3QFUA

Crystal structure of yeast hsp70 (bip/kar2) complexed with adp
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
NYGTVIGIDLGTTYSCVAVMKNGKTEILANEQGNRITPSYVAFTDDERLIGDAAKNQVAANPQNTIFDIKRLIGLKYNDRSVQKDIKHLPFNVVNKDGKPAVEVSVKGEKKVFTPEEISGMILGKMKQIAEDYLGTKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVLRIVNEPTAAAIAYGLDKSDKEHQIIVYDLGGGTFDVSLLSIENGVFEVQATSGDTHLGGEDFDYKIVRQLIKAFKKKHGIDVSDNNKALAKLKREAEKAKRALSSQMSTRIEIDSFVDGIDLSETLTRAKFEELNLDLFKKTLKPVEKVLQDSGLEKKDVDDIVLVGGSTRIPKVQQLLESYFDGKKASKGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Structural analysis of the Sil1-Bip complex reveals the mechanism for Sil1 to function as a nucleotide-exchange factor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein homolog
total genus 110
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2011-01-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3qfuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3qfuA04
4FWRA 1BDGA 3SLCA 2GWKA 4IO8A 5JLFA 1LOTB 4BR9A 2P9SB 5AQXA 2UYTA 1C0GA 3ZX0A 3QBWA 4IJNA 3HSCA 1TYQA 3CJBA 4H0VB 3ZX2A 1RDWX 3MN9A 2A5XA 1GLFO 1GLCG 3BF1A 4BC5A 1NBWA 3O8MA 2P9PB 5KQ8A 3WQTA 2VWBA 4Y0WA 3QMLA 5AQZA 3IMXA 1Z05A 2YHXA 2ZF5O 1BUPA 3VGMA 4H0TB 3WEEB 2QWQA 5AR0A 4PKGA 3GOIA 1JCFA 4AM6A 3L6QA 3VEVA 2ASOA 3SK3A 2ZGZA 3D2EB 3VPZA 3C7NB 1NMDA 3H1VX 3O1WA 4ISFA 3RSEA 3SMPA 4EHUA 3U4LA 2A41A 1YVNA 3MCPA 4FWMA 4YDUC 5AZJB 1GLDG 4H0OA 1LCUA 3LM9A 4CI6A 3CIPA 2CGJA 3IFRA 3D2FB 1T44A 2W41A 3BF3A 5BRDA 5E26A 1TUUA 4L3QA 3OHRA 4DHYA 1SZ2A 2P9LB 4BRAA 3KVGA 4XH4A 1XUPO 2KHOA 1EQYA 2PAVA 4BR0A 4BRFA 3H45C 4B1ZA 4FWKA 4PKHA 3FR0A 3FZLA 4ISGA 2HOEA 4CZHA 3W0LA 4H5NA 3B8AX 4LC9B 4BRLA 2QWLA 4XEIA 1K8KB 5F0XA 2I7NA 4EFHA 4CBXA 3A5NC 4B1UB 2GTDA 5LJVA 3VEYA 3EKUA 4K42A 5B8HA 4K25A 4FO0A 2QWPA 4JD2A 3HM8A 4WQ4C 2V7ZA 2D0OA 2CH6A 5JICA 1T6DA 4BR2A 1RFQA 3SMSA 2QWRA 3C0BA 5AQIA 4CZMA 1GLLO 