4KBOA

Crystal structure of the human mortalin (grp75) atpase domain in the apo form
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
376
structure length
374
Chain Sequence
AVVGIDLGTTNSCVAVMEGKQAKVLENAEGARTTPSVVAFTADGERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYATKRLIGRRYDDPEVQKDIKNVPFKIVRASNGDAWVEAHGKLYSPSQIGAFVLMKMKETAENYLGHTAKNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGLDKSEDKVIAVYDLGGGTFDISILEIQKGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKRETGVDLTKDNMALQRVREAAEKAKCELSSSVQTDINLPYLTMSGPKHLNMKLTRAQFEGIVTDLIRRTIAPCQKAMQDAEVSKSDIGEVILVGGMTRMPKVQQTVQDLFGRAPSKAVNPDEAVAIGAAIQGGVLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the nucleotide-binding domain of mortalin, the mitochondrial Hsp70 chaperone.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Stress-70 protein, mitochondrial
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
total genus 105
structure length 374
sequence length 376
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 4kboA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kboA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4kboA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4kboA04
3D2FA 3A5NC 1GLAG 3HSCA 4CBWA 3C7NA 3CJCA 3VF6A 1SZ2A 1XQSC 3UE5A 2QWMA 1YVNA 4FSVA 4FWPA 2E2NA 2IVPA 4K43A 5AQLA 1JCFA 2IIRA 3CJAA 4JD2A 3CJ1A 1RFQA 1TYQA 3DXMB 2FSKA 2W41A 4B1VA 5AZIB 1K8KB 5KQDA 4BRLA 4FL9A 4IJAA 4MO5A 3CIPA 4FOIA 2P9LA 5LJWA 5AQQA 4FWOA 1TUUA 4BROA 2YJEA 3JXUA 3O1WA 2ZWHA 2P9NB 5EX5A 3O5BA 5BN8A 3VEYA 5AQHA 2FLOA 4CD3A 2D1KA 3QICA 3LDLA 1BO5O 3O4WA 4BRGA 2BUPA 2CH6A 2D0PA 4BVPA 3RSEB 2NLXA 4F9OA 3JS6A 4RTFD 2QWQA 4BRFA 2V51B 4EAHD 4BR5A 2PBDA 4BGAA 3U4LA 4DQ8A 3QFUA 1C0FA 1ATNA 2D4WA 5AQWA 2P9KA 4B1YB 5AQXA 3DXMA 3AAQA 3IFRA 5AZIA 1K8KA 5TKYA 1HKCA 2ITMA 4CZIA 1KAXA 1E4GT 2PAVA 2J4RA 2CGJA 2F9TA 2FF3B 2P9IA 3LM9A 4QS9A 3U8XA 1GLFO 1U2VA 4H5RA 4H0XB 1XUPO 3KVGA 1NLVA 1QZ6A 1U6ZA 