3LDLA

Crystal structure of human grp78 (70kda heat shock protein 5 / bip) atpase domain in complex with atp
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
DVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein
publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 114
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2010-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ldlA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldlA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldlA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ldlA04
4BVPA 3LDQA 4ISEA 4JHDA 4BQZA 3H6EA 3D2EA 2BTFA 1GLJO 5ADXH 4B1XB 4H0PA 4CJ7A 3I8BA 5F1XA 2D0PA 4H5RA 4ISFA 3MN5A 5AQHA 1BO5O 4F9OA 3A5MC 3LM2A 3W3DA 4M7YA 1K8KA 3GL1A 2QWQA 3D7EO 4JN4A 1JCGA 2QWNA 3D2FA 2P9UB 5AQSA 3MMVA 5FPNA 5EY4A 3ZEUA 1BA1A 4H5WA 3A5LC 3BEXA 5E84A 3A5NC 1HX1A 5ADXA 2YHWA 2YJFA 4BRFA 1BG3A 1NGDA 3ZX2A 4CD1A 2IVPA 4I6MB 3S41A 3U8XA 1ATSA 3IUCA 4H0YB 1QZ5A 3W0LA 3QMLA 1ATNA 2W41A 3SMPA 1GLCG 3LL3A 1NBWA 1BOTO 3GBTA 3M3ZA 2GELA 2ASMA 4CI6A 5LJVA 4NB4A 4MLHA 5AZIB 2D0OA 3VF2A 4BR5A 4QS9A 3ULEA 4CZLA 1MWMA 1T6CA 2HF4A 3LDLA 4BVOA 3U9ZA 3VETA 3TPQA 3UB5A 1YAGA 3IDHA 4MO5A 2ZWHA 2CGKA 5FPDA 3AARA 5AQFA 3MN6A 4BRAA 5AQGA 2GWJA 4CD3A 4DCHA 3GDQA 2Q31A 3H3OB 4HWIA 5AQMA 4WQ5A 3VENA 1NGIA 3VGLA 3O4WA 2OANA 2ASPA 1BUPA 3I33A 1Q18A 3UKUB 5AQOA 1XC3A 4BC2A 4L3QA 3DXMB 3FGUA 3AY9A 5FPEA 3WQUA 3ZX0A 5AQWA 1QHAA 3CJBA 3MK6A 4CZIA 2E1ZA 4PKGA 4CZGA 3EO3A 3JS6A 2P9PA 2CH6A 3G25A 2QWOA 1HLUA 4B1UB 1WUAA 4BQLA 3LDPA 5KPTA 2P9IA 3OHRA 4FSVA 3DAWA 4CZFA 5BN9A 2A41A 4BR0A 3CJ7A 2D1KA 4E1JA 3QBXA 2Q36A 1GLDG 3KVGA 3M6GA 2NZTA 3WUHA 4FOEA 2P9SB 3UKRA 3WT0A 4A2BA 1G99A 5EVZA 2A6AA 2Q2RA 1H1VA 2Q0UA 3KZBA 3CHWA 3R6MA 2PBDA 2AP1A 2UYTA 3LM9A 4M63C 4H0VB 3ENHA 5JICA 4FWLA 1TUYA 3HM8A 1ZBSA 