3L6QA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 from cryptosporidium parvum (cgd2_20)
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
GGPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the N-terminal domain of HSP70 from Cryptosporidium parvum (CGD2_20)
rcsb
molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
molecule tags Chaperone
source organism Cryptosporidium parvum
total genus 123
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3l6qA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3l6qA04
3ATVA 1YUWA 1BO5O 1X9JA 1ZBSA 3HM8A 3EO3A 3EZWA 4B1WB 4I6MA 2QWLA 5AQKA 1NGIA 5BN9A 3R6MA 4K25A 4JHDB 4WQ4C 2V51B 2ASMA 3TPQA 1BUPA 1NMDA 1RDWX 1T6DA 3JS6A 2H3GX 1NGEA 1Q18A 3QFUA 2V52B 2P9SA 4CZHA 3L6QA 1SAZA 1ZXOA 5KPTA 1HJOA 3FR0A 3LDOA 3HBTA 3C7NA 4BG9A 4CZJA 1ESVA 4FPBA 3ZETB 4MO5A 3H45C 2W40A 4L3QA 4HTLA 1NLVA 4BRLA 2OANA 4IWVA 4BRIA 5E26A 1BA0A 3DAWA 3QB0A 2HF4A 4Y0WA 3VPZA 4LC9B 5LY3A 4BVPA 5AQOA 1RGIA 1ATNA 3DXMB 5TKYA 1HKGA 3MK6A 1H1VA 3ULEB 3ATUA 4PKHA 4BVOA 2QM1A 4BR7A 1E4FT 1NGJA 3ZX3A 4Z94A 3VF2A 5EOYA 4C23A 4JN4A 5F2RA 4CZIA 4BC4A 5BRFA 2Q1NA 4BRQA 4CBUA 4O8KA 4PL7A 2QW9A 5KQDA 5I9EB 1R59O 4H0VB 2GUPA 3H1VX 1QZ6A 4AM7A 3LDNA 5AQTA 2ZGYA 4BROA 3M1FA 5ADXA 4MLHA 4BR0A 2NZTA 5ADXH 2VWBA 4BREA 3VEYA 2P9LB 1GLDG 4H0TB 1JCEA 4BRCA 4H5TA 2ASOA 1ZC6A 5JICA 1T44A 5AZJA 4K43A 2YJFA 3VEWA 1CZAN 4FPAA 3D7EO 4GY2B 4CZKA 2BTFA 4WYBA 5AQQA 2E2QA 4DCHA 3LDLA 5EVZA 4RCHA 1SZ2A 1TYQB 4BQZA 5F0XA 3IDHA 5JLFA 4IJAA 4BQLA 2Q36A 4CZGA 3VEVA 1HUXA 2YI1A 1JCFA 1QQMA 2A40A 2D0OA 1HX1A 3GDQA 3VEOA 2P9UB 4QS8A 2CH6A 5BRDA 5AQGA 3O5BA 4WQ5A 4BC2A 1J6ZA 3CQXA 1HKCA 1D4XA 3EKSA 1NGBA 3L4IA 4E1JA 5AQZA 2GWJA 1YXQA 1YAGA 2P9PA 2FF3B 1WUAA 4H5VA 4EHUA 2FSJA 4BRAA 1BU6O 1GLJO 4HWIA 4ISGA 1TUUA 5AZIA 3CIPA 3UB5A 1BOTO 