3QFPA

Crystal structure of yeast hsp70 (bip/kar2) atpase domain
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
377
structure length
367
Chain Sequence
YGTVIGIDLGTTYSCVAVMKTEILANEQGNRITPSYVAFTDDERLIGDAAKNQVAANPQNTIFDIKRLIGLKYNDRSVQKDILPFNVVNKDGKPAVEVSVKGEKKVFTPEEISGMILGKMKQIAEDYLGTKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVLRIVNEPTAAAIAYGLDKKEHQIIVYDLGGGTFDVSLLSIENGVFEVQATSGDTHLGGEDFDYKIVRQLIKKKHGIDVSDNNKALAKLKREAEKAKRALSSQMSTRIEIDSFVDGIDLSETLTRAKFEELNLDLFKKTLKPVEKVLQDSGLEKKDVDDIVLVGGSTRIPKVQQLLESYFDGKKASKGINPDEAVAYGAAVQAGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural analysis of the Sil1-Bip complex reveals the mechanism for Sil1 to function as a nucleotide-exchange factor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein homolog
molecule tags Chaperone
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 107
structure length 367
sequence length 377
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2011-01-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3qfpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3qfpA04
4XEIA 3VENA 4A62A 5E26A 3MDQA 1ATNA 3VEZA 4BRPA 3P4IA 4IXCA 4EFHA 4BRLA 5FPNA 4FPAA 2V7YA 4XH5A 4BC4A 1QHAA 1NLVA 2CH6A 1C0GA 2HF3A 1NGAA 4BRGA 5JLHA 4Z94A 4BGAA 1NM1A 5KQDA 4BREA 4H0XB 3WEEA 1GLJO 3WXKA 1YUWA 3SK3A 3TU5A 3CQXA 2UYTA 1LCUA 4PKIA 5ELZA 1ZXOA 2ZGZA 3C7NB 3EKSA 2FSNA 3HTVA 3BEXA 1CZAN 2P9KA 3C7NA 2GTDA 3EL2A 3MN7A 5I9EB 3O08A 1ZC6A 2E20A 4JHDA 3L4IA 2YHXA 5AQUA 3WXIA 2HMPA 3OHRA 1BO5O 3O80A 3QFPA 5AQOA 3O1BA 2QWMA 5JICA 1NGBA 4GNIA 4BRQA 4CZIA 3ULEB 5LJVA 2P9NB 3BF1A 1NGDA 4MO5A 4BC3A 3VF4A 3ULEA 2FLOA 3GL1A 1YXQA 5BN8A 2P9NA 4RTFD 1BA1A 5AQPA 2YI1A 2YJFA 4BRKA 2E2PA 1NGFA 4KBOA 1NWKA 4FPBA 2CGLA 5AQRA 1H1VA 1V4SA 5BPLA 4FWNA 3U8XA 3VF2A 3VEWA 3WQUA 4B1XB 2FXUA 4H5VA 1HX1A 3M3ZA 2V7ZA 3MMVA 1BG3A 1LOTB 3A8YA 3VGMA 3VOVA 2A40A 3M6GA 3GG4A 2QWPA 5AQLA 5AQZA 5BPMA 