3MN9A 2GWKA 3FZKA 3CJ9A 5AZJA 1U6ZA 3RSEB 2NRHA 1KAYA 3VGKA 4EHUA 2W40A 2GUPA 4XH1A 3QBWA 3FLCO 3HZ6A 4DB3A 3CETA 1X9JA 3HI0A 1XUPO 2QW9A 2HMPA 2FF6A 4CBXA 3CJ1A 2ITMA 4YDUA 2E2NA 1TYQB 2Q0RA 2IIRA 2YHXA 5EOYA 3O1BA 4AM7A 3VEWA 3A0IX 4BRPA 3FFKB 3BP8A 4KBOA 4IXCA 3VGMA 3SJHA 5EX5A 4M7XA 3C7NB 3VEVA 3VF4A 4Y0WA 3P4IA 2QWMA 3WXIA 3TU5A 1BU6O 4O8KA 2DPNA 1GLAG 1MWKA 4QS7A 4EAHD 5CE3A 3EL2A 1ZC6A 3CI5A 5BRDA 3U9DA 4MLEA 4JD2A 3QFUA 1C0GA 2E20A 1HUXA 2ZGYA 4IZ9A 4CZMA 4MO4A 4BR7A 1NGBA 4WQ4A 3J8AA 3VOVA 3H3NO 3HTVA 1KXPA 4B1YB 4H5NA 4DQ8A 2FF3B 3VF6A 3CQYA 5KQDA 3H46O 1LCUA 3SMSA 2FLOA 5LY3A 1DKGD 1EQYA 3ZX3A 2QWRA 4BRQA 2FSJA 5AQVA 2QXLA 2EWSA 3VEXA 5JLHA 4RCHA 5BREA 3WEEB 4B9QA 2P9UA 4A62A 1R59O 2P9KB 4FWKA 1SAZA 1GLEG 1P8ZA 1E4FT 2CH5A 3EKSA 3FZFA 5B8HA 3BF3A 5AQUA 4I6MA 2VYPA 5TKYA 3VESA 3WXJA 2E2QA 3GG4A 1X3NA 4FOIA 4BG9A 1MDUB 4O5FA 4B1VA 2IVOA 1WOQA 3AAPA 3CJAA 3A5OC 1HPMA 1Z6RA 1HKGA 2P9LB 5ELZA 4FWPA 4J8FA 5AQNA 2BUPA 2GEMA 4NO7A 2J4RA 3O08A 2P9NB 5AZIA 3DXKB 4BGAA 4RWTA 3WEEA 4K42A 2WUSA 3O1WA 4FWQA 2AA4A 4BRLA 1DEJA 1NGHA 3U4LA 2I7PA 1RFQA 2FSNA 3R9PA 3O8MA 4FWOA 4GY2B 4EHTA 4H5VA 1CZAN 3UE5A 3LDOA 1ESVA 1QZ6A 4H03B 4PKIA 4FWNA 5JLFA 4ISGA 5AQXA 5BPMA 4EIAA 3QFPA 2GTDA 4JAXA 1V4TA 1U2VB 3VEYA 4BRGA 3MCPA 2V7ZA 3B8AX 3FZMA 3L6QA 4JHDB 3UKUA 4XH4A 4BRDA 2KHOA 3D2EB 3DXMA 3O6WA 2IVNA 1LOTB 3EKUA 1NMDA 5AQKA 3LDNA 1NGEA 2E8AA 2F9WA 5KPRA 3H1QA 3H45C 4CZJA 2E88A 2A42A 2Q97A 1K8KB 1BDGA 3GE1A 1GLLO 3DWLA 1KAZA 4IJNA 1T6DA 3D2FB 1OKJA 1YXQA 3O80A 1QQMA 3ZEUB 3EN9A 1NGFA 3KHYA 4FWMA 3WQTA 1JCEA 1Y64A 2PAVA 4FWRA 4BR4A 3VERA 2VCPA 2P9SA 2V52B 5AQIA 5AQTA 4BC5A 5AQJA 4K25A 4BRHA 3AAQA 5AQRA 2FSKA 4BC4A 4A61A 1GLBG 4JNEA 1NLVA 4XH5A 1C0FA 5JMVA 4IO8A 5BRHA 1NGCA 1YVNA 2HF3A 1Z05A 1T44A 1NGJA 3RSEA 4CZEA 2QM1A 5AQYA 4H0TB 1NWKA 4QS8A 2YCHA 1IG8A 