3JXUA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 1a (hsp70-1) atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-09-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3jxuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3jxuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3jxuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3jxuA04
5CE3A 4CI6A 4FWSA 3O08A 3UKRA 3A8YA 2ZWHA 4PKGA 3TU5A 3JXUA 1HPMA 1YAGA 2P9UB 3FZHA 3FR0A 4H0VB 3SMSA 2P9LA 1NGCA 4PL7A 1NMDA 3FZMA 3VEVA 2V7YA 4H0PA 5JLFA 3AARA 4FOEA 5AFUH 4BRKA 4BRMA 4F9OA 3W3DA 2GTDA 4M7YA 3LM2A 1KXPA 3IFRA 5LJVA 3A5LC 1ESVA 5ELZA 4BC4A 1TUUA 3HZ6A 3EKUA 3UB5A 2P9IB 2EWSA 3VERA 2P9PA 4H03B 2A3ZA 5AQSA 3GDQA 3CJCA 5JMVA 3L4IA 1ATSA 1QQOA 1WUAA 5FPDA 3MK6A 4WQ4A 1NWKA 3BF3A 4BRLA 1R59O 3FGUA 4JAXA 3CJBA 3LM9A 4PKHA 1X9JA 1QHAA 1RGIA 1NGEA 3DXKB 3CHWA 4DCHA 3D7EO 3CJAA 4WYBA 1T44A 3DJCA 2VWBA 5EOYA 3VGLA 1QQNA 1T6DA 1MWMA 2I7PA 3DXMA 5BPLA 3VEOA 4XH4A 2KHOA 4CZEA 4CZHA 3MN5A 2ASMA 4H5NA 1BDGA 4I6MA 2A6AA 3CI5A 2UYTA 2HF4A 4JD2A 1GLEG 3SLCA 1ZC6A 3FE1A 3G25A 4BGBA 4XH5A 1HLUA 3ZETB 5AQJA 4M7XA 3VOVA 2BUPA 2A5XA 2E1YA 1BOTO 2OANA 1K8KB 3M6GA 2FF3B 3GE1A 1YXQA 3H45C 4FPBA 5FPNA 2CH6A 3AY9A 5AQXA 4O5FA 1JCFA 4MLEA 2A41A 4NO7A 2AA4A 2E20A 1SZ2A 3UKRB 4CBWA 1D4XA 2ZGZA 3BF1A 3MN7A 3VPZA 4FWPA 2Q0UA 2P9LB 1GLBG 4B9QA 5F2RA 3BUZB 3SK3A 4BQZA 5AQWA 2ITMA 3FFKB 2D0PA 2P9SA 4CJ7A 1ZXOA 3O5BA 3VENA 3ZETA 4IWVA 4YDUA 4DHYA 3VGKA 3S41A 1S22A 4CZIA 3FZKA 4CBUA 2HOEA 4WQ4C 3JS6A 3U8XA 4FPAA 3U9ZA 3ATUA 4BG8A 3QMLA 2P9PB 5BR9A 1NGIA 1IJJA 3EKSA 5EXWA 4HTLA 3EO3A 3ZX3A 4PKIA 1ATRA 2BTFA 4B1XB 4CBXA 4A2BA 3L6QA 5AQUA 3ENOA 2A42A 1V4TA 1MWKA 2QWMA 1BG3A 2FSNA 2E2PA 3VGMA 3D2EA 1CZAN 1XUPO 1ZBSA 2P9NA 2DPNA 2AP1A 4WQ5A 4ISEA 5F0XA 4CZMA 1YVNA 2GWKA 