3GDQA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 1-like atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
379
structure length
376
Chain Sequence
GIAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPQNTVFDAKRLIGRKFNDPVVQADMKLWPFQVINEGGKPKVLVSYKGENKAFYPEEISSMVLTKLKETAEAFLGHPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKGERHVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQANLEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELCADLFRGTLEPVEKALRDAKMDKAKIHDIVLVGGSTRIPKVQRLLQDYFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1-like
total genus 122
structure length 376
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3gdqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gdqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gdqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3gdqA04
2W40A 2BUPA 3H6EA 3FFKB 3FZMA 3VF6A 1QQMA 4WQ4A 2D4WA 3LL3A 2QWNA 4CZKA 2IIRA 1T6CA 4LC9B 4JD2A 3GOIA 3WXIA 5AQUA 2QWRA 3UE5A 4M63C 4RCHA 3CQYA 4BG9A 4DB3A 3QDKA 3A8YA 2QM1A 3M1FA 3IUCA 3VGLA 3D7EO 1HJOA 1NGJA 1U2VB 2IVOA 3VEOA 2QWQA 4M7XA 4BC4A 1NGGA 3W0LA 3VOVA 4WQ5C 2E2NA 3U4LA 3DXKB 4AM7A 4FWOA 1X9JA 2H3GX 4FWNA 3CERA 4YDUA 3O6WA 2YHYA 1R59O 4BGBA 4BR2A 1QZ6A 3CIPA 4BRKA 4BRGA 1Y64A 3ID8A 4MO5A 4B9QA 4H5NA 3RSEA 4JAXA 4K42A 1CZAN 3VENA 4JNEA 3CJ7A 4BR5A 1BDGA 1BA1A 3FGUA 3J8AA 1GLJO 1GLLO 3F9MA 1DGKN 4PKHA 3CJ9A 1C0GA 3O1BA 4FO0A 2Q2RA 1NGAA 4BRMA 1RDWX 5AQLA 3M3ZA 2HOEA 3KZBA 1T6DA 4M7YA 2P9NA 5BRHA 1V4TA 5AQXA 3MN9A 3VF4A 3FZFA 3CHWA 5AQHA 1IJJA 3CJ1A 1Z05A 2A42A 2D0OA 3EZWA 3O80A 3WQUA 1NGBA 3EKUA 3G25A 3CJBA 4K41A 4QS7A 5AQMA 4CZJA 1QQNA 4QS8A 3VERA 4IXCA 3B8AX 3H1VX 2E2PA 1E4GT 5AQYA 4CZHA 1IG8A 3A5MC 5LY3A 4JHDA 3TPQA 3H46O 5AQPA 2E2OA 4E1JA 3O08A 1LCUA 5BN9A 2E88A 1S22A 4XH1A 4XH4A 5FPNA 2FSKA 3ENOA 3EKSA 3IFRA 2HF4A 4PKIA 5JLHA 2Q31A 3JXUA 2P9UB 5EXWA 2PBDA 