3KVGA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 (cgd2_20) from cryptosporidium parvum in complex with amppnp
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the N-terminal domain of Hsp70 (cgd2_20) from Cryptosporidium parvum in complex with AMPPNP
rcsb
molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
molecule tags Chaperone
source organism Cryptosporidium parvum
total genus 124
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3kvgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3kvgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3kvgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3kvgA04
5KPTA 5AQOA 4CJ7A 4BR7A 3VEWA 2NLXA 4JD2B 3R9PA 3ZX3A 2GEMA 4BRMA 5LY3A 5AQHA 4CZKA 5JLFA 1GLLO 3O4WA 5AQVA 3SJHA 4O5FA 4BRCA 1HKBA 1SAZA 4MO4A 3S41A 5F0XA 5AQMA 2QWRA 2ASMA 1SQKA 3M1FA 3B8AX 5AQYA 2P9LA 3FGUA 2GWKA 3MN9A 2Q31A 5FPEA 4BVPA 3HZ6A 4PKGA 2P9PA 3QDKA 4EHTA 3GDQA 1ATNA 4XH5A 4BROA 4ISFA 5AZJA 1KAZA 2E8AA 3WQTA 2HOEA 3BF3A 3VERA 4JN4A 3H3NO 1JCGA 5KQDA 3CI5A 4QS7A 4FWQA 1Z6RA 3VF2A 1JCEA 4BC2A 2BTFA 4FO0A 3GE1A 3IMXA 3H1QA 3TU5A 1V4SA 1ESVA 3CERA 5BR9A 3O80A 2IVNA 3HTVA 3VEXA 2PBDA 3F9MA 2NZTA 2E2NA 1HPMA 2QXLA 1TYQB 5EY4A 2P9SB 5E84A 2KHOA 4E1JA 2E2PA 2PAVA 5BPMA 1HKGA 5AQKA 1LCUA 3VEYA 2GWJA 1KXPA 2GELA 2H3GX 5ELZA 1QZ5A 4BRGA 3A8YA 1BU6O 3VGKA 4K42A 4AM6A 3SLCA 3MN6A 1BA1A 4BRNA 2HMPA 2A5XA 3FZFA 2UYTA 1U6ZA 1SZ2A 2J4RA 3A5OC 3W0LA 3D7EO 5KPZA 2P9LB 3EZWA 4JHDA 4JD2A 3SK3A 2CH5A 4BR2A 4FPAA 4K41A 2E88A 3AAQA 4F9OA 3H45C 2P9PB 2ZGZA 2P9NA 1BOTO 2FXUA 4YDUC 5AZJB 3CETA 1H1VA 5TKYA 4BRFA 5F2RA 4HWIA 3QFUA 2HF4A 1WOQA 2OANA 1NWKA 4IZ9A 1LOTB 2VYPA 3ENHA 1NGAA 2QW9A 4RCHA 4WQ4A 2FSNA 3SMSA 3UKRA 1HLUA 5BRFA 3CJAA 1NM1A 2FSKA 3CQXA 1DGKN 3VESA 3R6MA 3LDOA 3CJCA 1GLJO 3O1BA 2QWQA 1S22A 4BG8A 3DAWA 4GNIA 4PKHA 