3ATUA

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp- and mg ion-bound state
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3atuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3atuA04
5AQFA 4PL7A 3C0BA 4K41A 4CZHA 5BPLA 5BN8A 2D4WA 1BOTO 1YVNA 5AQVA 2F9WA 4JNEA 3UB5A 2D1KA 1BUPA 1IG8A 4BRAA 1X3MA 3SMSA 3M6GA 5AZJB 1ATSA 2FXUA 4FWLA 1NWKA 2E20A 1X3NA 4MO4A 5AZJA 2P9PB 5BPNA 4KBOA 4ISGA 1C0GA 5BR9A 1E4GT 4O8KA 3FZFA 3ZEUB 4BR4A 2P9PA 3ENOA 4JHDA 2YHYA 3F9MA 1NGBA 3VENA 4BC3A 1X9JA 3ZEUA 1U2VB 3H6EA 4EHUA 3I33A 4QS9A 4BRNA 3C7NB 4FSVA 1HKCA 1ZXOA 3A5NC 3UKRB 2YCHA 3CJBA 1XUPO 1EQYA 1J6ZA 3C7NA 2Q2RA 3HI0A 2A3ZA 4M7YA 4C23A 5FPDA 4H0YB 3UKRA 3VEWA 1LOTB 4BC4A 2A42A 3CQXA 1NGFA 1HKGA 2GWKA 3EKUA 3R6MA 2ZGZA 1HKBA 2H3GX 3VERA 3WXJA 4EAHD 1HLUA 1E4FT 2Q31A 2P9SB 4BQLA 2E1ZA 5AQXA 4CJ7A 3RSEB 1Z6RA 3GOIA 3EO3A 3SK3A 4WYBA 3VGKA 5F0XA 3A5LC 2IVNA 4BR2A 4CBUA 3LM2A 3QBWA 3RSEA 4B1ZA 3L6QA 3VEOA 3WUHA 1RDWX 3GG4A 1RGIA 3CQYA 2ASMA 5I9EB 4B1WB 3A5MC 2QW9A 3CJAA 3FLCO 5AQQA 1GLFO 2YHXA 3JXUA 1QZ5A 2IVOA 2P9KB 1NGIA 3FZHA 2ZGYA 5AZIA 5JLFA 5KPZA 3A0IX 4CBXA 2P9KA 3O1WA 3FZKA 4WQ5A 3D2EB 2P9LB 5AQNA 4H0OA 4H5NA 1CZAN 1XC3A 2Q36A 2I7PA 1SQKA 3L0QA 4XH5A 3D2EA 2HF4A 2P9LA 5BRFA 1BG3A 4CZFA 3WXIA 1QHAA 3D2FB 1NLVA 3CI5A 3TPQA 4NB4A 1V4TA 2FSNA 3R9PA 3WQTA 4CZGA 3D2FA 3VF4A 4K25A 1D4XA 1Z05A 3ID8A 3SJHA 4BR9A 4JN4A 5F1XA 4B9QA 3GE1A 2Q0RA 1WUAA 5AQUA 3QFUA 2BUPA 4BRGA 5KQDA 3FR0A 1WOQA 1MWMA 4B1XB 5AQRA 3QICA 4BC2A 4NO7A 4H0VB 5LJWA 5BPMA 3H3NO 3MMVA 3BF1A 4JD2B 5EVZA 3M1FA 3MCPA 4YDUA 4CZMA 3QDKA 2GTDA 1JCFA 1TUYA 3BP8A 2P9IB 4JD2A 5TKYA 5KPRA 5CE3A 2AP1A 3B8AX 2HMPA 4FOEA 5AQTA 4PKIA 5AQMA 2P9NB 3OHRA 4FWMA 4IZ9A 2CGJA 3GDQA 3LDLA 3VF6A 1ATRA 5EX5A 2WUSA 