3D2FB

Crystal structure of a complex of sse1p and hsp70
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock protein homolog SSE1
publication title Structural basis for the cooperation of Hsp70 and Hsp110 chaperones in protein folding.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 116
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3d2fB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2fB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2fB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3d2fB04
2P9SA 4H5TA 3A5NC 3G25A 1NGCA 2BUPA 3QDKA 4FWQA 1KAZA 3ULEA 4PKIA 4CZGA 1Z05A 3CJ7A 1YVNA 2ASMA 4BRLA 4FWMA 1BWFO 4DCHA 4BR4A 5KPZA 3GG4A 4FPBA 3WXKA 3H1VX 2QWRA 1NGDA 4BRMA 2PAVA 3SMPA 3DWLA 3GDQA 4WQ4C 1NGIA 3R9PA 3FE1A 4IZ9A 2P9IA 2F9TA 1HJOA 1DGKN 4DB3A 2IVOA 4FWNA 2CGJA 1X3NA 5AQGA 2P9PB 5EVZA 3RSEB 4H03B 2QXLA 5AQJA 2QWPA 4O8KA 4B1XB 2V7YA 4CZHA 2WUSA 3IMXA 2H3GX 3HTVA 4CZEA 2W40A 3ZEUB 2E2OA 3EZWA 3U4LA 3VGLA 5BPNA 4XEIA 1DEJA 1GLCG 3J8AA 2QWLA 1CZAN 1QQOA 3M6GA 1QZ5A 2P9NB 5ADXA 2D0PA 4H0TB 4BREA 3HZ6A 1QQMA 2A6AA 3R6MA 3GL1A 3ZETA 5AQOA 4H0VB 1BU6O 1NBWA 3FZFA 2J4RA 1TUYA 4M7YA 4A62A 3HI0A 4B1YB 2KHOA 3CQXA 5AZJB 1H1VA 5AFUH 2ASPA 2Q36A 3KZBA 1RDWX 1ATNA 1GLAG 5AZIB 4BROA 3B8AX 2E1ZA 3MDQA 2QW9A 3VERA 2GUPA 1NGEA 2E2NA 4KBOA 3VESA 4FOEA 2GELA 3VETA 1GLFO 4RCHA 3CERA 5JMVA 1IG8A 3DXMB 4JD2B 4MO5A 3D2EA 4E1JA 3EN9A 4IXCA 4ISGA 4K43A 1MWMA 3AARA 4NO7A 3EKSA 4FWKA 2DPNA 1ATRA 2E8AA 1JCGA 1HLUA 5EXWA 1WOQA 1XUPO 3FFKB 3LM2A 1OKJA 4BG9A 3ENHA 4PKHA 2FXUA 3KHYA 1K8KA 2A40A 4H5VA 2OANA 2YHYA 3VENA 3WQTA 4IJAA 2EWSA 4QS8A 4BRDA 3KVGA 3LDNA 1Z6RA 1HPMA 4GNIA 1HX1A 1GLBG 3GBTA 4B1VA 5FPMA 4BR7A 3MN9A 2V51B 2NZTA 2PBDA 4BR5A 3WXLA 3MK6A 2GEMA 4RTFD 4BR0A 5I9EB 3WEEA 2V7ZA 2P9UB 1X9JA 3WQUA 3QBWA 3VEWA 3C0BA 5AQUA 3GE1A 