3LDQA

Crystal structure of hsc70/bag1 in complex with small molecule inhibitor
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
PAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
total genus 121
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ldqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ldqA04
5E26A 2P9IB 4A2AA 3AAQA 4FWNA 1QQOA 4PL8A 3QBXA 4RTFD 2E8AA 5AZIB 4HWIA 3HBTA 4ISFA 5EY4A 1GLCG 2E1YA 2ZWHA 1QQMA 1GLLO 1J6ZA 3CIPA 3D2EA 4B9QA 4JHDB 4BRHA 3O8MA 4ISGA 3CERA 3C7NB 1LOTB 5EXWA 5AQKA 4Y0WA 4BRGA 1ATSA 1NM1A 1ATNA 2YI1A 2DPNA 1U2VB 4XEIA 4CZKA 3BF3A 4H0XB 5BR9A 5JMVA 2AA4A 3OHRA 3KHYA 3VGMA 3MN7A 1X3MA 2YHWA 4O8KA 2P9KA 4H5RA 1ZXOA 3ULEA 1XQSC 3F9MA 1NGBA 1NGFA 3QFPA 3MN6A 1Z05A 3DXKB 1EQYA 1T6DA 3UE5A 3M1FA 1NGHA 3UKRA 1MDUB 5FPDA 3A5NC 2AP1A 3WXKA 1QHAA 3BP8A 2V7ZA 1ESVA 1SQKA 1HKGA 1NGJA 3WXLA 2VWBA 3QDKA 2E20A 5AQQA 3MMVA 4H5VA 3LDPA 3TU5A 3CJ7A 3QFUA 4B1WB 1WUAA 4BC3A 1BUPA 5AQHA 4GY2B 2VYPA 3SLCA 3VENA 3VEZA 3R6MA 5B8HA 5LJVA 3FGUA 2P9PA 3KZBA 5BN9A 3KVGA 3UKUB 3G25A 1ATRA 4FWSA 1NWKA 4WQ5C 2W41A 2P9NA 2P9SB 4YDUA 2HMPA 3S41A 5AQYA 3H1VX 3A8YA 4L3QA 3EN9A 4FL9A 4K42A 5AZJA 2VCPA 4HTLA 5AQMA 2E2PA 1HUXA 2EWSA 3DXMA 1MA9B 1SAZA 5FPNA 1X3NA 2QXLA 3EKSA 3O5BA 3FLCO 3O08A 3CQYA 1TUUA 1D4XA 4MLHA 4BRIA 2D4WA 2Q0RA 3MK6A 3IMXA 4BGAA 1S3XA 5BPNA 2QWMA 4FWLA 3O1BA 4BR5A 4XH1A 4FOIA 5BPMA 4FPBA 5BREA 3CJCA 2CGLA 3J8AA 5BPLA 3LDLA 3H3OB 3IDHA 1C0GA 2P9UA 2J4RA 3ATVA 1G99A 4ISEA 4GNIA 4IXCA 1XUPO 1TUYA 4BR0A 1CZAN 3H6EA 1HKCA 5EX5A 3WEEA 3ZX0A 5JICA 3LM2A 3VOVA 3CHWA 3ZX2A 3ZEUA 4PKHA 3BEXA 1NLVA 4A2BA 2GEMA 2HOEA 3DWLA 5I9EB 2YJEA 1WOQA 2P9IA 2IVOA 3SJHA 4Z94A 2A3ZA 3O4WA 4EIAA 4JNEA 3L4IA 5AZIA 3FR0A 3W0LA 3BF1A 4IO8A 1HLUA 4NB4A 5JLHA 4BR4A 4QS8A 1Q18A 4JHDA 