3LDQA

Crystal structure of hsc70/bag1 in complex with small molecule inhibitor
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
PAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 121
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3ldqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ldqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ldqA04
1XQSC 2P9IA 1T44A 3CQYA 2P9SA 1QZ5A 2VWBA 4BGAA 4PKIA 3WQUA 4B9QA 3AY9A 3GE1A 4CBXA 4FWRA 3D2FA 4BC3A 5BR9A 5AQKA 3WXLA 5BRFA 5AQOA 3L6QA 3VGMA 5CE3A 2P9KB 5AQQA 3A5MC 3TPQA 1NLVA 3FZHA 1U2VB 2Q0RA 3ZX0A 3ENOA 3UKRB 3VF4A 3CETA 2QWLA 1G99A 3DXMA 4YDUA 1NGGA 2A42A 1WUAA 1HUXA 2GEMA 1MWKA 1YAGA 1KXPA 1JCEA 1NGCA 3EKUA 3VGLA 4PKGA 1Q18A 4B1XB 5AZIA 2AA4A 3UE5A 5JMVA 5AZJA 5AQMA 3VF6A 3DAWA 4PL8A 5B8HA 1NWKA 2WUSA 5AQHA 3D7EO 4FWNA 4BC5A 4BQLA 2PAVA 4XEIA 4YDUC 3M6GA 1JCGA 1GLAG 3OHRA 5AQTA 3EKSA 2UYTA 4A2BA 1T6DA 2HMPA 4EAHD 4CBWA 4M7YA 3CQXA 4FPAA 4BR0A 5EX5A 3G25A 3ZEUB 1YXQA 4FWOA 1C0GA 3J8AA 1YUWA 1WOQA 2YHXA 1C0FA 1ATRA 3CJ7A 3RSEB 4FOIA 4BVPA 5KQ8A 4K25A 4RTFD 4EFHA 4JAXA 4JNEA 4BRQA 1HX1A 3HSCA 3DXKA 5JICA 1BDGA 2ITMA 1E4FT 1EQYA 3TU5A 4BRLA 3VEWA 4B1VA 3BEXA 5ADXH 3SMSA 4BR7A 1ATNA 4QS7A 1K8KB 5FPMA 3FZLA 3LDPA 3VETA 3CIPA 4GNIA 3VEYA 1BA0A 2FXUA 3BF1A 2V52B 4H0XB 1IJJA 4HTLA 3QMLA 3H6EA 5AQGA 4MLHA 3KZBA 5EXWA 5EY4A 4QS8A 1NGJA 2YCHA 3UKUA 4Z94A 4H0TB 3MN7A 1E4GT 2Q31A 2E8AA 1HKBA 3A5LC 3MCPA 2P9IB 5AQPA 2ZF5O 2P9SB 3HTVA 2E2NA 3ID8A 5BPLA 4H03B 3GDQA 4PL7A 2Q97A 1BU6O 3H1QA 3R6MA 3LM2A 5F0XA 1LCUA 3JXUA 3IDHA 3A0IX 3VENA 4EHTA 5BREA 5AQZA 2ASMA 2P9UA 3O6WA 3DXMB 4BRKA 5BPNA 1TUUA 2HF4A 3M1FA 2A41A 4BR9A 3W3DA 2NRHA 3QBXA 4FWPA 5AZIB 3HBTA 3WEEA 5F1XA 5AZJB 1ATSA 4I6MA 3FZKA 5FPNA 3R9PA 4EHUA 4NB4A 5AQWA 2IVOA 4IJAA 5LY3A 3DWLA 