5AQSA 4NO7A 3CJ7A 2E8AA 3ZETB 1KAYA 2QW9A 3CJ1A 3CQYA 3QDKA 5KPZA 5FPMA 5BREA 4JD2B 4LC9B 3UB5A 3H1VX 3VETA 3ZETA 4JD2A 1KAXA 2ZF5O 1TYQB 2F9TA 3LDOA 4M7YA 1TYQA 4FL9A 1DKGD 2PBDA 4PKHA 3SMSA 4XH1A 4B9QA 4M63C 4FWSA 2GELA 5KPRA 3WQTA 4CD1A 1JCFA 4CBUA 3KZBA 4ISFA 3R6MA 4QS9A 1ESVA 3GOIA 3MCPA 2H3GX 2I7PA 1HKCA 3ATVA 4BRAA 1U6ZA 3BP8A 1HKBA 3MK6A 2V52B 2VYPA 3VESA 1IJJA 2IVOA 1NGJA 4K25A 4BRDA 5AQIA 3KHYA 4B1WB 3DAWA 4IO8A 3HZ6A 4BC2A 2VCPA 2QWQA 1XC3A 4FWOA 5AR0A 3A0IX 2QM1A 1D4XA 1HJOA 3LM9A 2FSJA 4M7XA 4EAHD 2D0OA 1NGEA 4BR5A 3FZFA 1QZ6A 1HLUA 4JAXA 4H5WA 3RSEB 1T6DA 4DHYA 1X3NA 4PL7A 2EWSA 5EX5A 1ATRA 3RSEA 3MN9A 5F2RA 3FZHA 4QS8A 3A5NC 3J8AA 4K43A 1JCEA 3FE1A 3UKRB 3H1QA 5EOYA 3LDPA 4MLHA 2HF4A 1U2VB 4K42A 2ITMA 1MA9B 3UKRA 3U9ZA 5BRDA 1U2VA 4IWVA 2A6AA 5FPEA 4A61A 4K41A 4FWRA 2OANA 4WQ5A 5E84A 4A2AA 4H5TA 1GLCG 1SZ2A 5BR9A 2GWJA 2IIRA 3BF3A 2IVPA 2A3ZA 4JN4A 1NMDA 2D4WA 2FF3B 1GLAG 3MN6A 3ENHA 4BROA 2A5XA 1Z6RA 3QB0A 3M1FA 2ZWHA 1JCGA 4FWMA 2WUSA 5F0XA 1YVNA 1MWKA 3A5MC 3D2FB 2E2OA 4BVPA 5AQXA 3FR0A 3UKUB 3O5BA 3O4WA 3FZKA 3WXLA 4FWQA 2QWNA 3L6QA 3CHWA 3D7EO 4CZHA 1Y64A 4B1VA 5ADXA 4H0YB 3ZX3A 4H0VB 5ADXH 3JXUA 1T44A 2FSKA 3BUZB 2E2NA 4PL8A 5BN9A 4WQ4A 1S22A 3SLCA 3R9PA 4BRHA 4EHUA 3GBTA 2J4RA 4AM7A 5AQKA 1QQOA 4BRCA 3B8AX 2Q97A 3CIPA 4A2BA 3MN5A 1Z05A 4O8KA 3VPZA 2YHYA 3VF6A 3IDHA 1BUPA 3G25A 4FWLA 4XH4A 5TKYA 3U9DA 3GDQA 1YAGA 1GLLO 3EN9A 2Q2RA 2NRHA 3CJBA 4MO4A 1KXPA 5AQJA 3EKUA 1K8KB 4HWIA 3A5OC 4J8FA 4WYBA 1TUUA 5FPDA 2PAVA 3VERA 1K8KA 5AQFA 3VEVA 5AQTA 2ASOA 5EXWA 3O8MA 2NLXA 3WXJA 4FO0A 1BWFO 4BQLA 1RGIA 1XQSC 2QXLA 4GY2B 3DXKB 3ID8A 4Y0WA 4BRFA 4B1ZA 5BRHA 4I6MB 3HSCA 3HI0A 3S41A 2D0PA 3QMLA 4CZLA 5AZIB 2F9WA 5AFUA 3CJCA 1MWMA 3ZX2A 3D2EB 1V4TA 5AFUH 2Q0UA 2KHOA 1SQKA 5AQWA 4NB4A 4BG8A 3CJ9A 2A42A 4BR4A 2AP1A 3DJCA 2YCHA 3VEYA 4C23A 4YDUA 3VGKA 3ZEUB 1GLBG 1R59O 3DXMB 3W3DA 3QICA 3GE1A 4FWPA 4CZKA 2ASMA 3ZEUA 2P9UB 