2PAVA 3O1WA 2QWRA 5F1XA 4JAXA 3C7NA 4H5TA 4BG9A 2F9TA 4FOEA 2ASPA 3CI5A 3U8XA 2YJFA 5BN8A 3VF6A 5KPZA 5ADXH 2A6AA 1U2VA 5AQFA 1GLFO 4FWKA 4CZGA 4BR7A 3VEYA 4H5WA 4A61A 2QW9A 4EHUA 4H0PA 2QM1A 3MN9A 3ZETB 4CZMA 5AQSA 5AQOA 4PKGA 3DXKA 4WQ4C 3M6GA 3QB0A 4XH4A 5AQWA 1ZC6A 3CQXA 5KPRA 4H5NA 4BRAA 4FWPA 1YUWA 3M3ZA 3A5LC 3A0IX 2I7NA 4BQLA 4PKIA 1QZ6A 3QBWA 2V7YA 1GLAG 3JS6A 2ITMA 1KAZA 1XC3A 2CGKA 2FSKA 4XH5A 4CD3A 4CZHA 5BRHA 3CJ9A 5ADXA 4JD2B 1JCGA 3WXIA 3GDQA 3L6QA 1K8KB 5E84A 5AQNA 2I7PA 4IJAA 1X9JA 3FZMA 2FLOA 3HTVA 2Q31A 3I8BA 3O80A 4AM6A 1DEJA 4KBOA 5AQTA 3VGLA 3WQUA 3WT0A 3VEOA 4H0OA 3LDNA 2P9LB 2BTFA 3UKUA 2D0OA 3RSEB 2QWPA 1TYQB 4IZ9A 3FZLA 2P9SA 1V4TA 5BRFA 3SMSA 1DKGD 5KQ8A 2UYTA 5AR0A 2IVPA 1U6ZA 2ZF5O 4DB3A 4A62A 2CH6A 4CI6A 2QWQA 2IIRA 5AFUH 3VEWA 3FFKB 4QS9A 4BGBA 2FF3B 4CZJA 3VETA 3BUZB 5TKYA 4K43A 3ID8A 3GL1A 5AQJA 1QZ5A 2CH5A 2YHXA 5AQLA 1IG8A 2YCHA 1BDGA 1NGCA 3AARA 1NGAA 1BA1A 3B8AX 3VF4A 1DGKN 3SK3A 4NO7A 3D2FB 4H0VB 4MO4A 2GELA 2Q0UA 2Q97A 3LDQA 4BC5A 4CBXA 2E88A 1IJJA 4CZIA 2A5XA 4BRCA 5KQDA 3FE1A 2HF4A 5ELZA 3EKUA 4DCHA 2H3GX 4FO0A 4B1YB 4CZFA 4BROA 1YXQA 1T44A 5KPTA 1BG3A 2NLXA 3ENOA 5CE3A 5AFUA 4AM7A 4CJ7A 2E2OA 3EL2A 1Y64A 2Q36A 1RGIA 3FZKA 5EVZA 2A41A 5EOYA 1SZ2A 1KAXA 2D0PA 1T6CA 3L0QA 4YDUC 2QWNA 3UB5A 2FF6A 3ENHA 3GE1A 4CBUA 5LJWA 3CJ1A 3CJAA 1BO5O 1GLDG 2IVNA 4H0YB 3MN5A 4BRQA 3DJCA 4EFHA 2V52B 1NGDA 4K41A 4WQ5A 1MWKA 3ZX3A 3CETA 4FWMA 4FWOA 5FPEA 2Q2RA 2ASOA 3LDOA 3D2EB 3A5MC 3VGKA 4FWQA 4CBWA 4CZEA 4F9OA 3VF2A 3ZETA 3CJBA 4BVOA 1H1VA 1Z6RA 4B1ZA 1ZBSA 4E1JA 2E1ZA 5LY3A 2A40A 3R9PA 3H45C 1GLEG 5AQZA 1YVNA 3LM9A 4BRDA 4BG8A 3AAPA 1GLBG 3WUHA 2GWKA 1HPMA 4I6MB 3VEXA 4I6MA 2P9KB 1V4SA 3EO3A 4BRLA 3ULEB 3HI0A 2NRHA 2OANA 4BRKA 3VESA 4BRMA 5AQUA 1LCUA 3P4IA 