3KVGA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 (cgd2_20) from cryptosporidium parvum in complex with amppnp
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
GPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
publication title Crystal structure of the N-terminal domain of Hsp70 (cgd2_20) from Cryptosporidium parvum in complex with AMPPNP
rcsb
source organism Cryptosporidium parvum
total genus 124
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3kvgA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3kvgA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3kvgA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3kvgA04
3IFRA 4AM7A 3ZEUB 2W40A 4QS8A 4WQ5C 2OANA 4Y0WA 4O8KA 4H0YB 3CQXA 4FWNA 1HKGA 3VESA 2UYTA 5AQOA 1GLBG 3H45C 2D1KA 2P9NA 2D0PA 1KAZA 3EZWA 2YJFA 4B1YB 2IVNA 3M6GA 5AQXA 3WQTA 3LL3A 5F2RA 3UE5A 3LDOA 5TKYA 4QS9A 2QW9A 1X3MA 2W41A 2AP1A 2PAVA 3HBTA 4I6MA 4NB4A 3FZLA 4XEIA 4JD2A 1QQOA 1TUYA 2P9UB 2PBDA 4WQ5A 3DAWA 2QXLA 5AQTA 4BRFA 4IXCA 4MLEA 3O4WA 4RCHA 5AR0A 1SAZA 2GELA 4GY2B 1HLUA 3A5OC 4FWRA 2HMPA 4A2AA 3QMLA 3SLCA 4BR9A 2IIRA 5F1XA 1HJOA 4BRKA 3EKSA 1P8ZA 5AQWA 3R6MA 3SJHA 4K42A 4M7YA 2QWOA 3VPZA 1IG8A 3MN5A 3CERA 1DGKN 2V52B 2Q2RA 2CH6A 3AAQA 3HI0A 3VGLA 2AA4A 1ATSA 2CH5A 3ID8A 3GOIA 4IWVA 3LDPA 3D2FB 1EQYA 4M63C 2QWRA 4PKGA 4BROA 4CZKA 3M3ZA 3QBWA 3RSEA 1U2VA 1Z05A 2Q1NA 2YCHA 4IO8A 4CBXA 4AM6A 4BRMA 3O1BA 5JLHA 3ZEUA 3R8EA 3U9DA 2A41A 3F9MA 4HWIA 4BRNA 2ASMA 3CJBA 4MO5A 3CJCA 3IUCA 1HKBA 1RFQA 2A5XA 4BRQA 2WUSA 1MWMA 1U6ZA 4BGAA 4IJNA 1QZ5A 3S41A 5BPLA 4BRPA 4FL9A 2GTDA 2ASOA 5EY4A 4Z94A 1XC3A 3MK6A 3A5LC 1HX1A 2NRHA 3VF6A 1G99A 5BPNA 1RDWX 3VGKA 3FZHA 2P9UA 2P9IB 3LDLA 3C0BA 5CE3A 1C0GA 1BO5O 1E4GT 3ZX0A 2P9PB 4FPAA 3H3OB 2P9LB 2ZWHA 1KAYA 4B1XB 4BQLA 1LCUA 3VERA 4DCHA 2IVOA 1ATRA 3GE1A 3ENHA 4DHYA 3HM8A 2KHOA 3EO3A 2FSKA 3JXUA 3UB5A 5E26A 3WUHA 1GLFO 3H6EA 1T44A 3LM9A 3SK3A 5AQHA 2A40A 4L3QA 1NGBA 4CJ7A 4EHUA 4CZFA 4BRDA 1DKGD 4M7XA 3BF3A 4FPBA 5AQKA 1ZBSA 2BTFA 3RSEB 3VEXA 3D2FA 2D0OA 4F9OA 3SMPA 1QQNA 1H1VA 4BG9A 