3QFPA

Crystal structure of yeast hsp70 (bip/kar2) atpase domain
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
377
structure length
367
Chain Sequence
YGTVIGIDLGTTYSCVAVMKTEILANEQGNRITPSYVAFTDDERLIGDAAKNQVAANPQNTIFDIKRLIGLKYNDRSVQKDILPFNVVNKDGKPAVEVSVKGEKKVFTPEEISGMILGKMKQIAEDYLGTKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVLRIVNEPTAAAIAYGLDKKEHQIIVYDLGGGTFDVSLLSIENGVFEVQATSGDTHLGGEDFDYKIVRQLIKKKHGIDVSDNNKALAKLKREAEKAKRALSSQMSTRIEIDSFVDGIDLSETLTRAKFEELNLDLFKKTLKPVEKVLQDSGLEKKDVDDIVLVGGSTRIPKVQQLLESYFDGKKASKGINPDEAVAYGAAVQAGVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein homolog
publication title Structural analysis of the Sil1-Bip complex reveals the mechanism for Sil1 to function as a nucleotide-exchange factor.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 107
structure length 367
sequence length 377
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2011-01-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3qfpA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfpA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfpA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3qfpA04
1ATRA 5AQVA 4JHDA 4FOIA 2VWBA 1T6CA 4BRAA 5BR9A 4MO5A 3FZFA 1WUAA 2I7PA 3CJBA 1ZBSA 2I7NA 3B8AX 4E1JA 3VGLA 3WXLA 2D1KA 3ZETB 1JCFA 3LDQA 5JMVA 4Y0WA 1G99A 4H5RA 1V4TA 3CQXA 4RCHA 1LOTB 1HKCA 2FF3B 5AQKA 3LDNA 4BRLA 1XQSC 5AQSA 3GE1A 4AM6A 3FFKB 2PBDA 4BREA 5E26A 4BR9A 1K8KB 2A6AA 5F2RA 4O8KA 4HWIA 5BREA 3WQTA 2E8AA 2V7YA 4KBOA 5AQMA 4FWLA 3VESA 4A61A 1KXPA 5BPMA 2HF3A 3I8BA 4EFHA 5ADXH 1DGKN 2E1YA 3ULEB 5AZJB 1Y64A 2IVOA 2YHXA 4PL8A 1U6ZA 1K8KA 4IWVA 3D2FB 4BRNA 3QICA 4A2BA 5KPTA 3DXKB 3U9DA 3UKRA 4FWMA 3EO3A 4XH4A 3UKUA 3WXKA 1TUYA 4BRCA 5AQNA 5FPEA 1X3MA 3VEVA 4BC4A 5AZIB 2E1ZA 3D2EB 3VPZA 4FWRA 1LCUA 4JD2B 2QWRA 4CZFA 4CZHA 4DQ8A 5BRDA 2HOEA 3H46O 4K25A 4GY2B 4FPAA 4IZ9A 3WXJA 1NGBA 3FZMA 3TU5A 3H3NO 3U4LA 2ASMA 4IJAA 