4H5TA

Hsc70 nbd with adp and mg
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title New crystal structures of HSC-70 ATP binding domain confirm the role of individual binding pockets and suggest a new method of inhibition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
total genus 117
structure length 382
sequence length 382
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4h5tA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5tA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5tA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h5tA04
5BPMA 2V7YA 3DXKB 3S41A 4BC5A 4CD3A 3UKRA 3UKRB 2QXLA 3MDQA 4H0VB 4K41A 4DQ8A 1C0FA 3OHRA 4JHDB 2GTDA 4CBXA 4BR4A 3I8BA 4K25A 3EZWA 1YXQA 4HTLA 1E4GT 5BREA 1ZC6A 4GNIA 3IUCA 1BDGA 1NGEA 2P9NB 3CQYA 1BOTO 1IG8A 1X3NA 2A6AA 5FPEA 4IJNA 2GEMA 3ZEUB 4CZKA 5LY3A 4C23A 2ZGYA 1U2VA 1HUXA 2J4RA 3KVGA 3ZX3A 2ASOA 3D2FA 1MWMA 4B1YB 1ZXOA 4IZ9A 3A8YA 4J8FA 1WUAA 1ATNA 1NGIA 4BRIA 1U6ZA 4FPAA 3QBXA 3SJHA 2E8AA 3H1QA 1K8KA 3GE1A 3H46O 4FWMA 2Q31A 4H03B 3SMSA 1C0GA 1T44A 3MN5A 2FSKA 5AQKA 1QQMA 5JLFA 4XH5A 2P9IB 4GY2B 2FSJA 1DGKN 5TKYA 3CJAA 3DAWA 3LM9A 4PKHA 2CH6A 2GELA 4L3QA 2HMPA 5AQGA 4B1UB 3WT0A 2QM1A 4MO4A 5BN9A 3W3DA 2P9SA 4MO5A 3O08A 4CI6A 4FWLA 3MN6A 2WUSA 2Q36A 2ASMA 4MLEA 1NLVA 3IFRA 4M63C 4FWOA 5EOYA 4JN4A 2QWPA 4I6MA 3ID8A 3A0IX 4RTFD 5E26A 2P9KA 5AQMA 4B1WB 1X3MA 5F2RA 1KAZA 2ZF5O 4BROA 1WOQA 2A42A 4B1ZA 5KQ8A 5FPNA 3KHYA 2Q0UA 4XH1A 1Q18A 1JCGA 3VF6A 4EHTA 3VEZA 3I33A 3HI0A 4ISGA 4BRNA 3ENOA 3ZETB 4XEIA 3WXJA 1GLJO 2P9PB 5AQZA 1T6DA 4CZFA 4BRPA 3VEOA 2I7NA 3TPQA 1GLFO 1YVNA 3CJ9A 3QDKA 5AQTA 4BRQA 1H1VA 3FE1A 5AZJB 1HX1A 3DXMB 4FWNA 3EKSA 4BRAA 1BWFO 3LDQA 4BGBA 4BR2A 3VERA 5AZIB 5AQFA 1HKCA 2YHXA 3KZBA 3P4IA 2P9UB 2FLOA 2P9LA 1NGAA 2VWBA 4BRDA 4BQLA 5JICA 1NGGA 4H5NA 