KXPA 3VF6A 1NGJA 3RTVA 1N4NA 3CYMA 3OS0A 4YDUC 1J5OA 3CHWA 5T7BA 4DR1K 2KGQA 2N69A 3SQ1A 4FJ8A 2UXCK 1N34K 1NOYA 4Z4FA 3OBWA 4V1DC 3SUQA 1DT9A 4DR5K 3GOIA 2YV0X 2NRWA 1W0HA 3K57A 4E0DA 2D4WA 1WSFA 2ZJQL 3CI5A 5HBMA 2JWKA 3HM9A 4LF4K 3GKUA 4B1YB 2OTLN 1CXQA 5AQKA 4PKIA 1RCHA 1DQ7A 3KWGA 4CHQA 3PIPL 4GW6A 5BRDA 2GV9A 3WNEA 1SL0A 3K0SA 3DLEA 2G8KA 4NXMK 5C10A 4BRDA 2P9NB 3L2UA 1C1BA 4QCLA 4KRFA 5AQJA 2HMIA 2NRZA 5I42A 4RW4A 1P8ZA 4LF6K 2D5RA 1JLBA 2K35A 1HKBA 3THXB 1DTQA 1SNBA 1O13A 4OLBA 4DV3K 3LPUA 1XMOK 1IBLK 3ZSVA 3AARA 1XUPO 1HPMA 1J9AA 4BQZA 5AFUA 5AJ3K 3RRHA 4DQPA 1W7AA 1WUAA 1NK6A 5EU7A 1NJZA 2A1RA 2JDQD 4BR0A 1BO5O 3ZT1A 1D8YA 2UXBK 4BRQA 4DG1A 1ZYQA 1C6VA 1LW0A 4KH5A 1J5EK 4AHTA 3DOKA 1T1TA 4YORA 3AVIA 4B3MK 2Z1JA 2O8DB 3J7AP 5BPMA 4C1NI 2W00A 1TUUA 3C65A 1BMRA 3KHYA 4DQIA 3OYKA 4OKJA 4OPJA 3KD5E 4CEBA 4M3ZA 2I61A 4NLCA 1LWEA 1KRPA 4FJ7A 3O1WA 3D2FB 2XY6A 4I9LA 4DSKA 4JK7A 4LY7A 4CGIA 1N8RO 2WOMA 3AO2A 1TGOA 1QZ6A 3E01A 3HO1A 1B92A 3NH0A 4DS4A 3SMSA 2E1YA 2CH6A 4WE1A 3WUHA 4EP5A 1W2BM 3THWA 3VQEA 1G15A 1T05A 4DLGA 4CZJA 2KJAA 4C23A 4CFAA 5CYQA 3S5TA 1LOTB 3BEXA 1NMDA 2GUPA 4CJ7A 1BIUA 4CIGA 1SKSA 2W6LA 3T1YK 4RG8A 1Q9XA 4XH5A 2G8VA 2ZF5O 4I2QA 4YFUA 5EXWA 2UXDK 4IBNA 4B9SA 3MCPA 4FLUA 3R9PA 4JK8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FLZ A;  3BZC A;  4JS5 A;  2P9L B;  4BG9 A;  1SEG A;  3ZSR A;  3BDP A;  1BQM A;  4HHF A;  1WNS A;  4BR4 A;  1EP4 A;  2D0A A;  4ID1 A;  3NF7 A;  3ZSW A;  3U9Z A;  3I8D A;  2YIP A;  4CGD A;  4DSL A;  5AQG A;  2WUS A;  1NWK A;  3KLI A;  3HT3 A;  4Y1D A;  3PSF A;  1NK0 A;  1KVB A;  1CZ9 A;  1C56 A;  4WF9 L;  3CM6 A;  1UOC A;  1S1U A;  2X6S A;  4EIA A;  3OS1 A;  5FPM A;  4C8M A;  4W5O A;  1C55 A;  3E9P A;  4UAF E;  4UAD E;  5I3U A;  5KRS A;  1AHO A;  3QIN A;  2HB5 A;  2NRR A;  5GAG P;  1JLG A;  4OKK A;  3LL3 A;  2Q1N A;  5KK4 A;  1RTJ A;  3KIO A;  5CE3 A;  1VQ9 N;  5FPD A;  1NRA A;  3L4Q A;  1NGF A;  2BAN A;  3TTC A;  5J2M A;  2E5L K;  1JLE A;  1HYS A;  3UKR A;  4WQ5 C;  4DR4 K;  4KTW A;  4CEQ A;  3V9S A;  4HCB A;  1VK0 A;  3OA9 A;  4NLB A;  3V9W A;  3KLH A;  3LM2 A;  4H0X B;  5AFU H;  1GLC G;  4FPB A;  3GBT A;  2XY8 A;  3KD1 E;  3H45 C;  2W41 A;  4O55 A;  3G6E N;  2BUP A;  4X66 K;  4WQ4 A;  4BRI A;  1JXB A;  3KC6 A;  2ZM6 K;  2E2Q A;  3TAQ A;  1CZB A;  2P9P B;  1EXQ A;  3JYT A;  1N6Q A;  2FF3 B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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