3LDQA

Crystal structure of hsc70/bag1 in complex with small molecule inhibitor
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
PAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ldqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ldqA04
3H46O 3QMLA 3AY9A 3LL3A 3VEYA 2I7PA 3H3NO 1NGDA 1BA1A 3ZX0A 3LDOA 1GLFO 2FSKA 4PL8A 3BEXA 4FWKA 3GL1A 4H03B 3I8BA 1HKBA 1T44A 4H5WA 3IMXA 3MN5A 2CGJA 5BRDA 1BA0A 5LJVA 2P9UB 1GLBG 3GBTA 3CIPA 5KQDA 1RDWX 2P9LA 2E2QA 5AQIA 1KAXA 3A5NC 4BQZA 3LM9A 3FLCO 4HWIA 3IFRA 2ZGYA 3JS6A 3MN7A 3GG4A 3JXUA 1YUWA 1NMDA 4PKHA 3VEZA 1HLUA 4HTLA 3VF2A 3BUZB 4BRDA 4FWRA 4RCHA 4CZHA 3UKUA 1GLCG 2P9PA 5E84A 5AQKA 4FWSA 3VGLA 5AZJA 4MO4A 1YVNA 2WUSA 2ZGZA 3U9DA 2FF3B 2A42A 3W0LA 3WQUA 1QQMA 4IJAA 1ZXOA 1JCEA 4BGBA 5AQSA 1G99A 3CJ7A 4WQ4A 1XQSC 3DXKB 3A5OC 3LDPA 3DXMA 2QWLA 2E2PA 2J4RA 3ID8A 4FWNA 4YDUC 3ZX2A 4CZEA 5JLHA 1H1VA 4DHYA 2HF3A 3A5MC 4BC4A 1XC3A 4FSVA 3D7EO 4K42A 4AM7A 2QWOA 1HJOA 4H5TA 4C23A 3UB5A 2QM1A 1NLVA 2W41A 1R59O 4B1YB 3D2FA 5AZJB 1S3XA 2D0OA 2VWBA 2Q0UA 1ATNA 4ISEA 2CGKA 3VEVA 1KAYA 2I7NA 4FWPA 4BROA 1X3NA 4B1VA 4B1UB 1ZBSA 5AQHA 2IIRA 5AQRA 1TUUA 4IWVA 3FZFA 4BRLA 4BR7A 1HUXA 1K8KA 3TPQA 2P9SA 3O4WA 3FR0A 3VF4A 4WQ5A 4PL7A 4IJNA 4CZJA 3GE1A 2A41A 4JNEA 4CZKA 5JMVA 2BUPA 4JN4A 4H0XB 4BVPA 4I6MB 4CZLA 3B8AX 4JHDB 2QWNA 2Q97A 3MDQA 3BF3A 2Q36A 5AQFA 3O5BA 4JAXA 4BGAA 4BR9A 4EAHD 4FWQA 3SMPA 5AQYA 4CBUA 1Q18A 2A3ZA 3KVGA 4KBOA 4XH1A 1GLEG 3QFPA 2QWQA 2KHOA 2P9UA 3EL2A 1U6ZA 2OANA 2E1ZA 3C7NB 2P9IB 1RFQA 3MMVA 1HKGA 2ASPA 2ITMA 1BDGA 5AQLA 5BRHA 3R8EA 3ATVA 4DB3A 3U8XA 2V7YA 3WXIA 1TYQB 2Q31A 5AQPA 1QZ6A 2VYPA 4CZGA 3L0QA 3CI5A 5AZIB 2PAVA 3SJHA 5BPLA 3HZ6A 2CH5A 3L6QA 4ISGA 3S41A 2P9NB 5TKYA 2P9KB 3MN9A 3QICA 4RTFD 3DXKA 3QDKA 2QWPA 3H1QA 