3VEOA 5F2RA 1GLFO 5KPZA 1SZ2A 5AQLA 5BPNA 1E4GT 3L0QA 4YDUC 4FWSA 4CZHA 4BREA 4BR2A 4BRCA 2V7YA 4BR9A 5AR0A 1V4SA 3QB0A 4BROA 3ID8A 1TYQA 4B1WB 4HTLA 3ULEB 4FPBA 5AQZA 5KQ8A 3FZHA 3CQXA 3EZWA 3ENOA 3BUZB 2QWLA 1QQNA 1NM1A 1S22A 4RTFD 4CBUA 3C7NA 3H1VX 1DGKN 3QDKA 4BRMA 5AFUH 4A2AA 1BA0A 4CZKA 1YUWA 3QICA 4BRNA 2YHYA 3DJCA 3ZETB 4IWVA 3SLCA 4WQ4C 2E1YA 1HJOA 3HSCA 3MN7A 4GNIA 3CJCA 3IFRA 3JXUA 2H3GX 2YJEA 3HBTA 5I9EB 1S3XA 2A40A 5BR9A 2D4WA 1RGIA 3GOIA 1NGGA 3MDQA 5EXWA 4EFHA 5AFUA 2P9PB 2I7NA 4AM6A 2VWBA 4PL8A 2CGLA 3C0BA 4WYBA 4Z94A 5LJWA 1ZXOA 2F9TA 4K41A 4PKHA 1JCFA 2P9IB 2P9KA 3CERA 3BF1A 3M1FA 1NGAA 4IJAA 4BGBA 1HKCA 3ZETA 4BG8A 5AQQA 3UKRB 3WXLA 5E26A 1KAXA 4FL9A 2V51B 2E2PA 1MA9B 2FXUA 1QQOA 1BWFO 2CGJA 4WQ5C 4H0OA 3WXKA 5BRFA 3F9MA 3CIPA 4H0XB 5AZJB 3R8EA 3ATVA 2NLXA 2ASOA 2A3ZA 3VPZA 2P9LA 2ZF5O 1XQSC 1ATRA 1X3MA 4C23A 4BRIA 5FPMA 5BPLA 3A8YA 2E2OA 1RDWX 2P9NA 1D4XA 4XEIA 3DXKA 5AQPA 4FO0A 3L4IA 3ATUA 3FR0A 1J6ZA 5F0XA 3VEZA 2ZGZA 2A5XA 2HOEA 2YI1A 3O5BA 2QWPA 4DHYA 4K43A 4LC9B 3FZLA 3SK3A 3FE1A 1IJJA 4H5TA 1HKBA 4FPAA 4BC3A 1U2VA 4PL7A 1TUUA 4CBWA 4B1ZA 3IMXA 5BN8A 1SQKA 4JD2B 4BRKA 2Q1NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GMJB 4BVPA 5HBMA 4CJ5A 1TL1A 4BQZA 3P38A 3D0PA 1VQPN 4Z4EA 3O3FA 5ADXH 4CJ7A 4FYDA 3KOZA 2PYJA 4BECA 2I5JA 1YI2N 4F9OA 3TAPA 1K8KA 3GL1A 3PIOL 1JCGA 3D2FA 5AQSA 2P9UB 5FPNA 5EY4A 3ZEUA 1BA1A 3A5LC 4DTUA 3LWLA 3T1AA 4CQKA 3E9PA 4KTZA 5ADXA 4OGEA 2YJFA 1BG3A 1U45A 1BK8A 1J5EK 2IVPA 5HRSA 4DQRA 3OS0A 3QMLA 1J54A 1HR0K 1S1XA 3HP9A 1CXUA 4A59A 4DR4K 3KC6A 1C1BA 3LL3A 4YFUA 1S6PA 3ZSWA 1UOCA 2N2QA 5CZ2A 4Z4GA 1UAXA 4KB1A 4MDAA 4CZLA 1YT3A 1RBSA 3SBGA 4B8AB 4DKWA 1ZBLA 3CPWM 4BVOA 3SJJA 5K14A 1RDBA 5FROA 2HSTA 4DTRA 1VQKN 4H8KA 1NOZA 5FPDA 3AARA 3NGYA 3R3LA 1OVQA 3CYMA 1KCFA 3MN6A 2GWJA 1KV0A 3RMAA 3H3OB 