3QFUA

Crystal structure of yeast hsp70 (bip/kar2) complexed with adp
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
NYGTVIGIDLGTTYSCVAVMKNGKTEILANEQGNRITPSYVAFTDDERLIGDAAKNQVAANPQNTIFDIKRLIGLKYNDRSVQKDIKHLPFNVVNKDGKPAVEVSVKGEKKVFTPEEISGMILGKMKQIAEDYLGTKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVLRIVNEPTAAAIAYGLDKSDKEHQIIVYDLGGGTFDVSLLSIENGVFEVQATSGDTHLGGEDFDYKIVRQLIKAFKKKHGIDVSDNNKALAKLKREAEKAKRALSSQMSTRIEIDSFVDGIDLSETLTRAKFEELNLDLFKKTLKPVEKVLQDSGLEKKDVDDIVLVGGSTRIPKVQQLLESYFDGKKASKGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords 78 kDa glucose-regulated protein homolog
publication title Structural analysis of the Sil1-Bip complex reveals the mechanism for Sil1 to function as a nucleotide-exchange factor.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 110
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2011-01-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3qfuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qfuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3qfuA04
5ADXA 4CJ7A 4FSVA 4Z94A 4O8KA 2W40A 3WEEA 4H5RA 1RFQA 2Q31A 4E1JA 4ISGA 4I6MA 1NMDA 4GNIA 2P9SB 3MN7A 3DXKB 2ASPA 1QZ5A 4FWLA 3WXKA 4BR0A 4WQ4C 2DPNA 2FF3B 2Q0UA 3CJBA 2WUSA 2YI1A 1QQOA 3VEWA 5JMVA 4EIAA 1KAZA 1DEJA 1EQYA 3VEZA 1NGFA 2P9NB 3AAPA 3C7NB 5FPEA 2YJEA 3ZEUA 5KPRA 4BREA 3LDPA 3L6QA 2P9UA 1V4SA 3ZX2A 5BR9A 4EFHA 5AZJB 3ZX0A 2E2OA 2VWBA 3O08A 4H0TB 1H1VA 3KHYA 5AQMA 4WQ4A 3SMSA 3UKUB 4LC9B 3CIPA 1HJOA 5FPMA 3VF2A 3A5LC 4J8FA 4MO5A 4Y0WA 3TU5A 3H46O 1RGIA 4FWSA 1HKBA 3WXJA 3GOIA 4B1ZA 2F9WA 3FGUA 3WT0A 2P9KB 1MDUB 4H0PA 2E2NA 2BTFA 4BC3A 2A5XA 1NGAA 3QMLA 2VCPA 3I8BA 1T6CA 4L3QA 2ZWHA 4JHDB 2D4WA 2ZGYA 3UKRB 3H45C 5AQQA 1K8KB 1HLUA 3QICA 3CHWA 4BGBA 3CJ1A 5FPDA 3GG4A 2YCHA 4K43A 3ATVA 3WXIA 4CZLA 3AAQA 3CI5A 1S22A 5AQKA 4M7XA 5TKYA 4QS9A 3ULEA 4DQ8A 3QBXA 4FWPA 2HF4A 2Q1NA 3EO3A 2YHWA 3DXMA 1ATRA 3M6GA 2QWOA 