5F2RA 4JD2A 3MDQA 1K8KA 1JCFA 2CGJA 4C23A 1C0FA 3UKRB 4EHTA 3DAWA 4BC2A 3I33A 3GOIA 5JLFA 2GWJA 4BRPA 4RCHA 5F0XA 3QMLA 4H0TB 2P9LA 4BC4A 3VERA 3FZFA 1E4FT 3U9ZA 3RSEA 1TYQA 4O5FA 4B1UB 3GG4A 4MO5A 4DHYA 1HKBA 3O6WA 4PL7A 1BWFO 2W40A 3H46O 5AQVA 4CZLA 3H3NO 5AQPA 1RDWX 1QQNA 1R59O 4DQ8A 3WXJA 4BREA 4WYBA 5AQXA 4M7YA 4EAHD 2P9PB 2QWLA 2ZGZA 3ATUA 1HJOA 1KAYA 4K25A 5AQGA 3QICA 4JN4A 5FPMA 2QWOA 1GLJO 4IWVA 1YAGA 2P9NB 2NZTA 5AQIA 4BRFA 3VPZA 4LC9B 1KXPA 1NGGA 1HX1A 4BQZA 3FZHA 1MWMA 2E2QA 3GBTA 1NMDA 4QS7A 3IFRA 5AZJB 4CD1A 3IUCA 1S22A 3DXMB 3HM8A 2HF3A 3MCPA 2V51B 3D7EO 3LL3A 3U9DA 2PBDA 4B1VA 3D2FA 5AQRA 2ASMA 4BR9A 4BR2A 1BU6O 4FSVA 4BRNA 1OKJA 3HSCA 2F9WA 1JCEA 2FSNA 2YHYA 3EZWA 2ZGYA 3TPQA 4M7XA 2E2NA 3JXUA 4IJNA 2GTDA 2KHOA 4M63C 3A5OC 1BOTO 4WQ4A 4MLEA 1E4GT 2FXUA 1BA0A 2D1KA 2FSJA 2P9UB 3U4LA 4FPAA 3AY9A 4B1XB 2BUPA 1NBWA 3W3DA 4FWRA 3WEEB 4BVPA 2GUPA 3R8EA 4J8FA 2Q1NA 4H03B 1RFQA 3ZEUB 4RWTA 3SMPA 1P8ZA 5BRDA 3H1QA 3WQTA 3VEVA 1NGIA 1NGEA 3HZ6A 2A42A 3C0BA 2WUSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O4GA 4CEBA 3ZSOA 4A2AA 3AAQA 3KK3A 1QQOA 1T3VA 4RTFD 3RRHA 3SQ1A 4GV9A 1Q7YO 3M5RA 3DLEA 4HWIA 3HBTA 4ISFA 4L8RB 3R1XA 3M8SA 3O9SA 4IDKA 1SEGA 1GLLO 3D2EA 4H4MA 4BRHA 3AVAA 1NK8A 3CERA 5HOOA 1LOTB 4BRGA 5M1KA 4ILGB 3TTFA 1PTXA 4DFPA 1JLAA 4YNQA 3QLHA 3BF3A 5JMVA 2VQEK 2AA4A 3OHRA 1NRBA 1VSJA 5C0YA 4QOZB 4LH5A 4PHTX 3LPTA 4H5RA 5BR8K 3OS0A 3KIOA 4JK7A 1RBRA 3QFPA 3UE5A 1N4NA 4EZ9A 1NU0A 1NH5A 4BE7B 3AA3A 3NH2A 3NBPA 5LMUK 3UKRA 4DTRA 2X6SA 1IG9A 3ZT0A 2AP1A 3BP8A 2P51A 3AVIA 4UQGA 3SCXA 4HVJA 4FK2A 1QVGM 1T05A 4JKGA 1VNAA 4E7JA 4CGIA 2E20A 2R7YA 4H5VA 2FBVA 3VQAA 1VRUA 3CFPA 1BHLA 3U6FA 2B3CA 2KKZA 3O3FA 3EE8A 3VENA 1RTJA 3FGUA 2LR3A 4JI3K 4CHZA 3KVGA 4FWSA 3D6RA 3HJFA 