2I7NA 4B1WB 4CJ7A 3GE1A 2W40A 2QWLA 3G25A 4FO0A 3DJCA 4WQ5C 1S22A 4PKIA 3DXKA 3FR0A 1T44A 3H3OB 1X3NA 2GTDA 4BRMA 1NGHA 3L6QA 1GLJO 1BU6O 2EWSA 3H46O 1QQNA 3S41A 3D2FB 3H1VX 3I33A 4GNIA 3A8YA 3CQYA 3KZBA 3SK3A 4IXCA 3RSEA 5B8HA 5AQMA 5F0XA 3CJ7A 1HX1A 4LC9B 1ESVA 4BC4A 5AQOA 4BRKA 5FPNA 4EFHA 5FPEA 1JCEA 4JD2B 3GBTA 3O6WA 4HTLA 4QS7A 3R6MA 3MN9A 1H1VA 1BA1A 1TYQB 3HM8A 1Q18A 5BRHA 2AP1A 2IVNA 4H0YB 4RCHA 4M63C 3VPZA 5AR0A 3UKRB 1IJJA 4BQZA 3MK6A 3MN7A 3FLCO 2E2PA 3WEEB 2P9LB 4XEIA 3VETA 2IVOA 1HJOA 1HUXA 3VERA 2YHWA 3HBTA 4AM6A 1CZAN 4BC5A 5F1XA 1P8ZA 2F9WA 3VENA 3WXIA 3BUZB 4BRPA 1BUPA 4J8FA 1NGEA 3GDQA 3VEOA 1BG3A 2I7PA 3BEXA 4XH1A 2P9SB 3LDPA 1ATRA 3R8EA 3A5LC 4EHTA 4B1ZA 3HZ6A 3O1BA 3TU5A 1MA9B 2P9UB 2P9KB 1S3XA 2P9PA 3SMSA 2A3ZA 2YJFA 4WQ4C 4XH5A 4CZKA 2A40A 5AQIA 1IG8A 3TPQA 1NGCA 3UKRA 4BR4A 3VGLA 2P9IB 5FPDA 1U2VB 3WEEA 1BA0A 3WXLA 3FZMA 5ADXH 4AM7A 4H03B 3GG4A 3O08A 4ISEA 4I6MB 4CZMA 3OHRA 4M7YA 3DXKB 4DB3A 2QWNA 1HKGA 2FSNA 1J6ZA 5FPMA 5BREA 4E1JA 3IUCA 2VYPA 4M7XA 2ASOA 3GL1A 4BR9A 4A61A 2OANA 4A2BA 3M6GA 2Q97A 4ISFA 3FZLA 5BRFA 5ADXA 4IJNA 1MDUB 2P9SA 3SLCA 3MN5A 5CE3A 2NZTA 3QBXA 3W3DA 3QDKA 3VF2A 5AQRA 3ENOA 4H0VB 1BOTO 4BQLA 2P9UA 2ZGYA 5AQKA 2GUPA 3ATVA 4Y0WA 4JHDA 2ZF5O 1Z05A 1HLUA 5EY4A 4CZJA 3CERA 5AQFA 2HF3A 1MWKA 2GWJA 5EOYA 2GELA 1Y64A 5AQYA 1OKJA 2D0OA 4K42A 2HOEA 5ELZA 4MLEA 4A2AA 3CI5A 3BF3A 4CZLA 4PKGA 4I6MA 4FWNA 4BGBA 4BRNA 2E8AA 1DGKN 3IDHA 4BR0A 4CZGA 4JN4A 4CI6A 5BPMA 1NGJA 5BPNA 4QS8A 1QZ5A 3VEWA 2E1ZA 3ZETA 4Z94A 5BPLA 3H3NO 3ID8A 5AQTA 3A0IX 1KAZA 2ASMA 3VOVA 4B1UB 5EXWA 3ENHA 3EZWA 1GLCG 5AQNA 4CBUA 4XH4A 3EN9A 4KBOA 3O80A 2A42A 3IMXA 4BRHA 4FPBA 3U9DA 1ZC6A 1QQOA 4EIAA 2FXUA 4WQ4A 2P9PB 2HMPA 1G99A 4A62A 3VEVA 1V4SA 3ZX3A 5F2RA 5JICA 4FWSA 3EO3A 1NMDA 5AFUH 4FWKA 1TUYA 3QBWA 3FZHA 3AARA 4H5NA 4IZ9A 2UYTA 4PL8A 3ZX2A 1LOTB 4YDUC 4H0PA 2ZGZA 1V4TA 4BG9A 4BRCA 1T6CA 4PL7A 2Q2RA 2YCHA 1XC3A 3I8BA 3MMVA 2QWRA 4O5FA 5AFUA 1KAYA 3FGUA 