4FSVA

Crystal structure of a heat shock 70kda protein 2 (hspa2) from homo sapiens at 1.80 a resolution
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
384
structure length
380
Chain Sequence
RGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a heat shock 70kDa protein 2 (HSPA2) from Homo sapiens at 1.80 A resolution
rcsb
molecule keywords Heat shock-related 70 kDa protein 2
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 120
structure length 380
sequence length 384
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-06-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4fsvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4fsvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4fsvA04
5TKYA 4FO0A 4DQ8A 1KAZA 2CH6A 3H46O 4BRLA 4WYBA 4DHYA 4FWQA 5BRDA 3DAWA 1KAYA 3C7NB 4XH1A 1BU6O 4K25A 3LDQA 3FFKB 1WUAA 1XQSC 1RGIA 4FWSA 5AQZA 2FSNA 5BPMA 1C0GA 1S3XA 1IG8A 1BUPA 4Y0WA 4BRMA 5E84A 3GOIA 3DXMB 3UKRA 5AQQA 4BRFA 4YDUA 2KHOA 1TUUA 1KXPA 1NBWA 2I7PA 3LDNA 3VEZA 4CZIA 4BC2A 3BF3A 4EHTA 4BRIA 3CJAA 3VEYA 3UB5A 2GELA 3VPZA 1V4TA 2A3ZA 3IMXA 1HX1A 1ZBSA 3O1BA 1J6ZA 2E1YA 2P9PB 3BP8A 3FGUA 2VCPA 2YJFA 2FSJA 1V4SA 2E2NA 3UKUB 2P9UB 3O5BA 2ASMA 4BGBA 5EXWA 1MWKA 1NWKA 4JD2B 2V7YA 5AQSA 3O6WA 4BR4A 4PKIA 4CZGA 3CJ1A 4MO5A 4CD1A 5FPNA 1U6ZA 3HZ6A 4CZLA 4BC3A 2E2OA 5AQJA 3EN9A 3M6GA 2FF6A 3VEVA 4PL8A 3LM9A 3IFRA 1QHAA 3H1VX 4CJ7A 4PL7A 4QS7A 4BRNA 2FSKA 4CZKA 1BG3A 4BR7A 2H3GX 2IVPA 4GY2B 3A5OC 5I9EB 4BVOA 3FZFA 2ASOA 4BQLA 3M1FA 4LC9B 4C23A 4H0OA 1QQOA 2CGLA 4BR5A 3GDQA 1T6CA 3JS6A 2HMPA 2YHWA 4IJNA 5F0XA 3VF6A 4FOIA 1MWMA 3MCPA 3L0QA 1MA9B 1Q18A 4H0YB 3CETA 3KVGA 5BR9A 2QXLA 3BUZB 3CJ9A 4BREA 1ATRA 3VESA 4O8KA 3H3OB 5E26A 3U4LA 3H45C 1BOTO 1GLCG 2D1KA 2I7NA 4PKHA 4QS9A 2ASPA 4B1WB 1LOTB 4BRDA 3VERA 3VOVA 5KPRA 3H1QA 2QWRA 4FWKA 4BRAA 1H1VA 1HJOA 2F9WA 