3AAQA 4RCHA 1LCUA 1MDUB 3FZFA 2E2QA 5JLHA 1NGJA 3VEYA 3EKUA 3H3NO 3LDPA 3A5NC 2CGJA 3IDHA 2FF6A 2QWNA 5BPLA 4BC2A 3ULEA 3SK3A 1JCEA 3ULEB 3FZMA 2I7PA 5FPDA 1GLLO 3W0LA 3CQXA 4JAXA 4PKGA 4WQ5C 2A40A 3EO3A 4WYBA 1MA9B 4BRCA 3DWLA 4PL7A 3ZX2A 3LDOA 3HM8A 2FF3B 4WQ5A 4KBOA 4JD2A 3J8AA 1E4FT 2E2PA 4BG9A 1J6ZA 1GLDG 2NLXA 4CZMA 3WEEA 4ISEA 5AQLA 3U9DA 1U2VB 1R59O 2ZGZA 2BUPA 4B1VA 3MK6A 3H1VX 3VGKA 1SQKA 5EY4A 3D2FB 3D7EO 4Y0WA 3B8AX 2GUPA 4PKIA 1NM1A 2EWSA 3GDQA 2ASPA 5EX5A 4EIAA 5AFUH 2W40A 4ISFA 3VESA 3O5BA 2CH5A 4EHUA 2PAVA 4BREA 1K8KB 4YDUC 1QZ6A 2AP1A 3ATUA 5KQDA 3R8EA 4K43A 2ZWHA 5JMVA 4YDUA 4FWKA 2HOEA 4CZHA 5AQHA 4IO8A 3H3OB 4BRMA 2YHYA 2PBDA 1ATRA 5AQVA 3ZX0A 4H5RA 1GLAG 5F0XA 3G25A 2VYPA 1TUUA 3O4WA 2QWOA 4LC9B 3WQTA 1SAZA 2P9SB 1NMDA 1P8ZA 2OANA 2IIRA 3U4LA 2CGLA 2H3GX 2HF3A 5AQNA 1Y64A 3GG4A 2VCPA 3JXUA 3O1WA 5FPMA 1BU6O 3MN7A 5KPZA 4O5FA 5LJVA 3EL2A 3DJCA 4I6MB 4FSVA 2YHWA 3UB5A 2IVOA 2P9KB 5I9EB 2V7ZA 2D0PA 4XH4A 3O80A 1D4XA 4F9OA 5CE3A 1HJOA 5AQXA 1HPMA 3AAPA 4BR0A 4QS7A 3RSEA 3O6WA 3VENA 2UYTA 2ITMA 1BUPA 3H45C 3QBWA 4H0XB 1BG3A 4DHYA 3CJ1A 3VEWA 1QQNA 2QWRA 5BRDA 5KPRA 3CJBA 3LDLA 3VOVA 5EXWA 4AM6A 5B8HA 4BG8A 4BC3A 1NGHA 3D2EA 4MLHA 3R6MA 1GLCG 4BR7A 3LM2A 1RGIA 4JNEA 3CIPA 4EFHA 1OKJA 4QS9A 2E2OA 1IJJA 3L0QA 3UE5A 4DCHA 4BRLA 3U8XA 2Q0RA 2E2NA 4BRHA 1RDWX 4CZLA 1G99A 1S22A 1NGCA 1ATSA 4A2AA 2BTFA 3L6QA 1HLUA 4M7XA 1GLEG 4CBUA 4CZIA 2Q2RA 2P9LB 2IVNA 1TUYA 5AQWA 3MMVA 1QQOA 2YCHA 1QZ5A 3EN9A 3H6EA 3CI5A 3C0BA 3UKUA 3UKUB 5AQPA 5BPNA 1EQYA 4WQ4C 2GWKA 3VGLA 1Z6RA 2YJEA 3GBTA 4H0PA 3HZ6A 4B1XB 4BRKA 1GLBG 4JD2B 4BQZA 4PL8A 4H5TA 4FOEA 3SMPA 3U9ZA 2E88A 3WEEB 3BUZB 3DXKA 1TYQA 1TYQB 1DEJA 3HSCA 3WQUA 5KPTA 1SZ2A 3O1BA 3WXLA 4A61A 3A5MC 3WXIA 3BF3A 4HWIA 4JHDA 1V4SA 2YJFA 3GL1A 1DKGD 5AQIA 3TU5A 1BA0A 2F9WA 1X9JA 3CJ7A 2FXUA 