3F9MA 4BR4A 2E2OA 1WOQA 4BQZA 5KPTA 4B1XB 2PBDA 4O8KA 4QS7A 1NM1A 2CH5A 2E2NA 5ADXH 3FZMA 3DXKA 1X9JA 1YAGA 2YJFA 3ATUA 2FSNA 5BPLA 4QS8A 5AQVA 1ATRA 3GDQA 3DWLA 4YDUA 3AARA 1YXQA 2WUSA 3R9PA 2DPNA 5AQLA 3WXIA 3JS6A 3DJCA 4CBUA 4WQ5C 3HBTA 3MMVA 3I33A 2P9NB 4NB4A 2YHWA 2QXLA 4K43A 2FF3B 2F9TA 2A40A 3FZFA 1D4XA 3P4IA 4JHDA 4BRKA 4MLHA 3UKUB 4BQLA 5BPNA 2VYPA 5BRHA 5AQNA 5CE3A 2P9UB 4O5FA 2E1ZA 4C23A 5EXWA 2GEMA 3VF6A 3QFPA 3ENOA 4EAHD 3GBTA 1MDUB 2P9SA 1BA1A 5BN8A 3FLCO 4JN4A 3LDPA 2IVNA 4WQ4A 1YUWA 5FPDA 4MO4A 5LJWA 3I8BA 3HTVA 4BC3A 1KAZA 1BU6O 3A5OC 5KPZA 5FPMA 1TUYA 2V52B 4J8FA 4FWQA 4EIAA 2D1KA 3CERA 2E1YA 1KAXA 4WYBA 1MWMA 4NO7A 2BUPA 1Q18A 2QW9A 3U8XA 5AQRA 2NZTA 2GWJA 3AAPA 2I7PA 3A5LC 3O5BA 5AQJA 3ENHA 1BWFO 1CZAN 2F9WA 5AZIB 4JAXA 3D2EA 4BRPA 4WQ5A 3C7NA 1U2VB 5AQPA 1DGKN 3GL1A 4BG8A 3CI5A 1ZC6A 2QWNA 1MA9B 3W3DA 2D4WA 4B9QA 5AZJA 5LY3A 1QQNA 3CETA 1J6ZA 5BN9A 4IJAA 2OANA 3CQXA 3D2FA 3WUHA 1QQMA 2IVPA 4B1VA 4DQ8A 4BR7A 1S3XA 1NGFA 2P9LA 1BG3A 4FWSA 2H3GX 3DAWA 1NGEA 1BOTO 5AQYA 2QM1A 3CQYA 4EHTA 3H46O 4GY2B 5AQHA 4BRHA 2QWMA 4K41A 1V4SA 1DEJA 1SQKA 2Q97A 2P9KB 3MN5A 3AAQA 1K8KA 5ELZA 2NLXA 2GUPA 3H1QA 3DXMB 2BTFA 3ZX3A 2AA4A 1IG8A 3GG4A 3CHWA 2V7YA 1RGIA 3BUZB 3VENA 3M1FA 2P9IB 3L0QA 3IDHA 5EX5A 4XH1A 1GLJO 5F1XA 1BO5O 4B1WB 1JCGA 3ULEB 4BREA 1ZXOA 4M63C 4RWTA 3D7EO 3LDQA 4MLEA 4BGBA 4H5WA 5EVZA 3QBXA 4ISEA 4PL7A 5AFUA 3MK6A 4BRDA 3G25A 5TKYA 4CZJA 2E8AA 4CD1A 4E1JA 2P9NA 4FL9A 4IXCA 1HKCA 4A62A 1NGGA 5BR9A 1QZ5A 4FOIA 1QQOA 4CZFA 2FXUA 3H3NO 5F2RA 3O08A 3UKRB 3UKUA 4BVOA 2VCPA 2Q1NA 2IIRA 3TPQA 3WXKA 3QB0A 3MDQA 2QWOA 5AQKA 3S41A 1T6CA 4FOEA 3FZKA 2Q0RA 4M7YA 5AQFA 4FWPA 3UE5A 3WXJA 4CZKA 3O1BA 3ZEUB 5FPNA 2J4RA 4HTLA 2ASPA 3ID8A 1ATSA 4A2AA 4H0PA 2HF4A 1OKJA 2ZWHA 1QHAA 3O6WA 4I6MB 5BREA 1X3MA 1ZBSA 2P9PA 4BGAA 3R8EA 5FPEA 3WXLA 2V51B 3CJ7A 1WUAA 3CJ9A 4BRQA 2ITMA 2YCHA 2A42A 3ZETB 1E4GT 4FWLA 