2Q97A 4CBUA 4BGBA 2IVPA 3TPQA 2YHWA 3EL2A 1ZC6A 1NGIA 2QWNA 1BWFO 2I7PA 5BRFA 3O80A 4FOEA 3LM2A 3A5MC 4H5NA 3ATVA 2HF4A 3GL1A 1JCGA 3MN6A 4CBWA 5BR9A 2E88A 2Q36A 5AQQA 3QFUA 4FWQA 2E1YA 3LDQA 4ISFA 1K8KA 1GLEG 4JHDB 4PKIA 3MMVA 2P9IA 1WOQA 2D4WA 4A61A 1NGAA 2VYPA 4BRLA 3L0QA 2P9PA 1YVNA 3WT0A 2CGLA 3VEOA 3O08A 1S22A 4BRAA 2V7YA 3CJ9A 1CZAN 2V7ZA 2P9LA 4O5FA 3VGMA 2FXUA 4H5VA 4BR5A 3CIPA 4H0XB 4BR4A 3ZETB 3U8XA 3DWLA 4J8FA 3WEEB 4B9QA 2YHYA 3A8YA 3B8AX 3O1WA 2YI1A 1ESVA 4H0OA 5BN8A 4B1VA 3I8BA 5AQGA 2ZGZA 2A42A 2I7NA 3VF4A 5FPMA 4B1WB 1QQMA 4BC3A 4GNIA 5AZIB 5B8HA 1OKJA 5BPMA 1Z6RA 4BVPA 4FWOA 3VEVA 2GWKA 4FWSA 2H3GX 3MN9A 2FSNA 1D4XA 3W0LA 1R59O 2Q0UA 2EWSA 2ZF5O 2F9TA 5KQDA 4CD3A 4BRIA 3WXLA 1X9JA 3MN7A 4QS7A 4XH1A 4EHTA 4WYBA 4FWMA 5E84A 4H03B 3U4LA 4RWTA 2E8AA 2BUPA 4BRCA 1KAXA 4H5RA 3KHYA 1JCFA 1K8KB 4FO0A 2HOEA 3KVGA 4PL7A 3BF1A 1BU6O 3O5BA 3HZ6A 1HPMA 1T6DA 1NGFA 5AQNA 3FFKB 3QB0A 5AQVA 1TYQA 4JHDA 2QM1A 4FSVA 3L4IA 4MO4A 1J6ZA 3MCPA 1SQKA 5FPNA 3O6WA 1QHAA 2F9WA 3QFPA 3HSCA 4BC4A 3VF2A 3WXIA 4CI6A 3CQYA 4JAXA 5FPEA 1NGCA 3BEXA 3J8AA 4BC2A 1GLLO 3EKUA 3C7NB 3ZETA 2GUPA 2Q0RA 3JS6A 3WEEA 3U9ZA 5F0XA 3WXKA 4K41A 1NBWA 5JMVA 4B1UB 4BVOA 4WQ4C 3CETA 4BQZA 1DEJA 3UKUB 4YDUC 5AQUA 1XUPO 3ULEB 5AQSA 4CZEA 3AAPA 3KZBA 2CGJA 5AZIA 1TUUA 1HUXA 3FGUA 3CJ1A 3DXMB 3ENOA 4EFHA 3ZX2A 4KBOA 2E2NA 3QICA 1NWKA 4CD1A 5AZJB 2E20A 1WUAA 1XQSC 4H0PA 2J4RA 3EN9A 5AQRA 3FZMA 1MA9B 2ASPA 4BG8A 5JICA 5KPRA 5ELZA 3ZX3A 1BG3A 2ITMA 3H3NO 5EOYA 4CZMA 1BDGA 3OHRA 3P4IA 4JNEA 4BR0A 2YHXA 5BRHA 4WQ4A 3VOVA 5KPZA 4JN4A 3WQUA 4C23A 4YDUA 3BUZB 3UKRA 1BOTO 5AQPA 3BP8A 1TYQB 2V51B 1E4FT 4K43A 3VENA 4B1ZA 5AQJA 5AQMA 3AY9A 1NM1A 2FLOA 4FOIA 2HF3A 5AFUA 5BN9A 5LY3A 3CI5A 4H5TA 3I33A 1MWKA 1BA0A 5ADXA 2VWBA 1Q18A 1T6CA 1Y64A 1NGEA 3R9PA 4H0TB 1RGIA 1NGDA 3GDQA 3C7NA 4RTFD 2E1ZA 5KQ8A 5AQYA 5AQLA 4A62A 4BR2A 5LJVA 3ATUA 2Q31A 5EXWA 3D7EO 4FWKA 2FSJA 5LJWA 2P9SA 3O8MA 3A0IX 2QWPA 3MDQA 3D2EB 1YXQA 1GLAG 2GEMA 1NMDA 3W3DA 4E1JA 5AQIA 5BRDA 1NGJA 3UKUA 3FLCO 3FZKA 2VCPA 3IMXA 1ATNA 2QWMA 3ULEA 2CGKA 