4IWVA 5AFUA 3LDNA 1LOTB 4H0OA 2V7ZA 3WUHA 3LDQA 3JS6A 2FSNA 3EL2A 1D4XA 3AAQA 3H3NO 4CZMA 3QDKA 2DPNA 3C7NA 1NMDA 4FOEA 3VERA 3ZETA 5KPZA 4CZFA 3R8EA 1OKJA 3A8YA 4C23A 2VYPA 1KAXA 1NGDA 3SLCA 3VEOA 3WXKA 2HOEA 4O8KA 4BGBA 3QBWA 3DXKB 1ZBSA 1MWMA 2NZTA 5I9EB 2D0PA 1BWFO 1NBWA 3O1BA 1CZAN 3VOVA 2P9LA 2V7YA 5LJVA 1SQKA 4FWLA 5BRHA 3WQTA 1RFQA 1JCFA 1P8ZA 2QWNA 4ISFA 2E1ZA 4CZJA 2CH5A 4FWSA 3GOIA 3CERA 5FPDA 1Y64A 4LC9B 3S41A 4BRDA 4CZHA 3H46O 3A5OC 3CHWA 1GLEG 1T6CA 2YHYA 3QICA 3SMPA 1NM1A 2AP1A 2Q0UA 2I7NA 3O4WA 4E1JA 2D1KA 2Q2RA 4BRHA 4BRPA 4MLEA 5E84A 3IUCA 3UKUB 4FL9A 2D0OA 3SJHA 5E26A 3O8MA 2A6AA 3H45C 4H5TA 2GWKA 4M7XA 5BN9A 2E2OA 3WXJA 3FLCO 5AR0A 1HJOA 1DKGD 1SZ2A 3MN5A 1XUPO 4GY2B 4B1WB 4KBOA 4BQZA 3VGKA 2ASPA 4B1UB 3VPZA 4CZIA 5ADXA 4RWTA 3VEXA 4MO4A 3CJ1A 1U6ZA 1YVNA 4BRAA 1QHAA 4WQ5A 2I7PA 3VEVA 2Q36A 4BR2A 3MK6A 4K42A 2E1YA 3SK3A 4H0YB 5AQUA 1GLBG 3LM9A 4CD1A 1GLLO 4WQ5C 1X9JA 4BC4A 2GUPA 4CZGA 2IIRA 3WEEB 1KAYA 3M3ZA 4WQ4A 4I6MB 3D2FB 3CJAA 2A40A 2YJEA 3CI5A 3FZMA 3GL1A 2ASOA 2ZWHA 4IJNA 5AQNA 4DHYA 3FE1A 2KHOA 4JD2A 3U8XA 2OANA 3ZX3A 3D2EA 4WQ4C 4FSVA 4BRNA 4CZLA 3QB0A 3IMXA 1NGFA 5TKYA 3DJCA 4BREA 4DQ8A 2P9PA 3C7NB 1X3NA 3ZX2A 3ZETB 4BRCA 4J8FA 5AQRA 3H1VX 4JHDA 1GLFO 2J4RA 2Q1NA 2QWOA 1J6ZA 2P9NA 2F9WA 4XH4A 2BUPA 5JLFA 1ESVA 1TYQA 1BOTO 4AM6A 4ISEA 1V4SA 3IFRA 4IO8A 5AQYA 4H5WA 5BN8A 2P9LB 2HF3A 1S3XA 4FWQA 5AFUH 5KPRA 3GBTA 3FGUA 4H0VB 4JN4A 3ULEA 1BO5O 2FF3B 3MN6A 4BRMA 2EWSA 1MA9B 3B8AX 2NLXA 3O08A 1ZXOA 1IG8A 4IXCA 1BG3A 1HKCA 1NGEA 4PKHA 4BR5A 3C0BA 4H0PA 2FSKA 2CGKA 1NGIA 4HWIA 2QWQA 4BVOA 3HI0A 2ZGYA 2GTDA 3WXIA 1NGBA 5FPEA 4H5VA 3VESA 4XH1A 5BPMA 4CZEA 4BC2A 2E2PA 4F9OA 3CJBA 4XH5A 1DGKN 3HZ6A 2QW9A 5KQDA 5F2RA 3HM8A 1NGAA 2CH6A 2QM1A 3O80A 5ELZA 3F9MA 1GLDG 5EVZA 