4H0YB 4K41A 1KAYA 2YHYA 3BP8A 1TYQA 2V51B 5AQQA 1OKJA 2YI1A 3VEXA 4BVPA 3KVGA 3W3DA 2NRHA 3D2EA 4FWKA 2V52B 3ENHA 4JD2A 3WT0A 3R8EA 4JAXA 1GLLO 3QBXA 3VENA 3FZKA 3HI0A 1HKBA 2GWJA 4XH5A 5E84A 2PAVA 1GLEG 4IO8A 3I33A 1QHAA 1EQYA 5AQRA 3RSEB 1SQKA 4CZLA 2IVNA 3LL3A 4ISGA 4MO4A 3TPQA 2QWPA 1NGIA 2P9KB 3O08A 5ADXA 3L4IA 1BDGA 1IJJA 5F1XA 2GEMA 3O4WA 2ZF5O 3MN7A 2QWNA 5KPZA 4CBUA 4FO0A 4WQ5C 4BRKA 4JN4A 3DXMB 2IVPA 2Q0RA 3GOIA 3AAPA 3R9PA 2AA4A 3CJ9A 3KZBA 2P9SB 4JNEA 3HBTA 5EOYA 5BN9A 2YJFA 4IJNA 4DHYA 3ZEUB 2P9NB 5EX5A 4BROA 2P9IB 2W41A 2YCHA 1NGJA 3HM8A 3O80A 3DWLA 3FR0A 3UE5A 3WEEA 4J8FA 3VF6A 1NGEA 1Z6RA 3ATVA 2A41A 4Z94A 4ISFA 1BO5O 4LC9B 2UYTA 1QQOA 1QZ6A 4HTLA 3WQUA 5ELZA 1E4FT 1H1VA 2J4RA 4B1ZA 1BUPA 4WYBA 3ZEUA 1Q18A 1WOQA 3AAQA 3MN6A 2VYPA 2P9IA 3IMXA 4FOEA 3ENOA 3SK3A 2DPNA 5KQ8A 2FSKA 3QBWA 1YVNA 4O5FA 4B1UB 1C0GA 1ZXOA 3R6MA 3LM9A 2GUPA 4B1XB 3ZETA 2P9PB 5LY3A 4I6MB 4FWSA 1Z05A 1KAXA 4EAHD 1ATSA 3P4IA 1RGIA 4WQ4C 3ATUA 3CJAA 3MN5A 2F9WA 4YDUC 5KQDA 1BU6O 4EIAA 2E2PA 3VF4A 2FXUA 1NLVA 3QB0A 3A8YA 2ASPA 1MA9B 4BRDA 4FWOA 2QWQA 5EXWA 3LDOA 3ZX2A 2EWSA 4B1WB 3W0LA 4B9QA 2IIRA 2P9PA 2QXLA 1QQMA 2CH6A 4I6MA 3H6EA 1GLDG 3A0IX 3ULEA 5BRFA 4XH1A 5AZJA 5AQFA 3U9ZA 1RDWX 4BG8A 3VEOA 4BR4A 3HZ6A 3MCPA 3C7NB 4CJ7A 4M7XA 4RTFD 3VF2A 3D2FA 3MK6A 3U8XA 4CZIA 1BWFO 5AQPA 5JLFA 4AM7A 3M1FA 3DXKA 3CJCA 1ESVA 4H0XB 2QW9A 3QFPA 2NLXA 2QWMA 5AZIA 5B8HA 4BRPA 4BVOA 4BR0A 4C23A 4BC3A 4FSVA 2P9UB 4BRFA 4MLHA 1ZC6A 1BA1A 3C7NA 4FL9A 1MWMA 3ZX0A 1X3NA 3M6GA 3MMVA 1U2VB 4BC2A 4BGBA 3CJ1A 4IXCA 2HF4A 4FWQA 4M63C 2AP1A 2GELA 1HUXA 3DJCA 3WXIA 2YJEA 2W40A 2D0PA 4BRIA 4K42A 2WUSA 1T6DA 2ZGYA 3FGUA 4F9OA 1HPMA 5JICA 1NGHA 3G25A 3CERA 4CZEA 4H5WA 5FPMA 2FLOA 2P9UA 1GLJO 3DAWA 5FPNA 2CGKA 4GNIA 5BRHA 4EHTA 1NGCA 1U2VA 5TKYA 1GLAG 2A40A 4JHDB 3O6WA 3EZWA 4CBWA 3RSEA 4ISEA 4H0OA 4CI6A 2P9LB 5F0XA 3VGMA 4DB3A 2P9KA 1YUWA 3FE1A 3A5OC 3IDHA 2E2QA 1GLFO 1XUPO 3GBTA 5LJWA 3VOVA 