3L6QA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 from cryptosporidium parvum (cgd2_20)
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
GGPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
publication title Crystal structure of the N-terminal domain of HSP70 from Cryptosporidium parvum (CGD2_20)
rcsb
source organism Cryptosporidium parvum
total genus 123
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3l6qA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3l6qA04
5BRHA 2F9TA 2HF4A 3RSEA 4M7XA 1LCUA 5KPZA 1C0GA 1GLJO 3DXMA 2V7ZA 2D4WA 3O8MA 4EIAA 1KAYA 1SAZA 4CZMA 4XH1A 5LY3A 3VEOA 5AQGA 2A3ZA 4CZFA 3EO3A 2E2PA 3BF1A 3SMSA 5KPRA 4BR4A 2A42A 4BQZA 3IUCA 4LC9B 4CZLA 2QW9A 3VF2A 1WOQA 4ISEA 5AQTA 3ULEA 4H0VB 4A61A 1XC3A 1NLVA 3JXUA 4K41A 4WYBA 3VGLA 3UE5A 3H6EA 3QICA 3FZMA 4BROA 3UKRB 1HKCA 1ZBSA 5BRDA 4IO8A 2GEMA 3HBTA 4BRFA 4H5RA 4FWNA 3VOVA 4WQ4C 1ATSA 1OKJA 2FXUA 3QFPA 2P9KA 2P9UB 4MLEA 2V7YA 3QBWA 3D2FB 3O5BA 3SK3A 5FPMA 2E2QA 2QWPA 3MMVA 2D1KA 4B9QA 4H0XB 1NWKA 5KQ8A 3C0BA 3LDLA 1K8KB 2Q2RA 4PKGA 4RCHA 3TU5A 4B1ZA 4BRPA 4BGBA 1Q18A 4BRLA 2IVOA 4MO5A 1G99A 3VEVA 4JHDA 1BA0A 5BN8A 2AA4A 3IMXA 1EQYA 4CZIA 5EXWA 3WXKA 4B1XB 3FZLA 1GLDG 2Q1NA 4K43A 3ZX0A 1U2VB 1BDGA 4BC3A 3IDHA 2DPNA 1X9JA 1QZ6A 4NO7A 3IFRA 5TKYA 2A40A 1NGFA 5EX5A 1NGEA 2GUPA 1D4XA 4FO0A 3UB5A 4BRDA 5AQRA 3QFUA 5KPTA 4EHTA 5B8HA 1JCEA 2P9PB 2Q0RA 1T6CA 5AQKA 3R8EA 3CETA 4BRQA 4BC5A 3C7NB 5AZIA 4BQLA 2P9SB 3HZ6A 3WXLA 1TUUA 4FOIA 4BVOA 3GOIA 3BP8A 3ZETB 2I7NA 2P9LA 1TYQB 1HPMA 3CERA 4FSVA 3FE1A 1BOTO 1S22A 4YDUA 1X3NA 3H1VX 5CE3A 4EAHD 5AQLA 4JD2B 2QXLA 2IIRA 3VEWA 3FGUA 5AFUA 3P4IA 2QWLA 3M1FA 5KQDA 3CQXA 2V51B 1E4FT 3CHWA 4HTLA 3GE1A 4H03B 3SMPA 2FSNA 1QQNA 4E1JA 3DJCA 2FF6A 2E1ZA 3CJ9A 3O1BA 4JN4A 1GLLO 4A62A 4BR5A 4BC2A 1T44A 