4H5WA

Hsc70 nbd with betaine
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
382
structure length
382
Chain Sequence
KGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title New crystal structures of HSC-70 ATP binding domain confirm the role of individual binding pockets and suggest a new method of inhibition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
total genus 124
structure length 382
sequence length 382
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-09-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4h5wA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5wA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4h5wA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4h5wA04
1GLDG 2AP1A 1NGCA 1ATSA 4WQ5A 4QS8A 4BC5A 4BC3A 4IZ9A 1R59O 2YI1A 3FZLA 4CZEA 3J8AA 4BRDA 3ID8A 5BRDA 2FLOA 2PBDA 5AQQA 1TYQB 4ISFA 3H1QA 1ESVA 1P8ZA 1NGGA 3VGLA 2IVNA 2A6AA 3CQYA 4MO5A 4BR4A 2P9UA 5AQKA 1OKJA 3VEYA 4CZHA 3HZ6A 3KVGA 4XH4A 4JHDA 2A40A 5EX5A 3D2EA 2YJFA 3DXMA 4K42A 3GE1A 4K43A 3AAQA 4BC4A 5KQDA 2P9SA 3CI5A 1WUAA 3WEEB 3WUHA 2A41A 2A3ZA 3WQUA 4M7XA 4BR7A 5BRFA 4HTLA 3RSEB 2CGKA 2P9LA 3LDPA 4NB4A 4A2BA 4BRPA 1XC3A 2ZF5O 5EVZA 2QWOA 5BN8A 2I7PA 4JAXA 1BA0A 4CZGA 3GL1A 2CGJA 4IJNA 4CD1A 1NGHA 4QS7A 5EOYA 3VENA 2FSNA 4BGBA 4AM7A 3ATUA 3MN5A 2QXLA 3IUCA 2GWKA 3EL2A 3M1FA 1K8KB 4DHYA 3R8EA 3UKRB 3KZBA 3EN9A 3EZWA 2Q1NA 3UB5A 2P9PA 3I33A 2GEMA 5EY4A 2ZGZA 3CETA 4MLEA 2DPNA 3MN9A 1SQKA 2Q0UA 3SMSA 4CJ7A 4H0XB 3O08A 3L6QA 3C7NA 3KHYA 4PKGA 1H1VA 2HF3A 2IVPA 5BPNA 1X3NA 2ZWHA 3VGKA 4CBWA 1HKBA 3D2FB 2P9KB 3VPZA 3ZX3A 4E1JA 4BRCA 4BG8A 3ENHA 1QHAA 5CE3A 3H1VX 4FWQA 1YXQA 4FWNA 4BR5A 2Q0RA 5TKYA 1SAZA 2YJEA 3HSCA 2GWJA 3FE1A 2E20A 3C0BA 2FF3B 3QDKA 4F9OA 3MN6A 3QMLA 3L4IA 3ENOA 3VERA 3VETA 3H3NO 3SJHA 4H0PA 4FPBA 3WXLA 3G25A 4PKHA 3GBTA 4H5WA 4WQ5C 5BPMA 3UE5A 