3IUCA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 5 (bip/grp78) atpase domain in complex with adp
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
GTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70kDa protein 5 (Glucose-regulated protein, 78kDa
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 113
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2009-08-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3iucA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3iucA04
2Q31A 2NLXA 3U9ZA 3ZETB 4BRPA 4BVOA 3ZX3A 1YAGA 2H3GX 3WXLA 3D7EO 2QM1A 5F0XA 2Q36A 4I6MA 3VF2A 4BC4A 4PL7A 3KVGA 3FFKB 1ATSA 4JHDA 4BRAA 4CBWA 4H0PA 1U2VB 4BRFA 4FWSA 4BREA 2PBDA 5AQQA 1BOTO 3O4WA 4MLEA 4BC5A 1BA1A 1V4SA 5EXWA 3O08A 3O1BA 1E4GT 1BO5O 1RDWX 3BF1A 1JCGA 4DQ8A 3D2EA 1Z05A 4EHUA 3LDNA 2Q97A 3S41A 5AQNA 3CJ9A 2IVPA 3W0LA 2V7ZA 5FPMA 4CZKA 3DXKB 2FF6A 2QWRA 4M63C 4YDUC 3BEXA 3O8MA 3VGKA 1NGFA 3ZX2A 4CJ7A 1G99A 4CBUA 3H45C 5AQOA 1QZ6A 5CE3A 1ZBSA 4E1JA 4IO8A 1XQSC 3UKRA 3O1WA 3UB5A 3WQUA 2DPNA 1HUXA 3A5LC 4FOEA 5AZJA 4FWNA 3CJCA 2E2OA 4BC2A 1Y64A 1RFQA 3A5MC 1ZC6A 4NB4A 5AQMA 3VEZA 5AZIB 3QFPA 3WUHA 2F9WA 4CD3A 4K25A 3MDQA 4EFHA 1QQMA 1P8ZA 1DKGD 4BGAA 5KPRA 3A0IX 3GE1A 5F2RA 1QHAA 2GEMA 4BGBA 2D4WA 4EAHD 1JCEA 4RWTA 3EKUA 3H1QA 1TUUA 3FGUA 3MN6A 2P9KB 5AQVA 3HZ6A 4H5RA 2VWBA 3QFUA 4BG9A 3WEEB 1NGIA 3AAPA 5KPZA 2BUPA 5BN9A 2CGKA 4XEIA 1YXQA 3IDHA 5ADXA 3H1VX 1HJOA 2VCPA 3H3NO 5F1XA 4HWIA 2ITMA 4A2AA 4YDUA 2P9PB 4EHTA 3VEVA 5I9EB 3SJHA 1TUYA 3L4IA 1U2VA 4BRDA 2IVOA 2E2QA 4PKIA 2FLOA 2AP1A 1ATNA 1H1VA 1QZ5A 2E2NA 3EO3A 4A2BA 1NGGA 3MN9A 1S3XA 4BR9A 5JICA 5EX5A 3QB0A 3QBWA 1BUPA 4NO7A 1BG3A 2Q1NA 2WUSA 4CI6A 2ASMA 1K8KB 2D1KA 5BREA 1TYQB 4H0TB 1CZAN 4IXCA 4IJNA 3VERA 2GUPA 3C7NB 2GWKA 3EKSA 4HTLA 4BVPA 3J8AA 2PAVA 4EIAA 2E2PA 