3M3ZA 2PAVA 2YCHA 2W41A 4FOIA 1Z6RA 3CJ7A 3H3NO 2FF6A 2GELA 4BGAA 2IVNA 1BA0A 2GWJA 1HKBA 3IDHA 3ID8A 3DXMB 4K25A 2QWQA 3SJHA 3LDOA 5AQGA 5KQDA 3HM8A 4I6MB 4ISFA 3CJ9A 4JD2B 5ADXH 4H5TA 4K43A 4HWIA 3BP8A 2QWNA 1HKGA 2QWOA 1H1VA 5KPTA 4BRHA 3CIPA 4Y0WA 1HJOA 4BR4A 3WQTA 4JHDA 3U4LA 1DEJA 4KBOA 3H6EA 3LDNA 2ASPA 3ULEA 1ATNA 5BPMA 3O1BA 1MA9B 4CD3A 1NGBA 2E88A 3QBXA 4BR2A 3C7NA 1KAYA 2ZF5O 3L0QA 2IIRA 4QS8A 5B8HA 3H3OB 3EL2A 4RWTA 4BRNA 4DB3A 3VF4A 3F9MA 3KZBA 3RSEA 4BRIA 3GL1A 2CGJA 2YJFA 1SQKA 1TYQA 5JICA 4O8KA 5FPMA 2GEMA 5LJWA 1NGHA 4J8FA 2CGKA 3FZFA 2YI1A 4FWNA 4IJAA 5AQFA 4M63C 4EHTA 2VYPA 4QS9A 3CQYA 1Q18A 1BU6O 2P9SB 4FWOA 1JCEA 4K41A 3MN6A 4K42A 1QZ5A 4H0OA 3CETA 3QICA 4BRFA 3ATVA 4H0TB 1MDUB 3B8AX 1QQMA 5F1XA 4C23A 2QWPA 3ZEUA 4CZFA 4EHUA 1NGJA 3TPQA 4FL9A 3D2FB 4A2AA 3WQUA 4BRGA 4ISGA 1X3NA 4BVOA 4RCHA 2FSKA 4AM6A 4B1UB 3R9PA 2NRHA 4CZGA 3HTVA 1Y64A 5AQVA 2Q97A 2ASOA 3A5MC 2YHYA 1T6CA 4FO0A 3DWLA 1NGFA 1KAZA 3U9DA 1E4GT 3MDQA 3IUCA 4QS7A 3I8BA 1BO5O 2E2OA 5KQ8A 3CJ1A 4XEIA 1HX1A 1DGKN 4H5VA 2YJEA 5KPRA 1HKCA 4CD1A 4H0XB 3D2EB 4AM7A 2P9NB 2I7NA 1GLFO 3J8AA 1V4SA 4MO5A 3UKUA 5AZJA 3D2FA 5JLHA 1G99A 4B1VA 4GNIA 4BRDA 5AR0A 2P9KA 5AQHA 3VEZA 5E26A 4BR5A 3FZLA 3O8MA 4FWKA 4JNEA 4A62A 4BR0A 1JCGA 3H1QA 4BC3A 4IXCA 5AFUA 3FLCO 4MLHA 1TUYA 3HBTA 1Z05A 2VCPA 4A61A 3AAQA 2YHWA 1X3MA 5BRFA 5AQMA 3MMVA 4JHDB 5EY4A 1LOTB 1NBWA 2QXLA 2CGLA 3W0LA 4BG9A 1NM1A 3O4WA 3ULEB 3P4IA 5E84A 3VESA 3LDPA 3A5OC 1C0GA 2GUPA 4EAHD 1SAZA 2HF3A 3UE5A 3VEXA 1IG8A 3IMXA 3C7NB 3VEWA 3HSCA 3WEEB 5AQOA 2NLXA 3QFUA 5LY3A 3O6WA 1QZ6A 3RSEB 2F9WA 1NGGA 3CQXA 5FPEA 3OHRA 1TYQB 2QM1A 1GLJO 4H5WA 3GBTA 4BVPA 3GOIA 5BN8A 1BA1A 1HUXA 3GG4A 2H3GX 1NGAA 3VF2A 1DKGD 2D4WA 4GY2B 3WXJA 1RDWX 4FSVA 5EX5A 1GLLO 1U2VA 2FSJA 1GLAG 5AZIA 3EN9A 