3LDQA

Crystal structure of hsc70/bag1 in complex with small molecule inhibitor
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
PAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
total genus 121
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ldqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ldqA04
3WXKA 1WOQA 2AA4A 4MO5A 3MCPA 1TUUA 4JD2B 3FR0A 5AQUA 3MN5A 3MMVA 1NGAA 4RTFD 4JHDA 3ZX3A 1YXQA 2QWLA 2HMPA 1X3NA 1QZ6A 1NWKA 1U2VB 1HLUA 3H3OB 1T6CA 4H0XB 3CJ7A 1QHAA 5AQFA 4JN4A 4MO4A 4BC4A 4BG9A 1X9JA 4CZHA 1KAYA 4AM7A 3U9ZA 3H46O 4GY2B 5FPNA 4DB3A 3O08A 4M7YA 4WQ4C 5AFUH 3ZETB 3VEOA 3ENHA 1GLLO 3JS6A 4WQ5C 3R6MA 4IJAA 2HOEA 3VGMA 4B9QA 4BRQA 5KPTA 1NGGA 2GWJA 4J8FA 4BREA 5KQDA 1S3XA 4IO8A 4K25A 2E2PA 1DKGD 2GEMA 3EKUA 4ISGA 3VGKA 2QWPA 1SAZA 2Q36A 1R59O 1T6DA 1V4TA 4FWPA 1MWMA 2QWMA 3VPZA 4PKGA 4BC3A 3HZ6A 2FXUA 4AM6A 3OHRA 5LY3A 4C23A 2VCPA 1NLVA 3LDQA 4CD1A 4BG8A 2CGJA 3I8BA 3BF1A 4LC9B 4H5RA 3MN9A 2KHOA 1ATRA 2QWOA 4XH4A 1GLFO 5AQPA 4M63C 5BREA 1WUAA 2A6AA 3D2EB 3H6EA 3KHYA 2P9KA 3VEXA 2E1YA 2F9WA 3L0QA 2A41A 4DCHA 3HTVA 2E20A 2IVPA 2W40A 3CJAA 3WQUA 5AQYA 2E88A 1BG3A 1ESVA 4FWNA 3UKRB 5AQGA 3DJCA 1GLBG 3JXUA 5KPRA 5EX5A 3RSEB 4EIAA 5LJVA 4H0PA 4BQLA 4EFHA 2VYPA 2QWNA 3L4IA 2CGKA 5AQTA 4JAXA 3BEXA 3UKUA 3AAPA 3CJ9A 1LCUA 3KVGA 4H0VB 4M7XA 2WUSA 2D0OA 3U8XA 4JHDB 5AQJA 3H45C 3D2FA 5TKYA 4BR7A 4O5FA 3TU5A 1TYQA 4PL8A 4B1XB 3MN7A 2CH5A 3S41A 3WEEA 2E2QA 1MA9B 3UE5A 1KAXA 3SK3A 3VGLA 4BRNA 3A0IX 3HBTA 2YJFA 3FZLA 3LDOA 3HSCA 4A62A 3L6QA 5BRDA 1KAZA 1JCGA 3ZEUA 2P9PA 1ATSA 1P8ZA 5BPMA 2FF6A 2DPNA 1XC3A 4I6MA 3WXJA 3C0BA 4BRFA 1YVNA 4H5NA 1MWKA 4ISEA 4IZ9A 3R9PA 4IJNA 4Y0WA 5BPLA 3BP8A 3H3NO 4A2AA 3HM8A 3AARA 3O8MA 5AZJA 5BR9A 3G25A 4BC2A 2A40A 4BRCA 1D4XA 3FZMA 1ATNA 4MLHA 