3SLCA 3MN6A 4F9OA 3R9PA 2GELA 4BREA 3VENA 1RGIA 1D4XA 1YAGA 2QXLA 5AQMA 4BR0A 3WUHA 3C0BA 3J8AA 2YHYA 3CJ1A 5BRFA 1NGGA 5FPEA 4BC2A 3DWLA 5B8HA 1T6CA 2W40A 3EO3A 4AM6A 3QFUA 1MWKA 3A0IX 3O08A 4XH5A 3D2EA 2YCHA 2QW9A 2UYTA 4FWOA 3CQYA 3OHRA 3WEEB 2GEMA 5BPMA 4Z94A 4L3QA 3FZMA 1P8ZA 2NRHA 4NB4A 4BRAA 1NM1A 2QWRA 2GWKA 2IVNA 3CERA 1BO5O 4IXCA 3CQXA 3LM2A 4I6MA 3SMSA 2EWSA 4JHDA 3W3DA 2Q1NA 1NGBA 2YI1A 2YHXA 3EKUA 4DCHA 1YXQA 3VEOA 3ATUA 3O6WA 2ASOA 4FPBA 4XEIA 3VERA 5AR0A 3RSEB 1X3MA 3D2EB 3AAPA 3FFKB 4NO7A 1SQKA 5KPRA 1ESVA 4BG9A 3I33A 2FXUA 3H3OB 1DEJA 4BRHA 5BREA 4CJ7A 3VF6A 3P4IA 1ZC6A 2AA4A 4JD2B 3VETA 3C7NA 2IVPA 1HX1A 4FL9A 2P9IA 3VPZA 4FWMA 2VCPA 3AAQA 3H1VX 4FPAA 2V7ZA 3ZEUB 2FSNA 1ATSA 4BRGA 1GLJO 4O8KA 4EHUA 2GTDA 3CJCA 1TYQA 3ZETB 1JCFA 1NGHA 1ATRA 2A5XA 1QQNA 5AZIA 4CBWA 2A6AA 3CJBA 5FPDA 2P9NA 5EVZA 2HF4A 2P9KA 4CD1A 3HBTA 4BRPA 5BR9A 4XH4A 5I9EB 3IDHA 3O80A 1C0FA 3UKRB 4BRFA 3DJCA 4WQ4C 4A2AA 4BRNA 4DQ8A 4BR2A 1Z6RA 4PKIA 1HPMA 4YDUA 5EXWA 3TU5A 4IO8A 5FPMA 2FSJA 3FZHA 2IVOA 5ELZA 4B9QA 3WQTA 5AQZA 2E8AA 2GWJA 1C0GA 1NGFA 3VEXA 4H5RA 1QQOA 1WUAA 4K25A 1E4FT 1DGKN 4B1XB 3UE5A 4H0YB 3A8YA 3BP8A 4BQLA 1LCUA 3FE1A 4QS8A 2FLOA 1U2VA 4RWTA 5EY4A 1BOTO 4BRKA 1SZ2A 4H0TB 1NBWA 5AFUA 1XUPO 1NGEA 1Y64A 3VGMA 3HSCA 3VOVA 1NGAA 3QBWA 1TUYA 1GLAG 1BUPA 2YJEA 1OKJA 4LC9B 2HOEA 3WEEA 4H0PA 4BR5A 4FO0A 5KPTA 2YHWA 4H0OA 2D4WA 4WQ5C 5JLFA 4EHTA 2FF6A 5EX5A 1KAZA 1BG3A 2H3GX 3QBXA 1BWFO 5AFUH 3U9ZA 2V52B 4GNIA 4B1WB 3IUCA 4CD3A 1U2VB 1LOTB 1BU6O 2GUPA 2A40A 3RSEA 3G25A 3M1FA 5AQNA 3ULEB 4GY2B 5AQQA 1NGCA 5AQUA 4BRMA 5LJWA 3WXLA 4A61A 4PKGA 3U4LA 1WOQA 5EOYA 1E4GT 1V4SA 4JD2A 1MWMA 2PBDA 3QB0A 1CZAN 1MA9B 3AARA 5BN8A 3LDLA 4CZMA 2F9WA 2DPNA 3CHWA 3M3ZA 3CJAA 4MO5A 1KXPA 3EKSA 3WT0A 