4BRAA 3D2FB 1HUXA 4A61A 5BR9A 4GNIA 3O1WA 5BN8A 4CD1A 3UKRA 1S3XA 1ZBSA 2P9IB 4BR7A 3W3DA 2P9PA 4WQ5A 3HBTA 3KHYA 4A2AA 4EIAA 1ZC6A 4FWLA 4H0VB 2P9LA 3D2EB 3HSCA 3ENHA 3TU5A 3SJHA 3LDLA 4H5WA 1GLDG 5F2RA 3L0QA 3ZEUA 4B1YB 2P9KB 4B1UB 5AQQA 4H0OA 4DCHA 4BQZA 5AQTA 5KPRA 3OHRA 2ZGYA 2Q36A 3CJCA 1TUYA 3VEWA 1HKBA 4EAHD 5B8HA 5FPDA 2ITMA 5JMVA 1OKJA 5KPTA 1G99A 4BRLA 3HI0A 4B1VA 4AM6A 1U2VA 3I8BA 2ASOA 2QWPA 3QFUA 2QW9A 3AARA 3LM2A 1MWKA 1ATRA 3VGMA 1GLAG 1MA9B 3QBXA 4PKGA 5AR0A 5AQVA 1BO5O 1BA0A 3DXMB 1Q18A 5TKYA 5EVZA 4BVOA 2J4RA 4H5RA 1V4SA 4EHUA 4H0YB 4CBWA 5AQNA 3L6QA 5AZIA 5AFUH 5F1XA 3R9PA 3DJCA 3HM8A 2CGJA 1HLUA 1GLCG 1ATSA 4CI6A 1HKGA 3GL1A 2P9SA 4BRPA 2Q0UA 4CZFA 5KPZA 3FLCO 2E8AA 4IJAA 4BC5A 3WT0A 4NO7A 4CBUA 1C0FA 3WXLA 3ZX2A 2HF3A 3ULEA 3EO3A 1NM1A 1QZ5A 2E2QA 2Q0RA 4Y0WA 5AQZA 1K8KB 1JCFA 4H0PA 1WUAA 4BRQA 2GWKA 4MLHA 4L3QA 3EL2A 3CJAA 3UKUA 4BR4A 1LOTB 3MDQA 4BVPA 2NRHA 4FPAA 4CD3A 3ZX0A 4FOIA 3BEXA 4CZGA 3BF3A 2NZTA 4FWKA 3ZETA 2YJEA 4QS9A 1TYQB 3MMVA 5BREA 3CETA 2P9UA 4FSVA 3FE1A 3L4IA 2YHWA 2VWBA 3O4WA 1D4XA 1E4FT 1ATNA 3H3NO 3SLCA 2IVPA 4HWIA 2P9IA 2FSNA 1QQOA 3LDNA 1P8ZA 4HTLA 5AQFA 1RFQA 3WQTA 2A40A 4BRCA 2A41A 2Q97A 5AZJA 2YI1A 3DAWA 4I6MB 4GY2B 3H3OB 2P9KA 1KAXA 5BRDA 3VF2A 2P9NB 3GBTA 1SZ2A 4J8FA 3MN5A 3SK3A 3AAPA 2VCPA 3C7NA 5BPMA 3H45C 3C0BA 1NGIA 1U6ZA 3ATUA 1HKCA 3BF1A 3LDPA 4CBXA 2ASPA 3SMPA 3CI5A 2A5XA 4H5TA 2EWSA 4K43A 4JHDB 1BOTO 3A5OC 3MN7A 5ELZA 2FSJA 4CZEA 1JCEA 1YAGA 1GLFO 3WEEB 4FOEA 1NWKA 5F0XA 2IVNA 3DXMA 2PAVA 2GTDA 4BG8A 3R8EA 5ADXH 5I9EB 2AP1A 1JCGA 4CZLA 4F9OA 1DKGD 2QWLA 3FZKA 2CH6A 1EQYA 3VETA 2ZF5O 3S41A 3GDQA 3H1QA 4WYBA 4A62A 2I7PA 2FXUA 3FR0A 1NMDA 3DXKA 2CGKA 4CJ7A 4C23A 3QICA 2UYTA 3IDHA 1XQSC 5JLFA 2P9PB 3U8XA 1HPMA 5FPEA 4ISGA 2P9LB 4IO8A 2ASMA 4B1WB 1NGHA 4H03B 3LDOA 5AQIA 2CGLA 4DHYA 5EX5A 4BREA 1KAYA 3A5LC 1RGIA 4BR9A 1K8KA 3ZEUB 5BRFA 2DPNA 