1NGIA 2KHOA 4BROA 4BRKA 4B9QA 4IO8A 5AQYA 2QM1A 2VCPA 1ATRA 2Q97A 1QZ6A 1NGEA 3W0LA 1MWKA 2P9IA 1IJJA 5BN9A 3QBXA 4BC2A 1BG3A 4GNIA 3DXKA 2AA4A 3FFKB 3TPQA 3LDQA 3CQXA 3TU5A 2A42A 1QQOA 4FSVA 3AARA 1RDWX 2ASPA 1HKGA 4BRAA 4FWKA 1HLUA 2YCHA 2YHWA 2E88A 3RSEA 2I7NA 3AAPA 3BUZB 4RWTA 2ASMA 3W3DA 4H0YB 1DGKN 1X3MA 3U8XA 1GLEG 2D1KA 5F2RA 5AQOA 3A5LC 3VF2A 2E1ZA 4BRMA 2YHYA 3O1WA 5AQJA 5AR0A 4K25A 4WQ4A 4BQLA 5AQHA 3WXKA 1NWKA 1E4FT 3QFPA 3R9PA 3ZETB 5AQWA 1LOTB 2V7YA 3A5NC 5AQXA 3CJ9A 3ZX0A 1U2VB 1ZXOA 3H45C 2CGLA 3GOIA 4XH1A 5FPDA 4A61A 3ZEUB 1MDUB 3A0IX 4BR0A 1CZAN 5BR9A 2GELA 2QWMA 3LDOA 3O1BA 1D4XA 1ZC6A 1YVNA 3BP8A 4BRLA 4EAHD 3F9MA 3MK6A 5AZIB 4CZIA 2V51B 4EHTA 3LDNA 1T44A 4XH5A 3WXIA 4RCHA 3ULEB 1NGDA 1C0FA 1XQSC 5KPTA 4GY2B 1JCFA 2HF4A 2NRHA 2V52B 3BEXA 4I6MB 5AQFA 5B8HA 1YAGA 2QW9A 4EHUA 3IDHA 3MCPA 3UKUB 4FWLA 4A62A 4WYBA 1Q18A 1NBWA 3VEOA 4BGAA 2W41A 1BDGA 1MWMA 2ASOA 3B8AX 4FWPA 3ZX2A 3CHWA 1S22A 2BTFA 4H0VB 4DB3A 1EQYA 4H0TB 2F9WA 1G99A 1C0GA 3U9DA 1WOQA 4H5RA 2WUSA 4RTFD 4B1UB 3QB0A 5AQIA 4PL8A 4JD2B 4CD3A 2E2OA 1T6CA 4H0OA 3O8MA 5ELZA 5AQGA 3DJCA 4Y0WA 4BQZA 1KAXA 3HI0A 5AQRA 2Q2RA 1TUUA 3EO3A 3O80A 5AQUA 3L0QA 5FPEA 4B1ZA 5ADXH 1V4SA 5JLFA 3CJ1A 5AFUH 2P9UB 2FXUA 3QFUA 2QWRA 2ZGYA 4YDUC 1DKGD 1QQNA 4BRFA 4LC9B 4JHDB 4BRNA 2UYTA 3JS6A 1QZ5A 3DXMB 3FZFA 3HTVA 4FWSA 3ATVA 3IFRA 3SLCA 4BG9A 2E2PA 3LL3A 5AZJB 2P9SB 2A5XA 4KBOA 1TYQA 5ADXA 2IIRA 3P4IA 5AFUA 4CBXA 3FGUA 3VF6A 4MLHA 4EFHA 1HUXA 2P9LB 1U2VA 2V7ZA 2BUPA 3O6WA 4BREA 1GLLO 2NZTA 3U4LA 3SK3A 3ZEUA 3O5BA 3H6EA 3LDLA 4FOEA 3QBWA 4BRGA 5AQVA 1GLJO 3DWLA 5FPMA 1X9JA 3AY9A 1V4TA 1KAZA 3WEEA 3LM2A 3S41A 5BPLA 2P9NB 4K41A 5LJWA 5AZIA 2OANA 4AM6A 1YUWA 5LY3A 2QWLA 1NMDA 1Y64A 2CH5A 1GLFO 4ISEA 2GTDA 4FWMA 4FPAA 3ULEA 1HKCA 3MMVA 3FZKA 3WQTA 3H46O 4M7YA 3FZMA 4I6MA 4NO7A 1Z05A 4BRIA 2E1YA 1K8KA 1SZ2A 3UKRA 4XEIA 