3ZEUA 5AQTA 1MDUB 1J6ZA 4K43A 3ULEA 4QS9A 4Y0WA 4A62A 2P9LB 4BC3A 2E20A 4MLEA 5AQWA 2QWMA 3H6EA 2HMPA 3ENHA 4QS7A 4BG8A 4A2BA 4ISFA 3ZETA 2E2OA 5BN9A 3GOIA 4EFHA 5BPNA 3O8MA 4BC5A 1GLDG 3HI0A 1NGIA 3EZWA 2ASMA 5AQGA 4EIAA 5KQ8A 4O5FA 4BR4A 3CETA 3WXKA 3O1WA 4BRCA 3MK6A 2ZF5O 3UKUB 2YJFA 4BVOA 2P9PB 3FGUA 1HKCA 5LY3A 1NWKA 3ENOA 4K41A 4BRQA 1JCGA 3UKRA 4H5VA 2BTFA 5E26A 5JICA 2AP1A 1EQYA 3FZKA 2E88A 3R6MA 3VEWA 2NZTA 3SK3A 2CGLA 1GLLO 2E2NA 3KZBA 4MLHA 4CZFA 5CE3A 3DXMB 3BF1A 4CI6A 1QZ5A 2NLXA 5AQVA 1NGJA 2V51B 1QHAA 1Z05A 4BRIA 3H45C 2Q2RA 5F1XA 4CBXA 3FZLA 2Q0RA 2F9TA 1SAZA 4M7YA 4FWLA 2CH6A 3D2FB 5ADXA 3A5LC 1V4TA 3WXJA 2E1YA 3MCPA 3HM8A 1IG8A 3GDQA 4FOEA 4H0VB 4IZ9A 5F0XA 3EN9A 3O1BA 4M7XA 3L4IA 3KHYA 4J8FA 5KPZA 1X9JA 5FPNA 1K8KB 3VGKA 2D0PA 3M6GA 2P9SB 3ZX3A 4CZIA 4M63C 4B1ZA 4E1JA 3LDNA 1S22A 3VESA 1DKGD 5ADXH 5AQOA 4H5NA 3DAWA 3LDQA 1IJJA 5AQJA 3CJ9A 2D1KA 3F9MA 2ZWHA 4WYBA 3HTVA 5AQXA 1T6DA 5F2RA 4FOIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AY9A 4AHSA 3NAEA 5GAGP 3LDOA 4RG8A 4CJVA 4RW8A 4FWKA 4DV2K 3GL1A 2Z1HA 3I8BA 1T44A 5AJ3K 1LWFA 1GLBG 3GBTA 1CHZA 1VQMN 5KTQA 4YOTA 1FH3A 4KHQA 3O3HA 1NRAA 5AQIA 1B9DA 2ZGYA 5JENA 3MN7A 3NH0A 3GG4A 1KC8O 4JRQA 2LI7A 4PKHA 5J2PA 3MCAB 1A5WA 1S6QA 3NH1A 4CZHA 4QAGA 3UKUA 3T1YK 3K2PA 3OTOK 3CCMN 1ZU3A 4JLHA 4FM1A 1NNEA 4DF8A 3WQUA 4GKKK 3V81A 1S1VA 1JCEA 4BGBA 2M8BB 3CMEN 2QWLA 2J4RA 3ZX2A 2F8TA 1FW6A 1H1VA 2IS3A 4FK2A 2ASCA 1SKRA 3R3LA 4BC4A 5C10A 3NCIA 1TKZA 4BDZA 4AM7A 4K42A 2QWOA 1HJOA 4B9LA 4H5TA 3KD5E 4C23A 3PO4A 4AH9A 2OTLN 1KVAA 2HNYA 2YBRC 2G8FA 4WF9L 2O4IA 3KLIA 4CHYA 2D0OA 2VWBA 4JI7K 5K14A 3S5TA 1QS4A 1Q8IA 2C1GA 4ISEA 3HT3A 4GV6A 3HP9A 4DTRA 3RMAA 1KAYA 4FWPA 4BROA 3IG1A 1JJ2M 2N2QA 2IOCA 1ZBSA 4CIFA 4FZYA 3BDPA 