4FOIA 1QQNA 3WT0A 3FZKA 1NLVA 3O5BA 3R9PA 3LDQA 2QWMA 4L3QA 2YHWA 1KAZA 4ISEA 5BR9A 2CH6A 2A5XA 1D4XA 4XH5A 1C0FA 2D0OA 5AZIA 3L0QA 5TKYA 3R8EA 3VGLA 4K43A 4H03B 1R59O 3GDQA 3H46O 3QDKA 4AM7A 4H5TA 2QWQA 3U8XA 1EQYA 4H5VA 1T44A 1BA0A 5AQPA 3W3DA 5LJWA 4WQ4C 3ZEUB 3VESA 4CBXA 1GLJO 4H0XB 2FSNA 2P9KA 3HI0A 3HSCA 3B8AX 1V4TA 3CQXA 2Q0RA 2YJFA 5AQTA 1X3NA 1MWKA 1WOQA 3WXKA 4CZFA 2QWOA 2I7NA 5AQZA 3WEEA 2V7YA 3DAWA 1MWMA 1BU6O 2QWLA 2ZGYA 1DEJA 4DCHA 4FWKA 3F9MA 3RSEB 4B1UB 2P9PA 2P9UA 5AQJA 5AQGA 4CZGA 3SK3A 5EVZA 2P9LB 5KQDA 3FZHA 3LDLA 3M1FA 4JNEA 3U9DA 3ULEB 1HPMA 1LCUA 5AFUH 3ATUA 3A8YA 2NRHA 3GG4A 3CQYA 5AQLA 3LM2A 4A62A 3IUCA 4BRKA 4QS9A 4FWLA 5AQWA 4J8FA 5AQRA 3MK6A 3QICA 3WXIA 4FPBA 3TPQA 4O8KA 4H0VB 4CZHA 4B1XB 3M6GA 4MO5A 3FZMA 4KBOA 1K8KA 4XH1A 2CGLA 1HLUA 4BRCA 5BRHA 4CZIA 3CI5A 2FSJA 4BRGA 3I8BA 3QMLA 1GLEG 4BRNA 4BRIA 3IFRA 1RGIA 2FSKA 5AQIA 5BPLA 3ID8A 3FR0A 4FL9A 2Q0UA 1GLFO 4K41A 3A5NC 3M3ZA 5AQUA 3BUZB 1WUAA 3IMXA 3ZETA 3H6EA 4BR5A 2E8AA 2YJEA 5E26A 5AR0A 2YI1A 4RCHA 4BRHA 5BRDA 3FZLA 2HOEA 4IJAA 4JHDB 1NGBA 1NWKA 1Q18A 1IG8A 3CERA 4BG8A 2A6AA 4BR7A 3UE5A 1HKBA 1NGAA 4ISFA 3AY9A 4Z94A 4GY2B 4BRLA 4B1ZA 4XH4A 2NZTA 3UKUB 1NBWA 3ENHA 1LOTB 4RTFD 4A61A 3VF4A 2GTDA 1HKCA 5AQHA 1YVNA 5FPDA 5KQ8A 3G25A 2V52B 3HTVA 4H0OA 2IIRA 2YCHA 3RSEA 2J4RA 3DXKA 2A42A 2P9IB 4FWMA 3FLCO 4H5NA 1DGKN 2P9LA 3FZFA 3MN7A 3KZBA 3U4LA 4H5WA 4C23A 1NGCA 3DJCA 3UKRB 4B1YB 2E1ZA 2UYTA 3VEOA 3ATVA 4QS7A 1ESVA 2QWPA 3VOVA 1NMDA 2QW9A 3VEYA 2Q2RA 1Z6RA 4JD2B 4LC9B 4FSVA 5E84A 2P9SB 1T6DA 3D2FB 2I7PA 2A40A 3ZX0A 1SAZA 3HM8A 2CGJA 1X3MA 4H0YB 4JAXA 3CIPA 1BDGA 5AQFA 1MA9B 4JN4A 1GLBG 2P9NB 4MLHA 2KHOA 5JLHA 4FWRA 5BPNA 2ZGZA 3JS6A 2GELA 3O80A 4GNIA 3LDPA 4CZEA 3SMPA 4BROA 4CZLA 1YUWA 2HF4A 3VF6A 5AQSA 4DHYA 1JCFA 2HMPA 5BPMA 1HX1A 4BRMA 1NGJA 3WQTA 