4IO8A

Crystal structure of human hsp70 complexed with 4-{(2r,3s,4r)-5-[(r)-6-amino-8-(3,4-dichloro-benzylamino)-purin-9-yl]-3,4-dihydroxy-tetrahydro-furan-2-ylmethoxymethyl}-benzonitrile
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGDTKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Functional analysis of hsp70 inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70kDa protein 1A variant
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
total genus 117
structure length 377
sequence length 377
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4io8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4io8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4io8A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4io8A04
4FPAA 4EFHA 4M7YA 3IFRA 1S22A 2Q36A 4J8FA 4BVOA 2FF3B 2FXUA 4KBOA 5AQOA 3U9DA 4BQLA 5ADXA 2P9IA 3UKUB 3VGMA 5AQYA 4BQZA 4B1XB 1LCUA 2QWLA 3HM8A 4JHDB 2OANA 3DXMA 1G99A 4CZFA 1YUWA 5AQJA 2HF4A 1JCEA 3VGLA 4YDUC 4CI6A 4BRGA 3H3NO 5EVZA 3MK6A 3WEEB 4LC9B 4QS7A 4IZ9A 2CGJA 5AQHA 1Q18A 5KPZA 3C0BA 3CI5A 3JXUA 1HKGA 2GWKA 4FL9A 4DB3A 4BRKA 3UKUA 4H0OA 3UKRA 3UE5A 4MLEA 4NO7A 1GLBG 1RFQA 3CHWA 3D7EO 5FPNA 3EKUA 3ATVA 4JHDA 4FSVA 2V51B 1TYQB 4QS8A 2D0OA 2WUSA 1WOQA 4MO4A 4H0YB 2P9KB 2Q0RA 5ADXH 5F2RA 3LM2A 5EXWA 3A0IX 4K42A 3I33A 2E1ZA 3WEEA 3GBTA 3SLCA 3I8BA 4EAHD 3CJBA 3M3ZA 5AQPA 2D0PA 4FWSA 2P9PB 4FWKA 4B9QA 2I7PA 4PKGA 4BR0A 3FZLA 3ID8A 4BREA 4BR7A 1GLDG 5AZIB 3O4WA 4Z94A 2IVPA 3O1BA 3LDNA 2E2PA 1OKJA 4BC5A 4WQ5A 1WUAA 4BRQA 1XUPO 4H5RA 2GEMA 5AQWA 3H3OB 1BA0A 5EOYA 4YDUA 5E26A 4DHYA 4H5TA 2E20A 3L0QA 3ENHA 2YHXA 3H1VX 3CIPA 3QBWA 1NGJA 1MWKA 3WXLA 5BRDA 4FPBA 3ZX3A 4E1JA 3MN5A 5AQNA 3B8AX 4O5FA 5AZIA 2VCPA 5E84A 2NZTA 1QQMA 2IVNA 1NLVA 4BG8A 2V52B 2Q2RA 5AQXA 2QM1A 2V7ZA 4BR4A 3EN9A 3O08A 4B1ZA 3O8MA 2E1YA 1X3NA 4MLHA 3QB0A 4H5VA 3QFPA 4Y0WA 