3M3ZA

Crystal structure of hsc70/bag1 in complex with small molecule inhibitor
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
PAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Protein binding
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
publication title Adenosine-Derived Inhibitors of 78 kDa Glucose Regulated Protein (Grp78) ATPase: Insights into Isoform Selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 114
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3m3zA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3m3zA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3m3zA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3m3zA04
3UKRA 4H0PA 3A5OC 2F9WA 2BUPA 5EY4A 2QWQA 2ZGYA 1GLAG 2VYPA 4JN4A 5AQJA 3RSEA 4ISEA 3O1WA 1GLCG 5JMVA 2E88A 1BO5O 1DEJA 2P9PB 3OHRA 3CERA 3W0LA 2CGLA 4BC4A 4DQ8A 1CZAN 2QWRA 4WQ4C 4FWLA 3O8MA 4I6MA 3SLCA 3LL3A 2FXUA 3VPZA 2YI1A 5AQQA 1XC3A 1QHAA 2P9PA 3EL2A 4YDUA 3DAWA 5AQVA 3MK6A 3WEEB 2W41A 5LJVA 2ITMA 3MN9A 4BRHA 2FF6A 1XUPO 3D2FB 3WQUA 4FWRA 3VENA 3KVGA 2D0OA 2A6AA 4M7XA 4IWVA 2E8AA 4K43A 3S41A 3FZMA 1K8KA 5BPNA 3FZFA 2YHYA 3HI0A 3WXIA 1RGIA 2E2NA 4B1ZA 4XH1A 4CZGA 4DHYA 4ISGA 3WEEA 5AQTA 5BRFA 5KPRA 4LC9B 1HX1A 2D4WA 1HKGA 3O08A 3ZEUB 4H5VA 3R8EA 3VESA 3B8AX 1QQNA 3W3DA 4BR7A 3D2FA 1NGGA 3EZWA 2P9SB 3M1FA 3MN7A 4C23A 2QWLA 3DXMB 5AQIA 1LOTB 2I7NA 5LY3A 4PKIA 1T6CA 2A3ZA 1YAGA 2NLXA 3IFRA 4XH4A 1NM1A 2FSKA 2NRHA 1HLUA 3R6MA 4B1VA 3ULEB 4QS8A 4BRDA 4CD1A 3ZEUA 3F9MA 1ATNA 2P9SA 1OKJA 5JICA 3DXMA 5FPNA 4WQ4A 5JLHA 3IUCA 1V4SA 4WYBA 5AQZA 4H0VB 1GLFO 1YXQA 4O8KA 4B1YB 2HMPA 3ZETB 3H3NO 1DKGD 1KAYA 3GBTA 2VWBA 5F2RA 1LCUA 4HTLA 4BR0A 4MLHA 1QZ5A 4BRGA 1GLLO 3IDHA 5E26A 3QBWA 3ENOA 4MO4A 2YCHA 3H3OB 4PL8A 4CBUA 2E1YA 2H3GX 2V7ZA 1SAZA 2I7PA 3M6GA 5KPZA 1JCFA 3O4WA 3VEYA 1NGBA 3ZETA 3CIPA 2V52B 2YJFA 