4K25A 2CGKA 3HTVA 4BC3A 1RDWX 1ATSA 2A5XA 1X3MA 4L3QA 4MO4A 3SMPA 4CZHA 1NBWA 3A5OC 3LDOA 1C0GA 1QHAA 1YAGA 2FF6A 4JHDB 5KPZA 3LDQA 1HPMA 2CH5A 4CD1A 3HI0A 2FSJA 1NGBA 4RWTA 4IWVA 4CZFA 4BVOA 1MWMA 4FWRA 4WQ5A 5JMVA 2QWPA 5KPRA 3CETA 1DKGD 3AY9A 1E4FT 2DPNA 5E26A 1SAZA 4FWLA 2QW9A 2GWKA 2E88A 4IO8A 4HWIA 1D4XA 2Q31A 5AQGA 3CHWA 2V7YA 4JAXA 5E84A 3ZETB 3ULEA 3AAPA 3LM2A 5AQJA 5JLHA 5BR9A 3FZFA 3R9PA 3QB0A 3ZEUB 3CJBA 3H45C 3P4IA 4PKHA 3MCPA 5KQ8A 2V52B 1GLLO 2Q0RA 3D2EA 2BTFA 5AQSA 3WUHA 4H5VA 1NM1A 1WUAA 4H5WA 1GLDG 4BRQA 4DHYA 4H5TA 4JNEA 3MDQA 4CBXA 3KHYA 3FFKB 1JCGA 3ATUA 2KHOA 2Q36A 2WUSA 1WOQA 3VF4A 2Q0UA 1ZXOA 3EL2A 4ISGA 3L4IA 1KXPA 4EHUA 4B1XB 3QMLA 2E1YA 3FE1A 3FZKA 2NRHA 3BP8A 1LCUA 4YDUA 3UKUB 2E20A 2VCPA 3WXKA 5AQPA 2YI1A 2AA4A 4FOEA 3VEXA 2GEMA 3C0BA 3MN6A 4BG8A 3VGMA 3LDNA 3B8AX 5BRDA 3WQUA 2YHYA 1YUWA 2V7ZA 2Q1NA 5AQZA 5AQUA 3DWLA 3ZEUA 4O8KA 4BRIA 3ZX0A 1BDGA 4BC2A 5AZJB 3EKUA 3BF1A 2VWBA 1Z6RA 1ZBSA 4NB4A 5KPTA 3WXJA 4C23A 2P9NA 2QWOA 2CGLA 4FWQA 2A41A 1HKBA 1DEJA 4GY2B 5EVZA 4H0TB 1GLBG 3WQTA 1QQMA 2H3GX 4H0OA 1RGIA 4FPAA 3SJHA 4BR7A 3GOIA 3H1QA 3C7NB 2E2QA 2QM1A 3EKSA 3M1FA 3H6EA 5JLFA 1NGDA 3O8MA 3UKUA 4K41A 5BN9A 2YHXA 3VESA 3QFPA 4CZEA 1BWFO 2QXLA 1NGGA 3DAWA 1T6DA 2ASPA 1NGIA 1R59O 3LL3A 3WT0A 3CQXA 3L0QA 3CJ9A 4NO7A 3VEZA 4BRAA 3D7EO 3J8AA 3UB5A 1NGFA 1GLEG 2E2OA 3ULEB 1YXQA 4B9QA 4BREA 1NWKA 1EQYA 3U9ZA 5I9EB 1SQKA 3F9MA 5AQVA 4WYBA 3VGKA 4DCHA 5AZJA 5LJVA 5LY3A 4BR2A 4FWMA 3D2EB 1X9JA 4BRDA 3W0LA 2A6AA 3M3ZA 1NGAA 4MLHA 2HF4A 3A5MC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZBFA 4CF0A 2LN8A 2Z1HA 2RPIA 4CBWA 4KTQA 1VAZA 1SZ2A 4Z4HA 3OVNA 1YVNA 3CCSN 4FSVA 1ZBIA 4X64K 1JCFA 4LF5K 1MR4A 2IIRA 2ASCA 3ID6A 3DXMB 2HSTA 1W9HA 4B1VA 1LQQA 3ZLJA 4FL9A 4I9QA 3CIPA 2EX3A 4FOIA 5AQQA 4FWOA 1TUUA 3AA3A 4BROA 1TAQA 2ZWHA 4JEPA 3DRSA 4DQPA 3QICA 4KHSA 4Z4CA 1O13A 4J2BA 1XC9A 3AVCA 4HUGA 4E7JA 5IT9O 1WBBA 2CH6A 4BVPA 5J2PA 4F9OA 2RKIA 4E3SA 