1P8ZA 2P9NA 3ULEB 4BRDA 5KPTA 4A62A 3ZX0A 4H0TB 3CJ7A 5F2RA 4FWOA 1GLCG 3ULEA 4IJAA 2V51B 1OKJA 4M7XA 3MN5A 3M3ZA 1TYQB 3DXMB 2W40A 3KHYA 5JICA 4CI6A 4CZIA 1TYQA 3DXMA 3IFRA 3MK6A 1BO5O 5AFUH 4HTLA 3CJ9A 4BQZA 1NGEA 4EHTA 2Q1NA 4H0XB 4BROA 5JMVA 2QWQA 5FPEA 3H45C 1XQSC 4BG8A 4GNIA 1NBWA 4FWQA 4BVPA 4WQ4C 1V4SA 1SAZA 1U2VA 3LDQA 2YJEA 3H46O 2GELA 3ENHA 4A61A 4IXCA 2D0PA 3P4IA 2J4RA 1K8KB 4F9OA 2P9UB 2BTFA 2GWJA 1BDGA 1NGCA 4MO5A 1ESVA 4H5WA 1NGHA 3H1VX 3BUZB 1T6CA 1K8KA 3LDOA 1T6DA 3UE5A 1GLJO 3KVGA 2P9UA 5EY4A 3WEEB 1BWFO 3MN7A 3U9DA 2FSJA 3O08A 4BR5A 5AQKA 2QWNA 3ZX2A 3WEEA 3QFPA 2P9SA 5ADXH 5AQWA 3QBXA 2FF6A 5B8HA 3CHWA 4FWNA 2A41A 2CGKA 3UKUB 1JCGA 4A2AA 4B1YB 5AFUA 5BRDA 2E88A 2V7YA 4K43A 3LM9A 2GUPA 2EWSA 1R59O 4H5RA 5JLHA 5AQJA 3MDQA 3D7EO 3CJCA 4MLEA 4BC5A 3VESA 3VGLA 4IJNA 3CERA 3GBTA 3LL3A 1T44A 1JCEA 2UYTA 1DKGD 1KAYA 1MDUB 1U6ZA 1HJOA 4ISFA 4PKGA 5E84A 1TUUA 4BVOA 4WQ5C 3MN6A 4BR0A 2NRHA 3A8YA 5AQGA 2E2PA 2NZTA 1YXQA 2ASOA 2YI1A 2A5XA 3QB0A 5ADXA 2ASPA 1QQMA 4BRCA 1Q18A 4PL8A 5LY3A 2KHOA 3BEXA 2D0OA 5KQ8A 1HPMA 1HX1A 3A5OC 5AQIA 2ITMA 3VOVA 3VPZA 3AAQA 3U9ZA 2QXLA 2QWMA 2VCPA 5LJVA 3U4LA 3QMLA 4BGAA 2A40A 1S22A 4FPBA 4J8FA 3VEYA 4H5TA 4DB3A 2CH5A 3G25A 4H0PA 4RTFD 3LDPA 1G99A 3KZBA 4BRMA 4LC9B 4MLHA 4CD3A 3EZWA 2V7ZA 1GLLO 3FFKB 3VF2A 2FF3B 4Z94A 4BRLA 2P9IA 4YDUC 3FZMA 3VETA 1KXPA 1NGAA 1RFQA 5AQPA 3I8BA 3BF3A 4XEIA 4CD1A 1ZC6A 2DPNA 3SLCA 3W0LA 1NMDA 4FOIA 4H03B 1QQOA 5AQOA 3U8XA 4AM6A 4BREA 2GEMA 4RWTA 3W3DA 4FWKA 4QS7A 2PAVA 1DEJA 4BG9A 1NM1A 4B1UB 1HUXA 3EL2A 5AR0A 3JS6A 4XH4A 3WQUA 2FSKA 1QZ6A 5FPNA 5FPMA 3AY9A 3ATVA 4JAXA 1NGGA 4QS8A 2A6AA 4HWIA 3CIPA 4IWVA 2W41A 3EN9A 1GLAG 3HZ6A 1Y64A 3R8EA 1BU6O 4JHDB 1GLEG 3HTVA 4WQ4A 3FGUA 4H5VA 3SMPA 1BA1A 