3QICA 2ZWHA 3RSEA 1DGKN 4RTFD 2FSNA 4EHTA 4JNEA 4BR9A 4NB4A 3IUCA 3BP8A 2P9KA 5FPEA 3BF3A 2QWRA 1GLLO 2F9TA 2E88A 3CJBA 2YJEA 3DJCA 1G99A 1U2VA 2WUSA 1MWKA 5EX5A 4BC3A 1DKGD 3D2EB 3OHRA 3M3ZA 3MN7A 4CD1A 2D1KA 4IJNA 5AQLA 3O8MA 3WEEA 1QZ5A 3LM9A 3ZEUB 3FZKA 1NGAA 3GL1A 2FSKA 4DHYA 3FLCO 1S3XA 2A42A 4XEIA 4H03B 3HSCA 5B8HA 2Q0RA 1QQNA 3I8BA 3WQTA 5AQMA 5AQUA 5AQHA 1X3NA 2ITMA 3FGUA 4BG8A 3C0BA 2IVOA 4H0OA 3EL2A 1T6CA 5AFUA 2PAVA 2QWQA 5AFUH 1K8KB 2KHOA 1IG8A 4K42A 3O80A 4MO4A 3U9DA 1KXPA 2FXUA 3DXKB 3AAPA 1XQSC 1KAYA 2VYPA 3S41A 2P9IA 3A5OC 3G25A 2IVNA 4IZ9A 3SLCA 1LCUA 4CJ7A 4KBOA 5AQRA 2I7PA 5EY4A 2E20A 5AQPA 3ZETA 3MN6A 4CBWA 4DB3A 1NGGA 2J4RA 4BRMA 3H46O 1GLCG 3DWLA 4FWLA 4XH5A 3CHWA 3W0LA 4IO8A 5AQXA 3VEXA 4CZLA 4JD2B 3O4WA 3H3NO 2FF6A 3UKRB 3CI5A 3I33A 2GWKA 2AA4A 4XH4A 3QFPA 3L0QA 5FPNA 3MMVA 3VEZA 4K41A 4NO7A 4BRPA 3KVGA 2F9WA 3WXKA 4A2AA 4RWTA 3A5MC 3O1WA 3CQYA 3CERA 3A5NC 1V4SA 3CJ9A 4EFHA 3WUHA 5BPMA 4XH1A 5AQIA 2YCHA 1BWFO 3EKUA 3WXIA 4FWRA 1OKJA 3CETA 5BR9A 3U9ZA 4BRNA 5KQ8A 3CJ7A 4EAHD 5AQYA 2ZF5O 3HTVA 4FWNA 3MDQA 4ISFA 4M63C 2YHYA 5AQVA 2HOEA 3VGLA 2YHXA 3UKUB 2QXLA 4FWMA 2P9NB 4FOIA 4H5NA 2DPNA 3GG4A 2W41A 1C0GA 3WXJA 2V7YA 4WQ5C 3KZBA 4H0XB 2QWMA 4MLEA 2IVPA 4M7YA 2Q2RA 1TYQA 3LDQA 3FZHA 3D2FB 5AQFA 3O08A 4DQ8A 3BEXA 3AY9A 2GELA 1U6ZA 3A0IX 3FZLA 3QBWA 3QBXA 4YDUA 3VGMA 3VERA 3HZ6A 2P9UA 4I6MB 3IFRA 4YDUC 1MDUB 2HMPA 3VF6A 3FZMA 3SJHA 5AR0A 4PL8A 1WOQA 4AM6A 3MN5A 4J8FA 3ZX2A 1BDGA 4JAXA 2CGJA 5F1XA 1EQYA 1ATSA 2P9SB 3FE1A 4CZEA 3C7NB 4PKIA 4H0PA 2HF3A 2GEMA 2E2PA 1NM1A 2D4WA 2QWNA 1LOTB 3CJAA 5AQSA 4FOEA 3R8EA 4FL9A 1NWKA 4CI6A 1NBWA 4H5RA 4B9QA 3LL3A 4WQ4A 3KHYA 3SMPA 5FPMA 1IJJA 1HLUA 1DEJA 5BREA 1GLAG 3H6EA 4A61A 3AAQA 4BGBA 1QQOA 2IIRA 1Y64A 4GNIA 4JHDA 1BG3A 4QS7A 1MA9B 2I7NA 2Q31A 2CGKA 5ELZA 3UE5A 