1HJOA 5AFUA 4MLHA 4BC4A 3VEZA 1J6ZA 3SMPA 2CH6A 2VWBA 2YCHA 5JMVA 2DPNA 3CQYA 3HSCA 3BUZB 2V51B 3MN7A 4A62A 4BQZA 2ZF5O 4IO8A 1NGCA 4ISEA 3EKSA 5AQGA 2D0OA 1R59O 4JHDB 5AQTA 2E1ZA 5F1XA 5ADXA 2P9KA 5AQJA 2IVPA 2ZGYA 4CZMA 3H3OB 1MWKA 1X9JA 2P9NB 2A3ZA 3BF1A 2A6AA 4RTFD 4FWMA 4B1UB 3HI0A 3HM8A 5KPRA 2I7NA 2ASOA 3H46O 2E1YA 4BR0A 4BR9A 2V7YA 4CZEA 4I6MA 1GLFO 2BUPA 2YJEA 1BG3A 4YDUA 3UKRB 1HX1A 3JS6A 2YJFA 4FOIA 4WQ4C 3DWLA 5B8HA 2QWNA 1V4TA 3EN9A 2IVOA 4EAHD 1NGGA 4H5VA 3IDHA 5BPNA 3O08A 1QQMA 4BRPA 3H6EA 1G99A 2Q97A 2FF6A 2A41A 1P8ZA 1QZ6A 3LM9A 3RSEA 2W40A 1E4GT 5EXWA 1IJJA 3MMVA 2Q0UA 1YAGA 1YXQA 2FSJA 3D2FB 3L6QA 5I9EB 1NBWA 4BC5A 3QFPA 2A40A 1NGFA 5EOYA 2V52B 5KQ8A 4CZHA 3EL2A 3I33A 1NGJA 2Q1NA 4LC9B 1U2VA 1MDUB 4BVOA 2F9WA 3ENOA 2ITMA 2CGLA 2YHWA 3FZMA 1QHAA 3VF6A 1T6DA 2P9KB 1OKJA 3A5NC 3VPZA 3BP8A 4CI6A 3MN5A 3O8MA 3VEVA 3A0IX 3LDQA 3A5MC 4BREA 2ZWHA 4AM7A 4H5WA 4H5NA 3ID8A 2P9IB 4I6MB 4NB4A 4CD1A 3O5BA 4BRKA 2FLOA 5LJWA 1BWFO 5AQLA 3C0BA 1DKGD 4CZFA 5BRHA 4BG9A 3FR0A 3QICA 3CHWA 2NRHA 4K25A 3ZX2A 3WUHA 4BQLA 5JLHA 3AAPA 4FWOA 4FWRA 4WYBA 4EFHA 1TUYA 5JICA 3RSEB 2ASPA 4HTLA 4CZLA 4XH4A 4IXCA 3WXIA 1HUXA 1C0GA 1HKCA 3J8AA 3FZHA 5AFUH 2QWPA 2YI1A 5AQQA 2D0PA 5AZIB 1IG8A 3IFRA 3UKUA 3WEEB 1U2VB 1KAYA 1X3MA 4M7YA 4IJNA 4MLEA 3D2FA 1E4FT 1T6CA 3ATVA 2Q36A 3G25A 2IIRA 3TPQA 3FZLA 5EVZA 4M7XA 1D4XA 3ATUA 1QQOA 3LDPA 3FZKA 5AQPA 3O1WA 3R8EA 4BRIA 4A61A 4M63C 1ZBSA 3QBXA 3L0QA 4BRDA 1BUPA 5ADXH 4H0PA 3EO3A 4QS8A 3U4LA 4KBOA 4PL7A 5AQXA 3AY9A 4FL9A 1DEJA 4WQ5A 3M6GA 4H5TA 5EX5A 3P4IA 4BGBA 4L3QA 3VGLA 2QM1A 4CZJA 3M3ZA 1ZC6A 3QB0A 3FLCO 3H1VX 3ULEB 1RFQA 3DXKA 4J8FA 3WT0A 1GLAG 2AA4A 3OHRA 1CZAN 4H03B 1NMDA 4B1ZA 3O6WA 5BREA 5AQNA 3VF4A 1BDGA 1XQSC 2V7ZA 3VEOA 1EQYA 3GOIA 3U9DA 1X3NA 2P9IA 3KZBA 4B1VA 4QS9A 4RWTA 4FWSA 3VETA 3DXMA 4DHYA 4FOEA 4IJAA 