4BQLA 4CZJA 4BRQA 4B9QA 1NM1A 1T6CA 1QQOA 4CD1A 1KAXA 4BC3A 3JXUA 5EY4A 2VYPA 3CJBA 2EWSA 5BRFA 5FPNA 3EL2A 4FPAA 2IVNA 2FXUA 3CJ1A 5LY3A 1NGDA 4M7XA 2GWJA 1NGEA 3UKUA 4FWOA 3TU5A 2E20A 3OHRA 4ISGA 4O5FA 4PL8A 3VGMA 4Y0WA 3FE1A 1S22A 3BP8A 3HBTA 5ELZA 1C0GA 3P4IA 5KPTA 2D0PA 3DXMB 4BR4A 4QS8A 1GLLO 2P9IA 1TYQA 3CJ7A 3MCPA 4PKGA 1GLDG 5LJVA 1KAYA 3VEXA 3C7NA 4DB3A 3MMVA 5ADXH 3DWLA 4WQ4A 4WQ5C 1X9JA 1E4FT 2E1YA 2ZWHA 3EN9A 2ASOA 3L6QA 2CH5A 1OKJA 3CETA 4JD2A 5AQXA 2FF3B 5JLFA 4M7YA 3BF3A 5FPEA 3AAQA 4BR2A 1HKGA 2P9SA 5AQKA 2A41A 3D2FA 3SLCA 3AARA 4K42A 5AFUA 3A5OC 5AQYA 4I6MB 2QXLA 4MO4A 4B1VA 4FO0A 3VENA 3ENOA 2P9NA 3ZEUA 3EZWA 2YHYA 3CJAA 1ATRA 5EOYA 5BN8A 1BWFO 2F9TA 3GBTA 4AM6A 4F9OA 3VEWA 3VPZA 1U6ZA 3WXJA 3QBXA 3D2EB 3LDOA 1NGHA 2BTFA 2W41A 3GL1A 4IWVA 3LL3A 2V51B 2OANA 2P9UB 3O6WA 2AA4A 4WQ5A 2ZF5O 2HF3A 4FWQA 1J6ZA 3ULEA 1GLCG 1SQKA 2YHXA 3C0BA 4B1WB 1SZ2A 5AZJB 3GOIA 5B8HA 3I33A 1KXPA 4FWPA 4BR0A 3CHWA 2ASPA 3SMSA 4CZMA 4WYBA 4IZ9A 3R6MA 2W40A 3MN5A 2E88A 1IJJA 3DXMA 3H3OB 3VETA 2QWNA 3KHYA 2A3ZA 1GLAG 1XC3A 1MDUB 4BQZA 3LM9A 1XUPO 4PKHA 5JMVA 1ZXOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1T7AA 2X78A 2KPYA 3SPZA 4EZ9A 1WSEA 3AVCA 4U7BA 2VY6A 4E0DA 5KRTA 1QVFM 3KK1A 3ZX3A 2WOMA 1N4NA 4FLWA 2N66A 3G0ZA 4BDYA 2QM1A 3P38A 4I6MA 3VF2A 2MZ0A 1ATSA 1T03A 4CBWA 4BRFA 1S6QA 4JRPA 3SUPA 1NOZA 4MLEA 4AILC 3CCLN 4YOXA 1G15A 2YHBA 5EXWA 3QETA 1Q81O 2Q97A 4J2BA 1OZZA 2IVPA 4O8UA 4FYDA 3HOSA 4DTRA 2VGNA 3EY1A 4OPHA 3O8MA 4OGEA 3MXIA 1YJWN 1GPTA 5CE3A 1ITGA 1ZBSA 1XQSC 3UKRA 3WQUA 1W7AA 4JI8K 2HBMA 3A5LC 4FOEA 4E7JA 2YKMA 4DR1K 3T19A 3CJCA 4BC2A 4E1MA 1J53A 2KBHA 3A5MC 3FFIA 2DTUA 4O44A 4NB4A 4HTUA 1NK4A 3VEZA 5AZIB 3QFPA 1NMNA 3WUHA 3KHWA 3DRPA 4NLBA 1HNIA 4BGAA 3CCUN 3GE1A 4RWTA 1EX4A 1YTAA 3NFAA 1KC8O 3B6PA 3H1QA 3HM9A 