1VSHA 3CCVN 5AQMA 3O4WA 4DV2K 1L3SA 1AHOA 4F4KA 3DOLA 1BUPA 3L56A 4HUGA 3OVNA 1FK9A 1Q18A 3R2VA 4DG1A 1XC3A 3TTFA 3BDPA 1SV5A 3I0SA 4CHQA 3K58A 4KI4A 2X74A 3KK7A 1JXCA 1SEGA 5AQWA 1VAZA 3DLLL 3PSMA 3L3UA 5C25A 1S6QA 3HPHA 1TKDA 1RT5A 3G4SN 2P9PA 2O8BB 4KHUA 2HBJA 1HQEA 3CG7A 1WUAA 3HOTA 4M3XA 1BQMA 5KPTA 4LFCK 1TVRA 3DAWA 2DTUA 4DLEA 1Z25A 5BN9A 4CJVA 4E1JA 4RG8A 2E3FA 5C2FA 3F9KA 3WUHA 1VSDA 3B6PA 4KAZA 1JZBA 3AA5X 3UKRA 1GPTA 3WT0A 5EVZA 2A6AA 4WFNL 1QSSA 4CJLA 3CHWA 1RBVA 4B08A 2AP1A 4M63C 4H0VB 4JKHA 5JICA 3J80O 3LP3A 4I9QA 3MN9A 2GWKA 3SV3A 3CJ9A 5AZJA 3V9XA 3KK1A 1N8RO 2OPRA 4AHUA 4FJ8A 2GUPA 2XO7A 3QBWA 3ZSVA 3HZ6A 2KYQA 3VQ7A 2F4VK 1X9JA 1XHXA 3N4PA 1XUPO 1L3UA 3CCQN 4V1DC 4I2QA 4C8MA 2E2NA 4GV3A 4AM7A 3QEXA 4JKDA 5J2QA 4GKJK 3FFKB 2YNIA 2HNDA 1S9GA 5EX5A 3VEVA 1JKHA 1RDDA 2VG7A 1L3TA 4O8KA 1ZUTA 1UA1A 1XNQK 4YOYA 4OKEA 2IOCA 1ASWA 3AVNA 5CE3A 4N76A 5BRDA 4O0IA 3ZSYA 4JD2A 1SKRA 5FDLA 4IZ9A 3HPGA 3KD5E 1KSPA 4ILGB 2N2RA 4WE1A 1WMTA 3H3NO 1KXPA 4B1YB 3E9LA 4QAGA 4H5NA 3KP1A 2VQEK 3AVGA 3VF6A 4N56A 3H46O 1CN2A 4JI2K 3MX5A 2X6SA 1EQYA 4BRQA 2FSJA 4FJKA 3VEXA 5JLHA 2P9UA 4V19S 1JXBA 1JLEA 1BCGA 4CEDA 2NRZA 3ID6A 4OVLA 5C24A 4KV8A 3L4QA 3FZFA 5B8HA 2YKNA 3CM6A 4UJ0A 4FW1A 3WXJA 2E2QA 3GG4A 1L4VA 3NF9A 4ZTJA 4K8XA 3BK3C 3AA4A 1LQQA 3QIPA 1JLGA 1CXQA 2IVOA 1X9WA 3KTQA 1RNHA 2ZM6K 2XRIA 4RW9A 4DS5A 4JLHA 4J8FA 2GEMA 1A5XA 3O9QA 3QINA 1NK9A 3VTHA 3DXKB 4BGAA 4CJPA 4WF9L 2WUSA 2RKIA 4FWQA 3V9WA 2G8IA 3OYMA 3GKUA 1NGHA 1JKZA 1NJXA 4EP5A 5DM7L 4H5VA 4PA1A 2D0AA 1EXQA 4CHZA 1K9MO 4CGIA 4CJWA 3T69A 1VNAA 4LF7K 1LQIA 5AQXA 4EIAA 3AVIA 4LF9K 1Y97A 1NK4A 3TTCA 4IKFA 4CIEA 3MCPA 1KLMA 4FJXA 4DU1A 5E41A 3L6QA 2WC9A 3D2EB 1CZ9A 1OH5A 2IVNA 3N4QA 1SKWA 5AQKA 4FXDA 1C0MA 4AH9A 1RDUA 1OH6A 4DR5K 2O8BA 1N6QA 3SQ1A 4CZJA 2NRRA 2E88A 2QA4N 3DWLA 2UXCK 1T6DA 