4BRCA 3WEEA 1NWKA 1SAZA 3QDKA 5AZIA 4H5RA 3BP8A 2HMPA 3O4WA 4BROA 3M6GA 1V4TA 3QFUA 3EKSA 4IZ9A 3LDOA 2A6AA 5JMVA 4CBWA 1NGHA 2Q2RA 2CGLA 1HJOA 1ESVA 3VGKA 3FGUA 4H5TA 1DKGD 1H1VA 1NGJA 1XQSC 4PKIA 3UB5A 3VF4A 1IJJA 4FSVA 1TYQB 1MWKA 3MN7A 5AQOA 4KBOA 1U6ZA 1R59O 3QICA 3WQUA 1BA0A 1NGCA 4A61A 4H0XB 1G99A 2P9KA 2Q31A 1Y64A 2FSKA 2Q36A 4A2BA 4GNIA 3VEOA 5AQTA 3VOVA 3AY9A 3R6MA 4PL8A 4Z94A 3DXMA 5EOYA 2FSJA 3CJCA 3VGLA 1Z6RA 3O80A 2E20A 3SJHA 4DCHA 3CJAA 2P9IA 4BRMA 4JNEA 1KXPA 1C0FA 4BC4A 4AM7A 5AFUH 4BR5A 3H3OB 3EO3A 1HKBA 3VETA 2AP1A 3LM2A 2EWSA 3VESA 3WT0A 2ZGYA 2YI1A 1NGDA 3RSEB 3KHYA 3ULEA 4RCHA 3KZBA 2W40A 1QZ6A 2ASMA 5BPMA 2FF6A 2E2PA 2GELA 4BRNA 2HF3A 3BEXA 1GLAG 1NLVA 3VEZA 1E4FT 2CGKA 3A5MC 3LDNA 3VEWA 4CZGA 3U9ZA 5AQQA 4H5VA 3HZ6A 3ATVA 3A0IX 2IVOA 2E88A 1GLBG 3CJ1A 5KPRA 1NGAA 1S22A 4XH5A 3LL3A 1HX1A 4QS9A 3A8YA 1HUXA 4BRIA 3FE1A 5AQGA 3EL2A 1X3NA 3UKRA 5JLHA 4BRGA 4F9OA 5BRFA 3VF2A 4BC2A 2YHYA 4CZEA 2D0PA 3M3ZA 4FWNA 3VERA 5AQMA 4B1YB 3GE1A 4JD2B 1HLUA 5E84A 3J8AA 1ATNA 3FFKB 2P9UA 4BG9A 3H6EA 1KAYA 2FLOA 4CZIA 4IWVA 5AQWA 4MO5A 5AQUA 3ZEUA 1HPMA 3L4IA 1NGBA 3LDLA 3EZWA 4BVPA 1JCEA 3DXKB 4HWIA 4FPAA 3FZHA 3TU5A 4I6MA 5KQDA 3MN6A 2YJEA 4RTFD 2E2QA 4FWOA 1XC3A 3HI0A 3VEXA 3ZETA 1GLEG 1HKGA 4CD3A 4FPBA 5ADXA 2NRHA 5AQSA 1P8ZA 3EN9A 4DB3A 4H03B 4JHDB 4CZLA 3U9DA 1NGIA 5EY4A 4CJ7A 4H0YB 2A3ZA 4M7XA 3IUCA 5I9EB 1U2VA 2Q0UA 3JXUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G10A 3L3VA 4KB1A 1JLAA 2VG7A 3RVCA 4M3WA 4DQSA 4CJUA 3A2FA 1C0GA 5CHIA 3ZX0A 3CC2N 3QBWA 3NF9A 1RDWX 1TK0A 2NRRA 1LW0A 1RT3A 3NF6A 1GLFO 1GLCG 2EHGA 3AA2A 4BC5A 1JLCA 2VWBA 3ZT1A 2UU9K 5AQZA 3CCMN 1L5UA 4H0TB 4NLBA 3WEEB 1SL2A 3CCRN 3GOIA 3B6PA 5C0YA 4AM6A 4CHQA 1NKCA 1TAQA 2ZGZA 3D2EB 3V9ZA 4ISFA 3RSEA 2ZM6K 1RT1A 4A59A 4B3RK 3MCPA 3RMCA 1Q9YA 3GKUA 1GLDG 4DSIA 3LM9A 2NUBA 5SWMA 4GVEA 1T44A 2W41A 2E4LA 4E89A 3BGRA 4H4OA 5FROA 