2F9TA 3D2EB 1S3XA 2A42A 2P9UA 2W40A 3MDQA 2BTFA 5BRFA 5B8HA 3L6QA 1HKCA 3AARA 3JS6A 3ZX2A 3DXKB 1KXPA 4IXCA 2E8AA 1KAYA 4HWIA 1XC3A 4FOEA 3ULEB 4B1UB 4PL8A 2P9LB 1NGEA 4FWMA 4JNEA 2CGLA 2I7NA 5I9EB 4PKIA 3WUHA 2P9NB 3GOIA 4BRNA 3R8EA 3HTVA 3O6WA 4C23A 3FE1A 5JLHA 3WXJA 2H3GX 4I6MB 2W41A 2GELA 3CJ7A 1DGKN 4CZHA 4BR9A 4FWQA 3WQTA 4EHUA 1K8KA 3M6GA 3DXKA 3ZX0A 1HPMA 1NGGA 2ASOA 2P9LA 2ZF5O 3CJCA 5JMVA 5AFUA 5AQLA 2FLOA 1BWFO 4IO8A 1NM1A 3BEXA 2P9NA 1NGCA 3ZETB 4CZGA 1J6ZA 3J8AA 2BUPA 1NWKA 1SQKA 5FPEA 3R9PA 3BP8A 2HF3A 4H5NA 3MCPA 4I6MA 1NGDA 3LDOA 2HMPA 2P9SB 4CD3A 4DCHA 4BGAA 4B1WB 5JLFA 3HI0A 3VEYA 1U2VB 4O8KA 3AAQA 4WQ4A 2YI1A 5BN9A 1DKGD 4B1YB 2NRHA 3L4IA 3EO3A 4H5WA 3FFKB 1IG8A 2ASMA 2YCHA 2V7YA 2FSKA 1V4TA 1QQNA 5CE3A 2UYTA 4H0TB 4FOIA 1QZ5A 3ZETA 4BRMA 1BG3A 3IDHA 4BRFA 1T6CA 3KVGA 2Q31A 3C7NB 5AQFA 3HBTA 1NBWA 2EWSA 3U4LA 2KHOA 5AFUH 1NGHA 2E88A 1GLFO 1YAGA 1QZ6A 2Q0UA 3VGKA 3VOVA 1BDGA 2D1KA 4CBXA 5FPMA 4CZKA 3WQUA 2CGKA 3IUCA 4BR2A 5BPLA 1TYQA 3FZFA 1C0GA 4BRCA 3UB5A 2GTDA 2P9KA 5AQTA 2VWBA 4BRIA 1KAZA 3ATUA 4BR5A 5AQKA 3FLCO 4EIAA 4F9OA 1R59O 3GE1A 1ATSA 1V4SA 3C7NA 3VPZA 4DQ8A 3TPQA 2P9PA 3O80A 1YVNA 3H1QA 4QS9A 4XEIA 1BA1A 3VF4A 2AA4A 2PAVA 1QQOA 3BUZB 4PL7A 3A5OC 4JD2B 1GLJO 5AZJB 2Q1NA 3CQYA 3KZBA 5BREA 1GLCG 2VYPA 4FWOA 3H6EA 1ATNA 4K43A 4AM7A 4CZJA 5JICA 2Q97A 3A5LC 5EX5A 4CBWA 2E2OA 2YHWA 4AM6A 4NB4A 3CJ9A 4CD1A 3U8XA 1DEJA 1ZBSA 3VETA 3QICA 3HZ6A 3A8YA 3GL1A 1P8ZA 4K25A 3WXKA 3FZMA 3MN7A 2QW9A 5AQUA 2J4RA 4BRHA 5AZJA 5AQSA 2QWOA 3QMLA 1IJJA 4HTLA 2F9WA 2QWQA 3CERA 5EY4A 3CJ1A 4MO5A 3SMPA 3MN9A 2A6AA 3AAPA 1T44A 4RCHA 4XH4A 4M63C 3HSCA 4JAXA 3WT0A 3D2EA 3R6MA 4BRDA 1TUUA 3VF6A 4BRAA 3FGUA 5AR0A 2ASPA 1Z6RA 2YJFA 4BC2A 4FWPA 3ENOA 3ULEA 3CETA 1E4GT 3F9MA 4H0XB 1C0FA 1H1VA 2A3ZA 4FWRA 3MN6A 4ISFA 1BU6O 4BRPA 2CH5A 4H0PA 4CZEA 1E4FT 4ISGA 1NGBA 1Y64A 3MMVA 2FF6A 