1BQNA 1ILYA 1HUXA 1K8KA 3I8DA 3TPQA 3VF4A 5C42A 4WQ5A 1JLCA 3AV9A 2YEOA 3GE1A 4CZJA 2A41A 4CZKA 4E7HA 5JMVA 1D8YA 2O8FA 4I6MB 1SKSA 2P5OA 4OPKA 3T3FA 4NYFA 2QWNA 2D0BA 5AQFA 3O5BA 3ZSOA 4AHTA 4KB1A 3TSQA 1RT2A 3KLFA 4DTJA 4CHOA 1T03A 1A5XA 1VSKA 4KBOA 4XH1A 4YOVA 2UUBK 3MEEA 3EZ5A 2QWQA 2YHAA 4CGGA 4CW7B 1U6ZA 4J2EA 3TR8A 3C6HA 2GUIA 3M5RA 3J80O 3S9HA 5M1FA 1RFQA 1LQIA 2BE2A 4DV0K 4O5BA 3SCXA 1UOCA 2KBKA 3U8XA 3D6RA 4IG3A 1TYQB 2Q31A 2HW3A 3SF4D 3CYMA 1B92A 3TAEA 5BPLA 2CH5A 5KRTA 4CHZA 4E1MA 1GOBA 4N76A 2UUAK 4RTFD 4OX9K 1RTIA 3DXKA 5M1NA 4E7KA 1HNVA 3QDKA 4JKEA 4F3OA 4FK0A 1TGOA 2JWLA 3SLCA 1ASUA 4CJTA 3R9PA 1X9MA 2IC3A 3SAFA 4CIGA 4AHRA 1RDDA 2OPQA 3P38A 2SN3A 2VWKA 4GVEA 4BR0A 3K5LA 3VQ9A 2QEXN 1D9DA 4CFCA 2O8CB 1Z26A 1E3MA 1NGGA 2E3FA 3LP2A 5B8HA 3AO3A 1T6CA 3ZT3A 3EO3A 1MWKA 2F4VK 4GV3A 4H4OA 1XWLA 3SPYA 4A5BA 3RRHA 2YCHA 2UYTA 2N66A 4NLCA 3J81O 1YHQN 2KYQA 5BPMA 3KKRA 5H1SQ 4E7JA 2NRHA 4NB4A 4CFAA 4CJWA 1QSSA 3QNOA 3IRXA 4FJ9A 3SMSA 4JHDA 1XNRK 3AGKA 4B9TA 4MFBA 3ID6A 2G8WA 3NH2A 1WN7A 2PYJA 2ASOA 3K5OA 5DK5A 3PX4A 1YJWN 5AR0A 3G6EN 1L3UA 3FFKB 3NF6A 1ICAA 1SV5A 2JLEA 5KPRA 3SQ0A 2FXUA 1L5UA 3NF8A 1WSHA 3H3OB 4YOYA 5BREA 1CXUA 2DFFA 3CCUN 2KQ2A 3QEVA 3OJSA 5JVGL 3K9JA 4FWMA 2ITGA 3L2VA 1HNIA 4X62K 2FSNA 2O8EB 4U67L 3DLBA 3HPOA 5C2FA 3CC7N 3ZSZA 1NJIO 5JS2A 3G10A 3RMCA 4CF2A 5HRNA 3BZCA 1SL2A 1NGHA 1ATRA 4AHCA 3ZSQA 4CBWA 2B6AA 3HO1A 2RF2A 2P9NA 3HYFA 5I9EB 4BRFA 2G2KA 2ZJRL 4DV3K 4A2AA 5LMNK 1TVRA 4DQ8A 4BR2A 1Q9YA 3QI7A 4IOAL 3LZJA 1U49A 3TU5A 3NFAA 4CK2A 4KREA 2A1SA 3WQTA 5AQZA 5CZ2A 2E8AA 1C0GA 4BDYA 4H5RA 4FZXC 4NXNK 1QQOA 1WUAA 4KYPA 1TAQA 1A5VA 4BQLA 3A8YA 3CFPA 1WSJA 4GMJB 3RR7A 1ZBUA 4B9NA 5C2DA 3CF5L 1S1UA 4DTMA 1U2VA 3RMDA 2LN8A 1BQMA 5AFUA 3ULDA 3OS2A 3DMJA 2XY5A 