3C7NA 5BN8A 3A5OC 4BGAA 5AQHA 4FWMA 4F9OA 5EVZA 3O80A 3SLCA 3CJCA 1V4SA 4PL7A 1SQKA 2FSJA 3WXIA 4BRKA 2BTFA 2P9KB 2YI1A 3U4LA 2FF3B 1J6ZA 3BUZB 1YAGA 3VERA 4H5WA 1ZBSA 2YJEA 4K41A 3EO3A 3W0LA 1DGKN 1ZXOA 4CZKA 1S22A 5EOYA 3IUCA 1NGBA 5E84A 2NZTA 3CERA 4CZIA 5JLFA 4YDUC 2GTDA 2PAVA 3CQYA 4QS8A 3UKUB 3WXLA 2CH6A 4EHTA 5AQXA 5KQ8A 2NRHA 2P9NA 1TUYA 1NGHA 3VOVA 2UYTA 1BA0A 4QS7A 3LM2A 2V52B 3A5NC 3EZWA 3CHWA 3VF4A 2FSNA 3FGUA 1RGIA 3U9DA 3D2FB 3DXMA 3FE1A 1TYQB 4IXCA 5I9EB 4GNIA 3BF3A 1OKJA 4H0YB 4CBUA 4RWTA 2ASOA 1MDUB 3WEEB 3GBTA 4CJ7A 4QS9A 5AQWA 3FFKB 1RDWX 4BC5A 2I7NA 5AQZA 4B1VA 2P9UA 2NLXA 5AQIA 1BU6O 5JLHA 1KXPA 3M6GA 3O1WA 4BR0A 2H3GX 5AQVA 3CETA 4BR9A 1NGDA 3H1VX 1ZC6A 2P9PB 5AR0A 2P9LA 3QDKA 3ZEUB 3ZX2A 5ELZA 2QXLA 4I6MB 1GLEG 2A3ZA 2YHXA 2ZGYA 3D7EO 4CZMA 4MLEA 1HKCA 2IVNA 1X3MA 1XQSC 2HF3A 2QM1A 3O6WA 2V7YA 3VEVA 2BUPA 1DEJA 4JNEA 1NMDA 3AY9A 5AZJB 4CZJA 3MK6A 2F9TA 3CJ1A 4HTLA 4WYBA 2CGLA 1GLDG 3LM9A 3LDLA 3HI0A 2P9SA 1NGCA 3C7NB 5BRHA 1HUXA 1C0FA 5AQQA 2ASMA 3MDQA 3LDNA 3CJBA 3FLCO 1BDGA 1T44A 5E26A 4BRPA 5F1XA 3ENOA 2A5XA 1HPMA 4WQ4A 3FZFA 3P4IA 4BRAA 1HX1A 3W3DA 4A61A 1XUPO 5BN9A 1GLAG 4WQ5A 5KPZA 3DXKA 4H5TA 4DQ8A 3CIPA 2E8AA 1K8KA 4FWRA 4CZGA 1BUPA 3O4WA 1BOTO 1YUWA 1QQNA 2E1ZA 4BRIA 1QQMA 2ZWHA 5ADXA 4HWIA 2P9NB 3GDQA 2AP1A 2I7PA 1E4FT 2EWSA 3VF6A 4FOEA 5FPMA 4CZFA 4O8KA 4PKHA 3VEZA 3ULEA 5FPEA 4EAHD 3IFRA 3VETA 3DXMB 5F2RA 4BGBA 2QWQA 1JCEA 2ITMA 4B1WB 2YHWA 3SMSA 1IG8A 4CBWA 5LJWA 2A42A 2E2OA 4FPAA 4KBOA 1HJOA 3I33A 2D1KA 2HF4A 1Q18A 5BPNA 2IIRA 4E1JA 5JICA 1CZAN 1HKBA 1Z6RA 3UB5A 4BRGA 4BR4A 2GWKA 4EHUA 2FLOA 1NM1A 1HKGA 3A5LC 1BA1A 2P9UB 3EKSA 4FPBA 3LL3A 3GE1A 4BROA 3M3ZA 3WQTA 2FSKA 2Q31A 5EXWA 5F0XA 2D4WA 2P9IA 5AZIA 4DHYA 3EN9A 2P9LB 3QMLA 2QW9A 1JCFA 4FWLA 2D0PA 4XEIA 