4EIAA 4B1WB 3ZEUB 1P8ZA 1GLCG 1NLVA 4CZKA 5AQPA 2Q1NA 2E8AA 4FWRA 4B1ZA 2QW9A 3O80A 5TKYA 3QB0A 4JN4A 5I9EB 2IVOA 4MO4A 4YDUC 1J6ZA 2P9UA 1YUWA 5AQLA 3WEEA 5AQTA 1BWFO 4Z94A 3H1VX 3VEYA 4BRQA 2Q2RA 4BR7A 2ZGYA 4FWLA 2YHXA 3ZX0A 5AQZA 2E2NA 3LL3A 3CERA 2W40A 2Q31A 3BEXA 3EZWA 4NB4A 3KHYA 3MN9A 4H5RA 4EFHA 5BREA 4BROA 1C0FA 3DAWA 2Q0RA 2IVPA 2V52B 2WUSA 2E2QA 4BR9A 3LDQA 3QFPA 3C0BA 5AQYA 1RFQA 4L3QA 3SMPA 3WT0A 1EQYA 1NGDA 5AZJB 3UKUB 2Q36A 2P9IA 4H0YB 3WXIA 4BREA 5BN9A 2P9KB 5AQRA 4IJNA 4DQ8A 3AAPA 4BQLA 4BRCA 1KAXA 3VF6A 2V7ZA 2QWLA 4IZ9A 1WOQA 4WQ5C 1U6ZA 2D0OA 3QBWA 3KVGA 2FXUA 2PBDA 2CH5A 1OKJA 4BC2A 5BRDA 1BUPA 5AQKA 3DXKA 3O1WA 4IO8A 2D1KA 3MCPA 4CZLA 4RTFD 3WUHA 2QWRA 3LDLA 4BC5A 3R8EA 3I33A 5AQQA 2A40A 1XC3A 3QDKA 3R6MA 3WXLA 4BRPA 1GLDG 2HMPA 4E1JA 1S3XA 4FWQA 3HI0A 3ENHA 3VETA 2F9TA 2NZTA 5AQIA 5EVZA 4FWMA 3A0IX 1XQSC 3M1FA 5BPNA 1E4FT 5AQNA 3ZX2A 1U2VB 1LCUA 2E1ZA 2V51B 1K8KA 3A5NC 5KPZA 4BRAA 5AZIB 4CZJA 3H46O 2FLOA 4XH1A 4B1YB 5BRHA 2J4RA 4LC9B 4PL8A 5ADXA 3WXKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2JDQD 5CE3A 5M1OA 3O08A 1LAVA 3A8YA 2ZWHA 4PKGA 4HHFA 3JXUA 3HJFA 1VQ8N 2G2KA 4X65K 1CXQA 2P5OA 1GOCA 3SMSA 2E6MA 1M90O 3VQ9A 2RPIA 3LAMA 3VEVA 3WNFA 4CHZA 4CEZA 2V7YA 1GPSA 1N32K 2OPPA 4I2PA 4BRMA 2GTDA 3NGYA 4M7YA 3LM2A 1KXPA 3IFRA 5LJVA 3A5LC 4IDHA 2LJ7A 2BGGA 3CD6N 1LWFA 4E7IA 4EP5A 3OYEA 4Z4FA 1TUUA 2ATQA 2EWSA 1T7EA 1CLQA 3GDQA 5JMVA 1ATSA 1KFSA 4B9SA 4KRFA 3SV4A 3LP3A 2HHVA 4BRLA 1LQQA 3TSUA 3UIQA 3I0RA 3VN5A 4E1MA 1RGIA 4IG3A 3CHWA 3U6FA 5HP1A 5EOYA 3VGLA 2G8KA 4CJ5A 5CR4A 1MWMA 4BE1A 4U7BA 4CZHA 2C1GA 1T7BA 3AVJA 4I6MA 4LSLA 2HF4A 4FK0A 3AA4A 3HK2A 5HBMA 1OVQA 4BGBA 3L56A 1HLUA 1HJRA 1BIUA 4BWJA 5AQJA 4M7XA 4CHQA 4FCYA 3LDSA 3VOVA 2X6NA 4CJSA 3M6GA 4N56A 4E7JA 4LF5K 3NVMA 