3FR0A 4Z94A 5KQDA 1V4TA 1ATSA 4CZJA 1GLLO 3QFPA 3VEOA 5AQZA 5AQMA 2IIRA 3DJCA 5JLFA 3VOVA 4FPAA 3CJCA 4K25A 4EHTA 5AQNA 4BGAA 3CIPA 5CE3A 3LDQA 5KQ8A 4FL9A 3FZHA 5EOYA 4B9QA 4MO4A 5LJWA 1MA9B 5E84A 3MN6A 4K41A 2P9PA 3RSEA 4HTLA 1SQKA 1NGAA 4BRIA 4BRCA 3VGMA 3FZKA 1NGHA 4FWPA 5FPDA 4JN4A 4H5RA 3WT0A 3D7EO 1V4SA 1LCUA 2CH6A 3ZEUA 4WQ4A 4H5NA 4CI6A 1E4FT 1EQYA 3C7NB 2HMPA 3EKUA 2FSNA 3H3OB 3S41A 3SLCA 5KPTA 2Q97A 2P9NA 3BEXA 2VYPA 3BF1A 2BTFA 4H5WA 5AQSA 2NLXA 3FZLA 2Q2RA 4BR2A 4XH4A 1E4GT 4B1UB 4CJ7A 3UKUB 1NGFA 5AQIA 5AZJA 1MWKA 3DXKB 3CETA 4A2AA 4FWRA 2QWNA 3LDLA 5EY4A 4BC4A 3VEXA 5AZIA 5JICA 4LC9B 3O1WA 5B8HA 5AQHA 1QZ6A 5BRHA 3ATUA 5AQYA 4BRFA 4XH5A 2W41A 4CD3A 3CJAA 3QB0A 2V52B 1XQSC 4MLEA 3UKRB 4JD2A 3DXMA 3CHWA 2D1KA 2I7PA 1GLEG 1R59O 3OHRA 4ISFA 3O08A 2D4WA 4I6MB 3VPZA 1T6DA 4CZMA 4M7XA 3A0IX 3LM9A 4QS7A 4EAHD 1BDGA 4QS9A 4YDUC 2FLOA 3U9ZA 3CI5A 2FF3B 1QQNA 4B1WB 4BC3A 5AR0A 2Q0RA 3TPQA 3EO3A 2D0OA 3L6QA 3P4IA 3EL2A 4WQ5C 4C23A 3O1BA 2P9KB 2ZF5O 2QWQA 3A5LC 3CQYA 3BF3A 1BG3A 4H0PA 3A8YA 3M3ZA 5AQPA 3ID8A 1BOTO 2P9UA 3FLCO 1JCFA 3LDPA 5AQTA 1HUXA 1NGGA 5AFUA 3W0LA 3M1FA 1IJJA 2ZGYA 3FGUA 2A5XA 3A5OC 3HSCA 5BREA 4CBUA 1JCEA 3CJBA 4RWTA 5JLHA 2Q31A 3H1QA 4F9OA 4JHDA 2CH5A 3AAQA 3WXIA 4BRKA 5F1XA 4HWIA 5BRFA 2YI1A 4M63C 5LY3A 2FF6A 3BUZB 2E1YA 1NLVA 3IFRA 1TYQB 4FWOA 4Y0WA 4CD1A 1GLDG 5F0XA 1YUWA 3IUCA 1P8ZA 2ZWHA 1LOTB 1QHAA 3SJHA 1BA0A 2ZGZA 2P9LB 3AAPA 2CGLA 3WXJA 4DHYA 4GY2B 5FPEA 4XH1A 4PL7A 1C0GA 3TU5A 3QICA 3C7NA 4WYBA 4BRHA 4DQ8A 5ADXH 4O5FA 3O80A 4BRPA 4BRGA 1GLJO 1T6CA 5AQKA 2AA4A 4H0XB 3D2FB 3O8MA 1NMDA 1ZC6A 4CZLA 3O6WA 1U2VB 1MDUB 2YCHA 3WUHA 2Q0UA 3UKUA 2A3ZA 3H45C 5KPRA 3DXKA 1NM1A 3H46O 5BPMA 2F9WA 3VEZA 2VCPA 4L3QA 3VEYA 4AM6A 2YJEA 2P9SB 1S3XA 3H6EA 3U8XA 4CBWA 5BRDA 3ULEB 2AP1A 4ISEA 3SMSA 3MMVA 4IWVA 4H0OA 