5AQLA 4BRDA 4H0TB 2PBDA 4BRLA 3QBXA 3QFPA 2Q97A 1NGJA 3CI5A 4CZLA 1Z05A 4FWQA 2GUPA 1NGFA 4RCHA 4FL9A 1U6ZA 3QBWA 4NB4A 2J4RA 4JD2A 5AQNA 1SZ2A 3FZHA 1GLCG 3R8EA 2P9SB 3A8YA 4FOIA 2V51B 4FWSA 4FO0A 1U2VA 2YCHA 5CE3A 2ASPA 1QQOA 4B1ZA 3VESA 4L3QA 3FZKA 3ZETA 4CZEA 4H5VA 1Y64A 4CBXA 5ADXH 5AQRA 2Q0RA 3F9MA 5AQKA 3WT0A 1E4GT 4Z94A 2E2NA 2VWBA 3TPQA 3DXKB 1QZ5A 3VEYA 4FWKA 3VENA 3ZX0A 4A2BA 1K8KB 3QICA 4BR2A 1H1VA 5B8HA 3ATVA 3QFUA 3O1BA 3VEWA 5EY4A 1BO5O 1G99A 4BRMA 5FPDA 4ISFA 3ATUA 2Q1NA 5AFUA 3SMPA 3DAWA 3M1FA 2YHYA 4FSVA 3EL2A 4K43A 2Q2RA 4FWOA 4BVPA 4IWVA 3GG4A 3ULEB 3GL1A 3A5MC 1NGEA 2OANA 3ID8A 1C0GA 4PKIA 4BRHA 4BR5A 4BVOA 4CD3A 2V7ZA 3H1QA 4H03B 2W41A 4K42A 5BRFA 5JMVA 2GELA 4B1YB 2IVOA 1GLJO 5AQSA 3CQXA 4XH1A 4H0OA 4NO7A 2ZGZA 4BQZA 1NBWA 2QWRA 1RFQA 2ZF5O 1EQYA 5AQOA 1BWFO 3WUHA 4B1UB 3D2EA 3DWLA 3GOIA 3IMXA 3B8AX 3AAQA 2P9IB 3MN6A 1NGIA 5AZIB 3VF2A 3O5BA 1LOTB 3J8AA 3QB0A 5AQMA 3UKRA 3IDHA 3LDPA 4XH5A 3KZBA 3RSEA 3SJHA 4CI6A 1IJJA 2Q0UA 4YDUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Z1HA 3WXKA 3AO2A 3KD1E 4LF4K 4XJXA 3SUQA 2LT8A 4JD2B 3IG1A 4JHDA 1VSMA 4BWMA 3ZX3A 4PUOA 3BZKA 2HMPA 3NVMA 1B7DA 4DQIA 3G10A 1NWKA 1RDDA 4CJLA 4BC4A 1X9JA 1KRPA 1KAYA 4DB3A 3H08A 1EWRA 3RRHA 2BRZA 3SCXA 1T0ZA 1T8EA 2YV0X 1GLLO 2GUIA 1ZVEA 1TGOA 3TAQA 1GPTA 1JLAA 4B9QA 1SL2A 1NE5A 2GWJA 3V1QA 3ZSRA 4E7HA 4DSJA 1I6GA 4BDPA 4KHPK 2E2PA 1A5VA 1L3TA 3TTDA 4CFCA 3BGRA 4OLAA 3P31A 3DLHA 2NY8X 3QEIA 1V4TA 1WNSA 4DV2K 1OVYA 4FWPA 5IT9O 3LZJA 2QWMA 3THVA 4PKGA 4BC3A 3OHRA 5LY3A 3CCVN 3CD6N 3M8RA 1NLVA 4W5RA 3PLAA 4CD1A 2FBTA 3KLHA 5CYQA 4LFCK 3I8BA 4DMNA 1WSEA 2HBKA 4LC9B 4KTQA 2O8FB 2F8SA 3VQ5A 2OA8A 3MN9A 3NBPA 4M42A 4M41A 4DU3A 4HCCA 2QWOA 4OGCA 4LSNA 1NPIA 3H6EA 4KI6A 2P9KA 2IOCA 3Q7CA 1UWBA 3SPZA 2E20A 