4K41A 3UKRB 3VENA 2QWRA 3VEVA 4ISEA 4H0VB 3OHRA 5BPNA 2E2QA 3CJAA 5KQDA 5KPTA 4BROA 4WQ5C 1BUPA 4IWVA 4CZIA 2A5XA 3IMXA 3G25A 4FO0A 4PKHA 1NMDA 3SK3A 3U9ZA 1U6ZA 3VF2A 4BC3A 2CH6A 4XH1A 4H03B 1X3MA 4L3QA 3VEZA 3WXIA 3O5BA 3LL3A 5AQGA 1LOTB 3LDQA 4CZLA 5AQMA 2P9SA 1HJOA 5F0XA 3EL2A 3CQXA 2A41A 3M1FA 1HLUA 1U2VA 4B1VA 3TU5A 2QWPA 3S41A 3VEOA 5BRHA 2A40A 4FWLA 2GUPA 5AQIA 3FZKA 2FSJA 4M7XA 3GDQA 1NGFA 4BGBA 1YXQA 2ZGZA 5LJVA 1CZAN 1RDWX 1BO5O 5AQVA 3DAWA 4GY2B 2IIRA 3LDLA 5BPMA 1ZC6A 5FPDA 1JCFA 2ITMA 4WYBA 2ZWHA 5ELZA 4JN4A 2YJEA 1ESVA 4A2AA 1ATRA 3QDKA 2HOEA 3QFUA 3FZHA 4IJNA 5AQRA 1GLAG 2IVOA 3BF3A 3D2FB 5AQZA 2YHYA 3ZEUB 3P4IA 4A62A 5KQ8A 3BF1A 4BC4A 2DPNA 5BN8A 3VEXA 1QHAA 3DWLA 2P9UB 2E2NA 4EHTA 2QWNA 1HKBA 1MDUB 4BVPA 4BG9A 1GLEG 1MA9B 3FR0A 3SMSA 1SZ2A 4FWNA 3VERA 2FSNA 3H46O 3KHYA 1NGAA 1RGIA 2D4WA 3LDPA 1TUYA 1HUXA 3RSEB 4GNIA 1KAXA 1BOTO 1ZXOA 4JD2A 3EKSA 4A61A 3SJHA 4BRLA 5AQQA 4CBUA 3D2FA 3A5MC 3DJCA 1HX1A 4RTFD 3ZEUA 1JCGA 3VEWA 3O1WA 3AY9A 4A2BA 4WQ4C 4CJ7A 1D4XA 3W3DA 5TKYA 4XH5A 2P9IB 5LY3A 1XQSC 2NLXA 3GG4A 4RWTA 1K8KB 1X9JA 2AP1A 4IJAA 1T6DA 5F1XA 3DXMB 3EZWA 2GWJA 5LJWA 2QXLA 1SAZA 3A5NC 3VESA 3RSEA 1NGIA 1GLLO 1EQYA 4CZMA 1Z05A 1MWMA 2PBDA 2ZGYA 3H45C 3QBXA 2QWMA 3LM9A 5KPRA 5BR9A 3W0LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4EFHA 3CCRN 1GOCA 3IFRA 4OGEA 4DFKA 4NXMK 3T1AA 2YX6A 2NNWA 3TANA 2ZJRL 4BQZA 4B1XB 1LCUA 3DXMA 4FLUA 3K9JA 4CZFA 2PZSA 4LF4K 1BQNA 3PO5A 3H3NO 5C12A 1VQMN 4QS7A 2UXCK 3E9OA 2CGJA 3THYA 1NJYA 1I6GA 4MFBA 5KPZA 3NH0A 1VAZA 4FM0A 4KHYA 4WE1A 1N6QA 1VSLA 4CJ4A 4BRKA 3UKRA 4HVJA 3J80O 1ZVGA 4PQUA 5GINA 4O8UA 1P00A 1ASUA 1GLBG 2MZ0A 5FPNA 3D7EO 3O3FA 4CJVA 2XHBA 4PA1A 3LAKA 4LSLA 1S6QA 3HP9A 5ADXH 2DTUA 2E6LA 2YKMA 1PTXA 3MXMA 3LM2A 4CEDA 1NPIA 4UADE 2E3GA 3SLCA 4B9VA 4EAHD 2ITGA 4CHQA 1YF5L 1MR4A 4JKCA 3MCAB 4OX9K 1BL3A 3N4PA 4C8MA 