3L4IA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 (cgd2_20) from cryptosporidium parvum in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title CRYSTAL STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF HSP70 (CGD2_20) FROM Cryptosporidium PARVUM IN COMPLEX WITH ADP and inorganic phosphate
rcsb
molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
molecule tags Chaperone
source organism Cryptosporidium parvum
total genus 124
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3l4iA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l4iA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l4iA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3l4iA04
4BRNA 1V4TA 4BRHA 1TYQB 4H0XB 4B1UB 4BVPA 3L6QA 3O4WA 5AQTA 5BPMA 4DB3A 4WQ5A 2BTFA 1SAZA 3VESA 1S22A 2YI1A 4CZMA 2PAVA 2YHWA 2IVPA 1SZ2A 1QHAA 3AY9A 4H0TB 4HTLA 1NGGA 3MN9A 4NB4A 1BG3A 3FE1A 1T6CA 2P9IA 4BR4A 3DAWA 4BGBA 2IIRA 3I8BA 2E1ZA 1HX1A 4IWVA 3H1VX 3FZMA 2P9IB 4O8KA 1GLDG 4BRAA 5KPZA 2OANA 4B9QA 2IVNA 3O80A 3C0BA 4CZJA 3EKSA 1BO5O 1Y64A 3H45C 4WQ5C 4CZKA 1Z05A 4ISEA 3GOIA 3FZLA 1QQOA 3AAPA 3P4IA 1X3NA 1KAZA 5BRHA 4BG9A 5ADXA 1MWKA 3R9PA 3A5MC 1LOTB 4YDUC 4FPBA 1IG8A 1E4GT 1GLCG 2FSNA 4AM6A 4BVOA 3VEVA 5JICA 4BRMA 4BRLA 2E2PA 3WXKA 4C23A 1RFQA 5AZIA 4A62A 5AQIA 5F0XA 3KHYA 5KPRA 3L4IA 3RSEA 4B1VA 3D7EO 4CZIA 4CBUA 4BR2A 1YUWA 4XEIA 2UYTA 2Q1NA 2GEMA 3RSEB 4FOIA 4BR0A 1DEJA 2FXUA 3U9ZA 4FWKA 3A8YA 2YHYA 1NGFA 5AQXA 1WOQA 3SMSA 1MA9B 3WQUA 2ASOA 5AQOA 1GLBG 5I9EB 4IO8A 5AQUA 3F9MA 4H0OA 4IJNA 1D4XA 5AQVA 3WT0A 5F2RA 2A3ZA 2P9UB 3G25A 3KZBA 4H5WA 4MO5A 3FZHA 4EAHD 5ADXH 1ATNA 1C0FA 4HWIA 2V7ZA 1ZXOA 1SQKA 4BRCA 4BG8A 5AQWA 2ZGZA 1HJOA 3BF1A 4DCHA 1NGJA 2J4RA 1DGKN 4EFHA 1EQYA 3JS6A 3S41A 2HF3A 4BR9A 4B1YB 2CGLA 4JAXA 4H0VB 5F1XA 3ENOA 2A6AA 1MDUB 1OKJA 4PL8A 5LY3A 3H46O 2QWQA 