4A2BA 4Z94A 3LM9A 4FPBA 3R6MA 1KXPA 5LJWA 4EFHA 5KQDA 3I33A 5E84A 3U9DA 3WXJA 5CE3A 2HMPA 1KAZA 4IZ9A 2E1YA 1J6ZA 5AQGA 3UB5A 1NGEA 3GG4A 4XH5A 5AFUA 3QMLA 1NGFA 3VEXA 3QFPA 5KQ8A 3AY9A 3FZLA 4MLEA 3QB0A 4JD2B 4NB4A 3HZ6A 2ZWHA 3AAQA 4BGAA 1TYQA 4RWTA 1BWFO 3U9ZA 4O8KA 2Q1NA 1GLEG 4O5FA 4B1ZA 2D1KA 1NLVA 4FWRA 1NGDA 4MO4A 5AQKA 4H0XB 2FLOA 4BC3A 2V7ZA 5E26A 2YHXA 1ZXOA 4ISEA 2A6AA 1YVNA 2CH5A 1MDUB 4BRDA 4PL7A 5AZIB 1YUWA 3VEYA 2YJFA 2GWJA 4RTFD 1X3NA 2I7NA 2P9SB 3WXKA 2KHOA 4JN4A 3JS6A 2GELA 2NLXA 4BRNA 1XC3A 3P4IA 5LJVA 3D2FA 5BPNA 4WQ4C 2FF3B 5AQOA 4I6MA 4BC2A 4EHTA 2A3ZA 3ATVA 1GLBG 3RSEB 3A0IX 2W41A 1BUPA 1SAZA 3VPZA 3ULEB 3MK6A 3MN6A 4ISFA 4FWSA 3BUZB 2F9WA 3SMSA 1YXQA 2FF6A 3D2EA 3VGKA 1HX1A 3O5BA 4BROA 2QWMA 4H5VA 4FWMA 3UKUB 1BU6O 2YCHA 5AQRA 5AQWA 1QHAA 2WUSA 1Z6RA 2E1ZA 4IJNA 3BP8A 3MCPA 5EOYA 4BRHA 4B1XB 3WEEA 1NGCA 2V51B 3CQXA 3FZHA 3VESA 5BPLA 5AQJA 5FPMA 4YDUC 3GE1A 4FWQA 3ZETB 4K25A 3EN9A 2D0PA 3VEZA 5JICA 3ZX3A 1H1VA 1WOQA 4FWPA 5AQSA 1XUPO 4KBOA 2F9TA 5EY4A 1X3MA 2GEMA 3HTVA 4PL8A 4CZIA 2ZGZA 2OANA 3QBWA 4BR0A 4BQLA 4CZMA 2BTFA 2GUPA 3IMXA 4FL9A 2VYPA 1TUUA 3O8MA 5AZJB 4IWVA 3LDQA 3KVGA 3A5NC 4DQ8A 2E20A 1NBWA 3VEVA 3DWLA 1DEJA 2AA4A 3UKRB 3WUHA 2QWOA 4BRIA 3M6GA 1SQKA 5ADXA 2V7YA 2V52B 4H0TB 1T44A 3C7NB 1ESVA 2QXLA 1MWMA 4BRFA 4XEIA 1BG3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2W40A 3FZMA 4JLHA 4JD2A 3GOIA 3O9UA 3AA3A 1TL1A 3ZSRA 3G10A 4BG9A 4DB3A 2VWKA 1J5EK 2G8KA 4FJGA 4FM0A 2MZ0A 2O8CB 3IUCA 3VGLA 2DFEA 3O4NA 3D7EO 2YNGA 5C15A 2VG5A 3VEOA 5GIOA 3NCIA 3R1XA 3W0LA 4B3RK 3SQ0A 1VSLA 3VTHA 2C1GA 1HQUA 2H3GX 1QVFM 4YDUA 3O6WA 4E7JA 4G9ZA 3RSEA 1JLFA 3SUPA 4K42A 1P00A 4DG1A 4EZ6A 1W0HA 1GLLO 3F9MA 4FLVA 4O8UA 3O1BA 3KLGA 1PE4A 1ZBLA 2Q2RA 1N33K 4AILC 1T6DA 1EKEA 4PWDA 5BRHA 1V4TA 1RDCA 5AQHA 4O0IA 4B9SA 4FW1A 3G25A 3ZSXA 3CJBA 4K41A 3MAQA 5HRPA 2RE2A 4CZJA 4F2RA 3NBPA 