3MXJA 4FVMA 1YXQA 3AO1A 3H45C 3VA0A 3QINA 5FPNA 4MLEA 2AA4A 3ZSXA 3UKRB 4CBWA 2WTUA 3MXIA 4UAEF 3PUFA 1D4XA 1ASUA 3N4QA 2MZ0A 5KGWA 3BF1A 2D5RA 3MN7A 4CJLA 4YY3K 4W5QA 4ILJA 1SKWA 3PX6A 4CJUA 3SK3A 4CF9A 2ITMA 4DLEA 3I55N 2MBKA 3HOTA 4YOUA 4DLGA 3VQPA 4NLCA 1C0MA 2XRIA 5D3GA 1VSHA 3KJVA 4DTJA 2VWJA 4K0KK 4O4GA 3VMFB 4A5AA 4AHTA 4NCBA 1K9MO 3ATUA 3OYMA 3QMLA 1RDUA 4AHRA 1LQIA 3ZX3A 3EO3A 1I2UA 2BTFA 1YTAA 3SBTA 4B9VA 1XNQK 2X78A 3KLGA 2SN3A 1MWKA 1BG3A 1W9HA 3BGRA 3QERA 3D2EA 1CZAN 3C6AA 4LH4A 1SL1A 2AP1A 1N36K 3DYAA 5F0XA 4CZMA 4KH6A 1T0ZA 4DS5A 4DTPA 2YCHA 2KQ2A 2KLAA 1Z6RA 4PQUA 4FJ9A 3H3NO 2LY6A 3G4SN 3VQDA 1BA0A 1HKBA 3ID8A 1VQPN 2KSKA 4K25A 3TAGA 2WBNA 4MQ3A 1ILYA 2A1SA 3AVMA 3CCLN 4AQYK 3EEQA 4HWIA 3NDKA 3BP8A 1HKGA 1H1VA 3CIPA 1HJOA 4Z4CA 3VQ4A 1U47A 4DQIA 3JAMO 4DSEA 4KB1A 4IOCL 3H6EA 1VQ5N 4KTZA 4CEQA 1MA9B 2VQFK 1FW6A 3QBXA 3OYBA 4AF1A 1ZBFA 2ZF5O 2IIRA 1I6GA 4CK3A 1C1CA 1NNEA 1SQKA 3HOSA 4X64K 5FPMA 1W97L 1RT1A 1DJTA 2CGKA 4JEPA 2YI1A 4FWNA 5CY4A 2VG5A 3TI0A 2VYPA 3CPEA 4QS9A 3I0SA 2P9SB 1DTQA 1BK8A 1OZZA 1QZ5A 3VQ7A 3KHWA 1QSSA 3QICA 4BRFA 3ATVA 4E1NA 1C0TA 3LP0A 4H0TB 1MDUB 2LSNA 1KD1O 1QQMA 5F1XA 4CZFA 3ZEUA 4O55A 1ICAA 4AHSA 1NGJA 1RBRA 5DMRA 4DTSA 3D2FB 1VNBA 4AAZA 1KRPA 4ELUA 1EXQA 3WQUA 3CYGA 4FJ8A 2KKZA 1KV0A 1LV5A 3V9WA 3AA2A 4JS4A 2YNFA 3AVBA 2Q97A 1SV5A 2G8WA 1VSJA 3C94A 5IWAK 4FO0A 4JI3K 1E4GT 3IUCA 4CEFA 3SCXA 4CFBA 4BWMA 1RT3A 4CK2A 5KQ8A 4Y1CA 1YITN 3U3GA 1HX1A 5KPRA 5GIPA 4DUYK 2UU9K 4CD1A 3OYIA 4AM7A 2P9NB 3L2VA 4KHPK 4M3XA 2E3FA 3K58A 1V4SA 5AZJA 1CXUA 2Z1IA 3MAQA 5JLHA 5MLCQ 2OPQA 4B8CA 1Z26A 4F8RA 3VA3A 5AQHA 3JSMA 4BR5A 4M3RA 3CFPA 2Z1JA 3O8MA 4JNEA 4A62A 4IXCA 3WNGA 3QEXA 3K5MA 4MLHA 4CJVA 2HBKA 3M8RA 2XY7A 4OPKA 2NNWA 4A61A 3NVKA 1BQMA 1S1VA 2NRXA 4JYAK 4DF8A 1IO2A 