1YXQA 3F2KA 1QQMA 4CF0A 3EN9A 1NGFA 2NY9X 3CM5A 3DM2A 2PAVA 5EU7A 3WQTA 3CC2N 2VCPA 2V52B 1NRBA 5AQTA 1JLBA 3P31A 4HCCA 5AQRA 3TTDA 4BC4A 4A61A 3CCMN 3K5NA 2O8DB 4CEFA 3OTOK 3KK3A 4XH5A 2KLAA 5JMVA 4R5PA 4DSLA 5KTQA 1TKTA 1NGCA 1YVNA 3TAFA 1Z05A 3E9OA 2ZJQL 4CK3A 4DV4K 1NGJA 4CK1A 4CZEA 4H0TB 4QS8A 2YCHA 4GW6A 5KGXA 5BR8K 1T3VA 5KPZA 1TAQA 3NE6A 1VQ4N 1I94K 4Y1DA 5FRNA 4BRCA 5LMNK 2Y1JA 5AR0A 1V4SA 2VG6A 5FLXO 4BROA 3ULEB 4FPBA 1B7DA 3EYZA 3FZHA 3KLIA 5M1FA 5GINA 1RDCA 2HB5A 2UUBK 2W6KA 1DGKN 5AFUH 2LY5A 1JL1A 1K8BA 3QLHA 1RCHA 3ZETB 4FZYA 2E1YA 1NE5A 2KPYA 4KKOA 3HBTA 2H3GX 2YJEA 2A40A 2KKZA 4A57A 1ZYVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4GMJ B;  4BVP A;  5HBM A;  4CJ5 A;  1TL1 A;  4BQZ A;  3P38 A;  3D0P A;  1VQP N;  4Z4E A;  3O3F A;  5ADX H;  4CJ7 A;  4FYD A;  3KOZ A;  2PYJ A;  4BEC A;  2I5J A;  1YI2 N;  4F9O A;  3TAP A;  1K8K A;  3GL1 A;  3PIO L;  1JCG A;  3D2F A;  5AQS A;  2P9U B;  5FPN A;  5EY4 A;  3ZEU A;  1BA1 A;  3A5L C;  4DTU A;  3LWL A;  3T1A A;  4CQK A;  3E9P A;  4KTZ A;  5ADX A;  4OGE A;  2YJF A;  1BG3 A;  1U45 A;  1BK8 A;  1J5E K;  2IVP A;  5HRS A;  4DQR A;  3OS0 A;  3QML A;  1J54 A;  1HR0 K;  1S1X A;  3HP9 A;  1CXU A;  4A59 A;  4DR4 K;  3KC6 A;  1C1B A;  3LL3 A;  4YFU A;  1S6P A;  3ZSW A;  1UOC A;  2N2Q A;  5CZ2 A;  4Z4G A;  1UAX A;  4KB1 A;  4MDA A;  4CZL A;  1YT3 A;  1RBS A;  3SBG A;  4B8A B;  4DKW A;  1ZBL A;  3CPW M;  4BVO A;  3SJJ A;  5K14 A;  1RDB A;  5FRO A;  2HST A;  4DTR A;  1VQK N;  4H8K A;  1NOZ A;  5FPD A;  3AAR A;  3NGY A;  3R3L A;  1OVQ A;  3CYM A;  1KCF A;  3MN6 A;  2GWJ A;  1KV0 A;  3RMA A;  3H3O B;  1VSH A;  3CCV N;  5AQM A;  3O4W A;  4DV2 K;  1L3S A;  1AHO A;  4F4K A;  3DOL A;  1BUP A;  3L56 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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