3DXMA 2V51B 3CETA 4AM6A 4CBXA 3IFRA 4CZFA 2P9UA 1P8ZA 2CGKA 3F9MA 1C0FA 1NGIA 4IJNA 3QBXA 2DPNA 4CZGA 2QWRA 4FWKA 1NGHA 1QZ5A 4EIAA 1GLFO 4IZ9A 4FSVA 2E1ZA 2W40A 3QBWA 3H6EA 2P9PB 4B1YB 4BRMA 1MDUB 1E4GT 3SMPA 5AQGA 5LJWA 3H46O 2P9PA 3DWLA 5AQHA 2CGJA 3WEEB 3LDNA 2I7NA 4BGBA 1RDWX 3LDLA 4CZMA 4WQ5C 2P9KB 3VEOA 1TUYA 3AY9A 1ZBSA 4BQZA 2QWLA 4JHDB 5CE3A 5EY4A 3CERA 3H3NO 1QQMA 4DB3A 2GEMA 2GUPA 2P9SB 1GLDG 2A41A 1GLEG 3AARA 4H0TB 3R8EA 2P9SA 4BC5A 4FOEA 1WUAA 3I8BA 2NZTA 4RWTA 3FGUA 3O6WA 4BR9A 3D2FA 3WUHA 2Q0RA 3UKUA 4BRNA 5AQYA 4B1UB 2CH5A 3AAPA 4MLEA 2E88A 2E2QA 2ZGYA 5F1XA 1QQNA 1XUPO 2HOEA 4F9OA 4CJ7A 1NGGA 1DEJA 1S3XA 2YJEA 4CD3A 3IMXA 1BA0A 1HKGA 2Q1NA 1G99A 4ISGA 1BU6O 4H0PA 3HBTA 4WQ4C 1IG8A 4CI6A 5JMVA 3CI5A 3LL3A 4ISEA 5AQVA 2P9LB 4CZJA 4BR0A 4L3QA 1X9JA 5JLFA 3QFUA 1X3MA 1BOTO 3W0LA 2P9LA 4DCHA 4RCHA 2W41A 3IUCA 2Q31A 3LM2A 3FZMA 5BPNA 3CJAA 1OKJA 2E1YA 1ATSA 4H5RA 3KVGA 2IVNA 1HPMA 2QWOA 1E4FT 3LDQA 5KQ8A 2BUPA 1NBWA 3ENOA 3VEXA 1T6CA 1NGCA 3JS6A 5EVZA 3H45C 4FOIA 4H0OA 4PKGA 4CZEA 4O5FA 2AA4A 4BVOA 5AQQA 1DGKN 4HTLA 5AZJB 4CBWA 4EHTA 3SJHA 3EZWA 1BDGA 3DXKA 3FLCO 5AZJA 3EO3A 4I6MA 1SAZA 4BR7A 2D1KA 5AZIA 3D2EA 4E1JA 5B8HA 2P9IB 5BRFA 5AQMA 3AAQA 4BRIA 4BR2A 3ZX0A 4H5NA 3UE5A 1RFQA 2FF6A 3A5LC 4H03B 2P9IA 3WT0A 4QS7A 3ATUA 3TPQA 2BTFA 3FZLA 1Q18A 1EQYA 1HUXA 3VGLA 1WOQA 3U4LA 5KPTA 3H3OB 3FFKB 4DQ8A 5LY3A 3C0BA 4YDUC 4JNEA 4IJAA 1KAZA 2YHWA 3HM8A 2GWKA 2Q36A 4BG9A 1J6ZA 5AQNA 3O1WA 2ASPA 2VWBA 3I33A 3L0QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C6UA 4CJVA 3QI7A 3DOKA 3CXCM 4CEDA 1CXUA 3KLHA 4YORA 4LFCK 4CHNA 3S3OA 2CH6A 1C0GA 4GV6A 4KRFA 1NGAA 4YOYA 3EE8A 4EP5A 3TR8A 5KQDA 3VN5A 4H0XB 3SK3A 4DR1K 4PKIA 3SQ2A 2KFZA 3C7NB 3SYZA 3D45A 4N76A 2DFFA 4MDAA 2GTDA 4TSXA 1NOZA 2BGGA 3RR7A 2E20A 4JHDA 3WXIA 3OHRA 4FK0A 3QFPA 4C8KA 1EX4A 3O1BA 3CC4N 2NRZA 5JICA 1WNSA 3HRGA 1DJTA 5C25A 1TKTA 5LJVA 4K8XA 3S9HA 2P9NB 4FLYA 