2O8CB 2OPPA 4PKGA 3FZLA 3WXMB 3D6RA 4CIGA 4N41A 4Z94A 3BGRA 3LDNA 1SV5A 4DV0K 4WQ5A 4CFBA 2G8VA 4AF1A 3RR8A 2VGMA 4BRQA 4M3XA 3I0RA 4CIFA 3V9WA 3H3OB 3VQAA 4AHUA 4YDUA 5E26A 1T8EA 3AVMA 2KTQA 1ZVEA 1VQLN 3E1YA 4RW9A 1U49A 3CCMN 3H1VX 3ZSZA 1F21A 2O8CA 3CIPA 1MWKA 1FJGK 4FPBA 5AQNA 3B8AX 4GVMA 2P1JA 4EP4A 3OS2A 2IVNA 5TKWA 1NLVA 3LPTA 4BG8A 5AQXA 2QM1A 3QFPA 3MWTA 4C8NA 3MDQA 4HUGA 2LI7A 3DI6A 2KQ2A 5CZ2A 1NK6A 3JS6A 3KOZA 2E8AA 3MWPA 4FOEA 3AVIA 4LSNA 4CGJA 4DV1K 4FWMA 2I7NA 4YFUA 3DLGA 4JKFA 3OYDA 3TAPA 1TL1A 3HTVA 2FBTA 5JLHA 4RW7A 4Z4GA 4MQ3A 5FRMA 3OW2M 3LZJA 2YV0X 5D3GA 4KH5A 3V9UA 2KBHA 1BCOA 4KB0A 2GELA 4CZHA 2QI2A 5IWAK 1C6VA 4IFVA 2Z1HA 3WQTA 2YBRC 2HW3A 3MEEA 3P1GA 1SL1A 3TTDA 2HHSA 4FXDA 3WNFA 5AFUA 4KHSA 4OGCA 3OJUA 1RBSA 1NGCA 2BUPA 4M3YA 4CJKA 4X62K 2HMPA 4KHPK 3HI0A 4B3MK 2YC1C 4WQ4A 1I3AA 5BN9A 4DG1A 3DOLA 3A2FA 4H5WA 3E9LA 4GW6A 3OS1A 3EZ5A 3SUPA 2VG7A 4CEEA 1CXUA 4DSKA 2UYTA 3KLFA 4FLWA 4AHSA 1LQQA 4RW6A 4CJUA 1L3VA 5LMUK 2RPIA 1T6CA 3OYCA 3U4LA 4V19S 1GPTA 1JLBA 1VQ7N 4B08A 2RHKA 3THVA 4FJKA 3J7AP 4A5AA 1BDGA 4DTXA 4AEIA 2OPSA 3WQUA 4YOYA 2LSNA 3G0ZA 2NRZA 2IOCA 3ATUA 4Z4CA 1S1WA 4EIAA 4AQYK 4U7BA 1WMTA 4E0DA 1FKOA 2VY6A 1WSIA 2EX3A 4DQ8A 4JI8K 1EX4A 2P9PA 1WSHA 1YVNA 3H1QA 3NVKA 2QXFA 4DV5K 4FM1A 2WFBA 3PY8A 5J2MA 4OKJA 3ZT3A 1IV0A 2Q1NA 4YOWA 1RCHA 2GV9A 3KD5E 1GLCG 3D0PA 4B9MA 5HRRA 1XMOK 1ZU3A 1NJIO 4RW8A 2HMIA 4K43A 1UGLA 4UY8O 3SF4D 1U4BA 2ZQBA 4AM7A 1Z25A 5JICA 2UUCK 4CJRA 1B7DA 4NB4A 3CJ9A 1N8RO 4CD1A 3EE8A 4LF9K 3NF6A 3VETA 4CGHA 3A8YA 1P8ZA 5J2NA 3FZMA 2XY6A 3NH1A 2YEOA 5AQSA 3V9ZA 1BI4B 2YHBA 2QWQA 3CJ1A 3PIOL 4E7IA 2BDPA 4DSFA 4RCHA 2X78A 4XH4A 4M63C 3HSCA 3HK2A 5HOOA 3D2EA 2DFFA 3DM2A 4BRAA 4E7LA 2ASPA 4JKHA 3HT3A 2B3CA 2IDOA 3AO2A 1Z6RA 1E4GT 2A1RA 1C0FA 3OYFA 4Q0BA 3AO5A 1RBVA 1T05A 1L3SA 4FWRA 1BI4A 3MN6A 3VA3A 1N32K 4GMJB 3UIQA 3V1QA 4ISGA 