4A2BA 3CJBA 1GLEG 3WXLA 1K8KA 4JAXA 3D2EA 2HF3A 1XC3A 2CGJA 3CIPA 2E2OA 3UKUB 1QQNA 2D4WA 3GBTA 5BPLA 1BA0A 4MO5A 1MWMA 5AQSA 4B1WB 1NGBA 2D1KA 3W3DA 4CZGA 1JCFA 4FSVA 3U8XA 5AZIA 3EKUA 3QBWA 3C7NB 2AP1A 3LM2A 4O8KA 4BR5A 3VGMA 1ATRA 3WEEA 4GY2B 3GL1A 4H0OA 4DQ8A 2YHYA 3CJ1A 5FPMA 3MK6A 2QWOA 4FWLA 4IWVA 3U9ZA 1TUUA 4WQ5C 2Q0RA 2E2QA 4XEIA 4C23A 3QMLA 5LJVA 3DXKB 4BRLA 2P9UA 3ZEUB 3LDLA 5AQFA 5BRDA 2F9TA 1RGIA 4H0XB 2E20A 4FWPA 3CJ7A 4BGAA 5BN8A 4B1XB 1XUPO 4CD3A 4H5RA 3ZX0A 2CGKA 3BEXA 3VENA 3DXMB 5AQUA 4FWNA 4B9QA 3ULEA 4CBWA 1NGEA 5AR0A 2A42A 5CE3A 1K8KB 2I7PA 3D2EB 1C0FA 3FE1A 4FPBA 2VCPA 5AQWA 4NO7A 3ZETA 3LDNA 4DCHA 3IUCA 1RDWX 3CJ9A 1Y64A 3MDQA 2WUSA 3MCPA 3AARA 3VOVA 4H0YB 4PL8A 3FFKB 3I8BA 4BRAA 4BR4A 4BRQA 3WQUA 4XH1A 3HBTA 4A2AA 1KAXA 2QWMA 3JXUA 3DJCA 3UB5A 2GTDA 5AQIA 1Z05A 4EHUA 5FPNA 1MA9B 2W41A 1GLBG 4PKIA 3L4IA 1T44A 4JNEA 4CZIA 4Z94A 3KHYA 1Q18A 2P9UB 4BRHA 1YVNA 1ZXOA 4EIAA 1ATSA 2EWSA 3C7NA 3LL3A 4BC3A 5BN9A 1NLVA 5E26A 3WXJA 3A5LC 4H0VB 4K43A 4ISGA 3KVGA 1NGIA 4H0TB 2YHXA 1NGHA 1S3XA 3GG4A 2FF3B 4CBUA 4Y0WA 1YUWA 1GLCG 3UE5A 1NGDA 1BO5O 5FPDA 3ZEUA 2GUPA 4B1YB 4DB3A 5AQRA 5AQZA 2QWLA 1GLDG 1TYQA 1WUAA 2P9SA 4FWKA 2Q2RA 3WXKA 4CBXA 3ZETB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C65A 3HK2A 3VEWA 2NLXA 4JD2B 3ZX3A 4W5RA 1PX9A 4CK1A 5AQVA 2X78A 2RPIA 3RMCA 4O5FA 2G8WA 1UOCA 3V9UA 3S41A 4MO4A 1IKWA 3SQ2A 4E1MA 2QWRA 1NK7A 2ASMA 3M1FA 4C8MA 3TTCA 2IC3A 3FGUA 3NAEA 3MN9A 2Q31A 2P5OA 3CG7A 4JI8K 3ZSYA 2P9PA 3MAQA 2N66A 1ATNA 4XH5A 4ISFA 4FVUA 5SWMA 4CESA 3SUOA 3VA3A 4BY9C 4IFEA 3THVA 1SL0A 3DRPA 5KQDA 4GKKK 4B3OA 1UWBA 1VQPN 2FC0A 5FLXO 4FWQA 4FJHA 2HHHK 1B9DA 1TV6A 4BC2A 2HMIA 4V1DC 2RE2A 4IG3A 1V4SA 3TU5A 2IVNA 3HTVA 4JI4K 3CW4A 1BQNA 1NKBA 1HPMA 5C25A 3DLEA 2QXLA 4LD0A 3KWIA 1KC8O 1BIUA 2PAVA 3AVJA 3M5RA 3L2VA 3HSTB 1LCUA 