2H3GX 5EY4A 5I9EB 3GL1A 3L6QA 2Q0UA 4B1YB 3F9MA 3OHRA 3AARA 1HJOA 3DXMA 4FPBA 4XEIA 3MDQA 3HTVA 3CETA 4CZKA 2QM1A 3VGKA 4H0VB 2P9SA 4QS7A 1GLBG 3AY9A 5CE3A 4BR5A 3H45C 2E2OA 2P9NA 3EKUA 4BQZA 5KPRA 1NWKA 2HMPA 4CZJA 2P9LA 4BQLA 5AR0A 3O8MA 3IUCA 1RFQA 4PKHA 2CGLA 5AQXA 2ZGZA 5AQLA 5AQIA 1IG8A 3QDKA 3CHWA 4H0PA 1D4XA 3FZLA 2A3ZA 5AFUA 1KAZA 3S41A 2CGJA 4FWPA 4NO7A 3JS6A 1MDUB 4BR2A 1GLCG 3VEZA 1BOTO 1XC3A 2D0OA 2YHWA 3KHYA 3O5BA 5JLHA 3MN9A 2NZTA 2E2NA 5BPNA 5AQHA 5BN8A 2Q31A 2F9TA 3UKRB 4CD3A 3UKUB 2ZWHA 1S22A 3QFUA 2Q2RA 3CQYA 3GG4A 3L0QA 1MWKA 4PKIA 2KHOA 3UB5A 3H1QA 4BG9A 3SLCA 2ASOA 3BUZB 1BA0A 4BRHA 1NM1A 3LM2A 1DKGD 2BTFA 5FPDA 2BUPA 1YXQA 2VCPA 3SJHA 3ZX3A 5AQTA 3CJ7A 3CI5A 2OANA 3QMLA 1TYQB 4H5TA 4B1VA 2Q36A 1X9JA 4BR7A 5EVZA 1JCGA 3H1VX 3VEWA 3C0BA 1R59O 1J6ZA 3LDPA 5AQZA 2FF6A 4NB4A 3HSCA 3SMSA 4WQ5A 3JXUA 4BRGA 3BF3A 1E4GT 5AQWA 4DCHA 1NGDA 3J8AA 4QS8A 4BRMA 5AFUH 5AQJA 4A2AA 3EKSA 3D7EO 4BC5A 3M3ZA 3EL2A 3IFRA 3VEYA 1YAGA 1QQNA 1NMDA 3A5MC 3LDLA 3H3OB 1NGGA 4MLEA 4CZMA 4EHUA 2CH5A 2ITMA 3VETA 4H03B 5AQOA 4L3QA 4K43A 2FSJA 2FSNA 2E20A 3EN9A 5AQYA 1C0FA 1HLUA 1ATNA 5AQGA 2QWLA 3A5NC 1DEJA 1TUUA 1SAZA 4A62A 1NGAA 4CZGA 5BPLA 2Q1NA 2V7ZA 1S3XA 1V4SA 3FLCO 3BF1A 2D4WA 3GDQA 1QZ5A 4H0TB 2GWKA 2E88A 4PKGA 3CIPA 1HKGA 3ID8A 1SZ2A 4H5NA 5LJVA 1T44A 2Q97A 1NGFA 3WEEB 2A42A 3O1WA 3A5LC 5AQUA 1P8ZA 4CD1A 1NBWA 4M7YA 2GTDA 4RWTA 3O1BA 4BRQA 1JCEA 4QS9A 3WUHA 1BG3A 1CZAN 4H5VA 4FWNA 2A5XA 4BGAA 4WQ4A 4CBXA 2QWOA 4YDUA 3SMPA 3VERA 3FZHA 4PL7A 1HX1A 3BEXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CF0A 2VWBA 4AQYK 1K9MO 3OYCA 2I7PA 3CCEN 1QHTA 4AHRA 2QEXN 5M1FA 3VGLA 2D1KA 3ZETB 1NOYA 3QETA 4H5RA 1V4TA 4YOVA 1LOTB 1HKCA 2FF3B 3V9ZA 1NJIO 3BK3C 4FZYA 5AQSA 3GE1A 2PBDA 1N5YA 4FJXA 4BREA 2ATQA 4LF4K 1IKXA 1FK9A 2Y1JA 2YKMA 4KHQA 5BREA 1RILA 4WF9L 3K0SA 4BE7B 1XRSB 3HPGA 4KBOA 3T1YK 1VK0A 3QEIA 4A61A 2D0BA 4JYAK 1WMTA 3DM2A 3VN5A 3RMAA 3SJJA 