1NGBA 1RDCA 4JK7A 4DWIA 3T1HK 2Z1IA 3VQ7A 3LP3A 3CJAA 2FC0A 4E19A 4WQ5C 3KD1E 4CCHA 1QHTA 1NJWA 2NRRA 2G8IA 2F7TA 3SYZA 1SNBA 3BY5A 4FLVA 3IMXA 4BWMA 4CF1A 4R79A 3U9ZA 1SS6A 3TSUA 3AVNA 1EWRA 1KRPA 4XH1A 4H03B 1JLCA 3WNEA 3QIOA 4EP5A 4DF4A 3CFOA 4Y1DA 3CCQN 4OJRA 1BISA 4OLBA 4JI7K 1POIA 2A41A 4FJJA 3NVMA 1DJTA 4OPHA 4I9LA 3AA3A 3OYIA 3DLHA 1DTQA 3T69A 4M41A 1IKXA 1CZBA 1TVRA 1WAJA 3K5LA 4YHHK 1XNRK 1SEGA 2IIRA 4JI4K 4C8OA 5BPMA 1JCFA 1S9EA 3VQ9A 2AJQA 2QA4N 1WSGA 1U04A 1EO1A 2ZWHA 1GOAA 3QERA 2UUAK 4JN4A 4A2AA 3KK7A 3T1YK 2HOEA 1VQPN 1YITN 3NF8A 2OPRA 3OYAA 4UAFE 4IFEA 4O5BA 3D2FB 5AQZA 1S1UA 1TK8A 3VEXA 4EHTA 1HKBA 3O3GA 4DUZK 2Q3SA 4HHTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4EFH A;  3CCR N;  1GOC A;  3IFR A;  4OGE A;  4DFK A;  4NXM K;  3T1A A;  2YX6 A;  2NNW A;  3TAN A;  2ZJR L;  4BQZ A;  4B1X B;  1LCU A;  3DXM A;  4FLU A;  3K9J A;  4CZF A;  2PZS A;  4LF4 K;  1BQN A;  3PO5 A;  3H3N O;  5C12 A;  1VQM N;  4QS7 A;  2UXC K;  3E9O A;  2CGJ A;  3THY A;  1NJY A;  1I6G A;  4MFB A;  5KPZ A;  3NH0 A;  1VAZ A;  4FM0 A;  4KHY A;  4WE1 A;  1N6Q A;  1VSL A;  4CJ4 A;  4BRK A;  3UKR A;  4HVJ A;  3J80 O;  1ZVG A;  4PQU A;  5GIN A;  4O8U A;  1P00 A;  1ASU A;  1GLB G;  2MZ0 A;  5FPN A;  3D7E O;  3O3F A;  4CJV A;  2XHB A;  4PA1 A;  3LAK A;  4LSL A;  1S6Q A;  3HP9 A;  5ADX H;  2DTU A;  2E6L A;  2YKM A;  1PTX A;  3MXM A;  3LM2 A;  4CED A;  1NPI A;  4UAD E;  2E3G A;  3SLC A;  4B9V A;  4EAH D;  2ITG A;  4CHQ A;  1YF5 L;  1MR4 A;  4JKC A;  3MCA B;  4OX9 K;  1BL3 A;  3N4P A;  4C8M A;  2O8C B;  2OPP A;  4PKG A;  3FZL A;  3WXM B;  3D6R A;  4CIG A;  4N41 A;  4Z94 A;  3BGR A;  3LDN A;  1SV5 A;  4DV0 K;  4WQ5 A;  4CFB A;  2G8V A;  4AF1 A;  3RR8 A;  2VGM A;  4BRQ A;  4M3X A;  3I0R A;  4CIF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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