3CJBA 3IUCA 4A2BA 4XH1A 4IJAA 4CD3A 3DWLA 5KPTA 4EHUA 5B8HA 2HOEA 1QZ6A 3FFKB 2Q0UA 3IFRA 2QW9A 4JHDA 2NZTA 3GDQA 4PKGA 3ENHA 2FSKA 2ZF5O 3IMXA 5TKYA 5LJWA 1QQNA 4JHDB 1LCUA 3MK6A 3D2EA 4FSVA 1BUPA 1KAYA 2P9KA 4FOEA 4MLEA 4QS9A 3ZX0A 2FSJA 5JMVA 1G99A 5AQYA 2CGJA 3GG4A 2QWOA 3D2EB 1J6ZA 4BRPA 2YHXA 2P9KB 5AQHA 4H0YB 3ZX3A 3A5LC 1HKBA 3HM8A 3EZWA 3M3ZA 3EN9A 2YJEA 3CETA 4RCHA 1DKGD 4FO0A 1NWKA 5FPMA 1YAGA 4CI6A 3LDNA 4BRIA 3BUZB 4M7XA 3MCPA 5EXWA 2W40A 3GE1A 4FWRA 1ZBSA 3FLCO 3CJ7A 5BRFA 3O08A 5JLFA 3ATVA 1HPMA 3FZKA 3QB0A 3OHRA 4QS7A 4DQ8A 1X3MA 4CJ7A 3JXUA 4WQ4A 3VPZA 2YJFA 3QBWA 2ITMA 3VGLA 3QFUA 4XH4A 2A40A 4K43A 1CZAN 3SLCA 3VERA 3W3DA 1JCEA 3VEYA 4ISFA 3HSCA 3M6GA 3C7NB 3WXLA 3O6WA 5BN9A 3GL1A 4JD2A 5AZJA 4M63C 2HMPA 2P9NA 5E26A 3WQTA 3BP8A 4XH5A 1YVNA 5AQJA 3VEZA 4JD2B 5AZJB 1HKGA 2P9NB 4RWTA 3ID8A 2FLOA 3MN7A 3VGMA 5EOYA 3VEXA 4BR5A 3CJAA 4Y0WA 3A0IX 3O8MA 5AQSA 5FPDA 2P9SB 1NGDA 2CH6A 3WXJA 5BR9A 2V52B 4WQ4C 4AM7A 3ZETB 2Q31A 3D2FB 1IJJA 4BC4A 3ZEUB 2P9UA 1RDWX 5LJVA 2E8AA 1XC3A 1U6ZA 3HI0A 4FWSA 4CZGA 3A5NC 2Q2RA 2HF4A 2VCPA 5AQKA 2FF6A 3LM2A 3QBXA 3R8EA 2QWMA 4PL7A 4PKIA 3QDKA 1XQSC 2PBDA 2A5XA 3J8AA 3WUHA 4FWQA 1BWFO 4FWNA 4EHTA 5AQMA 1NMDA 4NO7A 1QQMA 4B1WB 2V51B 4CZHA 1HLUA 1WUAA 2VYPA 4K42A 2P9PB 3MN6A 3HBTA 1NGCA 2BUPA 2D1KA 4WYBA 1BOTO 2AA4A 3UB5A 4CBXA 3FGUA 3A5OC 3LDQA 1NGEA 3H6EA 4E1JA 4CZFA 2GTDA 5AQFA 3H1QA 4PKHA 2D0PA 1NGIA 3AARA 4BREA 2GWJA 2D0OA 4BC2A 3UE5A 4BRQA 3VETA 1BU6O 4I6MA 3W0LA 2ASMA 3CQYA 4I6MB 4MLHA 5EVZA 2QWRA 4BR7A 3ULEB 5BN8A 5AQPA 4FL9A 4F9OA 3U8XA 2AP1A 2D4WA 2ZWHA 4BC5A 3R6MA 3MN5A 1NGBA 3ZX2A 3CQXA 4QS8A 3VENA 3O1WA 3LL3A 3QICA 3U9DA 3WXIA 4CZLA 5BPNA 2NLXA 5E84A 1T6DA 2NRHA 1ZC6A 4CZEA 4H5VA 4K25A 4RTFD 2E2NA 1C0GA 2W41A 3CIPA 3H3OB 5EX5A 5BPLA 3O1BA 5AFUA 4O5FA 4H0PA 3FR0A 2E1YA 3UKRA 3MDQA 4YDUA 4KBOA 4H03B 