1NGGA 2HMPA 4QS9A 5F2RA 2PAVA 4BG9A 2A6AA 4CZEA 1CZAN 3ZEUB 4CBWA 2GELA 5AQHA 1NGJA 1NGBA 2CGLA 1BWFO 5BRFA 1JCFA 2GTDA 2CGJA 3O1WA 3I8BA 2E2NA 4CD1A 4XH4A 1XUPO 3LDOA 2ZGZA 5I9EB 4I6MA 1BO5O 2VCPA 4B1WB 3FLCO 4BR2A 1BA1A 2D0OA 2VYPA 4B1UB 5AQXA 4BRCA 5BPLA 4RTFD 3EKSA 2CH5A 5AFUH 5E26A 4GY2B 2FSKA 5AQMA 3HM8A 3A8YA 3D2EB 4HWIA 4BREA 3U4LA 2FSJA 2GWKA 3CJ7A 2FLOA 5AZJA 3BEXA 4B1VA 4IXCA 3WT0A 3HSCA 2E88A 1RFQA 3VF6A 1V4TA 3G25A 3EKUA 2F9WA 4H5NA 1HLUA 3AARA 1ATRA 4CZGA 5ELZA 3S41A 3WEEB 3CJAA 1V4SA 3CI5A 4M7YA 5LJWA 2CH6A 5E84A 1IG8A 4JNEA 3A5NC 3VERA 4RWTA 4FWSA 1RDWX 2W41A 3ATUA 3MDQA 5FPDA 4O8KA 3H46O 4DQ8A 3QB0A 5ADXA 5JLFA 2YJFA 4BR0A 3LDQA 3MN6A 5AQUA 1GLFO 1MDUB 3A5OC 4FPAA 2P9IA 4O5FA 3JS6A 2P9SA 3DWLA 1ZC6A 3CIPA 3KVGA 2QWQA 4WQ5C 2W40A 4ISFA 3UKUB 1Y64A 4DCHA 1QQOA 3VETA 2ASMA 4XH5A 4JD2A 4MO4A 4BRNA 3WXJA 3ATVA 3RSEB 4BRKA 4H0PA 1NGHA 4CZKA 2Q97A 3DXMB 2YHXA 2Q0UA 3ID8A 4DHYA 5AQOA 1HUXA 4BVPA 3OHRA 3O4WA 4C23A 2P9NA 4XEIA 2ITMA 1T6DA 5EOYA 2A5XA 3WXIA 2ASOA 4H5VA 4WQ4A 1KXPA 3DXKA 2E8AA 3LM9A 3O6WA 3QBXA 5ADXH 3QDKA 4CJ7A 1XQSC 3ULEB 2CGKA 2FF3B 1QQMA 1NGIA 2QWOA 3CJBA 4BRMA 3LDNA 4BRHA 3VEXA 3VEZA 2I7PA 1P8ZA 2E2OA 3WQUA 4PKIA 3AAQA 3MN9A 1YAGA 2UYTA 1GLAG 4BR9A 2IVNA 2P9KB 3ZX3A 4H5TA 5AQSA 4PL7A 4A2AA 1YXQA 4IJNA 2BUPA 1HKBA 3LL3A 1BG3A 3VGMA 3J8AA 1ZXOA 4Y0WA 3HI0A 4FWLA 3EL2A 1H1VA 2EWSA 2QWRA 4A2BA 3A5MC 4H0YB 4JHDB 2YHWA 4BRAA 4BRIA 3UKRA 5BPMA 2YCHA 4FWKA 4H5WA 3ZX2A 4ISGA 3WUHA 4BRGA 1KAXA 1NMDA 3FFKB 3GBTA 1RGIA 1MWKA 4MLHA 5BR9A 2J4RA 3L6QA 3L0QA 3I33A 5F0XA 5BN9A 3M3ZA 2D0PA 2P9UA 2HOEA 5FPEA 4FWOA 3SLCA 1GLBG 3DAWA 3D2FA 4EFHA 4JAXA 4CBUA 3R9PA 5AQPA 3ENOA 4CBXA 5EVZA 1TUYA 4M63C 1R59O 4L3QA 3GL1A 1K8KA 3KHYA 3H3OB 4CZJA 3VF4A 2IVPA 1U6ZA 5AZIB 3AY9A 2V52B 3GG4A 3VENA 3FZFA 2E1YA 4QS7A 5AQYA 