2A41A 5AQJA 3TU5A 2P9IB 1SQKA 1GLEG 5E84A 3D2EA 4A2BA 2E2OA 5AQWA 2E1YA 1GLBG 1C0FA 3VESA 3FZFA 3CJ1A 5JLHA 4BR4A 3ZEUA 1YVNA 2Q0UA 4BRGA 4BR5A 5KPRA 3H3OB 3MCPA 1JCGA 5EXWA 1Z05A 4B1XB 4BGAA 4CZMA 4O5FA 2A5XA 2EWSA 2CGLA 4F9OA 4BRDA 3MN9A 2A6AA 4FWKA 5BRHA 1E4GT 3SK3A 3BUZB 4FO0A 2V7ZA 3B8AX 4BRHA 1RFQA 3DXMA 1K8KA 3QDKA 1XUPO 2E2NA 2BUPA 1NGFA 3DXKA 3O6WA 3ULEA 4BRKA 3JXUA 2AP1A 2QWPA 4PKGA 2VCPA 3BF1A 4BR2A 3A5LC 2A3ZA 1GLFO 3IMXA 4B1YB 4EIAA 5AZJB 5LJVA 3ENHA 5AQNA 3U8XA 1BA1A 3ID8A 1X3MA 3HI0A 4FWOA 3VOVA 3GBTA 2ASPA 2ZGZA 3H1QA 4FWQA 4JD2A 2CH5A 3ZX0A 3CJCA 4A62A 1MWMA 2NRHA 5BPLA 3UKRA 1NGHA 3WXLA 3A8YA 1XC3A 4FWSA 4CBXA 4CD3A 4QS9A 2P9LA 2GTDA 3AARA 3GE1A 3W3DA 3R9PA 3QMLA 3WT0A 4H5WA 3M6GA 3WQUA 2D0PA 4H0YB 4M7XA 4B1UB 4B1ZA 3U4LA 1KAXA 3O1BA 3LDPA 3VGKA 2Q97A 3SMSA 2P9PB 3VETA 1HPMA 4FWPA 3J8AA 4FSVA 2NLXA 4IXCA 5KPZA 5BN8A 1NGCA 1NGDA 1Z6RA 5AZIB 3GOIA 1ATRA 3RSEB 4B1VA 2QWOA 3VF4A 1P8ZA 3UKUA 5JMVA 4BC5A 2PBDA 2UYTA 2P9NA 3VENA 2P9KB 1TUYA 1KAZA 4ISEA 1S22A 5BPNA 1QHAA 2YHWA 5FPDA 3LM2A 2FLOA 1U2VB 2E8AA 5LJWA 3FFKB 1V4TA 2E1ZA 4CZFA 3P4IA 3ENOA 3F9MA 5CE3A 3D2FA 3WEEB 4BRFA 1HKBA 3EN9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SS6A 4OGEA 3TAQA 1J53A 4CFBA 1KRPA 3HM8A 2XY8A 3EO3A 3CCRN 1KD1O 4A5AA 1DLOA 2LY6A 5AQKA 1VQ8N 4K25A 3R6MA 1KVBA 2JWKA 4WQ4C 1NMDA 4IG3A 3JS6A 4ZTFA 1VRTA 5GAGP 1T7EA 2P9SA 2V52B 2YNGA 1ZXOA 5KPTA 1HJOA 1OVQA 3SBGA 3HBTA 5M1FA 2DY4A 1IKXA 3AVKA 1B92A 2EX3A 4FPBA 3ZETB 4MO5A 3HOTA 4YY3K 1BMRA 4L3QA 1A5WA 1HNVA 5CY0A 1BA0A 2BH1A 4Y0WA 1D9DA 1RDCA 3DRRA 1C6VA 4FLUA 5AQOA 1HYZA 1RGIA 5TKYA 1AHOA 1YF5L 1H1VA 4O0JA 4J2EA 3TSPA 1ZBLA 1PE4A 2BANA 3ZX3A 1QS4A 4R5PA 3EY1A 1T8EA 1Q8IA 4DSEA 1WSEA 1RT5A 2KFZA 2E3GA 1R59O 4H0VB 1XMQK 4BE1A 1F21A 5AQTA 2RPIA 3M1FA 5AJ3K 4QOZB 3T1YK 4FLVA 5ADXH 