1T44A 3FZFA 2A42A 4GNIA 3CJCA 3IDHA 1BDGA 2GUPA 2ASPA 3LM9A 3UKRB 1TUUA 1Q18A 5BRDA 3C7NA 1BA0A 4MO4A 4BRDA 1Z6RA 2V7YA 3SK3A 5AQLA 3CJ1A 1ESVA 3CHWA 1NGAA 2E2QA 2E20A 2I7NA 3QMLA 3L0QA 3WEEA 4FPAA 4BRKA 4EIAA 1R59O 5FPEA 4FWPA 4GY2B 3SJHA 3WEEB 1JCGA 3DJCA 3VF2A 4BGAA 1ATRA 4ISGA 1KAXA 1X9JA 3VGKA 4H5NA 3HTVA 3HZ6A 2A41A 2P9SA 1U2VA 1GLJO 2WUSA 4IXCA 3VOVA 1P8ZA 3KVGA 2F9WA 3ZETA 3D2FA 3BF3A 3ZEUA 4BROA 1U2VB 3AAQA 3EO3A 1NM1A 2E88A 5AQGA 2QM1A 5AQRA 4M7YA 1TUYA 3CI5A 2KHOA 2YCHA 4FWOA 5AR0A 2QWLA 5CE3A 4BRGA 4L3QA 5AFUH 2Q97A 2QWPA 5AZIB 3BEXA 3U4LA 3LDOA 1XUPO 3H3NO 3DXKA 2GELA 5JLHA 4H5TA 4IZ9A 5AQZA 1GLFO 5KQ8A 1NLVA 4BQZA 4A61A 1HKCA 4B1ZA 1YXQA 3DXKB 2I7PA 2CH5A 4J8FA 3B8AX 3VF4A 3QFPA 1KXPA 4K41A 1RGIA 1S3XA 2P9PA 2CGKA 1E4FT 3EL2A 3TU5A 3LDPA 4BQLA 2QWNA 2Q0RA 2Q36A 4BRFA 1NBWA 2H3GX 1MWMA 2FF3B 3M1FA 4FWLA 4JNEA 4LC9B 4DHYA 3O5BA 1HUXA 1V4SA 5ELZA 3VEWA 5AQNA 2IVOA 3TPQA 4FWMA 1ATSA 5AQQA 3SMPA 1QZ5A 1JCFA 5FPNA 2EWSA 3MMVA 5EY4A 3GBTA 3UKUB 4CBWA 2DPNA 4Z94A 1H1VA 3LDLA 3EKUA 1BA1A 2P9LA 4CD1A 1GLLO 3ULEA 1GLEG 1K8KA 3I33A 3DXMA 3VF6A 1NGHA 5BREA 4B1XB 3ATUA 4BC3A 2VWBA 2E2OA 2P9LB 3CERA 3UKUA 5KQDA 3VEOA 1K8KB 1GLAG 3DXMB 1TYQA 2GWKA 4JN4A 4H5RA 2QXLA 4A2AA 2ZGYA 3CJ9A 2F9TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FDLA 4I9LA 2KZZA 4JI6K 1TYQB 4AB0A 4FVMA 3AVKA 1L3SA 4B1UB 1CXUA 4BVPA 4ILGB 3O4WA 4OPHA 3M8PA 3KLHA 4WQ5A 1N36K 3QI7A 2O8FB 1S9GA 1A5WA 2YI1A 4DTRA 1JLQA 3CYGA 4B9LA 3KOZA 2NY8X 4DR5K 2G8UA 2E6MA 3MN9A 4NB4A 1BG3A 1T6CA 4ZTFA 3THXB 3HPGA 4BGBA 4XIUA 2B5JA 1HX1A 2BRZA 4FJ5A 4KH6A 1VSLA 3RWUA 4FJ7A 3L2RA 4O8KA 1X1PA 4EP5A 3K0SA 4F8RA 2HHXA 4FJIA 2OANA 4AQYK 3C0BA 2HB5A 3V81A 2O8CB 4CZKA 2I61A 3GOIA 4ISEA 5KGXA 1QQOA 2R7YA 1KAZA 3OYLA 3EYZA 2PYLA 3A5MC 4FPBA 1IG8A 3DRSA 1NMNA 4KB1A 5AZIA 1HYZA 5KPRA 3L2QA 3D7EO 3NHGA 4O0IA 