1XNQK 4L3QA 4CJFA 3OHRA 3MXIA 4DTNA 4FJKA 4CF2A 2XY5A 4ID5A 2KHOA 3L3UA 3H45C 3ZT3A 4B1ZA 4DSJA 4CF0A 1T7AA 3QIPA 3FR0A 4ISGA 1VQ8N 1VSJA 2QTDA 4OKEA 4BRLA 4DR3K 4DTPA 1GOAA 1NPIA 4CIEA 2KYQA 2GTDA 2YNGA 3EKUA 4CGHA 2XY6A 4FM2A 2QWPA 2WTUA 1T6DA 1W7AA 1RFQA 1TI5A 3SMSA 3C0BA 4CJVA 1B9FA 4UAFE 1LAWA 3OJUA 1WSHA 5JS1A 3KP1A 1VQON 2BDPA 4DTSA 2PBDA 4O8KA 2JDQD 3OYCA 1KLNA 2CH5A 3RMDA 1YITN 1VRUA 5D3GA 2YJFA 2KBHA 1QVGM 4ICLA 3LPUA 3MEDA 4CJLA 3AARA 3HL8A 3ZT0A 4BDYA 3WXIA 5KK4A 3D0PA 4CBUA 4Z4EA 1RBRA 3KK1A 3IKMA 3ZSXA 1A5WA 4NB4A 1NK6A 1RTJA 2FF3B 2HB5A 2ZD1A 1Q86O 2LI7A 2A40A 4JHDA 3P4IA 1CHZA 4YY3K 3L56A 2VYPA 3T19A 1D5AA 2P9UB 4ZTJA 2ZJQL 3DRRA 2GEMA 3AVJA 1OH8A 5DK5A 4IDHA 4E7JA 4FJ8A 3R2VA 4KHPK 5GIPA 3T1HK 3GBTA 5KRSA 1MDUB 1B7DA 2G8HA 3LDPA 4B3OA 4WQ4A 1YUWA 1PTXA 3MWPA 4U67L 3A5OC 4MQ3A 2SN3A 3WNHA 5KPZA 1C0TA 1CZ9A 3AV9A 4AHSA 1BQMA 3KLIA 4KHYA 4FWQA 4EIAA 1OZZA 4WYBA 4FJHA 2BUPA 3PX0A 2QW9A 4HCCA 2NZTA 2GMOA 3O5BA 4DWIA 1I6FA 4O0IA 1TL3A 4JKAA 2F9WA 3SJJA 4JAXA 3F2KA 2RPIA 3GL1A 1ZC6A 3W3DA 4ELTA 1FW6A 4LF4K 3CETA 4LSNA 4DSLA 3CQXA 3THYA 3OW2M 1NK5A 2HNZA 3WUHA 4OPKA 4DTXA 3V6DA 4FK2A 1S3XA 4LY7A 1NGFA 3DAWA 2KQ2A 1BK8A 3CQYA 4DKWA 4CJEA 3H46O 1DJTA 5AQHA 4OJRA 1JKHA 2HVIA 1O13A 2F4VK 3HPGA 1BIZA 4K41A 1HMVA 3H08A 1V4SA 1DEJA 3ZSZA 1U47A 4JKBA 2OYQA 3BK3C 2YNHA 1KCFA 4HUEA 1TKZA 5ELZA 3MXJA 2LJMA 2GUPA 2AA4A 1IG8A 2HHVA 4LF8K 3NDKA 2IGIA 1AYJA 1C0UA 3VENA 2XY7A 3DLKA 2IAJA 5EX5A 2ATQA 4RW8A 3QEPA 4LH4A 1TK5A 5F1XA 2KJAA 4HVJA 1BO5O 4B1WB 1VSFA 4DF4A 3CM5A 3NH1A 2W6LA 5FRMA 5FLXO 2D56A 2O8DB 4KI4A 2W00A 3J81O 3SUNA 1P0AA 1JLEA 4GV6A 2HHSA 2HBKA 4BRDA 2HHTA 4B9LA 4FW2A 3NMUA 4BEBA 5TKYA 4CZJA 4CD1A 4WFAL 4B9UA 2P9NA 1NJIO 1OH6A 1K6YA 2EX3A 2XRIA 4DLEA 2FXUA 2QXFA 3CW4A 4W5TA 2VCPA 2Q1NA 3TPQA 3K9JA 3MDQA 1SL1A 1GPTA 4OO1J 3CMEN 3WXMB 2OPQA 4CZKA 4DMNA 3ZEUB 4FJMA 5HRNA 3VQAA 4MDAA 4H0PA 1BGXT 