3IUCA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 5 (bip/grp78) atpase domain in complex with adp
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
GTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70kDa protein 5 (Glucose-regulated protein, 78kDa
publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 113
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2009-08-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3iucA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3iucA04
3C7NA 2D1KA 3I8BA 2A6AA 1GLCG 4IWVA 4FPBA 4PKGA 1S3XA 3DWLA 4PKIA 1OKJA 3CETA 4A62A 2EWSA 3CJBA 3DXKB 3ATVA 3CI5A 5I9EB 3IMXA 3DXKA 4CJ7A 1KAZA 2CGKA 4CD1A 4HWIA 1NGIA 2GUPA 3R6MA 4K41A 4EAHD 3H45C 2H3GX 3D2EB 1P8ZA 2QM1A 5CE3A 3VEOA 3IUCA 4QS7A 3LDOA 4WQ4C 1MWMA 2J4RA 2P9KB 3AARA 1BWFO 3D2EA 4FO0A 3ULEB 4BG9A 4BRQA 4K25A 2P9KA 4CZHA 3VESA 3CHWA 4BC4A 3ULEA 4H0OA 4ISGA 4BRNA 1G99A 3UKRB 3O8MA 3M3ZA 4H5NA 3CQXA 2A42A 3UKRA 3BF1A 1BUPA 1BA1A 2Q31A 2QWQA 1NGCA 3SMPA 2FF6A 4FWQA 4L3QA 3W3DA 3QICA 4AM7A 3EZWA 1NGEA 3GOIA 4H03B 1YAGA 4GNIA 4BGBA 3D2FA 4E1JA 3EKSA 4H5TA 5AZIB 4A2BA 4IZ9A 1BOTO 4BQLA 5AZIA 1ZXOA 1XUPO 3VENA 4FWMA 3MMVA 3MCPA 1Z6RA 4YDUA 1NLVA 4XH4A 4BR7A 5EX5A 2CH5A 2E8AA 2P9PB 5AR0A 4CZEA 2GWJA 3CJ9A 1MWKA 5AQPA 4FOIA 2D4WA 1HUXA 2P9PA 3LDNA 5AQFA 2YHWA 2E1ZA 2W40A 3VF6A 5BRFA 3A5LC 3U9ZA 3WUHA 4FWRA 3LM9A 3O1BA 3CJCA 3LDQA 2ZF5O 4BREA 2Q0UA 4QS8A 3QFUA 3RSEB 4CBUA 5EXWA 2I7PA 4IJAA 4CBXA 1NGBA 3O1WA 3EKUA 1RFQA 3DXMB 3GG4A 2P9LB 5F1XA 4CBWA 4B9QA 1HPMA 2IVOA 1K8KB 1TUYA 5EVZA 2CGLA 1WOQA 1T6DA 1QHAA 3CJ1A 1K8KA 4FOEA 3VGLA 4H0TB 3ZETB 1LCUA 4NO7A 3O4WA 3DJCA 3IFRA 1C0FA 1NBWA 5AQKA 1HKCA 3TPQA 3ZETA 4ISEA 4BVPA 2E2OA 5AQOA 1HKGA 3C0BA 1JCEA 3ID8A 4BG8A 5KPRA 3FZKA 1ZBSA 4EIAA 4FL9A 3EO3A 4H0XB 5ADXA 1MDUB 1GLDG 