2ZGZA 2YHYA 2CH6A 2FXUA 2ASMA 3VGMA 1LOTB 3H3NO 4FPAA 3U9DA 2H3GX 3O1WA 3FZKA 1JCEA 4XEIA 2V51B 3WQUA 4NB4A 1R59O 2Q97A 3O5BA 4A2AA 3EKSA 4CD3A 2FSNA 2I7PA 1YVNA 3ENHA 1NGGA 3GDQA 3UB5A 1V4TA 3L4IA 2VYPA 4JAXA 3B8AX 2I7NA 3D2FA 2D0PA 3ENOA 3U9ZA 1NWKA 3SLCA 2QWRA 3GBTA 1C0FA 3AARA 3D7EO 3ZETA 2V7YA 1G99A 3EKUA 2EWSA 4BRMA 1BOTO 2AP1A 1X9JA 4AM6A 2E88A 2FLOA 4PKHA 2CGLA 4BQZA 3QFUA 3HI0A 2IVPA 2IVOA 5BRDA 4QS7A 4RWTA 5AQOA 1U2VB 3WUHA 4A61A 2CH5A 3CERA 2D0OA 2W41A 4K25A 5BPMA 2OANA 1TYQB 5F0XA 5AQJA 3BF1A 5AQFA 3FE1A 3H1QA 2E20A 3L0QA 3W0LA 1ZBSA 3EL2A 5E84A 3RSEA 5BPLA 4ISEA 3MMVA 4FWQA 2QWPA 1BG3A 4CZEA 1Y64A 5AZIB 1DKGD 1NLVA 2QXLA 3SMPA 4CZGA 3CJ7A 5AQSA 1ATSA 3CQYA 4AM7A 3FZFA 1SAZA 2P9LB 4IZ9A 3IMXA 2P9PA 2IIRA 1BUPA 1NGJA 3D2EB 4K42A 1LCUA 1GLJO 4CBWA 1JCGA 2D1KA 1TUUA 4BRPA 4CBXA 2P9IB 1BO5O 2Q2RA 4PKGA 2HOEA 4RTFD 1QZ6A 2PBDA 4BRKA 1NGHA 4MO4A 3LDNA 5AQWA 3W3DA 1WUAA 1KAXA 3CJ9A 3VETA 4JNEA 3A5OC 2QWQA 4H0XB 5LJWA 1BA0A 2CGJA 3QB0A 1GLEG 4YDUA 4CZJA 1U6ZA 2A42A 1NGIA 1KXPA 4BR7A 3P4IA 4WQ5C 5BREA 3FZHA 1KAYA 4CI6A 1XQSC 2GEMA 2QM1A 5JLHA 4JD2B 1JCFA 4BRHA 4M63C 1BWFO 3LDOA 3VERA 3DAWA 4FWNA 2QW9A 5BN9A 5AQIA 5ADXH 2QWLA 4IJAA 3A8YA 4PKIA 5BN8A 5BRFA 3O4WA 1IJJA 4FWKA 4WQ5A 5JICA 3JXUA 3BEXA 2P9SA 1NGEA 1MWMA 4IO8A 5EX5A 3DXKA 3WEEB 4CZHA 5BRHA 3S41A 1ZXOA 2ASOA 3LDQA 3VGKA 4I6MB 1T6DA 3VPZA 1GLLO 4XH5A 3MN9A 4B1VA 2GWKA 2P9NA 1SZ2A 3VGLA 3C7NA 4H5VA 2A6AA 1XC3A 3FR0A 4FPBA 5KQDA 4BC2A 1ATNA 2Q0RA 4B1XB 3VEVA 5AQTA 5AZJA 3TPQA 4BRCA 2QWMA 2CGKA 4FOIA 3ZEUB 2NLXA 4CZKA 3UKUA 3VEOA 5AQUA 2E2PA 2P9UB 1BU6O 3EZWA 3O8MA 4NO7A 3IFRA 5B8HA 5F1XA 4FL9A 4H03B 5ELZA 2A3ZA 3MK6A 3HSCA 3H1VX 2P9KA 4PL8A 4BQLA 1X3NA 5KQ8A 4RCHA 4EHTA 1MWKA 5KPZA 4FO0A 3LDLA 3I33A 4JHDA 3UKRA 2HMPA 4PL7A 3O1BA 1YUWA 4BVOA 1QQMA 4BC4A 4XH1A 4BRGA 1NGCA 1GLFO 3LM2A 1NBWA 2FSKA 4BRAA 1ZC6A 4BR5A 1K8KA 3CQXA 2HF3A 4C23A 3OHRA 4B1WB 1HKGA 2V7ZA 4H0YB 4BRNA 3AY9A 