1Z05A 1MDUB 1XC3A 3MN9A 3O5BA 3KVGA 2P9KA 4K41A 4M63C 3VEZA 3CJ9A 4BG8A 4BRIA 4DB3A 3KHYA 1QQMA 1U2VA 2F9TA 2W41A 1NGHA 2PBDA 2VCPA 3UKRA 4CBUA 2D4WA 4FWMA 5KPTA 1X3MA 4CJ7A 2GELA 4FWKA 1BA1A 3QFUA 3L0QA 3O1WA 5AQLA 1GLJO 3LL3A 1RGIA 3FR0A 3UB5A 2A3ZA 1SAZA 1Z6RA 4BRGA 3ATVA 2E88A 2QWPA 4A62A 1R59O 3EO3A 4BROA 4JD2B 2W40A 4BRFA 3CJCA 3ATUA 2FSJA 4A2AA 3D2EB 3ZEUA 1GLCG 5AQVA 3FFKB 4Y0WA 2E2QA 3LDLA 2P9UB 2H3GX 2V51B 4NO7A 1KAZA 3W0LA 4EIAA 5AQXA 3MMVA 4A61A 3AARA 3BF3A 2QWRA 2QWMA 4CD3A 3LDOA 1QQNA 5JLHA 1H1VA 2FLOA 2P9PB 2YJFA 3RSEA 4BG9A 4B1YB 2A5XA 3U9DA 2E20A 4MO5A 3BP8A 3FZFA 4DCHA 4JHDB 3GG4A 4FO0A 1BUPA 1S22A 2P9NB 3MDQA 3U9ZA 3EZWA 3BUZB 5AQFA 1TYQB 3QFPA 4ISGA 2ZGZA 3WT0A 4CZKA 5EOYA 4RCHA 4QS9A 3EN9A 2IVPA 1DEJA 3I8BA 3P4IA 1HPMA 2IVNA 1K8KA 4IZ9A 2FF6A 2GWJA 4FPBA 1QZ6A 1V4TA 3ENHA 3H3OB 2CGJA 3ULEB 3VF2A 4CI6A 3A5NC 1ZC6A 5AQJA 3U4LA 1TUYA 2QXLA 2BTFA 3I33A 2CGLA 5AQIA 2YHWA 4B1ZA 5BRDA 4K43A 4WYBA 1QQOA 5AQSA 4BR4A 4O5FA 1HLUA 2YI1A 4AM7A 1HKGA 5LJWA 3AAPA 4H5RA 4H5NA 4L3QA 3L4IA 1RDWX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NDKA 3MEEA 2P9IA 4UQGA 3PO5A 1RDBA 2VWBA 4DV6K 3O9UA 4O0JA 1XHXA 5I42A 3OBWA 4FWRA 4E0DA 3D2FA 2JWLA 4BC3A 4B8AB 4BDYA 3D0PA 5AQOA 1VSJA 4R5PA 3VGMA 5CE3A 1BCGA 1HNIA 1NLVA 3JAMO 3PSMA 3ZSOA 3V1RA 1WAJA 3ZX0A 1S1UA 3HPHA 4CK2A 1EP4A 1WUAA 4ILHA 1NGCA 1RTJA 3SQ0A 3NBPA 3J7YP 4B1XB 4CF2A 3MX5A 2UUAK 5AZJA 4DR7K 4N41A 1NWKA 5AQHA 1BHLA 4FWNA 1HNWK 2PAVA 4XEIA 3NE6A 4CJ5A 2UYTA 3O3GA 1T6DA 4EAHD 4CHNA 4BR0A 3RR8A 2QKBA 3J81O 1ICAA 2O8DB 4CW7B 3CC2N 2IOCA 4I9LA 4M3XA 1NH5A 4B3SK 1ATRA 2W6KA 3CJ7A 3RSEB 2O4IA 4BVPA 1HQEA 1VK0A 3SAFA 1NK0A 3CYMA 5J2NA 4GKJK 4QCLA 1BK8A 1UA1A 1QTMA 3THVA 1DQ7A 1REVA 3DXKA 3KK2A 3KK3A 5IT9O 3CYGA 1JLEA 5GAEP 1EQYA 4M3RA 3TU5A 