3BF1A 3PSFA 1YJNN 2C1IA 1NGDA 4I9QA 4KKOA 1SL0A 2FLOA 2KFNA 4MFBA 4UAEF 4RTFD 1RT1A 4I7FA 4R79A 3ASMA 2OPSA 5SWMA 4KBOA 2G8FA 4FPBA 1FW6A 5AQRA 1NK8A 3TANA 3U8XA 3VEWA 4AEIA 3NF9A 3P31A 4B1XB 1POIA 2XY6A 2VQEK 1JLBA 2ZD1A 3NH0A 1EWQA 1HX1A 3M3ZA 4BWMA 1FK9A 4FJLA 4KO0A 3CYGA 3VOVA 4GVMA 1N32K 3E7UX 2QWPA 5AQLA 2ZJQL 1B92A 3CQYA 5KPZA 1W9HA 4LC9B 3H1VX 1JLCA 3VETA 3KOXA 1TKXA 2NRTA 1ZU3A 4DR3K 3LWMA 3OS1A 3V9ZA 1TYQA 4FL9A 1DKGD 4M63C 4B08A 1BCOA 2BH1A 3L8BA 1QVGM 3TSPA 2YNFA 5LMUK 4JI5K 4QS9A 1HJRA 3NGYA 2H3GX 1IG9A 5CZ2A 3ATVA 4CJSA 2LI7A 2IC3A 1ICAA 1HKBA 3TTCA 2XRIA 3VESA 4E3SA 3HK2A 3AO5A 2IVOA 1NGJA 3HL8A 4DSJA 1GPSA 4B1WB 3VMFB 4FM0A 1I2UA 5CHIA 4IO8A 5KRSA 2VCPA 1OMYA 3NVMA 3L2WA 3DLLL 2QWQA 4B3MK 2QM1A 4F2SA 1D4XA 1NRBA 3AO1A 2FSJA 1QSSA 2D0OA 1W97L 4CGDA 3KWGA 3QEXA 1HNVA 4JAXA 4EP4A 3VTHA 4NLCA 3AVHA 5F2RA 5DM7L 3LWLA 1WN7A 4IG3A 1ASVA 1VSIA 2W6LA 3TTDA 3H1QA 3CCVN 2OTJN 3AVLA 5GINA 5CY4A 4X64K 3DLRA 5FPEA 4HVJA 4FWRA 3ZSVA 4WQ5A 4YOVA 4BEBA 3HT3A 1BQNA 1GLCG 2GWJA 2HB5A 1IKXA 3TAMA 4O55A 1N4NA 3WXMB 2RN2A 4NCAA 2IIRA 3CG7A 1XNRK 1T7PA 1NMDA 4FJXA 2D0BA 2FF3B 2F8SA 4N56A 1PTXA 1N8RO 2A5XA 1RTHA 3TARA 2KGQA 1BIZA 1WLJA 1LV5A 3CW4A 3KP0A 5KGXA 3AVKA 3CC2N 2UXBK 2QXFA 3F2KA 3NH2A 4DTRA 3V1QA 5GIOA 4OPAA 2E2OA 4FJ5A 5AQXA 2KBJA 2HVHA 3O4WA 2WBNA 1WAJA 3D7EO 3L6QA 4CZHA 3B6PA 3IG1A 2RKIA 3ZX3A 1BK8A 5ADXH 3RVCA 4KH5A 2KZZA 3DOLA 4PHTX 3AVAA 4BDYA 4WQ4A 2O8DA 4O0IA 4JKGA 1HRHA 1TVRA 3THVA 2YNIA 1VHXA 1K73O 1CLQA 1X1PA 3AVIA 1EWRA 3B8AX 3E66A 3KD5E 3CIPA 4O8KA 3THWB 4JYAK 4O8UA 4F2RA 3G25A 4FWLA 4FJ9A 2O8BA 5TKYA 3GDQA 2OPQA 3NCIA 1S9GA 2Q2RA 2Z1GA 4JRQA 4FZYA 4PY5A 4HWIA 3A5OC 4CJ3A 3VQ7A 3CM6A 4DR7K 2PYLA 3VEVA 4CJEA 3KLEA 3J80O 1WB9A 5EXWA 1XHZA 3WXJA 4JKAA 2WC9A 4IOAL 3QERA 4FO0A 2ZQBA 1VQ4N 1XQSC 4BRFA 4M3RA 3DXKB 1NH5A 4B1ZA 3MXJA 5C24A 3ZLJA 4OKEA 2AJQA 5J2PA 4W5NA 1ILYA 5AZIB 5AFUA 5C12A 3D2EB 5C2DA 1KTQA 4R5PA 3SCXA 4NB4A 