1YUWA 2P9NA 5AQUA 4BR9A 3ZEUA 2YI1A 4IXCA 3VEXA 1T6CA 3CERA 4BC4A 2D4WA 2QW9A 3R9PA 1Z05A 3A5LC 5LJWA 1RFQA 2DPNA 4FL9A 5AQQA 3M6GA 4CZGA 3BF1A 4FWQA 4DB3A 2E1YA 3LDNA 2A41A 2Q1NA 3BP8A 3A5OC 3MCPA 1CZAN 5ADXA 4FWSA 3FGUA 4IWVA 1HKBA 3VGMA 3QB0A 3VF4A 5E84A 5AQRA 4M7YA 1NWKA 3VPZA 3HTVA 3FZHA 4H0OA 3QMLA 4BRFA 4NO7A 4CD1A 1BA1A 2P9IA 4FWRA 2CGKA 3M3ZA 4NB4A 3WXKA 1JCFA 1KAYA 4H5WA 3CETA 3ENHA 2A5XA 3WUHA 4Z94A 1KAXA 1KXPA 3ATVA 3AY9A 5F1XA 4H5VA 1V4TA 3RSEB 5BN8A 4O8KA 4H0TB 2V51B 1ZBSA 4A62A 2E20A 1XQSC 4E1JA 3L4IA 3F9MA 3CHWA 4BRGA 2GWJA 1MWKA 4AM7A 1NGFA 3QICA 3M1FA 2KHOA 1QHAA 1HKGA 2FSNA 1XUPO 2D1KA 5BRHA 5ELZA 2Q97A 3D2EB 1LOTB 2W41A 4BVPA 4FO0A 4RWTA 5AQYA 3IMXA 3SLCA 3FZLA 4QS8A 4EAHD 4BGAA 3VETA 2D0OA 2HF4A 5BR9A 2NZTA 4CZEA 5AQSA 3C7NA 5AQJA 3C7NB 3O8MA 3VEVA 2QWQA 5ADXH 1S3XA 3ZETA 2E1ZA 2QWLA 5BRFA 4CJ7A 4CZJA 2P9PA 1ESVA 3BEXA 3CJCA 3FLCO 4IJAA 4H0YB 3AARA 4BVOA 3FFKB 5AQOA 3QFPA 1BO5O 5AR0A 5AFUA 4K42A 4BR5A 5AZJA 2A3ZA 3DXMA 4FOIA 2NRHA 4CBWA 5EVZA 1NGBA 1XC3A 2IVPA 5AZIA 3HBTA 3FZKA 2F9TA 2AA4A 3JS6A 3LL3A 1NBWA 4A2BA 1YAGA 2P9UA 4WQ4A 3GOIA 3QFUA 3MN9A 4FWPA 2QWMA 2V52B 1NGDA 4FPBA 4B9QA 3VF2A 3FR0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DXKB 3OYIA 3E7RL 2K35A 3AO1A 4JKFA 3S41A 3V6DA 3UKRA 1UAXA 3LP0A 4JHDB 4JI4K 4OPAA 2KFZA 4GMJB 1OMYA 1GOBA 3KOXA 4C8MA 1YT3A 3PV8A 1JJ2M 4HTLA 4FPAA 4I9LA 1BOTO 5LY3A 2HBMA 2ZGYA 1A5WA 4DS4A 4V1DC 4B9TA 1AHOA 4JKGB 3SQ1A 5CYQA 2KLAA 1YI2N 5GINA 1T3VA 2B6AA 4Y1CA 4DFJA 3DRRA 1WUAA 4DV7K 1ATNA 5JVGL 3K9KA 2X6SA 3QBXA 2BH1A 3SJHA 3ZT2A 3H1QA 3HYFA 3GE1A 4CJTA 1WBDA 4H03B 3SMSA 4N5SA 3MN5A 4BWJA 3ZSVA 4CEEA 3OW2M 4DTUA 2AJQA 5JLFA 1BK8A 3CYMA 2P9IB 3AVIA 4JI2K 5HP1A 1Q82O 4MDBA 1QSSA 2VWJA 4J2DA 1DGKN 2NRRA 5TKYA 3CJAA 3DAWA 4PKHA 4ZTJA 1S6PA 4B08A 2GELA 1U47A 2O8FB 3PSMA 