1Q8IA 2P9KB 3ZT0A 4YHHK 5AQVA 4LY7A 2GV9A 1KQSM 2RN2A 3Q7CA 1IKXA 2DY4A 1XMQK 3J80O 4FJ9A 1HQUA 1DJTA 2JWLA 3DLEA 3IDHA 4XEIA 3LZIA 1QVGM 5SWMA 2HHVA 3I0SA 1JL2A 1B7DA 1TK5A 4IG3A 1TKZA 2XY8A 3SJHA 3R3LA 2E3GA 3V9WA 4BRDA 4JI3K 1VQLN 2FLOA 1MU2A 2E2NA 3EO3A 5DM6L 1WBBA 1DQ7A 2KTQA 1Y97A 3CCEN 2VWKA 4Z4HA 4BR9A 1VQON 2ZJRL 2GUIA 4M3ZA 1EETA 2JGUA 3IS9A 4CHQA 2EX3A 2ZE2A 3BGRA 2ASMA 1S9GA 3OYFA 1NK9A 1CZAN 3VQPA 1K73O 3B6OA 1JZAA 1HPZA 2E2PA 1IG9A 3TSQA 1ZYVA 3FZKA 1VSMA 2LSNA 1W2BM 4ISEA 5BR9A 2CH6A 1IBKK 1C1CA 1NH5A 3ALYA 3BDPA 4FZXC 3KLHA 3JYTA 3R8EA 2W00A 1CZBA 1TKTA 3L2VA 5I42A 2OTLN 2LN8A 1R59O 1VNBA 3H46O 4H5TA 1I6FA 1HMVA 4DV2K 3VTIA 2MN5A 1A5WA 3W3DA 3OYAA 3THYB 3LAMA 4H0XB 3U3GA 3HSCA 3B8AX 1SN4A 3OS2A 1LAWA 4CZFA 3QO9A 4W5TA 2ZJPL 1JLFA 4BE0A 3CCVN 2QWLA 2ZGYA 4FJ8A 3PX6A 5AQJA 4CZGA 3HJFA 4LFAK 2ITGA 3SYZA 1I39A 2O4GA 3KLIA 1I2UA 1KFDA 1RT5A 1HPMA 2NRHA 3AVBA 3LANA 4CERA 3CQYA 1QE1A 4IO9L 5AQLA 3NGYA 4A62A 4FWLA 1NK8A 2JWKA 2KKZA 1T7PA 3PO4A 3NDKA 1YT3A 3FZMA 3CFOA 2CGLA 4BRCA 3ZSXA 1BGXT 2X74A 1IO2A 5BRHA 3CCJN 3KOXA 4ID1A 2C1IA 5GIOA 2FSJA 3OYCA 4JLHA 4BRGA 4B3SK 1GLEG 4R79A 4CGIA 5BR8K 3AA2A 3FR0A 3KK7A 2HSTA 1NRBA 4JKAA 3A5NC 4MQ3A 2O8BB 1B9DA 3BUZB 3IMXA 3BY5A 4J2DA 4PA1A 2XO7A 5E26A 4F2SA 4RCHA 4BRHA 3VQ8A 3IKMA 4FJJA 2KQ2A 2NRWA 1NWKA 3SPYA 3VTHA 1LQIA 3T1YK 4Z0UA 1VSDA 1ICAA 4WCEL 2KLAA 3NGZA 4JKCA 1RBSA 3TTFA 1TI5A 2LI7A 1HRHA 1LOTB 3ENHA 3ID6A 4RTFD 4C8NA 4KB1A 1VAZA 4LFCK 5C2FA 3AGKA 1C0MA 1I94K 1RBVA 5FPDA 2B6AA 2V52B 4K8ZA 4Y1DA 2A42A 1C1BA 2P9IB 3T1AA 2OPQA 4DSKA 4FWMA 3CM6A 3SUOA 4H5NA 2PY5A 3SCXA 3U4LA 3DJCA 4B1YB 4UAFE 3CMEN 4QS7A 3C6TA 1BQMA 2D0AA 1I2VA 1Z6RA 4RW8A 4KHNA 4FSVA 3E7UX 3P83D 4AEIA 2I7PA 1T8EA 4QCLA 3QESA 1NJZA 1X3MA 2RE2A 1BDGA 5AQFA 4OLAA 5M1FA 2YEOA 4CF8A 3F73A 3N4PA 1EP4A 2KHOA 3ITHA 