2ZGYA 4H0VB 1BA1A 2GEMA 1JCEA 4CZFA 4FWPA 4B1ZA 1HKCA 3JXUA 4O5FA 5BRHA 2P9LA 4JAXA 5BREA 1CZAN 3A5NC 4BRKA 1Z6RA 3SK3A 3GG4A 1HKGA 5BN8A 5KPTA 1GLFO 3EKSA 1DKGD 4EAHD 1NGCA 3QFUA 3C0BA 1RDWX 4DCHA 2GWKA 2PAVA 1RFQA 3QMLA 2YHXA 1DGKN 3ZEUA 3LDOA 2BUPA 1U2VA 3A0IX 2Q36A 3WQUA 4IXCA 3IDHA 1Z05A 3UE5A 3FR0A 4QS8A 1SQKA 3U9DA 4BC5A 5BPNA 4NB4A 3QICA 5ADXA 4RCHA 4RWTA 4M7XA 3D2FA 4JN4A 3HI0A 4MLEA 2A40A 2AA4A 4K41A 1E4GT 3H6EA 4M7YA 2E88A 5F1XA 4KBOA 3FZKA 2QWQA 4ISFA 3ENHA 5AQYA 3VEOA 4XH4A 1G99A 3ATUA 4IWVA 5CE3A 3VGLA 1OKJA 2Q1NA 3TU5A 5AQMA 4BC4A 3RSEA 3ULEA 1HUXA 2FLOA 3CJ7A 4A61A 2E2QA 3GBTA 3O80A 2NLXA 1NMDA 5EVZA 2NRHA 4EFHA 2Q2RA 5AQHA 3SLCA 3EKUA 1K8KB 1S22A 3SMPA 2QW9A 1NGIA 2D0OA 5AFUH 2E20A 2IVOA 2UYTA 1QZ5A 4H03B 4WQ5C 5EOYA 1YUWA 1ATSA 3WUHA 4FL9A 2HOEA 3D7EO 3FE1A 3OHRA 2E8AA 1YAGA 5AR0A 3R6MA 4CBWA 2P9LB 4ISEA 3VENA 1GLEG 4FWOA 5AZIA 1D4XA 3ZETA 4BG8A 2P9NB 3F9MA 2FF3B 2ZWHA 3CQXA 3O08A 4A62A 4Z94A 4HTLA 5EY4A 1DEJA 2QWMA 2P9KA 5JLFA 2D0PA 1QQMA 1NGGA 3VEWA 3ZEUB 2D4WA 1TYQA 3VF2A 1KAXA 1X3NA 1GLLO 3MN7A 1U2VB 1YVNA 4WQ4A 1SAZA 5AQTA 3EZWA 1NLVA 4H5NA 2YJEA 3DWLA 5FPMA 1ZXOA 4BR9A 2Q97A 2P9IA 4E1JA 3J8AA 3BF1A 2GWJA 3O1WA 4FWNA 2F9TA 3L6QA 1SZ2A 3IUCA 4YDUC 3VGMA 3CIPA 2Q0RA 3D2FB 5EX5A 2J4RA 3UKRB 1HPMA 3LDLA 4XH5A 4AM7A 1NGBA 4H5RA 5LY3A 4CI6A 4BRPA 2ITMA 3FLCO 1ESVA 3LL3A 1NGEA 3TPQA 3RSEB 3ULEB 3DXMA 2QWOA 2E2PA 2QM1A 1JCFA 3CJBA 3GE1A 4B1VA 4B1UB 4FWRA 4NO7A 4XEIA 3B8AX 5ELZA 3EL2A 4BQZA 3EO3A 3MK6A 5AQRA 3QFPA 3LM2A 3VETA 2Q0UA 1EQYA 2VYPA 3LDPA 4H5VA 1BA0A 4K43A 2FXUA 3CI5A 1GLJO 2QWNA 5AZIB 1HKBA 4CZMA 4H0TB 4IO8A 2YCHA 3U9ZA 3ZX0A 1LCUA 3AAQA 5AQNA 3O8MA 1NGJA 3DXKA 2YHYA 4FWLA 5BPLA 4A2AA 2P9KB 4GNIA 5JICA 4HWIA 1BDGA 3AARA 1TYQB 4DB3A 4B1YB 5FPEA 5AZJA 2A42A 3CERA 3P4IA 2EWSA 5AQPA 2P9IB 2GTDA 3KHYA 3SJHA 1XUPO 3QBWA 5AQGA 2A6AA 1HLUA 