2VWBA 1X1PA 4BREA 1YIJN 4CJEA 4FZXC 4CJRA 4JEPA 1GLDG 3OY9A 3JSMA 3SQ1A 4H0TB 1MYNA 2LI7A 5GIPA 1NPIA 1ZC6A 5JS2A 1T44A 1Q82O 4CJ4A 2UUCK 4K43A 2LJMA 3VEWA 3RMBA 1J9AA 1VQNN 4KH6A 3THYB 3LP1A 4CHQA 3UIQA 1NU0A 1VQKN 2KFNA 2E2QA 3LDLA 1OH5A 5C12A 1VNAA 1VQON 4RCHA 4BQZA 5F0XA 1TK8A 1JKZA 1SL0A 4CQKA 2YI1A 1JCFA 1QQMA 3LWLA 4JS4A 4LSLA 2FBYA 2CH6A 3TAPA 1IBLK 3O5BA 1NK6A 4CGFA 4CW7B 4DU1A 2O4GA 4KB1A 1HKCA 3E7UX 1Q9XA 3EKSA 3MWPA 3LP0A 4CE9A 1JLCA 3L4QA 3HP6A 3PLAA 4M3ZA 3KLEA 1WUAA 4FJJA 4H5VA 2FSJA 2O8BA 1RDDA 5C2FA 4BE0A 2VQFK 3LANA 4CEOA 2ZJQL 3QICA 5M1PA 2G8IA 3RSEA 3C95A 4EHTA 4BR9A 2JWLA 3K9JA 2HBKA 4IOCL 4FLXA 2IAJA 3SCXA 1JXCA 5FPEA 3BF3A 4NCBA 4GV6A 2F9TA 4DSKA 1W0HA 2YJEA 4CHZA 4CJSA 3CM5A 3F9KA 1MWKA 4FLWA 4EP5A 5AQLA 3AA3A 1YTAA 3LM9A 3FZKA 1NGAA 2Z1GA 3GL1A 2B4JA 3FLCO 1S3XA 2W00A 3QNNA 1ILYA 4ILHA 1QQNA 3I8BA 5LMUK 5JVGL 4RG8A 4DS4A 2O8EA 4BG8A 1L3TA 2VGMA 2IVOA 4DU4A 3EL2A 3V1QA 1VQPN 2LN8A 4DWIA 2ITGA 2A1RA 3U9DA 3DXKB 3CCSN 1XQSC 1HNZK 3S41A 3CG7A 4FJLA 4H4OA 4KBOA 3F5TA 1NRAA 1S1TA 2YX6A 4I9LA 3NF8A 2LJ7A 1WSHA 1QE1A 2E20A 2MN5A 2VWJA 4DR2K 4KRFA 4HUEA 4CBWA 4KTQA 3H46O 1GLCG 3B6PA 2E2FA 3W0LA 1VNBA 4IO9L 3NMUA 2ZQBA 5AQXA 3AVBA 3VEXA 4CF1A 2W6KA 2D0CA 1HQEA 3K59A 1JZAA 2AA4A 3QFPA 1UGLA 3L0QA 1IV0A 3MMVA 1ZBFA 4BRPA 1NKBA 4OPJA 1SN1A 2O8FB 1PX9A 1E3MA 1KFDA 2YKMA 4A59A 2X74A 3V9XA 2AJQA 4CGIA 1V4SA 4EFHA 4UQGA 2HNDA 1IKVA 4OO1J 3RR7A 5AQIA 5A2QO 1N8RO 3ZT0A 1HNWK 1BWFO 3G71N 4O8UA 3KK7A 4YOXA 5AQYA 4M63C 4PY5A 3CCQN 2N2QA 4WCEL 5AQVA 3OYFA 4L8RB 4M42A 2YHXA 2RHKA 4JI1K 4CEEA 4AAZA 3AO2A 1NH5A 1ZYVA 2W41A 3C6UA 1LWFA 3WXJA 1YT3A 2OPRA 4CERA 5GADP 4MLEA 2IVPA 3HVTA 4M7YA 3FZHA 4IKFA 4LSNA 2IGIA 3ID6A 4DQ8A 3AA4A 2GELA 3A0IX 3FZLA 1BCOA 1FW6A 1DTTA 4JKAA 3CFRA 4OLAA 3TWHA 4CK3A 2OYQA 2P9UA 1I6GA 1K6YA 4DUZK 4DV3K 