4DB3A 4BRQA 3R8EA 1D4XA 4CBUA 5AQXA 1C0GA 3ID8A 4ISFA 4CZIA 3FLCO 5KPTA 1QQNA 2NRHA 3HBTA 2GWJA 3SJHA 3A0IX 4FWMA 5LJVA 4H5NA 4BVPA 3BUZB 4BRIA 2A41A 3QBWA 3GE1A 2GUPA 4FWRA 2UYTA 4IXCA 4QS8A 1HUXA 1Z6RA 3ULEB 4DCHA 3MN6A 3R9PA 1MA9B 3FFKB 3HM8A 1GLBG 4YDUC 2YHXA 3DXMB 4H5TA 3DJCA 5JLFA 5BPNA 3CJCA 5AQYA 3LM9A 1J6ZA 3HTVA 4EAHD 1NGDA 4HWIA 4BGAA 2IVNA 1OKJA 2E8AA 1E4FT 3J8AA 4BR4A 4DHYA 1BA1A 3G25A 3ATUA 5AQZA 1HPMA 1IG8A 4GY2B 5AQNA 3A5NC 4BR9A 5EY4A 4F9OA 3F9MA 1SQKA 3UE5A 1Q18A 1TUYA 1T44A 3D2FB 4XH4A 2V52B 1S3XA 4KBOA 4B9QA 1X3MA 2YJFA 4BG9A 2ZF5O 2J4RA 2AA4A 3U4LA 4BRDA 3IDHA 5EVZA 5AQPA 1GLAG 3ZETB 5AFUA 3VENA 3C0BA 3QFPA 4CD1A 2NZTA 3VESA 3LL3A 4BROA 3MN5A 1U2VA 3O6WA 3A5MC 3MCPA 3VEYA 3VOVA 4EHUA 3EN9A 1WOQA 1TYQA 3M1FA 3U8XA 2PAVA 3KZBA 3KVGA 1XUPO 5F2RA 4O5FA 3BP8A 5AR0A 2QWNA 1GLDG 3R6MA 4K41A 2BUPA 5EOYA 4HTLA 4BC5A 5AZIA 3RSEB 1NGBA 3O80A 2Q36A 1YXQA 4WYBA 3H6EA 5CE3A 4H0OA 3ZX3A 2KHOA 3FZLA 3GL1A 2P9LA 3VF4A 2A40A 5EXWA 1NM1A 4H5WA 1YAGA 2F9TA 3BF3A 4A62A 3D2EA 5I9EB 4IJNA 4A2BA 2P9PB 2E1YA 4MLHA 2P9IA 3VEXA 3CETA 3CJAA 1CZAN 2ITMA 4BR2A 3WQTA 5AQVA 2FF6A 5AQGA 1Z05A 2E2QA 1P8ZA 5AQHA 3SK3A 4BG8A 3M3ZA 3DWLA 4FOEA 2E1ZA 5AQLA 4BRFA 1GLCG 5AQRA 4FWOA 4CZFA 1HX1A 5FPNA 1E4GT 4B1UB 5AFUH 1BDGA 3VF6A 4JD2A 4MLEA 4M7YA 1QHAA 1HKCA 3H3OB 1ESVA 2GTDA 3JS6A 3MDQA 4IWVA 3IUCA 3WXLA 3FZMA 2FSJA 4BRLA 5E26A 4H0VB 1DGKN 2GELA 4CZMA 4B1YB 3QDKA 5LY3A 1RDWX 3HZ6A 4JN4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CC2N 2G8KA 3ZSRA 2W42A 4Z94A 1U04A 4H5RA 4HUFA 1NMDA 4JKHA 4GNIA 3WNHA 3DXKB 2ASPA 3K9JA 4PA1A 3U3YA 3K2PA 4YOXA 3CCJN 1ZYVA 1LQQA 3VQPA 1DEJA 4EIAA 1L3SA 1CXUA 3M8QA 1NK6A 1HYZA 3J81O 4DTOA 3F9KA 4F2SA 2YJEA 3NF6A 4OGEA 4BREA 3HO1A 1WLJA 1TGOA 5JVHL 5GIPA 1KFSA 5AZJB 4DV2K 2P5GA 2VWBA 1NK0A 1H1VA 3SCXA 4OLBA 5AQMA 2BANA 3UKUB 4LF4K 4CEQA 2O8BA 1HJOA 4CJFA 4ELTA 3VF2A 3A5LC 4Y0WA 2OTLN 3WXMB 2F9WA 3BZKA 3RVCA 3FGUA 