1U2VB 3HBTA 3VOVA 4CZEA 4BRLA 2YHXA 2Q2RA 1QQMA 2DPNA 4CZFA 4BVPA 3A5LC 3LDLA 4QS7A 1ATRA 3QMLA 2AP1A 3A5MC 4BRPA 3QFUA 1SQKA 2P9NB 2ZGZA 3JS6A 4F9OA 2V51B 1WUAA 5AQOA 5BN8A 4BG9A 5LJWA 4EFHA 1IJJA 5ADXH 4H5TA 3H6EA 4FOIA 3J8AA 1U2VA 4NB4A 1KAXA 3ATUA 4FWOA 1ESVA 1NGAA 2Q0UA 4BGAA 4BREA 3A8YA 4IO8A 2QWOA 4MLEA 3VF6A 3MN6A 4M63C 4FL9A 3VETA 5BREA 1GLDG 4BR5A 3R9PA 2IVNA 2P9NA 5FPEA 5BPLA 3BEXA 5EX5A 5ADXA 3BUZB 3WXLA 5AQWA 4CJ7A 4IZ9A 2UYTA 4CZHA 1HKBA 3HZ6A 3LM9A 3BP8A 2Q31A 3ENHA 4FO0A 4FWSA 4H5RA 4A2BA 3U9ZA 4FWQA 1EQYA 3I8BA 5EOYA 3H45C 2EWSA 5AQXA 1MWMA 1E4GT 1BU6O 1HPMA 5AR0A 1NMDA 4Z94A 2D0PA 2HF4A 3QICA 1HKCA 5F0XA 2FLOA 4HWIA 3VERA 4BRMA 2CGJA 5KPTA 2P9UB 3HM8A 2ZF5O 3GL1A 2QWMA 4CZKA 3LDNA 1E4FT 4FWNA 1QZ6A 4BRIA 3P4IA 3HTVA 4XEIA 5E84A 3FFKB 4JAXA 4E1JA 3L4IA 3UE5A 4BQZA 5AQGA 3A5NC 5AQYA 2D1KA 3G25A 2CH6A 4WQ5C 2P9UA 2BTFA 1NGFA 3EO3A 2HOEA 3MN5A 2E20A 3CJ9A 3WT0A 2YHWA 4CBXA 2A42A 3KZBA 4BRQA 2P9KB 5JLFA 3LDOA 4K25A 3UKUB 2P9IB 2PAVA 2CH5A 1Z05A 4H0TB 4H0OA 1GLEG 1MWKA 4H5WA 4EHTA 5AZJB 2E2OA 3LM2A 1T44A 4IJNA 1NGCA 2P9KA 4XH5A 1BUPA 4JHDB 3CJCA 4H5NA 3UKUA 3H1VX 2P9IA 3CETA 1U6ZA 1HJOA 5F1XA 5AQLA 3CI5A 3D2EB 3WXJA 3ULEA 3H46O 2A40A 2GEMA 5AQUA 1D4XA 5BR9A 2QM1A 4BC5A 3SMPA 5CE3A 5AQSA 5FPDA 1JCGA 2J4RA 4RTFD 3VEWA 3L0QA 3C7NB 3GDQA 1C0GA 1IG8A 3D2EA 4BVOA 2P9LB 4PKGA 3QFPA 1J6ZA 1JCEA 3ZX3A 3ZX2A 3L6QA 3I33A 5AFUA 3U4LA 5AQMA 4K41A 2Q36A 5ELZA 2VCPA 4IJAA 5KQDA 5EVZA 1ZBSA 3FGUA 4O5FA 2HF3A 3EKSA 1C0FA 1X3MA 4GY2B 4AM7A 1MDUB 2P9LA 1YVNA 1Z6RA 4K42A 4H03B 4CZIA 1BDGA 2NZTA 2E2QA 3AAPA 1ATSA 3VF2A 4M7YA 5B8HA 3H1QA 1X9JA 3QBXA 3VGMA 1R59O 2IVOA 1TYQB 1NGJA 4BR9A 4BRFA 4BROA 3SJHA 3GE1A 3EKUA 5EXWA 2IIRA 3CHWA 2GWJA 4BQLA 3AAQA 3KHYA 4BRCA 3M3ZA 1NBWA 2GWKA 1V4TA 2AA4A 1GLJO 5FPMA 3GOIA 5AQKA 4MO5A 4BRKA 4BC2A 3DXKB 4I6MB 4J8FA 1G99A 2QW9A 1RDWX 1TYQA 