5JLFA 4CZIA 4PL8A 3M1FA 1HKCA 3WXJA 3GG4A 3L6QA 1NGHA 3DXMA 4CZHA 1YUWA 2P9KA 4BRHA 1S3XA 5AZJA 3HTVA 4BRGA 3VEWA 3DXKB 2FF3B 4H0VB 3FE1A 4A2BA 1NGGA 1JCEA 3TU5A 4DQ8A 1GLCG 4H5WA 5AQZA 2A6AA 4LC9B 3QBXA 2QWQA 1YAGA 5BREA 3G25A 2DPNA 2YJEA 1BA1A 3UKRB 4PKHA 1SZ2A 4K25A 1GLDG 1BUPA 3CHWA 1C0FA 2P9NB 4IJAA 4HTLA 3VEZA 2E2PA 4IZ9A 4EAHD 3H1VX 2QWLA 3QDKA 5I9EB 2GWJA 3CJAA 3LDNA 1LOTB 4XH4A 4I6MB 3VEYA 2A3ZA 5KPTA 4JD2B 2FF6A 3H1QA 3DJCA 3FR0A 1IJJA 2E2QA 2ZGYA 1KXPA 3VETA 3SMSA 4BREA 4XH5A 1MDUB 4CZJA 4ISEA 2NLXA 1NLVA 2P9SB 1QZ6A 4ISGA 5EVZA 5AQFA 1V4TA 2E2OA 4FWPA 3GBTA 4FWLA 3D2EA 3FZFA 5AFUH 4DB3A 3CJ7A 5ADXH 2P9KB 1ZXOA 4CZGA 4BC5A 1GLJO 1X3NA 1V4SA 3H46O 4NO7A 3IDHA 1U2VB 4EIAA 3DXKA 5EX5A 3A5NC 4CZLA 3AARA 5FPDA 4BR7A 4MLHA 2NZTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3Q7CA 4CHPA 3TAFA 2OANA 3QIPA 4Y0WA 1LW2A 4OGEA 1NG9A 4MQ3A 4DF4A 3QEXA 4FWNA 4DSIA 1RILA 4DSKA 2D1KA 1N6QA 4DQQA 4DFMA 3I55N 4Q0BA 1KSPA 4UY8O 3LDOA 3FFIA 1SN4A 3SJJA 1X3MA 2W41A 1BQMA 1R0AA 4B08A 4YORA 4AHUA 3N4QA 4AB0A 5GIPA 1QQOA 1TUYA 4CHOA 4HHTA 1RBSA 3LZJA 4YY3K 3AVKA 3DAWA 3L2UA 1XC9A 2UUCK 4I2QA 4BRFA 1T7BA 1TAQA 1ASVA 4RCHA 1SEGA 2BRZA 2C1IA 4GY2B 4FWRA 1SNBA 1CXQA 2VGMA 2OCEA 4U67L 4BR9A 2IIRA 3K0SA 3AA3A 3BY5A 3CM6A 4K42A 3ZSOA 2QWOA 1LWCA 2NY8X 2EHGA 3VPZA 1NK4A 3KD1E 1ICAA 3VQQA 2YKMA 2HW3A 1N32K 2CH6A 3DI6A 5FRMA 4FLYA 2SN3A 4GVEA 1U45A 5BR8K 1O1WA 3DYAA 2UXCK 3D2FB 4JKDA 3E01A 3QBWA 1U2VA 2Q1NA 1I94K 4IO8A 1BI4A 2YHBA 3CF5L 4AM6A 2R7YA 4OO1J 3O1BA 3ZEUA 3U9DA 1VQ6N 4Z0UA 3C6TA 4BRNA 2O8BA 3CJCA 3MXIA 3IUCA 1RBUA 4A5BA 3G71N 4HHFA 1NMNA 1NJWA 4JI0K 3RTVA 4FL9A 2ASOA 2NRVA 3HJFA 3T1HK 1KVCA 3MK6A 3EYZA 4E89A 4OGCA 4LH4A 4B9NA 3E7UX 1OH7A 3AO4A 1KFSA 3FZHA 3CC4N 2ZJRL 4DG1A 2OPRA 3ZX0A 4HCCA 1K8BA 1Q8IA 2N2RA 1ASUA 3ENHA 4YOYA 2FSKA 4O44A 3WUHA 1XMOK 1KV0A 3AVAA 4RW6A 4FJMA 1KVAA 1TI5A 4DU1A 3KTQA 1N33K 2A40A 1VQNN 3G6EN 3J7AP 2G8IA 4H4MA 3BF3A 3ZSQA 1XNRK 4MDAA 3DMJA 3F2KA 3AV9A 4NXMK 2D0OA 4RW8A 4R79A 3MEDA 3L8BA 2UXBK 3HYFA 4BG9A 3VA3A 4B3TK 1NU0A 3VTHA 3KD5E 5KRSA 4B3OA 