3A8YA 1NGHA 5AFUH 2ASMA 4IJNA 3VEZA 3AAQA 1R59O 3ENOA 3MK6A 4H5VA 2QW9A 4FWKA 4IO8A 2P9SB 3VPZA 1JCGA 1DGKN 4EHUA 1NGAA 1IG8A 1TUUA 3VEXA 5KQDA 2FSJA 2P9SA 5KQ8A 5E84A 4BQZA 4EHTA 1QZ6A 3MN5A 4CZKA 2UYTA 3R8EA 3A5MC 3A5OC 3U4LA 2YI1A 5AQNA 2GEMA 2P9UA 4H0VB 4BRIA 2CH6A 3F9MA 4B1YB 3CJAA 3HBTA 1ATRA 2ZGYA 4BR9A 4DB3A 1QQMA 1ESVA 2GWKA 3L0QA 4FWPA 2IIRA 4CZIA 1V4TA 3WXIA 4AM6A 3FFKB 3FGUA 5EOYA 3VF2A 4CZJA 2F9WA 3CERA 4BC2A 3KHYA 5BRHA 4H5RA 3I33A 4JD2A 2YCHA 4GY2B 4C23A 2E2PA 4BRGA 1LOTB 1NGJA 3D2FB 2ZGZA 2I7NA 5TKYA 4B1VA 2A5XA 3UE5A 5AQVA 1X9JA 2FSKA 1XC3A 2PAVA 2E2QA 4KBOA 4BRAA 5FPEA 3QBWA 1U6ZA 3VGMA 5AQMA 1GLJO 3H3OB 4I6MA 4WQ4A 2DPNA 3AAPA 5EY4A 2Q0RA 3W0LA 4K42A 4CZGA 2V51B 4BC5A 2HOEA 3LDPA 3O6WA 4O8KA 3HTVA 5B8HA 3SLCA 3VERA 4BC3A 4CI6A 4XH1A 4WQ5C 3LL3A 4PL8A 2E20A 5AQUA 3JXUA 5AQIA 2V7ZA 3M1FA 3AY9A 4BGAA 3ZEUB 5JLFA 3GE1A 3TU5A 1NWKA 1WUAA 2FXUA 3FZMA 2OANA 2PBDA 3CJ7A 3ZEUA 4BROA 2NLXA 1ATNA 3EL2A 3WXJA 1BU6O 3VEYA 4BR4A 1EQYA 3VGKA 4DCHA 4BRPA 1QQNA 2FLOA 3SK3A 5BREA 2HF4A 2WUSA 1SQKA 2GELA 4NB4A 4DHYA 4A2AA 5JMVA 5AQYA 3P4IA 3KZBA 2QWLA 1HJOA 3J8AA 2F9TA 4LC9B 4O5FA 3FZHA 4FWNA 3QB0A 3HZ6A 4M7YA 2D0OA 4CZMA 5BPNA 3O80A 3H1VX 5ELZA 2ASOA 3HSCA 1RGIA 2VCPA 3BUZB 3O08A 1CZAN 4PKHA 3L6QA 4FWOA 4ISFA 2KHOA 4JN4A 4FWSA 3QMLA 3BEXA 3FZLA 3QDKA 4BRMA 5BN8A 2QXLA 1T6CA 2E2NA 1T44A 3R9PA 3M6GA 5KPZA 5AZJB 4XEIA 5ADXH 4MO5A 1E4GT 4QS9A 5AQSA 4B1XB 1GLAG 5BPMA 5AZJA 3LM2A 1Y64A 3MN9A 1ATSA 4BR2A 3GBTA 3DAWA 3KVGA 4CZFA 3A5NC 2ZWHA 3H1QA 3H46O 2P9UB 2QWPA 3FR0A 1HKBA 2P9IB 3H6EA 2CGJA 4Z94A 3L4IA 1GLBG 1DKGD 3QFPA 2NZTA 3BF3A 3FZFA 3SMSA 3U8XA 3WXLA 3CIPA 3U9DA 4BVOA 4EFHA 3FE1A 1YVNA 2P9IA 1GLEG 5FPDA 3QBXA 2FF3B 3MN7A 4IXCA 4BRDA 5LJWA 5E26A 2VWBA 4MO4A 4JD2B 4JAXA 3WQTA 5JLHA 1QZ5A 3JS6A 4JNEA 2VYPA 4DQ8A 4BR0A 