1UGLA 4BG8A 4BR4A 3DJCA 4F3TA 2YCHA 3AVNA 3VGKA 4BY9C 2LKBA 3DXMB 4E72A 4X65K 1N34K 3PX4A 4FWPA 4MDBA 3OYIA 1D8YA 2ASMA 3BK3C 2JWLA 3R3LA 1TAQA 3VTIA 1ZYVA 4CBXA 4CZFA 2P9UA 4W5OA 2CGKA 2ATBA 3AA2A 2GMOA 4CEZA 1I6FA 1NGIA 2NY9X 4IJNA 2YNGA 3QEIA 2A1RA 3ZT3A 2QWRA 2KBKA 1OVYA 3I56N 3AVBA 1ZYQA 1QZ5A 3NE6A 3PSMA 4WFBL 1ZBUA 3SUPA 3QBWA 3H6EA 4BRMA 2Y1JA 1E4GT 3ZSZA 1VRTA 4FLZA 1YITN 4JI4K 4C8LA 4RW4A 1NPIA 3Q7BA 4HUFA 1VQ9N 3T1AA 4JKDA 3I0SA 1EO1A 4ZHRA 3IRXA 4CJPA 1RBRA 2PFUA 4WQ5C 5HOOA 1B9DA 1KLNA 2HVIA 2MZ0A 1JLQA 1RTDA 1S1TA 4JHDB 4JRPA 1JLAA 3VQBA 4FJGA 3NH1A 4KHWA 1RT7A 1GLEG 3R8EA 1VSHA 2N2RA 2B4JA 2P9SA 4DF8A 4FOEA 1VSJA 2W6KA 4BR9A 3UKUA 4B1UB 5E41A 2CH5A 4MLEA 2E88A 4CJKA 2HOEA 5HROA 4CJ7A 2ZE2A 4CD3A 2WFBA 4LFBK 1BA0A 3NF8A 2Q1NA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3C6U A;  4CJV A;  3QI7 A;  3DOK A;  3CXC M;  4CED A;  1CXU A;  3KLH A;  4YOR A;  4LFC K;  4CHN A;  3S3O A;  2CH6 A;  1C0G A;  4GV6 A;  4KRF A;  1NGA A;  4YOY A;  3EE8 A;  4EP5 A;  3TR8 A;  5KQD A;  3VN5 A;  4H0X B;  3SK3 A;  4DR1 K;  4PKI A;  3SQ2 A;  2KFZ A;  3C7N B;  3SYZ A;  3D45 A;  4N76 A;  2DFF A;  4MDA A;  2GTD A;  4TSX A;  1NOZ A;  2BGG A;  3RR7 A;  2E20 A;  4JHD A;  3WXI A;  3OHR A;  4FK0 A;  3QFP A;  4C8K A;  1EX4 A;  3O1B A;  3CC4 N;  2NRZ A;  5JIC A;  1WNS A;  3HRG A;  1DJT A;  5C25 A;  1TKT A;  5LJV A;  4K8X A;  3S9H A;  2P9N B;  4FLY A;  3BF1 A;  3PSF A;  1YJN N;  2C1I A;  1NGD A;  4I9Q A;  4KKO A;  1SL0 A;  2FLO A;  2KFN A;  4MFB A;  4UAE F;  4RTF D;  1RT1 A;  4I7F A;  4R79 A;  3ASM A;  2OPS A;  5SWM A;  4KBO A;  2G8F A;  4FPB A;  1FW6 A;  5AQR A;  1NK8 A;  3TAN A;  3U8X A;  3VEW A;  4AEI A;  3NF9 A;  3P31 A;  4B1X B;  1POI A;  2XY6 A;  2VQE K;  1JLB A;  2ZD1 A;  3NH0 A;  1EWQ A;  1HX1 A;  3M3Z A;  4BWM A;  1FK9 A;  4FJL A;  4KO0 A;  3CYG A;  3VOV A;  4GVM A;  1N32 K;  3E7U X; 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