3V9XA 1Y64A 1HPZA 3EE8A 4NCAA 2PYLA 4IWVA 3D2FB 1JLBA 4RW8A 3QICA 3SPZA 4R5PA 4A2BA 1LQIA 1SN1A 2ZJPL 4FWMA 3EO3A 4XH4A 2VWKA 1TUYA 4BRCA 5JVHL 5AQNA 5FPEA 2PYJA 3VEVA 2F4VK 4M45A 5AZIB 1OVYA 4FWRA 4DMNA 4CZFA 4DQ8A 3DLBA 2HOEA 3H46O 1ZVGA 4HCBA 4GY2B 1Y97A 1U04A 5AJ3K 1C0TA 3J7ZO 4DU4A 3ZYYX 3TU5A 5TKWA 3L2WA 1AHOA 2YIPA 4IJAA 2LSNA 2YHYA 4I2QA 1TYQA 2V51B 3K9JA 5AQQA 2JWLA 1OKJA 3VEXA 4BVPA 3KVGA 1Z26A 4FK2A 2IS3A 1KVBA 3WT0A 3KK1A 4DSKA 1N8RO 4O44A 4NXNK 2O8DB 2KTQA 3SV3A 3NF7A 3VENA 2IC3A 4KI6A 3NHGA 2UUCK 1HKBA 2GWJA 4JI6K 3BY5A 4IG3A 5E84A 3KKSA 1HNVA 4DV0K 5KGXA 1GLEG 4IO8A 3I33A 1RT2A 5AQRA 1SQKA 3OS1A 1KFDA 3AO2A 3MWPA 2PY5A 5ADXA 2XY6A 3THXB 4DKWA 1VHXA 1L3SA 4AHUA 4JV5K 4WQ5C 1ASVA 3T7ZA 3OVNA 2YHBA 4C8KA 3NCIA 3K57A 4LFBK 1JJ2M 1I2UA 3AAPA 2E6LA 4FLZA 1EO1A 5BN9A 3U3GA 2P9NB 2P9IB 2MN5A 3AVHA 3TAPA 3IS9A 3HM8A 2O8EA 3AO3A 4J2BA 4CJLA 1BMRA 1NKCA 4B3SK 1JLQA 2A41A 4Z94A 1WSJA 4ISFA 1BO5O 2O8FB 4LC9B 3NF9A 4HTLA 2XHBA 4AAZA 4LF5K 2UUAK 1E4FT 1H1VA 1ZU3A 3LWLA 4JRQA 3SPYA 3TAQA 1WOQA 2VYPA 2P9IA 4FYDA 3ENBA 3SK3A 3O3GA 3N4PA 3E7UX 4YOUA 4B1UB 1C0GA 3AVGA 2KQ2A 3TWHA 4DQSA 2P9PB 5LY3A 4B8AB 4FLXA 2O8FA 3NFAA 1KAXA 4EAHD 3P4IA 4WQ4C 3ALYA 2LKBA 3WNEA 2F9WA 2P5GA 1SUQA 1B9FA 2E2PA 4CEBA 3D0PA 4ZHRA 3H08A 4TSXA 2FXUA 3K58A 1I94K 3QB0A 3KLGA 3A8YA 2ASPA 2SN3A 3ZX2A 2HSTA 1XHZA 3THWB 2G8KA 3OYLA 4JKDA 4JI4K 1GPSA 1T0ZA 2P9PA 1U47A 2QXLA 3R3LA 3T1HK 5HRPA 3A0IX 2BH1A 5BRFA 5AQFA 2QK9A 3EEQA 4CVNE 4BG8A 4NCGA 3D6RA 4BR4A 2YBRC 3HL8A 5JENA 4HTUA 3IRXA 4OPKA 3U8XA 4W5QA 3TABA 5AQPA 1YVUA 4AM7A 4OLBA 3DXKA 3ZT1A 3J7AP 3SF4D 4ZTFA 1IKWA 1JLFA 1MR4A 2RF2A 2QW9A 4B3RK 4A5BA 2QWMA 3DLEA 5KRSA 3P83D 1T7AA 5FLXO 5B8HA 3LWMA 4FLWA 4CK1A 1WSGA 1T7PA 4BC3A 3CC4N 4FSVA 1NJWA 3F73A 3P1GA 4UADE 3QIPA 1OH8A 4FL9A 3ZT2A 1MWMA 1IBKK 1P0AA 4BGBA 3N4QA 4M63C 2OPPA 2GELA 3OYFA 4KB1A 3DJCA 3HP9A 2YJEA 3DRSA 1KC8O 4FJ8A 4K42A 1EXQA 2WUSA 1T05A 2I61A 3CMAN 3OBWA 4BECA 