4HTLA 3WEEB 2NRHA 1KAXA 5FPMA 4K43A 2AP1A 3BP8A 4BRHA 3WEEA 3EN9A 3HM8A 1SAZA 1NGDA 1TYQB 4B1UB 4M7XA 3WQUA 2V52B 2QWOA 3G25A 3ZX0A 1NGGA 2A3ZA 1TYQA 5BR9A 2Q1NA 2E88A 4YDUC 1RDWX 4J8FA 4I6MB 5LJVA 1BDGA 3HI0A 4MLEA 5F0XA 3ENHA 5AQWA 5AQLA 1YUWA 2FSNA 3WXKA 2YJFA 1E4FT 1HX1A 1IJJA 2IVNA 3OHRA 3IDHA 2A40A 1NM1A 4A61A 3ATUA 3FLCO 3SJHA 1S22A 2ASPA 1XQSC 5AQXA 1BO5O 1QQOA 1J6ZA 1X3NA 2D0PA 2Q97A 3VEWA 4RCHA 3GL1A 4FSVA 2A41A 5BN9A 5AQJA 5AQHA 1YXQA 4H0PA 4M63C 3ZX2A 1C0GA 1DEJA 5AQGA 2W41A 2Q2RA 2BUPA 2Q36A 2GTDA 1KAYA 2YHYA 3CQYA 4BR5A 1Q18A 4MLHA 3D7EO 2YHXA 4RTFD 4BRCA 2HMPA 4JHDB 4Y0WA 4BRLA 1BA0A 4CD3A 5FPNA 4H5WA 2E1YA 4FWLA 5AQTA 4FPAA 4JHDA 5KPTA 2HF3A 4CZLA 2QWRA 3MDQA 1NGFA 4F9OA 1JCFA 1GLLO 1Z05A 1V4SA 3WT0A 4B1WB 4PL7A 2QWMA 2BTFA 3A0IX 3UKUB 3H3NO 4WQ5A 5AQZA 5F2RA 5AQRA 1KXPA 5BPLA 3UKUA 1GLFO 1H1VA 3RSEA 1D4XA 1MA9B 2QWNA 1ZC6A 5LY3A 3DXMA 5BRDA 1SZ2A 2ITMA 2P9LA 3VETA 4BRKA 3B8AX 3ZX3A 4XH5A 3MN6A 3UB5A 3VEVA 5AQQA 4B1ZA 2P9NB 3VOVA 2AA4A 1BG3A 2P9NA 2YJEA 1HLUA 1U2VB 1X3MA 3S41A 4WYBA 5JICA 2IVPA 3VF4A 3GDQA 3C7NB 1U2VA 3LDLA 1NMDA 4BRFA 2V7YA 4RWTA 3O5BA 4H0YB 5AFUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4U67L 4DR1K 4B08A 3I8BA 1GLCG 4CF0A 4FJLA 2O8CB 1DT9A 4CJWA 3QEPA 1OKJA 4K8XA 5KGXA 2PFUA 1ZFUA 4CJ3A 2NUBA 3DXKB 3MXJA 1JLGA 4CJVA 1N34K 2B68A 1SUQA 3KK2A 3O9UA 4EAHD 1VQ6N 3H45C 1BGXT 4DTNA 4LF7K 3D2EB 3G71N 5CE3A 5J2QA 3IUCA 3S9HA 1BWFO 5I3UA 3VN5A 1RILA 1SL2A 4DTXA 4CCHA 1RDCA 2F96A 3SUPA 3P5JA 5C25A 1IG9A 3F5TA 3ULEA 4H0OA 4HVJA 2ATBA 4BRNA 4B9VA 1TAQA 3O8MA 4UAEF 3CQXA 3CM6A 4OLBA 5C10A 3BF1A 4WFNL 1BA1A 4V19S 4BDPA 3E01A 3MX5A 4MFBA 4M3TA 4F3TA 3PSIA 2RN2A 1WAJA 3EZWA 1NGEA 3GOIA 3OS2A 4F4KA 1C0MA 1BK8A 4A59A 5HRSA 4H03B 4CEDA 3IG1A 2KLAA 3EKSA 4E7HA 4H5TA 2W6KA 1BCOA 2YNFA 1ZXOA 1JKZA 