1T44A 5JMVA 3HM8A 4CZEA 2NZTA 4BGAA 2V51B 2QWLA 1E4FT 3A5MC 4CZHA 3U8XA 3VF4A 2IVNA 4BRQA 1R59O 5KQDA 1BO5O 3W3DA 4L3QA 3G25A 4I6MA 4FWMA 3R9PA 3A5LC 1NM1A 1GLBG 1XC3A 1IJJA 3KZBA 2CGJA 1Y64A 4BRHA 1JCGA 5KQ8A 3CHWA 3DJCA 2V7ZA 5AQKA 5AQUA 3D2EA 3MN5A 5BN9A 4PKGA 1C0FA 5AQWA 4JHDA 2HF4A 4CZJA 2ZF5O 1X3MA 5BRFA 2BTFA 4IZ9A 3S41A 5KPZA 1YXQA 4J8FA 5AQIA 5FPDA 5AQXA 2P9SA 1T6DA 4FOEA 3HTVA 4B1XB 3AAPA 4FPAA 3A8YA 1ATNA 3ZX3A 1QZ6A 2VWBA 3WEEA 3CQYA 2W41A 3QDKA 1ZC6A 5AQVA 5ADXH 1MDUB 3VGKA 4MO4A 4EHUA 2DPNA 3I33A 3FZHA 2GUPA 3DXKB 4BRCA 3AY9A 4H0XB 1GLDG 2A5XA 4MLHA 3WXIA 3HSCA 3WQTA 3CJCA 4BROA 1NGAA 4ISGA 5AZJB 3ENOA 4AM6A 3H3NO 3WXKA 2ZGZA 3C7NA 2AP1A 3QBXA 3MMVA 3WXJA 2Q31A 2V52B 4CBUA 1NGFA 3L4IA 1P8ZA 2CH5A 2HF3A 4BG9A 5LJVA 1NGDA 4BR2A 3W0LA 4BR0A 2WUSA 3FZLA 1BWFO 4CBXA 2QWPA 5AQFA 1GLAG 5AQLA 4I6MB 1NGHA 4F9OA 4BVPA 3O4WA 4BRGA 4FSVA 3WXLA 3MN9A 3HBTA 4EIAA 4JNEA 4K42A 3D2EB 4JHDB 4A2BA 4CD3A 5JLHA 3ATVA 5LJWA 4M63C 4H5TA 1TUYA 5F2RA 4B9QA 1X9JA 3R8EA 3FZMA 3MDQA 4RTFD 2P9PA 3ID8A 2P9SB 3UKUA 3MN6A 3ZETB 2OANA 1K8KA 2P9UA 4H5WA 2PBDA 3M3ZA 5AQOA 2W40A 4FPBA 4H0PA 4WQ4C 3WEEB 4JD2A 1QQNA 2E1ZA 3SMSA 3BEXA 4IJAA 3GL1A 2CGKA 2IIRA 2YI1A 3QB0A 5B8HA 3WT0A 2A41A 4WQ5A 2P9NA 5AFUA 3ZX2A 1WOQA 3I8BA 3VEXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VTIA 4CHZA 4DQ8A 4Z0UA 2RE2A 3EZ5A 3S3OA 2O8EA 1HJRA 4CHQA 3LPTA 1WUAA 3WNGA 4DR3K 1UA0A 4LF9K 1FKOA 4OKJA 4EZ6A 1J9AA 3VTHA 2O4GA 5FROA 4E7JA 2KW4A 1VQ8N 4LY7A 4UJ0A 1NJYA 4N41A 5C12A 5J2PA 1TK5A 2VGMA 4AHRA 4XJXA 1ZVEA 4O5BA 4BRFA 3SAFA 3CXCM 2GL1A 3VEZA 4CZIA 4BC2A 4KKOA 3DYAA 2E3GA 3ZSXA 3CJAA 3QETA 2HHUA 3A2FA 1VSDA 3O1BA 1BI4A 2FSJA 2E2NA 3UKUB 5GIPA 3J7YP 2EX3A 4HE7A 1VSMA 5HL7L 2ASMA 3DOKA 4FVUA 1MWKA 2XHBA 2V7YA 3RWUA 3RRGA 3K0SA 3O6WA 4BR4A 4PKIA 4CF1A 3HZ6A 5EU7A 3T3FA 1ZFUA 3THWA 4PL8A 3LM9A 5DM6L 