1BA1A 5AQRA 1SAZA 4BRAA 3JXUA 2GWKA 3UKRA 1KXPA 3R8EA 4J8FA 2HF4A 1T44A 1DKGD 2Q1NA 4JAXA 2P9IB 4EHUA 1J6ZA 3ENOA 3ATVA 3DAWA 2QWMA 4I6MA 2E2PA 1XC3A 4BGBA 1WUAA 3ZX3A 1RGIA 3F9MA 4IJNA 4BR9A 4FSVA 3VF6A 3QMLA 3A5MC 2YJFA 3VEVA 3CJ9A 1Y64A 2QM1A 1NGBA 5LJVA 4PKGA 2FSKA 5E26A 3UE5A 3AY9A 5BPLA 4IO8A 3H3NO 3W3DA 2GTDA 3I8BA 3U9DA 1HKGA 2ASOA 5TKYA 3ZX0A 4BC2A 2I7NA 2P9KA 1U6ZA 3ZETB 2YHXA 3VF4A 1HKBA 2IVNA 4YDUA 4B1ZA 4A61A 4FWLA 3UB5A 4EFHA 2NRHA 4BQLA 1S22A 4CZKA 5EX5A 1C0FA 2HOEA 4WQ5A 4BRNA 2YHWA 4NB4A 3ZX2A 2A41A 1NGJA 1BUPA 4BVOA 4FWSA 3QFUA 3BP8A 3VF2A 1KAYA 4FO0A 4CZIA 3CJ1A 5F2RA 2FSJA 2E2QA 4BG8A 1KAXA 3D2EB 2QWOA 1D4XA 2VWBA 5BN8A 4BVPA 5AQFA 1TYQA 3LL3A 3MN5A 1YAGA 4FOIA 4JNEA 4CBXA 3L4IA 5AQXA 5BR9A 4BC5A 1RFQA 1TUUA 1YXQA 4MLHA 2UYTA 1X3MA 3HM8A 5AQWA 1K8KB 4PL8A 2P9LA 5ELZA 4BQZA 3IDHA 5FPNA 3GOIA 3JS6A 3L0QA 2ITMA 3SK3A 3I33A 2HF3A 1ESVA 4AM7A 1NWKA 5AQLA 4EIAA 3LDOA 2GWJA 3FZMA 1G99A 4A2BA 3MN7A 3O4WA 4BRQA 1ZXOA 2E88A 1BO5O 4K42A 3D2FA 5AQVA 4CZFA 1U2VA 2CGKA 5AQQA 2E20A 2A42A 3QBXA 1SZ2A 4H0YB 3VGKA 3WEEB 2IVPA 5BN9A 3MCPA 1Q18A 3O5BA 3HBTA 4JHDB 1HKCA 1ZBSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OJUA 3G25A 4JYAK 4N5SA 3MXIA 4FJIA 3QDKA 5FLXO 4FJ8A 3SUOA 4CEDA 3ULEA 3VQ9A 1OH5A 1L3UA 1YVNA 4FJ9A 1S9GA 2W00A 4AAZA 2PY5A 4CE9A 2FBTA 1OMYA 3H1VX 3HO1A 1A5WA 2PAVA 4WQ4C 3SBTA 2G8UA 3FE1A 2KFZA 4M3RA 1HJOA 3EYZA 1DGKN 2F8SA 4LFBK 2VWKA 2O8FA 1M1KO 1WT7A 2QXLA 5AQJA 1VQMN 1WSGA 3AO2A 4F2SA 2H3GX 4HE7A 3LP3A 4CZEA 2W40A 5HL7L 1EO1A 1DQ7A 3CCUN 1HR0K 3EZWA 1LW2A 4B9SA 3VGLA 3AA3A 2UU9K 5BPNA 1B92A 3L2UA 4LF5K 3EY1A 4JI7K 2D0PA 3AGKA 4BREA 3KLFA 1JLGA 1NBWA 3KP0A 3FZFA 3KOWA 4A62A 2KHOA 2PZSA 4BE2A 4C1NI 1O13A 1KLMA 4UADE 3HP9A 4CJPA 1QQCA 4PA1A 3NF7A 4DTOA 1SKRA 5AZIB 4JRPA 3S3MA 1VNAA 1BHLA 2X6NA 1HYZA 3MDQA 3QO9A 