2P9NA 2P9SB 4YDUA 4LFBK 1VQNN 2NY8X 1J9AA 1I2UA 4CESA 4L3QA 1OH6A 4FL9A 4K42A 5AZJA 4HHTA 5AQMA 1BK8A 4B9LA 4RG8A 3QEXA 2E2PA 1HUXA 2EWSA 2I5JA 2UXCK 1MA9B 1SAZA 3ZSRA 4DG1A 3OYAA 4MLHA 1Z25A 3MK6A 5BPNA 4FWLA 2QXFA 4BR5A 1HPZA 4FOIA 3OYLA 3CJCA 4JKFA 2Q3SA 3KJVA 3LDLA 1EO1A 4JI8K 2SN3A 1C56A 1T7PA 3KKRA 3OJUA 4ISEA 5FLXO 1XUPO 3OJSA 3K0SA 2QKKA 3WEEA 3KLEA 4K8ZA 4IOCL 5DM6L 1O13A 3AO3A 3BEXA 1XRSB 4KYPA 1IBLK 4FXDA 3VN5A 3PSIA 4E7LA 5I9EB 1RTDA 3SJHA 1TL3A 4EIAA 1LAVA 2Z1HA 3L4IA 3W0LA 3ZCMA 1POIA 1NE5A 4GVMA 4DR7K 3TR8A 4NB4A 4N5SA 4X62K 4KH4A 1VAZA 4B8AB 3O1WA 4JAXA 4CK1A 4E1NA 4FOEA 1T03A 4JV5K 2YJFA 3HL8A 4ZTFA 2A6AA 1N33K 4OPKA 4KTWA 1A5VA 4LF5K 2F7TA 4E7KA 4BDYA 2HNZA 4E7IA 4CHPA 4FM2A 1FKPA 1D9FA 4CZMA 5AQSA 4AB0A 4AHSA 4PKGA 1VSIA 4FCYA 4LF6K 3THYB 4WQ4C 4KPYA 3NF8A 1KTQA 2A1RA 4V19S 2YIPA 2OPSA 3ASMA 4FJJA 2IGIA 2KPYA 4JI7K 4CF8A 1WBDA 1CXQA 1OH8A 4KRFA 2NRVA 2LI7A 1GLAG 3JS6A 4YOWA 3SNNA 4DV2K 1KAZA 3PV8A 2FSKA 3HVRA 1FK9A 3T7ZA 3CJ9A 1JCGA 4DV1K 2LKBA 1YF5L 5E84A 5AQNA 1MYNA 2FLOA 4AM6A 2Q31A 2B68A 4LF8K 3WQUA 4KHUA 4HUEA 5CYMA 3RSEB 1NJYA 4M3XA 3FZLA 2P9SA 1V4TA 3BZKA 4CJEA 1F21A 4C1NI 4CJTA 1TK5A 1WSJA 1K9MO 1WT7A 1U6ZA 2HHTA 2HSTA 4DB3A 4A62A 4CI6A 5AFUH 2IIRA 4YOYA 2O8BB 2A1SA 2FF3B 3AVBA 1EP4A 3VETA 5TKYA 2F8SA 1C0TA 3IG1A 2QTDA 4HE7A 3CC7N 2YHXA 4FZXC 1C6VA 4IG3A 1NGCA 3BK3C 3AARA 1BA1A 3OYMA 1NJXA 3VQ4A 4JKBA 1KLNA 4WFBL 1J54A 1AYJA 4CJSA 3ENBA 3WNFA 2Q0UA 3LDQA 1RT1A 2FBTA 2E88A 4MFBA 1NK9A 2KYQA 3MAQA 3MEGA 4CZIA 4BRCA 5KQDA 3FE1A 4V1DC 3EKUA 3DMJA 2H3GX 3H08A 1LQHA 4MDAA 2G8IA 2NLXA 3CFOA 1OH7A 1BCGA 4DUZK 2YC1C 3SF4D 3CCMN 2P5OA 1GOCA 2HHXA 3DLHA 4R5PA 3AVCA 4Z0UA 1SUQA 1I39A 2JDQD 2D0PA 3O4QA 3OYCA 2NRZA 3L0QA 1CLQA 4DS4A 1UA1A 2FF6A 2B4JA 4CBUA 3KWGA 4KREA 