3ALYA 3KP1A 4AILC 4B3OA 2B3CA 1JLBA 3T7ZA 2YIOA 1Z6RA 2PYJA 5HLFA 4XH4A 3QERA 4UJ0A 2P9PB 2Z1HA 3K59A 2BH1A 1OVQA 2Y1IA 2W40A 3VF6A 5BRFA 1KLNA 3WUHA 4KTQA 1BL3A 3AGKA 4JI2K 4RW7A 1J5EK 4QS8A 3DLEA 4M3ZA 4J2AA 3AVHA 3O1WA 4OKKA 5GAGP 1RFQA 3GG4A 3K0SA 5F1XA 1HPMA 1TI5A 4CJTA 3J7YP 4X64K 1NOYA 5EVZA 1WOQA 1T6DA 2SN3A 4LF6K 1K8KA 1YITN 2E6LA 1T03A 5KI6A 4FLZA 1Q7YO 4FOEA 5HP1A 2KZMA 1G15A 1RTIA 4FZYA 2LY6A 5HOOA 1DTTA 3OYDA 2A1RA 1N5YA 4FLYA 1RDDA 4WF9L 3PLAA 3DLBA 2HNZA 3L3VA 2G2KA 3G0ZA 3F9KA 4BVPA 3QI7A 3OYIA 4CHOA 5LL6Z 3C6UA 2RHKA 4BG8A 1LQQA 4FL9A 4CVNE 1MDUB 3A8YA 1EO1A 4DU3A 4M3UA 3G10A 1C56A 5AFUH 3VEZA 3AAQA 1W97L 3ENOA 3HM9A 3MK6A 3SUQA 4E89A 4KRFA 2XY8A 4WCEL 3VPZA 2X74A 3UIQA 2FSJA 2P9SA 3WNGA 1JZBA 4KHSA 4EHTA 4BQZA 4FJ9A 1HPZA 3V9XA 3VQCA 4B9LA 1XNRK 4IOAL 3DLHA 2Z1GA 1L5UA 3M8RA 2CH6A 3E9LA 3G6EN 4ID5A 1W0HA 4DUYK 2HVIA 5HBMA 4BR9A 3T19A 1CN2A 2EX3A 3S3OA 1ESVA 2N2RA 3L0QA 2IIRA 1V4TA 3WXIA 3C6TA 1POIA 1XC9A 3FGUA 4CZJA 5EOYA 3WNEA 4BE1A 4BC2A 5BRHA 1KRPA 4W5QA 3JSMA 1S1TA 1ZBLA 3MCAB 1VNAA 4CEQA 1L4VA 1CXQA 4MDBA 3KJVA 1ASWA 2D0AA 4CGIA 1ICAA 3SJJA 2G8UA 3NE6A 2I7NA 2A5XA 5AQVA 1OMYA 1J53A 3VQ6A 4DWIA 3QBWA 2E2FA 1U6ZA 5AQMA 3H3OB 2RKIA 3ZSVA 2DPNA 1C0UA 1HJRA 1E3MA 4V1DC 1WSGA 3W0LA 4GV3A 4K42A 4CZGA 4CGGA 2V51B 2HHXA 2HOEA 2ITGA 5B8HA 2GMOA 4CI6A 1KC8O 2ASCA 4PL8A 4OPJA 1Z25A 4W5OA 3SV3A 2G8VA 4KB0A 4IG0A 3M1FA 2C1GA 1SN4A 4R5PA 3HSTB 3THYA 4BDYA 1Y97A 3CJ7A 3FZMA 2PBDA 4M3RA 3ZEUA 3KHWA 1KTQA 3RWUA 2O8EA 1OH6A 3WXJA 3E9OA 4ILHA 2B4JA 4CK2A 1EQYA 5M1FA 4DCHA 4BRPA 2Z1IA 1QQNA 3SK3A 5BREA 3NH2A 1BCMA 3EY1A 5H1SQ 5JMVA 2FBVA 5AQYA 3V81A 1KQSM 1M1KO 3PUFA 1HYVA 4XIUA 1AHOA 1BI4B 2F9TA 4O5FA 3OYMA 1IKVA 4AHTA 2KZZA 5CYQA 4IFYA 1ZVGA 3BZKA 1FH3A 4FWNA 3ZT4A 4LFCK 3J7AP 2YHBA 2IC3A 4I2QA 3OW2M 1U48A 2QKKA 5BPNA 