3VEWA 1OVQA 4JI1K 2BH1A 3FZLA 1Q9XA 4BY9C 2KKZA 1UOCA 2JLEA 4NYNA 1BA0A 2E0HA 1ZVGA 1D5AA 1BCMA 2FXUA 1MR4A 2VG6A 3NF9A 3MEDA 1N33K 4JK9A 4W5QA 2V52B 3OS0A 2VWJA 5AQGA 1IKXA 3KZBA 1N4NA 1T7EA 3UKUA 4WE1A 3MN7A 1E4GT 4V19S 2Q31A 2F96A 3KOYA 2P9IB 1IBMK 2ZF5O 1HNVA 4O55A 5BPLA 3J7ZO 3WXMB 2ASCA 3CFRA 4DWIA 2XY6A 1VSIA 4B08A 4JYAK 3LP3A 3R6MA 3AVHA 5F0XA 3LM2A 4MFBA 2G8VA 2VY6A 3IDHA 5BREA 5DM6L 1B7DA 5AQZA 4HCBA 4KYPA 2HSTA 1VSHA 3S3MA 3O6WA 2GV9A 5BPNA 5HRRA 1I3AA 1XI1A 2ZJQL 4DF4A 3W3DA 4FWPA 3A2FA 1RILA 4OJRA 2NRRA 5F1XA 2XY5A 5AZJB 3SV4A 1ZYQA 4V1DC 4I6MA 5FPNA 1ZUTA 4DV0K 3EZ5A 4CJQA 4J2DA 3S9HA 3OYLA 2X6SA 3G0ZA 1ZU3A 1JL2A 1D4XA 3BZCA 2YC1C 3QDKA 3KD5E 5HROA 1NMDA 1K8AO 4KHYA 1N8RO 2HW3A 1JLQA 3R8EA 4C23A 1I2VA 2VYPA 4BDPA 3SLCA 5KGXA 3WXKA 2XHBA 4TSXA 3QEPA 1I6FA 3DXKB 3QBWA 2W00A 2LT8A 2Y1JA 1HYSA 3ZSXA 1MWMA 1RDAA 1WWNA 5I9EB 2HHTA 3OY9A 3DRRA 3TAQA 1AHOA 3B6OA 2V7YA 4Z4CA 5BRHA 4BE2A 1JCFA 1RT2A 3CMEN 1T1TA 4ILGB 4LC9B 3S41A 4CZHA 4LFCK 4PQUA 1PX9A 3SPYA 2EX3A 2XY7A 1JLAA 4FVUA 1C6VA 3O9SA 1NM1A 4B9SA 2I7NA 2D1KA 3E9OA 3KD1E 3NVMA 4N76A 1PE4A 2O8BA 3UKUB 4FL9A 3KTQA 4WFBL 1PTXA 1C0UA 3PX0A 2HVHA 3V9SA 4M7XA 4CF0A 2BGGA 3WXJA 1WSJA 2B68A 1SZ2A 1WB9A 2HMIA 4KBOA 4LD0A 4BQZA 4Y1DA 2ASPA 3Q7BA 2N69A 4LF4K 1S6QA 3CJ1A 3M8RA 2B4JA 4OGCA 1QHAA 2I7PA 5GAHP 4DTPA 3K59A 5IWAK 4K42A 4PHTX 5DMRA 3SK3A 3DLBA 1C0MA 4H0YB 3T7ZA 1GLBG 3U6FA 4LF7K 3OYKA 4WQ5C 1KQSM 2IIRA 1KAYA 3M3ZA 1FKOA 4I6MB 1K9MO 4JS5A 3CC4N 3VN5A 5KK4A 2A40A 3FZMA 3BY5A 4B9NA 1TK8A 4W5OA 4JD2A 4WFAL 2NNWA 3QIOA 3ZX3A 2YIOA 1VSKA 4WQ4C 5K14A 3TAMA 2G2KA 4CGDA 4A5BA 1VQ8N 1TKTA 3V4IA 4E1NA 3DJCA 4BREA 1VSEA 2JWKA 2ZD1A 3L56A 4BRCA 3OYDA 2YV0X 3ZYYX 3H1VX 2QWOA 3DI6A 4IEIA 5CYQA 3ZSVA 3L3UA 2RHKA 1BQNA 4AM6A 4IFVA 2Z1HA 1V4SA 