2E4LA 4QS7A 3V1QA 4FK0A 4CZKA 3SJJA 1D9DA 1IKYA 3AO5A 3I0SA 4GY2B 1BGXT 2MBKA 4JI2K 4LF6K 4M3XA 2P5OA 4W5NA 4FLZA 1HRHA 2CGLA 1WLJA 5D3GA 1K9MO 4E7HA 3RVCA 4IJNA 5F0XA 3AVIA 2RKIA 3L0QA 3CC4N 1Q18A 3K5LA 4CJTA 3SAGA 5BR9A 2QXLA 5JS2A 3U4LA 4CEBA 3P31A 1HR0K 3PO5A 1HMVA 3R2VA 4BDZA 3TABA 2W42A 5M1QA 3VOVA 3C6HA 3H1QA 2QWRA 4OGEA 3OYFA 2ZGYA 1JLEA 4B8CA 3DLHA 4DQPA 3OS2A 1RNHA 3QI7A 4PQUA 3K5NA 4KHSA 3KOZA 3BZKA 1OH6A 3A5NC 3SK3A 3GG4A 5BN8A 3HSTB 1IKXA 4FJNA 1DKGD 5CY0A 3OBWA 3PSIA 1KFSA 1RDWX 4A5AA 4RG8A 3VMFB 4JKAA 1XRSB 1Q86O 1TAQA 3ZEUA 1ITGA 3LDOA 1P0AA 3QERA 3WQUA 4AF1A 4CF9A 3LZIA 3QEPA 1Z05A 5K14A 1SL1A 2HBMA 3UE5A 4B8AB 4QS8A 1NU0A 1SQKA 2O8BB 2YIOA 4DU3A 5JVGL 2NRRA 4NB4A 2LY6A 4ELVA 1KLMA 3ZSWA 1TL1A 3MAQA 4M7XA 1K6YA 4JN4A 1Q9XA 1WSHA 4X65K 3F5TA 4IG0A 4FVMA 2WFBA 3PIOL 4K41A 1RT6A 4H8KA 4M7YA 1FK9A 3MEDA 1VRTA 4F3OA 4NCGA 1JXEA 4ISFA 2YILA 3DRRA 1O13A 4XH4A 4M3YA 1G99A 3HPOA 3ATUA 4IWVA 3VGLA 1HNIA 4DTMA 2SN3A 3RSEA 2ZQBA 1HUXA 3JYTA 4PWDA 4RW6A 2E2QA 3GBTA 4DQQA 5EVZA 3SUNA 2OZSA 3AGKA 4U67L 3SMPA 3EKUA 3J80O 3KP1A 5EOYA 4O55A 2E8AA 1WT7A 3LAMA 1Q82O 4E0DA 3OYNA 1RT7A 2YHAA 3TSPA 1XMOK 1FXXA 4ISEA 1IKVA 3TAMA 3VENA 1ZU3A 3F9MA 3SUOA 3CD6N 4Z94A 4O44A 2QWMA 3TAPA 3QIOA 1NGGA 2HNDA 1TYQA 1NK7A 3VQDA 3PSFA 1KAXA 1ZUTA 3MN7A 1SKRA 4WQ4A 3PX0A 4CF0A 3GKUA 1NLVA 2GX9A 3DWLA 4BR9A 4E1JA 1KSPA 4OKEA 1I2VA 1VSEA 3J8AA 4FM1A 3KOYA 4FWNA 1I94K 1SZ2A 3AO3A 5CHIA 4LD0A 5KI6A 4BE0A 1U45A 5EX5A 5LMUK 3NAEA 2KFNA 4ZHRA 5CYMA 3T7ZA 4XH5A 5C0YA 4H5RA 4CI6A 1SN1A 3CMAN 1J54A 3FLCO 1SNBA 1ESVA 3LL3A 4E3SA 4ILJA 1NGEA 4FYDA 3TPQA 3C94A 3ULEB 1EX4A 1T8EA 2G8WA 3L3UA 3GE1A 1DT9A 3KK7A 2KBHA 4I7FA 3EO3A 3AVLA 4JYAK 3MK6A 5AQRA 3QFPA 1D9FA 4ELTA 2Q0UA 4CJLA 1EQYA 2VYPA 2YNHA 3LDPA 4H5VA 4YOUA 1ZYVA 1EKEA 3E66A 4K43A 2FXUA 3KK2A 1NRAA 4CJRA 3KC6A 2YNIA 3NFAA 4H0TB 2YCHA 1UOCA 