3CJCA 3CJBA 4FOIA 1Z6RA 4EIAA 3HM8A 5E26A 2FF6A 3JXUA 5FPNA 1GLAG 3VGMA 4CZMA 4CZLA 4Z94A 4PL7A 4C23A 2E8AA 3A8YA 5F1XA 3QICA 4JN4A 1IG8A 5AQPA 2HMPA 4FO0A 4IWVA 1RGIA 4BRHA 5AQTA 2IVOA 4BR2A 5AQZA 3BF3A 4JD2A 3VEWA 2PAVA 4IXCA 4H5NA 1HPMA 3A5MC 2P9KA 3D2FA 1DEJA 1S3XA 2EWSA 4H5VA 3CERA 1NGAA 1HJOA 4PKIA 3VF4A 1E4GT 5AQSA 3WT0A 5KPZA 3R6MA 2F9TA 2ITMA 1T6DA 3VEZA 1GLCG 4B1XB 2P9IB 2D0PA 5JICA 3U9ZA 3VEVA 1MA9B 3DXKB 5AZJA 5KQ8A 4J8FA 2QWNA 1J6ZA 3A5OC 1LCUA 2HOEA 4O5FA 3VEXA 1KAYA 2FSJA 3MDQA 1BWFO 4A2AA 3CIPA 3M3ZA 3EKUA 4FL9A 1ZBSA 2H3GX 4BVPA 3O4WA 4FWRA 4CZFA 2Q36A 5LJVA 4O8KA 3VESA 4CZJA 5F0XA 4JNEA 5AQMA 5BREA 5JLHA 1HX1A 2QWPA 5KPRA 4BRQA 2P9NA 3HBTA 3WXJA 5BRHA 3SMPA 4IJAA 1KXPA 4CBUA 3EKSA 2GUPA 3FLCO 1BU6O 2VYPA 1U6ZA 3D2EB 4CI6A 2E2QA 2E2NA 4DCHA 4HWIA 3GDQA 3ZETA 1JCEA 1NGFA 3GG4A 2D4WA 5AQLA 3FZHA 4CZKA 3M6GA 1TUYA 3LM9A 5AQNA 2FSKA 3MN7A 4H03B 4WQ4C 3BF1A 3D7EO 1NLVA 4M63C 1NM1A 4ISGA 1QQMA 4DQ8A 3IMXA 4B1WB 4BR9A 1BUPA 1BA1A 2YHXA 2P9PB 3FR0A 2NLXA 4QS9A 2Q31A 3C7NB 1BO5O 1RFQA 2VWBA 4B1VA 4BVOA 3I8BA 1GLBG 1XUPO 4B1YB 3H3OB 4YDUA 1NGBA 2D0OA 4H5TA 3CJAA 1ATNA 5EXWA 5I9EB 5E84A 1BOTO 3OHRA 4L3QA 1JCGA 2QWQA 2W40A 1NGJA 4MO4A 4FWOA 3UKUA 3DAWA 5JMVA 2CH6A 2J4RA 3VOVA 3CJ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2AP1A 1BL3A 4OPHA 1T05A 3T19A 4RW6A 4IZ9A 3KHWA 4CZEA 4I7FA 5BRDA 3TAEA 1ESVA 1P8ZA 1NGGA 1OH8A 2IVNA 4MO5A 2P5GA 4M42A 5AQKA 2E6LA 3F9KA 3TTDA 4LFCK 5D3GA 1VQ4N 3I8DA 3M8QA 3V4IA 2YILA 3CMEN 4B8CA 5EX5A 2DY4A 3D2EA 2DFEA 2YJFA 4K42A 4AHTA 4Q5VA 4CHNA 3L3VA 4BC4A 3VA0A 3OJUA 1I94K 3NH1A 3KP0A 4LH4A 4KV8A 3SQ0A 2A41A 3WQUA 3SV4A 5SZTA 1L3UA 2KPYA 5BRFA 2ATQA 4LF9K 2P9LA 1XNQK 4CIFA 2ZF5O 4FM1A 3K5OA 2QWOA 3NBPA 1RTDA 2QXFA 3OYKA 4IJNA 1NJYA 2GBZA 2QXLA 3EL2A 3N4PA 2ITGA 2KKZA 3R8EA 3CCLN 3LP0A 4JI7K 2Q1NA 3NVMA 3I33A 2GEMA 5EY4A 1VSKA 3CETA 