1U2VA 3A0IX 2P9LB 1NGAA 4BR7A 4CI6A 4FWPA 3VGKA 2YHYA 1SQKA 2QM1A 4GNIA 2BTFA 1QZ5A 1X3MA 4IJAA 5JMVA 2NLXA 2ZF5O 2P9PA 1DKGD 3A5LC 1JCGA 4J8FA 4NB4A 4F9OA 3FZHA 2H3GX 3FZKA 3C7NA 3FR0A 4FWMA 3ENHA 4BG8A 2QWMA 1QHAA 3BUZB 1NGDA 3ZETA 2ZGYA 2YJEA 4BC4A 2YI1A 1TYQA 3WQTA 3H3NO 3KZBA 1J6ZA 1DEJA 3VPZA 3BF3A 4QS8A 4FWQA 5F1XA 4I6MB 4PKHA 1YUWA 4CZHA 2KHOA 1SZ2A 3SJHA 1C0FA 4Z94A 3H1QA 4YDUC 1HKGA 4K42A 4PL8A 2WUSA 5JLHA 3LDPA 3ZEUA 3MN7A 5AQQA 4KBOA 3D7EO 3L4IA 4IWVA 3W0LA 1NGCA 3M6GA 3MK6A 5AZJB 1BUPA 4H0OA 2QWNA 1LOTB 1NM1A 2HF3A 3O80A 2OANA 5AQJA 2A41A 3MCPA 5JICA 4K25A 4FPBA 3U9ZA 3TPQA 2AP1A 2Q31A 4WQ5A 3W3DA 3CQYA 2NRHA 4DB3A 5AQVA 4FWRA 1KAZA 3AAPA 1MA9B 3U9DA 4AM6A 5EY4A 3EZWA 2P9IB 4FOEA 3VEYA 3D2EA 1ATNA 2PBDA 4H0TB 3LM2A 3U8XA 3GDQA 1S3XA 5AQNA 5AQZA 3HTVA 2E20A 1GLEG 2NZTA 1HX1A 3B8AX 4B1YB 1IJJA 3WEEA 1Z6RA 3VESA 2Q36A 3H45C 5AQFA 5BREA 3EN9A 5AR0A 3CJ1A 5AQWA 1GLCG 4BGAA 4IZ9A 4FL9A 3O08A 1BU6O 3QMLA 4EHUA 2P9NB 3CJCA 2ASPA 2VWBA 3F9MA 5AQIA 1MWMA 4AM7A 3MN5A 5FPNA 1HJOA 3DXKB 1YVNA 1ESVA 4CD3A 1Z05A 5BPNA 2ZWHA 3UKUA 2GWJA 1WUAA 5LJVA 1E4GT 3R6MA 1NBWA 1DGKN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5BRHA 4HUEA 4M7XA 1LCUA 5KPZA 2YNFA 2DFFA 2V7ZA 4OX9K 3SBGA 1RTJA 3MECA 4NYNA 3A2FA 5AQGA 1NJYA 4CZFA 2G8FA 2O8EB 5KPRA 4BR4A 4CJLA 1RT6A 4M3XA 2WC9A 4M41A 2VWJA 5AQTA 4ZHRA 4Z4HA 3RWUA 4CF8A 4K41A 2OCEA 4WYBA 4DR6K 1M90O 5LMUK 3QICA 2FBTA 1HKCA 1DQ7A 3KHWA 1WLJA 3ZT0A 3KLGA 3NF6A 5DM6L 5M1QA 4G9ZA 4B9NA 1OKJA 1JLBA 4A59A 1Z25A 1JLEA 4M45A 4HCCA 3HVRA 2LI7A 1X9WA 3L4QA 2O8BA 1NWKA 1NNEA 4KHWA 1ZBHA 4JKCA 3C0BA 4NLBA 3DRRA 3LDLA 2Q2RA 4RCHA 4QCLA 4B1ZA 1Q18A 2IVOA 2UUAK 4MO5A 1G99A 4LF8K 1I39A 4M3YA 5JS1A 3ZSWA 1YHQN 3ZX0A 2Q1NA 3CC2N 1W0HA 3ID6A 3KKRA 5KTQA 3HVTA 1QZ6A 2NUBA 1RNHA 4NO7A 3IFRA 3D6RA 