3CFPA 5LL6Z 4A5AA 1I2UA 3VESA 4FOEA 2GELA 4RCHA 4KREA 3CERA 2VQFK 4MO5A 2UXDK 4E1JA 3QERA 3THYB 4ISGA 4K43A 1NJYA 2O8BB 3AVFA 1L5UA 4G1QA 3V4IA 4OLBA 1TKZA 3EKSA 4FWKA 1NK0A 3I55N 3RR8A 4BVPA 3LM2A 1HLUA 5EXWA 1XUPO 2EX3A 1IG9A 1W9HA 1OKJA 3V81A 4H5VA 1S1TA 1REVA 5CZ1A 1I6GA 1DTTA 4IJAA 1BK8A 3TSQA 1KD1O 1Z6RA 3ZSXA 4DV7K 1GLBG 3GBTA 4JI3K 4YOTA 4BR7A 2G8FA 3MN9A 3M8PA 2NZTA 2HHIA 1N8RO 2ZJPL 4BR0A 2VG7A 5I9EB 1BIUA 1JLCA 2P9UB 3WQUA 3HP6A 4C8MA 4CJTA 3QBWA 3VEWA 4OGEA 3LDSA 1D9DA 3GE1A 4JI2K 2YIPA 3HVRA 1JLBA 4BWMA 1OZZA 4CK2A 2IIRA 4PHTX 2DTUA 4M45A 4CGFA 4U7BA 2IOCA 2LY6A 4JI6K 3CD6N 4IOXA 3SZ2A 3V6DA 4IFYA 3AO1A 4FL9A 4C8OA 4B9QA 4M3WA 1JLQA 3BZCA 5E84A 4FJ7A 3EE9A 1VSIA 5GADP 3SCXA 4ZHRA 2XHBA 4Q5VA 4CGDA 2F96A 4YORA 1FH3A 1RTJA 1LCUA 1NJZA 4OO1J 4H5NA 4CI6A 1EQYA 1RT2A 2HSTA 3C7NB 1SL0A 1JL2A 4RG8A 3K0SA 2YHAA 3VQQA 1NRBA 2FSNA 3PSFA 3SLCA 4FLTA 1I2VA 2Z1IA 2BTFA 5HP1A 2NLXA 3FZLA 1SN1A 4Y1DA 4OKEA 3T1HK 1E4GT 4B1UB 4FJXA 4YNQA 3CETA 1WB9A 5D3GA 1FKPA 4A2AA 2LI7A 5K14A 4B3SK 4WFBL 3IKMA 3VEXA 1NJWA 5DM6L 1HNZK 4CHYA 2ZD1A 5B8HA 3DLGA 3CC7N 5AQYA 5CR4A 4R5PA 1XQSC 4E7HA 2HBMA 2NUBA 3DXMA 4JKDA 3ISNC 3I0SA 5M1KA 1VSMA 1J9AA 2I7PA 4G9ZA 1DT9A 1R59O 4DR2K 4B08A 3QEWA 3N4QA 1IBMK 4ISFA 3TR8A 4CFCA 4CZMA 1NK4A 3A0IX 1JLFA 4QS7A 3SAGA 4QS9A 3SJJA 2GBZA 2O8EB 3OVNA 4NLBA 3O9QA 1I6FA 2QTDA 3THWB 1E3MA 2Q0RA 3TPQA 2D0OA 4C23A 3VQEA 1RDDA 2P9KB 3O1BA 4IG0A 1L3SA 3A5LC 1KFDA 1S1WA 3ZSOA 5T7BA 3BF3A 3M3ZA 4LF8K 5AQPA 1BOTO 3SPYA 4KYPA 4LD0A 5IT9O 5KRTA 4NYNA 2FBYA 4DQIA 1N6QA 1TAQA 4OKJA 3A5OC 2UUCK 1CLQA 4B9NA 4RWTA 3AO5A 4A5BA 3H1QA 2O8DB 4WFNL 3L4QA 3WXIA 5BRFA 3TAFA 2YI1A 2HHQA 4M63C 1YT3A 4LY7A 3ZSYA 1HJRA 3OS2A 4LF4K 3BUZB 1HQUA 2E1YA 4DMNA 2WFBA 3DLBA 1GLDG 1IKWA 1P8ZA 2LJMA 4Z4EA 3AA5X 1JL1A 4FM2A 3R2VA 4CJ5A 5FPEA 4DR7K 5EU7A 2KBKA 