3JSMA 4FXDA 3O3HA 3MN9A 2D5RA 2Q0UA 3SMSA 2OA8A 3L6QA 3MWTA 1NK9A 4PWDA 1H1VA 1VSHA 1P90A 2OTJN 1JXBA 3CYMA 4CHPA 3TABA 3VPZA 3ZX3A 3E9LA 4BE1A 2XRIA 1POIA 3ENHA 2IGIA 3KK1A 3THYA 3H1VX 4BR5A 3AVHA 4FWNA 4CEAA 2F96A 3OYCA 1IO2A 3NAEA 4XIUA 1SAZA 3HSCA 4F3OA 1WN7A 3C0BA 4DQIA 1IG9A 4CESA 4F9OA 3QMLA 3L4IA 3VERA 5HRPA 4Y1DA 1UGLA 3NGYA 3P1GA 4FPBA 4KHUA 2YBRC 4M3TA 4YOVA 4OPJA 3VQ7A 5BPMA 1FKPA 4W5QA 1KVAA 4BRKA 3NDKA 4CJWA 4B9QA 5AQYA 2QM1A 1IKXA 2YHBA 2Q97A 1QZ6A 4X65K 3W0LA 1MWKA 2P9IA 1T7AA 3E9PA 2AA4A 3OYNA 1LQQA 3LDQA 2JGUA 4WCEL 3MEGA 2LKBA 3TU5A 1QQOA 1BI4A 2LR3A 4BRAA 3J7ZO 2YCHA 2A1SA 1G15A 1Y97A 4GW6A 1VNAA 2JDQD 4RWTA 3CYGA 2GV9A 2VG5A 1OVQA 1K9MO 3KLGA 1GLEG 3O9TA 2D1KA 5F2RA 4AB0A 1SL1A 1C1BA 3VF2A 5FLXO 3HPOA 4BRMA 2YHYA 4WQ4A 4K25A 2MBKA 3KLEA 3TI0A 3G10A 1E4FT 5KRTA 1S72N 2NRXA 1LOTB 2V7YA 3ZX0A 5AQXA 3RMCA 1U2VB 1KD1O 4AAZA 3GOIA 4XH1A 3HP9A 5J2NA 4DR6K 4JEPA 4DLEA 3A0IX 3ITHA 3V9WA 5KTQA 1HPZA 3QETA 4KI6A 5GAHP 2Y1JA 3SBTA 3F9MA 2RPIA 1HMVA 2SN3A 4CK2A 1BHLA 4N56A 1T44A 4XH5A 2ZD1A 4CF9A 5KPTA 1XQSC 1HNWK 4GY2B 4E1MA 3LWMA 3QEWA 2NRZA 4GVMA 3DLGA 3IDHA 1OVYA 3UKUB 4BEBA 4WFNL 2W41A 1ASWA 1MWMA 5M1QA 4FWPA 3DM2A 1YJ9N 4CEZA 4DQQA 2RF2A 5AQIA 3I0RA 3AVCA 3DJCA 4Y0WA 1KAXA 5AQRA 1I6GA 4FW2A 3EO3A 4CGJA 4XJXA 3WXMB 4I9LA 4C1NI 1K6YA 1QVGM 3QO9A 2QWRA 5DM7L 2YKMA 3VMFB 2HBLA 4CJLA 3PLAA 4DTXA 2JLEA 2K35A 1Z26A 5MLCQ 2I61A 4FJNA 2A5XA 1TYQA 2IIRA 3NGZA 1NKCA 2QEXN 5JS2A 5T7BA 4CBXA 1RCHA 1CZ9A 1IKYA 4MLHA 2P9LB 1C6VA 2F8TA 2E4LA 2V7ZA 2LY6A 1S9GA 1EKEA 4JI0K 2BUPA 3O6WA 2Z1IA 2IS3A 4NCAA 4CFDA 3IAYA 2M8BB 1GOCA 4FOEA 4HUGA 3TSUA 1EX4A 1L3VA 4HE7A 5FPMA 3SUNA 1X9JA 2YNFA 3JYTA 3HVRA 2LY5A 2GMOA 3S3OA 5BPLA 5LJWA 2QA4N 2QI2A 4KTQA 2VY6A 1RT6A 3LZJA 4WE1A 1NNEA 2GTDA 4FPAA 1HKCA 3MMVA 1BCGA 3R2VA 3PO5A 1FKOA 3H46O 4M7YA 3B6OA 3FZMA 4NO7A 4KH6A 1IH7A 4CF1A 4CJTA 