1HJRA 1FK9A 3BZCA 5EX5A 2GUPA 2O8FB 4CHNA 4FM0A 1GOAA 1Q81O 3L56A 4W5RA 4G1QA 2P9PB 4PUOA 3THYB 3CETA 3SBTA 3WNHA 4BRQA 1NK5A 3AGRA 4BC5A 5AZIA 1Q82O 3HZ6A 4FOIA 3ZSRA 4BY9C 3R3LA 3SUNA 1HPMA 3FE1A 1BOTO 4DS4A 4FK0A 3H1VX 4EAHD 1I6FA 3SI6A 4Z4IA 4KO0A 5AFUA 3DOKA 3P4IA 5LL6Z 3F9KA 3BY5A 1L3TA 3CHWA 2FSNA 2EX3A 3DJCA 1DT9A 3O1BA 4JN4A 4A62A 4BC2A 1ILYA 2A6AA 1T7BA 3VTHA 4CBWA 1NGJA 4UAFE 3J7AP 2LJMA 3RMCA 1TV6A 1BWFO 2GTDA 1NKBA 1IBLK 2HHHK 1JLFA 3O1WA 2E2NA 3LDOA 4FLVA 4C1NK 2ZGZA 3QINA 5I9EB 4I6MA 1BO5O 4BR2A 1HNVA 4JKEA 1KFDA 4B1UB 4RTFD 3KK7A 2OPPA 3PX0A 5SWMA 3HL8A 2KQ2A 3HSTB 1W7AA 1RTHA 2FSKA 1JXCA 3SPZA 2NRZA 4BREA 3U4LA 2FSJA 3QEPA 2OZMA 2GWKA 5AZJA 5FROA 4X64K 1SKRA 4GV3A 3G25A 2KLAA 4K8XA 4CGHA 1VQLN 1N33K 4H5NA 5ELZA 1I2UA 5HBMA 1HNWK 1KFSA 3LZJA 4FYDA 2CH6A 3NH2A 2HBMA 3J7YP 4FWSA 1CZ9A 3AVHA 4DV1K 5KK4A 3QB0A 5ADXA 5JLFA 3HXMA 3HOTA 4B3MK 1VQMN 1MDUB 1CN2A 1IV0A 3K0SA 2G8IA 1U49A 4O5FA 3JS6A 1WB9A 4F2RA 1ZC6A 3HOSA 4ISFA 1VNAA 4ELTA 3Q7BA 1BCGA 4XH5A 3KIOA 2XY7A 1NK9A 4KH4A 4CEZA 4BRNA 3WXJA 4KTWA 2OZSA 4CZKA 4AB0A 3OYFA 2YHXA 4DHYA 2A1RA 1BHLA 1GPSA 3SPYA 4LH4A 5EOYA 1Q9YA 2A5XA 4JKAA 3TTCA 5KRSA 3QEVA 3MWTA 3K9JA 3C6AA 1KXPA 1D5AA 4B9UA 4YFUA 2YHBA 3CM6A 3P5JA 3NGZA 3E9LA 4O55A 4BRMA 3LDNA 4BRHA 1QVFM 4IO9L 4WFAL 3L2QA 2E2OA 5J2QA 3ZSXA 3C94A 3U3GA 1TGOA 1RBVA 4JI4K 3G10A 1GLAG 3K2PA 2M8BB 1NK7A 5M1OA 4AHRA 4A2AA 4IJNA 3BGRA 1BRZA 3LL3A 2QTDA 2O8BB 3RTVA 4FWLA 2O4GA 5M1FA 2E6LA 2LKBA 3KK3A 2YCHA 4FWKA 3OJUA 1NK0A 3VA3A 4JI0K 2ASCA 3GBTA 1RGIA 3LP1A 3OYLA 1VSDA 3M3ZA 4XJXA 2P9UA 2YKMA 2HOEA 5FPEA 4EFHA 4IFYA 4JAXA 4DTRA 4HHFA 4M3TA 1Q86O 3TARA 1TUYA 1WAFA 1K8KA 5GADP 1T0ZA 1TKZA 4FLZA 1YTAA 3H3OB 2UU9K 2OA8A 3V9XA 4W5NA 4V1DC 3AA4A 2IVPA 2ZJRL 5AZIB 3K5NA 3VQEA 4B08A 1RDDA 1SL1A 2E1YA 4QS7A 3LDSA 1XMOK 