4Y0WA 3ATVA 4CBWA 1NGDA 4GNIA 5AQFA 1S22A 4JNEA 5BN9A 4RWTA 1BA0A 3SMSA 2FSJA 1BA1A 3CJBA 1T6DA 4BR4A 1GLBG 5AQNA 4FWPA 4FPAA 4ISFA 3DXKA 2Q1NA 5AZIB 1K8KB 2GTDA 4FWKA 2WUSA 2A5XA 4H0XB 2OANA 1Q18A 3VEVA 4BG8A 2KHOA 2FSNA 4CZMA 3FZLA 3CQXA 3LDQA 3VGKA 3VEXA 4BGBA 2QWPA 2W40A 4EIAA 5BRHA 2Q97A 2ASMA 3CJAA 3VEOA 5AZIA 1NGEA 3CJ7A 4EHUA 2A41A 1NWKA 1X3NA 1Y64A 4BRAA 3FZHA 3DJCA 2CGKA 1S3XA 2GUPA 4QS9A 4AM6A 1NGIA 2ASOA 1H1VA 3ID8A 1NGHA 1KXPA 5BRDA 4B1UB 1XQSC 3SK3A 3WXKA 2ASPA 3CJ1A 1BWFO 3BF3A 2QWNA 3VF4A 4CZLA 3O5BA 3DWLA 4A61A 3ZX0A 3HSCA 5AZJA 4B9QA 3FZKA 1TUUA 3IMXA 3O1BA 4H0YB 2QXLA 3U8XA 1SZ2A 4CZJA 3VEZA 4JHDA 4A62A 4CI6A 3CQYA 5AFUH 3TU5A 1MA9B 5I9EB 4NO7A 1QQOA 2Q0RA 2PBDA 3TPQA 4BRNA 3FE1A 5AQRA 4FOEA 1KAZA 1BOTO 1TUYA 3WQTA 4WQ5A 5TKYA 3GG4A 4KBOA 3JXUA 3WUHA 2E1ZA 2V7YA 4YDUC 3QB0A 3C7NA 3D7EO 2F9TA 3FLCO 4L3QA 4DB3A 3C0BA 2E2PA 2GELA 3MDQA 4B1WB 4FWMA 3LDPA 1HUXA 4JD2B 3EN9A 1WOQA 5AQHA 3O80A 4BC3A 4FSVA 1ZC6A 1ZXOA 3MCPA 3UKRB 3U9DA 4FPBA 4DCHA 3O6WA 2IVPA 3MMVA 4BR2A 3BF1A 5BPMA 1P8ZA 3AY9A 3QDKA 4B1XB 4PL7A 3RSEB 5AQPA 1NLVA 4RCHA 4EAHD 3FR0A 4PKHA 5KQ8A 1BG3A 3AARA 3A0IX 3VGLA 1RFQA 2FF3B 4JD2A 1DGKN 2YJEA 1YUWA 3UB5A 2ZWHA 4CD3A 4IXCA 4A2AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DM6L 2FBVA 1HPZA 5EY4A 4FVMA 4FYDA 4JN4A 5AQJA 3CFRA 2GBZA 4JI0K 4DV4K 5FLXO 1ITGA 3O4QA 2P9PB 2OPPA 1YT3A 2R7YA 4GV3A 1VQNN 4DU1A 2HB5A 3OYLA 3RR7A 4B8CA 4KYPA 2HW3A 2OCEA 1JKHA 4YDUA 4DFKA 4M41A 3B6OA 3THYA 3UIQA 2NRRA 3ZSWA 2P1JA 3OJSA 4HUFA 1NK8A 4CFDA 1XUPO 3D2FB 2A1RA 1QVFM 4FWRA 3SI6A 4AHVA 4Z4IA 1HYSA 1ZBUA 4M7XA 3RTVA 4K43A 1K8KA 2YHYA 4YORA 4CGHA 4WFAL 3THVA 4CHQA 5KK4A 4CJPA 2G8KA 4B1ZA 4JYAK 2WTUA 1TL3A 4DHYA 5BRFA 4B9VA 4DKWA 3P1GA 4H5VA 3NVMA 3VESA 3KWGA 1ZVGA 3LAMA 4C23A 2QWLA 3DXMB 3G6EN 1UA0A 3IG1A 4PKIA 2LI7A 1T6CA 3HYFA 3OYJA 1YAGA 2NLXA 