3HYFA 2BTFA 4M3TA 4YOWA 3QMLA 4O55A 1T6CA 2ZWHA 2LJ7A 2DY4A 1VSEA 3P5JA 4FM0A 3OVNA 2ZM6K 5KTQA 2DFEA 4OVLA 4CCHA 3C6TA 5KGXA 4YOUA 2QKKA 3RRHA 4K8ZA 1QVFM 4Q0BA 2P1JA 3HOTA 3T69A 4IO9L 1KVBA 4CZLA 3NH2A 3KWGA 4AEIA 1UAXA 4YORA 4W5RA 2E3FA 2GL1A 2G2KA 4CGFA 3ZT2A 5AQKA 4WCEL 5TKYA 1C1AA 3ULEA 3QBXA 2HF4A 4IDKA 4M3WA 2Q1NA 2SN3A 2YHWA 1ATRA 3SUOA 2BGGA 2FXUA 2YIOA 1LOTB 2HNYA 4ZTFA 1TK5A 3AA4A 3U9DA 2H3GX 4CGHA 4H4MA 1R59O 1TVRA 3DI6A 3P31A 4A2AA 2PYJA 4CQKA 4NCGA 2QA4N 1XNQK 3ENHA 1E3MA 3LP2A 3UB5A 4Y1DA 4XJXA 4WFNL 3L4IA 2O8EA 2I7NA 3D2FA 3MEGA 1VRUA 3ZCMA 1QSYA 4K8XA 3SLCA 3GBTA 4AHRA 3QETA 3ZETA 1S6PA 4PHTX 1BOTO 2PZSA 5J2PA 3AO3A 2E88A 4AM6A 4PKHA 4JI1K 4PUOA 3N4QA 2YV0X 3K5NA 4FLZA 5BRDA 1IKWA 3K58A 1D9FA 5AQOA 5JS2A 2CH5A 1U4BA 4K25A 5BPMA 5F0XA 4BACA 2LSNA 4DV1K 2B6AA 2E20A 1IV0A 2B3CA 4JLHA 3KKRA 1C0TA 4DR5K 4DSKA 1ZBSA 3EL2A 1VQ7N 2WC9A 4ISEA 1ILYA 4FWQA 2QWPA 1BG3A 2QI2A 3CQ8A 1T7PA 4CF1A 1WSGA 1S6QA 2XHBA 2NRWA 3PY8A 5AQSA 4AM7A 2P9LB 1TL3A 4OGCA 3D2EB 2IDOA 1GLJO 4BEBA 1JCGA 4CF2A 3THWA 3THXB 4AHVA 2HHQA 2HOEA 3MX5A 5C15A 3EZ5A 1BQNA 4DG1A 4CEAA 4JK8A 2IAJA 3VETA 5JENA 1VQ6N 2UUAK 2CGJA 3NHGA 5CY4A 3O3FA 1U6ZA 2A42A 3CM5A 4CFBA 3HVTA 1TKXA 3AVJA 2PYLA 2ASCA 4DV5K 4CI6A 2QM1A 2HHTA 4CK2A 4A5AA 1FKPA 1JCFA 4M3YA 2D5RA 1BWFO 4DQQA 3VERA 4FWNA 1QSSA 4DTPA 4JV5K 2QWLA 4IJAA 3SBGA 3M8RA 5BN8A 5BRFA 4RW7A 4NCBA 1P90A 1IH7A 1F21A 1IJJA 1D8YA 3JYTA 5C12A 3ID6A 4DQPA 3PIOL 1WNSA 3THYA 1NK5A 1NGEA 4B8AB 4IO8A 2KFNA 5BRHA 2IS3A 1N36K 4FLXA 1K9MO 3LP0A 3VPZA 4PY5A 1GPSA 4XH5A 2O8DA 2W00A 2P9NA 3VGLA 1SZ2A 3C7NA 2A6AA 3FR0A 5KQDA 4FW1A 4BC2A 3L2RA 4V1DC 3CW4A 5C24A 2QWMA 2NLXA 3NF8A 3PO5A 2E2PA 1IKVA 2LJMA 3EZWA 3O8MA 3CF5L 4DF4A 4GVEA 5B8HA 4H03B 5ELZA 1ZBLA 1WSFA 3H1VX 5CYMA 2GBZA 4Z4EA 1XWLA 2QTDA 5E41A 4FJNA 3TAGA 1X3NA 1YF5L 1YTUA 4FO0A 4DR2K 3I33A 3KIOA 4JHDA 1VQ5N 2HMPA 4CFCA 4PL7A 1GOCA 4BVOA 1SKSA 3VQQA 1D9DA 4XH1A 4DTMA 4BRGA 