1WBBA 3DMJA 2ZWHA 1QHAA 4DR6K 3OYHA 1HQUA 1KSPA 3ALYA 3EZ5A 2X6SA 4BGAA 4O44A 5FPEA 4FJJA 3CJ7A 4FLYA 1L3VA 3M8QA 3I0RA 4DR4K 1IV0A 4FWLA 4E0DA 3WEEA 1NWKA 1SAZA 2UUAK 3QDKA 5AZIA 4DSKA 3K59A 3JYTA 4NLCA 4GW6A 2G8FA 3BP8A 2FBXA 1RT7A 1S6QA 1K73O 3WNGA 4R5PA 1RT2A 4LD0A 3S5TA 4Z4FA 4E7HA 1YVUA 3DLGA 2YBRC 4WFBL 3LDOA 3AA5X 4GVMA 1EX4A 1UOCA 4AILC 2XHBA 2I5JA 1IBMK 2NRWA 4RW6A 3VGKA 3FGUA 4H5TA 1H1VA 3CCQN 4LF7K 3ZYYX 4J2EA 2WFBA 1S1WA 3KOYA 3VQ9A 5DMRA 3HM9A 3WQUA 5MLCQ 1FKPA 4JI4K 4LF6K 1NGCA 1QTMA 4H0XB 3SQ1A 4A2BA 3VEOA 3VOVA 3VTIA 5CZ1A 3THXA 2FSJA 1Z6RA 1TKDA 1CXUA 4DCHA 3L4QA 1KXPA 2Q3SA 1C0FA 1LW2A 3VA3A 4AM7A 4JK8A 1FJGK 4BR5A 3ULDA 3VETA 2AP1A 4AHCA 3WT0A 4Q5VA 3RSEB 5CY4A 3ULEA 1VSKA 4E1NA 1WSGA 1NRBA 5BPMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3G10 A;  3L3V A;  4KB1 A;  1JLA A;  2VG7 A;  3RVC A;  4M3W A;  4DQS A;  4CJU A;  3A2F A;  1C0G A;  5CHI A;  3ZX0 A;  3CC2 N;  3QBW A;  3NF9 A;  1RDW X;  1TK0 A;  2NRR A;  1LW0 A;  1RT3 A;  3NF6 A;  1GLF O;  1GLC G;  2EHG A;  3AA2 A;  4BC5 A;  1JLC A;  2VWB A;  3ZT1 A;  2UU9 K;  5AQZ A;  3CCM N;  1L5U A;  4H0T B;  4NLB A;  3WEE B;  1SL2 A;  3CCR N;  3GOI A;  3B6P A;  5C0Y A;  4AM6 A;  4CHQ A;  1NKC A;  1TAQ A;  2ZGZ A;  3D2E B;  3V9Z A;  4ISF A;  3RSE A;  2ZM6 K;  1RT1 A;  4A59 A;  4B3R K;  3MCP A;  3RMC A;  1Q9Y A;  3GKU A;  1GLD G;  4DSI A;  3LM9 A;  2NUB A;  5SWM A;  4GVE A;  1T44 A;  2W41 A;  2E4L A;  4E89 A;  3BGR A;  4H4O A;  5FRO A;  1XNQ K;  4L3Q A;  4CJF A;  3OHR A;  3MXI A;  4DTN A;  4FJK A;  4CF2 A;  2XY5 A;  4ID5 A;  2KHO A;  3L3U A;  3H45 C;  3ZT3 A;  4B1Z A;  4DSJ A;  4CF0 A;  1T7A A;  3QIP A;  3FR0 A;  4ISG A;  1VQ8 N;  1VSJ A;  2QTD A;  4OKE A;  4BRL A;  4DR3 K;  4DTP A;  1GOA A;  1NPI A;  4CIE A;  2KYQ A;  2GTD A;  2YNG A;  3EKU A;  4CGH A;  2XY6 A;  4FM2 A;  2QWP A;  2WTU A; 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