1S6PA 4XEIA 3OJUA 2Q1NA 3S3NA 4LF8K 3RSEB 3ZYYX 3CCLN 3OYAA 1DEJA 4YOVA 4DFKA 3P31A 4JV5K 3U9ZA 4ELUA 3WQUA 1D9DA 4FK0A 1GLBG 2X78A 4NLCA 3OTOK 4H0OA 4C8NA 3KLFA 1T7EA 4K8ZA 3WT0A 1WNSA 1OVYA 4IKFA 2P9UB 1SL1A 4J2EA 3MWTA 2RN2A 3KZBA 3NVKA 4H5WA 4MO5A 3EZ5A 3OYMA 1EWRA 1NRAA 4PA1A 4R79A 2V7ZA 3P83D 1L3VA 1ZXOA 1S1VA 4BRCA 3OYBA 4KAZA 3BF1A 4FVUA 1NGJA 1DGKN 1JLFA 4B3SK 2GMOA 3VQBA 3JS6A 5IWAK 4BR9A 2A7TA 2YHBA 1JXBA 4ICLA 3ASMA 4B1YB 2CGLA 1XMQK 3PX6A 4H0VB 4DSIA 5F1XA 2MN5A 1MDUB 1OKJA 4B9TA 4NYNA 3T1YK 2QXFA 3J7YP 2RHKA 1RTHA 1I6GA 2IOCA 4CEQA 2QEXN 3DLKA 3E7UX 4IJAA 4CD3A 4KO0A 4BDYA 1QZ6A 4DV4K 3KJVA 3RMBA 4RG8A 3AVNA 1TK0A 1VQ7N 2P51A 3TR8A 3GDQA 4PKGA 3ENHA 3KK2A 4CJEA 2FSKA 4FJHA 2ZF5O 4KKOA 3P1GA 1PTXA 3SBTA 5TKYA 5D3GA 4JHDB 4CHQA 2KTQA 1KAYA 4ILHA 4JK9A 4JK7A 1S5JA 1YJNN 4NCAA 4MLEA 4QS9A 3ZX0A 1G99A 4KTWA 4BRPA 3D2EB 4DQQA 5AQHA 3ZX3A 3QETA 1REVA 1QSYA 2FBXA 1NJIO 2YJEA 4H4MA 4KB0A 4FO0A 1NWKA 4M45A 4DS4A 4KRFA 5C0YA 3VQ4A 2PYJA 2NY9X 2E5LK 3HO1A 1ZBSA 3FLCO 4DS5A 5BRFA 1N6QA 2ZE2A 4R5PA 3QB0A 4QS7A 4DQ8A 1BI4A 2WBNA 5CY4A 1OH6A 1U48A 1TGOA 2ITMA 3VGLA 2QKBA 2OZSA 1R0AA 4K43A 3VQDA 3VEYA 3M6GA 2G2KA 2N66A 5BN9A 1KSPA 3TTCA 4JD2A 4M63C 5J2PA 4JI8K 3WQTA 3BP8A 1YVNA 3SQ1A 4DQPA 4OKEA 2KFNA 2P9NB 4FLTA 2FLOA 2N2QA 3ENBA 3AVIA 3HPOA 1T8EA 4BR5A 1JL2A 1NK5A 4DV6K 3ZCMA 3RMCA 5AQSA 1NGDA 5BR9A 4C8OA 4AM7A 3ZETB 1UA1A 1NRBA 3DLHA 4HUFA 1EO1A 4BC4A 2WTUA 1RT7A 2YKNA 3ZEUB 2G8KA 1RDWX 5MLCQ 3CM5A 4V1DC 1HR0K 4UAFE 4CZGA 1UA0A 2VCPA 4FJGA 1Q9XA 2W6KA 2QKKA 3S9HA 3KD1E 2QWMA 4WCEL 1TKXA 4IOAL 4OJRA 1ITGA 2VY6A 1HNXK 5AQMA 1NMDA 3J81O 4CHNA 4UY8O 3B6PA 3TAGA 3J7ZO 2ZM6K 1BCOA 3AO1A 3J7AP 1NK4A 2YNHA 1NK0A 2F4VK 1RTIA 2E4LA 3LDQA 1NGEA 1S6QA 4C1NI 1CHZA 3RRGA 3CM6A 3MX5A 5HOOA 4B3OA 4O8UA 4LD0A 4BREA 4CFBA 3CFRA 1UGLA 3O9RA 1U49A 2O4GA 3HYFA 3CQYA 2HHIA 3DLBA 