1C0FA 2HOEA 2YJFA 2HF3A 3ZX3A 3LDNA 2VWBA 4FWSA 1MWKA 5EOYA 3VEVA 3TU5A 4DCHA 1IJJA 3ZETB 3VGMA 2CGLA 4BR7A 2E2NA 2OANA 3HSCA 4O5FA 3WXKA 4CZLA 3ZETA 1YUWA 4CBWA 1GLDG 1KAZA 4A2BA 2QWPA 5E26A 4FPAA 4Y0WA 4IO8A 4EIAA 2ZWHA 4GY2B 3VEXA 3S41A 4BRQA 4EFHA 2E2OA 2ZF5O 4CZKA 3HM8A 3DWLA 3UKUA 2QWRA 4K42A 2E8AA 1NGDA 4PKHA 2QM1A 4L3QA 1H1VA 1MA9B 1NGJA 3EKSA 4RCHA 4BRFA 4FWPA 5AQZA 3CJ1A 2E1YA 1KAXA 4BRIA 4DQ8A 1DGKN 1BA0A 4ISEA 2QWOA 3O1BA 1ATNA 5AZIB 2IVPA 3IUCA 4XH1A 2PBDA 4FO0A 1ZBSA 3CETA 3O8MA 4B1VA 3MN9A 3IDHA 2VYPA 3O4WA 2QWLA 3O6WA 1SZ2A 5AQHA 2I7NA 4CZJA 4M63C 5AQLA 2CH6A 3IMXA 5BN9A 3AAPA 3ATUA 3L4IA 4CZEA 4FL9A 3DAWA 2E2QA 3J8AA 4E1JA 3H1QA 3HBTA 3AARA 5ELZA 4FWRA 5BRHA 4DHYA 1QQNA 3DJCA 3FZLA 4BRHA 3FE1A 2NLXA 5EXWA 2FLOA 4AM7A 2IIRA 1S3XA 2F9TA 3WT0A 2Q97A 2Q0UA 3DXKB 3O5BA 3H3OB 5BREA 3VEZA 3O80A 1LCUA 4I6MB 5AQSA 3DXKA 4BGBA 2YHWA 4I6MA 1YAGA 4BRPA 3GL1A 5AQYA 4BRKA 2V52B 1GLBG 2AA4A 3WXLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LMUK 5A2QO 2QEXN 2B68A 3L2RA 4UADE 2D4WA 4M45A 1BI4B 1YVNA 3TSQA 5AQVA 2F9WA 3E7RL 1VK0A 2HB5A 1QSYA 3CCMN 3QIPA 3KOYA 1TKDA 1BI4A 4KKOA 3G6EN 4YOTA 1JLCA 4CEFA 3MXIA 1IG8A 3SMSA 3E01A 5AZJB 1RDCA 4E89A 2FXUA 2RHKA 3LP2A 1X3NA 4MO4A 4IBNA 5AZJA 3LP3A 3MWTA 5BPNA 4YOVA 2OPRA 1CZBA 1W0HA 4CIEA 1YITN 1M90O 1C56A 3ENOA 4JHDA 1VSDA 2ATQA 2HBMA 3F9MA 1Q8IA 1RCHA 3I33A 1TK8A 1NG9A 1ZYWA 4DF8A 3OYIA 4FSVA 3L2QA 2YCHA 4A5AA 2B6AA 3QINA 1DTTA 3CQ8A 2O8DB 4KHYA 3AGKA 3V81A 4BC4A 2F96A 3PO4A 2O8DA 2LJ7A 3EKUA 1VNBA 3R6MA 1QS4A 5CZ2A 4Y1DA 3HO1A 1T3VA 4C1NK 2HHUA 1E4FT 4CGDA 1E3MA 1A5XA 4FVMA 3OJUA 1U47A 4ELVA 5AQXA 2OPSA 3SPZA 1WSGA 4CIFA 1Z6RA 1RT6A 1RBUA 3VGKA 3A5LC 3THXB 2EX3A 2MBKA 4CBUA 4DV4K 1RTHA 3QBWA 4U7BA 3THXA 1RDWX 