2VG7A 4JV5K 1PE4A 2YILA 1NKCA 4B1UB 2QKKA 3QERA 2D0BA 2OA8A 1VSKA 1J54A 4FM2A 4JKCA 4LH4A 4MO5A 2X74A 1JZAA 1LQIA 4CI6A 4FWLA 3LP3A 1KVCA 2ASMA 1NLVA 4OPHA 1NJIO 3TSUA 4JN4A 3ID8A 3JSMA 2O4GA 4B1WB 3AA3A 2ZF5O 1VQON 4PQUA 3RR8A 3CCVN 3PO5A 5FRMA 3L2QA 1CZBA 5KQ8A 3KHYA 4GVMA 2Q0UA 1KQSM 1G15A 3NVMA 1QHTA 2HSTA 3OBYA 3RRGA 3RVCA 1VSIA 2NNWA 1C0UA 3ZT4A 1Q8IA 3ENOA 4BRNA 1TVRA 2E5LK 5AQZA 1T6DA 4CZFA 4OLAA 3CC2N 1NK6A 2I7NA 1YVNA 1H1VA 1DTTA 5AZJB 3NVKA 4AAZA 1HNZK 4OGEA 3KLEA 4OVLA 4BGBA 4BR2A 2FBVA 2LKBA 4WFAL 5C15A 2YHXA 3P4IA 5D3GA 2P9UB 2FLOA 3ZT3A 1L3UA 1NGAA 1C0MA 1HNXK 3NH1A 3UIQA 4RCHA 1JLFA 1MDUB 2E2QA 3R3LA 4PA1A 3MECA 5JLHA 1A5XA 2RHKA 3AGRA 3LDPA 2LY5A 3IDHA 2FF6A 5BPLA 1RT1A 3CCUN 3C6AA 3W0LA 1S1XA 3CQXA 4B9SA 3HOTA 3QEPA 1QS4A 1WBBA 3QETA 4ZHRA 4PL7A 3THYA 3O9RA 3LAKA 1BMRA 2YHAA 1M90O 2W00A 4O44A 3O3HA 1XHZA 3OS0A 4M3TA 4UAFE 1B7DA 1J6ZA 1GLDG 2NLXA 1OH7A 4CZMA 3WEEA 3PIOL 1C1AA 4IOXA 5FROA 4W5OA 1U2VB 3O9TA 4CEBA 1WMTA 1JLAA 4NYNA 2P51A 1SQKA 3ZT0A 4CJFA 4E72A 3D7EO 4Y0WA 2YBRC 4CJQA 5FDLA 1NM1A 4FM0A 3A2FA 3GDQA 2ASPA 5EX5A 1Q7YO 3VESA 2CH5A 3KKRA 4RW6A 4EHUA 3AVHA 3OYJA 1NG9A 4Z4GA 1SKRA 4K43A 2IC3A 4HE7A 1RT3A 4JS4A 5HRRA 1X1PA 5JMVA 1EP4A 3MXJA 4CF8A 2GL1A 3F2KA 3CPWM 1OH6A 3H3OB 4BE7B 4BRMA 4HVJA 4AHSA 5AQVA 3ZX0A 3LP1A 3BK3C 3G25A 4CHYA 2IIRA 1P8ZA 2OANA 4AEIA 1RBUA 3KC6A 2H3GX 1K9MO 1Y64A 4DQPA 4JI6K 2B68A 2WOMA 1BU6O 4I6MB 4Z4HA 2G8KA 4Z4EA 3MCAB 1RCHA 3MX5A 2IVOA 1TI5A 2V7ZA 3SI6A 3AVLA 3NBPA 4BDYA 1S5JA 3AAPA 4O4GA 3RSEA 1Q86O 3O6WA 4OPJA 3H45C 1T7EA 4NLBA 3CJ1A 3SQ4A 1QQNA 1ITGA 2NRVA 1ZFUA 5BRDA 5KPRA 3CJBA 3LDLA 1GPSA 4NXMK 3SPYA 1YJNN 5CYMA 1C55A 4BG8A 3THXB 5LL6Z 4Q5VA 4BR7A 1GLCG 1K8BA 2KJAA 4KH5A 3N4QA 4KHUA 3K58A 3L0QA 3O9SA 3UE5A 1L3SA 1RNHA 4DCHA 4BRLA 4KV8A 4YORA 2RPIA 1G99A 1NGCA 1K73O 4ILJA 4B8AB 