3VEYA 2YHBA 1KXPA 4KHQA 3A8YA 3MEGA 4C1NI 3LZIA 1WSIA 3ASMA 1LQIA 4YY3K 1REVA 4Z4CA 3EZWA 4JHDA 3K9KA 2W42A 4BECA 3CYGA 1X1PA 2UUAK 3AO5A 1N32K 2E88A 1M90O 1TI5A 3EZ5A 2P9NA 1Q9YA 1XMQK 4LF8K 3S5TA 1JKZA 4KI6A 4OGEA 2XY6A 3QERA 3ZSVA 1VSDA 1N6QA 4N5SA 1NWKA 3LAKA 4IZ9A 2W00A 1LOTB 1DTQA 4RCHA 4DV1K 1AHOA 1J9AA 4OPHA 4C8KA 4DQQA 2LN8A 4OPKA 2ZM6K 1NM1A 2ATQA 4DTJA 2WC9A 4DQSA 3NBPA 4KB0A 5JS2A 4E7JA 3M8RA 4B9VA 2VQFK 3KOYA 5HP1A 1NRBA 3R6MA 3LDOA 2WBNA 2LSNA 1GLJO 4CGDA 2QWQA 1BCGA 1HJOA 4JS5A 1Y97A 3C6UA 5DM6L 3SQ0A 1OZZA 2VWBA 3E7RL 1EWQA 1GPSA 1FK9A 3MN7A 2YIOA 3OJUA 3IRXA 2WFBA 3CCMN 4YFUA 3CCUN 1XNRK 2E6MA 1U04A 2D5RA 2E1ZA 4E7IA 5KRTA 5AQJA 5J1EA 2KJAA 1MWKA 1X9JA 2A3ZA 3BF1A 2A6AA 5CZ2A 2ZJPL 4DV4K 4FWMA 3MX5A 1JLFA 5CYMA 4DFJA 4BR0A 3BZKA 4FW2A 4EZ9A 2V7YA 1TVRA 4FOIA 2KKZA 1A5VA 3KKRA 1BI4A 5B8HA 2QWNA 1V4TA 5JVHL 4H5VA 3L8BA 3TAMA 4OPJA 1QQMA 1KVCA 2RN2A 3H6EA 2Q97A 2A41A 1MU2A 4BE7B 5EXWA 1HNZK 1T3VA 4JI0K 2Q0UA 1YXQA 4X65K 3ZT3A 4M3TA 1T7AA 2BANA 4BC5A 4O55A 4JI1K 3KOWA 3EE8A 2NRVA 3VQPA 3D6RA 4KFBA 4CZHA 4HTUA 1NGJA 2Q1NA 4HHTA 4LC9B 4CK2A 3OVNA 3CCVN 1HQEA 3ENOA 1C56A 2YHWA 2PZSA 2UXDK 1X9SA 3FZMA 3AO3A 4CEOA 4LSLA 5KTQA 3SBGA 3HPHA 3CMEN 4WF9L 3A5NC 4YHHK 2O8FA 4CI6A 3EEQA 4WFAL 5J2PA 3A0IX 3LDQA 1RDDA 1EX4A 3A5MC 1ZVGA 2HHSA 4JRQA 4AM7A 4CF1A 1TAUA 3NDKA 1RBTA 2P9IB 4NB4A 3OYDA 4M3RA 5LJWA 4E1NA 2XRIA 5AQLA 3L2RA 3MXIA 3I8DA 1DKGD 3K58A 3GKUA 2X6SA 3FR0A 3CCQN 2NRHA 4LFAK 3ZX2A 4BQLA 4FK2A 3AAPA 4YORA 1C0TA 3VQ4A 1J5EK 1C0MA 1KSPA 3ZSOA 3RSEB 2RHKA 4N56A 1JL1A 1VSKA 2YKMA 4BWJA 4CIFA 2OA8A 4DTNA 1HKCA 1VQ6N 2OTJN 2O8EA 2YILA 5D3GA 1RCHA 1W2BM 3HOTA 1T7BA 1VRTA 3NH2A 3WEEB 3S3NA 1S9GA 1KAYA 4B9UA 4NCGA 3D2FA 1E4FT 1OVQA 1T6CA 3LPUA 2IIRA 3FZLA 5EVZA 4M7XA 4FLVA 1YVUA 2JLEA 3MX2A 4DS4A 4R79A 2OPQA 4A61A 3ULDA 2C1IA 4QS8A 3U4LA 