1U49A 4BRHA 4ZTJA 3RWUA 4DQ8A 3S3OA 2YX6A 4BRPA 1T6CA 1N5YA 4X66K 3M5RA 4CHPA 1MDUB 1I3AA 2A3ZA 3H45C 1K8AO 2OZMA 2E0HA 4FM0A 4JKHA 3ASMA 5KGWA 3H46O 1C6VA 1VSLA 3K9JA 4JKGA 4Z4CA 2F9WA 2PFUA 3VQAA 2YJEA 1XNRK 3K58A 4M41A 5FRNA 3H6EA 2HBLA 3ULEB 4ISEA 4DSKA 3K57A 4DV0K 4JLHA 3VN5A 2HHUA 3K5MA 3CCEN 1BA1A 4BRAA 2JWKA 3UKRA 1HRHA 4RW6A 3R8EA 1HYSA 1NOZA 3DRSA 1T44A 3JSMA 2AJQA 1DKGD 4EZ6A 2Q1NA 3CCJN 4JKFA 2HB5A 4RW7A 3C6TA 3ENOA 3O3HA 2DY4A 3OY9A 2O8FB 5DK5A 2KZZA 1WUAA 3KHWA 4BR9A 1TKDA 3AVLA 3DLLL 1ZFUA 4KFBA 4AHCA 1EP4A 2YJFA 4PQUA 3NGYA 2GL1A 3NE6A 2OA8A 1NGBA 3M8RA 3AY9A 5BPLA 4IO8A 2Q3SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3OJU A;  3G25 A;  4JYA K;  4N5S A;  3MXI A;  4FJI A;  3QDK A;  5FLX O;  4FJ8 A;  3SUO A;  4CED A;  3ULE A;  3VQ9 A;  1OH5 A;  1L3U A;  1YVN A;  4FJ9 A;  1S9G A;  2W00 A;  4AAZ A;  2PY5 A;  4CE9 A;  2FBT A;  1OMY A;  3H1V X;  3HO1 A;  1A5W A;  2PAV A;  4WQ4 C;  3SBT A;  2G8U A;  3FE1 A;  2KFZ A;  4M3R A;  1HJO A;  3EYZ A;  1DGK N;  2F8S A;  4LFB K;  2VWK A;  2O8F A;  1M1K O;  1WT7 A;  2QXL A;  5AQJ A;  1VQM N;  1WSG A;  3AO2 A;  4F2S A;  2H3G X;  4HE7 A;  3LP3 A;  4CZE A;  2W40 A;  5HL7 L;  1EO1 A;  1DQ7 A;  3CCU N;  1HR0 K;  3EZW A;  1LW2 A;  4B9S A;  3VGL A;  3AA3 A;  2UU9 K;  5BPN A;  1B92 A;  3L2U A;  4LF5 K;  3EY1 A;  4JI7 K;  2D0P A;  3AGK A;  4BRE A;  3KLF A;  1JLG A;  1NBW A;  3KP0 A;  3FZF A;  3KOW A;  4A62 A;  2KHO A;  2PZS A;  4BE2 A;  4C1N I;  1O13 A;  1KLM A;  4UAD E;  3HP9 A;  4CJP A;  1QQC A;  4PA1 A;  3NF7 A;  4DTO A;  1SKR A;  5AZI B;  4JRP A;  3S3M A;  1VNA A;  1BHL A;  2X6N A;  1HYZ A;  3MDQ A;  3QO9 A;  3CFP A;  5LL6 Z;  4A5A A;  1I2U A;  3VES A;  4FOE A;  2GEL A;  4RCH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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