4BWJA 1T7BA 2X78A 3R6MA 1JLCA 4ILGB 4A5BA 4B1VA 5C2DA 2ZJPL 1XC9A 4BRDA 4HCBA 4CD1A 4PA1A 3SV3A 1RNHA 4YOVA 3B6PA 5C42A 2KYQA 3KOXA 5JLHA 4ZTFA 5AQZA 4H0VB 3ZSYA 3ZETB 1TKTA 3H3NO 2D56A 5HL7L 1ZU3A 3KKRA 2KZZA 3J81O 1BIZA 3AVIA 4CHOA 5GINA 3OYMA 3NBPA 3IDHA 1KRPA 4AHCA 2OTJN 3T1AA 3ENOA 3BK3C 4PL8A 4ILJA 2OPQA 2I7PA 2LY5A 3M6GA 5KPZA 1C0TA 4FJ5A 3CIPA 2GMOA 4DQSA 2HBMA 2YJFA 1XMQK 2KBHA 4C8OA 3HBTA 3HSTB 3VOVA 5SWMA 1Q8IA 2VWJA 4BRLA 1QQMA 3CM6A 4LD0A 1ZYWA 1NKCA 3HXMA 4QS7A 4CGFA 1HNZK 4B9SA 2P9NB 1RTHA 1WUAA 1NK0A 5AQOA 5FRNA 4EFHA 3H6EA 5TKWA 3VQ9A 4JRPA 1ZBLA 4FWOA 2Q0UA 1NGAA 4BREA 3PSMA 3A8YA 3PLAA 2QWOA 4CJUA 2DTUA 4MLEA 3MN6A 3VETA 3KKSA 5BREA 4W5NA 3CCSN 2G8HA 1GLDG 3MECA 1I39A 3S3MA 2VGMA 3OYHA 5BPLA 1VQPN 4CK3A 1SN4A 3RMCA 3WXLA 1RT1A 5JS2A 4IOXA 2QTDA 4CJ7A 4DV2K 2UYTA 5AJ3K 3HZ6A 2HBKA 2Q31A 4A2BA 4LFBK 2YKNA 1X9SA 1VQ9N 4CGGA 1VSDA 5AQXA 1YJ9N 3MCAB 1NMDA 3KLFA 4OLBA 3QICA 3IRXA 3CYGA 2O8FA 3HVTA 4JKFA 4X64K 1HRHA 2CGJA 5LL6Z 5J2PA 3BY5A 4F3TA 4DV7K 3HOSA 3LDNA 1E4FT 4FWNA 3F5TA 4JKGB 3HP9A 4PHTX 4G9ZA 3O3FA 4I2QA 1EETA 3FFKB 3IKMA 3CM5A 4JAXA 4E1JA 1ICAA 4JK7A 2JGUA 4FJKA 1R0AA 3G25A 3ZYYX 1RILA 4E72A 1NGFA 3CCLN 2E0HA 1CN2A 3SV4A 1S9EA 4CBXA 3L2WA 3OS1A 1OH5A 3KK7A 3QIPA 4DTOA 5HRNA 4F4KA 1VSKA 4N56A 3THXA 4JKHA 3UKUB 2O8EA 1UOCA 2P9IB 4ID5A 3SPZA 3NMUA 4CQKA 5MLCQ 1TK8A 3MX5A 2E2OA 3F73A 1S1XA 3T69A 2HNDA 4KKOA 3VQDA 3CJCA 3KLIA 4H5NA 3E66A 4IFEA 3CETA 3OYCA 3RMAA 1VK0A 2ATQA 5C12A 4CEAA 3P38A 1BRZA 4HUGA 3IAYA 1BK8A 4BC5A 3ALYA 5CE3A 1SUQA 1JCGA 5J2NA 4AHSA 4AH9A 5JVGL 1X9MA 4RTFD 1N32K 3C7NB 1DQ7A 1C0GA 5E41A 4B3OA 2OPSA 2YX6A 2RHKA 2KFNA 3PX4A 4BWMA 2BDPA 4PKGA 1HNVA 3K59A 4C8MA 1REVA 3AVCA 3OYAA 1OH7A 3FGUA 4WF9L 1EP4A 3EE9A 1C0FA 5FROA 4CGJA 3L2UA 1L3TA 1MDUB 3VQ6A 3AVHA 3H1QA 1X9JA 2HMIA 3T3FA 4DWIA 1NGJA 1LW2A 4BR9A 1GPTA 1NOZA 2YILA 2HHTA 