3JS6A 4RTFD 3AO5A 3LALA 4JI2K 4LF9K 4HHTA 3RWUA 4BR5A 1S9EA 2PBDA 4BGAA 2NRWA 4CCHA 4JV5K 1VQ9N 1OH7A 1D8YA 1SV5A 3AAQA 4B8CA 3IFRA 3ENBA 4X66K 2UUBK 5C12A 1K8KA 5TKYA 2ITMA 1QS4A 2J4RA 2F9TA 1T7BA 4QS9A 1TL3A 1NLVA 1QZ6A 1U6ZA 3V1OA 4CJ7A 4YHHK 3GE1A 3G25A 4FO0A 1IO2A 2JGUA 1PE4A 1KC8O 3FR0A 3G10A 1T44A 4YY3K 4CFDA 1KFSA 5T7BA 2E3GA 4ICLA 2GTDA 4GVMA 1I6GA 1GLJO 3H46O 3S41A 4B3MK 1BIUA 2W6LA 3A8YA 3KZBA 4M3YA 1GPSA 4CJRA 3L3UA 4AHUA 5DM7L 4FCYA 4W5NA 1ESVA 3LANA 3IS9A 3ZT1A 4DUYK 3THXB 4QAGA 1CXUA 4FLWA 1QVFM 3NVMA 4DSEA 4N47A 2OA8A 3AA4A 4CJTA 3GBTA 4PQUA 1D9DA 4DS5A 3VQEA 3KP0A 5BRHA 4H0YB 4E7LA 4IBNA 1DQ7A 4WF9L 1BRZA 4M63C 1U48A 1IJJA 4BQZA 3J80O 3CCVN 2KLAA 2KFZA 3MK6A 5CZ1A 3FLCO 3WEEB 5KGXA 2P9LB 4H4OA 2XRIA 3HP9A 1D5AA 3IKMA 3KWIA 3R2VA 4E72A 1HUXA 2B3CA 2YHWA 5GAEP 4DV3K 1CZAN 1WBDA 4CFBA 3OYEA 3OYCA 3VENA 1C1BA 3O9RA 3BUZB 4BRPA 3BK3C 4UAEF 4FYDA 1NGEA 2B68A 1GOAA 3BEXA 1JLGA 2MBKA 4CHOA 2P9SB 3AVLA 2LR3A 4OKKA 4RW7A 4EHTA 3TU5A 3O1BA 1BQMA 5DM6L 4JS5A 5JS2A 4DMNA 1S3XA 1JKHA 1RT1A 1WMTA 2Z1JA 4DR7K 2A3ZA 2YJFA 4KB0A 4K8XA 1YJ9N 1GOCA 5AQIA 4C8MA 3CC4N 1S1VA 1BQNA 3VGLA 1TVRA 1WAJA 2P9IB 5FPDA 3OYDA 3PY8A 4F3OA 4DLGA 1BIZA 4KH5A 3WXLA 5ADXH 4AM7A 3GG4A 4OLBA 3CCEN 4M7YA 3DXKB 1HNIA 4YNQA 1T0ZA 2KBKA 4CJUA 2E2FA 1J6ZA 5BREA 3NFAA 2VYPA 2ASOA 3GL1A 1YIJN 1FKPA 2YC1C 3RRHA 1OH5A 3MECA 4ISFA 5BRFA 5C15A 3RMCA 1UGLA 3I56N 4UQGA 1DTQA 3E9OA 3QDKA 1NK0A 1FK9A 4WFNL 1BOTO 2A7TA 3E9PA 3ZSOA 3ATVA 3HL8A 4Y0WA 4JHDA 4M3TA 4CJ4A 4JKGA 1Z05A 4DLEA 1UWBA 1T7AA 3TTDA 2GWJA 4FM1A 2DY4A 2XY7A 2GELA 4AH9A 2GX9A 4J2AA 1OKJA 4DQSA 2UXDK 2W00A 1CZBA 2WFBA 4YORA 4MDAA 4KHNA 5M1KA 3DRRA 3VQ4A 1OZZA 4FWNA 3SQ2A 1S1WA 4BDYA 2E8AA 3IDHA 4CZGA 5HRRA 4E1NA 4NCGA 1W7AA 4DSIA 4JI0K 3MCAB 4KHQA 3QEVA 3ZETA 2E1ZA 2E6MA 3T19A 3L2VA 4UADE 4F2RA 4R5PA 5AQNA 3LP1A 3EN9A 4KBOA 4BRHA 4LSLA 1YF5L 1F21A 2FXUA 4BE7B 1UA0A 2HMPA 1G99A 4CIFA 2BGGA 1V4SA 1WWNA 1B9DA 2E0HA 4AAZA 3ZX3A 3AO4A 1N36K 