4DSFA 4JI3K 5DMRA 2P9LB 4CF2A 4NLCA 1J5EK 4IOAL 1VSJA 1REVA 3PY8A 1S1UA 1A5VA 2O8CA 3MMVA 1QQOA 3CI5A 1EQYA 4OKKA 3DLHA 3TABA 1YTAA 4WFBL 3VQBA 5DM7L 2YJEA 1RT2A 4JK9A 3HZ6A 1JXEA 1ZBUA 3D6RA 1GLBG 4JD2B 3HT3A 1L3TA 3H08A 2ZJPL 2E88A 3HXMA 3BUZB 1J9AA 1TYQB 3DMJA 3ITHA 2LI7A 4A61A 4JI1K 3A5MC 3BF3A 3LANA 4HWIA 2OPQA 1UOCA 3TU5A 3S3MA 1BA0A 3AO2A 3HP9A 4IXCA 3VEXA 4CJVA 3CERA 4DMNA 3KP0A 2QW9A 2D4WA 3C6TA 3R9PA 4M3WA 3A5LC 1D9DA 2EX3A 3BZKA 3HVRA 4IBNA 3VQ9A 1RDCA 2DPNA 3OYEA 2A1SA 3SF4D 4W5NA 4DF4A 2YV0X 3LDNA 4CGFA 4J2EA 5KGWA 5ADXA 4FWSA 3FGUA 3OYAA 4DR2K 2IS3A 4FJHA 2O8BB 4DQQA 3OTOK 3S3OA 1NWKA 2X78A 2G8VA 4JKBA 4CJWA 4E7KA 4E89A 1BI4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3DXK B;  3OYI A;  3E7R L;  2K35 A;  3AO1 A;  4JKF A;  3S41 A;  3V6D A;  3UKR A;  1UAX A;  3LP0 A;  4JHD B;  4JI4 K;  4OPA A;  2KFZ A;  4GMJ B;  1OMY A;  1GOB A;  3KOX A;  4C8M A;  1YT3 A;  3PV8 A;  1JJ2 M;  4HTL A;  4FPA A;  4I9L A;  1BOT O;  5LY3 A;  2HBM A;  2ZGY A;  1A5W A;  4DS4 A;  4V1D C;  4B9T A;  1AHO A;  4JKG B;  3SQ1 A;  5CYQ A;  2KLA A;  1YI2 N;  5GIN A;  1T3V A;  2B6A A;  4Y1C A;  4DFJ A;  3DRR A;  1WUA A;  4DV7 K;  1ATN A;  5JVG L;  3K9K A;  2X6S A;  3QBX A;  2BH1 A;  3SJH A;  3ZT2 A;  3H1Q A;  3HYF A;  3GE1 A;  4CJT A;  1WBD A;  4H03 B;  3SMS A;  4N5S A;  3MN5 A;  4BWJ A;  3ZSV A;  4CEE A;  3OW2 M;  4DTU A;  2AJQ A;  5JLF A;  1BK8 A;  3CYM A;  2P9I B;  3AVI A;  4JI2 K;  5HP1 A;  1Q82 O;  4MDB A;  1QSS A;  2VWJ A;  4J2D A;  1DGK N;  2NRR A;  5TKY A;  3CJA A;  3DAW A;  4PKH A;  4ZTJ A;  1S6P A;  4B08 A;  2GEL A;  1U47 A;  2O8F B;  3PSM A;  2VG7 A;  4JV5 K;  1PE4 A;  2YIL A;  1NKC A;  4B1U B;  2QKK A;  3QER A;  2D0B A;  2OA8 A;  1VSK A;  1J54 A;  4FM2 A;  4JKC A;  4LH4 A;  4MO5 A; 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