2IVPA 3P31A 2QKBA 1HRHA 5FLXO 2F96A 4YHHK 1ZC6A 2QWNA 1QVGM 1EWQA 1XMQK 4FOEA 1W0HA 1JL1A 4K0KK 2HVIA 1POIA 4IDHA 4J2DA 1L3UA 4DV6K 2BANA 1XRSB 4FWQA 1L3SA 4Z4GA 2RF2A 4PKIA 5EU7A 1BGXT 2D4WA 1GOAA 3AVHA 4A61A 2NUBA 4A5AA 3L0QA 1TK5A 2P9PA 1KFDA 1HMVA 5IWAK 3WT0A 2CGLA 3O08A 4JKBA 5LMNK 3ID6A 1CZAN 5DM6L 2VQEK 2V7ZA 2P9LA 4IFYA 4PA1A 2FXUA 1IKWA 1VSIA 4Z4EA 5GAGP 3DWLA 3ZSXA 1CHZA 4WFBL 3B8AX 3OYFA 2YKNA 1LAWA 5AQGA 1WSIA 3LP1A 1RT4A 3PO5A 3AVGA 3SBGA 3VF4A 5FPMA 2NRRA 3B6PA 2Y1IA 4B9SA 3OJSA 4QAGA 1MR4A 2G8HA 4GNIA 4TSXA 3AGKA 4CJPA 4BE2A 4NXNK 3K9KA 2GWKA 4CK1A 3TARA 3KWGA 1R59O 2Y1JA 2F9TA 5HBMA 4CD3A 1P90A 3TTFA 2OZSA 3S3OA 2GX9A 1FKPA 2HBJA 3VQ9A 4CJ3A 1BCGA 1JZAA 4KYPA 1RBRA 3U4LA 2BUPA 4BRCA 3SYZA 3KHYA 1JCFA 2VG5A 4FO0A 4X65K 1K9MO 1Y97A 1C56A 2HOEA 4KH6A 4CEOA 3KVGA 3O9TA 4PL7A 3HZ6A 4RW4A 4WF9L 4I9QA 2B68A 1HQEA 3FFKB 4CEDA 4M3ZA 5KK4A 1NOYA 2HB5A 3C65A 3HK2A 4JK8A 1T7PA 3J7YP 1QHAA 3HSCA 1BHLA 4UADE 1SN1A 3WXIA 4CI6A 3CQYA 5FPEA 1NGCA 2JWKA 4BC2A 3LP2A 4C8MA 4C8KA 1L5UA 2B4JA 3EKUA 4B8AB 4CJRA 3U9ZA 3PIPL 4PUOA 1RT5A 4LFAK 2OYQA 5JMVA 4B1UB 1KVBA 3HPGA 4FW1A 3CD6N 1IH7A 4WQ4C 4BQZA 3UKUB 2G8FA 2HHTA 4KHQA 4FLTA 3ZT3A 1JLBA 3KZBA 2XY8A 5AZIA 1TUUA 3OYDA 3CCLN 4CCHA 3DXMB 3ENOA 4EFHA 2YNGA 1JLGA 3J81O 2P51A 4NCGA 3OY9A 4ILHA 3DLGA 2J4RA 3TAEA 3FZMA 2ASPA 3ZX3A 4J2EA 1BG3A 2ITMA 3CMAN 5EOYA 3OHRA 4JNEA 2YHXA 4CJ4A 5BRHA 4WQ4A 3D6RA 2NRWA 4DFPA 4CJLA 3UKRA 5C2FA 5J2QA 3CCEN 4K43A 4YOUA 4MFBA 1QTMA 1NKCA 1NM1A 4M3TA 4JKGA 2VG6A 2HF3A 1WWNA 3I33A 2KTQA 3MWTA 2VWBA 1LQIA 1N8RO 1N5YA 5HRNA 1Y64A 4F4KA 3R2VA 1J54A 1VSEA 3THWB 3L2RA 5KQ8A 4GV6A 1C0TA 3LP3A 3ATUA 5M1PA 4FWKA 2FSJA 2E6LA 2P9SA 1OH5A 3C6HA 3ZSVA 4YOTA 1NMDA 4E1JA 5BRDA 1ZBFA 1T0ZA 3FLCO 4CF0A 2VCPA 1ATNA 4CGFA 4CE9A 4OLAA 4ID1A 4OX9K 1JKZA 3ZSWA 3P83D 2KQ2A 3CCSN 1HNVA 1S3XA 5AZJA 2X6NA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3M1F A;  1HKC A;  3WXJ A;  3GG4 A;  3L6Q A;  1NGH A;  3DXM A;  4CZH A;  1YUW A;  2P9K A;  4BRH A;  1S3X A;  5AZJ A;  3HTV A;  4BRG A;  3VEW A;  3DXK B;  2FF3 B;  4H0V