3I0SA 3IRXA 2LT8A 1Q8IA 3L2QA 3AARA 4H5NA 1TKXA 3NGZA 4PL8A 3T1YK 3PX6A 1SKRA 5LL6Z 4H0PA 2D0AA 2ZGZA 1A5VA 3TANA 4IFEA 4ZTJA 2Q2RA 1C6VA 5AFUA 3FGUA 4K25A 1N8RO 3HTVA 4BC3A 3TTFA 4A5BA 1ATSA 4LH4A 3SMPA 3WNEA 4M41A 1I2UA 3O4QA 1YAGA 5KPZA 3K0SA 3DLLL 2YX6A 5HL7L 3HPGA 3VQPA 1XNQK 1B9FA 1IBKK 4ILHA 2OPQA 1BCGA 4BVOA 4WQ5A 3RRGA 3LP3A 3AY9A 3CPEA 4E19A 2FBYA 4CIGA 1SS6A 3NF7A 4KH6A 2XY6A 3CMEN 4A59A 4O4GA 4Z4GA 1VQ4N 2NRRA 4AHSA 5HRSA 1L3SA 3C6AA 2NNWA 1RDCA 5E84A 1T8EA 2D0BA 4HUEA 3FZFA 3QB0A 4MFBA 5M1OA 2P51A 3DLRA 1TK8A 2G8IA 3JSMA 2VG6A 5KQ8A 2BTFA 5AQSA 2D5RA 4JKDA 1GLDG 1SL2A 1SN1A 4HTUA 2ZE2A 1BL3A 3O3FA 2KHOA 4FJLA 3VF4A 5HRNA 5GADP 1NK4A 2Q0UA 3FE1A 1U04A 3UKUB 2JWLA 2YI1A 2KJAA 4JKFA 1NPIA 2XHBA 5HLFA 2F8SA 4BG8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ZBF A;  4CF0 A;  2LN8 A;  2Z1H A;  2RPI A;  4CBW A;  4KTQ A;  1VAZ A;  1SZ2 A;  4Z4H A;  3OVN A;  1YVN A;  3CCS N;  4FSV A;  1ZBI A;  4X64 K;  1JCF A;  4LF5 K;  1MR4 A;  2IIR A;  2ASC A;  3ID6 A;  3DXM B;  2HST A;  1W9H A;  4B1V A;  1LQQ A;  3ZLJ A;  4FL9 A;  4I9Q A;  3CIP A;  2EX3 A;  4FOI A;  5AQQ A;  4FWO A;  1TUU A;  3AA3 A;  4BRO A;  1TAQ A;  2ZWH A;  4JEP A;  3DRS A;  4DQP A;  3QIC A;  4KHS A;  4Z4C A;  1O13 A;  4J2B A;  1XC9 A;  3AVC A;  4HUG A;  4E7J A;  5IT9 O;  1WBB A;  2CH6 A;  4BVP A;  5J2P A;  4F9O A;  2RKI A;  4E3S A;  3JS6 A;  4RTF D;  3AO5 A;  3LAL A;  4JI2 K;  4LF9 K;  4HHT A;  3RWU A;  4BR5 A;  1S9E A;  2PBD A;  4BGA A;  2NRW A;  4CCH A;  4JV5 K;  1VQ9 N;  1OH7 A;  1D8Y A;  1SV5 A;  3AAQ A;  4B8C A;  3IFR A;  3ENB A;  4X66 K;  2UUB K;  5C12 A;  1K8K A;  5TKY A;  2ITM A;  1QS4 A;  2J4R A;  2F9T A;  1T7B A;  4QS9 A;  1TL3 A;  1NLV A;  1QZ6 A;  1U6Z A;  3V1O A;  4CJ7 A;  4YHH K;  3GE1 A;  3G25 A;  4FO0 A;  1IO2 A;  2JGU A;  1PE4 A;  1KC8 O;  3FR0 A;  3G10 A;  1T44 A;  4YY3 K; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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