1NGHA 3CERA 1DTQA 2N2QA 1N4NA 4CJRA 1B9DA 4CHQA 3TSPA 1HRHA 1WNSA 1UA0A 4EHTA 5TKYA 4FJHA 4JKFA 3O6WA 4W5NA 3EZWA 3G0ZA 5F0XA 2VG6A 1S1XA 3A5OC 3IDHA 3G71N 3ZT3A 1TGOA 3RVCA 2H3GX 5EY4A 3L6QA 3MECA 3F9MA 3OHRA 4FPBA 4KO0A 4CZKA 4DQQA 3VGKA 4KHUA 2P9SA 1GLBG 4DV2K 3AY9A 1ZFUA 1QE1A 5SZTA 2OZSA 1ZBUA 4CIGA 2HMPA 5C12A 4CFCA 1S1UA 1J54A 1YF5L 4PKHA 4YOWA 2BDPA 5AQXA 5AQLA 4AHCA 4CIFA 3QDKA 3CHWA 4KYPA 3TTCA 3CCRN 2JWKA 4HHTA 1J9AA 2BE2A 4CJVA 4EP4A 3S41A 2CGJA 2RHKA 3E1YA 4NO7A 2YC1C 1S6PA 3ISNC 3QNNA 4YOYA 5AQHA 1T3VA 1W2BM 3DI6A 2FBXA 2KLAA 3UKRB 3T3FA 4WFAL 5KI6A 2C1GA 2F7TA 1I2VA 4KHWA 3KTQA 1WAFA 3GKUA 2Q2RA 3L0QA 4DFKA 3O9UA 4X65K 4K8XA 1ZBHA 4OLAA 4BG9A 4UJ0A 4B8CA 3F5TA 3T19A 3F9KA 3SLCA 2I5JA 2OZMA 4CW7B 4FK4A 1W9HA 2FBVA 1NK8A 1S1VA 4BRHA 1T7EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4CF0 A;  2VWB A;  4AQY K;  1K9M O;  3OYC A;  2I7P A;  3CCE N;  1QHT A;  4AHR A;  2QEX N;  5M1F A;  3VGL A;  2D1K A;  3ZET B;  1NOY A;  3QET A;  4H5R A;  1V4T A;  4YOV A;  1LOT B;  1HKC A;  2FF3 B;  3V9Z A;  1NJI O;  3BK3 C;  4FZY A;  5AQS A;  3GE1 A;  2PBD A;  1N5Y A;  4FJX A;  4BRE A;  2ATQ A;  4LF4 K;  1IKX A;  1FK9 A;  2Y1J A;  2YKM A;  4KHQ A;  5BRE A;  1RIL A;  4WF9 L;  3K0S A;  4BE7 B;  1XRS B;  3HPG A;  4KBO A;  3T1Y K;  1VK0 A;  3QEI A;  4A61 A;  2D0B A;  4JYA K;  1WMT A;  3DM2 A;  3VN5 A;  3RMA A;  3SJJ A;  3V9X A;  1Y64 A;  1HPZ A;  3EE8 A;  4NCA A;  2PYL A;  4IWV A;  3D2F B;  1JLB A;  4RW8 A;  3QIC A;  3SPZ A;  4R5P A;  4A2B A;  1LQI A;  1SN1 A;  2ZJP L;  4FWM A;  3EO3 A;  4XH4 A;  2VWK A;  1TUY A;  4BRC A;  5JVH L;  5AQN A;  5FPE A;  2PYJ A;  3VEV A;  2F4V K;  4M45 A;  5AZI B;  1OVY A;  4FWR A;  4DMN A;  4CZF A;  4DQ8 A;  3DLB A;  2HOE A;  3H46 O;  1ZVG A;  4HCB A;  4GY2 B;  1Y97 A;  1U04 A;  5AJ3 K;  1C0T A;  3J7Z O;  4DU4 A;  3ZYY X;  3TU5 A;  5TKW A;  3L2W A;  1AHO A;  2YIP A; 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