2E1YA 5JVGL 3UKRA 2NY8X 1T7EA 3CJCA 4FOIA 1Z6RA 2ZE2A 4EIAA 3O9RA 3T3FA 2GUIA 3U6FA 1VQ9N 4CZLA 4PL7A 4C23A 5HOOA 5F1XA 3QICA 4CHOA 1IG8A 2C1IA 3S9HA 2XY6A 4BR2A 5AQZA 3BF3A 4OKKA 1C1AA 3A5MC 1S3XA 3CERA 4H4OA 1W97L 2HHHK 3HYFA 4CGIA 5A2QO 1E4GT 3K9KA 4GV6A 2HBJA 3L8BA 4DSLA 2F9TA 1ZYVA 1GLCG 2KGQA 4YHHK 2P9IB 5JICA 3K0SA 3KWGA 1ICAA 3L2QA 1PE4A 4KTZA 2WBNA 4C8MA 1XMQK 2XY7A 2G8IA 5JENA 1RBTA 4JS4A 3QNNA 4CEQA 3A5OC 4O5FA 2HOEA 5TKWA 3K5LA 1W7AA 1RTJA 2B4JA 3J7AP 5HRNA 5GADP 1N8RO 3EKUA 3CW4A 4FL9A 2VGMA 4FWRA 4IEEA 1S1TA 2AJQA 5FRNA 3IRXA 1DTTA 4BE7B 5HRRA 1IKWA 5BREA 5JLHA 5KPRA 1SL0A 4BRQA 4CGGA 4CQKA 1WSHA 3HBTA 3WXJA 1SL2A 5BRHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2AP1 A;  1BL3 A;  4OPH A;  1T05 A;  3T19 A;  4RW6 A;  4IZ9 A;  3KHW A;  4CZE A;  4I7F A;  5BRD A;  3TAE A;  1ESV A;  1P8Z A;  1NGG A;  1OH8 A;  2IVN A;  4MO5 A;  2P5G A;  4M42 A;  5AQK A;  2E6L A;  3F9K A;  3TTD A;  4LFC K;  5D3G A;  1VQ4 N;  3I8D A;  3M8Q A;  3V4I A;  2YIL A;  3CME N;  4B8C A;  5EX5 A;  2DY4 A;  3D2E A;  2DFE A;  2YJF A;  4K42 A;  4AHT A;  4Q5V A;  4CHN A;  3L3V A;  4BC4 A;  3VA0 A;  3OJU A;  1I94 K;  3NH1 A;  3KP0 A;  4LH4 A;  4KV8 A;  3SQ0 A;  2A41 A;  3WQU A;  3SV4 A;  5SZT A;  1L3U A;  2KPY A;  5BRF A;  2ATQ A;  4LF9 K;  2P9L A;  1XNQ K;  4CIF A;  2ZF5 O;  4FM1 A;  3K5O A;  2QWO A;  3NBP A;  1RTD A;  2QXF A;  3OYK A;  4IJN A;  1NJY A;  2GBZ A;  2QXL A;  3EL2 A;  3N4P A;  2ITG A;  2KKZ A;  3R8E A;  3CCL N;  3LP0 A;  4JI7 K;  2Q1N A;  3NVM A;  3I33 A;  2GEM A;  5EY4 A;  1VSK A;  3CET A;  3JSM A;  4FXD A;  3O3H A;  3MN9 A;  2D5R A;  2Q0U A;  3SMS A;  2OA8 A;  3L6Q A;  3MWT A;  1NK9 A;  4PWD A;  1H1V A;  1VSH A;  1P90 A;  2OTJ N;  1JXB A;  3CYM A;  4CHP A;  3TAB A;  3VPZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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