3KD1E 2Z1HA 4PL8A 3ZX2A 3KK2A 4I7FA 1U45A 3SBTA 5F1XA 2P9SB 4FZZA 3V4IA 3SZ2A 2ZE2A 1T7AA 1QHTA 1R0AA 4H0PA 2HF3A 2YIOA 1LV5A 2E2PA 5AQSA 3HP9A 1RDAA 3SMPA 1TL1A 4JYAK 3AA2A 1NOZA 1DEJA 4DU3A 3AAQA 4BGBA 1QQOA 1Y64A 2E6LA 4DS5A 4F4KA 1VAZA 1MA9B 2CGKA 4M3UA 2A41A 4JI6K 2P1JA 3TU5A 2P9IB 3D2EA 1VQ7N 4IFEA 1QSLA 5AQWA 3VESA 1GLBG 1LQHA 4CFAA 2OPSA 1D8YA 4BGAA 4CZMA 2CGLA 4KV8A 4FWKA 3NBPA 3J7YP 3B8AX 4DV6K 1JZBA 4JI8K 2N69A 4DSIA 5C10A 1RTHA 4PKGA 4E7JA 3KKRA 4BR2A 2A3ZA 1GLFO 3IMXA 4BY9C 4DTPA 3L3VA 3RMDA 4K0KK 2XY6A 1NK9A 4AHCA 3VQ8A 1Q81O 3DRSA 1BQMA 4DLEA 2VWKA 3AGRA 4JLHA 4XJXA 2CH5A 3M8SA 3ZX0A 1FKPA 3RTVA 3BZKA 4A62A 3HM9A 2NRHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1SS6 A;  4OGE A;  3TAQ A;  1J53 A;  4CFB A;  1KRP A;  3HM8 A;  2XY8 A;  3EO3 A;  3CCR N;  1KD1 O;  4A5A A;  1DLO A;  2LY6 A;  5AQK A;  1VQ8 N;  4K25 A;  3R6M A;  1KVB A;  2JWK A;  4WQ4 C;  1NMD A;  4IG3 A;  3JS6 A;  4ZTF A;  1VRT A;  5GAG P;  1T7E A;  2P9S A;  2V52 B;  2YNG A;  1ZXO A;  5KPT A;  1HJO A;  1OVQ A;  3SBG A;  3HBT A;  5M1F A;  2DY4 A;  1IKX A;  3AVK A;  1B92 A;  2EX3 A;  4FPB A;  3ZET B;  4MO5 A;  3HOT A;  4YY3 K;  1BMR A;  4L3Q A;  1A5W A;  1HNV A;  5CY0 A;  1BA0 A;  2BH1 A;  4Y0W A;  1D9D A;  1RDC A;  3DRR A;  1C6V A;  4FLU A;  5AQO A;  1HYZ A;  1RGI A;  5TKY A;  1AHO A;  1YF5 L;  1H1V A;  4O0J A;  4J2E A;  3TSP A;  1ZBL A;  1PE4 A;  2BAN A;  3ZX3 A;  1QS4 A;  4R5P A;  3EY1 A;  1T8E A;  1Q8I A;  4DSE A;  1WSE A;  1RT5 A;  2KFZ A;  2E3G A;  1R59 O;  4H0V B;  1XMQ K;  4BE1 A;  1F21 A;  5AQT A;  2RPI A;  3M1F A;  5AJ3 K;  4QOZ B;  3T1Y K;  4FLV A;  5ADX H;  2VWB A;  1X1P A;  4BRE A;  1YIJ N;  4CJE A;  4FZX C;  4CJR A;  4JEP A;  1GLD G;  3OY9 A;  3JSM A;  3SQ1 A;  4H0T B;  1MYN A; 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