1GOBA 1YVUA 4FJJA 3EE8A 5AQNA 1B9DA 1JZBA 3QIPA 4FWLA 4A2AA 4GNIA 4G1QA 3ZT4A 1JXCA 3AARA 2LJ7A 1BK8A 5AZJA 3L2RA 4JS4A 3P4IA 3SI6A 4OPHA 2XY5A 3KHYA 1XUPO 2VG7A 1L3TA 1HLUA 3P1GA 4A59A 4C8NA 1YJ9N 3ZSZA 4CZEA 2IAJA 3T1YK 2V51B 5SWMA 1ZBLA 3U8XA 4J2DA 1NK9A 1X9SA 4I6MA 4FWMA 4EZ9A 1GLBG 3KZBA 2CGJA 2K35A 4BRHA 3MXIA 1SS6A 4IO9L 5KQ8A 1X9MA 3DLBA 4BWJA 2ZJQL 2VQFK 1S72N 3SPZA 4FJ7A 5AQKA 4B3MK 4M3UA 1C0FA 4C8OA 2ZF5O 5BRFA 1VQ7N 1QHTA 3G0ZA 3S41A 2Z1HA 3TARA 1DJTA 2E6MA 4GKJK 4BE2A 5IT9O 2P9SA 2F7TA 1P90A 4FOEA 4A5BA 3CCSN 3AAPA 1JKZA 3A8YA 2YNGA 3ZX3A 3VQCA 3K57A 2F4VK 5AQVA 4ILGB 4DR2K 4CHOA 2KKZA 2MZ0A 4MO4A 2OPQA 2MN5A 4WFNL 4BRCA 4JKGB 4M41A 4NYNA 4DV4K 3WXIA 4FM2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VTI A;  4CHZ A;  4DQ8 A;  4Z0U A;  2RE2 A;  3EZ5 A;  3S3O A;  2O8E A;  1HJR A;  4CHQ A;  3LPT A;  1WUA A;  3WNG A;  4DR3 K;  1UA0 A;  4LF9 K;  1FKO A;  4OKJ A;  4EZ6 A;  1J9A A;  3VTH A;  2O4G A;  5FRO A;  4E7J A;  2KW4 A;  1VQ8 N;  4LY7 A;  4UJ0 A;  1NJY A;  4N41 A;  5C12 A;  5J2P A;  1TK5 A;  2VGM A;  4AHR A;  4XJX A;  1ZVE A;  4O5B A;  4BRF A;  3SAF A;  3CXC M;  2GL1 A;  3VEZ A;  4CZI A;  4BC2 A;  4KKO A;  3DYA A;  2E3G A;  3ZSX A;  3CJA A;  3QET A;  2HHU A;  3A2F A;  1VSD A;  3O1B A;  1BI4 A;  2FSJ A;  2E2N A;  3UKU B;  5GIP A;  3J7Y P;  2EX3 A;  4HE7 A;  1VSM A;  5HL7 L;  2ASM A;  3DOK A;  4FVU A;  1MWK A;  2XHB A;  2V7Y A;  3RWU A;  3RRG A;  3K0S A;  3O6W A;  4BR4 A;  4PKI A;  4CF1 A;  3HZ6 A;  5EU7 A;  3T3F A;  1ZFU A;  3THW A;  4PL8 A;  3LM9 A;  5DM6 L;  2E4L A;  4QS7 A;  3V1Q A;  4FK0 A;  4CZK A;  3SJJ A;  1D9D A;  1IKY A;  3AO5 A;  3I0S A;  4GY2 B;  1BGX T;  2MBK A;  4JI2 K;  4LF6 K;  4M3X A;  2P5O A;  4W5N A;  4FLZ A;  1HRH A;  2CGL A;  1WLJ A;  5D3G A;  1K9M O;  4E7H A;  3RVC A; 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