5AQYA 1KLNA 4DU1A 3PX6A 3T1AA 2N2RA 4KPYA 3VGKA 4CJQA 2DTUA 5AJ3K 2LR3A 4DTJA 5CYMA 1QZ5A 4IJAA 1BIUA 3CCUN 2NLXA 3KOWA 2YILA 3PY8A 4UY8O 2I61A 1DKGD 4B9LA 1YF5L 5J2PA 4J8FA 1B9DA 3FZKA 3LP2A 2A1SA 2G8UA 3HP6A 3KP0A 1YJWN 2R7YA 3JSMA 2YJEA 4E89A 1TYQA 1S1VA 2FBYA 4DSJA 4OKJA 2UXDK 3LPTA 4B3RK 1ZU3A 2YBRC 1ZUTA 1U48A 5F1XA 4I6MB 4PKHA 4DS5A 2HVHA 4CGFA 1KTQA 3EZ5A 1TI5A 2KHOA 2D0AA 2NNWA 4CJVA 4YOWA 4Z94A 4YDUC 4JKHA 3OYDA 3CCQN 4DR2K 1T3VA 3LDPA 3ZEUA 4DU4A 4CK3A 3W0LA 1SUQA 5AZJB 4FLUA 2QWNA 1HR0K 4RG8A 2ZM6K 3O9SA 3OYCA 4DV2K 1P90A 2OANA 2KBJA 2A41A 2B68A 2Q31A 4WQ5A 3W3DA 2FC0A 1Q9XA 1WSHA 2G8WA 1VHXA 3U9DA 5A2QO 1JLAA 3MEEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5BRH A;  4HUE A;  4M7X A;  1LCU A;  5KPZ A;  2YNF A;  2DFF A;  2V7Z A;  4OX9 K;  3SBG A;  1RTJ A;  3MEC A;  4NYN A;  3A2F A;  5AQG A;  1NJY A;  4CZF A;  2G8F A;  2O8E B;  5KPR A;  4BR4 A;  4CJL A;  1RT6 A;  4M3X A;  2WC9 A;  4M41 A;  2VWJ A;  5AQT A;  4ZHR A;  4Z4H A;  3RWU A;  4CF8 A;  4K41 A;  2OCE A;  4WYB A;  4DR6 K;  1M90 O;  5LMU K;  3QIC A;  2FBT A;  1HKC A;  1DQ7 A;  3KHW A;  1WLJ A;  3ZT0 A;  3KLG A;  3NF6 A;  5DM6 L;  5M1Q A;  4G9Z A;  4B9N A;  1OKJ A;  1JLB A;  4A59 A;  1Z25 A;  1JLE A;  4M45 A;  4HCC A;  3HVR A;  2LI7 A;  1X9W A;  3L4Q A;  2O8B A;  1NWK A;  1NNE A;  4KHW A;  1ZBH A;  4JKC A;  3C0B A;  4NLB A;  3DRR A;  3LDL A;  2Q2R A;  4RCH A;  4QCL A;  4B1Z A;  1Q18 A;  2IVO A;  2UUA K;  4MO5 A;  1G99 A;  4LF8 K;  1I39 A;  4M3Y A;  5JS1 A;  3ZSW A;  1YHQ N;  3ZX0 A;  2Q1N A;  3CC2 N;  1W0H A;  3ID6 A;  3KKR A;  5KTQ A;  3HVT A;  1QZ6 A;  2NUB A;  1RNH A;  4NO7 A;  3IFR A;  3D6R A;  1HJR A;  1FK9 A;  3BZC A;  5EX5 A;  2GUP A;  2O8F B;  4CHN A;  4FM0 A;  1GOA A;  1Q81 O;  3L56 A; 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