3PSMA 3O80A 5ELZA 3QETA 4DSKA 3KD1E 4NLCA 4HUEA 3O08A 2O8DB 1A5VA 4YOWA 2O4GA 2YKNA 4JKDA 2UUBK 3QMLA 4LF5K 3FZLA 4NLBA 2X6NA 2ZJQL 5J1EA 4LF9K 3RMDA 3LPUA 3QNNA 1T6CA 2HMIA 4CK1A 2FBYA 1U49A 4OPHA 1S1VA 4XEIA 4MO5A 3O9QA 1C55A 4DQRA 3ITHA 3NVMA 4O4GA 3SF4D 5AZJA 3MN9A 1Y64A 2OZSA 2IOCA 2KFNA 1T8EA 3E7UX 1BQMA 3DAWA 4CZFA 3A5NC 2ZWHA 3H46O 5AJ3K 4BY9C 2QWPA 3FR0A 1HKBA 2JGUA 1R0AA 3SAGA 3OJSA 1DKGD 3QFPA 2NZTA 5GAEP 3CPEA 3SMSA 4BVOA 4DTMA 3FE1A 1EXQA 1S1WA 1YVNA 2P9IA 5FPDA 3QBXA 5TKWA 3V9SA 2XY7A 1VAZA 4FM0A 1ZVEA 4BRDA 5CHIA 5E26A 4JD2B 1QZ5A 4CIEA 3D6RA 3JS6A 4JNEA 4JKGA 4ELUA 4BR0A 4HTLA 4BWMA 4B9NA 1S9EA 4JLHA 1QVFM 3CCMN 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4U67 L;  4DR1 K;  4B08 A;  3I8B A;  1GLC G;  4CF0 A;  4FJL A;  2O8C B;  1DT9 A;  4CJW A;  3QEP A;  1OKJ A;  4K8X A;  5KGX A;  2PFU A;  1ZFU A;  4CJ3 A;  2NUB A;  3DXK B;  3MXJ A;  1JLG A;  4CJV A;  1N34 K;  2B68 A;  1SUQ A;  3KK2 A;  3O9U A;  4EAH D;  1VQ6 N;  3H45 C;  1BGX T;  4DTN A;  4LF7 K;  3D2E B;  3G71 N;  5CE3 A;  5J2Q A;  3IUC A;  3S9H A;  1BWF O;  5I3U A;  3VN5 A;  1RIL A;  1SL2 A;  4DTX A;  4CCH A;  1RDC A;  2F96 A;  3SUP A;  3P5J A;  5C25 A;  1IG9 A;  3F5T A;  3ULE A;  4H0O A;  4HVJ A;  2ATB A;  4BRN A;  4B9V A;  1TAQ A;  3O8M A;  4UAE F;  3CQX A;  3CM6 A;  4OLB A;  5C10 A;  3BF1 A;  4WFN L;  1BA1 A;  4V19 S;  4BDP A;  3E01 A;  3MX5 A;  4MFB A;  4M3T A;  4F3T A;  3PSI A;  2RN2 A;  1WAJ A;  3EZW A;  1NGE A;  3GOI A;  3OS2 A;  4F4K A;  1C0M A;  1BK8 A;  4A59 A;  5HRS A;  4H03 B;  4CED A;  3IG1 A;  2KLA A;  3EKS A;  4E7H A;  4H5T A;  2W6K A;  1BCO A;  2YNF A;  1ZXO A;  1JKZ A;  3ALY A;  3KP1 A;  4AIL C;  4B3O A;  2B3C A;  1JLB A;  3T7Z A;  2YIO A;  1Z6R A;  2PYJ A;  5HLF A;  4XH4 A; 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