4DR2K 4GV9A 1QSSA 2QA4N 5AQYA 4DR4K 1BG3A 4E1MA 3DJCA 5KPRA 2DTUA 3QERA 5HRPA 4E7KA 3KWGA 2HB5A 1RBVA 3LAMA 4EFHA 4F2SA 2QWNA 3BEXA 4B3RK 2MBKA 3TI0A 3DYAA 1RT3A 3ZCMA 3CJ9A 3L2QA 1LCUA 3I8DA 4PA1A 3G71N 3J81O 5AQJA 1BIZA 3O3GA 4W5QA 3ZSXA 4G9ZA 4BR7A 1JLBA 1TYQA 2BANA 4B1XB 3R1XA 3QIPA 3S41A 4IFVA 3WEEA 4UY8O 3SQ4A 3K9KA 4BRNA 2I5JA 3G0ZA 1HNXK 2D0BA 1ASUA 3V81A 1RTIA 3EZ5A 3THXB 2EX3A 3P38A 1C56A 3SF4D 4FM1A 3DLLL 1P8ZA 5BPMA 2YNGA 3C6UA 4FLWA 4FJIA 4WFBL 3KOWA 2LJ7A 3L56A 2BH1A 3C0BA 4BRFA 3SQ0A 2PYLA 1MWKA 1OMYA 4ISEA 4IZ9A 1CZBA 4IJNA 4CJWA 2OZSA 2KFZA 3HM8A 1IKYA 3O8MA 4KB0A 4CJ4A 5GAHP 1QQCA 2QK9A 2HHSA 1PE4A 4QOZB 1SN4A 3VMFB 3SZ2A 1X9SA 1WLJA 5H1SQ 4LH4A 4LH5A 5EVZA 4PHTX 3SLCA 2F4VK 1V4SA 4BRKA 1N32K 3RRGA 3DLKA 1RT1A 3A2FA 1XNRK 4CJQA 4Z4IA 4H5WA 1ZBSA 4GW6A 4ZHRA 5EOYA 3HVTA 1NMNA 5E84A 3OYDA 5JLFA 3K58A 4O44A 4QS8A 3L4QA 3KP1A 4EHTA 1CXQA 5I42A 4M3WA 1NGHA 2XY8A 3AA5X 1Q82O 3VOVA 2UYTA 4QS7A 2V52B 3A5NC 3EZWA 3CHWA 3L3UA 2HW3A 3U9DA 3D2FB 3DXMA 4IXCA 2KQ2A 3KK7A 1OKJA 1RTJA 2ASOA 1MDUB 4A57A 3KLIA 3LALA 1TAUA 4CJ7A 3PSIA 1LQQA 2HNDA 4BC5A 2ZD1A 3D6RA 4BE2A 5CZ1A 5JLHA 1BHLA 4KFBA 5AQVA 1DT9A 5GAGP 3THWA 4ID1A 2QI2A 1A5WA 1JLFA 1ZC6A 3RVCA 3ZEUB 4IOAL 1KFSA 3CCQN 4I6MB 2LY5A 1VRUA 3OA9A 4MLEA 3VQAA 3VQ9A 1X3MA 3O6WA 4E7LA 2V7YA 2RKIA 2BUPA 3BDPA 4ELUA 2N2QA 3VQ6A 3E1YA 4JI6K 3CJ1A 4HTLA 1I3AA 2CGLA 3LDLA 2P9SA 3AO1A 3C7NB 2NRWA 4CGGA 4FM0A 2JLEA 5M1NA 3E9LA 3RMDA 4DTUA 4DTPA 2JGUA 2W42A 3U6FA 2G8FA 1A5XA 4DFKA 2RF2A 3ENOA 4BRPA 2O8EB 4JEPA 1BRZA 3VQPA 1XI1A 2HBLA 3OS0A 3P4IA 3ZSOA 3NHGA 1YJNN 4FW2A 4BEBA 4DV7K 4Q5VA 4NYFA 4BECA 4DKWA 3VA3A 5JS2A 4AHCA 3DXKA 3NF8A 3PX0A 2E8AA 3WXMB 4NYNA 3LP0A 1DTQA 1KVCA 4JK9A 5D3GA 2ZWHA 4E1NA 5ADXA 4HWIA 3MXMA 4J2BA 1JKHA 4CF8A 5IWAK 4Y1CA 