1RTIA 3SAHA 4DU4A 3NVKA 3G0ZA 3WNGA 5M1NA 5I9EB 4B1WB 1PTXA 2KLAA 5M1QA 3CJAA 4DUZK 3TSPA 3OYFA 2YHXA 4CERA 3ZSYA 5CYQA 3ZT3A 3NGZA 3VQ4A 3A0IX 1LQHA 1LWFA 1QSSA 3SQ2A 3NGIA 4JI8K 3D2EB 3ZT4A 4H5NA 1XC3A 3AVJA 1XC9A 3L0QA 4XH5A 4OPKA 3D2EA 2HF4A 2PY5A 3J7AP 1BG3A 3NBPA 3T7ZA 1TK5A 1JKZA 3KD5E 1QHAA 3CI5A 4M3WA 5GIOA 4NB4A 4HCBA 2FSNA 4JEPA 3R9PA 3WQTA 2HMIA 4CZGA 5HL7L 2DY4A 3ID8A 3SJHA 4OLAA 5M1KA 5F1XA 4B9QA 2Q0RA 4O44A 3CXCM 4JI3K 4O8UA 3QETA 2O8BA 1S1VA 4B3TK 3FR0A 1WOQA 2WFBA 3LZJA 3CCLN 5BPMA 2NRZA 5FRMA 2IS3A 3SQ1A 3MMVA 3RVCA 5DM6L 3BF1A 4B9VA 3DLKA 4OKEA 1JCFA 4MFBA 4XJXA 4AHTA 5KPRA 2Z1JA 3SJJA 4JLHA 1VQMN 1NK7A 1NK4A 2NY8X 3VN5A 3LDLA 1ATRA 5EX5A 2WUSA 4FJMA 1FJGK 2P51A 5T7BA 3F9KA 5F2RA 4FWOA 1GLCG 5FLXO 1I2VA 4WFBL 4M7XA 5JICA 5GADP 3S3MA 2O4IA 4IFVA 4CZIA 3QEXA 1XMQK 5GINA 1T7PA 1UA1A 3VA3A 3CJ9A 1NGEA 1LWCA 4CEEA 5JMVA 2QWQA 4CCHA 3WNFA 1WSHA 2K35A 2Z1IA 3KOXA 3TAEA 1OVYA 3I55N 1NU0A 1SKSA 3CG7A 1K8AO 3ENHA 4A61A 4BY9C 4CVNE 2J4RA 4F9OA 1KTQA 1N34K 2GWJA 1NGCA 1ESVA 4FJ8A 1NGHA 3H1VX 1VQLN 3T1AA 4DS4A 3WEEB 2XO7A 1RNHA 2JDQD 4U67L 3U9DA 1BIZA 4GKKK 4HVJA 2QWNA 3WEEA 4DQIA 5IWAK 3AVCA 2KYQA 1WSIA 5ADXH 3MXMA 3L2VA 3VQDA 1T7BA 4X62K 5HRPA 1G15A 2UUAK 3QBXA 5B8HA 1DQ7A 3IRXA 4B9SA 4FWNA 5JENA 4KO0A 3CC4N 2G8VA 4IDHA 2GUPA 4CF8A 2HBJA 4JK8A 2HHQA 4H5RA 1X9MA 1IKXA 1HNVA 3HL8A 3NCIA 1AHOA 4KB0A 5AQJA 2G2KA 4M3TA 1C55A 3CJCA 4MLEA 1HRHA 3RMDA 1JXBA 3OYEA 1SEGA 1T44A 1JCEA 2NRVA 1ZUTA 1YJ9N 1KVBA 1U6ZA 5HOOA 5E84A 2OZMA 1T0ZA 2UUBK 3M5RA 1JXEA 1QE1A 3LP0A 1L3UA 2A5XA 3QB0A 3PIPL 3AO1A 3PV8A 2KHOA 3K2PA 2G8KA 2KBKA 1X9WA 4DWIA 1T8EA 5D3GA 1FK9A 1HX1A 3SUPA 2P5OA 3A5OC 5AQIA 1VQ8N 2M8BB 2NRWA 3VOVA 4CJ4A 3THVA 3AAQA 4FLXA 3VQAA 4KHNA 3LDSA 4CF2A 3QMLA 