1MU2A 4A59A 1N6QA 3AA2A 3CCSN 5SWMA 2OPRA 1XC9A 5BN8A 4CEAA 4Z4GA 1S3XA 4PWDA 5KPRA 4H0VB 1F21A 3MXJA 4JN4A 4J2BA 1BO5O 1NRBA 4IOAL 3MN6A 3VQ8A 2E6LA 2NLXA 4JI2K 2YBRC 1L4VA 1NGEA 4JK7A 3KJVA 4DV7K 4B3TK 4M3ZA 5JS1A 2CGKA 1OH6A 2QWQA 4EP4A 5HRSA 2O8BB 3PIOL 3HK2A 3VESA 4FJ8A 3CFOA 1G15A 3HP6A 2N2RA 4DQSA 4C1NI 2E2PA 1BGXT 3AVIA 2KZMA 4XIUA 3K57A 1S72N 4AHUA 3HM8A 5M1QA 4HVJA 5ELZA 3F9MA 1S9GA 5EVZA 1MDUB 3MN9A 3KVGA 4CJUA 3DOLA 2KPYA 3AGRA 4BG8A 3TABA 2WTUA 1NOZA 1IV0A 2LSNA 4ELUA 1DTQA 1EWQA 1KFSA 5LL6Z 3UKRA 2P1JA 4KFBA 3C6HA 4FWMA 3QETA 1QSSA 2GELA 4W5NA 3O1WA 5AQLA 3LL3A 2WONA 3TTCA 4IFYA 1EXQA 1LQQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3NDK A;  3MEE A;  2P9I A;  4UQG A;  3PO5 A;  1RDB A;  2VWB A;  4DV6 K;  3O9U A;  4O0J A;  1XHX A;  5I42 A;  3OBW A;  4FWR A;  4E0D A;  3D2F A;  2JWL A;  4BC3 A;  4B8A B;  4BDY A;  3D0P A;  5AQO A;  1VSJ A;  4R5P A;  3VGM A;  5CE3 A;  1BCG A;  1HNI A;  1NLV A;  3JAM O;  3PSM A;  3ZSO A;  3V1R A;  1WAJ A;  3ZX0 A;  1S1U A;  3HPH A;  4CK2 A;  1EP4 A;  1WUA A;  4ILH A;  1NGC A;  1RTJ A;  3SQ0 A;  3NBP A;  3J7Y P;  4B1X B;  4CF2 A;  3MX5 A;  2UUA K;  5AZJ A;  4DR7 K;  4N41 A;  1NWK A;  5AQH A;  1BHL A;  4FWN A;  1HNW K;  2PAV A;  4XEI A;  3NE6 A;  4CJ5 A;  2UYT A;  3O3G A;  1T6D A;  4EAH D;  4CHN A;  4BR0 A;  3RR8 A;  2QKB A;  3J81 O;  1ICA A;  2O8D B;  4CW7 B;  3CC2 N;  2IOC A;  4I9L A;  4M3X A;  1NH5 A;  4B3S K;  1ATR A;  2W6K A;  3CJ7 A;  3RSE B;  2O4I A;  4BVP A;  1HQE A;  1VK0 A;  3SAF A;  1NK0 A;  3CYM A;  5J2N A;  4GKJ K;  4QCL A;  1BK8 A;  1UA1 A;  1QTM A;  3THV A;  1DQ7 A;  1REV A;  3DXK A;  3KK2 A;  3KK3 A;  5IT9 O;  3CYG A;  1JLE A;  5GAE P;  1EQY A;  4M3R A;  3TU5 A;  3VEW A;  1OVQ A; 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