1GLDG 1IBKK 3TTDA 1NGDA 3WNEA 2KBHA 3C6UA 3ZX3A 4W5RA 4CIEA 5FPEA 3LZIA 2Q2RA 2ASOA 3LDOA 2HB5A 3A5MC 4CEAA 3KLIA 5M1QA 4CBWA 3CJBA 3HP9A 3PUFA 5KGWA 1H1VA 1Z6RA 2ZQBA 3KOWA 3THYA 1JJ2M 3CFRA 1X9SA 4LF7K 2E1ZA 2EHGA 3ALYA 4YHHK 3H45C 1GLEG 2W42A 2NUBA 1YVNA 4BRDA 4BG8A 3SAHA 3NH1A 1GLBG 4I6MB 1NRAA 2P9KB 4BRLA 1KCFA 3L56A 4F4KA 4DUYK 3DRRA 4BRKA 4LY7A 4LFAK 3LAMA 1KFDA 3P4IA 3AO4A 4W5OA 3SAFA 2P1JA 4DTPA 1C0FA 1JXBA 4CGHA 4KH6A 3I33A 3GOIA 5JLFA 2RPIA 1KVBA 1JL1A 1UA0A 3VERA 3NF9A 3U9ZA 3PIPL 4NLCA 3RSEA 3V81A 1N8RO 1Q8IA 4O5FA 4Y1DA 1U48A 2OPRA 1DT9A 4MO5A 4CEZA 1JLFA 3TABA 3DLGA 2KZMA 1BWFO 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2O4G A;  4CEB A;  3ZSO A;  4A2A A;  3AAQ A;  3KK3 A;  1QQO A;  1T3V A;  4RTF D;  3RRH A;  3SQ1 A;  4GV9 A;  1Q7Y O;  3M5R A;  3DLE A;  4HWI A;  3HBT A;  4ISF A;  4L8R B;  3R1X A;  3M8S A;  3O9S A;  4IDK A;  1SEG A;  1GLL O;  3D2E A;  4H4M A;  4BRH A;  3AVA A;  1NK8 A;  3CER A;  5HOO A;  1LOT B;  4BRG A;  5M1K A;  4ILG B;  3TTF A;  1PTX A;  4DFP A;  1JLA A;  4YNQ A;  3QLH A;  3BF3 A;  5JMV A;  2VQE K;  2AA4 A;  3OHR A;  1NRB A;  1VSJ A;  5C0Y A;  4QOZ B;  4LH5 A;  4PHT X;  3LPT A;  4H5R A;  5BR8 K;  3OS0 A;  3KIO A;  4JK7 A;  1RBR A;  3QFP A;  3UE5 A;  1N4N A;  4EZ9 A;  1NU0 A;  1NH5 A;  4BE7 B;  3AA3 A;  3NH2 A;  3NBP A;  5LMU K;  3UKR A;  4DTR A;  2X6S A;  1IG9 A;  3ZT0 A;  2AP1 A;  3BP8 A;  2P51 A;  3AVI A;  4UQG A;  3SCX A;  4HVJ A;  4FK2 A;  1QVG M;  1T05 A;  4JKG A;  1VNA A;  4E7J A;  4CGI A;  2E20 A;  2R7Y A;  4H5V A;  2FBV A;  3VQA A;  1VRU A;  3CFP A;  1BHL A;  3U6F A;  2B3C A;  2KKZ A;  3O3F A;  3EE8 A;  3VEN A;  1RTJ A;  3FGU A;  2LR3 A;  4JI3 K;  4CHZ A;  3KVG A;  4FWS A;  3D6R A; 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