4IFEA 4QS8A 2IDOA 2JGUA 3B8AX 4DV1K 1NK0A 1IG8A 4JHDA 3KHWA 3H46O 5AQPA 3NF6A 3TABA 4EP4A 1POIA 4XH4A 1KCFA 3C6TA 3AGRA 1DT9A 1Q7YO 3P31A 2Q31A 2P9UB 1TK0A 2O4GA 2PBDA 1TAUA 3AVAA 1VRUA 4V19S 1NU0A 4CD1A 5MLCQ 1NG9A 1VSIA 4GMJB 2NRVA 1K9MO 2P9IB 1S1UA 4DSIA 4BR7A 4UJ0A 1MYNA 1T7BA 4WQ5A 1NRAA 3W3DA 3RRGA 2YNIA 4A2AA 4EIAA 4DTJA 3WXMB 4CJTA 4NYNA 2XRIA 3LDLA 1CZBA 3THXA 4H5WA 3HYFA 3OYBA 2P9KB 4CFDA 1EX4A 4BQZA 3U3YA 5KPRA 4CEQA 2ZGYA 4JK7A 1SS6A 1HKBA 2ITMA 4I7FA 3CW4A 1G99A 4BRLA 4BDPA 3V1RA 4A5AA 3I8BA 2ASOA 2QWPA 3QFUA 5KGXA 5GAEP 1HNVA 1OVYA 5FRNA 4N5SA 5AR0A 1BO5O 3VQPA 1WSEA 4NYFA 3DLRA 1T7PA 1BA0A 3DXMB 1Q18A 4M41A 1W9HA 4BVOA 4EHUA 1V4SA 3OYEA 1I2UA 5J1EA 1ZFUA 3PO4A 4LF7K 5AQNA 3AVFA 2HHIA 1ICAA 3R9PA 3L56A 3U6FA 4CIFA 1KFSA 4ICLA 3KK7A 3OJUA 1GLCG 3HT3A 4IFYA 1S9GA 5HRSA 4DR4K 1TVRA 2Q0UA 4DTOA 3ZSVA 4G1QA 1TKTA 2Z1IA 5GINA 4IJAA 4DMNA 4WFAL 4NO7A 3OS0A 3V1QA 1NK6A 2HNYA 2B5JA 4CEZA 1NNEA 2E2QA 4JK8A 1JCFA 4O5BA 3DI6A 1WUAA 1SEGA 2KKZA 3EL2A 2B6AA 1Q81O 1A5XA 3UKUA 1WNSA 4BR4A 1CXQA 3MDQA 4MFBA 4NCAA 2OPQA 3AVNA 4CD3A 3PIPL 3F73A 4FOIA 1Q9YA 4NXNK 3BF3A 2LI7A 5FLXO 3VQDA 3V1OA 3HP9A 3ZETA 1TYQB 4B3SK 1FW6A 3AVHA 4KRFA 3HSTB 2KBJA 3L4IA 2X78A 4AHRA 2VWBA 1D4XA 2E0HA 1E4FT 2IVPA 1KTQA 3SQ4A 1LW2A 4M3UA 1RTIA 4AH9A 3CYGA 1QQOA 3LDNA 1ZBHA 2HBMA 3KTQA 4CJQA 1RFQA 2NRXA 4DSKA 1QSLA 1GPTA 3DAWA 2IOCA 5BRDA 3VF2A 4KHQA 3KLHA 3NF8A 1SZ2A 1G15A 4HUFA 3DLLL 3C7NA 1ZYWA 3H45C 1NGIA 2HHXA 1T3VA 1HKCA 3BF1A 2ASPA 1BK8A 5I42A 4U7BA 3O3GA 4LFCK 4DV6K 4IOAL 4BEBA 3S3OA 4JKDA 3MN7A 1L3VA 5AJ3K 1JCEA 1YAGA 1JJ2M 4FOEA 1NWKA 5F0XA 3V6DA 4CJUA 4BG8A 3HO1A 1VSHA 3C6HA 5ADXH 3CPWM 2Z1HA 2O8CA 5CY4A 1JCGA 1TK5A 4HCCA 3SUOA 5CYMA 3S41A 2KJAA 4WYBA 4PQUA 3OS2A 2I7PA 3FR0A 4IDKA 4FJJA 1RTDA 4CFAA 4DF4A 3FFIA 2SN3A 2IGIA 2HW3A 4C23A 3IDHA 3P5JA 4JK9A 5JLFA 4DTUA 1IBMK 1ILYA 1HPMA 4AHVA 4OLAA 3LDOA 3HOSA 2CGLA 1VNAA 