1B92A 3VF6A 1NJZA 1D9FA 5FPMA 3BY5A 1QTMA 4CZFA 3CC4N 3ULEA 2N66A 3DRRA 3MECA 1U45A 1JCEA 4B9SA 4A59A 2A42A 3V9SA 1Q18A 4NCBA 4E1JA 1MR4A 3V9UA 4IBNA 1YHQN 3WQTA 1P0AA 2Q31A 5F0XA 3ZSYA 5AZIA 3AVKA 1BGXT 3QMLA 2QW9A 4YFUA 4ICLA 1NKBA 3KKRA 4M3UA 1G15A 2W6KA 4XEIA 2Q3SA 4M45A 4BRDA 1B3CA 4DQSA 3QFPA 2Y1JA 3OYKA 1J9AA 1Z05A 3AVCA 4FWQA 4W5TA 4FJKA 1NGFA 3MEEA 1Q81O 1U6ZA 2HNYA 3WNGA 4B9NA 4ILHA 1ZBHA 3S3MA 2DFHA 1S6QA 3OYCA 4KH4A 1NK7A 4RW8A 2VG5A 4FWSA 1ZUTA 1GOCA 2YNIA 3C94A 4Z4HA 2ASPA 4EP5A 4M3ZA 1QVFM 5J2NA 3S3OA 1JLGA 1RDUA 4CBXA 5HRNA 5AQRA 2Q0RA 5HRRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2Z1H A;  3WXK A;  3AO2 A;  3KD1 E;  4LF4 K;  4XJX A;  3SUQ A;  2LT8 A;  4JD2 B;  3IG1 A;  4JHD A;  1VSM A;  4BWM A;  3ZX3 A;  4PUO A;  3BZK A;  2HMP A;  3NVM A;  1B7D A;  4DQI A;  3G10 A;  1NWK A;  1RDD A;  4CJL A;  4BC4 A;  1X9J A;  1KRP A;  1KAY A;  4DB3 A;  3H08 A;  1EWR A;  3RRH A;  2BRZ A;  3SCX A;  1T0Z A;  1T8E A;  2YV0 X;  1GLL O;  2GUI A;  1ZVE A;  1TGO A;  3TAQ A;  1GPT A;  1JLA A;  4B9Q A;  1SL2 A;  1NE5 A;  2GWJ A;  3V1Q A;  3ZSR A;  4E7H A;  4DSJ A;  1I6G A;  4BDP A;  4KHP K;  2E2P A;  1A5V A;  1L3T A;  3TTD A;  4CFC A;  3BGR A;  4OLA A;  3P31 A;  3DLH A;  2NY8 X;  3QEI A;  1V4T A;  1WNS A;  4DV2 K;  1OVY A;  4FWP A;  5IT9 O;  3LZJ A;  2QWM A;  3THV A;  4PKG A;  4BC3 A;  3OHR A;  5LY3 A;  3CCV N;  3CD6 N;  3M8R A;  1NLV A;  4W5R A;  3PLA A;  4CD1 A;  2FBT A;  3KLH A;  5CYQ A;  4LFC K;  3I8B A;  4DMN A;  1WSE A;  2HBK A;  4LC9 B;  4KTQ A;  2O8F B;  2F8S A;  3VQ5 A;  2OA8 A;  3MN9 A;  3NBP A;  4M42 A;  4M41 A;  4DU3 A;  4HCC A;  2QWO A;  4OGC A;  4LSN A;  1NPI A;  3H6E A;  4KI6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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