3HVRA 4DFMA 3KLGA 3MWPA 1S9GA 3G25A 4H0PA 1T7AA 2G8HA 4KH5A 3EZWA 2VWKA 1GLLO 4GV6A 3VF2A 2FF3B 2Q3SA 2P9IA 3PIOL 1B9FA 1C1AA 1NGAA 4CEBA 1L3VA 2ZE2A 4WFAL 1VRTA 3ZSWA 5JVGL 4LF5K 5AQOA 4AM6A 4B9TA 3QNNA 4RWTA 4YORA 3SAFA 2HBKA 2JWLA 3OVNA 1A5WA 4QS7A 1DEJA 4B1UB 1FKOA 1HUXA 3M8PA 5IT9O 1QZ6A 5FPNA 4B9LA 3ATVA 3QIOA 1XNQK 1TV6A 2DFHA 1IH7A 4FM0A 3C94A 4O4GA 2A6AA 3EN9A 1S72N 3E7UX 4AHVA 1C6VA 3K58A 1GLAG 3HZ6A 1Y64A 4M3YA 3R8EA 3LAKA 4DKWA 1Q9YA 4NCAA 4DLGA 2RN2A 3HTVA 2HW3A 3FGUA 4H5VA 4FYDA 2YJFA 1KD1O 1I3AA 1S6PA 4CJ3A 1SL2A 4FWSA 4C1NI 3K5MA 4J2BA 3VEVA 4AQYK 1B3CA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5LMU K;  5A2Q O;  2QEX N;  2B68 A;  3L2R A;  4UAD E;  2D4W A;  4M45 A;  1BI4 B;  1YVN A;  3TSQ A;  5AQV A;  2F9W A;  3E7R L;  1VK0 A;  2HB5 A;  1QSY A;  3CCM N;  3QIP A;  3KOY A;  1TKD A;  1BI4 A;  4KKO A;  3G6E N;  4YOT A;  1JLC A;  4CEF A;  3MXI A;  1IG8 A;  3SMS A;  3E01 A;  5AZJ B;  1RDC A;  4E89 A;  2FXU A;  2RHK A;  3LP2 A;  1X3N A;  4MO4 A;  4IBN A;  5AZJ A;  3LP3 A;  3MWT A;  5BPN A;  4YOV A;  2OPR A;  1CZB A;  1W0H A;  4CIE A;  1YIT N;  1M90 O;  1C56 A;  3ENO A;  4JHD A;  1VSD A;  2ATQ A;  2HBM A;  3F9M A;  1Q8I A;  1RCH A;  3I33 A;  1TK8 A;  1NG9 A;  1ZYW A;  4DF8 A;  3OYI A;  4FSV A;  3L2Q A;  2YCH A;  4A5A A;  2B6A A;  3QIN A;  1DTT A;  3CQ8 A;  2O8D B;  4KHY A;  3AGK A;  3V81 A;  4BC4 A;  2F96 A;  3PO4 A;  2O8D A;  2LJ7 A;  3EKU A;  1VNB A;  3R6M A;  1QS4 A;  5CZ2 A;  4Y1D A;  3HO1 A;  1T3V A;  4C1N K;  2HHU A;  1E4F T;  4CGD A;  1E3M A;  1A5X A;  4FVM A;  3OJU A;  1U47 A;  4ELV A;  5AQX A;  2OPS A;  3SPZ A;  1WSG A;  4CIF A;  1Z6R A;  1RT6 A;  1RBU A;  3VGK A;  3A5L C;  3THX B; 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