B;  3FE1 A;  4A2B A;  1NGG A;  1JCE A;  3TU5 A;  4DQ8 A;  1GLC G;  4H5W A;  5AQZ A;  2A6A A;  4LC9 B;  3QBX A;  2QWQ A;  1YAG A;  5BRE A;  3G25 A;  2DPN A;  2YJE A;  1BA1 A;  3UKR B;  4PKH A;  1SZ2 A;  4K25 A;  1GLD G;  1BUP A;  3CHW A;  1C0F A;  2P9N B;  4IJA A;  4HTL A;  3VEZ A;  2E2P A;  4IZ9 A;  4EAH D;  3H1V X;  2QWL A;  3QDK A;  5I9E B;  2GWJ A;  3CJA A;  3LDN A;  1LOT B;  4XH4 A;  4I6M B;  3VEY A;  2A3Z A;  5KPT A;  4JD2 B;  2FF6 A;  3H1Q A;  3DJC A;  3FR0 A;  1IJJ A;  2E2Q A;  2ZGY A;  1KXP A;  3VET A;  3SMS A;  4BRE A;  4XH5 A;  1MDU B;  4CZJ A;  4ISE A;  2NLX A;  1NLV A;  2P9S B;  1QZ6 A;  4ISG A;  5EVZ A;  5AQF A;  1V4T A;  2E2O A;  4FWP A;  3GBT A;  4FWL A;  3D2E A;  3FZF A;  5AFU H;  4DB3 A;  3CJ7 A;  5ADX H;  2P9K B;  1ZXO A;  4CZG A;  4BC5 A;  1GLJ O;  1X3N A;  1V4S A;  3H46 O;  4NO7 A;  3IDH A;  1U2V B;  4EIA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3Q7C A;  4CHP A;  3TAF A;  2OAN A;  3QIP A;  4Y0W A;  1LW2 A;  4OGE A;  1NG9 A;  4MQ3 A;  4DF4 A;  3QEX A;  4FWN A;  4DSI A;  1RIL A;  4DSK A;  2D1K A;  1N6Q A;  4DQQ A;  4DFM A;  3I55 N;  4Q0B A;  1KSP A;  4UY8 O;  3LDO A;  3FFI A;  1SN4 A;  3SJJ A;  1X3M A;  2W41 A;  1BQM A;  1R0A A;  4B08 A;  4YOR A;  4AHU A;  3N4Q A;  4AB0 A;  5GIP A;  1QQO A;  1TUY A;  4CHO A;  4HHT A;  1RBS A;  3LZJ A;  4YY3 K;  3AVK A;  3DAW A;  3L2U A;  1XC9 A;  2UUC K;  4I2Q A;  4BRF A;  1T7B A;  1TAQ A;  1ASV A;  4RCH A;  1SEG A;  2BRZ A;  2C1I A;  4GY2 B;  4FWR A;  1SNB A;  1CXQ A;  2VGM A;  2OCE A;  4U67 L;  4BR9 A;  2IIR A;  3K0S A;  3AA3 A;  3BY5 A;  3CM6 A;  4K42 A;  3ZSO A;  2QWO A;  1LWC A;  2NY8 X;  2EHG A;  3VPZ A;  1NK4 A;  3KD1 E;  1ICA A;  3VQQ A;  2YKM A;  2HW3 A;  1N32 K;  2CH6 A;  3DI6 A;  5FRM A;  4FLY A;  2SN3 A;  4GVE A;  1U45 A;  5BR8 K;  1O1W A;  3DYA A;  2UXC K;  3D2F B;  4JKD A;  3E01 A;  3QBW A;  1U2V A;  2Q1N A;  1I94 K;  4IO8 A;  1BI4 A;  2YHB A;  3CF5 L;  4AM6 A;  2R7Y A;  4OO1 J;  3O1B A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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