1I94K 4F4KA 2PYLA 1E3MA 1QS4A 2NRZA 2YNFA 4JLHA 5EX5A 4BGBA 3P4IA 4L3QA 1GOBA 2E2FA 4E7HA 4CZJA 2G8HA 1RDUA 4CJFA 4BDYA 3FLCO 3DXKA 3F2KA 2YNGA 4UADE 4H03B 1NMDA 4FM0A 5AQNA 1BDGA 3O3HA 1GOCA 1BCMA 3KZBA 4U67L 3WNGA 3P1GA 1DQ7A 3DXMA 3VETA 4EP4A 3TAEA 2KBJA 2CGJA 3CIPA 4AH9A 2VG7A 3OY9A 4B3MK 1WSGA 4DTUA 1QQNA 5EU7A 2D4WA 4KHWA 3KK1A 3PO5A 1G15A 5BPLA 3OYIA 4MO5A 1MWMA 4AF1A 4B1WB 1RTIA 1SEGA 4FLXA 2UXCK 2MBKA 3MWPA 4ILGB 4E89A 4CJKA 2YEOA 3EKUA 2AP1A 4BR5A 4H0OA 5FPMA 2QWOA 3VQ7A 1LWFA 4FWLA 4IWVA 4Z4HA 4DV0K 1TUUA 4CJTA 4DSEA 2VWKA 5K14A 4DSJA 3CCLN 4C23A 4F2RA 5LJVA 3OYKA 4CECA 1WT7A 1KVBA 4UAEF 4B3SK 2IGIA 3ZEUB 4CJQA 1PE4A 2F9TA 3OYHA 4FLTA 4CJEA 4H8KA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3C65 A;  3HK2 A;  3VEW A;  2NLX A;  4JD2 B;  3ZX3 A;  4W5R A;  1PX9 A;  4CK1 A;  5AQV A;  2X78 A;  2RPI A;  3RMC A;  4O5F A;  2G8W A;  1UOC A;  3V9U A;  3S41 A;  4MO4 A;  1IKW A;  3SQ2 A;  4E1M A;  2QWR A;  1NK7 A;  2ASM A;  3M1F A;  4C8M A;  3TTC A;  2IC3 A;  3FGU A;  3NAE A;  3MN9 A;  2Q31 A;  2P5O A;  3CG7 A;  4JI8 K;  3ZSY A;  2P9P A;  3MAQ A;  2N66 A;  1ATN A;  4XH5 A;  4ISF A;  4FVU A;  5SWM A;  4CES A;  3SUO A;  3VA3 A;  4BY9 C;  4IFE A;  3THV A;  1SL0 A;  3DRP A;  5KQD A;  4GKK K;  4B3O A;  1UWB A;  1VQP N;  2FC0 A;  5FLX O;  4FWQ A;  4FJH A;  2HHH K;  1B9D A;  1TV6 A;  4BC2 A;  2HMI A;  4V1D C;  2RE2 A;  4IG3 A;  1V4S A;  3TU5 A;  2IVN A;  3HTV A;  4JI4 K;  3CW4 A;  1BQN A;  1NKB A;  1HPM A;  5C25 A;  3DLE A;  2QXL A;  4LD0 A;  3KWI A;  1KC8 O;  1BIU A;  2PAV A;  3AVJ A;  3M5R A;  3L2V A;  3HST B;  1LCU A;  3VEY A;  2YHB A;  1KXP A;  4KHQ A;  3A8Y A;  3MEG A;  4C1N I;  3LZI A;  1WSI A;  3ASM A;  1LQI A;  4YY3 K;  1REV A;  4Z4C A;  3EZW A;  4JHD A;  3K9K A;  2W42 A;  4BEC A;  3CYG A; 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