1NGCA 4DQIA 3AVGA 2FSKA 2ZQBA 4BR5A 1K8KA 3CQXA 4FM2A 4JI5K 1ICAA 1HKGA 2HHVA 4DB3A 4BRQA 3R8EA 4CBUA 4ISFA 3V1RA 1XI1A 1HNVA 4H5NA 5CY0A 4BRIA 2A41A 3VQCA 3BK3C 1T05A 2W6KA 1LAWA 2PY5A 2O8CB 4IDHA 3BDPA 3AVAA 3ZSOA 1KD1O 5MLCQ 1BHLA 1SV5A 4UJ0A 3KLEA 5BPNA 3CJCA 1VHXA 2XY8A 1J6ZA 3OYCA 4HWIA 4BGAA 3NH0A 1OKJA 2E8AA 1E4FT 3LZJA 3NF9A 4AAZA 1VK0A 1VQNN 4BR4A 4DHYA 2KBHA 3VQ4A 1T0ZA 3RR7A 3QO9A 3G25A 4JKGB 4FJXA 4CEFA 4KH5A 4KHNA 5AQNA 4BR9A 4DFJA 1YVUA 3F9MA 5HRSA 4CJLA 1Q18A 1TUYA 3VQ8A 5KGWA 2F7TA 4DLEA 3QERA 3ZSZA 4BG9A 2HW3A 3MXJA 1HMVA 2J4RA 2X74A 4RW6A 3U4LA 2LT8A 1QS4A 3U6FA 3VENA 4RW9A 4CD1A 1RT6A 4BROA 3MN5A 3O6WA 4JI4K 4ZTJA 3CCRN 1TKZA 4FJLA 3M1FA 2PAVA 3EY1A 3KZBA 3KLFA 4MFBA 3V81A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3CC2 N;  2G8K A;  3ZSR A;  2W42 A;  4Z94 A;  1U04 A;  4H5R A;  4HUF A;  1NMD A;  4JKH A;  4GNI A;  3WNH A;  3DXK B;  2ASP A;  3K9J A;  4PA1 A;  3U3Y A;  3K2P A;  4YOX A;  3CCJ N;  1ZYV A;  1LQQ A;  3VQP A;  1DEJ A;  4EIA A;  1L3S A;  1CXU A;  3M8Q A;  1NK6 A;  1HYZ A;  3J81 O;  4DTO A;  3F9K A;  4F2S A;  2YJE A;  3NF6 A;  4OGE A;  4BRE A;  3HO1 A;  1WLJ A;  1TGO A;  5JVH L;  5GIP A;  1KFS A;  5AZJ B;  4DV2 K;  2P5G A;  2VWB A;  1NK0 A;  1H1V A;  3SCX A;  4OLB A;  5AQM A;  2BAN A;  3UKU B;  4LF4 K;  4CEQ A;  2O8B A;  1HJO A;  4CJF A;  4ELT A;  3VF2 A;  3A5L C;  4Y0W A;  2OTL N;  3WXM B;  2F9W A;  3BZK A;  3RVC A;  3FGU A;  3HYF A;  2BTF A;  4M3T A;  4YOW A;  3QML A;  4O55 A;  1T6C A;  2ZWH A;  2LJ7 A;  2DY4 A;  1VSE A;  3P5J A;  4FM0 A;  3OVN A;  2ZM6 K;  5KTQ A;  2DFE A;  4OVL A;  4CCH A;  3C6T A;  5KGX A;  4YOU A;  2QKK A;  3RRH A;  4K8Z A;  1QVF M;  4Q0B A;  2P1J A;  3HOT A;  3T69 A;  4IO9 L;  1KVB A;  4CZL A;  3NH2 A;  3KWG A;  4AEI A;  1UAX A;  4YOR A;  4W5R A;  2E3F A;  2GL1 A;  2G2K A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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