4CECA 2AJQA 4I6MB 2HBJA 3AA5X 2QWRA 3AVFA 1DTTA 4BR7A 3ULEB 3O9TA 3U8XA 4PHTX 5FRNA 4BC5A 4OKKA 4BE7B 5KK4A 1HQEA 3OA9A 1T03A 1IG9A 1NGBA 4IG0A 3LL3A 3WXIA 3KP0A 4I9QA 4JKAA 2NLXA 1N4NA 4CZEA 1S72N 1YVUA 3I0SA 2LN8A 1VSMA 3H3OB 4M41A 5AFUA 3NMUA 1KC8O 3G71N 1DJTA 3UKRA 3ITHA 5BR8K 4N56A 4H03B 1N32K 4K0KK 3CCEN 2Z1GA 3IDHA 1BDGA 1YJWN 2ASPA 1S9EA 1TUUA 4O5BA 2V7YA 4CF0A 4E7IA 4CEEA 4X64K 1O13A 2I7NA 2M8BB 4K8XA 2VWKA 1VSHA 3G4SN 3CPWM 1HQUA 4NCGA 4BRKA 3SAGA 2DTUA 4FWPA 4CJFA 3WEEB 3VF2A 4CJWA 4H5NA 5J2NA 1GLJO 4IXCA 3VOVA 2F9WA 2HBKA 1QHTA 3L2VA 4BROA 1FKPA 1C1BA 1U2VB 1VQKN 2E88A 5AQGA 4CIGA 3OJSA 4CESA 2OPQA 3TAEA 4DFPA 4FWOA 3OY9A 3KTQA 2QWLA 5CE3A 3OS1A 4BRGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5FDL A;  4I9L A;  2KZZ A;  4JI6 K;  1TYQ B;  4AB0 A;  4FVM A;  3AVK A;  1L3S A;  4B1U B;  1CXU A;  4BVP A;  4ILG B;  3O4W A;  4OPH A;  3M8P A;  3KLH A;  4WQ5 A;  1N36 K;  3QI7 A;  2O8F B;  1S9G A;  1A5W A;  2YI1 A;  4DTR A;  1JLQ A;  3CYG A;  4B9L A;  3KOZ A;  2NY8 X;  4DR5 K;  2G8U A;  2E6M A;  3MN9 A;  4NB4 A;  1BG3 A;  1T6C A;  4ZTF A;  3THX B;  3HPG A;  4BGB A;  4XIU A;  2B5J A;  1HX1 A;  2BRZ A;  4FJ5 A;  4KH6 A;  1VSL A;  3RWU A;  4FJ7 A;  3L2R A;  4O8K A;  1X1P A;  4EP5 A;  3K0S A;  4F8R A;  2HHX A;  4FJI A;  2OAN A;  4AQY K;  3C0B A;  2HB5 A;  3V81 A;  2O8C B;  4CZK A;  2I61 A;  3GOI A;  4ISE A;  5KGX A;  1QQO A;  2R7Y A;  1KAZ A;  3OYL A;  3EYZ A;  2PYL A;  3A5M C;  4FPB A;  1IG8 A;  3DRS A;  1NMN A;  4KB1 A;  5AZI A;  1HYZ A;  5KPR A;  3L2Q A;  3D7E O;  3NHG A;  4O0I A;  1S6P A;  4XEI A;  3OJU A;  2Q1N A;  3S3N A;  4LF8 K;  3RSE B;  3ZYY X;  3CCL N;  3OYA A;  1DEJ A;  4YOV A;  4DFK A;  3P31 A;  4JV5 K;  3U9Z A;  4ELU A;  3WQU A;  1D9D A;  4FK0 A;  1GLB G;  2X78 A;  4NLC A;  3OTO K; 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