3SAHA 4LSNA 3KLHA 1BISA 1WN7A 2PYLA 4AAZA 4E7KA 3K5OA 1I6GA 3T1YK 3PV8A 1BL3A 3GOIA 5FPMA 3MEDA 3NGYA 5AQKA 3J7ZO 3DLRA 2XHBA 2VQEK 4UY8O 1WNSA 2NRVA 2FBXA 4M3RA 3ATVA 5J2MA 1KFDA 5HOOA 4RW6A 4DUYK 3QETA 5GAHP 4CK1A 4RWTA 1BA0A 5D3GA 4NCAA 3CFPA 1PE4A 3CCQN 4BR4A 3SPYA 2HHVA 4ISFA 1KSPA 3OYKA 3AV9A 4CHYA 3E7RL 4IBNA 3TWHA 4H0XB 2O8BA 2OANA 2HHSA 4DTNA 1P90A 1P00A 2E2FA 1WSHA 1N8RO 2B5JA 1UGLA 1I2UA 4EIAA 3VEXA 1NK7A 2QWPA 3ZSXA 1KTQA 3T1HK 1TK5A 4DS4A 4B8AB 4FLXA 1HMVA 3CJ7A 4EHUA 4DTXA 1NWKA 3QLHA 1T7AA 3M8PA 5JENA 4QS9A 1NGIA 4CEDA 2YHBA 3V9XA 4B1UB 1XHXA 5C25A 1XQSC 3WXKA 4DV6K 4DSLA 1BWFO 2E5LK 4Q0BA 1HQUA 3OYGA 1IBMK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5DM6 L;  2FBV A;  1HPZ A;  5EY4 A;  4FVM A;  4FYD A;  4JN4 A;  5AQJ A;  3CFR A;  2GBZ A;  4JI0 K;  4DV4 K;  5FLX O;  1ITG A;  3O4Q A;  2P9P B;  2OPP A;  1YT3 A;  2R7Y A;  4GV3 A;  1VQN N;  4DU1 A;  2HB5 A;  3OYL A;  3RR7 A;  4B8C A;  4KYP A;  2HW3 A;  2OCE A;  1JKH A;  4YDU A;  4DFK A;  4M41 A;  3B6O A;  3THY A;  3UIQ A;  2NRR A;  3ZSW A;  2P1J A;  3OJS A;  4HUF A;  1NK8 A;  4CFD A;  1XUP O;  3D2F B;  2A1R A;  1QVF M;  4FWR A;  3SI6 A;  4AHV A;  4Z4I A;  1HYS A;  1ZBU A;  4M7X A;  3RTV A;  4K43 A;  1K8K A;  2YHY A;  4YOR A;  4CGH A;  4WFA L;  3THV A;  4CHQ A;  5KK4 A;  4CJP A;  2G8K A;  4B1Z A;  4JYA K;  2WTU A;  1TL3 A;  4DHY A;  5BRF A;  4B9V A;  4DKW A;  3P1G A;  4H5V A;  3NVM A;  3VES A;  3KWG A;  1ZVG A;  3LAM A;  4C23 A;  2QWL A;  3DXM B;  3G6E N;  1UA0 A;  3IG1 A;  4PKI A;  2LI7 A;  1T6C A;  3HYF A;  3OYJ A;  1YAG A;  2NLX A;  4BWJ A;  1T7B A;  2X78 A;  3R6M A;  1JLC A;  4ILG B;  4A5B A;  4B1V A;  5C2D A;  2ZJP L;  1XC9 A;  4BRD A;  4HCB A;  4CD1 A;  4PA1 A;  3SV3 A;  1RNH A;  4YOV A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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