2LKBA 3OY9A 3ZSWA 4LH5A 2OZSA 1VQKN 1HNVA 3SMPA 4CJFA 1RTJA 4O4GA 1CXQA 4BEBA 3VMFB 5AQSA 1OMYA 1NGJA 4CZJA 3IG1A 2YILA 3MEEA 4CHNA 1VQMN 4BC3A 1S1TA 1VQ7N 4IEIA 1JXBA 3D45A 5FDLA 4H8KA 4OX9K 2EWSA 3QIOA 5BRFA 5FPNA 3V4IA 1NU0A 4CJ5A 2A7TA 1TK8A 2E0HA 4FWOA 1GOCA 1NJIO 2HHSA 2RKIA 2D5RA 3BP8A 4DKWA 1JLBA 3CQ8A 5ELZA 1RDBA 5C15A 4NCBA 4I9QA 2D0PA 4DV7K 2NNWA 1TYQA 4PKGA 1GLDG 2E6LA 4K0KK 3MMVA 5ADXH 1S1VA 3T3FA 1VSEA 1KVBA 2BRZA 4CECA 3EN9A 4B3TK 4CFDA 3TAPA 3L6QA 1NE5A 4CE9A 4E7LA 2HB5A 3DOLA 2Q3SA 1FKOA 3CFRA 3THWA 1KVCA 5JLFA 1NK5A 3AAQA 4BR2A 4CJEA 1HKGA 2P9SA 2A41A 3DLKA 3SLCA 4FZYA 3AVHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1T7A A;  2X78 A;  2KPY A;  3SPZ A;  4EZ9 A;  1WSE A;  3AVC A;  4U7B A;  2VY6 A;  4E0D A;  5KRT A;  1QVF M;  3KK1 A;  3ZX3 A;  2WOM A;  1N4N A;  4FLW A;  2N66 A;  3G0Z A;  4BDY A;  2QM1 A;  3P38 A;  4I6M A;  3VF2 A;  2MZ0 A;  1ATS A;  1T03 A;  4CBW A;  4BRF A;  1S6Q A;  4JRP A;  3SUP A;  1NOZ A;  4MLE A;  4AIL C;  3CCL N;  4YOX A;  1G15 A;  2YHB A;  5EXW A;  3QET A;  1Q81 O;  2Q97 A;  4J2B A;  1OZZ A;  2IVP A;  4O8U A;  4FYD A;  3HOS A;  4DTR A;  2VGN A;  3EY1 A;  4OPH A;  3O8M A;  4OGE A;  3MXI A;  1YJW N;  1GPT A;  5CE3 A;  1ITG A;  1ZBS A;  1XQS C;  3UKR A;  3WQU A;  1W7A A;  4JI8 K;  2HBM A;  3A5L C;  4FOE A;  4E7J A;  2YKM A;  4DR1 K;  3T19 A;  3CJC A;  4BC2 A;  4E1M A;  1J53 A;  2KBH A;  3A5M C;  3FFI A;  2DTU A;  4O44 A;  4NB4 A;  4HTU A;  1NK4 A;  3VEZ A;  5AZI B;  3QFP A;  1NMN A;  3WUH A;  3KHW A;  3DRP A;  4NLB A;  1HNI A;  4BGA A;  3CCU N;  3GE1 A;  4RWT A;  1EX4 A;  1YTA A;  3NFA A;  1KC8 O;  3B6P A;  3H1Q A;  3HM9 A;  1Q8I A;  2P9K B;  3ZT0 A;  4YHH K;  5AQV A;  4LY7 A;  2GV9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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