3HSCA 3OY9A 4NYNA 4O0JA 5T7BA 3AO1A 4BE7B 4PHTX 2YJEA 1RT5A 2HOEA 2QA4N 1AHOA 2VG7A 4O44A 3HXMA 2DY4A 3U6FA 2YHWA 4LF9K 4FJJA 3OYBA 4WQ5C 4PA1A 4CEZA 1TKDA 2XHBA 1KAZA 1IH7A 2H3GX 3LP3A 3QEWA 3CM5A 4Z4IA 1U2VB 1BU6O 3L2WA 2Q3SA 2E6LA 3K58A 3ULEB 2HHHK 4JKCA 4FK4A 5AQQA 4BRMA 3TWHA 3KHWA 1IBLK 4PKGA 5EOYA 3NDKA 1M1KO 4E7IA 1ZYVA 2IDOA 4FJIA 5MLCQ 3AVCA 3CG7A 3AARA 1NJXA 1VQLN 2W00A 3ZSRA 3DM2A 3WT0A 1NU0A 2GV9A 4K43A 4A62A 2P9LB 2YIPA 4ELTA 2QXFA 3H6EA 2HMPA 4QS7A 3TSUA 4CJUA 3OYHA 1TAUA 4JS4A 2D0CA 3I0SA 4WFNL 3TTFA 3GOIA 3KK1A 3EE9A 3O8MA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3AY9 A;  4AHS A;  3NAE A;  5GAG P;  3LDO A;  4RG8 A;  4CJV A;  4RW8 A;  4FWK A;  4DV2 K;  3GL1 A;  2Z1H A;  3I8B A;  1T44 A;  5AJ3 K;  1LWF A;  1GLB G;  3GBT A;  1CHZ A;  1VQM N;  5KTQ A;  4YOT A;  1FH3 A;  4KHQ A;  3O3H A;  1NRA A;  5AQI A;  1B9D A;  2ZGY A;  5JEN A;  3MN7 A;  3NH0 A;  3GG4 A;  1KC8 O;  4JRQ A;  2LI7 A;  4PKH A;  5J2P A;  3MCA B;  1A5W A;  1S6Q A;  3NH1 A;  4CZH A;  4QAG A;  3UKU A;  3T1Y K;  3K2P A;  3OTO K;  3CCM N;  1ZU3 A;  4JLH A;  4FM1 A;  1NNE A;  4DF8 A;  3WQU A;  4GKK K;  3V81 A;  1S1V A;  1JCE A;  4BGB A;  2M8B B;  3CME N;  2QWL A;  2J4R A;  3ZX2 A;  2F8T A;  1FW6 A;  1H1V A;  2IS3 A;  4FK2 A;  2ASC A;  1SKR A;  3R3L A;  4BC4 A;  5C10 A;  3NCI A;  1TKZ A;  4BDZ A;  4AM7 A;  4K42 A;  2QWO A;  1HJO A;  4B9L A;  4H5T A;  3KD5 E;  4C23 A;  3PO4 A;  4AH9 A;  2OTL N;  1KVA A;  2HNY A;  2YBR C;  2G8F A;  4WF9 L;  2O4I A;  3KLI A;  4CHY A;  2D0O A;  2VWB A;  4JI7 K;  5K14 A;  3S5T A;  1QS4 A;  1Q8I A;  2C1G A;  4ISE A;  3HT3 A;  4GV6 A;  3HP9 A;  4DTR A;  3RMA A;  1KAY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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