4DTXA 4DHYA 1I6FA 4BREA 4OKJA 1EETA 1K8KA 5BRFA 4A2BA 3SI6A 2Z1GA 4ILGB 4FPBA 3R6MA 1KVBA 4EFHA 4CJFA 1FKOA 3I33A 5E84A 1RDBA 1BCGA 3WXJA 3J7AP 4I9LA 5CE3A 1KAZA 1BI4B 2E1YA 2GUIA 5CR4A 2YKMA 1NGEA 3GG4A 3TAMA 4DSFA 1YTAA 3VEXA 1BIUA 3PO5A 3QERA 2A1SA 4CK2A 4JD2B 4IOXA 5KRTA 1LAVA 2ZWHA 3PX6A 3BK3C 4MDBA 1X9SA 3C6UA 3U9ZA 1GLEG 3ZCMA 3SJJA 2N2RA 4CJRA 1L3UA 4RW7A 3UIQA 4M45A 5A2QO 4ILJA 5E41A 4BDYA 3WNHA 4CGFA 1FKPA 2RKIA 2BDPA 3LANA 3VEYA 1KVCA 3L2WA 2XHBA 4JS4A 2O8BB 2P9SB 4JN4A 4KTQA 1XC3A 1XNRK 2ETJA 5BPNA 5FROA 4CJPA 1L3SA 2A3ZA 3RSEB 2W41A 4LD0A 2EX3A 3OYGA 3NFAA 3O4QA 4IDHA 4DF8A 3MN6A 4DFKA 3QO9A 4CEBA 3BUZB 2HVIA 2F9WA 3SMSA 3K58A 1TKDA 4JI4K 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2W40 A;  3FZM A;  4JLH A;  4JD2 A;  3GOI A;  3O9U A;  3AA3 A;  1TL1 A;  3ZSR A;  3G10 A;  4BG9 A;  4DB3 A;  2VWK A;  1J5E K;  2G8K A;  4FJG A;  4FM0 A;  2MZ0 A;  2O8C B;  3IUC A;  3VGL A;  2DFE A;  3O4N A;  3D7E O;  2YNG A;  5C15 A;  2VG5 A;  3VEO A;  5GIO A;  3NCI A;  3R1X A;  3W0L A;  4B3R K;  3SQ0 A;  1VSL A;  3VTH A;  2C1G A;  1HQU A;  2H3G X;  1QVF M;  4YDU A;  3O6W A;  4E7J A;  4G9Z A;  3RSE A;  1JLF A;  3SUP A;  4K42 A;  1P00 A;  4DG1 A;  4EZ6 A;  1W0H A;  1GLL O;  3F9M A;  4FLV A;  4O8U A;  3O1B A;  3KLG A;  1PE4 A;  1ZBL A;  2Q2R A;  1N33 K;  4AIL C;  1T6D A;  1EKE A;  4PWD A;  5BRH A;  1V4T A;  1RDC A;  5AQH A;  4O0I A;  4B9S A;  4FW1 A;  3G25 A;  3ZSX A;  3CJB A;  4K41 A;  3MAQ A;  5HRP A;  2RE2 A;  4CZJ A;  4F2R A;  3NBP A;  4IFE A;  4QS8 A;  2IDO A;  2JGU A;  3B8A X;  4DV1 K;  1NK0 A;  1IG8 A;  4JHD A;  3KHW A;  3H46 O;  5AQP A;  3NF6 A;  3TAB A;  4EP4 A;  1POI A;  4XH4 A;  1KCF A;  3C6T A;  3AGR A;  1DT9 A;  1Q7Y O;  3P31 A;  2Q31 A;  2P9U B;  1TK0 A;  2O4G A;  2PBD A;  1TAU A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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