2FBXA 3THYB 4JHDB 1NKEA 2XY8A 1O13A 3LALA 1U4BA 1C0GA 2GUPA 2HF3A 4CFDA 1BCMA 1IG8A 1X9WA 1YI2N 3VEWA 3WEEB 2R7YA 3O3GA 4EZ6A 2N69A 5LY3A 3O6WA 3CQXA 1TYQB 3QIPA 1WSGA 3I56N 2XO7A 5BN8A 3K0SA 4R79A 4JK7A 1HUXA 3QO9A 4IDKA 3WNHA 3SUOA 2BRZA 4FLVA 4GY2B 4OPAA 2WC9A 3OJUA 2FSJA 2HHSA 4JKFA 3S5TA 4DV7K 4FZZA 2HHQA 1GLAG 3EN9A 4K8XA 1K8BA 4B1WB 3KWGA 2E3GA 1NLVA 1IBMK 5AQPA 3E1YA 4FJXA 4CIEA 1EETA 4B1ZA 2QW9A 3O80A 5TKYA 4W5TA 3K57A 1YHQN 1CN2A 1W0HA 1SKRA 5DK5A 4YDUC 5AQLA 4Z94A 4WF9L 2OYQA 1J5OA 2I5JA 3MWPA 2D56A 1XNRK 5JENA 4FWLA 1DT9A 4E7KA 2NRVA 4JKDA 4E19A 5AQZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2JDQ D;  5CE3 A;  5M1O A;  3O08 A;  1LAV A;  3A8Y A;  2ZWH A;  4PKG A;  4HHF A;  3JXU A;  3HJF A;  1VQ8 N;  2G2K A;  4X65 K;  1CXQ A;  2P5O A;  1GOC A;  3SMS A;  2E6M A;  1M90 O;  3VQ9 A;  2RPI A;  3LAM A;  3VEV A;  3WNF A;  4CHZ A;  4CEZ A;  2V7Y A;  1GPS A;  1N32 K;  2OPP A;  4I2P A;  4BRM A;  2GTD A;  3NGY A;  4M7Y A;  3LM2 A;  1KXP A;  3IFR A;  5LJV A;  3A5L C;  4IDH A;  2LJ7 A;  2BGG A;  3CD6 N;  1LWF A;  4E7I A;  4EP5 A;  3OYE A;  4Z4F A;  1TUU A;  2ATQ A;  2EWS A;  1T7E A;  1CLQ A;  3GDQ A;  5JMV A;  1ATS A;  1KFS A;  4B9S A;  4KRF A;  3SV4 A;  3LP3 A;  2HHV A;  4BRL A;  1LQQ A;  3TSU A;  3UIQ A;  3I0R A;  3VN5 A;  4E1M A;  1RGI A;  4IG3 A;  3CHW A;  3U6F A;  5HP1 A;  5EOY A;  3VGL A;  2G8K A;  4CJ5 A;  5CR4 A;  1MWM A;  4BE1 A;  4U7B A;  4CZH A;  2C1G A;  1T7B A;  3AVJ A;  4I6M A;  4LSL A;  2HF4 A;  4FK0 A;  3AA4 A;  3HK2 A;  5HBM A;  1OVQ A;  4BGB A;  3L56 A;  1HLU A;  1HJR A;  1BIU A;  4BWJ A;  5AQJ A;  4M7X A;  4CHQ A;  4FCY A;  3LDS A;  3VOV A;  2X6N A;  4CJS A;  3M6G A;  4N56 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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